Protein domain
மூலக்கூறு உயிரியலில், ஒரு புரதக் களம் என்பது ஒரு புரதத்தின் பாலிபெப்டைட் சங்கிலியின் ஒரு பகுதியாகும், இது சுயமாக நிலைநிறுத்தப்பட்டு மற்றவற்றிலிருந்து சுயாதீனமாக மடிக்கிறது. ஒவ்வொரு களமும் ஒரு சிறிய மடிக்கப்பட்ட முப்பரிமாண கட்டமைப்பை உருவாக்குகிறது. பல புரதங்கள் பல களங்களைக் கொண்டுள்ளன, மேலும் ஒரு களம் பல்வேறு வகையான புரதங்களில் தோன்றலாம். மூலக்கூறு பரிணாமம் களங்களை கட்டுமானத் தொகுதிகளாகப் பயன்படுத்துகிறது, மேலும் இவை வெவ்வேறு செயல்பாடுகளுடன் புரதங்களை உருவாக்க வெவ்வேறு ஏற்பாடுகளில் மீண்டும் இணைக்கப்படலாம். பொதுவாக, களங்கள் சுமார் 50 அமினோ அமிலங்கள் முதல் 250 அமினோ அமிலங்கள் வரை நீளத்தில் வேறுபடுகின்றன. துத்தநாக விரல்கள் போன்ற குறுகிய களங்கள் உலோக அயனிகள் அல்லது டைசல்பைடு பாலங்களால் உறுதிப்படுத்தப்படுகின்றன. களங்கள் பெரும்பாலும் கால்மோடுலினின் கால்சியம்-பிணைப்பு EF கை களம் போன்ற செயல்பாட்டு அலகுகளை உருவாக்குகின்றன. அவை சுயாதீனமாக நிலையானவை என்பதால், சிமெரிக் புரதங்களை உருவாக்க ஒரு புரதத்திற்கும் மற்றொரு புரதத்திற்கும் இடையில் மரபணு பொறியியல் மூலம் களங்களை "மாற்றலாம்". பின்னணி இந்த களத்தின் கருத்து முதன்முதலில் 1973 ஆம் ஆண்டில் வெட்ட்லாஃபரால் முன்மொழியப்பட்டது, கோழி லைசோசைம் மற்றும் பாப்பைன் பற்றிய எக்ஸ்ரே படிகவியல் ஆய்வுகளுக்குப் பிறகு மற்றும் இம்யூனோகுளோபூலின்களின் வரையறுக்கப்பட்ட புரோட்டியோலிசிஸ் ஆய்வுகள் மூலம். வெட்ட்லாஃபர் களங்களை தன்னியக்கமாக மடிக்கக்கூடிய புரத கட்டமைப்பின் நிலையான அலகுகள் என்று வரையறுத்தார். கடந்த காலத்தில் களங்கள் பின்வருவனவற்றின் அலகுகளாக விவரிக்கப்பட்டுள்ளனஃ சிறிய கட்டமைப்பு செயல்பாடு மற்றும் பரிணாம மடிப்பு. ஒவ்வொரு வரையறையும் செல்லுபடியாகும் மற்றும் பெரும்பாலும் ஒன்றுடன் ஒன்று இருக்கும், அதாவது. பல்வேறு புரதங்களிடையே காணப்படும் ஒரு சிறிய கட்டமைப்பு களம் அதன் கட்டமைப்பு சூழலுக்குள் சுயாதீனமாக மடிக்க வாய்ப்புள்ளது. இயற்கை பெரும்பாலும் பல களங்களை ஒன்றிணைத்து ஏராளமான சாத்தியக்கூறுகளுடன் பன்முக மற்றும் பன்முக செயல்பாட்டு புரதங்களை உருவாக்குகிறது. ஒரு மல்டிடோமைன் புரதத்தில், ஒவ்வொரு களமும் அதன் சொந்த செயல்பாட்டை சுயாதீனமாக அல்லது அதன் அண்டை நாடுகளுடன் ஒருங்கிணைந்த முறையில் நிறைவேற்றலாம். களங்கள் வைரஸ் துகள்கள் அல்லது தசை இழைகள் போன்ற பெரிய கூட்டங்களை உருவாக்குவதற்கான தொகுதிகளாக செயல்படலாம் அல்லது என்சைம்கள் அல்லது ஒழுங்குமுறை புரதங்களில் காணப்படும் குறிப்பிட்ட வினையூக்கி அல்லது பிணைப்பு தளங்களை வழங்கலாம். எடுத்துக்காட்டுஃ பைருவேட் கைனேஸ் ஒரு பொருத்தமான எடுத்துக்காட்டு பைருவேட் கைனேஸ் (முதல் படத்தைப் பார்க்கவும்), இது கிளைகோலிடிக் நொதியாகும், இது பிரக்டோஸ்-1,6-பைபாஸ்பேட்டிலிருந்து பைருவேட்டிற்கு பாய்வதை ஒழுங்குபடுத்துவதில் முக்கிய பங்கு வகிக்கிறது. இது அனைத்து-β நியூக்ளியோடைடு-பிணைப்பு களம் (நீல நிறத்தில்), ஒரு α/β-அடி மூலக்கூறு பிணைப்பு களம் (சாம்பல் நிறத்தில்) மற்றும் ஒரு α/β-ஒழுங்குமுறை களம் (ஆலிவ் பச்சை நிறத்தில்) ஆகியவற்றைக் கொண்டுள்ளது, இது பல பாலிபெப்டைட் இணைப்பிகளால் இணைக்கப்பட்டுள்ளது. இந்த புரதத்தில் உள்ள ஒவ்வொரு களமும் பல்வேறு புரதக் குடும்பங்களில் நிகழ்கிறது. மைய α/β-பீப்பாய் அடி மூலக்கூறு பிணைப்பு களம் மிகவும் பொதுவான நொதி மடிப்புகளில் ஒன்றாகும். இது முற்றிலும் தொடர்பில்லாத எதிர்வினைகளை ஊக்குவிக்கும் பல்வேறு நொதி குடும்பங்களில் காணப்படுகிறது. α/β-பீப்பாய் பொதுவாக TIM பீப்பாய் என்று அழைக்கப்படுகிறது, இது ட்ரையோஸ் பாஸ்பேட் ஐசோமரேஸின் பெயரால் பெயரிடப்பட்டது, இது தீர்க்கப்பட்ட முதல் கட்டமைப்பாகும். இது தற்போது கேத் டொமைன் தரவுத்தளத்தில் 26 ஒத்த குடும்பங்களாக வகைப்படுத்தப்பட்டுள்ளது. முதல் மற்றும் கடைசி ஸ்ட்ராண்ட் ஹைட்ரஜன் பிணைப்பால் மூடப்பட்ட β-α-β மையக்கருத்துக்களின் வரிசையிலிருந்து டிஐஎம் பீப்பாய் உருவாகிறது, இது எட்டு ஸ்ட்ராண்டட் பீப்பாய்களை உருவாக்குகிறது. இந்த களத்தின் பரிணாம தோற்றம் குறித்து விவாதம் உள்ளது. ஒரு ஆய்வு ஒரு ஒற்றை மூதாதையர் நொதி பல குடும்பங்களாக பிரிந்திருக்கலாம் என்று பரிந்துரைத்துள்ளது, மற்றொரு ஆய்வு ஒரு நிலையான டிஐஎம்-பீப்பாய் அமைப்பு ஒருங்கிணைந்த பரிணாம வளர்ச்சியின் மூலம் உருவாகியுள்ளது என்று கூறுகிறது. பைருவேட் கைனேஸில் உள்ள டிஐஎம்-பீப்பாய் 'தொடர்ச்சியற்றது', அதாவது களத்தை உருவாக்க பாலிபெப்டைட்டின் ஒன்றுக்கு மேற்பட்ட பிரிவுகள் தேவைப்படுகின்றன. புரதத்தின் பரிணாம வளர்ச்சியின் போது ஒரு களத்தை மற்றொரு களத்தில் செருகியதன் விளைவாக இது இருக்கலாம். கட்டமைப்பு களங்களில் நான்கில் ஒரு பங்கு தொடர்ச்சியற்றவை என்று அறியப்பட்ட கட்டமைப்புகளிலிருந்து காட்டப்பட்டுள்ளது. செருகப்பட்ட β-பீப்பாய் ஒழுங்குமுறை களம் 'தொடர்ச்சியானது', இது பாலிபெப்டைட்டின் ஒற்றை நீட்சியால் ஆனது. புரத கட்டமைப்பின் அலகுகள் ஒரு புரதத்தின் முதன்மை அமைப்பு (அமினோ அமிலங்களின் சரம்) இறுதியில் அதன் தனித்துவமான மடிக்கப்பட்ட முப்பரிமாண (3D) இணக்கத்தை குறியாக்கம் செய்கிறது. ஒரு புரதத்தை 3டி கட்டமைப்பில் மடிப்பதை நிர்வகிக்கும் மிக முக்கியமான காரணி துருவ மற்றும் துருவமற்ற பக்க சங்கிலிகளின் விநியோகம் ஆகும். நீர் சூழலுடன் தொடர்பைத் தவிர்ப்பதற்காக மூலக்கூறின் உட்புறத்தில் ஹைட்ரோபோபிக் பக்க சங்கிலிகளை புதைப்பதன் மூலம் மடிப்பு இயக்கப்படுகிறது. பொதுவாக புரதங்கள் ஹைட்ரோஃபிலிக் எச்சங்களின் ஷெல்லால் சூழப்பட்ட ஹைட்ரோபோபிக் எச்சங்களின் மையத்தைக் கொண்டுள்ளன. பெப்டைட் பிணைப்புகள் துருவமாக இருப்பதால் அவை ஹைட்ரோபோபிக் சூழலில் இருக்கும்போது ஒருவருக்கொருவர் ஹைட்ரஜன் பிணைப்பால் நடுநிலையாக்கப்படுகின்றன. இது பாலிபெப்டைட்டின் பகுதிகளுக்கு வழிவகுக்கிறது, அவை இரண்டாம் நிலை அமைப்பு எனப்படும் வழக்கமான 3D கட்டமைப்பு வடிவங்களை உருவாக்குகின்றன. இரண்டாம் நிலை கட்டமைப்பில் இரண்டு முக்கிய வகைகள் உள்ளனஃ α-ஹெலிசஸ் மற்றும் β-தாள்கள். இரண்டாம் நிலை கட்டமைப்பு கூறுகளின் சில எளிய சேர்க்கைகள் புரத கட்டமைப்பில் அடிக்கடி ஏற்படுவதாகக் கண்டறியப்பட்டுள்ளது, மேலும் அவை சூப்பர் செகண்டரி அமைப்பு அல்லது மையக்கருத்துக்கள் என்று குறிப்பிடப்படுகின்றன. எடுத்துக்காட்டாக, β-ஹேர்பின் மையக்கருத்து ஒரு சிறிய வளையத்தால் இணைக்கப்பட்ட இரண்டு அருகிலுள்ள எதிர் இணையான β-இழைகளைக் கொண்டுள்ளது. இது பெரும்பாலான எதிர் இணையான β கட்டமைப்புகளில் ஒரு தனிமைப்படுத்தப்பட்ட ரிப்பனாகவும், மிகவும் சிக்கலான β-தாள்களின் ஒரு பகுதியாகவும் உள்ளது. மற்றொரு பொதுவான சூப்பர்-செகண்டரி அமைப்பு β-α-β மையக்கருத்து ஆகும், இது இரண்டு இணையான β-ஸ்ட்ராண்ட்களை இணைக்க அடிக்கடி பயன்படுத்தப்படுகிறது. மைய α-ஹெலிக்ஸ் முதல் இழையின் சி-முனையை இரண்டாவது இழையின் என்-முனையுடன் இணைக்கிறது, அதன் பக்க சங்கிலிகளை β-தாளுக்கு எதிராகப் பிணைக்கிறது, எனவே மேற்பரப்பில் இருந்து β-இழைகளின் ஹைட்ரோபோபிக் எச்சங்களைப் பாதுகாக்கிறது. இரண்டு களங்களின் சகப்பிணைப்பு ஒரு செயல்பாட்டு மற்றும் கட்டமைப்பு நன்மையைக் குறிக்கிறது, ஏனெனில் சகப்பிணைப்பு இல்லாத அதே கட்டமைப்புகளுடன் ஒப்பிடும்போது ஸ்திரத்தன்மை அதிகரிக்கிறது. மற்ற நன்மைகள், நீரிய சூழல்களில் நிலையற்றதாக இருக்கக்கூடிய இடைநிலை நொதி பிளவுகளுக்குள் இடைநிலைகளின் பாதுகாப்பு மற்றும் தொடர்ச்சியான எதிர்வினைகளின் தொகுப்புக்குத் தேவையான நொதி செயல்பாட்டின் நிலையான ஸ்டோச்சியோமெட்ரிக் விகிதம் ஆகும். களங்களை தீர்மானிப்பதற்கான ஒரு முக்கியமான கருவியாக கட்டமைப்பு சீரமைப்பு உள்ளது. மூன்றாம் நிலை அமைப்பு பல மையக்கருத்துக்கள் ஒன்றிணைந்து களங்கள் எனப்படும் சுருக்கமான, உள்ளூர், அரை-சுயாதீன அலகுகளை உருவாக்குகின்றன. பாலிபெப்டைட் சங்கிலியின் ஒட்டுமொத்த 3டி அமைப்பு புரதத்தின் மூன்றாம் நிலை அமைப்பு என்று குறிப்பிடப்படுகிறது. களங்கள் மூன்றாம் நிலை கட்டமைப்பின் அடிப்படை அலகுகளாகும், ஒவ்வொரு களமும் வளையப் பகுதிகளால் இணைக்கப்பட்ட இரண்டாம் நிலை கட்டமைப்பு அலகுகளிலிருந்து கட்டப்பட்ட ஒரு தனிப்பட்ட ஹைட்ரோபோபிக் மையத்தைக் கொண்டுள்ளது. பாலிபெப்டைட்டின் பொதி பொதுவாக களத்தின் வெளிப்புறத்தை விட உட்புறத்தில் மிகவும் இறுக்கமாக இருக்கும், இது திடமான போன்ற மையத்தையும் திரவ போன்ற மேற்பரப்பையும் உருவாக்குகிறது. மைய எச்சங்கள் பெரும்பாலும் ஒரு புரதக் குடும்பத்தில் பாதுகாக்கப்படுகின்றன, அதேசமயம் சுழல்களில் உள்ள எச்சங்கள் புரதத்தின் செயல்பாட்டில் ஈடுபடாவிட்டால் அவை குறைவாகவே பாதுகாக்கப்படுகின்றன. புரதத்தின் மூன்றாம் நிலை கட்டமைப்பை களத்தின் இரண்டாம் நிலை கட்டமைப்பு உள்ளடக்கத்தின் அடிப்படையில் நான்கு முக்கிய வகுப்புகளாகப் பிரிக்கலாம். அனைத்து-α களங்களும் α-ஹெலிசஸிலிருந்து பிரத்தியேகமாக கட்டப்பட்ட ஒரு கள மையத்தைக் கொண்டுள்ளன. இந்த வகுப்பில் சிறிய மடிப்புகள் ஆதிக்கம் செலுத்துகின்றன, அவற்றில் பல மேலேயும் கீழேயும் ஓடும் ஹெலிக்ஸ் கொண்ட ஒரு எளிய மூட்டை உருவாக்குகின்றன. அனைத்து-β களங்களும் எதிர் இணையான β-தாள்களால் ஆன ஒரு மையத்தைக் கொண்டுள்ளன, பொதுவாக இரண்டு தாள்கள் ஒன்றுக்கொன்று எதிராக நிரம்பியுள்ளன. இழைகளின் அமைப்பில் பல்வேறு வடிவங்களை அடையாளம் காணலாம், இது பெரும்பாலும் தொடர்ச்சியான மையக்கருத்துக்களின் அடையாளத்திற்கு வழிவகுக்கிறது, எடுத்துக்காட்டாக கிரேக்க முக்கிய மையக்கருத்து. α + β களங்கள் அனைத்து-α மற்றும் அனைத்து-β மையக்கருத்துக்களின் கலவையாகும். இந்த வகுப்பில் புரதங்களை வகைப்படுத்துவது கடினம், ஏனெனில் மற்ற மூன்று வகுப்புகளுடன் ஒன்றுடன் ஒன்று இருப்பதால் இது கேத் டொமைன் தரவுத்தளத்தில் பயன்படுத்தப்படுவதில்லை. α/β களங்கள் β-α-β மையக்கருத்துக்களின் கலவையிலிருந்து தயாரிக்கப்படுகின்றன, அவை முக்கியமாக ஆம்பிபாதிக் α-ஹெலிச்களால் சூழப்பட்ட இணையான β-தாளை உருவாக்குகின்றன. இரண்டாம் நிலை கட்டமைப்புகள் அடுக்குகள் அல்லது பீப்பாய்களில் அமைக்கப்பட்டுள்ளன. களங்களின் அளவு வரம்புகள் அளவு வரம்புகளைக் கொண்டுள்ளன. தனிப்பட்ட கட்டமைப்பு களங்களின் அளவு ஈ-செலக்டினில் 36 எச்சங்கள் முதல் லிபோக்சிஜெனேஸ்-1 இல் 692 எச்சங்கள் வரை மாறுபடும், ஆனால் பெரும்பாலானவை, 90 சதவீதம், சராசரியாக சுமார் 100 எச்சங்களுடன் 200 க்கும் குறைவான எச்சங்களைக் கொண்டுள்ளன. மிகவும் குறுகிய களங்கள், 40 க்கும் குறைவான எச்சங்கள், பெரும்பாலும் உலோக அயனிகள் அல்லது டைசல்பைடு பிணைப்புகளால் உறுதிப்படுத்தப்படுகின்றன. பெரிய களங்கள், 300 க்கும் மேற்பட்ட எச்சங்கள், பல ஹைட்ரோபோபிக் மையங்களைக் கொண்டிருக்க வாய்ப்புள்ளது. குவாட்டர்னரி அமைப்பு பல புரதங்கள் ஒரு குவாட்டர்னரி கட்டமைப்பைக் கொண்டுள்ளன, அவை பல பாலிபெப்டைட் சங்கிலிகளைக் கொண்டுள்ளன, அவை ஒரு ஒலிகோமெரிக் மூலக்கூறுடன் இணைகின்றன. அத்தகைய புரதத்தில் உள்ள ஒவ்வொரு பாலிபெப்டைட் சங்கிலியும் ஒரு துணை அலகு என்று அழைக்கப்படுகிறது. ஹீமோகுளோபின், எடுத்துக்காட்டாக, இரண்டு α மற்றும் இரண்டு β துணை அலகுகளைக் கொண்டுள்ளது. நான்கு சங்கிலிகள் ஒவ்வொன்றும் ஒரு ஹீம் பாக்கெட்டுடன் ஆல்-α குளோபின் மடிப்பைக் கொண்டுள்ளன. கள மாற்றீடு என்பது ஒலிகோமெரிக் கூட்டங்களை உருவாக்குவதற்கான ஒரு பொறிமுறையாகும். கள மாற்றத்தில், ஒரு மோனோமெரிக் புரதத்தின் இரண்டாம் நிலை அல்லது மூன்றாம் நிலை உறுப்பு மற்றொரு புரதத்தின் அதே உறுப்பால் மாற்றப்படுகிறது. கள மாற்றீடு இரண்டாம் நிலை கட்டமைப்பு கூறுகள் முதல் முழு கட்டமைப்பு களங்கள் வரை இருக்கலாம். இது ஒலிகோமெரைசேஷன் மூலம் செயல்பாட்டு தழுவலுக்கான பரிணாம வளர்ச்சியின் மாதிரியையும் குறிக்கிறது, எ. கா. துணை அலகு இடைமுகங்களில் அவற்றின் செயலில் உள்ள தளத்தைக் கொண்ட ஒலிகோமெரிக் என்சைம்கள். பரிணாம தொகுதிகளாக களங்கள் இயற்கை ஒரு டிங்கர் மற்றும் ஒரு கண்டுபிடிப்பாளர் அல்ல, புதிய வரிசைகள் கண்டுபிடிக்கப்பட்டதை விட முன்பே இருக்கும் காட்சிகளிலிருந்து தழுவிக் கொள்ளப்படுகின்றன. களங்கள் புதிய வரிசைகளை உருவாக்க இயற்கையால் பயன்படுத்தப்படும் பொதுவான பொருள்; அவை மரபணு ரீதியாக நடமாடும் அலகுகள் என்று கருதப்படலாம், அவை 'தொகுதிகள்' என்று குறிப்பிடப்படுகின்றன. பெரும்பாலும், களங்களின் சி மற்றும் என் முனையங்கள் விண்வெளியில் நெருக்கமாக உள்ளன, இது பரிணாம வளர்ச்சியின் போது அவற்றை எளிதில் தாய் கட்டமைப்புகளில் "ஸ்லாட்" செய்ய அனுமதிக்கிறது. ஆர்க்கியா, பாக்டீரியா மற்றும் யூகாரியா ஆகிய மூன்று வகையான உயிரினங்களிலும் பல களக் குடும்பங்கள் காணப்படுகின்றன. புரத தொகுதிகள் என்பது புரதக் களங்களின் துணைக்குழுவாகும், அவை குறிப்பாக பல்துறை கட்டமைப்பைக் கொண்ட பல்வேறு புரதங்களின் வரம்பில் காணப்படுகின்றன. உறைதல், ஃபைப்ரினோலிசிஸ், நிரப்பு, எக்ஸ்ட்ரா செல்லுலார் மேட்ரிக்ஸ், செல் மேற்பரப்பு ஒட்டுதல் மூலக்கூறுகள் மற்றும் சைட்டோகைன் ஏற்பிகளுடன் தொடர்புடைய எக்ஸ்ட்ரா செல்லுலார் புரதங்களில் எடுத்துக்காட்டுகள் காணப்படுகின்றன. பரவலான புரத தொகுதிகளின் நான்கு உறுதியான எடுத்துக்காட்டுகள் பின்வரும் களங்களாகும்ஃ SH2, இம்யூனோகுளோபூலின், ஃபைப்ரொனெக்டின் வகை 3 மற்றும் கிரிங்கிள். மூலக்கூறு பரிணாமம் ஒத்த வரிசை மற்றும் கட்டமைப்பைக் கொண்ட தொடர்புடைய புரதங்களின் குடும்பங்களுக்கு வழிவகுக்கிறது. இருப்பினும், ஒரே கட்டமைப்பைப் பகிர்ந்து கொள்ளும் புரதங்களுக்கு இடையே வரிசை ஒற்றுமைகள் மிகவும் குறைவாக இருக்கலாம். புரதங்கள் ஒரு பொதுவான மூதாதையரிடமிருந்து வேறுபட்டிருப்பதால் புரத கட்டமைப்புகள் ஒத்ததாக இருக்கலாம். மாற்றாக, சில மடிப்புகள் மற்றவற்றை விட அதிக சாதகமாக இருக்கலாம், ஏனெனில் அவை இரண்டாம் நிலை கட்டமைப்புகளின் நிலையான ஏற்பாடுகளைக் குறிக்கின்றன, மேலும் சில புரதங்கள் பரிணாம வளர்ச்சியின் போக்கில் இந்த மடிப்புகளை நோக்கி ஒன்றிணையக்கூடும். தற்போது சுமார் 110,000 சோதனை ரீதியாக தீர்மானிக்கப்பட்ட புரத 3D கட்டமைப்புகள் புரத தரவு வங்கியில் (பி. டி. பி) டெபாசிட் செய்யப்பட்டுள்ளன. இருப்பினும், இந்த தொகுப்பில் பல ஒத்த அல்லது மிகவும் ஒத்த கட்டமைப்புகள் உள்ளன. அனைத்து புரதங்களும் அவற்றின் பரிணாம உறவுகளைப் புரிந்துகொள்ள கட்டமைப்புக் குடும்பங்களாக வகைப்படுத்தப்பட வேண்டும். கட்டமைப்பு ஒப்பீடுகள் கள மட்டத்தில் சிறப்பாக அடையப்படுகின்றன. இந்த காரணத்திற்காக அறியப்பட்ட 3D கட்டமைப்பைக் கொண்ட புரதங்களில் களங்களை தானாக ஒதுக்க பல வழிமுறைகள் உருவாக்கப்பட்டுள்ளன (பார்க்க). கேத் டொமைன் தரவுத்தளம் களங்களை சுமார் 800 மடங்கு குடும்பங்களாக வகைப்படுத்துகிறது; இந்த மடிப்புகளில் பத்து அதிக மக்கள் தொகை கொண்டவை மற்றும் அவை 'சூப்பர்-மடிப்புகள்' என்று குறிப்பிடப்படுகின்றன. சூப்பர்-மடிப்புகள் குறிப்பிடத்தக்க வரிசை ஒற்றுமை இல்லாமல் குறைந்தது மூன்று கட்டமைப்புகள் இருக்கும் மடிப்புகள் என வரையறுக்கப்படுகின்றன. முன்பு விவரிக்கப்பட்டபடி, மிகவும் மக்கள்தொகை கொண்ட α/β-பீப்பாய் சூப்பர் மடிப்பு ஆகும். மல்டிடோமைன் புரதங்கள் பெரும்பாலான புரதங்கள், மூன்றில் இரண்டு பங்கு ஒரு செல்லுலார் உயிரினங்களிலும், மெட்டாசோவாவில் 80 சதவீதத்திற்கும் அதிகமானவை மல்டிடோமைன் புரதங்களாகும். இருப்பினும், பிற ஆய்வுகள் 40 சதவீதம் புரோக்கரியோடிக் புரதங்கள் பல களங்களைக் கொண்டுள்ளன, அதே நேரத்தில் யூகாரியோட்டுகள் சுமார் 65 சதவீதம் பல கள புரதங்களைக் கொண்டுள்ளன என்று முடிவு செய்தன. யூகாரியோடிக் மல்டிடோமைன் புரதங்களில் உள்ள பல களங்கள் புரோக்கரியோட்டுகளில் சுயாதீன புரதங்களாகக் காணப்படுகின்றன, இது மல்டிடோமைன் புரதங்களில் உள்ள களங்கள் ஒரு காலத்தில் சுயாதீன புரதங்களாக இருந்ததாகக் கூறுகிறது. எடுத்துக்காட்டாக, முதுகெலும்புள்ள விலங்குகள் GAR சிந்த்டேஸ், AIR சிந்த்டேஸ் மற்றும் GAR டிரான்ஸ்ஃபார்மைலேஸ் களங்களைக் கொண்ட பல நொதி பாலிபெப்டைடைக் கொண்டுள்ளன (GARs-AIRs-GARt; GAR: கிளைசினமைடு ரிபோநியூக்ளியோடைடு சிந்த்டேஸ்/டிரான்ஸ்பரேஸ்; AIR: அமினோமிடாசோல் ரிபோநியூக்ளியோடைடு சிந்த்டேஸ்). பூச்சிகளில், பாலிபெப்டைடு GARs-(AIRs) 2-GARt ஆகவும், ஈஸ்டில் GARs-AIRs GARt இலிருந்து தனித்தனியாகவும், பாக்டீரியாவில் ஒவ்வொரு களத்திலும் தனித்தனியாகவும் குறியிடப்படுகிறது. புதிய செயல்பாடுகளை உருவாக்க பரிணாம வளர்ச்சியின் போது தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட அழுத்தத்திலிருந்து மல்டிடோமைன் புரதங்கள் தோன்றியிருக்கலாம். பல்வேறு புரதங்கள் பொதுவான மூதாதையர்களிடமிருந்து வெவ்வேறு கலவைகள் மற்றும் களங்களின் சங்கங்களால் வேறுபட்டுள்ளன. மட்டு அலகுகள் மரபணு மாற்றத்தின் வழிமுறைகள் மூலம் உயிரியல் அமைப்புகளுக்கு உள்ளேயும் அதற்கு இடையிலும் அடிக்கடி நகர்கின்றனஃ கிடைமட்ட இடமாற்றங்கள் (இனங்களுக்கு இடையில்) உட்பட மொபைல் கூறுகளின் இடமாற்றம்; தலைகீழ்கள், இடமாற்றங்கள், நீக்குதல் மற்றும் நகல்கள் போன்ற மொத்த மறுசீரமைப்புகள்; ஒத்த மறுசீரமைப்பு; பிரதிபலிப்பின் போது டி. என். ஏ பாலிமரேஸின் வழுக்கை. அமைப்புகளின் வகைகள் புரதங்களில் காணப்படும் எளிய மல்டிடோமைன் அமைப்பு, ஒரே களத்தை மீண்டும் மீண்டும் செய்வதாகும். களங்கள் ஒருவருக்கொருவர் தொடர்பு கொள்ளலாம் (கள-கள தொடர்பு) அல்லது சரத்தில் மணிகள் போல தனிமைப்படுத்தப்படலாம். மாபெரும் 30,000 எஞ்சிய தசை புரத டைட்டின் சுமார் 120 ஃபைப்ரொனெக்டின்-III-வகை மற்றும் Ig-வகை களங்களைக் கொண்டுள்ளது. செரின் புரோட்டீஸ்களில், ஒரு மரபணு நகல் நிகழ்வு இரண்டு β-பீப்பாய் கள நொதி உருவாவதற்கு வழிவகுத்தது. மறுபயன்பாடுகள் மிகவும் பரவலாக வேறுபட்டுள்ளன, அவற்றுக்கிடையே வெளிப்படையான வரிசை ஒற்றுமை இல்லை. செயலில் உள்ள தளம் இரண்டு β-பீப்பாய் களங்களுக்கு இடையிலான பிளவுகளில் அமைந்துள்ளது, இதில் ஒவ்வொரு களத்திலிருந்தும் செயல்பாட்டு ரீதியாக முக்கியமான எச்சங்கள் பங்களிக்கப்படுகின்றன. சைமோட்ரிப்சின் செரின் புரோட்டீஸின் மரபணு ரீதியாக வடிவமைக்கப்பட்ட பிறழ்வுகள் அவற்றின் செயலில் உள்ள தள எச்சங்கள் ஒழிக்கப்பட்டாலும் சில புரோட்டீனேஸ் செயல்பாட்டைக் கொண்டுள்ளன என்று காட்டப்பட்டது, எனவே நகல் நிகழ்வு நொதியின் செயல்பாட்டை மேம்படுத்தியது என்று அனுமானிக்கப்பட்டுள்ளது. கினேசின்கள் மற்றும் ஏபிசி டிரான்ஸ்போர்ட்டர்களால் விளக்கப்பட்டபடி, தொகுதிகள் அடிக்கடி வெவ்வேறு இணைப்பு உறவுகளைக் காட்டுகின்றன. கினெசின் மோட்டார் களம் ஒரு சுருள் சுருள் பகுதி மற்றும் ஒரு சரக்கு களத்தை உள்ளடக்கிய ஒரு பாலிபெப்டைட் சங்கிலியின் இரு முனைகளிலும் இருக்கலாம். ஏபிசி டிரான்ஸ்போர்ட்டர்கள் இரண்டு தொடர்பில்லாத தொகுதிகள், ஏடிபி-பிணைப்பு கேசட் மற்றும் ஒரு ஒருங்கிணைந்த சவ்வு தொகுதி ஆகியவற்றைக் கொண்ட நான்கு களங்களுடன் கட்டப்பட்டுள்ளன, அவை பல்வேறு சேர்க்கைகளில் ஏற்பாடு செய்யப்பட்டுள்ளன. களங்கள் மறுசீரமைக்கப்படுவது மட்டுமல்லாமல், ஒரு களம் மற்றொரு களத்தில் செருகப்பட்டதற்கு பல எடுத்துக்காட்டுகள் உள்ளன. மற்ற களங்களுடன் வரிசை அல்லது கட்டமைப்பு ஒற்றுமைகள் செருகப்பட்ட மற்றும் பெற்றோர் களங்களின் ஒத்த கருத்துக்கள் சுயாதீனமாக இருக்க முடியும் என்பதை நிரூபிக்கின்றன. போல் I குடும்பத்தின் பாலிமரேஸ்களுக்குள் உள்ள 'பனை' களத்தில் செருகப்பட்ட 'விரல்கள்' ஒரு எடுத்துக்காட்டு. ஒரு டொமைனை மற்றொரு டொமைனில் செருக முடியும் என்பதால், ஒரு மல்டிடோமைன் புரதத்தில் எப்போதும் குறைந்தபட்சம் ஒரு தொடர்ச்சியான டொமைன் இருக்க வேண்டும். கட்டமைப்பு களங்கள் மற்றும் பரிணாம/செயல்பாட்டு களங்களின் வரையறைகளுக்கு இடையிலான முக்கிய வேறுபாடு இதுதான். ஒரு பரிணாம களம் களங்களுக்கு இடையிலான ஒன்று அல்லது இரண்டு இணைப்புகளுக்கு மட்டுப்படுத்தப்படும், அதேசமயம் கட்டமைப்பு களங்கள் வரம்பற்ற இணைப்புகளைக் கொண்டிருக்கலாம், ஒரு பொதுவான மையத்தின் இருப்பு பற்றிய கொடுக்கப்பட்ட அளவுகோலுக்குள். பல கட்டமைப்பு களங்கள் ஒரு பரிணாம களத்திற்கு ஒதுக்கப்படலாம். ஒரு சூப்பர் டொமைன் பெயரளவில் சுயாதீனமான தோற்றம் கொண்ட இரண்டு அல்லது அதற்கு மேற்பட்ட பாதுகாக்கப்பட்ட களங்களைக் கொண்டுள்ளது, ஆனால் பின்னர் ஒரு கட்டமைப்பு/செயல்பாட்டு அலகாக மரபுரிமையாகப் பெறப்பட்டது. இந்த ஒருங்கிணைந்த சூப்பர் டொமைன் மரபணு நகலால் மட்டும் தொடர்பில்லாத பல்வேறு புரதங்களில் ஏற்படலாம். ஒரு சூப்பர் டொமைனுக்கு ஒரு எடுத்துக்காட்டு PTEN, டென்சின், ஆக்ஸிலின் மற்றும் சவ்வு புரதம் TPTE2 இல் உள்ள புரத டைரோசின் பாஸ்பேடேஸ்-C2 டொமைன் ஜோடி ஆகும். இந்த சூப்பர் டொமைன் விலங்குகள், தாவரங்கள் மற்றும் பூஞ்சைகளில் உள்ள புரதங்களில் காணப்படுகிறது. PTP-C2 சூப்பர் டொமைனின் ஒரு முக்கிய அம்சம் டொமைன் இடைமுகத்தில் அமினோ அமில எச்சங்கள் பாதுகாப்பு ஆகும். களங்கள் தன்னாட்சி மடிப்பு அலகுகள் மடிப்பு புரத மடிப்பு-தீர்க்கப்படாத சிக்கல்ஃ 1960 களின் முற்பகுதியில் அன்ஃபின்சனின் ஆரம்ப வேலையிலிருந்து, ஒரு பாலிபெப்டைட் அதன் நிலையான சொந்த இணக்கத்திற்குள் விரைவாக மடிக்கும் பொறிமுறையை முழுமையாகப் புரிந்துகொள்வதற்கான குறிக்கோள் மழுப்பலாகவே உள்ளது. பல சோதனை மடிப்பு ஆய்வுகள் நமது புரிதலுக்கு பெரிதும் பங்களித்துள்ளன, ஆனால் புரத மடிப்பை நிர்வகிக்கும் கொள்கைகள் இன்னும் மடிப்பு பற்றிய முதல் ஆய்வுகளில் கண்டுபிடிக்கப்பட்டவற்றை அடிப்படையாகக் கொண்டவை. ஒரு புரதத்தின் சொந்த நிலை வெப்ப இயக்கவியல் ரீதியாக நிலையானது என்பதை அன்ஃபின்சென் காட்டினார், இணக்கம் அதன் இலவச ஆற்றலின் உலகளாவிய குறைந்தபட்சத்தில் உள்ளது. மடிப்பு என்பது உயிரியல் ரீதியாக சாத்தியமான நேர அளவில் புரதத்தை மடிக்க அனுமதிக்கும் இணக்கமான இடத்தின் திசைதிருப்பப்பட்ட தேடல் ஆகும். லெவிண்டால் முரண்பாடு, ஒரு சராசரி அளவிலான புரதம் மிகக் குறைந்த ஆற்றல் கொண்ட ஒன்றைக் கண்டுபிடிப்பதற்கு முன்பு சாத்தியமான அனைத்து இணக்கங்களையும் மாதிரி செய்தால், முழு செயல்முறையும் பில்லியன் கணக்கான ஆண்டுகள் எடுக்கும் என்று கூறுகிறது. புரதங்கள் பொதுவாக 0.01 மற்றும் 1000 விநாடிகளுக்குள் மடிகின்றன. எனவே, புரத மடிப்பு செயல்முறை ஒரு குறிப்பிட்ட மடிப்பு பாதை வழியாக ஏதேனும் ஒரு வழியில் இயக்கப்பட வேண்டும். இந்த தேடலை வழிநடத்தும் சக்திகள் உள்ளூர் மற்றும் உலகளாவிய தாக்கங்களின் கலவையாக இருக்கலாம், அவற்றின் விளைவுகள் எதிர்வினையின் பல்வேறு கட்டங்களில் உணரப்படுகின்றன. சோதனை மற்றும் கோட்பாட்டு ஆய்வுகளின் முன்னேற்றங்கள், மடிப்புகளை ஆற்றல் நிலப்பரப்புகளின் அடிப்படையில் பார்க்க முடியும் என்பதைக் காட்டுகின்றன, அங்கு மடிப்பு இயக்கவியல் என்பது ஓரளவு மடிக்கப்பட்ட கட்டமைப்புகளின் குழுமத்தின் முற்போக்கான அமைப்பாகக் கருதப்படுகிறது, இதன் மூலம் ஒரு புரதம் மடிக்கப்பட்ட கட்டமைப்பிற்குச் செல்கிறது. இது ஒரு மடிப்பு புனலின் அடிப்படையில் விவரிக்கப்பட்டுள்ளது, இதில் ஒரு அவிழ்க்கப்பட்ட புரதம் அதிக எண்ணிக்கையிலான இணக்க நிலைகளைக் கொண்டுள்ளது மற்றும் மடிக்கப்பட்ட புரதத்திற்கு குறைவான நிலைகள் உள்ளன. ஒரு புனல் என்பது புரத மடிப்புக்கு ஆற்றல் குறைவதையும், மூன்றாம் நிலை அமைப்பு உருவாக்கத்தை அதிகரிப்பதன் மூலம் என்ட்ரோபி இழப்பையும் குறிக்கிறது. புனலின் உள்ளூர் கடினத்தன்மை இயக்க பொறிகளைப் பிரதிபலிக்கிறது, இது தவறாக மடிக்கப்பட்ட இடைநிலைகளின் குவிப்புடன் தொடர்புடையது. ஒரு மடிப்பு சங்கிலி அதன் சுருக்கத்தை அதிகரிப்பதன் மூலம் குறைந்த இன்ட்ரா-சங்கிலி ஃப்ரீ-ஆற்றல்களை நோக்கி முன்னேறுகிறது. சங்கிலியின் இணக்கமான விருப்பங்கள் பெருகிய முறையில் ஒரு சொந்த கட்டமைப்பை நோக்கி சுருங்குகின்றன. புரத மடிப்புகளில் களங்களின் நன்மை கட்டமைப்பு களங்கள் மூலம் பெரிய புரதங்களின் அமைப்பு புரத மடிப்புகளுக்கு ஒரு நன்மையைக் குறிக்கிறது, ஒவ்வொரு களமும் தனித்தனியாக மடிப்பு செய்ய முடியும், மடிப்பு செயல்முறையை துரிதப்படுத்துகிறது மற்றும் எச்சங்களின் தொடர்புகளின் பெரிய கலவையைக் குறைக்கிறது. மேலும், புரதங்களில் காணப்பட்ட ஹைட்ரோபோபிக் எச்சங்களின் சீரற்ற விநியோகத்தைப் பொறுத்தவரை, கள உருவாக்கம் ஒரு பெரிய புரதத்திற்கு அதன் ஹைட்ரோபோபிக் எச்சங்களை புதைக்க உகந்த தீர்வாகத் தோன்றுகிறது, அதே நேரத்தில் ஹைட்ரோஃபிலிக் எச்சங்களை மேற்பரப்பில் வைத்திருக்கிறது. இருப்பினும், புரத மடிப்பு மற்றும் சொந்த கட்டமைப்பின் உறுதிப்படுத்தலின் ஆற்றல் ஆகியவற்றில் களங்களுக்கிடையேயான தொடர்புகளின் பங்கு, ஒவ்வொரு புரதத்திற்கும் வேறுபடலாம். டி4 லைசோசைமில், ஒரு களத்தின் மீது மற்றொரு களத்தின் தாக்கம் மிகவும் வலுவாக இருப்பதால், முழு மூலக்கூறும் புரோட்டியோலிடிக் பிளவுகளை எதிர்க்கிறது. இந்த விஷயத்தில், மடிப்பு என்பது ஒரு தொடர்ச்சியான செயல்முறையாகும், அங்கு சி-முனைய களம் ஒரு ஆரம்ப கட்டத்தில் சுயாதீனமாக மடிப்பு செய்ய வேண்டும், மற்ற களத்திற்கு மடிப்பு மற்றும் உறுதிப்படுத்தலுக்கு மடிப்பு சி-முனைய களத்தின் இருப்பு தேவைப்படுகிறது. ஒரு தனிமைப்படுத்தப்பட்ட களத்தின் மடிப்பு அதே விகிதத்தில் அல்லது சில நேரங்களில் ஒருங்கிணைந்த களத்தை விட வேகமாக நடக்கலாம் என்று கண்டறியப்பட்டுள்ளது, இது மடிப்பின் போது மீதமுள்ள புரதத்துடன் சாதகமற்ற தொடர்புகள் ஏற்படலாம் என்பதைக் குறிக்கிறது. பெரிய புரதங்களின் மடிப்புகளில் மெதுவான படி மடிக்கப்பட்ட களங்களின் இணைப்பாகும் என்று பல வாதங்கள் தெரிவிக்கின்றன. களங்கள் முற்றிலும் சரியாக மடிக்கப்படாததால் அல்லது அவற்றின் தொடர்புக்குத் தேவையான சிறிய மாற்றங்கள் ஆற்றல் ரீதியாக சாதகமற்றவை என்பதால், டொமைன் இடைமுகத்திலிருந்து தண்ணீரை அகற்றுவது போன்றது. களங்கள் மற்றும் புரத நெகிழ்வுத்தன்மை புரத கள இயக்கவியல் பல மூலக்கூறு அங்கீகாரம் மற்றும் சமிக்ஞை செயல்முறைகளில் முக்கிய பங்கு வகிக்கிறது. புரதக் களங்கள், உள்ளார்ந்த ஒழுங்கற்ற நெகிழ்வான இணைப்பு களங்களால் இணைக்கப்பட்டுள்ளன, புரதக் கள இயக்கவியல் வழியாக நீண்ட தூர அலஸ்டரி தூண்டப்படுகின்றன. இதன் விளைவாக வரும் மாறும் முறைகளை பொதுவாக முழு புரதம் அல்லது தனிப்பட்ட களங்களின் நிலையான கட்டமைப்புகளிலிருந்து கணிக்க முடியாது. இருப்பினும் ஒரு புரதத்தின் வெவ்வேறு கட்டமைப்புகளை ஒப்பிடுவதன் மூலம் அவற்றை ஊகிக்க முடியும் (மூலக்கூறு இயக்கங்களின் தரவுத்தளத்தில் உள்ளதைப் போல). விரிவான மூலக்கூறு இயக்கவியல் பாதைகள் மற்றும் முக்கிய கூறு பகுப்பாய்வு ஆகியவற்றில் மாதிரிகள் எடுப்பதன் மூலமும் அவை பரிந்துரைக்கப்படலாம், அல்லது நியூட்ரான் சுழல் எதிரொலி நிறமாலை மூலம் அளவிடப்படும் நிறமாலையைப் பயன்படுத்தி அவற்றை நேரடியாகக் காணலாம். கட்டமைப்பு ஒருங்கிணைப்புகளிலிருந்து கள வரையறை கட்டமைப்பு கட்டுமானத் தொகுதிகள் மற்றும் பரிணாமத்தின் கூறுகளாக களங்களின் முக்கியத்துவம் அறியப்பட்ட கட்டமைப்பின் புரதங்களில் அவற்றை அடையாளம் காண்பதற்கும் வகைப்படுத்துவதற்கும் பல தானியங்கி முறைகளைக் கொண்டு வந்துள்ளது. நம்பகமான டொமைன் ஒதுக்கீட்டிற்கான தானியங்கி நடைமுறைகள் டொமைன் தரவுத்தளங்களின் உருவாக்கத்திற்கு அவசியம், குறிப்பாக அறியப்பட்ட புரத கட்டமைப்புகளின் எண்ணிக்கை அதிகரித்து வருவதால். ஒரு களத்தின் எல்லைகளை காட்சி ஆய்வு மூலம் தீர்மானிக்க முடியும் என்றாலும், ஒரு தானியங்கி முறையை உருவாக்குவது நேரடியானது அல்ல. தொடர்ச்சியற்ற அல்லது மிகவும் தொடர்புடைய களங்களை எதிர்கொள்ளும்போது சிக்கல்கள் ஏற்படுகின்றன. ஒரு டொமைன் உண்மையில் என்ன என்பதற்கான நிலையான வரையறை இல்லை என்ற உண்மை என்னவென்றால், ஒவ்வொரு ஆராய்ச்சியாளரும் ஒரு தனித்துவமான அளவுகோல்களைப் பயன்படுத்துவதன் மூலம் டொமைன் ஒதுக்கீடுகள் பெரிதும் மாறுபட்டுள்ளன. ஒரு கட்டமைப்பு களம் என்பது மற்ற புரதங்களை விட அதற்குள் அதிக தொடர்புகளைக் கொண்ட ஒரு சிறிய, கோள வடிவ துணை அமைப்பு ஆகும். எனவே, ஒரு கட்டமைப்பு களத்தை இரண்டு காட்சி பண்புகளால் தீர்மானிக்க முடியும்ஃ அதன் செறிவு மற்றும் அதன் தனிமைப்படுத்தலின் அளவு. புரதங்களில் உள்ள உள்ளூர் சுருக்கத்தின் அளவீடுகள் டொமைன் ஒதுக்கீட்டின் ஆரம்பகால முறைகள் மற்றும் பல சமீபத்திய முறைகளில் பயன்படுத்தப்பட்டுள்ளன. முறைகள் முதல் வழிமுறைகளில் ஒன்று Cα-Cα தூர வரைபடத்தை ஒரு படிநிலை கிளஸ்டரிங் வழக்கத்துடன் பயன்படுத்தியது, இது புரதங்களை பல சிறிய பிரிவுகளாக, நீளத்தில் 10 எச்சங்களாகக் கருதியது. ஆரம்ப பிரிவுகள் பிரிவுகளுக்கிடையேயான தூரங்களின் அடிப்படையில் ஒன்றன் பின் ஒன்றாக தொகுக்கப்பட்டன; குறுகிய தூரங்களைக் கொண்ட பிரிவுகள் தொகுக்கப்பட்டன, அதன்பிறகு ஒற்றை பிரிவுகளாகக் கருதப்பட்டன. படிப்படியான கிளஸ்டரிங் இறுதியாக முழு புரதத்தையும் உள்ளடக்கியது. களங்களுக்கிடையேயான தூரங்கள் பொதுவாக உள்-கள தூரங்களை விட பெரியவை என்ற உண்மையையும் கோ பயன்படுத்திக் கொண்டார்; சாத்தியமான அனைத்து Cα-Cα தூரங்களும் மூலைவிட்ட அடுக்குகளாக குறிப்பிடப்பட்டன, இதில் ஹெலிக்ஸ், நீட்டிக்கப்பட்ட இழைகள் மற்றும் இரண்டாம் நிலை கட்டமைப்புகளின் கலவைகளுக்கு தனித்துவமான வடிவங்கள் இருந்தன. சவுதாமினி மற்றும் ப்ளண்டெல் முறையின் படி ஒரு புரதத்தில் இரண்டாம் நிலை கட்டமைப்புகளை அவற்றின் Cα-Cα தூரங்களின் அடிப்படையில் தொகுத்து, அவற்றின் டெண்ட்ரோகிராம்களில் உள்ள வடிவத்திலிருந்து களங்களை அடையாளம் காட்டுகிறது. செயல்முறை புரதத்தை அமினோ அமிலங்களின் தொடர்ச்சியான சங்கிலியாக கருதாததால், தொடர்ச்சியற்ற களங்களுக்கு சிகிச்சையளிப்பதில் எந்த பிரச்சனையும் இல்லை. இந்த டெண்ட்ரோகிராம்களில் உள்ள குறிப்பிட்ட முனைகள் புரதத்தின் மூன்றாம் நிலை கட்டமைப்புக் கிளஸ்டர்களாக அடையாளம் காணப்படுகின்றன, இதில் சூப்பர்-செகண்டரி கட்டமைப்புகள் மற்றும் களங்கள் இரண்டும் அடங்கும். 3Dee டொமைன் தரவுத்தளத்தை உருவாக்க டோமாக் வழிமுறை பயன்படுத்தப்படுகிறது. புரதம் தன்னிச்சையாக இரண்டு பகுதிகளாகப் பிரிக்கப்படும்போது ஒவ்வொரு வகை தொடர்புகளின் எண்ணிக்கையிலிருந்து இது ஒரு 'பிளவு மதிப்பை' கணக்கிடுகிறது. கட்டமைப்பின் இரண்டு பகுதிகளும் தனித்துவமாக இருக்கும்போது இந்த பிளவு மதிப்பு பெரியதாக இருக்கும். ஓடக் மற்றும் ஜானின் முறை பல்வேறு எச்ச நிலைகளில் மீண்டும் மீண்டும் பிளவுபடுத்தப்பட்ட இரண்டு சங்கிலி பிரிவுகளுக்கு இடையில் கணக்கிடப்பட்ட இடைமுக பகுதிகளை அடிப்படையாகக் கொண்டது. பிளவுபட்ட பகுதிகளின் மேற்பரப்பு பகுதிகளை பூர்வீக கட்டமைப்புடன் ஒப்பிடுவதன் மூலம் இடைமுகப் பகுதிகள் கணக்கிடப்பட்டன. இடைமுகப் பகுதி குறைந்தபட்சமாக இருந்த ஒரு தளத்தில் சாத்தியமான கள எல்லைகளை அடையாளம் காணலாம். மற்ற முறைகள் சுருக்கத்தைக் கணக்கிட கரைப்பான் அணுகல் அளவீடுகளைப் பயன்படுத்தியுள்ளன. பி. யு. யு வழிமுறை, களங்களுக்கிடையேயான இயக்கவியலை தோராயமாக மதிப்பிடுவதற்குப் பயன்படுத்தப்படும் ஒரு ஒத்திசைவான மாதிரியை உள்ளடக்கியது. அடிப்படை இயற்பியல் கருத்து என்னவென்றால், ஒவ்வொரு களத்திலும் பல கடுமையான தொடர்புகள் ஏற்படும் மற்றும் களங்களுக்கு இடையில் தளர்வான தொடர்புகள் ஏற்படும். இந்த வழிமுறை FSSP களத் தரவுத்தளத்தில் களங்களை வரையறுக்கப் பயன்படுகிறது. களங்கள் ஹைட்ரோபோபிக் உட்புறத்தைக் கொண்டுள்ளன என்ற கருத்தின் அடிப்படையில் புரத கட்டமைப்புகளில் உள்ள களங்களை அடையாளம் காண DETECTIVE என்ற முறையை ஸ்விண்டெல்ஸ் (1995) உருவாக்கினார். வெவ்வேறு களங்களிலிருந்து வரும் ஹைட்ரோபோபிக் கோர்கள் இடைமுகப் பகுதி வழியாகத் தொடரும் போது குறைபாடுகள் ஏற்படுவது கண்டறியப்பட்டது. ரிஜிட்ஃபைண்டர் என்பது இரண்டு வெவ்வேறு இணக்கங்களிலிருந்து புரத கடினமான தொகுதிகளை (களங்கள் மற்றும் சுழல்கள்) அடையாளம் காண்பதற்கான ஒரு புதிய முறையாகும். கடினமான தொகுதிகள் தொகுதிகளாக வரையறுக்கப்படுகின்றன, அங்கு அனைத்து இடைநிலை எச்ச தூரங்களும் இணக்கங்களின் குறுக்கே பாதுகாக்கப்படுகின்றன. பாண்டுரங்கன் மற்றும் டோப்ஃப் உருவாக்கிய RIBFIND முறை புரதங்களில் இரண்டாம் நிலை கட்டமைப்பு கூறுகளின் இடஞ்சார்ந்த கிளஸ்டரிங் செய்வதன் மூலம் புரத கட்டமைப்புகளில் கடினமான உடல்களை அடையாளம் காட்டுகிறது. கிரையோ எலக்ட்ரான் நுண்ணோக்கி அடர்த்தி வரைபடங்களில் புரத கட்டமைப்புகளை நெகிழ்வாக பொருத்த RIBFIND கடினமான உடல்கள் பயன்படுத்தப்பட்டுள்ளன. இயக்கவியல் களங்களை அடையாளம் காண ஒரு பொதுவான முறை, அதாவது கட்டமைப்பு ஏற்ற இறக்கங்களின் போக்கில் தோராயமாக கடினமான அலகுகளாக செயல்படும் புரதப் பகுதிகள், பொடெஸ்டியோ மற்றும் பலர் அறிமுகப்படுத்தியுள்ளனர். மேலும், பிற பயன்பாடுகளுடன், இயக்கவியல் அடிப்படையிலான கள உட்பிரிவுகளின் நிலைத்தன்மையை நிலையான கட்டமைப்பு அடிப்படையிலானவற்றுடன் ஒப்பிடவும் பயன்படுத்தப்பட்டது. PiSQRD என்று அழைக்கப்படும் இந்த முறை, ஒரு வலை சேவையகத்தின் வடிவத்தில் பொதுவில் கிடைக்கிறது. பிந்தையது பயனர்களை ஒற்றை-சங்கிலி அல்லது மல்டிமெரிக் புரதங்களை அமைப்பின் ஏற்ற இறக்கங்களின் கூட்டு முறைகளின் அடிப்படையில் அரை-கடினமான களங்களாக உகந்த முறையில் பிரிக்க அனுமதிக்கிறது. முன்னிருப்பாக பிந்தையது ஒரு நெகிழ்வான நெட்வொர்க் மாதிரி மூலம் கணக்கிடப்படுகிறது; மாற்றாக முன்கூட்டியே கணக்கிடப்பட்ட அத்தியாவசிய இயக்க இடைவெளிகள் பயனரால் பதிவேற்றப்படலாம். எடுத்துக்காட்டு களங்கள் ஆர்மடில்லோ மீண்டும் மீண்டும் செய்கிறதுஃ பழ ஈ ட்ரோசோபிலா மெலனோகாஸ்டரின் β-கேடெனின் போன்ற ஆர்மடில்லோ புரதத்தின் பெயரால் பெயரிடப்பட்டது. அடிப்படை லியூசின் சிப்பர் களம் (bZIP களம்): பல டிஎன்ஏ-பிணைப்பு யூகாரியோடிக் புரதங்களில் காணப்படுகிறது. களத்தின் ஒரு பகுதியில் வரிசை-குறிப்பிட்ட டிஎன்ஏ-பிணைப்பு பண்புகளை மத்தியஸ்தம் செய்யும் ஒரு பகுதியும், இரண்டு டிஎன்ஏ-பிணைப்பு பகுதிகளின் டைமெரைசேஷனுக்குத் தேவையான லியூசின் சிப்பரும் உள்ளன. டிஎன்ஏ-பிணைப்புப் பகுதியில் அர்ஜினைன் மற்றும் லைசின் போன்ற பல அடிப்படை அமினோ அமிலங்கள் உள்ளன. காடரின் மீண்டும் மீண்டும் நிகழ்கிறதுஃ காடரின்கள் Ca2 +-சார்ந்த செல்-செல் ஒட்டுதல் புரதங்களாக செயல்படுகின்றன. காடரின் களங்கள் என்பது செல்களுக்கு வெளியே உள்ள பகுதிகளாகும், அவை அருகிலுள்ள உயிரணுக்களின் மேற்பரப்பில் காடரின்களுக்கு இடையில் செல்-க்கு-செல் ஹோமோஃபிலிக் பிணைப்பை மத்தியஸ்தம் செய்கின்றன. டெத் எஃபெக்டர் டொமைன் (டிஇடி): புரத-புரத பிணைப்பை ஒரே மாதிரியான தொடர்புகளால் (டிஇடி-டிஇடி) அனுமதிக்கிறது. காஸ்பேஸ் புரோட்டியேஸ்கள் புரோட்டியோலிடிக் அடுக்குகள் வழியாக அப்போப்டொசிஸைத் தூண்டுகின்றன. புரோ-காஸ்பேஸ்-8 மற்றும் ப்ரோ-காஸ்பேஸ்-9 ஆகியவை டிஇடி களங்கள் வழியாக குறிப்பிட்ட அடாப்டர் மூலக்கூறுகளுடன் பிணைக்கப்படுகின்றன, இது காஸ்பேஸ்களை தானாக செயல்படுத்த வழிவகுக்கிறது. EF கைஃ சமிக்ஞை புரதமான கால்மோடுலினின் ஒவ்வொரு கட்டமைப்பு களத்திலும் மற்றும் தசை புரதமான ட்ரோபோனின்-சி. இம்யூனோகுளோபூலின் போன்ற களங்களிலும் காணப்படும் ஒரு ஹெலிக்ஸ்-டர்ன்-ஹெலிக்ஸ் கட்டமைப்பு மையக்கருத்து. இம்யூனோகுளோபூலின் சூப்பர்ஃபேமிலியின் (IgSF) புரதங்களில் காணப்படுகிறது. அவை சுமார் 70-110 அமினோ அமிலங்களைக் கொண்டுள்ளன, மேலும் அவற்றின் அளவு மற்றும் செயல்பாட்டிற்கு ஏற்ப வெவ்வேறு பிரிவுகளாக (IgV, IgC1, IgC2 மற்றும் IgI) வகைப்படுத்தப்படுகின்றன. அவை ஒரு சிறப்பியல்பு மடிப்பைக் கொண்டுள்ளன, இதில் இரண்டு பீட்டா தாள்கள் ஒரு "சாண்ட்விச்" ஐ உருவாக்குகின்றன, இது பாதுகாக்கப்பட்ட சிஸ்டைன்கள் மற்றும் பிற சார்ஜ் செய்யப்பட்ட அமினோ அமிலங்களுக்கு இடையிலான தொடர்புகளால் உறுதிப்படுத்தப்படுகிறது. செல் ஒட்டுதல், செல் செயல்படுத்துதல் மற்றும் மூலக்கூறு அங்கீகாரம் ஆகியவற்றின் செயல்முறைகளில் புரத-புரத தொடர்புகளுக்கு அவை முக்கியமானவை. இந்த களங்கள் பொதுவாக நோயெதிர்ப்பு மண்டலத்தில் பங்கு வகிக்கும் மூலக்கூறுகளில் காணப்படுகின்றன. ஃபாஸ்போடைரோசின்-பைண்டிங் டொமைன் (பிடிபி): பிடிபி டொமைன்கள் பொதுவாக பாஸ்பரிலேட்டட் டைரோசின் எச்சங்களுடன் பிணைக்கப்படுகின்றன. அவை பெரும்பாலும் சமிக்ஞை கடத்தல் புரதங்களில் காணப்படுகின்றன. பிடிபி-டொமைன் பிணைப்பு தனித்துவம் பாஸ்போடைரோசினின் அமினோ-முனையப் பக்கத்தின் எச்சங்களால் தீர்மானிக்கப்படுகிறது. எடுத்துக்காட்டுகள்ஃ எஸ். எச். சி மற்றும் ஐஆர்எஸ்-1 ஆகிய இரண்டின் பிடிபி களங்கள் ஒரு என். பி. எக்ஸ். பி. ஒய் வரிசையுடன் பிணைக்கப்படுகின்றன. எஸ். எச். சி மற்றும் ஐஆர்எஸ்-1 போன்ற பிடிபி கொண்ட புரதங்கள் மனித உயிரணுக்களின் இன்சுலின் பதில்களுக்கு முக்கியமானவை. பிளெக்ஸ்ட்ரின் ஹோமோலஜி களம் (பி. எச்): பி. எச் களங்கள் பாஸ்போயினோசைடைடுகளை அதிக பாசத்துடன் பிணைக்கின்றன. PtdIn (3) P, PtdIn (4) P, PtdIn (3,4) P2, PtdIn (4,5) P2, மற்றும் PtdIn (3,4,5) P3 ஆகிய அனைத்திற்கும் தனித்தன்மை கண்டறியப்பட்டுள்ளது. பாஸ்போயினோசைடைடுகள் பல்வேறு உயிரணு சவ்வுகளுக்கு (அவற்றின் நீண்ட லிபோஃபிலிக் வால் காரணமாக) பிரிக்கப்படுகின்றன என்ற உண்மையைப் பொறுத்தவரை, பி. எச் களங்கள் பொதுவாக ஒரு சவ்வுக்கு புரதத்தை ஆட்சேர்ப்பு செய்கின்றன, அங்கு புரதம் செல் சமிக்ஞை, சைட்டோஸ்கெலிட்டல் மறுசீரமைப்பு அல்லது சவ்வு கடத்தல் ஆகியவற்றில் ஒரு குறிப்பிட்ட செயல்பாட்டைச் செய்ய முடியும். எஸ்ஆர்சி ஹோமாலஜி 2 களம் (எஸ்எச்2): எஸ்எச்2 களங்கள் பெரும்பாலும் சமிக்ஞை கடத்தல் புரதங்களில் காணப்படுகின்றன. எஸ்எச்2 களங்கள் பாஸ்பரிலேட்டட் டைரோசின் (பிடிஐஆர்) உடன் பிணைப்பை வழங்குகின்றன. எஸ். ஆர். சி வைரஸ் ஆன்கோஜீனின் பாஸ்போடைரோசின் பிணைப்பு களத்தின் பெயரால் பெயரிடப்பட்டது, இது ஒரு டைரோசின் கைனேஸ் ஆகும். மேலும் காண்கஃ SH3 களம். துத்தநாக விரல் டிஎன்ஏ-பிணைப்பு களம் (ZnF _ GATA): ZnF _ GATA களத்தைக் கொண்ட புரதங்கள் பொதுவாக விளம்பரதாரர்களின் டிஎன்ஏ வரிசை [ஏடி] GATA [ஏஜி] உடன் பிணைக்கும் படியெடுத்தல் காரணிகளாகும். அறியப்படாத செயல்பாட்டின் களங்கள் களங்களின் ஒரு பெரிய பகுதி அறியப்படாத செயல்பாட்டைக் கொண்டுள்ளன. அறியப்படாத செயல்பாட்டின் களம் (டி. யு. எஃப்) என்பது ஒரு புரத களமாகும், இது எந்த சிறப்பியல்பு செயல்பாடும் இல்லை. இந்த குடும்பங்கள் ப்ஃபாம் தரவுத்தளத்தில் டியுஎஃப் முன்னொட்டு மற்றும் அதைத் தொடர்ந்து ஒரு எண்ணைப் பயன்படுத்தி சேகரிக்கப்பட்டுள்ளன, எடுத்துக்காட்டுகள் டியுஎஃப்2992 மற்றும் டியுஎஃப்1220 ஆகும். இப்போது பிஃபாம் தரவுத்தளத்திற்குள் 3,000 க்கும் மேற்பட்ட டியுஎஃப் குடும்பங்கள் உள்ளன, இது அறியப்பட்ட குடும்பங்களில் 20 சதவீதத்திற்கும் அதிகமாக உள்ளது. ஆச்சரியப்படும் விதமாக, பிஃபாமில் உள்ள டியுஎஃப்களின் எண்ணிக்கை 20 சதவீதத்திலிருந்து (2010 இல்) 22 சதவீதமாக (2019 இல்) அதிகரித்துள்ளது, பெரும்பாலும் புதிய மரபணு வரிசைகளின் எண்ணிக்கை அதிகரித்து வருவதால். ப்ஃபாம் வெளியீடு 32.0 (2019) இல் 3,961 டியுஎஃப்கள் இருந்தன. மேலும் காண்க பைண்டிங் டொமைன் கோஃபாக்டர் டிரான்ஸ்பரேஸ் ஃபேமிலி பான்டைட், புரத டொமைன்களை உள்ளடக்கிய ஒரு உயிரியல் தரவுத்தளம் ப்ஃபாம்ஃ புரத டொமைன்களின் தரவுத்தளம் புரதம் புரதம் கட்டமைப்பு முன்கணிப்பு புரதம் கட்டமைப்பு முன்கணிப்பு மென்பொருள் புரதம் சூப்பர்ஃபேமிலி புரதம் டாண்டம் புரதம் குடும்பம் புரதம் துணைக்குடும்பம் குறுகிய நேரியல் மையக்கருத்து கட்டமைப்பு உயிரியல் புரதங்களின் கட்டமைப்பு வகைப்பாடு (எஸ். சி. ஓ. பி) கேத் புரதம் கட்டமைப்பு வகைப்பாடு தரவுத்தளம் வரிசை மையக்கருத்து கட்டமைப்பு மையக்கருத்து குறிப்புகள் ஜார்ஜ், ஆர். ஏ. (2002) "புரதங்களில் கட்டமைப்பு களங்களை கணிப்பது" ஆய்வறிக்கை, லண்டன் பல்கலைக்கழக கல்லூரி (அதன் ஆசிரியரின் பங்களிப்பு). முக்கிய ஆவணங்கள் வெளிப்புற இணைப்புகள் உயிரித் தொழில்நுட்பத்திற்கான தேசிய மையத்தின் இணையதளத்தில் கட்டமைக்கப்பட்ட களத் தரவுத்தளங்கள் பாதுகாக்கப்பட்ட களங்கள் 3டீ கேத் டாலி பி. எஃப். ஏ. எம் குல உலாவி வரிசை களத் தரவுத்தளங்கள் இன்டர்ப்ரோ பிரோசைட் புரோடாம் ஸ்மார்ட் என்சிபிஐ பாதுகாக்கப்பட்ட களத் தரவுத்தள சூப்பர்ஃபேமிலி நூலகம் எச். எம். எம். களின் சூப்பர்ஃபேமிலிகள் மற்றும் தரவுத்தளத்தை பிரதிநிதித்துவப்படுத்தும் அனைத்து முற்றிலும் வரிசைப்படுத்தப்பட்ட உயிரினங்களுக்கான (சூப்பர்ஃபேமிலி மற்றும் குடும்பம்) சிறுகுறிப்புகள் செயல்பாட்டு களத் தரவுத்தளங்கள் டி. சி. ஜி. ஓ செயல்பாடுகள், தோற்றவழிகள் மற்றும் நோய்கள் குறித்த களத்தை மையமாகக் கொண்ட ஆன்டாலஜிகளின் விரிவான தரவுத்தளம். புரதக் கட்டமைப்பு புரதக் குடும்பங்கள் புரத சூப்பர் குடும்பங்கள்