Phylo (video game)
பைலோ என்பது பல வரிசை சீரமைப்பு உகப்பாக்கம் பற்றிய ஒரு சோதனை வீடியோ கேம் ஆகும். மெக்கில் பயோ இன்ஃபர்மேட்டிக்ஸ் மையத்தால் உருவாக்கப்பட்டது, இது முதலில் நவம்பர் 2010 இல் ஒரு இலவச ஃப்ளாஷ் விளையாட்டாக வெளியிடப்பட்டது. ஒரு நோக்கத்துடன் ஒரு விளையாட்டாக வடிவமைக்கப்பட்ட வீரர்கள், கணினி வழிமுறை மூலம் சீரமைப்புகளை மேம்படுத்துவதற்காக வெவ்வேறு பைலோஜெனெடிக் வகைப்பாட்டின் நியூக்ளியோடைடு வரிசைகளைக் குறிக்கும் வடிவத்துடன் பொருந்தக்கூடிய புதிர்களைத் தீர்க்கிறார்கள். வெவ்வேறு வண்ணத் தொகுதிகளாக குறிப்பிடப்படும் ஒவ்வொரு நியூக்ளியோடைடு வரிசையையும் ஒன்றாக சீரமைப்பதன் மூலம், வீரர்கள் முடிந்தவரை பல வண்ணங்களைப் பொருத்துவதன் மூலமும், இடைவெளிகளைக் குறைப்பதன் மூலமும் ஒவ்வொரு தொகுப்பு வரிசைகளுக்கும் மிக உயர்ந்த புள்ளி மதிப்பு மதிப்பெண்ணை உருவாக்க முயற்சிக்கின்றனர். பைலோவால் உருவாக்கப்படும் நியூக்ளியோடைடு வரிசைகள் யுசிஎஸ்சி மரபணு உலாவியில் இருந்து உண்மையான வரிசை தரவுகளிலிருந்து பெறப்படுகின்றன. அதிக மதிப்பெண் பெற்ற வீரர்களின் சீரமைப்புகள் தரவுகளாக சேகரிக்கப்பட்டு, வலுவான மதிப்பெண் வழிமுறையுடன் மேலும் மதிப்பீடு செய்ய மெக்கில் பயோ இன்ஃபர்மேட்டிக்ஸ் மையத்திற்கு திருப்பி அனுப்பப்படுகின்றன. தற்போதைய கணினி உருவாக்கிய மதிப்பெண்ணை விட அதிக மதிப்பெண் பெறும் அந்த வீரர் சீரமைப்புகள் ஒரு உகப்பாக்கமாக உலகளாவிய சீரமைப்பில் மீண்டும் அறிமுகப்படுத்தப்படும். பின்னணி பைலோஜெனெடிக்ஸில் பல வரிசை சீரமைப்புகளின் குறிக்கோள், குழந்தைகள் இனங்களின் வரிசைகளை மிக சமீபத்திய பொதுவான மூதாதையருடன் ஒப்பிடுவதன் மூலம் ஒவ்வொரு இனத்தின் நியூக்ளியோடைடு வரிசையையும் தீர்மானிப்பதாகும். அத்தகைய உகந்த பல வரிசை சீரமைப்பை உருவாக்குவது பொதுவாக ஒரு மாறும் நிரலாக்க வழிமுறையுடன் தீர்மானிக்கப்படுகிறது, இது தேவையான பிறழ்வுகளின் எண்ணிக்கையைக் குறைப்பதன் மூலம் மிகவும் சாத்தியமான பரிணாம விளைவைக் கண்டறிகிறது. இந்த வழிமுறைகள் ஒவ்வொரு நியூக்ளியோடைடுக்கும் ஒவ்வொரு இனத்திற்கும் ஒரு வரிசையில் பைலோஜெனெடிக் மரங்களை உருவாக்குகின்றன, மேலும் குழந்தை இனங்களின் மரங்களை ஒப்பிடுவதன் மூலம் ஒரு பொதுவான மூதாதையருக்கான மரபணு வரிசையை தீர்மானிக்கின்றன. வழிமுறைகள் பின்னர் மதிப்பெண் பெற்று முடிக்கப்பட்ட பைலோஜெனெடிக் மரத்தை வரிசைப்படுத்துகின்றன, மேலும் அதிகபட்ச பார்சிமோனி மதிப்பெண்ணுடன் சீரமைப்பு உகந்ததாக தீர்மானிக்கப்படுகிறது, இதனால் மிகவும் பரிணாம ரீதியாக, பல வரிசை சீரமைப்பு. இருப்பினும், அதிக எண்ணிக்கையிலான வரிசைமுறைகளுக்கு இத்தகைய உகந்த சீரமைப்பைக் கண்டறிவது ஒரு NP-முழுமையான சிக்கலாக தீர்மானிக்கப்பட்டுள்ளது. அதற்கு பதிலாக பல வரிசை சீரமைப்பு சிக்கலைத் தீர்க்க ஒரு ஊடாடும் மரபணு வழிமுறையை உருவாக்க பைலோ மனித அடிப்படையிலான கணக்கீட்டைப் பயன்படுத்துகிறது. மூதாதையர் வரிசைகளின் உருவாக்கம் மற்றும் பார்சிமோனி மதிப்பெண் இன்னும் ஃபிட்ச்-மார்கோலியாஷ் முறையின் மாறுபாட்டைப் பயன்படுத்தி கணக்கிடப்படுகிறது, ஆனால் பைலோ யு. சி. எஸ். சி மரபணு உலாவியில் இருந்து பெறப்பட்ட மரபணு வரிசைகளை ஒரு முறை-பொருந்தும் விளையாட்டாக சுருக்குகிறது, இது மனித வீரர்களை வழிமுறை ரீதியாக அனைத்து மரங்களையும் கருத்தில் கொள்வதை விட பெரும்பாலும் சீரமைப்பை பரிந்துரைக்க அனுமதிக்கிறது. ஃபைலோவில் உள்ள ஒவ்வொரு புதிரும் சீரமைக்கப்பட வேண்டிய மொத்த வரிசை துண்டுகளின் எண்ணிக்கை மற்றும் மனிதர்களில் அந்த துண்டுடன் தொடர்புடைய ஒரு நோயின் அடிப்படையில் வகைப்படுத்தப்படுகிறது. ஒரு புதிர் தேர்ந்தெடுக்கப்பட்டவுடன், ஒவ்வொரு இனத்திற்கும் சீரமைக்கப்பட வேண்டிய சில மரபணு வரிசை துண்டுகள், வண்ணத் தொகுதிகளாக குறிப்பிடப்படுகின்றன, ஒவ்வொன்றும் ஒரு கட்டத்தின் ஒற்றை வரிசையில் வைக்கப்படுகின்றன. ஒரு மரபணு வரிசை துண்டின் ஒவ்வொரு நியூக்ளியோடைடும் கட்டத்தின் வழியாக செல்ல இலவசம். வீரர்கள் தங்களுக்கு இடையே உள்ள ஒவ்வொரு நெடுவரிசையிலும் அதிக எண்ணிக்கையிலான வண்ணப் போட்டிகளை உருவாக்குவதற்காக தேவைக்கேற்ப வரிசைகளை சரிசெய்யலாம், அதே நேரத்தில் தோன்றும் இடைவெளிகளின் எண்ணிக்கையைக் குறைக்கலாம். ஒவ்வொரு முனையிலும் உருவாக்கப்படும் வழிமுறை-தீர்மானிக்கப்பட்ட மூதாதையர் வரிசையுடன் ஒவ்வொரு வீரர்-சீரமைக்கப்பட்ட வரிசைகளையும் ஒப்பிடுவதன் மூலம் வரிசை சீரமைப்பின் மதிப்பெண் செய்யப்படுகிறது. ஒரு வண்ண போட்டி மதிப்பெண்ணுக்கு + 1 தருகிறது, ஒரு பொருந்தாத விளைச்சல்-1, இடைவெளி விளைச்சல்-5 இன் திறப்பு மற்றும் ஏற்கனவே உள்ள இடைவெளி விளைச்சல்-1 இன் நீட்டிப்பு. அனைத்து ஒப்பீடுகளின் கூட்டுத்தொகையும் ஒவ்வொரு பல விநாடிகளுக்கும் தீர்மானிக்கப்படுகிறது, இது அந்த வீரரின் சீரமைப்புக்கான இறுதி மதிப்பெண்ணை வழங்குகிறது. ஒவ்வொரு புதிருக்கும், விளையாட்டின் தொடக்கத்தில் ஒரு சில காட்சிகள் மட்டுமே ஆரம்பத்தில் கிடைக்கின்றன. அடுத்த சுற்றுக்குச் செல்வதற்கும், பொருத்தமாக அதிக காட்சிகளைத் திறப்பதற்கும் முன்பு கணினியால் தீர்மானிக்கப்பட்ட சம மதிப்பெண் வீரரால் தோற்கடிக்கப்பட வேண்டும். ஒரு வீரர் வெற்றி பெறுகிறார், மேலும் ஒவ்வொரு புதிருக்கும் கணினியால் உருவாக்கப்பட்ட இறுதி சம மதிப்பெண்ணை பொருத்துவதன் மூலம் அல்லது மீறுவதன் மூலம் தரவுத்தளத்தில் தங்கள் வரிசை சீரமைப்பை சமர்ப்பிக்க அனுமதிக்கப்படுகிறார். நிலைகள் (v 3.1.5), ஃபைலோ மூன்று விளையாட்டு முறைகளில் வருகிறதுஃ கதை முறை, வழிகாட்டப்பட்ட பயிற்சியில் அமைக்கப்பட்ட நிலைகளுடன் அசல் ஃபைலோ முறை, நோய்களின் தேர்வுடன் ஆர்என்ஏ மூலக்கூறுகளுக்கான ஒரு புதிய ரைபோ முறை, இதில் இரண்டு வரிசைகளும் ஆர்என்ஏ இரண்டாம் நிலை கட்டமைப்புகளும் (ஸ்டெம்-லூப்கள்) சீரமைக்கப்பட்டுள்ளன. கணினி வெளியீட்டுடன் ஒப்பிடும்போது, வீரர்கள் 70 சதவீத சீரமைப்புகளை மேம்படுத்த முடிந்தது. 2013 ஆம் ஆண்டில், ஃபைலோ டெவலப்பர்கள் ஓபன்-ஃபைலோ (இப்போது செயலிழந்துவிட்டது) என்ற வலை சேவையகத்தை உருவாக்கினர், இது வீரர்கள் சீரமைக்க ஆராய்ச்சியாளர்கள் தங்கள் சொந்த வரிசைகளின் தொகுப்புகளை பதிவேற்ற அனுமதிக்கிறது. கணினி சீரமைப்புகளுடன் ஒப்பிடும்போது, நிபுணத்துவ வீரர்கள் பெரும்பாலும் சிறிய முன்னேற்றங்களைச் செய்ய முடிந்தது வரிசை சீரமைப்பு வழிமுறைகள் என்ன செய்ய முடியும் என்பதை விட. மனிதர்களால் முன்மொழியப்பட்ட கணிசமாக சிறந்த சீரமைப்புகளின் சில சிறிய நிகழ்வுகளும் இருந்தன. ஐந்து ஆண்டுகால வரலாற்று ஃபைலோ தரவு குறித்த 2017 ஆம் ஆண்டின் அறிக்கையும் இதேபோன்ற முடிவுக்கு வருகிறது. மேலும் காண்க குடிமக்கள் அறிவியல் மனித அடிப்படையிலான கணக்கீட்டு கணக்கீட்டு பைலோஜெனெடிக்ஸ் க்ரவுட்ஸோர்சிங் திட்டங்களின் பட்டியல் மேற்கோள்கள் வெளிப்புற இணைப்புகள் அதிகாரப்பூர்வ பைலோ முகப்புப்பக்கம் 2010 வீடியோ கேம்கள் உலாவி கேம்கள் ஃப்ளாஷ் கேம்கள் புதிர் வீடியோ கேம்கள் குடிமக்கள் அறிவியல் மனித அடிப்படையிலான கணக்கீட்டு கேம்கள் கனடாவில் உருவாக்கப்பட்ட கிரவுட்ஸோர்சிங் வீடியோ கேம்கள்