Transmembrane protein 89
டிரான்ஸ்மெம்பிரேன் புரதம் 89 (TMEM89) என்பது மனிதர்களில் TMEM89 மரபணுவால் குறியிடப்பட்ட ஒரு புரதமாகும். மரபணு அமைப்பு TMEM89 மரபணு குரோமோசோம் 3 (3p21.31) இன் மைனஸ் ஸ்ட்ராண்டில் 48,658,192 முதல் 48,659,288 வரை காணப்படுகிறது மற்றும் 1,011 நியூக்ளியோடைடுகள் நீளமானது. இந்த மரபணுவில் இரண்டு எக்ஸான்கள் உள்ளன. இந்த இரண்டு எக்ஸான்களும் மாறி மாறி பிளவுபடும் என்று கணிக்கப்படவில்லை. மரபணு வெளிப்பாடு TMEM89 மரபணு விந்தணுக்களில் மிகவும் அதிகமாக வெளிப்படுத்தப்படுகிறது. வயிறு, சிறுநீரகங்கள், இதயம், கருப்பைகள், தைராய்டு, பெருங்குடல், எலும்பு மஜ்ஜை மற்றும் அட்ரீனல் திசுக்கள் போன்ற பிற திசுக்களில் TMEM89 குறைந்த அளவுகளில் வெளிப்படுகிறது. கருவின் இதயம், வயிறு, சிறுநீரகம் மற்றும் குடல் திசுக்களிலும் இந்த மரபணு வெளிப்படுகிறது. இம்யூனோஹிஸ்டோகெமிஸ்ட்ரி தரவு பெருங்குடல், பல்லுயிர் குழாய், சிறுநீரகம் மற்றும் விந்தணு திசுக்களின் செல் சவ்வுகளில் அமைந்துள்ள TMEM89 ஐக் கண்டறிந்துள்ளது. TMEM89 மரபணுவின் வெளிப்பாடு ஒரு சுட்டி பெருமூளை இருந்து மூளை திசுக்களில் குறைந்த அளவில் கண்டறியப்பட்டுள்ளது. மனித TMEM89 என்பது மனித புரத அட்லஸ் வெளிப்பாடு கிளஸ்டர் 23: ஸ்பெர்மாடிட்ஸ்-ஃபிளாஜெல்லம் & கோல்ஜி அமைப்பின் ஒரு பகுதியாகும். 15 நெருங்கிய வெளிப்பாட்டு அண்டை நாடுகளில் OR4M1, ANTXRL, TGIF2LX, CPXCR1, C3orf84, CXorf66, CLDN17, C11orf94, USP50, SPDYE4, MMP20, SSMEM1, C17orf98, SPACA1 மற்றும் LYZL1 ஆகியவை அடங்கும். அழியாத எச்ஐபாட் லைன் செல்களுடன் ஒப்பிடும்போது அம்னோடிக் திரவத்திலிருந்து பெறப்பட்ட எச்ஏகேபிசி-பி செல்களில் வேறுபட்ட மரபணு வெளிப்பாடு டிஎம்இஎம்89 வெளிப்பாடு மிகவும் அதிகமாக உள்ளது. டிஎம்இஎம்89 வெளிப்பாடு மேக்ரோபேஜ் இடம்பெயர்வு தடுப்பு காரணி (எம்ஐஎஃப்) கட்டுப்பாட்டுடன் ஒப்பிடும்போது கீழே தள்ளப்பட்ட உயிரணுக்களில் அதிகமாக உள்ளது. மனித கரு ஸ்டெம் செல்கள், துடிக்கும் கார்டியோமயோசைட்டுகள் கொண்ட கரு உடல்கள் மற்றும் கருவின் இதயத்திலிருந்து கார்டியோமயோசைட்டுகள் ஆகியவற்றின் வெளிப்பாட்டுடன் ஒப்பிடும்போது, மனித கரு ஸ்டெம் செல்களில் இருந்து வரும் கார்டியோமயோசைட்களில் TMEM89 வெளிப்பாடு மிகக் குறைவு. மருத்துவ முக்கியத்துவம் TMEM89 இன் மரபணு வெளிப்பாடு மேல் பாதை யூரோடெலியல் புற்றுநோய்களில் கட்டுப்படுத்தப்படுவது கண்டறியப்பட்டது, எனவே இந்த வகையான புற்றுநோய்களுக்கு சாத்தியமான பயோமார்க்கர் சுரக்கும் புரதமாக கணிக்கப்பட்டது. TMEM89 மரபணு ஒரு SNP பகுப்பாய்வில் ஆட்டிசம் ஸ்பெக்ட்ரம் கோளாறு தீவிரத்தின் சாத்தியமான மாற்றியாக இருப்பது கண்டறியப்பட்டது. TMEM89 இன் மரபணு வெளிப்பாடு ஒரு மாதிரியிலும் பயன்படுத்தப்பட்டது, இது நிலை 1 விந்தணு கிருமி செல் கட்டிகளில் சாத்தியமான மறுபிறப்புக்கான ஆபத்து மதிப்பெண்ணை முன்னறிவித்தது. புரத அமைப்பு முதன்மை மனித TMEM89 புரதம் 159 அமினோ அமிலங்கள் கொண்டது. இந்த புரதம் ~ 17.5kDa மூலக்கூறு நிறை மற்றும் ~ 10 pI இன் ஐசோ எலக்ட்ரிக் புள்ளியைக் கொண்டுள்ளது. மிகவும் அடிப்படை பிஐ கொண்ட புரதங்கள் பொதுவாக மைட்டோகாண்ட்ரியா அல்லது பிளாஸ்மா சவ்வுடன் தொடர்புடையவை மற்றும் குறைவான புரத தொடர்புகளைக் கொண்டுள்ளன. புரத அமைப்பு இரண்டு இடவியல் களங்களைக் கொண்டுள்ளது (செல்களுக்கு வெளியே மற்றும் சைட்டோபிளாஸ்மிக்) மற்றும் ஒரு சுழல் டிரான்ஸ்மெம்பிரேன் களம். மனித TMEM89 புரதத்தில் அமினோ அமிலங்கள் ஹிஸ்டிடின், லியூசின் மற்றும் டிரிப்டோபான் நிறைந்துள்ளன. மனித TMEM89 புரதத்தில் அஸ்பார்டேட், அஸ்பாரஜின் மற்றும் ஃபெனைலாலனைன் அமினோ அமிலங்கள் குறைந்த அளவில் உள்ளன. ED போன்ற அமினோ அமில வடிவங்கள் மனித TMEM89 புரதத்தில் குறைந்த அளவில் உள்ளன, அதே நேரத்தில் KR-ED வடிவம் அதிக அளவில் உள்ளது. மனித TMEM89 புரதத்தின் செல்லுலார் களத்திற்குள், வழக்கமான இடைவெளியுடன் 3 சிஸ்டைன்கள் உள்ளன. சைட்டோபிளாஸ்மிக் களத்தில், அமினோ அமிலங்கள் 3-5 மற்றும் 25-27 ஆகியவற்றிலிருந்து இரண்டு நேர்மறை அமினோ அமிலங்கள் இயங்குகின்றன. இந்த வெவ்வேறு அமினோ அமில வடிவங்கள் மற்றும் புரத களங்களை வலதுபுறத்தில் உள்ள புள்ளிவிவரங்களில் காணலாம். இரண்டாம் நிலை TMEM89 புரதம் α-ஹெலிசஸ் மற்றும் இழைகளால் மட்டுமே ஆனது. α-ஹெலிசஸ் மூன்று களங்களிலும் புரதம் முழுவதும் விநியோகிக்கப்படுகின்றன. மூன்றாம் நிலை மனித TMEM89 இன் மூன்றாம் நிலை அமைப்பு ஆல்பாஃபோல்ட் மற்றும் ஐ-டாஸர் மென்பொருளைப் பயன்படுத்தி கணிக்கப்பட்டது. இந்த கட்டமைப்புகளை வலதுபுறத்தில் காணலாம். மொழிபெயர்ப்புக்குப் பிந்தைய மாற்றங்கள் TMEM89 புரதம் அமினோ அமிலங்கள் 47-52 இலிருந்து கணிக்கப்பட்ட N-மிரிஸ்டைலேஷன் தளத்தையும், அமினோ அமிலங்கள் 106-111 இலிருந்து கணிக்கப்பட்ட Src ஹோமோலஜி 3 (SH3) பிணைப்பு களத்தையும், அமினோ அமிலம் S117 இல் பாதுகாக்கப்பட்ட கணிக்கப்பட்ட பாஸ்பரிலேஷன் தளத்தையும் கொண்டுள்ளது. என்-மிரிஸ்டைலேஷன் என்பது ஒரு புரத கொழுப்பு மாற்றமாகும், இது புரத-புரத தொடர்புகள், செல் சமிக்ஞை மற்றும் எண்டோமெம்ப்ரேன்கள் மற்றும் பிளாஸ்மா சவ்வுக்கு புரதங்களை குறிவைப்பதில் பங்கு வகிக்கிறது. SH3 பிணைப்பு களங்களைக் கொண்ட புரதங்கள் பொதுவாக சமிக்ஞை கடத்தல் பாதைகள், சைட்டோஸ்கெலிடன் அமைப்பு, சவ்வு கடத்தல் அல்லது ஆர்கனெல்லே அசெம்பிளி ஆகியவற்றில் ஈடுபட்டுள்ளன. புரோட்டீன் பாஸ்பரிலேஷன் என்பது சமிக்ஞை கடத்தல், புரதத் தொகுப்பு, உயிரணு பிரிவு, உயிரணு வளர்ச்சி, வளர்ச்சி மற்றும் முதுமை ஆகியவற்றுடன் தொடர்புடைய ஒரு முக்கியமான செயல்முறையாகும். மனித டி. எம். இ. எம்89 புரதம் சி4ஏ, ஆர். பி. எம்15பி, ஜி. ஓ. எல். ஜி. ஏ6ஏ, பி. எஃப். கே. எஃப். பி4, டி. ஓ. சி. கே3, எம். ஏ. பி. கே. ஏ. பி. கே3, இசட். என். எஃப்557, இசட். பி. டி. பி47 ஆகிய புரதங்களுடன் தொடர்பு கொள்கிறது. TMEM89 இன் எலும்பியல் பாலூட்டிகளில் மட்டுமே காணப்படுகின்றன. டி. எம். இ. எம்89 ஆர்த்தோலாக் இல்லாத ஒரே பாலூட்டி வகைப்பாட்டி மோனோட்ரீம்கள் ஆகும். மனித TMEM89 இன் சில ஆர்த்தோலாக்கள் பற்றிய தகவல்களுடன் ஒரு அட்டவணை கீழே உள்ளது. இந்த ஆர்த்தோலாக்கள் பல வரிசை சீரமைப்பு மற்றும் வலதுபுறத்தில் என்-மிரிஸ்டைலேஷன் தள சீரமைப்பை உருவாக்க பயன்படுத்தப்பட்டன. வலதுபுறத்தில் உள்ள புள்ளிவிவரங்களில் காணப்படுவது போல், மனித TMEM89 புரதத்தின் சைட்டோபிளாஸ்மிக் மற்றும் எக்ஸ்ட்ரா செல்லுலார் களங்களுக்குள் உள்ள பாதுகாக்கப்பட்ட பகுதிகள் மிகவும் பாதுகாக்கப்பட்டதாகத் தெரிகிறது. இந்த பாதுகாக்கப்பட்ட அமினோ அமிலங்களில் சில சைட்டோபிளாஸ்மிக் மற்றும் எக்ஸ்ட்ராசெல்லுலர் பகுதிகளில் உள்ள α-ஹீலிக்ஸின் ஒரு பகுதியாகும். மனித குரோமோசோம் 3 பற்றிய குறிப்புகள் மரபணுக்கள்