Alphaproteobacteria
ஆல்பாபிரோடியோபாக்டீரியா என்பது சூடோமோனடோட்டா (முன்பு புரோட்டியோபாக்டீரியா) என்ற பைலம் பாக்டீரியாவின் ஒரு வகுப்பாகும். மேக்னட்டோகோக்கேல்ஸ் மற்றும் மாரிப்ரோஃபண்டேல்ஸ் ஆகியவை அல்பாபிரோடியோபாக்டீரியாவின் அடித்தளமாக அல்லது சகோதரியாக கருதப்படுகின்றன. அல்பாபிரோடியோபாக்டீரியா மிகவும் மாறுபட்டது மற்றும் சில ஒற்றுமைகளைக் கொண்டுள்ளது, இருப்பினும் ஒரு பொதுவான மூதாதையரைப் பகிர்ந்து கொள்கிறது. அனைத்து புரோட்டியோபாக்டீரியாவையும் போலவே, அதன் உறுப்பினர்களும் கிராம்-நெகட்டிவ் மற்றும் அதன் சில இன்ட்ராசெல்லுலர் ஒட்டுண்ணி உறுப்பினர்களுக்கு பெப்டிடோகிளைகான் இல்லை, இதன் விளைவாக கிராம் மாறுபடும். பண்புகள் அல்பாபிரோடியோபாக்டீரியா ஒரு மாறுபட்ட வகைப்பாட்டி மற்றும் பல ஒளிச்சேர்க்கை இனங்களைக் கொண்டுள்ளது, பல இனங்கள் சி 1-சேர்மங்களை வளர்சிதை மாற்றுகின்றன (எ. கா., மெத்திலோபாக்டீரியம் எஸ்பிபி. ), தாவரங்களின் குறியீடுகள் (எ. கா., ரைசோபியம் எஸ்பிபி. ), ஆர்த்ரோபாட்களின் எண்டோசிம்பியான்டுகள் (வோல்பாச்சியா) மற்றும் ஊடுருவல் நோய்க்கிருமிகள் (எ. கா. ரிக்கெட்சியா). மேலும், இந்த வகுப்பு புரோட்டோமிட்டோகாண்ட்ரியனின் சகோதரி, யூகாரியோடிக் மூதாதையரால் சூழப்பட்ட பாக்டீரியா மற்றும் மைட்டோகாண்ட்ரியாவை உருவாக்கியது, அவை யூகாரியோடிக் உயிரணுக்களில் உள்ள உறுப்புகளாகும் (எண்டோசிம்பியோடிக் கோட்பாட்டைப் பார்க்கவும்). தொழில்நுட்ப ஆர்வமுள்ள ஒரு இனம் ரைசோபியம் ரேடியோபாக்டர் (முன்பு அக்ரோபாக்டீரியம் டுமேஃபாசியன்ஸ்): விஞ்ஞானிகள் பெரும்பாலும் இந்த இனத்தைப் பயன்படுத்தி வெளிநாட்டு டி. என். ஏவை தாவர மரபணுக்களுக்கு மாற்றுகிறார்கள். பெலாஜிபாக்டர் உபிக் போன்ற ஏரோபிக் அனோக்ஸிஜெனிக் ஃபோட்டோட்ரோபிக் பாக்டீரியாக்கள் பரவலாக பரவியிருக்கும் ஆல்பா புரோடியோபாக்டீரியாக்கள் மற்றும் திறந்த கடல் நுண்ணுயிர் சமூகத்தில் 10 சதவீதத்திற்கும் அதிகமாக இருக்கலாம். பரிணாமம் மற்றும் மரபியல் வரிசைகளின் பைலோஜெனியில் சில கருத்து வேறுபாடுகள் உள்ளன, குறிப்பாக பெலாஜிபாக்டீரியலின் இருப்பிடத்திற்கு, ஆனால் ஒட்டுமொத்தமாக சில ஒருமித்த கருத்து உள்ளது. மரபணு உள்ளடக்கத்தில் உள்ள பெரிய வேறுபாட்டால் இந்த கருத்து வேறுபாடு உருவாகிறது (எ. கா. Pelagibacter ubique இல் மரபணு நெறிப்படுத்தல்) மற்றும் பல வரிசைகளின் உறுப்பினர்களிடையே GC-உள்ளடக்கத்தில் பெரிய வேறுபாடு. குறிப்பாக, பெலாஜிபாக்டீரியல்ஸ், ரிக்கெட்சியாலிஸ் மற்றும் ஹோலோஸ்போரேல்ஸ் ஆகியவை ஏ. டி நிறைந்த மரபணுக்களைக் கொண்ட இனங்களைக் கொண்டுள்ளன. இது ஒருங்கிணைந்த பரிணாம வளர்ச்சியின் ஒரு நிகழ்வாக இருக்கலாம், இது ஒரு கலைப்பொருட்களின் தொகுப்புக்கு வழிவகுக்கும் என்று வாதிடப்பட்டுள்ளது. இருப்பினும், பல ஆய்வுகள் உடன்படவில்லை. மேலும், ரைபோசோமல் ஆர்என்ஏவின் ஜிசி-உள்ளடக்கம் (புரோக்கரியோட்டுகளுக்கான பாரம்பரிய பைலோஜெனெடிக் மார்க்கர்) மரபணுவின் ஜிசி-உள்ளடக்கத்தை குறைவாக பிரதிபலிக்கிறது என்று கண்டறியப்பட்டுள்ளது. பைலோஜெனியுடன் ரைபோசோமல் ஜி. சி-உள்ளடக்கத்தின் இந்த வழக்கத்திற்கு மாறான அலங்கார உறவின் ஒரு எடுத்துக்காட்டு என்னவென்றால், ஹோலோஸ்போரலஸின் உறுப்பினர்கள் பெலாஜிபாக்டீரியல்ஸ் மற்றும் ரிக்கெட்ஸியலஸின் உறுப்பினர்களை விட மிக அதிக ரைபோசோமல் ஜி. சி-உள்ளடக்கத்தைக் கொண்டுள்ளனர், இருப்பினும் அவை பிந்தைய இரண்டு வரிசைகளின் உறுப்பினர்களை விட அதிக மரபணு ஜி. சி-உள்ளடக்கங்களைக் கொண்ட இனங்களுடன் மிகவும் நெருக்கமாக தொடர்புடையவை. கிளாஸ் அல்பாபிரோடியோபாக்டீரியா மூன்று துணைப்பிரிவுகளாகப் பிரிக்கப்பட்டுள்ளது, அவை மேக்னட்டோகோசிடே, ரிக்கெட்ஸிடே மற்றும் கோலோபாக்டிடே ஆகும். அடிப்படைக் குழு மேக்னட்டோகாக்கிடே ஆகும், இது ஒரு பெரிய பன்முகத்தன்மை கொண்ட மேக்னடோடாக்டிக் பாக்டீரியாவால் ஆனது, ஆனால் ஒன்று மட்டுமே விவரிக்கப்பட்டுள்ளது, மேக்னட்டோகாக்கஸ் மரினஸ். ரிக்கெட்சைடே இன்ட்ராசெல்லுலர் ரிக்கெட்சியாலஸ் மற்றும் சுதந்திரமாக வாழும் பெலாஜிபாக்டீரியல்ஸ் ஆகியவற்றால் ஆனது. கோலோபாக்டீரியே என்பது ஹோலோஸ்போரேல்ஸ், ரோடோஸ்பிரில்லேல்ஸ், ஸ்பிங்கோமோனாடேல்ஸ், ரோடோபாக்டீரியேல்ஸ், கோலோபாக்டீரியேல்ஸ், கிலோனியெல்லேல்ஸ், கோர்டிமோனாடேல்ஸ், பர்வுலர்குலேஸ் மற்றும் ஸ்னீத்தியெல்லேல்ஸ் ஆகியவற்றால் ஆனது. வரிசைப்படுத்தப்பட்ட மரபணுக்களின் ஒப்பீட்டு பகுப்பாய்வுகள் பரவலாக விநியோகிக்கப்பட்ட புரதங்கள் மற்றும் முழு புரதங்களில் (அதாவது. கையொப்ப புரதங்கள்) அவை அனைத்து அல்பாபிரோடியோபாக்டீரியாக்களின் தனித்துவமான பண்புகளாகும், அல்லது அவற்றின் வெவ்வேறு முக்கிய வரிசைகள் (அதாவது. ரைசோபியலஸ், ரோடோபாக்டீரியல்ஸ், ரோடோஸ்பிரில்லல்ஸ், ரிக்கெட்ஸியலஸ், ஸ்பிங்கோமோனாடல்ஸ் மற்றும் கோலோபாக்டீரியல்ஸ்) மற்றும் குடும்பங்கள் (அதாவது. ரிக்கெட்சியேசியே, அனப்லாஸ்மாட்டேசியே, ரோடோஸ்பிரில்லேசியே, அசிட்டோபாக்டீரேசியே, பிராடிரியோசோபியேசியே, புரூசெல்லேசியே மற்றும் பார்டோனெல்லேசியே). இந்த மூலக்கூறு கையொப்பங்கள் இந்த வகைபிரித்தல் குழுக்களை சுற்றிவளைப்பதற்கும், இந்த குழுக்களில் புதிய இனங்களை அடையாளம் காண்பதற்கும்/ஒதுக்குவதற்கும் புதுமையான வழிமுறைகளை வழங்குகின்றன. அதிக எண்ணிக்கையிலான பிற புரதங்களில் உள்ள பைலோஜெனெடிக் பகுப்பாய்வுகள் மற்றும் பாதுகாக்கப்பட்ட இண்டல்கள், பீட்டாபிரோடியோபாக்டீரியா மற்றும் கம்மாபிரோடியோபாக்டீரியா தவிர மற்ற பைலா மற்றும் பாக்டீரியாவின் வகைகளை விட அல்பாபிரோடியோபாக்டீரியா பின்னர் கிளைத்துள்ளன என்பதற்கான ஆதாரங்களை வழங்குகின்றன. அல்பாபிரோடியோபாக்டீரியாவின் பைலோஜெனி தொடர்ந்து மறுபரிசீலனை செய்யப்பட்டு புதுப்பிக்கப்பட்டுள்ளது. ஆல்பா புரோடியோபாக்டீரியாவில் மேக்னட்டோகாசிடே சேர்க்கப்படுவது குறித்து சில விவாதங்கள் உள்ளன. எடுத்துக்காட்டாக, மேக்னட்டோகோசிடேக்கு ஒரு சுயாதீனமான புரோட்டியோபாக்டீரியல் வகுப்பு (எடாப்ரோடியோபாக்டீரியா) முன்மொழியப்பட்டுள்ளது. ஒரு சமீபத்திய பைலோஜெனமிக் ஆய்வு, மேக்னட்டோகோசிடே மற்றும் மற்ற அனைத்து ஆல்பா புரோடியோபாக்டீரியல் வகைக்கும் இடையில் புரோட்டோமிட்டோகாண்ட்ரியல் கிளேடை வைப்பதைக் குறிக்கிறது, இது மேக்னட்டோகோசிடே தவிர மற்ற ஆல்பா புரோடியோபாக்டீரியாவிலிருந்து புரோட்டோமிட்டோகாண்ட்ரியல் பரம்பரையின் ஆரம்ப வேறுபாட்டைக் குறிக்கிறது. புரோட்டோமிட்டோகாண்ட்ரியல் பரம்பரைக்கு ரிக்கெட்ஸிடேவுடன் நெருங்கிய உறவு இருக்க வேண்டிய அவசியமில்லை என்றும் இந்த பைலோஜெனி கூறுகிறது. Incertae Sedis பின்வரும் வகைப்பாடுகள் அல்பாபிரோடியோபாக்டீரியாவுக்கு ஒதுக்கப்பட்டுள்ளன, ஆனால் ஒன்று அல்லது அதற்கு மேற்பட்ட இடைப்பட்ட வகைபிரித்தல் தரவரிசைகளுக்கு ஒதுக்கப்படவில்லைஃ மின்வியேல்ஸ் சன் மற்றும் பலர் துணைப்பிரிவுக்கு ஒதுக்கப்படாத ஆணைகள். 2018 ஜெனரா ஒரு குடும்பத்திற்கு ஒதுக்கப்படவில்லை "கேண்டிடேட்டஸ் அனோக்ஸிபெலாஜிபாக்டர்" ரூயிஸ்-பெரெஸ் மற்றும் பலர். 2021 "பிலோஃபோகாக்கஸ்" மோன்ச் 1988 "கரோனோமைக்ரோபியம்" சோட்டோனி மற்றும் பலர். 2011 "கேண்டிடேட்டஸ் எண்டோலிசோக்ளினம்" க்வான் மற்றும் பலர். 2012 "கேண்டிடேட்டஸ் எண்டோவாட்டர்ஸிபோரா" ஆண்டர்சன் மற்றும் ஹேகுட் 2007 "கேண்டிடேட்டஸ் ஹாலிசியோமைக்ரோபியம்" லெவண்டேசி மற்றும் பலர். 2004 "கேண்டிடேட்டஸ் ஹாலிசாஸ்பேரா" கிரகெலண்ட் மற்றும் பலர். 2006 "கேண்டிடேட்டஸ் ஹோட்ஜ்கினியா" மெக்கட்சியோன் மற்றும் பலர். 2009 "கேண்டிடேட்டஸ் லாரிஸ்கெல்லா" மாட்சுரா மற்றும் பலர். 2012 "மரினோசல்போனோமோனாஸ்" ஹோம்ஸ் மற்றும் பலர். 1997 "கேண்டிடேட்டஸ் மெசோபெலாஜிபாக்டர்" ரூயிஸ்-பெரெஸ் மற்றும் பலர். 2021 "மெத்திலொசல்போனோமோனாஸ்" ஹோம்ஸ் மற்றும் பலர். 1997 "கேண்டிடேட்டஸ் மோனிலிபாக்டர்" Kragelund மற்றும் பலர். 2006 "நானோபாக்டீரியம்" சிஃப்ட்சியோக்லு மற்றும் பலர். 1997 "ஒலியோமோனாஸ்" கனமோரி மற்றும் பலர். 2002 "கேண்டிடேட்டஸ் பாராஹோலோஸ்போரா" எஷ்பாக் மற்றும் பலர். 2009 "கேண்டிடேட்டஸ் பைகோசோசியஸ்" தனபே மற்றும் பலர். 2015 "கேண்டிடேட்டஸ் புனிசிஸ்பிரில்லம்" ஓ மற்றும் பலர். 2010 "டெட்ராகோக்கஸ்" பிளாக்கால் மற்றும் பலர். 1997 "ட்யூபெராய்டோபாக்டர்" நிக்கிடின் 1983 இனங்கள் வைப்ரியோ தழுவல் முயர் மற்றும் பலர் ஒரு இனத்திற்கு ஒதுக்கப்படவில்லை. 1990 விப்ரியோ சைக்ளோசைட்ஸ் முயர் மற்றும் பலர். 1990 பைலோஜெனி தற்போது ஏற்றுக்கொள்ளப்பட்ட வகைபிரித்தல் பெயரிடுதலில் நிற்கும் (எல்பிஎஸ்என்) புரோக்கரியோடிக் பெயர்களின் பட்டியலை அடிப்படையாகக் கொண்டது. பைலோஜெனி முழு-மரபணு பகுப்பாய்வை அடிப்படையாகக் கொண்டது. துணைப்பிரிவு பெயர்கள் ஃபெர்லா மற்றும் பலரை அடிப்படையாகக் கொண்டவை. (2013). இயற்கையான மரபணு மாற்றம் அல்பாபிரோடியோபாக்டீரியாவில் இயற்கையான மரபணு மாற்றம் குறித்து ஒரு சில ஆய்வுகள் மட்டுமே பதிவாகியிருந்தாலும், இந்த செயல்முறை அக்ரோபாக்டீரியம் டுமேஃபேசியன்ஸ், மெத்திலோபாக்டீரியம் ஆர்கனோஃபிலம் மற்றும் பிராடிரிசோபியம் ஜாபோனிகம் ஆகியவற்றில் விவரிக்கப்பட்டுள்ளது. இயற்கையான மரபணு மாற்றம் என்பது ஒரு பாக்டீரியா உயிரணுவிலிருந்து மற்றொரு பாக்டீரியா உயிரணுவிற்கு இடைப்பட்ட ஊடகத்தின் மூலம் டிஎன்ஏ பரிமாற்றத்தை உள்ளடக்கிய ஒரு பாலியல் செயல்முறையாகும், மேலும் நன்கொடையாளர் வரிசையை பெறுநரின் மரபணுவில் ஒரே மாதிரியான மறுசீரமைப்பு மூலம் ஒருங்கிணைத்தல். குறிப்புகள் வெளிப்புற இணைப்புகள் பாக்டீரியா (புரோக்கரியோடிக்) பைலோஜெனி வலைப்பக்கம்ஃ ஆல்பா புரோட்டியோபாக்டீரியா. பாக்டீரியா வகுப்புகள்