SET domain
SET களம் என்பது ஒரு புரத களமாகும், இது பொதுவாக மெத்தில் டிரான்ஸ்ஃபெரேஸ் செயல்பாட்டைக் கொண்டுள்ளது. இது முதலில் ட்ரோசோபிலா ட்ரிதோராக்ஸ் புரதத்தில் உள்ள ஒரு பெரிய பாதுகாக்கப்பட்ட பகுதியின் ஒரு பகுதியாக அடையாளம் காணப்பட்டது, பின்னர் ட்ரோசோபிலா சு (வர்) 3-9 மற்றும் 'ஜெஸ்டேவின் மேம்பாட்டாளர்' புரதங்களில் அடையாளம் காணப்பட்டது, இதிலிருந்து SET என்ற சுருக்கம் பெறப்பட்டது [சு (வர்) 3-9, ஜெஸ்டேவின் மேம்பாட்டாளர் மற்றும் ட்ரிதோராக்ஸ்]. அமைப்பு SET களம் பொதுவாக ஒரு பெரிய மல்டிடோமைன் புரதத்தின் ஒரு பகுதியாகத் தோன்றுகிறது, மேலும் சமீபத்தில் தனித்துவமான கள கலவைகளுடன் மிகவும் மாறுபட்ட புரதங்களின் மூன்று கட்டமைப்புகள் விவரிக்கப்பட்டனஃ ஹிஸ்டோன் லைசின் மெத்தில் டிரான்ஸ்ஃபெரேஸ்களின் (HKMTs) சு (வர்) குடும்பத்தின் உறுப்பினரான நியூரோஸ்போரா க்ராஸா டிஐஎம்-5, லைசின் 9 இல் ஹிஸ்டோன் எச் 3 ஐ மெத்திலேட் செய்யும் மனித SETD7 (SET7 அல்லது SET9 என்றும் அழைக்கப்படுகிறது), இது லைசின் 4 தோட்ட பட்டாணி ரூபிஸ்கோ எல்எஸ்எம்டி இல் எச் 3 ஐ மெத்திலேட் செய்கிறது, இது ஹிஸ்டோன்களை மாற்றாத ஒரு நொதியாகும், ஆனால் அதற்கு பதிலாக ரூபிஸ்கோ நொதியின் பெரிய துணைக்குழுவின் நெகிழ்வான வால் பகுதியில் லைசின் 14 ஐ மெத்திலேட் செய்கிறது. SET களமே ஒரு அசாதாரண கட்டமைப்பாக மாறியது. மூன்று ஆய்வுகளிலும், எலக்ட்ரான் அடர்த்தி வரைபடங்கள் அடோமெட் அல்லது அடோஹ்சி கோஃபாக்டரின் இருப்பிடத்தை வெளிப்படுத்தியிருந்தாலும், SET களம் நியதி/அடோமெட்-சார்ந்த மெத்தில் டிரான்ஸ்ஃபெரேஸ் மடிப்புடன் எந்த ஒற்றுமையையும் கொண்டிருக்கவில்லை. SET களத்தின் சி-முனைய மையக்கருத்தில் கண்டிப்பாக பாதுகாக்கப்பட்டுள்ள டைரோசின், அடி மூலக்கூறு லைசின் புரோட்டோனேற்றப்பட்ட அமினோ குழுவிலிருந்து ஒரு புரோட்டனை பிரித்தெடுப்பதில் ஈடுபடலாம், இது அடோமெட் கோஃபாக்டரின் சல்போனியம் மெத்தில் குழுவின் மீது அதன் நியூக்ளியோஃபிலிக் தாக்குதலை ஊக்குவிக்கிறது. கோஃபாக்டரின் மேல் தங்கள் பாலிபெப்டைட் அடி மூலக்கூறுகளை பிணைக்கும் பாரம்பரிய வகையின் அடோமெட்-சார்ந்த புரத மெத்தில்ட்ரான்ஃபெரேஸ்களுக்கு மாறாக, ரூபிஸ்கோ எல். எஸ். எம். டி கட்டமைப்பிலிருந்து அடோமெட் ஒரு தனி பிளவுடன் பிணைக்கப்படுவதாகத் தெரிகிறது, இது ஒரு பாலிபெப்டைட் அடி மூலக்கூறு நொதியிலிருந்து வெளியிடப்படாமல் பல சுற்று மெத்திலேஷனுக்கு எவ்வாறு உட்படுத்தப்படலாம் என்பதைக் குறிக்கிறது. இதற்கு மாறாக, SET7/9 அதன் அடி மூலக்கூறுக்கு ஒரு ஒற்றை மெத்தில் குழுவை மட்டுமே சேர்க்க முடியும். செயல்பாடு SET களம் மற்றும் மயோடுபுலரின் தொடர்பான புரதங்களின் தொடர்பு வளர்ச்சிக் கட்டுப்பாட்டை மாற்றியமைக்கிறது என்பது நிரூபிக்கப்பட்டுள்ளது. செட் டொமைன் கொண்ட ட்ரோசோபிலா மெலனோகாஸ்டர் (பழ ஈ) புரதம், ஜெஸ்டின் மேம்பாட்டாளர், பிரிவு தீர்மானிப்பதில் ஒரு செயல்பாட்டைக் கொண்டுள்ளது மற்றும் பாலூட்டி ஹோமோலோக் மரபணு டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் மற்றும் குரோமாட்டின் கட்டமைப்பை ஒழுங்குபடுத்துவதில் ஈடுபட்டிருக்கலாம். ஹிஸ்டோன் லைசின் மெத்திலேஷன் என்பது ஹிஸ்டோன் குறியீட்டின் ஒரு பகுதியாகும், இது குரோமாட்டின் செயல்பாடு மற்றும் மரபணு செயல்பாட்டின் எபிஜெனெடிக் கட்டுப்பாட்டை ஒழுங்குபடுத்துகிறது. ஹிஸ்டோன் லைசின் மெத்தில் டிரான்ஸ்ஃபெரேஸ்கள் (எச்எம்டேஸ்) பல்வேறு ஏற்பி லைசின்களுக்கான அவற்றின் அடி மூலக்கூறு தனித்துவத்திலும், அவை மாற்றும் மெத்தில் குழுக்களின் (ஒன்று, இரண்டு அல்லது மூன்று) எண்ணிக்கைக்கான அவற்றின் தயாரிப்பு தனித்துவத்திலும் வேறுபடுகின்றன. ஒரே ஒரு விதிவிலக்குடன், எச்எம்டேஸ்கள் செட் குடும்பத்தைச் சேர்ந்தவை, அவை செட் களத்தைச் சுற்றியுள்ள வரிசைகளின்படி வகைப்படுத்தப்படலாம். மனித SET7/9, ஒரு மோனோ-மெத்திலேஸ் பற்றிய கட்டமைப்பு ஆய்வுகள், ஹிஸ்டோன்-இலக்குக்கான நொதியின் குறிப்பிட்ட தன்மைக்கான மூலக்கூறு அடிப்படையையும், மெத்திலேஷன் குறிப்பிட்ட தன்மைகளை தீர்மானிப்பதில் SET களத்தில் மாறாத எச்சங்களின் பங்கையும் வெளிப்படுத்தியுள்ளன. தொடர்புடைய களங்கள் SUV39 SET குடும்பத்தில் காணப்படும் N-முனைய முன்-SET களம் (), ஒன்பது மாறாத சிஸ்டைன் எச்சங்களைக் கொண்டுள்ளது, அவை மாறுபட்ட நீளத்தின் பகுதியால் பிரிக்கப்பட்ட இரண்டு பிரிவுகளாக தொகுக்கப்பட்டுள்ளன. இந்த 9 சிஸ்டைன்கள் 3 துத்தநாக அயனிகளை ஒருங்கிணைத்து ஒரு முக்கோணக் கிளஸ்டரை உருவாக்குகின்றன, இதில் துத்தநாக அயனிகள் ஒவ்வொன்றும் 4 நான்கு சிஸ்டைன்களால் ஒருங்கிணைக்கப்பட்டு ஒரு நாற்கர அமைப்பைக் கொடுக்கின்றன. இந்த களத்தின் செயல்பாடு கட்டமைப்பு ரீதியானது, சீரற்ற சுருள்களின் 2 நீண்ட பிரிவுகளை ஒன்றாக வைத்திருக்கிறது. பிந்தைய SET களம் () உட்பட C-முனையப் பகுதி ஹிஸ்டோன் வாலுடன் தொடர்பு கொள்ளாதபோது மற்றும் துத்தநாகம் இல்லாதபோது ஒழுங்கற்றதாக உள்ளது. SET களத்திற்கு பிந்தைய களத்தில் உள்ள மூன்று பாதுகாக்கப்பட்ட சிஸ்டைன்கள் SET கள செயலில் உள்ள தளத்திற்கு அருகில் முடிச்சு போன்ற கட்டமைப்பில் நான்காவது பாதுகாக்கப்பட்ட சிஸ்டைனுடன் இணைக்கப்படும்போது துத்தநாக-பிணைப்பு தளத்தை உருவாக்குகின்றன. S-adenosyl-L-methionine-பிணைப்பு மற்றும் ஹிஸ்டோன் வால் தொடர்புகளில் பங்கேற்கும் C-முனைய எச்சங்களை கட்டமைக்கப்பட்ட பிந்தைய SET பகுதி கொண்டு வருகிறது. பாதுகாக்கப்பட்ட மூன்று சிஸ்டைன் எச்சங்கள் எச்எம்டேஸ் செயல்பாட்டிற்கு இன்றியமையாதவை, ஏனெனில் செரின் உடன் மாற்றுவது எச்எம்டேஸ் செயல்பாட்டை ஒழிக்கிறது. இந்த களத்தைக் கொண்ட மனித மரபணுக்கள் குறியீட்டு புரதங்களின் எடுத்துக்காட்டுகள் பின்வருமாறுஃ ASH1L, SET களம் (AWS) EHMT1 (FP13812), EHMT2 (BAT8), EZH1, EZH2MLL, MLL2, MLL3, MLL5NSD1 PRDM1, PRDM2, PRDM5SETD1A, SETD2, SETD3, SETD4, SETD5, SETD6, SETD7, SETD8, SETDB1, SETDB2, SETMAR, SMYD1, SMYD3 ஆகியவற்றுடன் தொடர்புடையது.