Chemical database
இரசாயனத் தரவுத்தளம் என்பது இரசாயனத் தகவல்களைச் சேமிக்க வடிவமைக்கப்பட்ட ஒரு தரவுத்தளமாகும். இந்த தகவல் வேதியியல் மற்றும் படிக கட்டமைப்புகள், நிறமாலை, எதிர்வினைகள் மற்றும் தொகுப்புகள் மற்றும் வெப்ப இயற்பியல் தரவு பற்றியது. வேதியியல் தரவுத்தளங்களின் வகைகள் உயிரியல் செயல்பாட்டு தரவுத்தளங்கள் உயிரியல் செயல்பாட்டு தரவுத்தளங்கள் இலக்கியம், காப்புரிமைகள் மற்றும் திரையிடல் திட்டங்களில் உயிரியல் மதிப்பீடுகளிலிருந்து எடுக்கப்பட்ட உயிரியல் செயல்பாட்டு முடிவுகளுடன் கட்டமைப்புகள் அல்லது பிற இரசாயன தகவல்களை தொடர்புபடுத்துகின்றன. இரசாயன கட்டமைப்புகள் இரசாயன கட்டமைப்புகள் பாரம்பரியமாக அணுக்களுக்கு இடையிலான இரசாயன பிணைப்புகளைக் குறிக்கும் கோடுகளைப் பயன்படுத்தி குறிப்பிடப்படுகின்றன மற்றும் காகிதத்தில் வரையப்படுகின்றன (2D கட்டமைப்பு சூத்திரங்கள்). இவை வேதியியலாளருக்கு சிறந்த காட்சி பிரதிநிதித்துவங்களாக இருந்தாலும், அவை கணக்கீட்டு பயன்பாட்டிற்கும் குறிப்பாக தேடல் மற்றும் சேமிப்புக்கும் பொருந்தாது. சிறிய மூலக்கூறுகள் (மருந்து வடிவமைப்பு பயன்பாடுகளில் ஈந்தணைவிகள் என்றும் அழைக்கப்படுகின்றன), பொதுவாக அணுக்களின் பட்டியல்களையும் அவற்றின் இணைப்புகளையும் பயன்படுத்தி குறிப்பிடப்படுகின்றன. இருப்பினும் புரதங்கள் போன்ற பெரிய மூலக்கூறுகள் அவற்றின் அமினோ அமில கட்டுமானத் தொகுதிகளின் வரிசைகளைப் பயன்படுத்தி மிகவும் சுருக்கமாக குறிப்பிடப்படுகின்றன. கட்டமைப்புகளுக்கான பெரிய இரசாயன தரவுத்தளங்கள் டெராபைட் இயற்பியல் நினைவகத்தை எடுக்கும் மில்லியன் கணக்கான மூலக்கூறுகள் பற்றிய தகவல்களை சேமித்து வைப்பதையும் தேடுவதையும் கையாளும் என்று எதிர்பார்க்கப்படுகிறது. இலக்கிய தரவுத்தளம் வேதியியல் இலக்கிய தரவுத்தளங்கள் கட்டமைப்புகள் அல்லது பிற வேதியியல் தகவல்களை கல்வி ஆவணங்கள் அல்லது காப்புரிமைகள் போன்ற தொடர்புடைய குறிப்புகளுடன் தொடர்புபடுத்துகின்றன. இந்த வகை தரவுத்தளத்தில் எஸ். டி. என், சிஃபைண்டர் மற்றும் ரியாக்சிஸ் ஆகியவை அடங்கும். இலக்கியத்திற்கான இணைப்புகள் இரசாயன குணாதிசயத்தில் கவனம் செலுத்தும் பல தரவுத்தளங்களிலும் சேர்க்கப்பட்டுள்ளன. படிகவியல் தரவுத்தளம் படிகவியல் தரவுத்தளங்கள் எக்ஸ்-ரே படிக அமைப்பு தரவை சேமிக்கிறது. பொதுவான எடுத்துக்காட்டுகளில் புரோட்டீன் தரவு வங்கி மற்றும் கேம்பிரிட்ஜ் கட்டமைப்பு தரவுத்தளம் அடங்கும். என்எம்ஆர் ஸ்பெக்ட்ர தரவுத்தளம் என்எம்ஆர் ஸ்பெக்ட்ர தரவுத்தளங்கள் வேதியியல் கட்டமைப்பை என்எம்ஆர் தரவுகளுடன் தொடர்புபடுத்துகின்றன. இந்த தரவுத்தளங்களில் பெரும்பாலும் எஃப். டி. ஐ. ஆர் மற்றும் மாஸ் ஸ்பெக்ட்ரோமெட்ரி போன்ற பிற குணாதிசய தரவுகள் அடங்கும். எதிர்வினைகள் தரவுத்தளம் பெரும்பாலான இரசாயன தரவுத்தளங்கள் நிலையான மூலக்கூறுகள் பற்றிய தகவல்களை சேமித்து வைக்கின்றன, ஆனால் எதிர்வினைகளுக்கான தரவுத்தளங்களில் இடைநிலைகள் மற்றும் தற்காலிகமாக உருவாக்கப்பட்ட நிலையற்ற மூலக்கூறுகள் சேமிக்கப்படுகின்றன. எதிர்வினை தரவுத்தளங்கள் தயாரிப்புகள், கல்விகள் மற்றும் எதிர்வினை வழிமுறைகள் பற்றிய தகவல்களைக் கொண்டுள்ளன. வெப்ப இயற்பியல் தரவுத்தளம் என்பது நீராவி-திரவ சமநிலை, திரவங்களில் வாயுக்களின் கரைதிறன், திடப்பொருட்களில் திரவங்கள் (எஸ். எல். இ), கலவையின் வெப்பங்கள், ஆவியாக்கம் மற்றும் இணைவு உள்ளிட்ட கட்ட சமநிலை பற்றிய தகவல்களாகும். வெப்பத் திறன், உருவாக்கம் மற்றும் எரிப்பு வெப்பம் போன்ற கலோரித் தரவுகள், பாகுத்தன்மை மற்றும் வெப்ப கடத்துத்திறன் போன்ற போக்குவரத்து பண்புகள் வேதியியல் அமைப்பு பிரதிநிதித்துவம் டிஜிட்டல் தரவுத்தளங்களில் வேதியியல் கட்டமைப்புகளைக் குறிக்க இரண்டு முக்கிய நுட்பங்கள் உள்ளன இணைப்பு அட்டவணைகள்/அருகாமை மேட்ரிக்ஸ்கள்/பட்டியல்களாக பிணைப்பு (விளிம்புகள்) மற்றும் அணு பண்புக்கூறுகள் (முனைகள்) பற்றிய கூடுதல் தகவல்களுடன், அதாவதுஃ எம். டி. எல். மொல்ஃபைல், பி. டி. பி., சி. எம். எல். ஆழம் முதல் அல்லது அகலம் முதல் பயணத்தின் அடிப்படையில் ஒரு நேரியல் சரம் குறியீடாக, அதாவதுஃ ஸ்மைல்ஸ்/எஸ். எம். ஏ. ஆர். டி. எஸ், எஸ். எல். என், டபிள்யூ. எல். என், இன்சி. இந்த அணுகுமுறைகள் ஸ்டீரியோ கெமிக்கல் வேறுபாடுகள் மற்றும் கட்டணங்கள் மற்றும் ஆர்கானோ-உலோக சேர்மங்களில் காணப்படும் சிறப்பு வகையான பிணைப்புகளின் பிரதிநிதித்துவத்தை அனுமதிக்க சுத்திகரிக்கப்பட்டுள்ளன. கணினி பிரதிநிதித்துவத்தின் முக்கிய நன்மை, அதிகரித்த சேமிப்பு மற்றும் வேகமான, நெகிழ்வான தேடலுக்கான சாத்தியமாகும். தேடல் துணை அமைப்பு வேதியியலாளர்கள் கட்டமைப்புகளின் பகுதிகள், அவற்றின் IUPAC பெயர்களின் பகுதிகள் மற்றும் பண்புகளின் கட்டுப்பாடுகளின் அடிப்படையில் தரவுத்தளங்களைத் தேடலாம். இரசாயன தரவுத்தளங்கள் துணை-கட்டமைப்பு தேடலுக்கான ஆதரவில் மற்ற பொது நோக்க தரவுத்தளங்களிலிருந்து குறிப்பாக வேறுபட்டவை. இந்த வகையான தேடல் துணை வரைபட ஐசோமார்பிசத்தைத் தேடுவதன் மூலம் அடையப்படுகிறது (சில நேரங்களில் மோனோமார்பிசம் என்றும் அழைக்கப்படுகிறது) மேலும் இது வரைபடக் கோட்பாட்டின் பரவலாக ஆய்வு செய்யப்பட்ட பயன்பாடாகும். தேடலுக்கான வழிமுறைகள் கணக்கீட்டு ரீதியாக தீவிரமானவை, பெரும்பாலும் O (n3) அல்லது O (n4) நேர சிக்கலானது (இதில் n என்பது அணுக்களின் எண்ணிக்கை). தேடலின் தீவிரமான கூறு அணு-மூலம்-அணு-தேடல் (ஏபிஏஎஸ்) என்று அழைக்கப்படுகிறது, இதில் தேடல் அடி மூலக்கூறு அணுக்கள் மற்றும் இலக்கு மூலக்கூறுடன் பிணைப்புகளின் வரைபடம் தேடப்படுகிறது. ஏபிஏஎஸ் தேடல் பொதுவாக உல்மேன் வழிமுறை அல்லது அதன் மாறுபாடுகளைப் பயன்படுத்துகிறது (அதாவது. எஸ்எம்எஸ்டி). நேரக் கடனுதவி மூலம் வேகப்படுத்தல்கள் அடையப்படுகின்றன, அதாவது, தேடல் பணிகளில் சில நேரம் முன்கூட்டியே கணக்கிடப்பட்ட தகவல்களைப் பயன்படுத்துவதன் மூலம் சேமிக்கப்படுகிறது. இந்த முன் கணக்கீடு பொதுவாக மூலக்கூறு துண்டுகள் இருப்பது அல்லது இல்லாததைக் குறிக்கும் பிட் ஸ்ட்ரிங்குகளை உருவாக்குவதை உள்ளடக்கியது. ஒரு தேடல் கட்டமைப்பில் உள்ள துண்டுகளைப் பார்ப்பதன் மூலம், தேடல் கட்டமைப்பில் உள்ள துண்டுகளைக் கொண்டிருக்காத இலக்கு மூலக்கூறுகளுடன் ஏபிஏஎஸ் ஒப்பிட வேண்டியதன் அவசியத்தை அகற்ற முடியும். இந்த நீக்குதல் ஸ்கிரீனிங் என்று அழைக்கப்படுகிறது (மருந்து-கண்டுபிடிப்பில் பயன்படுத்தப்படும் ஸ்கிரீனிங் நடைமுறைகளுடன் குழப்பமடையக்கூடாது). இந்த பயன்பாடுகளுக்கு பயன்படுத்தப்படும் பிட்-ஸ்ட்ரிங்குகள் கட்டமைப்பு-விசைகள் என்றும் அழைக்கப்படுகின்றன. அத்தகைய விசைகளின் செயல்திறன் விசைகளை உருவாக்குவதற்குப் பயன்படுத்தப்படும் துண்டுகளின் தேர்வு மற்றும் தரவுத்தள மூலக்கூறுகளில் அவை இருப்பதற்கான நிகழ்தகவு ஆகியவற்றைப் பொறுத்தது. மற்றொரு வகையான விசை கணக்கீட்டில் பெறப்பட்ட துண்டுகளின் அடிப்படையில் ஹாஷ்-குறியீடுகளைப் பயன்படுத்துகிறது. இவை 'கைரேகைகள்' என்று அழைக்கப்படுகின்றன, இருப்பினும் இந்த சொல் சில நேரங்களில் கட்டமைப்பு-விசைகளுடன் ஒத்ததாக பயன்படுத்தப்படுகிறது. இந்த கட்டமைப்பு விசைகள் மற்றும் கைரேகைகளை சேமிக்கத் தேவையான நினைவகத்தின் அளவை 'மடிப்பு' மூலம் குறைக்கலாம், இது பிட்வைஸ் செயல்பாடுகளைப் பயன்படுத்தி விசையின் பகுதிகளை இணைப்பதன் மூலம் அடையப்படுகிறது, இதன் மூலம் ஒட்டுமொத்த நீளத்தைக் குறைக்கிறது. மூலக்கூறுகளின் 3டி இணக்கத்தை பொருத்துவதன் மூலம் அல்லது இடஞ்சார்ந்த கட்டுப்பாடுகளைக் குறிப்பிடுவதன் மூலம் உள்ளமைவு தேடல் என்பது மருந்து வடிவமைப்பில் குறிப்பாகப் பயன்படுத்தப்படும் மற்றொரு அம்சமாகும். இந்த வகையான தேடல்கள் கணக்கீட்டு ரீதியாக மிகவும் விலை உயர்ந்ததாக இருக்கலாம். பல தோராயமான முறைகள் முன்மொழியப்பட்டுள்ளன, எடுத்துக்காட்டாக BCUTS, சிறப்பு செயல்பாட்டு பிரதிநிதித்துவங்கள், மந்தநிலையின் தருணங்கள், கதிர்-தடமறிதல் ஹிஸ்டோகிராம்கள், அதிகபட்ச தூர ஹிஸ்டோகிராம்கள், வடிவ பல துளைகள். ஒருங்கிணைக்கக்கூடிய மற்றும் மெய்நிகர் இரசாயனங்களின் ஜிகா தேடல் தரவுத்தளங்கள் ஒவ்வொரு ஆண்டும் பெரிதாகி வருகின்றன, எனவே அவற்றை திறம்பட சுரங்கப்படுத்தும் திறன் மருந்து கண்டுபிடிப்பு திட்டங்களுக்கு முக்கியமானது. மோல்சாஃப்ட்டின் மோல்கார்ட் கிகா தேடல் (http://www.molsoft.com/giga-search.html) பில்லியன் கணக்கான இரசாயனங்களின் அடிப்பகுதி தேடலுக்காக வடிவமைக்கப்பட்ட முதல் முறையாகும். மூலக்கூறுகளின் கட்டமைப்பிற்கு அப்பாற்பட்ட அனைத்து பண்புகளையும் இயற்பியல்-வேதியியல் அல்லது மருந்தியல் பண்புகளாகப் பிரிக்கலாம், அவை விளக்கங்கள் என்றும் அழைக்கப்படுகின்றன. அதற்கு மேல், அதிகமாகவோ அல்லது குறைவாகவோ தெளிவற்ற பெயர்கள் மற்றும் ஒத்த சொற்களை வழங்கும் மூலக்கூறுகளுக்கு பல்வேறு செயற்கை மற்றும் அதிகமாகவோ அல்லது குறைவாகவோ தரப்படுத்தப்பட்ட பெயரிடும் அமைப்புகள் உள்ளன. IUPAC பெயர் பொதுவாக ஒரு மூலக்கூறின் கட்டமைப்பை மனிதனால் படிக்கக்கூடிய மற்றும் தனித்துவமான சரம் இரண்டிலும் பிரதிநிதித்துவப்படுத்த ஒரு நல்ல தேர்வாகும், இருப்பினும் இது பெரிய மூலக்கூறுகளுக்கு பெரியதாக இல்லை. மறுபுறம் அற்பமான பெயர்கள் ஒத்த சொற்கள் மற்றும் ஒத்த சொற்களால் நிரம்பியுள்ளன, எனவே வரையறுக்கும் தரவுத்தள விசையாக ஒரு மோசமான தேர்வாகும். மூலக்கூறு எடை, (பகுதி) சார்ஜ், கரைதிறன் போன்ற இயற்பியல்-வேதியியல் விளக்கங்கள். பெரும்பாலும் மூலக்கூறின் கட்டமைப்பை நேரடியாக அடிப்படையாகக் கொண்டு கணக்கிடப்படலாம், மருந்தியல் விளக்கங்களை மறைமுகமாக சம்பந்தப்பட்ட பன்முக புள்ளியியல் அல்லது சோதனை (ஸ்கிரீனிங், பயோஅஸ்ஸே) முடிவுகளைப் பயன்படுத்தி மட்டுமே பெற முடியும். அந்த விளக்கங்கள் அனைத்தும் கணக்கீட்டு முயற்சியின் காரணங்களுக்காக மூலக்கூறின் பிரதிநிதித்துவத்துடன் சேமிக்கப்படலாம் மற்றும் பொதுவாக உள்ளன. ஒற்றுமை மூலக்கூறு ஒற்றுமைக்கு ஒற்றை வரையறை இல்லை, இருப்பினும் கருத்து பயன்பாட்டின் படி வரையறுக்கப்படலாம் மற்றும் பெரும்பாலும் விளக்க இடத்தில் தூரத்தின் அளவின் தலைகீழ் என்று விவரிக்கப்படுகிறது. உதாரணமாக, மூலக்கூறு எடைகளில் உள்ள வேறுபாடு மற்றவற்றுடன் ஒப்பிடும்போது குறைவாக இருந்தால் இரண்டு மூலக்கூறுகள் மிகவும் ஒத்ததாகக் கருதப்படலாம். பல வேறுபட்ட தூர அளவீட்டை உருவாக்க பல்வேறு வகையான பிற நடவடிக்கைகளை இணைக்க முடியும். முக்கோண சமத்துவமின்மை உள்ளதா என்பதைப் பொறுத்து தூர அளவீடுகள் பெரும்பாலும் யூக்ளிடிய அளவீடுகள் மற்றும் யூக்ளிடியன் அல்லாத அளவீடுகளாக வகைப்படுத்தப்படுகின்றன. அதிகபட்ச பொதுவான துணை வரைபடம் (எம். சி. எஸ்) அடிப்படையிலான உட்பிரிவு தேடல் (ஒற்றுமை அல்லது தூர அளவீடு) மிகவும் பொதுவானது. பொதுவான துணை வரைபடத்தை (அடிப்பகுதி) பகிர்ந்து கொள்ளும் மூலக்கூறுகளைத் தாக்குவதன் மூலம் சேர்மங்கள் போன்ற மருந்துகளைத் திரையிடவும் எம். சி. எஸ் பயன்படுத்தப்படுகிறது. தரவுத்தளங்களில் உள்ள இரசாயனங்கள் ஒற்றுமைகளின் அடிப்படையில் 'ஒத்த' மூலக்கூறுகளின் குழுக்களாக தொகுக்கப்படலாம். படிநிலை மற்றும் படிநிலை அல்லாத கிளஸ்டரிங் அணுகுமுறைகள் இரண்டும் பல பண்புகளைக் கொண்ட இரசாயன நிறுவனங்களுக்கு பயன்படுத்தப்படலாம். இந்த பண்புக்கூறுகள் அல்லது மூலக்கூறு பண்புகள் அனுபவ ரீதியாகவோ அல்லது கணக்கீட்டு ரீதியாக பெறப்பட்ட விளக்கங்களாகவோ தீர்மானிக்கப்படலாம். மிகவும் பிரபலமான கிளஸ்டரிங் அணுகுமுறைகளில் ஒன்று ஜார்விஸ்-பேட்ரிக் வழிமுறை ஆகும். மருந்தியல் சார்ந்த வேதியியல் களஞ்சியங்களில், ஒற்றுமை பொதுவாக சேர்மங்களின் உயிரியல் விளைவுகளின் (ADME/tox) அடிப்படையில் வரையறுக்கப்படுகிறது, அவை QSAR முறைகளைப் பயன்படுத்தி இயற்பியல்-வேதியியல் விளக்கங்களின் ஒத்த சேர்க்கைகளிலிருந்து அரை தானியங்கி முறையில் ஊகிக்கப்படலாம். இரசாயன சேர்மங்களில் தனித்துவமான பதிவுகளைப் பராமரிப்பதற்கான பதிவு அமைப்புகள் தரவுத்தள அமைப்புகள் பதிவு அமைப்புகள் என்று அழைக்கப்படுகின்றன. இவை பெரும்பாலும் இரசாயன குறியீட்டு முறை, காப்புரிமை அமைப்புகள் மற்றும் தொழில்துறை தரவுத்தளங்களுக்கு பயன்படுத்தப்படுகின்றன. பதிவு முறைகள் பொதுவாக தனித்துவமான பிரதிநிதித்துவங்களைப் பயன்படுத்துவதன் மூலம் தரவுத்தளத்தில் குறிப்பிடப்படும் இரசாயனத்தின் தனித்துவத்தை அமல்படுத்துகின்றன. ஸ்ட்ரிங்கிஃபைட் குறியீடுகளின் தலைமுறைக்கு முன்னுரிமை விதிகளைப் பயன்படுத்துவதன் மூலம், 'கனோனிக்கல் ஸ்மைல்ஸ்' போன்ற தனித்துவமான/'கனோனிக்கல்' ஸ்ட்ரிங் பிரதிநிதித்துவங்களைப் பெறலாம். சிஏஎஸ் அமைப்பு போன்ற சில பதிவு அமைப்புகள் அதே நோக்கத்தை அடைய தனித்துவமான ஹாஷ் குறியீடுகளை உருவாக்க வழிமுறைகளைப் பயன்படுத்துகின்றன. ஒரு பதிவு முறைக்கும் ஒரு எளிய இரசாயன தரவுத்தளத்திற்கும் இடையிலான முக்கிய வேறுபாடு என்னவென்றால், அறியப்பட்ட, அறியப்படாத மற்றும் ஓரளவு அறியப்பட்டவற்றை துல்லியமாக பிரதிநிதித்துவப்படுத்தும் திறன் ஆகும். எடுத்துக்காட்டாக, ஒரு இரசாயன தரவுத்தளம் குறிப்பிடப்படாத ஸ்டீரியோ கெமிஸ்ட்ரி கொண்ட ஒரு மூலக்கூறை சேமிக்கக்கூடும், அதேசமயம் ஒரு இரசாயன பதிவக அமைப்பில் ஸ்டீரியோ உள்ளமைவு தெரியவில்லை, ஒரு குறிப்பிட்ட (அறியப்பட்ட) கலவை அல்லது ரேசிமிக் என்பதை பதிவாளர் குறிப்பிட வேண்டும். இரசாயனப் பதிவேடு அமைப்பில் இவை ஒவ்வொன்றும் வெவ்வேறு பதிவாகக் கருதப்படும். இரசாயனங்களில் உள்ள ஆலசன் அயனிகளில் உள்ள வேறுபாடுகள் போன்ற அற்பமான வேறுபாடுகளைக் கருத்தில் கொள்வதைத் தவிர்ப்பதற்காக பதிவு முறைகள் மூலக்கூறுகளை முன்கூட்டியே செயலாக்குகின்றன. வேதியியல் சுருக்கங்கள் சேவை (சிஏஎஸ்) பதிவு முறை ஒரு எடுத்துக்காட்டு. சிஏஎஸ் பதிவேடு எண்ணையும் பார்க்கவும். வேதியியல் தோட்டாக்கள் ஒப்பந்தத்தின் பட்டியல் டைரக்ட் ஜே கெம் கேம்பிரிட்ஜ்சாஃப்ட் பிங்கோ பின் பாயிண்ட் வேதியியல் பதிவு முறைகளின் பட்டியல் கெம்ரெக் பதிவு ரெக்மோல் கலவை-பதிவு தொகுப்பு வலை அடிப்படையிலான கருவிகள் கணக்கீட்டு பிரதிநிதித்துவங்கள் பொதுவாக வேதியியலாளர்களுக்கு தரவின் வரைகலை காட்சி மூலம் வெளிப்படையாக செய்யப்படுகின்றன. வேதியியல் கட்டமைப்பு எடிட்டர்களைப் பயன்படுத்துவதன் மூலமும் தரவு உள்ளீடு எளிமைப்படுத்தப்படுகிறது. இந்த ஆசிரியர்கள் உள்நாட்டில் வரைகலை தரவை கணக்கீட்டு பிரதிநிதித்துவங்களாக மாற்றுகிறார்கள். பிரதிநிதித்துவத்தின் பல்வேறு வடிவங்களின் ஒன்றோடொன்று மாற்றுவதற்கான ஏராளமான வழிமுறைகளும் உள்ளன. மாற்றத்திற்கான திறந்த மூல பயன்பாடு ஓபன்பாபெல் ஆகும். இந்த தேடல் மற்றும் மாற்று வழிமுறைகள் தரவுத்தள அமைப்பிற்குள் செயல்படுத்தப்படுகின்றன அல்லது இப்போது போக்கு நிலையான தொடர்புடைய தரவுத்தள அமைப்புகளுக்குள் பொருந்தக்கூடிய வெளிப்புற கூறுகளாக செயல்படுத்தப்படுகிறது. ஆரக்கிள் மற்றும் போஸ்ட்கிரேஎஸ்கியூஎல் அடிப்படையிலான அமைப்புகள் இரண்டும் பயனர் வரையறுக்கப்பட்ட தரவு வகைகளை அனுமதிக்கும் கார்ட்ரிட்ஜ் தொழில்நுட்பத்தைப் பயன்படுத்துகின்றன. இவை இரசாயன தேடல் நிலைமைகளுடன் SQL வினவல்களைச் செய்ய பயனரை அனுமதிக்கின்றன (எடுத்துக்காட்டாக, ஒரு ஸ்மைல்ஸ்கோல் நெடுவரிசையில் ஒரு ஸ்மைல்ஸ் சரமாக குறிப்பிடப்படும் கட்டமைப்பில் ஒரு ஃபீனைல் வளையத்தைக் கொண்ட பதிவுகளைத் தேடுவதற்கான வினவல் தேர்ந்தெடுக்கப்படலாம் * செமடபிள் சரத்திலிருந்து SMILESCOL.CONTAINS ('c1CCCCc1') IUPAC பெயர்களை கட்டமைப்பு பிரதிநிதித்துவங்களாக மாற்றுவதற்கான வழிமுறைகள் மற்றும் உரையிலிருந்து கட்டமைப்பு தகவல்களைப் பிரித்தெடுப்பதற்கும் நேர்மாறாகவும் பயன்படுத்தப்படுகின்றன. இருப்பினும், IUPAC இன் பல பேச்சுவழக்குகள் இருப்பதால் சிரமங்கள் உள்ளன. தனித்துவமான IUPAC தரநிலையை நிறுவுவதற்கான பணிகள் நடந்து வருகின்றன (InChi ஐப் பார்க்கவும்). உயிரியல் தரவுத்தளம் பெயில்ஸ்டீன் தரவுத்தளம் மற்றும் டார்ட்மண்ட் தரவு வங்கி பைண்டிங் டி. பி. சி. இ. பி. சி. இ. எம். இ. எம். பி. எல் கெமிஸ்சஸ் சென்ட்ரல்ப்ளாட் கட்டமைப்பு தரவுத்தளம் கெம்ஸ்பைடர் கூட்டு மருந்து கண்டுபிடிப்பு ஒப்பீட்டு டாக்ஸிகோஜெனமிக்ஸ் தரவுத்தளம் கணக்கீட்டு வேதியியல் பட்டியல் மருந்து வங்கி வேதியியல் தரவுத்தளங்களின் பட்டியல் மூலக்கூறு இயக்கவியல் மாடலிங் எல். ஓ. எல். ஐ தரவுத்தளம் என். எம். ஆர் ஸ்பெக்ட்ரா தரவுத்தளத்திற்கான மென்பொருளின் பட்டியல் பப்செம் எஸ். பி. ஆர். இ. எஸ். ஐ தரவுத்தளம் கொலோகலைசேஷன் பெஞ்ச்மார்க் கொலோகலைசேஷன் சோர்ஸ் குறிப்புகள் கணக்கீட்டு வேதியியல் கெமின்ஃபார்மேடிக்ஸ்