Pseudoproline
சூடோப்ரோலின் (சூடோ-ப்ரோலின், சை-ப்ரோ) வழித்தோன்றல்கள் பெப்டைடுகளின் எஃப்எம்ஓசி திட-கட்ட தொகுப்பின் போது திரட்டலைக் குறைக்க செயற்கை முறையில் உருவாக்கப்பட்ட டைபெப்டைடுகள் ஆகும். திடமான கட்ட பெப்டைட் தொகுப்பின் (எஸ். பி. பி. எஸ்) போது குறைந்த கரைசல் சிக்கல்கள் அல்லது முழுமையாக பாதுகாக்கப்பட்ட பெப்டைட் துண்டுகளின் வரையறுக்கப்பட்ட கரைதிறன் ஆகியவற்றால் பெரிய பெப்டைடுகளின் வேதியியல் தொகுப்பு இன்னும் மட்டுப்படுத்தப்பட்டுள்ளதுஃ பாதுகாப்பற்ற பெப்டைட் தொகுதிகளின் சுய-சங்கமத்தால் வேதியியல் தேர்ந்தெடுக்கும் பிணைப்பு முறைகள் கூட பாதிக்கப்படுகின்றன. வளர்ந்து வரும் பெப்டைட் சங்கிலியின் விருப்பமான இணக்கத்திற்கும் அதன் இயற்பியல் வேதியியல் பண்புகளுக்கும் இடையிலான உறவை தெளிவுபடுத்துவது, β-தாள் (பீட்டா-தாள்) உருவாக்கம் பெரும்பாலும் கரைசல் மற்றும் கரைதிறனில் குறிப்பிடத்தக்க குறைவால் இணையாக உள்ளது என்பதை வெளிப்படுத்துகிறது. வெளிப்புற காரணிகளால் பெப்டைடுகளின் கரைசலை அதிகரிக்கும் முயற்சிகளைத் தவிர, சில முயற்சிகள், அதாவது. N-மாற்றப்பட்ட Hmb அமினோ அமில வழித்தோன்றல்கள் மற்றும் சூடோப்ரோலின்கள் (மேல் வலதுபுறத்தில் உள்ள படத்தைப் பார்க்கவும்) திரட்டல் மற்றும் இரண்டாம் நிலை அமைப்பு உருவாக்கத்திற்கு பொறுப்பான பெப்டைடுகளின் உள்ளார்ந்த பண்புகளை மாற்றியமைப்பதாக தெரிவிக்கப்பட்டுள்ளது. சூடோப்ரோலின்கள் செரின்-(ஆக்சா) அல்லது த்ரியோனின்-பெறப்பட்ட ஆக்ஸசோலிடைன்கள் [ஆக்சா (5-மீ)] மற்றும் சிஸ்டைன்-பெறப்பட்ட தியாஜோலிடைன்கள் (டிஹெர்ட்ஸ்) ஆகியவற்றைக் கொண்டுள்ளன, அவை புரோலின் போன்ற வளைய கட்டமைப்பைக் கொண்டுள்ளன (மேல் வலதுபுறத்தைப் பார்க்கவும்). மட்டர் மற்றும் சக ஊழியர்கள் செரின், த்ரியோனின் மற்றும் சிஸ்டைனின் ஆக்சா மற்றும் தியாப்ரோலைன் வழித்தோன்றல்களை செர் (சைப்ரோ) உடன் வரையறுத்துள்ளனர். Thr (siPro), மற்றும் Cys (siPro), முறையே, இங்கு சுருக்கமான siPro புரோலைனுடனான உறவைக் குறிக்கிறது (நிலை 4 இல் ஹெட்டோரோஆட்டமிக் வளைய மாற்றுடன்). புரோலைன் வளையத்தின் நிலை 2 இல் மாற்றீடு கொண்ட சூடோப்ரோலின்கள் செர்/Thr/சிஸ்-(புரோ) என்று அழைக்கப்படுகின்றன. C2-மாற்றப்பட்ட சூடோப்ரோலின்களின் முந்தைய எச்சத்துடன் ஒரு சிஸ்-அமைடு பிணைப்புக்கான விருப்பம் காரணமாக, அவற்றின் ஒருங்கிணைப்பு பெப்டைட் முதுகெலும்பு ஒரு கிங்க் இணக்கத்தை விளைவிக்கிறது, இதனால் பெப்டைட் திரட்டல், சுய இணைப்பு அல்லது β-கட்டமைப்பு உருவாக்கம் தடுக்கப்படுகிறது. எனவே, சூடோப்ரோலின்கள் ஒரே நேரத்தில் இரண்டு செயல்பாடுகளைச் செய்கின்றனஃ அவை (1) செர், த்ரர் மற்றும் சிஸ் ஆகியவற்றிற்கான தற்காலிக பக்க சங்கிலி பாதுகாப்பாகவும், (2) பெப்டைட் தொகுப்பின் போது மற்றும் அடுத்தடுத்த சங்கிலி அசெம்பிளியில் கரைத்தல் மற்றும் இணைப்பு விகிதங்களை அதிகரிக்க கரைக்கும் கட்டுமானத் தொகுதிகளாகவும் செயல்படுகின்றன. இலவச அமினோ அமிலங்களை ஆல்டிஹைடுகள் அல்லது கீட்டோனுடன் வினைபுரிவதன் மூலம் சூடோப்ரோலின்கள் பெறப்படுகின்றன. அமினோ அமில வழித்தோன்றல்களை என்-முனைய சூடோப்ரோலின் கொண்ட வளர்ந்து வரும் பெப்டைட் சங்கிலியுடன் இணைப்பது பொதுவாக ஆக்சசோலிடைன் (தியாஜோலிடைன்) வளைய அமைப்பின் ஸ்டெர்ரிக் ரீதியாக தடைசெய்யப்பட்ட தன்மை மற்றும் நைட்ரஜன் அணுவின் நியூக்ளியோஃபிலிசிட்டி குறைவதால் குறைந்த விளைச்சலை விளைவிக்கிறது. இதன் விளைவாக, எஃப்எம்ஓசி-எக்ஸ்ஏஏ1-ஆக்சா/டிஹெர்ட்ஸ்-ஓஎச் வகையின் பொருத்தமான பாதுகாக்கப்பட்ட டைபெப்டைட் வழித்தோன்றல்களின் முன்மாதிரி பெப்டைட் தொகுப்பில் பயன்படுத்த விரும்பத்தக்கது. ஆக்சசோலிடைன்-மற்றும் தியாஜோலிடைன்-ரிங்-கொண்ட டைபெப்டைட் வழித்தோன்றல்களைத் தயாரிப்பதற்கு இரண்டு கருத்தியல் ரீதியாக வேறுபட்ட அணுகுமுறைகள் சாத்தியமாகும்ஃ (1) அமில ஃவுளூரைடுகள் அல்லது என்-கார்பாக்சியான்ஹைட்ரைடுகளைப் (என். சி. ஏ) பயன்படுத்தி செர்-அல்லது திர்-பெறப்பட்ட ஆக்சசோலிடைன்கள் அல்லது சிஸ்-பெறப்பட்ட தியாஜோலிடைன்களின் இன் சிட்டு அசைலேஷன்; மற்றும் (2) சி-டெர்மினல் செர் அல்லது திர் கொண்ட டைபெப்டைடுகளில் (சேர்ப்புக்குப் பிந்தைய) ஆக்சசோலிடைன் அமைப்புகளை நேரடியாக செருகுதல். தேர்ந்தெடுக்கும் முறை சுழற்சி அமைப்பின் C2 இல் உள்ள மாற்றீடுகளைப் போலவே வெல்ஐ என சூடோப்ரோலினின் தன்மையைப் பொறுத்தது. நன்மைகள் செயற்கை பெப்டைடுகளின் தரத்தை மேம்படுத்துவதற்கு சூடோப்ரோலின்கள் ஒரு சக்திவாய்ந்த கருவியாகும். சூடோப்ரோலைன் டைபெப்டைடுகள் நீண்ட மற்றும் கடினமான பெப்டைடுகளை ஒருங்கிணைப்பதற்கான வெற்றி விகிதத்தை பெரிதும் அதிகரித்துள்ளன. சூடோப்ரோலைன் டைபெப்டைடுகள் மற்ற அமினோ அமில வழித்தோன்றல்களைப் போலவே அறிமுகப்படுத்தப்படலாம். செரின் மற்றும் த்ரியோனின் கொண்ட பெப்டைடுகளின் எஃப்எம்ஓசி திட கட்ட பெப்டைட் தொகுப்பில் (எஸ்பிபிஎஸ்) சூடோப்ரோலின் (ஆக்ஸசோலிடைன்) டைபெப்டைடுகளின் வழக்கமான பயன்பாடு கச்சா பொருட்களின் தரம் மற்றும் விளைச்சலில் குறிப்பிடத்தக்க முன்னேற்றங்களுக்கு வழிவகுக்கிறது மற்றும் தோல்வியுற்ற வரிசைகளின் தேவையற்ற மீண்டும் மீண்டும் தொகுப்பைத் தவிர்க்க உதவுகிறது. ஊடுருவ முடியாத பெப்டைடுகள், நீண்ட பெப்டைடுகள்/சிறிய புரதங்கள் மற்றும் சுழற்சி பெப்டைடுகள் ஆகியவற்றின் தொகுப்பில் சூடோப்ரோலைன் டைபெப்டைடுகள் குறிப்பாக பயனுள்ளதாக நிரூபிக்கப்பட்டுள்ளன, இது பல சந்தர்ப்பங்களில் பெப்டைடுகளின் உற்பத்தியை செயல்படுத்துகிறது, இல்லையெனில் அதை உருவாக்க முடியாது. இந்த டைபெப்டைடுகள் பயன்படுத்த மிகவும் எளிதானதுஃ பெப்டைட் வரிசையில் முந்தைய அமினோ அமில எச்சத்துடன் ஒரு செரின் அல்லது த்ரோயோனின் எச்சத்தை பொருத்தமான சூடோப்ரோலைன் டைபெப்டைடுடன் மாற்றவும் (உங்கள் வலதுபுறத்தில் உள்ள உருவத்தைப் பார்க்கவும்). பிளவு மற்றும் பாதுகாப்பிழப்பு ஆகியவற்றில் பூர்வீக வரிசை மீண்டும் உருவாக்கப்படுகிறது. பயன்பாடுகள் சமீபத்திய ஆண்டுகளில், டி-20 (டிபி178 என்றும் அழைக்கப்படுகிறது), எப்டிஃபைபாடைடு, ஜிகோனோடைடு, பிராம்லின்டைடு, எக்ஸெனடைடு மற்றும் பிவலிருடின் போன்ற பல பெப்டைடுகள் அமெரிக்க உணவு மற்றும் மருந்து நிர்வாகத்தால் அங்கீகரிக்கப்பட்டுள்ளன, மேலும் அவை பல்வேறு நோய்களுக்கு சிகிச்சையளிப்பதில் பயன்படுத்த சந்தையில் உள்ளன. மிக முக்கியமாக, 2004 ஆம் ஆண்டின் இறுதியில், 600 க்கும் மேற்பட்ட பெப்டைடுகள் வளர்ச்சியில் அல்லது மேம்பட்ட முன்கூட்டிய மருத்துவ கட்டங்களில் இருந்தன. முன்னேற்றங்கள் பாரம்பரியமாக, திட-கட்டத் தொகுப்பு அனைத்து வகையான பெப்டைடுகளின் தொகுப்புக்கும் பாலிஸ்டிரீன் அடிப்படையிலான பிசின்களை நம்பியுள்ளது. இருப்பினும், அவற்றின் அதிக ஹைட்ரோபோபிசிட்டி காரணமாக, இந்த பிசின்கள் சில வரம்புகளைக் கொண்டுள்ளன, குறிப்பாக சிக்கலான பெப்டைடுகளின் தொகுப்பில், அத்தகைய சந்தர்ப்பங்களில், பாலிஎதிலீன் கிளைகோல் (PEG) அடிப்படையிலான பிசின்கள் பெரும்பாலும் சிறந்த முடிவுகளைத் தருகின்றன. சிக்கலான பெப்டைடுகளின் அசெம்பிளியை விரைவுபடுத்துவதற்கான மற்றொரு சக்திவாய்ந்த உத்தி சூடோப்ரோலைன் டைபெப்டைடுகளைப் பயன்படுத்துவதாகும். இந்த வழித்தோன்றல்கள் சங்கிலிகளுக்கிடையேயான தொடர்புகளை சீர்குலைக்கின்றன, அவை பொதுவாக ஒருங்கிணைந்த வரிசைகளில் மோசமான இணைப்பு விளைச்சலுக்கு காரணமாகின்றன. 40 அமினோ அமில எச்சங்கள் வரை கிட்டத்தட்ட அனைத்து பெப்டைட்களின் தொகுப்புக்கும் இரசாயன கருவிகளின் ஒரு பெரிய ஆயுதக் களஞ்சியம் இப்போது கிடைக்கிறது. இருப்பினும், பல சிறிய அளவிலான பெப்டைடுகள் மற்றும் பல பெரிய பெப்டைடுகள் மற்றும்/அல்லது புரதங்கள் இன்னும் பாரம்பரிய முறைகளால் கிடைக்கவில்லை. சமீபத்தில், RANTES (24-91) இன் திறமையான படிப்படியான திட-கட்ட தொகுப்பு வெளியிடப்பட்டது. CD8 + T உயிரணுக்களால் உற்பத்தி செய்யப்படும் ஒரு முக்கிய எச். ஐ. வி-அடக்கும் காரணியாக RANTES உள்ளது. செரின் புரோட்டீஸ் CD26/டைபெப்டிடைல்-பெப்டிடேஸ் IV (CD26/DPP IV) RANTES (1-91) இலிருந்து RANTES (24-91) க்கு ஒரு NH2-முனைய வெட்டுதலைத் தூண்டுகிறது, இது ஒரு M-வெப்பமண்டல எச். ஐ. வி-1 திரிபால் மோனோசைட்டுகளின் நோய்த்தொற்றைத் தடுக்கிறது. இந்த முறை PEG-அடிப்படையிலான கெம்மட்ரிக்ஸ் பிசின் மற்றும் சூடோப்ரோலின் டைபெப்டைடுகளின் நன்மைகளை ஒருங்கிணைக்கிறது. சூடோப்ரோலைன் மோனோமருடன் நேரடி இணைப்பு. செங்கோவும் அவரது சகாக்களும் பாலிபெப்டைட் தொகுப்பில் தனிப்பட்ட, ஒற்றை எச்சங்களின் சூடோப்ரோலைன் வழித்தோன்றல்களின் செயல்திறனை முதன்முதலில் உறுதிப்படுத்தினர். இலக்கியத்தின் படி, செர் (ேடிபிப்ரோ) இன் மாற்றம் சிறந்தது, இருப்பினும் Thr (ேடிப்ரோ) பரந்த அளவில் வேறுபட்டது. சூடோப்ரோலைன் மோனோமரின் அசைலேஷன் அசைலேட்டிங் எச்சத்தின் வேதியியல் தன்மையையும் சார்ந்துள்ளது. மானேவும் அவரது சகாக்களும் மனித வளர்ச்சி ஹார்மோன் (எச்ஜிஹெச்)-பெறப்பட்ட பாலிபெப்டைடை வெற்றிகரமாக ஒருங்கிணைத்தனர், இது முன்பு செர் (ஒசிப்ரோ) ஐப் பயன்படுத்தி அணுக சவாலானது, அதே நேரத்தில் ஜேஆர் 10 Thr (ஒசிப்ரோ) ஐப் பயன்படுத்தியது. சென்கோ மற்றும் பலர் மீது கட்டிடம். Szaniszló மற்றும் சக ஊழியர்கள் சமீபத்தில் Thr இன் அசைலேட்டிங் செயல்திறனை மேம்படுத்தி, அதை தங்கள் தொடர்ச்சியான ஓட்டம் பெப்டைட் ஒருங்கிணைப்பில் இணைத்துள்ளனர். மேலும் காண்கஃ புரோலின் பெப்டிடோமைமெடிக்ஸ் (பெப்டாய்டுகள் மற்றும் β-பெப்டைடுகள் போன்றவை) பெப்டைடுகளுடன் தொடர்புடைய மூலக்கூறுகள், ஆனால் வெவ்வேறு பண்புகளைக் கொண்டவை. பெப்டைட் தொகுப்பு மொழிபெயர்ப்பு ரைபோசோம் குறிப்புகள் சுழற்சி அமினோ அமிலங்கள் பெப்டைடுகள்