Hp53int1
மனிதப் புரதம் 53 இண்ட்ரான் 1 (Hp53int1) என்பது மனிதர்களில் Hp53int1 மரபணுவால் குறியிடப்பட்ட ஒரு புரதமாகும். மரபணு Hp53int1 மரபணு குரோமோசோம் 17p.13 இல் அமைந்துள்ளது, இது டிஎன்ஏ வரிசை 1125 அடிப்படை ஜோடிகளால் குறியிடப்பட்டுள்ளது, இது பகுதி 7,685,260 bp-7,686,371 bp ஐ உள்ளடக்கியது. Hp53int1 மரபணு குரோமோசோம் 17 இல் உள்ள WRAP53 மற்றும் TP53int1 மரபணுக்களுடன் ஒன்றுடன் ஒன்று இணைவதற்கு ஏற்ப, WRAP53int1 மற்றும் TP53int1 என்ற இரண்டு மாற்றுப்பெயர்களைக் கொண்டுள்ளது. Hp53int1 p53p2 தொடக்க தளத்தின் கீழ்நோக்கி அமைந்துள்ளது. Hp53int1 பல எக்ஸான்களைக் கொண்டிருக்கவில்லை, எனவே ஐசோஃபார்ம்கள் இல்லை. Hp53int1 மரபணு TP53 ஐப் போலவே அதே திசையில் படியெடுத்துள்ளது மற்றும் TP53 புரதம் நிறைந்த மைலாய்டு லுகேமியா செல்கள் HL-60 மற்றும் U937 இல் உள்ளது. இது TP53 மரபணு மற்றும் அடுத்தடுத்த புரதத்துடன் ஒரு வலுவான உறவைக் குறிக்கிறது, இதில் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணிகள், விளம்பர சமிக்ஞைகள், திசு வெளிப்பாடு மற்றும் துணை செல்லுலார் உள்ளூர்மயமாக்கல் ஆகியவை அடங்கும். இந்த மரபணுக்கள் ஒரே மாதிரியானவை அல்ல என்றாலும், இந்த உறவு செயல்பாடு, கட்டமைப்பு மற்றும் வெளிப்பாட்டிற்கான தடயங்களை வழங்கக்கூடும். எம்ஆர்என்ஏ டிரான்ஸ்கிரிப்ட் Hp53int1 ஒரு பாலிடெனைலேட்டட் டிரான்ஸ்கிரிப்ட் 1125 அடிப்படை ஜோடி நீளத்தால் குறியிடப்பட்டுள்ளது. அடிப்படை ஜோடி 633.926 க்கும் அடிப்படை ஜோடி 496.1000 க்கும் இடையில் ஒரு ஒழுங்குமுறை பாலி ஏ வால் வரிசைக்கும் இடையில் மீண்டும் மீண்டும் வரிசை உள்ளது. அடிப்படை ஜோடிகள் 633 மற்றும் 926 க்கு இடையிலான தொடர்ச்சியான வரிசை ஆலு எஸ்சி துணைக்குடும்பத்தின் தொடர்ச்சியைப் போலவே குறிப்பிடப்படுகிறது, இது மனிதர்கள் மற்றும் விலங்கினங்களில் மிகவும் ஏராளமான தொடர்ச்சியான வரிசைகளை வகைப்படுத்துகிறது, மேலும் இது சுமார் 32 மில்லியன் ஆண்டுகளுக்கு முன்பு பிற ஆலு துணைக்குடும்ப வளாகங்களிலிருந்து வேறுபட்டிருக்கலாம். விளம்பரதாரர் வரிசை Hp53int1 மரபணுவின் விளம்பரதாரர் வரிசை 540 அடிப்படை ஜோடிகள் நீளம் கொண்டதாக காட்டப்பட்டது. டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணிகள் எஸ். எம். ஏ. டி2, எஸ். ஆர். ஒய் மற்றும் ஈ. டி. வி7 ஆகியவை முறையே 2.99,2.73 மற்றும் 3.03 என்ற அடிப்படை பாதுகாப்பு மதிப்பெண்களைக் கொண்டிருந்தன, 4 இன் மதிப்பு மிக உயர்ந்த பாதுகாப்பையும்-0.5 மிகக் குறைந்த பாதுகாப்பையும் குறிக்கிறது. கேஎல்எஃப்2 மற்றும் கேஎல்எஃப்5 தலா 3.73 புள்ளிகளைப் பெற்றன. ஒப்பிடப்பட்ட இனங்கள் யானை, நாய், ரீசஸ் மக்காக் மற்றும் கோழி ஆகும். Hp53int1 புரதத்தின் மூலக்கூறு எடை 13.3 கிலோடால் மற்றும் நீளம் 118 அமினோ அமிலங்கள் ஆகும். இது ஒரு அடிப்படை புரதமாகும். 102-110 க்கு இடையில் மிகவும் பாதுகாக்கப்பட்ட அமினோ அமில வரிசை உள்ளது. அர்ஜினைன் மற்றும் டைரோசின் தளங்களை விட செரின் தள விநியோகம் கணிசமாக அதிகமாக உள்ளது. அமினோ அமிலங்களுக்கு இடையில் கேசீன் கினேஸ் II பாஸ்போரிலேஷன் தளம் 22-25 சாத்தியமாகும். கேசீன் கினேஸ் II பாஸ்பரிலேஷன் செல் பெருக்கத்தில் ஈடுபட்டுள்ளது. Hp53int1 புரதத்திற்கு கோளாறின் மூன்று பகுதிகள் கணிக்கப்பட்டுள்ளன. பிந்தைய மொழிபெயர்ப்பு மாற்றங்கள் அமினோ அமிலங்கள் 14-20 இடையே ஒரு சாத்தியமான O-β-GlcNAc தளம் உள்ளது. டிரான்ஸ்மெம்பிரேன் களங்கள் அல்லது சிக்னல் பெப்டைடுகள் எதுவும் இல்லை. S5, S15 மற்றும் S20 ஆகிய இடங்களில் பாதுகாக்கப்பட்ட பாஸ்பரிலேஷன் தளம் உள்ளது. கட்டமைப்பு இரண்டாம் நிலை Hp53int1 புரதத்தில் ஒரு ஆல்பா ஹெலிக்ஸ் மற்றும் ஐந்து பீட்டா தாள்கள் இருக்கும் என்று கணிக்கப்பட்டுள்ளது. எட்டு சாத்தியமான புரத பிணைப்பு தளங்கள் உள்ளன. மூன்றாம் நிலை துணை செல்லுலார் உள்ளூர்மயமாக்கல் Hp53int1 புரதம் சைட்டோபிளாஸத்திற்குள் உள்ளூர்மயமாக்கப்படுவதற்கான 56.5% வாய்ப்பு உள்ளது. திசு வெளிப்பாடு Hp53int1 மரபணுவுக்கு குறைந்த திசு குறிப்பிட்ட தன்மை உள்ளது. வயது வந்த மனித திசுக்களின் பல்வேறு மாதிரிகளை ஒப்பிடும்போது தைமஸ், கருப்பைகள், நிணநீர் கணுக்கள் மற்றும் வெள்ளை இரத்த அணுக்களில் அதிக வெளிப்பாடு உள்ளது. அருகிலுள்ள செரிமானப் பாதை, இரைப்பை குடல் மற்றும் ஆண்/பெண் திசுக்களில் ஆர்என்ஏ வெளிப்பாடு மற்றும் புரத வெளிப்பாடு ஆகிய இரண்டிற்கும் அதிக வெளிப்பாடு மதிப்பெண் இருந்தது. 10 மற்றும் 16 வாரங்களுக்கு இடையில் கருவின் வளர்ச்சியின் போது, நுரையீரல் மற்றும் இதய திசுக்களில் உயர்ந்த வெளிப்பாடு உள்ளது. Hp53int1 செல் பெருக்கம் அல்லது அப்போப்டொசிஸ் தேவைப்படும் நிலைமைகளின் கீழ் வேறுபட்ட முறையில் வெளிப்படுத்தப்படுகிறது, TP53 கட்டி ஒடுக்கும் மரபணு ஹோமோலஜி மற்றும் பரிணாம இணைப்புகளுடன் அதன் ஒற்றுமைக்கு ஏற்ப Hp53int1 மரபணு எந்த இணைப்புகளையும் கொண்டிருக்கவில்லை என்று கண்டறியப்பட்டது. என்சிபிஐ பிளாஸ்ட் வரிசை பகுப்பாய்வு மற்றும் கிளஸ்டல் டபிள்யூ ஆகியவற்றைப் பயன்படுத்தி பல வரிசை சீரமைப்பு Hp53int1 மற்றும் இருபது சிறந்த பிளாஸ்ட் வெற்றிகளுக்கு வடிவமைக்கப்பட்டது. இந்த ஆராய்ச்சியின் நோக்கம் பல்வேறு பாலூட்டிகள், முதுகெலும்பற்ற விலங்குகள் மற்றும் முதுகெலும்பற்ற விலங்குகளில் பல ஆர்த்தோலாக்களைக் கண்டுபிடிப்பதாகும், ஆனால் இரண்டு வகுப்புகளில் மட்டுமே முடிவுகள் இருந்தனஃ விலங்கினங்கள் மற்றும் பாக்டீரியாக்கள். மேலும், Hp53int1 க்குள் ஒரே ஒரு அமினோ அமில வரிசை மட்டுமே இருந்தது மற்றும் அதன் பொதுவான 20 அமினோ அமிலங்களின் ஆர்த்தோலாக்கள் நீளமாக நேராக சீரமைக்கப்பட்டன). ப்ரைமேட் மரபணுக்கள் குரோமோசோம் 13 இல் அமைந்துள்ளன, அதே நேரத்தில் Hp53int1 குரோமோசோம் 17 இல் அமைந்துள்ளது. அணு உறைக்குள் ப்ரைமேட் புரதங்களின் துணை செல்லுலார் உள்ளூர்மயமாக்கலுக்கும் சான்றுகள் உள்ளன, அதே நேரத்தில் Hp53int1 க்கான சான்றுகள் இது சைட்டோபிளாஸத்தில் இருப்பதாகக் கூறுகின்றன. எனவே, விலங்கினங்கள் கடுமையான ஆர்த்தோலாக்கள் அல்ல என்று கருதுவது நியாயமானது. கடுமையான Hp53int1 சீரமைப்புகள் ஏன் பாக்டீரியாவில் மட்டுமே காணப்படுகின்றன என்பதற்கான சாத்தியமான விளக்கம் பாக்டீரியாவிற்கும் விலங்கினங்களின் பொதுவான மூதாதையருக்கும் இடையில் பகிரப்பட்ட நிகழ்வைக் கடக்கும் சாத்தியமாகும். செயல்பாடு Hp53int1 புரதம் செல்லுலார் பெருக்கம் மற்றும் அப்போப்டொசிஸை ஒழுங்குபடுத்துவதில் ஈடுபட்டிருக்கலாம். இது அப்போப்டொசிஸ்-ரெகுலேட்டர் மற்றும் எங்கும் நிறைந்த ஒழுங்குமுறை புரதங்கள் தொடர்பு கொள்ளும் பயன்பாடு, TP53 உடன் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணிகளின் பங்கு (குறிப்பாக SMAD2, SRY மற்றும் ETV7 டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணிகள்), p53p2 தொடக்க தளத்தின் கீழ்நோக்கி அதன் இருப்பிடம், அதன் கேசீன் கைனேஸ் II பாஸ்போரிலேஷன் தளம் மற்றும் திசுக்கள் முழுவதும் அதன் எங்கும் நிறைந்த வெளிப்பாடு ஆகியவற்றால் குறிக்கப்படுகிறது. உயிரணு பெருக்கத்தைக் குறைக்கும் புரதங்கள் மிகைப்படுத்தப்படும்போது சூழல்களில் Hp53int1 மரபணு வெளிப்பாடு அதிகரிக்கிறது, இது உயிரணு வளர்ச்சியைக் கட்டுப்படுத்த வேண்டிய செல்லுலார் சூழல்களில் அதன் தேவையைக் குறிக்கிறது. மேலும், டிஎன்ஏ சேதத்திற்கு செல்லுலார் பதிலை செயல்படுத்துவதற்கு பொதுவான எச். பி 53 புரதம் முற்றிலும் தேவை என்பதை அளவு பகுப்பாய்வு காட்டுகிறது. இன்டராக்ட்டிங் புரோட்டீன்கள் பின்வரும் இன்டராக்ட்டிங் புரதங்கள் TP53 க்கு காணப்பட்டன, ஆனால் அவற்றின் குரோமோசோம் உறவு காரணமாக Hp53int1 க்கு பயன்படுத்தப்படலாம். கவனிக்க வேண்டிய முக்கியமானதுஃ இந்த இடைவினை புரதங்களின் செயல்பாடுகள் செல் ஒழுங்குமுறையில் (எங்கும் நிறைந்த, டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனல் ரெகுலேட்டர், அப்போப்டொசிஸ் மற்றும் புரதம்-டைரோசின் கைனேஸ்) நேரடியாக ஈடுபட்டுள்ளன. எஸ்என்பிக்கள் Hp53int1 க்கு இரண்டு அடையாளம் காணப்பட்ட எஸ்என்பிஎஸ் உள்ளன. TP53 விளம்பரதாரரின் மிகப்பெரிய ORF இன் மேல்நோக்கி அமைந்துள்ள 43 எச்சங்களின் வரிசையில் SNP 15 32 வது இடத்தில் உள்ளது. SNP 20 பின்னர் 1125 bp cDNA (Hp53int1) இன் 3 'முனையிலிருந்து 45 bp கீழ்நோக்கி அமைந்துள்ளது. மருத்துவ முக்கியத்துவம் Hp53int1 மரபணு கட்டி அடக்குதலில் ஈடுபட்டுள்ளது என்பதற்கான சான்றுகள் உள்ளன. Hp53int1 ஆனது TP53 எக்ஸான் 1 (TAD1) உடன் ஒன்றுடன் ஒன்று இணைகிறது. இந்த பிராந்தியத்திற்குள் ஏற்படும் பிறழ்வுகள் மாற்று எக்ஸான் வெளிப்பாடு அல்லது முழுமையற்ற பிளவு மற்றும் கட்டி அடக்கும் செயல்பாட்டின் இழப்பு ஆகியவற்றை ஏற்படுத்தும். ஆஸ்டியோசார்கோமாவைப் பொறுத்தவரை, TP53 இன் முழுமையற்ற பிளவு சம்பந்தப்பட்ட வழக்குகளில் ~20% இல் TAD1 க்குள் இந்த மறுசீரமைப்புகள் கண்டறியப்பட்டுள்ளன. இந்த மறுசீரமைப்புகள் TP53 இன்ட்ரான் 1 இன் முழு வரிசையிலும் அமைந்துள்ளன, ஆனால் அவற்றில் பெரும்பாலானவை Hp53int1 டிரான்ஸ்கிரிப்ட்டின் ஒரு களத்தில் குவிந்திருக்கும், இது இந்த இடத்திற்குள் குரோமாட்டின் இணக்கத்தால் இந்த மறுசீரமைப்புகளை எளிதாக்கலாம் என்று பரிந்துரைக்கிறது.