DREAM Challenges
டிரீம் சேலஞ்சஸ் (டயலொக் ஃபார் ரிவர்ஸ் இன்ஜினியரிங் அஸெஸ்மென்ட் அண்ட் மெத்தட்ஸ்) என்பது கூட்டமான போட்டிகளின் மூலம் உயிரியல் மருத்துவம் மற்றும் அமைப்புகள் உயிரியல் ஆராய்ச்சியை மேம்படுத்துவதற்கான ஒரு இலாப நோக்கற்ற முயற்சியாகும். 2006 ஆம் ஆண்டில் தொடங்கப்பட்ட ட்ரீம் சேலஞ்சஸ், சைனாப்ஸ் மேடையில் நடைபெறும் போட்டிகளுக்கு ஒரு தளத்தை வழங்க சேஜ் பயோனெட்வொர்க்ஸ் உடன் ஒத்துழைக்கிறது. 15 ஆண்டுகளுக்கும் மேலாக 60க்கும் மேற்பட்ட கனவு சவால்கள் நடத்தப்பட்டுள்ளன. கண்ணோட்டம் கனவு சவால்கள் 2006 ஆம் ஆண்டில் ஐபிஎம் ஆராய்ச்சியைச் சேர்ந்த குஸ்டாவோ ஸ்டோலோவிஸ்கி மற்றும் கொலம்பியா பல்கலைக்கழகத்தைச் சேர்ந்த ஆண்ட்ரியா கலிஃபானோ ஆகியோரால் நிறுவப்பட்டது. ட்ரீம் அமைப்பின் தற்போதைய தலைவர் கலிபோர்னியா பல்கலைக்கழகத்தைச் சேர்ந்த பால் பூட்ரோஸ் ஆவார். மேலும் அமைப்பு எமிரிட்டஸ் தலைவர்களான ஜஸ்டின் கின்னி மற்றும் குஸ்டாவோ ஸ்டோலோவிஸ்கி மற்றும் பல ட்ரீம் இயக்குநர்கள் வரை பரவியுள்ளது. தனிப்பட்ட சவால்கள் ஒரு குறிப்பிட்ட உயிரியல் மருத்துவ ஆராய்ச்சி கேள்வியைக் கையாள்வதில் கவனம் செலுத்துகின்றன, பொதுவாக ஒரு குறிப்பிட்ட நோய்க்கு சுருக்கமாக உள்ளன. மார்பக புற்றுநோய், கடுமையான மைலாய்டு லுகேமியா மற்றும் புரோஸ்டேட் புற்றுநோய் அல்லது அது போன்ற நோய்களில் கவனம் செலுத்திய பல கடந்தகால சவால்களுடன், புற்றுநோயியல் மீது ஒரு முக்கிய நோய் கவனம் செலுத்தப்பட்டுள்ளது. ஒரு தனிப்பட்ட சவாலில் சம்பந்தப்பட்ட தரவு நோய் சூழலை பிரதிபலிக்கிறது; புற்றுநோய்கள் பொதுவாக மனித மரபணுவில் உள்ள பிறழ்வுகள், மரபணு வெளிப்பாடு மற்றும் டிரான்ஸ்கிரிப்டோமிக்ஸில் உள்ள மரபணு நெட்வொர்க்குகள் மற்றும் பெரிய அளவிலான புரோட்டியோமிக்ஸ் போன்ற தரவுகளை உள்ளடக்கியிருந்தாலும், புதிய சவால்கள் ஒற்றை செல் வரிசைமுறை தொழில்நுட்பங்கள் மற்றும் வளர்ந்து வரும் குடல் நுண்ணுயிரியல் தொடர்பான ஆராய்ச்சி கேள்விகளை நோக்கி மாறிவிட்டன, இதனால் பரந்த ஆராய்ச்சி சமூகத்தின் போக்குகளை பிரதிபலிக்கிறது. கனவு சவால்களுக்கான உந்துதல் என்னவென்றால், போட்டிகள் மூலம் ஒரு பெரிய பார்வையாளர்களுக்கு க்ரவுட் சோர்சிங் தரவு மூலம், பகுப்பாய்வு ஒரு நிறுவனத்தால் நடத்தப்பட்டதை விட சிறந்த மாதிரிகள் மற்றும் நுண்ணறிவு பெறப்படுகிறது. நேச்சர் போர்ட்ஃபோலியோ மற்றும் பி. எல். ஓ. எஸ் வெளியீட்டு குழுக்களின் முதன்மை இதழ்கள் போன்ற அறிவியல் இடங்களில் கடந்தகால போட்டிகள் வெளியிடப்பட்டுள்ளன. DREAM சவால்களின் முடிவுகள் இணைய தளங்கள் மூலம் அறிவிக்கப்படுகின்றன, மேலும் சிறந்த செயல்திறன் கொண்ட பங்கேற்பாளர்கள் தங்கள் முடிவுகளை ISCB ஆல் ஏற்பாடு செய்யப்படும் வருடாந்திர RECOMB/ISCB மாநாடுகளில் RSG/DREAM உடன் முன்வைக்க அழைக்கப்படுகிறார்கள். DREAM சவால்கள் திறந்த அறிவியல் மற்றும் தரவை வலியுறுத்தியிருந்தாலும், நோயாளிகளின் குழுக்களில் மரபியல் போன்ற மிகவும் உணர்திறன் வாய்ந்த தரவுகளிலிருந்து எழும் சிக்கல்களைத் தணிப்பதற்காக, "தரவுகளுக்கு மாதிரி" அணுகுமுறைகள் ஏற்றுக்கொள்ளப்பட்டுள்ளன. இத்தகைய சவால்களில் பங்கேற்பாளர்கள் டோக்கர் அல்லது சிங்குலாரிட்டி போன்ற கொள்கலன்கள் மூலம் தங்கள் மாதிரிகளை சமர்ப்பிக்கிறார்கள். இது அசல் தரவின் ரகசியத்தன்மையைத் தக்கவைக்க அனுமதிக்கிறது, ஏனெனில் இந்த கொள்கலன்கள் பின்னர் ரகசிய தரவுகளில் அமைப்பாளர்களால் இயக்கப்படுகின்றன. இது மிகவும் பாரம்பரியமான திறந்த தரவு மாதிரியிலிருந்து வேறுபடுகிறது, இதில் பங்கேற்பாளர்கள் வழங்கப்பட்ட திறந்த தரவின் அடிப்படையில் நேரடியாக கணிப்புகளை சமர்ப்பிக்கிறார்கள். சவால் அமைப்பு ட்ரீம் சவால் ஒரு முக்கிய ட்ரீம்/சேஜ் பயோனெட்வர்க்ஸ் அமைப்புக் குழுவையும், ஒரு நீட்டிக்கப்பட்ட அறிவியல் நிபுணர் குழுவையும் உள்ளடக்கியது, அவர்கள் சவாலை உருவாக்குவதற்கும் கருத்தாக்குவதற்கும் அல்லது முக்கிய தரவை வழங்குவதன் மூலம் பங்களித்திருக்கலாம். கூடுதலாக, பரந்த ஆராய்ச்சி சமூகத்தால் புதிய கனவு சவால்கள் முன்மொழியப்படலாம். மருந்து நிறுவனங்கள் அல்லது பிற தனியார் நிறுவனங்களும் ட்ரீம் சவால்களில் ஈடுபடலாம், எடுத்துக்காட்டாக தரவை வழங்குவதில். சவால் கட்டமைப்பு முக்கிய கட்டங்களுக்கான காலக்கெடு (அறிமுக வெபினார்கள், மாதிரி சமர்ப்பிப்பு காலக்கெடு மற்றும் பங்கேற்புக்கான இறுதி காலக்கெடு போன்றவை) முன்கூட்டியே வழங்கப்படுகின்றன. வெற்றியாளர்கள் அறிவிக்கப்பட்ட பிறகு, போட்டியின் முக்கிய கண்டுபிடிப்புகளை விவரிக்கும் வெளியீட்டிற்கான பிந்தைய தற்காலிக பகுப்பாய்வுகளை நடத்த சிறந்த செயல்திறன் கொண்ட பங்கேற்பாளர்களுடன் அமைப்பாளர்கள் ஒத்துழைக்கத் தொடங்குகிறார்கள். சவால்கள் துணை சவால்களாகப் பிரிக்கப்படலாம், ஒவ்வொன்றும் ஆராய்ச்சிக் கேள்விக்குள்ளேயே வெவ்வேறு துணைத் தலைப்புகளைக் குறிக்கின்றன. எடுத்துக்காட்டாக, புற்றுநோய் சிகிச்சையின் செயல்திறன் கணிப்புகளைப் பொறுத்தவரை, இவை முன்னேற்றம் இல்லாத உயிர்வாழ்வு, ஒட்டுமொத்த உயிர்வாழ்வு, RECIST இன் படி சிறந்த ஒட்டுமொத்த பதில் அல்லது நிகழ்வு (முன்னேற்றம் அல்லது மரணம்) வரை சரியான நேரம் ஆகியவற்றிற்கான தனித்தனி கணிப்புகளாக இருக்கலாம். பங்கேற்பு கனவு சவால்களின் போது, பங்கேற்பாளர்கள் பொதுவாக வழங்கப்பட்ட தரவுகளின் அடிப்படையில் மாதிரிகளை உருவாக்கி, கணிப்புகள் அல்லது மாதிரிகளை சமர்ப்பிக்கிறார்கள், அவை பின்னர் அமைப்பாளர்களால் நிறுத்தி வைக்கப்பட்ட தரவுகளின் அடிப்படையில் சரிபார்க்கப்படுகின்றன. DREAM சவால்கள் பங்கேற்பாளர்களுக்கு சரிபார்ப்பு தரவை கசியவிடுவதைத் தவிர்க்கும் அதே வேளையில், பங்கேற்பாளர்களுக்கு துணை மாதிரி அல்லது ஸ்கிராம்பிள் செய்யப்பட்ட தரவுத்தொகுப்பில் அவர்களின் செயல்திறனை மதிப்பிடுவதில் உதவுவதற்கு நடுத்தர சவால் சமர்ப்பிப்பு லீடர்போர்டுகள் பொதுவாக கிடைக்கின்றன. கனவு சவால்கள் பங்கேற்பாளர்களுக்கு இலவசம். திறந்த கட்டத்தில் யார் வேண்டுமானாலும் தனித்தனியாகவோ அல்லது ஒரு குழுவாகவோ பங்கேற்க சினாப்ஸ் வழியாக பதிவு செய்யலாம். ஒரு நபர் ஒரு முறை மட்டுமே பதிவு செய்யலாம் மற்றும் எந்த மாற்றுப்பெயர்களையும் பயன்படுத்தக்கூடாது. சில விதிவிலக்குகள் உள்ளன, அவை ஒரு தனிநபரை பங்கேற்பதிலிருந்து தகுதி நீக்கம் செய்கின்றன, எடுத்துக்காட்டாகஃ குறிப்பிட்ட சவாலுக்கான தரவை அணுகும் சலுகை நபருக்கு உள்ளது, இதனால் அவர்களுக்கு நியாயமற்ற நன்மையை வழங்குகிறது. முந்தைய கனவு சவால்களை ஏமாற்றியதாகவோ அல்லது துஷ்பிரயோகம் செய்ததாகவோ நபர் பிடிபட்டுள்ளார் அல்லது சந்தேகத்தின் கீழ் உள்ளார். நபர் ஒரு மைனர் (18 வயதிற்குட்பட்டவர் அல்லது வசிக்கும் அதிகார வரம்பில் பெரும்பான்மை வயது). இது பெற்றோரின் ஒப்புதலின் மூலம் குறைக்கப்படலாம். க்ரவுட்ஸோர்சிங் திட்டங்களின் பட்டியலையும் பார்க்கவும் செயல்பாட்டு சிறுகுறிப்பின் விமர்சன மதிப்பீடு (சிஏஎஃப்ஏ) மரபணு விளக்கத்தின் விமர்சன மதிப்பீடு (சிஏஜிஐ) தொடர்புகளின் கணிப்பின் விமர்சன மதிப்பீடு (சிஏபிஆர்ஐ) புரத அமைப்பு கணிப்பின் விமர்சன மதிப்பீடு (சிஏஎஸ்பி) காகில் குறிப்புகள் பயன்பாட்டு இயந்திர கற்றல் உயிர் தகவலியல் கணினி அறிவியல் போட்டிகள் கிரவுட்ஸோர்சிங் முன்னறிவிப்பு போட்டிகள் மூலக்கூறு மாடலிங் நிரலாக்க போட்டிகள்