HITS-CLIP
கிராஸ்லிங்கிங் இம்யூனோப்ரீசிபிடேஷன் (எச்ஐடிஎஸ்-சிஎல்ஐபி) மூலம் தனிமைப்படுத்தப்பட்ட ஆர்என்ஏவின் உயர்-செயல்திறன் வரிசைமுறை என்பது மரபணு அளவிலான மேப்பிங் புரத-ஆர்என்ஏ பிணைப்பு தளங்கள் அல்லது விவோவில் உள்ள ஆர்என்ஏ மாற்ற தளங்களுக்கான சிஎல்ஐபியின் ஒரு மாறுபாடு ஆகும். நரம்பணு-குறிப்பிட்ட ஆர்என்ஏ-பிணைப்பு புரதம் மற்றும் பிளவுபடுத்தும் காரணி நோவா1 மற்றும் நோவா2 ஆகியவற்றிற்கான மரபணு-பரந்த புரத-ஆர்என்ஏ தொடர்பு வரைபடங்களை உருவாக்க ஹிட்ஸ்-சிஎல்ஐபி முதலில் பயன்படுத்தப்பட்டது; அதன் பின்னர் பிடிபி, ஆர்பிஃபாக்ஸ்2, எஸ்எஃப்ஆர்எஸ்1, எச்என்ஆர்என்பி சி மற்றும் என்6-மெத்திலடெனோசின் (எம்6ஏ) எம்ஆர்என்ஏ மாற்றங்கள் உட்பட பல பிளவுபடுத்தும் காரணி வரைபடங்கள் உருவாக்கப்பட்டுள்ளன. ஆர்என்ஏ-பிணைப்பு புரதமான ஆர்கோனாட்டின் எச்ஐடிஎஸ்-சிஎல்ஐபி, சுண்டெலி மூளையில் மைக்ரோஆர்என்ஏ-எம்ஆர்என்ஏ மற்றும் புரதம்-ஆர்என்ஏ தொடர்பு வரைபடங்களை டிகோடிங் செய்வதன் மூலம் மைக்ரோஆர்என்ஏ இலக்குகளை அடையாளம் காண்பதற்காகவும், பின்னர் கேனோராப்டிடிஸ் எலிகான்ஸ், கரு ஸ்டெம் செல்கள் மற்றும் திசு வளர்ப்பு செல்கள் ஆகியவற்றிலும் செய்யப்படுகிறது. எச்ஐடிஎஸ்-சிஎல்ஐபி இன் ஒரு புதுமையான மாற்றமாக, எம்ஆர்என்ஏவில் உள்ள என்6-மெத்திலடெனோசின் (எம்6ஏ) இருப்பிடங்களை துல்லியமாக வரைபடமாக்க எம்6ஏ-சிஎல்ஐபி உருவாக்கப்பட்டது. சமீபத்தில், ஆர்கோனூட் எச்ஐடிஎஸ்-சிஎல்ஐபி-க்கு பயன்படுத்தப்படும் மேம்பட்ட உயிர் தகவலியல், ஒற்றை நியூக்ளியோடைடு தெளிவுத்திறனுடன் பிணைப்பு தளங்களை அடையாளம் காண உதவுகிறது. திசு வளர்ப்பு உயிரணுக்களில் செல்லுலார் ஆர்என்ஏ-பிணைப்பு புரதங்கள் (ஆர்பிபி) மற்றும் மைக்ரோஆர்என்ஏ-கொண்ட ரிபோநியூக்ளியோபுரோட்டீன் வளாகங்களின் (எம்ஐஆர்என்பி) பிணைப்பு தளங்களை அடையாளம் காண இதே போன்ற முறைகள் பிஏஆர்-சிஎல்ஐபி. ஐசிஎல்ஐபி, துண்டிக்கப்பட்ட சிடிஎன்ஏக்கள் உட்பட சிடிஎன்ஏ நூலகத்தின் முழுமையான பெருக்கத்திற்காக, இதனால் குறுக்கு இணைப்பு தளங்களை அடையாளம் காண கூடுதல் வழிகளை செயல்படுத்துகிறது. குறிப்புகள் வெளிப்புற இணைப்புகள் கிளிப்ஸிம்-எம்சிஃ கிளிப்ஸிம்-எம்சி என்பது மாண்டே-கார்லோ அடிப்படையிலான அணுகுமுறையைப் பயன்படுத்தி மிஆர்என்ஏ/எம்ஆர்இ இணைப்புகளைக் கண்டறிய கிளிப்-செக் தரவைப் பயன்படுத்தும் ஒரு கருவியாகும். ஸ்டார்பேஸ் தரவுத்தளம்ஃ மைஆர்என்ஏ-எம்ஆர்என்ஏ, மைஆர்என்ஏ-எல்என்ஸிஆர்என்ஏ, மைஆர்என்ஏ-எஸ்என்ஸிஆர்என்ஏ, மைஆர்என்ஏ-சர்ஆர்என்ஏ, மைஆர்என்ஏ-சூடோஜென், புரதம்-எல்என்ஸிஆர்என்ஏ, புரதம்-ஆர்என்ஏ தொடர்புகள் மற்றும் எச்ஐடிஎஸ்-சிஎல்ஐபி (கிளிப்-செக், பார்-கிளிப், ஐசிஎல்ஐபி, கிளாஸ்) தரவு மற்றும் டார்கெட்ஸ்கேன், பிக்டர், ஆர்என்ஏ22, மைரண்டா மற்றும் பிட்டா மைக்ரோஆர்என்ஏ இலக்கு தளங்களிலிருந்து செர்என்ஏ நெட்வொர்க்குகளை ஆராய்வதற்கான ஒரு தரவுத்தளம். கிளிப்ஸ்ஃ ஹிட்ஸ்-சிஎல்ஐபி சோதனைகளிலிருந்து குறுகிய ஆர்என்ஏ வாசிப்புகளை பகுப்பாய்வு செய்வதற்கான குழாய். டிசிஎல்ஐபிஃ டிசிஎல்ஐபி என்பது இரண்டு ஒப்பீட்டு சிஎல்ஐபி-செக் (எச்ஐடிஎஸ்-சிஎல்ஐபி, பிஏஆர்-சிஎல்ஐபி அல்லது ஐசிஎல்ஐபி) சோதனைகளில் வேறுபட்ட பிணைப்பு பகுதிகளைக் கண்டுபிடிப்பதற்கான ஒரு பெர்ல் திட்டமாகும். ஆர்என்ஏ மூலக்கூறு மரபியல் மைக்ரோஆர்என்ஏ