Apratoxin A
அப்ரடாக்ஸின் ஏ-ஒரு சயனோபாக்டீரியல் இரண்டாம் நிலை வளர்சிதை மாற்றமாகும், இது ஒரு சக்திவாய்ந்த சைட்டோடாக்ஸிக் கடல் இயற்கை தயாரிப்பு என்று அழைக்கப்படுகிறது. இது சைட்டோடாக்சின்களின் அப்ராடோக்சின் குடும்பத்தின் வழித்தோன்றலாகும். கலப்பு பெப்டைடு-பாலிகேடைடு இயற்கை தயாரிப்பு ஒரு பாலிகேடைடு சிந்தேஸ்/ரைபோசோமல் அல்லாத பெப்டைடு சிந்தேஸ் பாதையிலிருந்து (பி. கே. எஸ்/என். ஆர். பி. எஸ்) வருகிறது. இந்த சைட்டோடாக்சின் ஜி 1-கட்ட செல் சுழற்சி கைது மற்றும் அப்போப்டொசிஸைத் தூண்டுவதற்கு அறியப்படுகிறது. இந்த இயற்கை உற்பத்தியின் செயல்பாடு புற்றுநோய் எதிர்ப்பு வழித்தோன்றல்களை உருவாக்குவதற்கான பிரபலமான இலக்காக மாறியுள்ளது. கட்டமைப்பு பண்புகள் மற்றும் உறுதிப்பாடு அப்ரடாக்ஸின் ஏ என்பது மேலே காட்டப்பட்டுள்ளபடி ஒரு கலப்பு பெப்டைட்-பாலிகெடைடு சுழற்சி அமைப்பு ஆகும். இது பாலிகெடைடு பிரிவுகளால் சூழப்பட்ட ஒரு தியாஜோலின் வளையத்தைக் கொண்டுள்ளது, அவற்றில் ஒன்று அசாதாரணமான மெத்திலேஷன் வடிவத்தைக் கொண்டுள்ளது. பல 2டி என்எம்ஆர் நுட்பங்கள் உட்பட நிறமாலை பகுப்பாய்வு மூலம் இந்த அமைப்பு தெளிவுபடுத்தப்பட்டுள்ளது. அமினோ அமிலப் பிரிவுகளின் முழுமையான அமைப்பு சிரல் எச். பி. எல். சி பகுப்பாய்வு மூலம் தீர்மானிக்கப்பட்டது. உயிரியக்கவியல் அப்ரடாக்ஸின் ஏ என்பது அப்ரடாக்ஸின் உயிரியக்கவியல் பாதையிலிருந்து வருகிறது. படம் 1 அப்ரடாக்ஸின்களின் முன்மொழியப்பட்ட உயிரியக்கவியல் பாதையை விவரிக்கிறது. அப்ராடாக்ஸின் உயிரியக்கவியல் பாதை என்பது வகை I மாடுலர் கலப்பு பாலிகேடைடு சிந்தேஸ்/ரைபோசோமல் அல்லாத பெப்டைடு சிந்தேஸ் (பி. கே. எஸ்/என். ஆர். பி. எஸ்) அமைப்பாகும். மரபணு ரீதியாக, படம் 1 இல் காட்டப்பட்டுள்ளபடி, 58kb உயிரியக்கவியல் மரபணு கிளஸ்டர் 12 திறந்த வாசிப்பு பிரேம்களால் (ORF கள்) ஆனது. தொகுதிகள் மற்றும் களங்கள் ஒவ்வொரு வகை I பாலிகடைடு-ஒத்திசைவு தொகுதியும் வரையறுக்கப்பட்ட செயல்பாட்டைக் கொண்ட பல களங்களைக் கொண்டுள்ளது, அவை குறுகிய இடைவெளி பகுதிகளால் பிரிக்கப்பட்டுள்ளன. ரைபோசோமல் அல்லாத பெப்டைடுகள் பல சிறப்பு என்ஆர்பிஎஸ் என்சைம்களால் ஒருங்கிணைக்கப்படுகின்றன. பாலிகெடைடு மற்றும் ரைபோசோமல் அல்லாத உயிரியக்கவியல் ஆகியவற்றுக்கு இடையிலான கட்டமைப்பு மற்றும் இயந்திரவியல் ஒற்றுமைகள் காரணமாக, அப்ரடாக்ஸின் ஏ இரண்டு உயிரியக்கவியல் பாதைகளிலிருந்தும் தொகுதிகளை இணைத்துள்ளது. அப்ரடாக்ஸின் ஏ உயிரியக்கவியலுக்காக பின்வரும் களங்கள் முன்மொழியப்பட்டுள்ளனஃ ஏ. ஆர்.-அடாப்டர் பிராந்தியம் ஜி. என். ஏ. டி.-ஜி. சி. என். 3 அசைல் டிரான்ஸ்பரேஸ் ஜி. என். எம். டி.-கிளைசின்-என்-மெத்தில் டிரான்ஸ்பரேஸ் எம். டி.-மெத்தில் டிரான்ஸ்பரேஸ் கே. எஸ்.-கீட்டோ சின்தேஸ் ஏ. டி.-அசைல் டிரான்ஸ்பரேஸ் கே. ஆர்.-கீட்டோ ரிடக்டேஸ் ஈ. ஆர்.-எனாயில் ரிடக்டேஸ் ஏ. சி. பி.-அசைல் கேரியர் புரதம் எச். சி. எஸ்.-எச். எம். ஜி.-கோ. ஏ. சின்தேஸ் ஈ. சி. எச்.-எனாயில்-கோ. ஏ. ஹைட்ரேடேஸ் சி.-ஒடுக்கம் ஏ.-அடினைலேஷன் பி. சி. பி.-பெப்டிடைல் கேரியர் புரதம் சி. ஒய்.-சுழற்சி நிலைகள் படம் 1 இல் காட்டப்பட்டுள்ள வளரும் சங்கிலி, ஒப்படைக்கப்பட்டுள்ளது. ஒரு டெர்ட்-பியூட்டைல் தியோஸ்டர் ஏ. சி. பி. க்கு ஏற்றப்படுகிறது. முதல் கார்பனைல் பிரிவில் இந்த பிரிவு நீட்டிக்கப்பட்டு கே. ஆர் உடன் சிகிச்சையளிக்கப்படுகிறது. மற்றொரு அசிடைல்-எஸ். சி. ஓ. ஏ நீட்டிப்பு நடைபெறுகிறது மற்றும் ஏ. சி. பி பாலிகெடைடு பகுதியை பீட்டா-ஹைட்ராக்சில் நிலையில் மாற்றியமைக்க மாற்றுகிறது, இது தியோஸ்டருக்கு பொருத்தமானது, மெத்தில்-கார்பாக்சிலிக் அமிலத்திற்கு. ஒரு நீரிழப்பு மற்றும் டீகார்பாக்சிலேஷன் உள்ளது. இறுதியில், பாதைக்குப் பிந்தைய மாற்றம் பீட்டா-ஹைட்ராக்ஸி நிலையை மெத்திலேட் செய்கிறது, அதே நேரத்தில் மற்ற மெத்தில் (மெத்தில்-மலோனைல் கோஏ பிரிவில் இருந்து) மற்றும் பிற இரண்டு ஹைட்ராக்சில்களுக்கு ஸ்டீரியோசென்டர்களை நிறுவுகிறது. பாலிகெடைடு பிரிவு என். ஆர். பி. எஸ்-க்கான அடுத்த தொகுதிக்கு மாற்றப்படுகிறது. என். ஆர். பி. எஸ்ஸின் போது, எந்த பெப்டைட் பிரிவுகளும் ஏற்றப்படுவதற்கு முன்பு தியாஜோலின் உருவாகிறது. இறுதி அமைப்பு ஒரு கூட்டல்-நீக்குதல் வகை பொறிமுறையால் சுழற்சி செய்யப்படுகிறது. பெப்டைட் பிரிவுகளின் ஸ்டீரியோ கெமிஸ்ட்ரி ஒவ்வொரு நொதி படியிலும் அடி மூலக்கூறு செயலில் உள்ள தளத்தால் வரையறுக்கப்படுகிறது. மருந்தியல் பொருத்தப்பாடு சயனோபாக்டீரியல் வளர்சிதை மாற்றங்கள் பொதுவாக புற்றுநோய் சிகிச்சையில் பயனுள்ளதாக இருக்கும் என்று கண்டறியப்பட்டுள்ளது. குறிப்பாக, அபார்டாக்ஸின் ஏ ஒரு சக்திவாய்ந்த புற்றுநோய் செல் சைட்டோடாக்சின் என்று கண்டறியப்பட்டுள்ளது. இது இன் விட்ரோ மற்றும் இன் விவோ ஆய்வுகள் இரண்டிலும் குறிப்பிடத்தக்க சைட்டோடாக்ஸிக் என்று கண்டறியப்பட்டுள்ளது. ஜி 1-கட்ட செல் சுழற்சி கைது மற்றும் அப்போப்டொசிஸ் ஆகியவற்றைத் தூண்டுவதற்கு அபார்டாக்ஸின் ஏ கண்டறியப்பட்டுள்ளது. இந்த சைட்டோடாக்சினுக்கான செயல்பாட்டு பொறிமுறையைப் புரிந்துகொள்ள அதிக வேலை செய்யப்பட்டிருந்தாலும், உயிரணுவில் உள்ள கட்டி எதிர்ப்பு செயல்பாட்டை அப்ராடோக்சின் ஏ எவ்வாறு மத்தியஸ்தம் செய்கிறது என்பதற்கான வரையறுக்கப்பட்ட புரிதல் இல்லை. மேலும், 60 கட்டி செல் கோடுகளில் வேறுபட்ட சைட்டோடாக்ஸிசிட்டி இருப்பதாக பல அறிக்கைகள் காட்டியிருந்தாலும், அப்ராடாக்ஸின் ஏ ஒரு சாத்தியமான கட்டி எதிர்ப்பு முகவராக இருக்க தேவையான தேர்வை கொண்டிருக்கவில்லை. குறிப்புகள் வெளிப்புற இணைப்புகள் அப்ரடாக்ஸின் ஒரு கட்டமைப்பு தகவல்-ஈ. எம். பி. எல்-ஈ. பி. ஐ சயனோடாக்சின்கள் டெர்ட்-பியூட்டைல் சேர்மங்கள் சுழற்சி பெப்டைடுகள் பாலிகேடைடுகள்