Global coordination level
உலகளாவிய ஒருங்கிணைப்பு நிலை (ஜி. சி. எல்) என்பது ஒரு கணக்கீட்டு முறையாகும், இது மாறிகளின் சீரற்ற துணைக்குழுக்களுக்கு இடையிலான தூர தொடர்பைக் கணக்கிடுவதன் மூலம் பல மாறுபட்ட தரவுகளில் கணினி அளவிலான சார்பு மதிப்பீடு செய்கிறது. முதலில் மரபணு வெளிப்பாடு தரவுகளுக்கு பயன்படுத்தப்பட்டது, ஜி. சி. எல் மரபணுக்களுக்கு இடையிலான ஒருங்கிணைப்பின் அளவை மதிப்பிடுகிறது, அவை பணிகள் மற்றும் உயிரியல் செயல்பாடுகளைச் செய்வதில் அடிப்படையில் இணைக்கப்பட்டுள்ளன. மரபணுக்களுக்கு இடையிலான ஜோடி வாரியான தொடர்புகள் பற்றிய துல்லியமான அறிவு தேவைப்படும் பாரம்பரிய முறைகளைப் போலல்லாமல், ஜி. சி. எல் அத்தகைய தகவல்கள் இல்லாமல் ஒருங்கிணைப்பை மதிப்பீடு செய்ய முடியும். பூஜ்ஜியத்தின் ஜி. சி. எல் மதிப்பு சுயாதீனமான மரபணு வெளிப்பாட்டைக் குறிக்கிறது, அதே நேரத்தில் பூஜ்ஜியத்திற்கு மேலே உள்ள மதிப்புகள் மரபணு-மரபணு ஒழுங்குமுறை தொடர்புகளைக் குறிக்கின்றன. உதாரணமாக, கியோட்டோ என்சைக்ளோபீடியா ஆஃப் ஜீன்ஸ் அண்ட் ஜீனோம்ஸ் (கே. இ. ஜி. ஜி) தரவுத்தளத்தில் அறியப்பட்ட மரபணு பாதைகளுக்கு ஜி. சி. எல் பயன்படுத்தப்படும்போது, அது கணிசமாக நேர்மறையான மதிப்புகளை அளிக்கிறது, அதே நேரத்தில் மரபணுக்களின் சீரற்ற துணைக்குழுக்கள் அல்லது ஒத்த மரபணு வெளிப்பாடு நிலைகளைக் கொண்ட போலி பாதைகள் மிகக் குறைந்த ஜி. சி. எல் மதிப்புகளைக் காட்டுகின்றன. கூடுதலாக, உயர் பரிமாண சுற்றுச்சூழல் மற்றும் உயிர்வேதியியல் இயக்கவியலை பகுப்பாய்வு செய்வதில் ஜி. சி. எல் பயனுள்ளதாக இருக்கும். மரபணு ஒழுங்குமுறை நெட்வொர்க் என்று அழைக்கப்படும் ஒரு சிக்கலான கட்டமைப்பில் மரபணுக்கள் ஒருவருக்கொருவர் தொடர்பு கொள்கின்றன, இது பல்வேறு உயிரியல் செயல்பாடுகளை செயல்படுத்துவதிலும் உயிரணுக்களுக்குள் வெவ்வேறு பணிகளைச் செய்வதிலும் முக்கிய பங்கு வகிக்கிறது. இருப்பினும், அதிக எண்ணிக்கையிலான செயல்பாட்டு மரபணுக்கள் மற்றும் இந்த அமைப்புகளின் உள்ளார்ந்த சீரற்ற தன்மை காரணமாக மரபணு ஒழுங்குமுறை வலையமைப்பின் துல்லியமான ஜோடி வாரியான தொடர்புகளை ஊகிப்பது சவாலானது. இந்த சவால்கள் இருந்தபோதிலும், அனைத்து தொடர்புகளையும் முழுமையாக ஊகிக்காமல் மரபணு ஒழுங்குமுறை வலையமைப்பின் சில அம்சங்களை இன்னும் பிரித்தெடுக்க முடியும். உதாரணமாக, சாத்தியமான அனைத்து தொடர்புகளுடன் ஒப்பிடும்போது உண்மையான மரபணு-மரபணு தொடர்புகளின் அடர்த்தியைக் குறிக்கும் நெட்வொர்க் இணைப்பு, பொதுவான செல்லுலார் செயல்முறைகளுக்கு முக்கியமான தாக்கங்களைக் கொண்டிருக்கலாம். முறை விளக்கம் நிபந்தனைக்குட்பட்ட சாத்தியக்கூறுகளின் (சி. எல்) கணக்கீடு என்பது கொடுக்கப்பட்ட உயிரணுக்களின் தொகுப்பில் உள்ள மரபணுக்களுக்கு இடையிலான பன்முக சார்புகளை அடிப்படையாகக் கொண்டது. இது மரபணுக்களின் துணைக்குழுக்களை சீரற்ற முறையில் தேர்ந்தெடுப்பதற்கும், படைப்பில் விவரிக்கப்பட்டுள்ளபடி அவற்றுக்கிடையேயான தூர தொடர்பைக் கணக்கிடுவதற்கும் ஒரு தொடர்ச்சியான செயல்முறையை உள்ளடக்கியது. இத்தகைய பல மரபணு துணைக்குழுக்களை சராசரியாகக் கணக்கிடுவதன் மூலம், மரபணுக்களுக்கு இடையிலான ஒட்டுமொத்த சார்புகளை மதிப்பிடுவதற்கு மரபணு இணைப்பு நிலப்பரப்பு (ஜி. சி. எல்) எனப்படும் ஒற்றை எண் மதிப்பு பெறப்படுகிறது. இருப்பினும், GCL இன் துல்லியம் மற்றும் நம்பகத்தன்மையை உறுதிப்படுத்த பல முக்கியமான முன் மற்றும் பிந்தைய செயலாக்க நடவடிக்கைகள் கணக்கில் எடுத்துக்கொள்ளப்பட வேண்டும். முதலாவதாக, பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்ட செல்களின் தொகுப்பை துணைக்குழுக்களாகப் பிரிக்க கிளஸ்டரிங் முறைகள் பயன்படுத்தப்பட வேண்டும், மேலும் ஒரே மாதிரியான தன்மையை உறுதிப்படுத்த ஒவ்வொரு துணைக்குழுவிற்கும் அல்லது மிகப்பெரிய ஒன்றிற்கும் ஜி. சி. எல் தனித்தனியாக கணக்கிடப்பட வேண்டும். இரண்டாவதாக, ஜி. சி. எல் கணக்கீட்டில் அவற்றின் தேவையற்ற செல்வாக்கைத் தவிர்க்க மற்ற செல்கள் ('அவுட்லையர்கள்' என்று குறிப்பிடப்படுகின்றன) அல்லது ஒருவருக்கொருவர் மிகவும் ஒத்திருக்கும் செல்கள் ('இன்லையர்கள்' என்று குறிப்பிடப்படுகின்றன) ஆகியவற்றிலிருந்து கணிசமாக விலகும் செல்கள் வடிகட்டப்பட வேண்டும். கூடுதலாக, ஜாக்னைஃப் பகுப்பாய்வு, பகுப்பாய்விலிருந்து உயிரணுக்களின் துணைக்குழுக்களை முறையாக நீக்குவது மற்றும் ஜி. சி. எல். ஐ மறுபரிசீலனை செய்வது ஆகியவை முடிவுகளின் ஸ்திரத்தன்மையை சோதிக்க செய்யப்பட வேண்டும். இந்த படிகள் அவசியம், ஏனென்றால் ஜி. சி. எல், மற்ற தொடர்பு நடவடிக்கைகளைப் போலவே, அசாதாரண செல்கள் மற்றும் பன்முகக் குழுக்களுக்கு உணர்திறன் கொண்டதாக இருக்கும், குறிப்பாக அரிதான, சத்தம் மற்றும் வெளிப்புற-பாதிப்புள்ள எஸ். சி. ஆர். என். ஏ-செக் தரவுகளின் சூழலில். பயன்பாடுகள் வயதானவர்கள்ஃ டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனல் ஒழுங்குமுறையின் தற்செயலான பிறழ்வு வயதான செயல்முறையில் ஒரு மேலாதிக்க காரணியாகும். இருப்பினும், பல ஒற்றை-செல் ஆர். என். ஏ-வரிசைமுறை தரவுத்தொகுப்புகளில் ஜி. சி. எல்-களை மதிப்பிடும்போது, வயதிற்கு ஏற்ப ஜி. சி. எல்-இன் சரிவு பல்வேறு உயிரினங்கள் மற்றும் உயிரணு வகைகளில் தொடர்ந்து காணப்படுகிறது. குறிப்பிடத்தக்க வகையில், ஒற்றை-செல் ஆர்என்ஏ-செக் தரவுகளின் அடிப்படையில் சுட்டி ஹீமாடோபோயிடிக் ஸ்டெம் செல்களில் ஜிசிஎல்லில் குறிப்பிடத்தக்க சரிவுகள் காணப்பட்டன, இது வயதான கோட்பாட்டை டிஸ்-வேறுபாடு என்று ஆதரிக்கிறது. 1970 களில் ரிச்சர்ட் கட்லரால் முதலில் முன்வைக்கப்பட்ட இந்த யோசனை, செல்கள் வயதாகும்போது அவற்றின் சரியான வேறுபாடு நிலையில் இருந்து விலகிச் செல்கின்றன என்பதைக் குறிக்கிறது, இது வயதான திசுக்களில் பொதுவாக அமைதியாக இருக்க வேண்டிய மரபணுக்களை செயல்படுத்துவதன் மூலம் சான்றளிக்கப்படுகிறது. உயிரியல் மாறுபாட்டை அளவிடுதல்ஃ மரபணு தொடர்புகளிலிருந்து எழும்போது மட்டுமே அதிகரித்த 'உயிரியல் மாறுபாடு' கொண்ட உயிரணுக்களின் குழுக்களில் ஜி. சி. எல் குறைகிறது. கோஹோர்ட்களில் அறிமுகப்படுத்தப்பட்ட உயிரியல் மற்றும் தொழில்நுட்ப மாறுபாட்டிற்கு இடையிலான விகிதத்தை மதிப்பிடுவதற்கும் ஒப்பிடுவதற்கும் ஜி. சி. எல் பயன்படுத்தப்படலாம். குறிப்புகள் கணக்கீட்டு உயிரியல் கணக்கீட்டு அறிவியல் ஸ்டப்கள்