23S ribosomal RNA
23S rRNA என்பது பாக்டீரியா/ஆர்க்கியன் ரைபோசோமின் பெரிய துணை அலகு (50S) இன் 2,904 நியூக்ளியோடைடு நீளமுள்ள (ஈ. கோலியில்) கூறு மற்றும் பெப்டிடைல் டிரான்ஸ்பரேஸ் மையத்தை (PTC) உருவாக்குகிறது. 23S rRNA ஐ-VI என்ற தலைப்பில் ஆறு இரண்டாம் நிலை கட்டமைப்பு களங்களாகப் பிரிக்கப்பட்டுள்ளது, அதனுடன் தொடர்புடைய 5S rRNA களம் VII ஆகக் கருதப்படுகிறது. ரைபோசோமல் பெப்டிடைல் டிரான்ஸ்பரேஸ் செயல்பாடு இந்த ஆர்ஆர்என்ஏவின் களம் வி இல் உள்ளது, இது மொழிபெயர்ப்பைத் தடுக்கும் நுண்ணுயிர் எதிர்ப்பிகளுக்கான மிகவும் பொதுவான பிணைப்பு தளமாகும், இது ரைபோசோமல் பொறியியலுக்கான இலக்காக அமைகிறது. இந்த ஆண்டிபயாடிக் வகுப்பின் நன்கு அறியப்பட்ட உறுப்பினரான குளோராம்ஃபெனிகோல், பெப்டைட் பிணைப்பு உருவாக்கத்தைத் தடுப்பதன் மூலம் செயல்படுகிறது, சமீபத்திய 3D-கட்டமைப்பு ஆய்வுகள் ரைபோசோமின் இனங்களைப் பொறுத்து இரண்டு வெவ்வேறு பிணைப்பு தளங்களைக் காட்டுகின்றன. 23S rRNA இன் களங்களில் பெப்டிடைல் டிரான்ஸ்பரேஸ் செயல்பாட்டுடன் ஏராளமான பிறழ்வுகள் ஆன்டிபயாடிக் எதிர்ப்புக்கு வழிவகுத்தன. 23S rRNA மரபணுக்கள் பொதுவாக மற்ற rRNA களுடன் ஒப்பிடும்போது செருகல்கள் மற்றும்/அல்லது நீக்குதல்கள் உட்பட அதிக வரிசை மாறுபாடுகளைக் கொண்டுள்ளன. 23S LSU rRNA இன் யூகாரியோடிக் ஹோமோலோக் 28S ரைபோசோமல் RNA ஆகும், இது 5.8S ரைபோசோமல் RNA ஆல் நிரப்பப்பட்ட ஒரு பகுதியைக் கொண்டுள்ளது. 23S rRNA செயல்பாடுகள் பொதுவாக, rRNA பெப்டிடைல் டிரான்ஸ்பரேஸின் இன்றியமையாத செயல்பாட்டைக் கொண்டுள்ளது. ரைபோசோமின் தூண்டுதல் மையப்பகுதி பெப்டைட் பிணைப்பு கட்டமைப்பில் பங்கு வகிக்கிறது. பெப்டிடைல்-டி. ஆர். என். ஏ மற்றும் அமினோஅசைல்-டி. ஆர். என். ஏ இரண்டும் புரதத் தொகுப்பு மற்றும் டிரான்ஸ்பெப்டிடேஷன் பதிலுக்கு முக்கியமானவை. இருப்பினும், 23S rRNA நிலைகள் (G2252, A2451, U2506, மற்றும் U2585) பெரிய ரைபோசோமல் துணைக்குழுவின் P தளத்தில் tRNA பிணைப்புக்கு குறிப்பிடத்தக்க செயல்பாட்டைக் கொண்டுள்ளன. பி தளத்தில் உள்ள இந்த மாற்ற நியூக்ளியோடைடுகள் பெப்டிடைல்-டி. ஆர். என். ஏ பிணைப்பைத் தடுக்கலாம். U2555 மாற்றம் பெப்டிடைல்-tRNA ஐ புரோமைசினுக்கு மாற்றுவதில் தலையிடலாம். மேலும், இந்த நிலைகளில் பாதி G2251, G2253, A2439 மற்றும் U2584 ஆகியவற்றின் வேதியியல் மாற்றம் tRNA பிணைப்பைத் தடுக்க முடியாது. P தளத்துடன் பிணைக்கும் 50S துணை அலகுகளின் பெப்டிடைல்-tRNA 23S rRNA இன் எட்டு நிலைகளை இரசாயன மாற்றத்திலிருந்து பாதுகாக்கிறது. மறுபுறம், 23S rRNA இல் உள்ள பிறழ்வு உயிரணு வளர்ச்சியிலும் தாக்கத்தை ஏற்படுத்தும். பிறழ்வுகள் A1912G, A1919G மற்றும் ேடிபிசி ஒரு சக்திவாய்ந்த வளர்ச்சி பினோட்டைப்களைக் கொண்டுள்ளன, மேலும் அவை மொழிபெயர்ப்பைத் தடுக்கின்றன, அதே நேரத்தில் பிறழ்வுகள் A1916G ஒரு எளிய வளர்ச்சி பினோட்டைப்பைக் கொண்டுள்ளது மற்றும் இது 50S துணை அலகுகளில் குறைபாட்டிற்கு வழிவகுக்கிறது. 23S rRNA ஹெலிக்ஸ் 26a 23S ரைபோசோமல் ஆர்என்ஏ ஆறு களங்களால் ஆனது, இது மூலக்கூறு தொடர்புகளின் சிக்கலான வலையமைப்பை உருவாக்குகிறது. ஒரு மைய ஒற்றை-இழைப் பகுதி இரண்டு பகுதிகளின் அடிப்படை-இணைப்பின் மூலம் அனைத்து களங்களையும் இணைக்கிறது, இது ஹெலிக்ஸ் 26a ஐ உருவாக்குகிறது. சிலர் ஹெலிக்ஸ் 26a ஐ டொமைன் 0 என்று கருதுகின்றனர், ஏனெனில் இது ஒரு மைய மையமாகவும் சிறிய மடிப்பு அலகாகவும் செயல்படுகிறது. உயிரினங்கள் முழுவதும் 23S மற்றும் 28S ரைபோசோமல் ஆர்என்ஏ வரிசைகளின் ஒப்பீடு ஹெலிக்ஸ் 26a இன் பாதுகாப்பை நிரூபிக்கிறது. டொமைன் கட்டமைப்பின் முதுகெலும்பாக ஹெலிஸ்கள் தொடர்ந்து ஆதரவை வழங்குகின்றன. "உயர்ந்த" தாவரங்களிலிருந்து வரும் பிளாஸ்டிட் குளோரோபிளாஸ்ட் ரைபோசோம்கள் 23S இன் துண்டுப்பிரசுரத்தால் உருவாக்கப்பட்ட கூடுதல் 4.5S rRNA ஐக் கொண்டுள்ளன. இது rRNA ஓபரானில் 23S இன் 3 'பக்கத்தில் அமைந்துள்ளது மற்றும் துண்டு துண்டாக இல்லாத 23S rRNA இன் 3' முனையுடன் ஒத்திருக்கிறது. மேலும் காண்கஃ 23S மெத்தில் ஆர்என்ஏ மையக்கருத்து LSU rRNA குறிப்புகள் வெளிப்புற இணைப்புகள் 23S ரைபோசோமல் ஆர்என்ஏ (பிகேபி00148) ரைபோசோமல் ஆர்என்ஏவின் சூடோக்னாட்டிற்கான சூடோபேஸ் நுழைவு