Wagner's gene network model
வாக்னரின் மரபணு நெட்வொர்க் மாதிரி என்பது செயற்கை மரபணு நெட்வொர்க்குகளின் கணக்கீட்டு மாதிரியாகும், இது மரபணு ஒழுங்குமுறை நெட்வொர்க்குகளின் வளர்ச்சி மற்றும் பரிணாம செயல்முறையை வெளிப்படையாக மாதிரியாகக் கொண்டுள்ளது. பல உயிரினங்களைக் கொண்ட ஒரு மக்கள் தொகை தலைமுறையிலிருந்து தலைமுறைக்கு உருவாக்கப்படலாம் மற்றும் உருவாகலாம். இது முதன்முதலில் ஆண்ட்ரியாஸ் வாக்னரால் 1996 இல் உருவாக்கப்பட்டது, மேலும் மரபணு நெட்வொர்க்குகள், மரபணு வெளிப்பாடு, வலிமை, பிளாஸ்டிசிட்டி மற்றும் எபிஸ்டாசிஸ் ஆகியவற்றின் பரிணாமத்தை ஆய்வு செய்ய மற்ற குழுக்களால் ஆய்வு செய்யப்பட்டுள்ளது. அனுமானங்கள் மாதிரி மற்றும் அதன் மாறுபாடுகள் பல எளிமைப்படுத்தும் அனுமானங்களைக் கொண்டுள்ளன. அவற்றில் மூன்று கீழே பட்டியலிடப்பட்டுள்ளன. உயிரினங்கள் மரபணு ஒழுங்குமுறை நெட்வொர்க்குகளாக வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளன. மரபணு வெளிப்பாடு பிரத்தியேகமாக டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனல் மட்டத்தில் கட்டுப்படுத்தப்படுகிறது என்று மாதிரிகள் கருதுகின்றன; ஒரு மரபணுவின் தயாரிப்பு அந்த மூல மரபணு அல்லது பிற மரபணுக்களின் வெளிப்பாட்டை (ஒரு கட்டுப்பாட்டாளராக இருக்க) கட்டுப்படுத்த முடியும். ஒரு மரபணு ஒரு செயலில் உள்ள டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனல் ரெகுலேட்டரை மட்டுமே உருவாக்க முடியும் என்று மாதிரிகள் கருதுகின்றன; ஒரு ரெகுலேட்டரின் விளைவுகள் அதே இலக்கு மரபணுவில் மற்ற ரெகுலேட்டர்களின் விளைவுகளிலிருந்து சுயாதீனமாக உள்ளன. மரபணு வகை மாதிரி தனிநபர்களை ஊடாடும் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனல் ரெகுலேட்டர்களின் நெட்வொர்க்குகளாகக் குறிக்கிறது. ஒவ்வொரு தனிநபரும் மரபணுக்களை குறியாக்கம் செய்யும் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணிகளை வெளிப்படுத்துகிறார்கள். ஒவ்வொரு மரபணுவின் உற்பத்தியும் சிஸ்-ஒழுங்குமுறை கூறுகள் மூலம் தன்னை மற்றும்/அல்லது பிற மரபணுக்களின் வெளிப்பாட்டு அளவைக் கட்டுப்படுத்த முடியும். மரபணுக்களுக்கிடையேயான தொடர்புகள் ஒரு மரபணு வலையமைப்பை உருவாக்குகின்றன, இது மாதிரியில் ஒரு × ஒழுங்குமுறை மேட்ரிக்ஸால் குறிக்கப்படுகிறது. மேட்ரிக்ஸ் ஆர் இல் உள்ள கூறுகள் தொடர்பு வலிமையைக் குறிக்கின்றன. மேட்ரிக்ஸில் உள்ள நேர்மறை மதிப்புகள் இலக்கு மரபணுவின் செயல்பாட்டைக் குறிக்கின்றன, அதே நேரத்தில் எதிர்மறையானவை அடக்குமுறையைக் குறிக்கின்றன. மதிப்பு 0 கொண்ட மேட்ரிக்ஸ் கூறுகள் இரண்டு மரபணுக்களுக்கு இடையிலான தொடர்புகள் இல்லாததைக் குறிக்கின்றன. ஃபெனோடைப் ஒவ்வொரு தனிநபரின் ஃபெனோடைப் அந்த நேரத்தில் மரபணு வெளிப்பாடு வடிவமாக வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளது. இந்த மாதிரியில் இது ஒரு நிலை திசையனால் குறிக்கப்படுகிறது. இதன் உறுப்பு t நேரத்தில் மரபணு i இன் வெளிப்பாட்டு நிலையை குறிக்கிறது. அசல் வாக்னர் மாதிரியில், 1 என்பது மரபணு வெளிப்படுத்தப்படுவதைக் குறிக்கிறது, அதே நேரத்தில்-1 என்பது மரபணு வெளிப்படுத்தப்படவில்லை என்பதைக் குறிக்கிறது. வெளிப்பாட்டு முறை ஆன் அல்லது ஆஃப் மட்டுமே இருக்க முடியும். - 1 (அல்லது 0) மற்றும் 1 க்கு இடையிலான தொடர்ச்சியான வெளிப்பாடு முறை வேறு சில வகைகளிலும் செயல்படுத்தப்படுகிறது. வளர்ச்சி செயல்முறை மரபணு வெளிப்பாட்டு நிலைகளின் வளர்ச்சியாக வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளது. அந்த நேரத்தில் மரபணு வெளிப்பாடு முறை ஆரம்ப வெளிப்பாடு நிலை என வரையறுக்கப்படுகிறது. மரபணுக்களுக்கிடையேயான தொடர்புகள் வளர்ச்சிச் செயல்பாட்டின் போது வெளிப்பாட்டு நிலைகளை மாற்றுகின்றன. இந்த செயல்முறை பின்வரும் வேறுபட்ட சமன்பாடுகளால் வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளது, அங்கு τ) நேரத்தின் வெளிப்பாட்டு நிலையைக் குறிக்கிறது. இது ஒரு வடிகட்டி செயல்பாட்டால் தீர்மானிக்கப்படுகிறது σ. அந்த நேரத்தில் மரபணுவில் உள்ள அனைத்து மரபணுக்களின் ஒழுங்குமுறை விளைவுகளின் () எடையுள்ள கூட்டுத்தொகையைக் குறிக்கிறது. அசல் வாக்னர் மாதிரியில், வடிகட்டி செயல்பாடு ஒரு படி செயல்பாடு மற்ற வகைகளில், வடிகட்டி செயல்பாடு ஒரு சிக்மாய்டல் செயல்பாடாக செயல்படுத்தப்படுகிறது இந்த வழியில், வெளிப்பாடு நிலைகள் தொடர்ச்சியான விநியோகத்தைப் பெறும். மரபணு வெளிப்பாடு ஒரு நிலையான வடிவத்தை அடைந்தால் அது இறுதி நிலையை அடையும். பரிணாம பரிணாம உருவகப்படுத்துதல்கள் இனப்பெருக்கம்-பிறழ்வு-தேர்வு வாழ்க்கைச் சுழற்சி மூலம் செய்யப்படுகின்றன. மக்கள் தொகை அளவின்படி நிர்ணயிக்கப்பட்டுள்ளது, அவை அழியாது. ஒன்றுடன் ஒன்று இணைக்கப்படாத தலைமுறைகள் பயன்படுத்தப்படுகின்றன. ஒரு வழக்கமான பரிணாம உருவகப்படுத்துதலில், ஒரு நிலையான மரபணு வெளிப்பாடு வடிவத்தை உருவாக்கக்கூடிய ஒற்றை சீரற்ற சாத்தியமான தனிநபர் நிறுவனராக தேர்ந்தெடுக்கப்படுகிறார். ஒரே மாதிரியான தனிநபர்களின் எண்ணிக்கையை உருவாக்க குளோன் செய்யப்பட்ட தனிநபர்கள் உருவாக்கப்படுகிறார்கள். ஓரினச்சேர்க்கை அல்லது பாலியல் இனப்பெருக்க முறையின்படி, தற்போதைய தலைமுறையிலிருந்து பெற்றோர் தனிநபர்களை (களை) தோராயமாக தேர்ந்தெடுப்பதன் மூலம் (மாற்றாக) சந்ததிகள் உற்பத்தி செய்யப்படுகின்றன. பிறழ்வுகள் நிகழ்தகவு μ உடன் பெறப்படலாம் மற்றும் அவற்றின் உடற்தகுதிக்கு சமமான நிகழ்தகவுடன் உயிர்வாழ முடியும். அடுத்த தலைமுறையைக் கண்டறியும் N தனிநபர்கள் உற்பத்தி செய்யப்படும் வரை இந்த செயல்முறை மீண்டும் மீண்டும் செய்யப்படுகிறது. இந்த மாதிரியில் உள்ள ஃபிட்னஸ் ஃபிட்னஸ் என்பது ஒரு நபர் இனப்பெருக்கம் செய்ய உயிர்வாழ்வதற்கான நிகழ்தகவு ஆகும். மாதிரியின் எளிமையான செயல்பாட்டில், வளர்ச்சியில் நிலையான மரபணு வகைகள் உயிர்வாழ்கின்றன (அதாவது. அவற்றின் உடற்தகுதி) மற்றும் வளர்ச்சியில் நிலையற்றவை அல்ல (அதாவது. அவர்களின் உடற்தகுதி). பிறழ்வு பிறழ்வுகள் மரபணு ஒழுங்குமுறையில் ஏற்படும் மாற்றங்களாக, அதாவது ஒழுங்குமுறை மேட்ரிக்ஸில் உள்ள கூறுகளின் மாற்றங்களாக வடிவமைக்கப்படுகின்றன. இனப்பெருக்கம் பாலியல் மற்றும் அயல்நாட்டு இனப்பெருக்கம் ஆகிய இரண்டும் செயல்படுத்தப்படுகின்றன. ஓரினச்சேர்க்கை இனப்பெருக்கம் என்பது பெற்றோரின் மரபணுவை நேரடியாக நகலெடுப்பதன் மூலம் சந்ததியினரின் மரபணுவை (மரபணு நெட்வொர்க்) உற்பத்தி செய்வதாக செயல்படுத்தப்படுகிறது. இரண்டு பெற்றோரின் மரபணுக்களின் மறுசீரமைப்பாக பாலியல் இனப்பெருக்கம் செயல்படுத்தப்படுகிறது. ஒரு உயிரினம் ஒரு நிலையான மரபணு வெளிப்பாடு வடிவத்தை அடைந்தால் அது சாத்தியமானதாகக் கருதப்படுகிறது. ஊசலாட்ட வெளிப்பாடு வடிவத்தைக் கொண்ட ஒரு உயிரினம் நிராகரிக்கப்பட்டு அடுத்த தலைமுறையில் நுழைய முடியாது. குறிப்புகள் வெளிப்புற இணைப்புகள் ஆண்ட்ரியாஸ் வாக்னர் ஆய்வக வலைப்பக்கம் மரபணு வெளிப்பாடு நெட்வொர்க்குகள் அமைப்புகள் உயிரியல்