BamHI
பாம்ஹி (பாம் எச் ஒன் என்று உச்சரிக்கப்படுகிறது) (பேசிலஸ் அமிலோலிக்விஃபேசியன்ஸிலிருந்து) ஒரு வகை II கட்டுப்பாடு எண்டோநியூக்ளீஸ் ஆகும், இது டிஎன்ஏவின் குறுகிய வரிசைகளை (6 பிபி) அடையாளம் காணும் திறனைக் கொண்டுள்ளது மற்றும் குறிப்பாக அவற்றை ஒரு இலக்கு தளத்தில் பிளவுபடுத்துகிறது. இந்த கண்காட்சி நியூமன் மற்றும் பலர் விவரித்தபடி பாம்ஹியின் கட்டமைப்பு-செயல்பாட்டு உறவுகளில் கவனம் செலுத்துகிறது. (1995). பாம்ஹி 5 '-ஜிஜிஏடிசிசி-3' அங்கீகார வரிசையில் பிணைக்கிறது, மேலும் ஒவ்வொரு இழையிலும் 5 '-குவானைனுக்குப் பிறகு இந்த வரிசைகளை பிளவுபடுத்துகிறது. இந்த பிளவு 4 பிபி நீளமுள்ள ஒட்டும் முனைகளில் விளைகிறது. அதன் வரம்பற்ற வடிவத்தில், பாம்ஹி ஒரு மைய பி தாளைக் காட்டுகிறது, இது α-ஹெலிசுகளுக்கு இடையில் உள்ளது. டிஎன்ஏ அங்கீகாரத்தின் மீது பாம்ஹி தொடர்ச்சியான வழக்கத்திற்கு மாறான இணக்க மாற்றங்களுக்கு உட்படுகிறது. இது டிஎன்ஏவை நொதி பிணைப்பை எளிதாக்குவதற்கு சிதைக்காமல் அதன் இயல்பான பி-டிஎன்ஏ இணக்கத்தை பராமரிக்க அனுமதிக்கிறது. பாம்ஹி ஒரு சமச்சீர் டைமர் ஆகும். டிஎன்ஏ டைமர்களுக்கு இடையில் உருவாகும் ஒரு பெரிய பிளவுக்குள் பிணைக்கப்பட்டுள்ளது; நொதி ஒரு "குறுக்குவெட்டு" முறையில் பிணைக்கிறது. ஒவ்வொரு பாம்ஹி துணைக்குழுவும் அதன் முதுகெலும்பு தொடர்புகளில் பெரும்பகுதியை டிஎன்ஏ அரை தளத்தின் பாஸ்பேட்டுகளுடன் செய்கிறது, ஆனால் அடிப்படை ஜோடி தொடர்புகள் எதிர் டிஎன்ஏ அரை தளத்தின் முக்கிய பள்ளத்தில் உள்ள ஒவ்வொரு பாம்ஹி துணை அலகுக்கும் நைட்ரஜன் தளங்களுக்கும் இடையில் செய்யப்படுகின்றன. புரதத்திற்கும் முக்கிய பள்ளத்தில் உள்ள ஒவ்வொரு எச்-பிணைப்பு நன்கொடையாளர்/ஏற்பி குழுவிற்கும் இடையில் நேரடி ஹைட்ரஜன் பிணைப்புகள் அல்லது நீர்-மத்தியஸ்த எச்-பிணைப்புகள் மூலம் புரதம் தளங்களை பிணைக்கிறது. இணையான 4 ஹெலிக்ஸ் மூட்டையின் அமினோ முனையத்தில் வசிக்கும் அணுக்களால் முக்கிய பள்ளத் தொடர்புகள் உருவாகின்றன. இந்த மூட்டை பாம்ஹி டைமர் இடைமுகத்தைக் குறிக்கிறது, மேலும் இந்த மூட்டையில் உள்ள என்ஹெச்2-முனைய அணுக்களின் இருமுனை தருணங்கள் நிலைமின்னியல் உறுதிப்படுத்தலுக்கு பங்களிக்கக்கூடும் என்று கருதப்படுகிறது. பாம்ஹி மற்றும் டிஎன்ஏ இடையேயான அடையாளம் காணும் தளங்கள் பாம்ஹி நொதி டிஎன்ஏவுடன் அதிக எண்ணிக்கையிலான தொடர்புகளை உருவாக்கும் திறன் கொண்டது. நீர்-மத்தியஸ்த ஹைட்ரஜன் பிணைப்பு, அதே போல் பிரதான-சங்கிலி மற்றும் பக்க-சங்கிலி தொடர்புகள் இரண்டும் பாம்ஹி அங்கீகார வரிசையை பிணைக்க உதவுகின்றன. முக்கிய பள்ளத்தில், பெரும்பாலான நொதி/டிஎன்ஏ தொடர்புகள் இணையான-4-ஹெலிக்ஸ் மூட்டையின் அமினோ முனையத்தில் நடைபெறுகின்றன, இது ஒவ்வொரு துணைக்குழுவிலிருந்தும் ஏ 4 மற்றும் ஏ 6 ஆல் ஆனது. ஒவ்வொரு துணைக்குழுவிலிருந்தும் a6 டிஎன்ஏ முக்கிய பள்ளத்திற்குள் நுழையவில்லை என்றாலும், அதன் முந்தைய சுழல்கள் அங்கீகார தளத்தின் வெளிப்புற முனைகளுடன் தொடர்பு கொள்கின்றன. மாறாக, ஒவ்வொரு துணைக்குழுவிலிருந்தும் a4 அங்கீகார வரிசையின் மையத்தில் உள்ள முக்கிய பள்ளத்திற்குள் நுழைகிறது. 6 அடிப்படை ஜோடி அங்கீகார வரிசை (12 நேரடி மற்றும் 6 நீர் மத்தியஸ்த பிணைப்புகள்) முழுவதும் நொதி மற்றும் டிஎன்ஏ இடையே மொத்தம் 18 பிணைப்புகள் உருவாகின்றன. a6 க்கு முன் ஒரு சுழல் வளையத்தில் அமைந்துள்ள Arg155 மற்றும் ASP154 ஆகியவை G: C அடிப்படை ஜோடிகளுடன் வெளியே இணைக்கப்பட்டுள்ளன, அதே நேரத்தில் நடுத்தர G: C ஜோடிகள் ASP154, Arg122 மற்றும் ASn116 (நேரடி பிணைப்பு) உடன் இணைக்கப்பட்டுள்ளன. தண்ணீருக்கும் ஏஎன்116 க்கும் இடையிலான ஹைட்ரஜன் பிணைப்பு உள்ளே ஏஃடி அடிப்படை ஜோடிகளில் பிணைப்பை விளைவிக்கிறது (நீர்-மத்தியஸ்த பிணைப்பு). மேலே விவாதிக்கப்பட்டபடி, எல் மற்றும் ஆர் துணை அலகுகள் ஒரு குறுக்கு வழியில் பிணைக்கப்படுகின்றன, இதன் மூலம் பாம் எச் I இன் ஆர்-துணை அலகு அங்கீகார வரிசையின் இடது டிஎன்ஏ அரை தளத்தைத் தொடர்புகொள்கிறது. ஒவ்வொரு பாம் எச் I துணைக்குழுவின் பிணைப்பும் துல்லியமாக அதன் சமச்சீர் கூட்டாளியைப் போலவே இருக்கும். பாம் எச் I க்கான அங்கீகார தளம் ஒரு பாலிண்ட்ரோமிக் வரிசையைக் கொண்டுள்ளது, இது பிணைப்புகளைக் காண்பிப்பதில் எளிதாக பாதியாக வெட்டப்படலாம். அங்கீகார தளமான ஜி. ஜி. ஏ. டி. சி. சி. சி. டி. ஏ. ஜி. ஜி 2010 ஆம் ஆண்டின் இறுதியில், புரோட்டீன் டேட்டா பேங்க் டூ-மெட்டல் மெக்கானிசம் பாம்ஹியில் பாம்ஹெச் I இன் 5 படிக கட்டமைப்புகள் இருந்தன, மற்ற வகை II கட்டுப்பாடு எண்டோநியூக்ளியேஸ்களைப் போலவே, டிஎன்ஏ பிளவுகளை ஊக்குவிக்க பெரும்பாலும் டைவலன்ட் உலோகங்கள் கோஃபாக்டர்களாக தேவைப்படுகின்றன. பாம்ஹி படிக அமைப்பு செயலில் உள்ள இடத்தில் இரண்டு உலோக அயனிகளை பிணைக்கும் திறனைக் கொண்டிருப்பதால், இரண்டு உலோக அயனி பொறிமுறை பாம்ஹியின் சாத்தியமான வினையூக்கி வழிமுறைகளில் ஒன்றாகும், இது கிளாசிக்கல் இரண்டு உலோக அயனி பொறிமுறையைத் தொடர ஏற்றது. இரண்டு உலோக அயனி பொறிமுறை என்பது கட்டுப்பாட்டு நொதியின் பிளவு எதிர்வினையை ஊக்குவிக்க இரண்டு உலோக அயனிகளைப் பயன்படுத்துவதாகும். பாம்ஹிஐ உலோக வினையூக்கிக்கு முக்கியமான மூன்று முக்கியமான செயலில் உள்ள தள எச்சங்களைக் கொண்டுள்ளது. அவை ஆஸ்ப்94, குளூ111 மற்றும் குளூ113 என அழைக்கப்படுகின்றன. இந்த எச்சங்கள் பொதுவாக அமிலத்தன்மை கொண்டவை. ஒரு உலோக அயனியின் முன்னிலையில், எச்சங்கள் உலோக அயனியை நோக்கி சுட்டிக்காட்டப்படுகின்றன. உலோக அயனிகள் இல்லாத நிலையில், எச்சங்கள் வெளிப்புறமாக சுட்டிக்காட்டப்படுகின்றன. இரண்டு உலோக அயனிகள் (ஏ மற்றும் பி) செயலில் உள்ள தளத்தில் ஒருவருக்கொருவர் 4,1 இடைவெளியில் உள்ளன மற்றும் இந்த எச்சங்களுடன் இணையாக உள்ளன. பொதுவாக, இரண்டு உலோக அயனிகள் (ஏ மற்றும் பி) செயலில் உள்ள இடத்துடன் பிணைக்கப்படும்போது, அவை மாற்றத்தின் போது ஒரு ஆக்ஸிஜன் அணு வெளியேறுவதன் மூலம் உருவாக்கப்பட்ட செயலில் உள்ள இடத்தில் உள்ளூர்மயமாக்கப்பட்ட எதிர்மறை மின்னூட்டங்களின் கொத்து விநியோகத்தை உறுதிப்படுத்த உதவுகின்றன. முதலாவதாக, ஒரு நீர் மூலக்கூறு உலோக அயனி ஏ மூலம் செயலில் உள்ள இடத்தில் செயல்படுத்தப்படும். இந்த நீர் மூலக்கூறு பாம்ஹி-டிஎன்ஏ வளாகத்தைத் தாக்கும் தாக்குதல் மூலக்கூறாக செயல்படும், இதனால் சிக்கலான எதிர்மறையை உருவாக்கும். பின்னர், மற்றொரு நீர் உலோக அயனி B உடன் பிணைக்கப்பட்டு, காம்ப்லெக்ஸின் இடது குழுவிற்கு ஒரு புரோட்டனை தானம் செய்யும், இது விட்டுச்செல்லும் ஆக்ஸிஜன் அணுவில் எதிர்மறை சார்ஜ் கட்டமைப்பை உறுதிப்படுத்துகிறது. பாம்ஹியின் செயலில் உள்ள தளத்தில் Ca2 + இன் செயல்பாடு அறியப்படுகிறது. இது டிஎன்ஏ பிளவுகளைத் தடுப்பதாகும், இது பாம்ஐஐயை எதிர்வினைக்கு முந்தைய நிலைக்கு மாற்றுகிறது. இது நீர் மூலக்கூறு தாக்குதல் மூலக்கூறு என்பதை வெளிப்படுத்தியது. இது 90o O-P-O பிணைப்பு கோணங்களை உருவாக்கும் Ca2 + உடன் பிணைக்கப்பட்டிருக்கும் வெளியேறும் குழுவிற்கு ஒரு புரோட்டனை நன்கொடையாக அளிக்கிறது. க்ளூ 113 லைசினால் மாற்றப்பட்டால், க்ளூ 113 தாக்குதல் நீர் மூலக்கூறிலிருந்து புரோட்டனை ஏற்றுக்கொள்வதால் பிளவு இழக்கப்படுகிறது. உயிரியல் முக்கியத்துவம் குறிப்பிட்ட டிஎன்ஏ வரிசையை அடையாளம் கண்டு ஒரு நியூக்ளியேஸ் மூலம் பிளவுபடுத்தும் திறன் காரணமாக, வகை II கட்டுப்பாடு எண்டோநியூக்லீஸைப் புரிந்துகொள்வதிலும், டிஎன்ஏவை குளோனிங் செய்வதிலும், மரபணு சிகிச்சையின் மூலம் சில டிஎன்ஏ பிறழ்விலிருந்து பெறப்பட்ட நோய்களுக்கு சிகிச்சையளிப்பதிலும் பாம்ஹெச்ஐ பல்வேறு முக்கியத்துவங்களைக் கொண்டுள்ளது. எடுத்துக்காட்டாக, என். ஏ. ஆர். பி மற்றும் எம். ஐ. எல். எஸ் நோய்க்குறிகள் மைட்டோகாண்ட்ரியல் நோய்கள் ஆகும், அவை மைட்டோகாண்ட்ரியல் டிஎன்ஏவில் உள்ள பிறழ்வுகளால் ஏற்படலாம். மிட்டோகாண்ட்ரியா கட்டுப்பாடு எண்டோநியூக்ளீஸ் மூலம் பிறழ்வு வரிசையை அகற்றிய பிறகு அதன் செயல்பாடுகளை மீட்டெடுக்க முடியும். மேற்கோள்கள் மேலும் வாசிப்பு வெளிப்புற இணைப்புகள் 5 படிக கட்டமைப்புகள் மூலக்கூறு உயிரியல் உயிரி தொழில்நுட்ப கட்டுப்பாடு நொதிகள்