RNA polymerase III
யூகாரியோட் உயிரணுக்களில், ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் III (போல் III என்றும் அழைக்கப்படுகிறது) என்பது 5S ரைபோசோமல் ஆர்என்ஏ, டிஆர்என்ஏ மற்றும் பிற சிறிய ஆர்என்ஏக்களை ஒருங்கிணைக்க டிஎன்ஏவை படியெடுத்த ஒரு புரதமாகும். ஆர்என்ஏ போல் III ஆல் படியெடுத்த மரபணுக்கள் "வீட்டு பராமரிப்பு" மரபணுக்களின் பிரிவில் வருகின்றன, அவற்றின் வெளிப்பாடு அனைத்து உயிரணு வகைகளிலும் பெரும்பாலான சுற்றுச்சூழல் நிலைமைகளிலும் தேவைப்படுகிறது. எனவே, போல் III டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனின் ஒழுங்குமுறை முதன்மையாக உயிரணு வளர்ச்சி மற்றும் உயிரணு சுழற்சியின் ஒழுங்குமுறையுடன் பிணைக்கப்பட்டுள்ளது, இதனால் ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் II ஐ விட குறைவான ஒழுங்குமுறை புரதங்கள் தேவைப்படுகின்றன. இருப்பினும், மன அழுத்த நிலைமைகளின் கீழ், எம்ஏஎஃப்1 புரதம் போல் III செயல்பாட்டை அடக்குகிறது. ராபாமைசின் அதன் நேரடி இலக்கு TOR வழியாக மற்றொரு போல் III தடுப்பானாகும். டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் செயல்முறை (எந்த பாலிமரேஸ் மூலம்) மூன்று முக்கிய நிலைகளை உள்ளடக்கியதுஃ துவக்கம், மரபணுவின் ஊக்குவிப்பாளர் நீள்வட்டத்தில் ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் வளாகத்தை உருவாக்க வேண்டும், ஆர்என்ஏ டிரான்ஸ்கிரிப்ட் முடிவின் தொகுப்பு, ஆர்என்ஏ டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனை முடித்தல் மற்றும் ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் வளாகத்தை பிரித்தல் துவக்கம்ஃ ஊக்குவிப்பாளரின் மீது பாலிமரேஸ் வளாகத்தின் கட்டுமானம். போல் III அசாதாரணமானது (போல் II உடன் ஒப்பிடும்போது) மரபணுவின் மேல்நோக்கி எந்த கட்டுப்பாட்டு வரிசைகளும் தேவையில்லை, அதற்கு பதிலாக பொதுவாக உள் கட்டுப்பாட்டு வரிசைகளை நம்பியுள்ளது-மரபணுவின் படியெடுத்த பகுதிக்குள் உள்ள வரிசைகள் (இருப்பினும் மேல்நோக்கி வரிசைகள் எப்போதாவது காணப்படுகின்றன, எ. கா. போல் II விளம்பரதாரர்களில் காணப்படுவது போல் U6 snRNA மரபணு ஒரு மேல்நோக்கிய TATA பெட்டியைக் கொண்டுள்ளது). 5S rRNA, tRNA மற்றும் U6 snRNA துவக்கத்துடன் தொடர்புடைய போல் III துவக்கத்தின் மூன்று வகுப்புகள் உள்ளன. அனைத்து சந்தர்ப்பங்களிலும், இந்த செயல்முறை கட்டுப்பாட்டு வரிசைகளுடன் பிணைக்கப்பட்ட டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணிகளுடன் தொடங்குகிறது, மேலும் TFIIIB (பாலிமரேஸ் III B க்கான டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணி) வளாகத்திற்கு ஆட்சேர்ப்பு செய்யப்பட்டு போல் III ஐ அசெம்பிளி செய்வதன் மூலம் முடிவடைகிறது. TFIIIB மூன்று துணை அலகுகளைக் கொண்டுள்ளதுஃ TATA பிணைப்பு புரதம் (TBP), ஒரு TFIIB-தொடர்பான காரணி (BRF1, அல்லது முதுகெலும்புகளில் உள்ள போல் III-டிரான்ஸ்கிரிப்ட் செய்யப்பட்ட மரபணுக்களின் துணைக்குழுவின் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனுக்கான BRF2), மற்றும் ஒரு B-டபுள்-ப்ரைம் (BDP1) அலகு. ஒட்டுமொத்த கட்டிடக்கலை போல் II இன் கட்டிடக்கலையுடன் ஒற்றுமையைக் கொண்டுள்ளது. 5S rRNA (கிளாஸ் I என்றும் அழைக்கப்படுகிறது) மரபணு துவக்கத்தில் கிளாஸ் I வழக்கமான நிலைகள்ஃ TFIIIA (பாலிமரேஸ் III A க்கான டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணி) இன்ட்ராஜெனிக் (டிரான்ஸ்கிரிப்ட் செய்யப்பட்ட டிஎன்ஏ வரிசைக்குள் உள்ளது) 5S rRNA கட்டுப்பாட்டு வரிசை, சி பிளாக் (பாக்ஸ் சி என்றும் அழைக்கப்படுகிறது) உடன் பிணைக்கிறது. டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனின் தொடக்க தளத்தைப் பொறுத்தவரை ஒரு நோக்குநிலையில் TFIIIC ஐ நிலைநிறுத்துவதற்கான A மற்றும் B தொகுதிகளை மாற்றும் ஒரு தளமாக TFIIIA செயல்படுகிறது, இது tRNA மரபணுக்களுக்கு காணப்பட்டதற்கு சமம். TFIIIC ஆனது TFIIIA-DNA வளாகத்துடன் பிணைக்கப்பட்டவுடன், TFIIIB இன் அசெம்பிளி tRNA டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனுக்கு விவரிக்கப்பட்டுள்ளபடி தொடர்கிறது. ஒரு டி. ஆர். என். ஏ (வகுப்பு II என்றும் அழைக்கப்படுகிறது) மரபணு துவக்கத்தில் இரண்டாம் வகுப்பு பொதுவான நிலைகள்ஃ டி. எஃப். ஐ. ஐ. ஐ. சி (பாலிமரேஸ் III சி க்கான டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணி) இரண்டு இன்ட்ராஜெனிக் (டிரான்ஸ்கிரிப்ட் டிஎன்ஏ வரிசைக்குள் உள்ளது) கட்டுப்பாட்டு வரிசைகளுடன் பிணைக்கிறது, ஏ மற்றும் பி தொகுதிகள் (பெட்டி ஏ மற்றும் பெட்டி பி என்றும் அழைக்கப்படுகிறது). டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனின் தொடக்க தளத்தின் மேல்நோக்கி சுமார் 26 அடிப்படை ஜோடிகளை மையமாகக் கொண்ட ஒரு தளத்தில் டிஎன்ஏவுடன் பிணைக்க டிஎஃப்ஐஐஐபியை நிலைநிறுத்தும் ஒரு அசெம்பிளி காரணியாக டிஎஃப்ஐஐஐசி செயல்படுகிறது. TFIIIB என்பது டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனின் தொடக்க இடத்தில் போல் III ஐ இணைக்கும் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணி ஆகும். டிஎஃப்ஐஐபி டிஎன்ஏவுடன் பிணைக்கப்பட்டவுடன், டிஎஃப்ஐஐஐசி இனி தேவையில்லை. விளம்பரதாரர் திறப்பிலும் TFIIIB முக்கிய பங்கு வகிக்கிறது. யு6 எஸ்என்ஆர்என்ஏ (கிளாஸ் III என்றும் அழைக்கப்படுகிறது) மரபணு துவக்கத்தில் மூன்றாம் வகுப்பு பொதுவான நிலைகள் (முதுகெலும்புள்ள விலங்குகளில் மட்டுமே ஆவணப்படுத்தப்பட்டுள்ளது): எஸ்என்ஏபிசி (எஸ்என்ஆர்என்ஏ ஆக்டிவேட்டிங் புரோட்டீன் காம்ப்ளக்ஸ்; துணை அலகுகள்ஃ 1,2,3,4,5) (பிபிபி மற்றும் பிடிஎஃப் என்றும் அழைக்கப்படுகிறது) பிஎஸ்இ (ப்ராக்ஸிமல் சீக்வென்ஸ் எலிமென்ட்) உடன் பிணைக்கிறது, இது டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனின் தொடக்க தளத்தின் மேல்நோக்கி சுமார் 55 அடிப்படை ஜோடிகளை மையமாகக் கொண்டுள்ளது. இந்த அசெம்பிளி போல் II டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணிகள் அக்டோபர் 1 மற்றும் எஸ். டி. ஏ. எஃப் ஆகியவற்றால் பெரிதும் தூண்டப்படுகிறது, அவை டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனின் தொடக்க தளத்தின் மேல்நோக்கி குறைந்தது 200 அடிப்படை ஜோடிகள் போன்ற டி. எஸ். இ (டிஸ்டல் சீக்வென்ஸ் எலிமெண்ட்) உடன் பிணைக்கப்படுகின்றன. இந்த காரணிகள் மற்றும் ஊக்குவிப்பு கூறுகள் எஸ்என்ஆர்என்ஏ மரபணுக்களின் போல் II மற்றும் போல் III டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனுக்கு இடையில் பகிர்ந்து கொள்ளப்படுகின்றன. டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனின் தொடக்க தளத்தின் மேல்நோக்கி 26 அடிப்படை ஜோடிகளை மையமாகக் கொண்ட ஒரு டாடா பெட்டியில் TFIIIB ஐ இணைக்க SNAPC செயல்படுகிறது. இது ஒரு டாடா பெட்டியின் இருப்பு ஆகும், இது எஸ். என். ஆர். என். ஏ மரபணு போல் II ஐ விட போல் III ஆல் படியெடுக்கப்படுகிறது என்பதைக் குறிப்பிடுகிறது. யு6 எஸ்என்ஆர்என்ஏ டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனுக்கான டிஎஃப்ஐஐபி ஒரு சிறிய பிஆர்எஃப்1 பாராளாக், பிஆர்எஃப்2 ஐக் கொண்டுள்ளது. TFIIIB என்பது டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனின் தொடக்க இடத்தில் போல் III ஐ இணைக்கும் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணி ஆகும். பிஆர்எப்2 கொண்ட டிஎஃப்ஐஐபியும் விளம்பரதாரர் திறப்பில் பங்கு வகிக்கிறது என்று வரிசை பாதுகாப்பு கணித்துள்ளது. போல் III மூலம் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் தொடங்கப்பட்டதைத் தொடர்ந்து நீளம் TFIIIB டிஎன்ஏவுடன் பிணைக்கப்பட்டுள்ளது (பாக்டீரியா σ காரணிகள் மற்றும் போல் II டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனுக்கான பெரும்பாலான அடித்தள டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணிகளைப் போலல்லாமல்). இது போல் III-டிரான்ஸ்கிரிப்ட் செய்யப்பட்ட மரபணுக்களின் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனல் ரீனைஷியேஷனின் அதிக விகிதத்திற்கு வழிவகுக்கிறது. Saccharomyces cerevisiae இல் நடத்தப்பட்ட ஒரு ஆய்வில், சங்கிலி நீளத்தின் விகிதம் சராசரியாக வினாடிக்கு 21 முதல் 22 நியூக்ளியோடைடுகளாக இருப்பது கண்டறியப்பட்டது, மேலும் வினாடிக்கு 29 நியூக்ளியோடைடுகள் மிக வேகமாக இருப்பது கண்டறியப்பட்டது. இந்த விகிதங்கள் ட்ரோசோபிலாவில் நடத்தப்பட்ட இன் விவோ ஆய்வில் கண்டறியப்பட்ட ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் II இன் நீளம் விகிதங்களுடன் ஒப்பிடத்தக்கவை. ஆர்என்ஏ சங்கிலி நீளத்தின் தனிப்பட்ட படிகளின் பகுப்பாய்வு, யு-டெர்மினேட்டட் ஆர்என்ஏ சங்கிலிகளுக்கு யு மற்றும் ஏ சேர்ப்பது மெதுவாக இருந்தது என்பதை சித்தரிக்கிறது. முடிவடையும் பாலிமரேஸ் III சிறிய பாலியு ஸ்ட்ரெச்சில் (5-6) டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனை நிறுத்துகிறது. யூகாரியோட்டுகளில், ஒரு ஹேர்பின் லூப் தேவையில்லை, ஆனால் மனிதர்களில் முடித்தல் செயல்திறனை மேம்படுத்தலாம். Saccharomyces cerevisiae இல், டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் நிறுத்தம் T7GT6 வரிசையில் ஏற்பட்டது மற்றும் முற்போக்கானது என்று கண்டறியப்பட்டது. ஐந்து, ஆறு மற்றும் ஏழு U எச்சங்களைக் கொண்ட டிரான்ஸ்கிரிப்ட்களின் இருப்பு மற்றும் T7 நீட்சியின் மெதுவான வாசிப்பு ஆகியவை ஆர். என். ஏ சங்கிலியில் ஒரு ஒற்றை G ஐ இணைப்பது நீளம் விகிதங்களை முழுமையாகவோ அல்லது கணிசமாகவோ மீட்டமைக்க உதவியது என்பதைக் குறிக்கிறது. டிரான்ஸ்கிரிப்ட் செய்யப்பட்ட ஆர்என்ஏக்கள் ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் III இலிருந்து டிரான்ஸ்கிரிப்ட் செய்யப்பட்ட ஆர்என்ஏக்களின் வகைகள் பின்வருமாறுஃ டிரான்ஸ்பர் ஆர்என்ஏக்கள் 5எஸ் ரைபோசோமல் ஆர்என்ஏ யூ6 ஸ்ப்லைசோசோமல் ஆர்என்ஏ ஆர்என்ஏ ஆர்என்ஏஎஸ் பி மற்றும் ஆர்என்ஏ எம்ஆர்பி ஆர்என்ஏ 7எஸ்எல் ஆர்என்ஏ (சமிக்ஞை அங்கீகாரத் துகள்களின் ஆர்என்ஏ கூறு) வால்ட் ஆர்என்ஏக்கள் ஒய் ஆர்என்ஏ சைன்இ (குறுகிய இடைவெளியில் மீண்டும் மீண்டும் கூறப்படும் கூறுகள்) 7எஸ்கே ஆர்என்ஏ பல மைக்ரோஆர்என்ஏக்கள் பல சிறிய நியூக்ளியோலார் ஆர்என்ஏக்கள் டிஎன்ஏ பழுதுபார்ப்பு ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் III இல் பல மரபணு ஒழுங்குமுறை ஆன்டிசென்ஸ் ஆர்என்ஏக்களின் பங்கு ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் III இரட்டை ஸ்ட்ராண்ட் பிரேக்குகளில் ஒரு நிலையற்ற ஆர்என்ஏ-டிஎன்ஏ கலப்பினத்தை உருவாக்குகிறது, இது ஒரே மாதிரியான மறுசீரமைப்பு மத்தியஸ்தம் செய்யப்பட்ட இரட்டை ஸ்ட்ராண்ட் பிரேக் பழுதுபார்ப்பில் ஒரு அத்தியாவசிய இடைநிலை படியாகும். இந்த படி 3 'தொங்கும் டிஎன்ஏ இழையை சீரழிவிலிருந்து பாதுகாக்கிறது. நிலையற்ற ஆர்என்ஏ-டிஎன்ஏ கலப்பின இடைநிலை உருவான பிறகு ஆர்என்ஏ இழைக்கு பதிலாக ஆர்ஏடி51 புரதம் மாற்றப்படுகிறது, இது பின்னர் எஸ்எஸ்டிஎன்ஏ படையெடுப்பு படிநிலையான ஒத்த மறுசீரமைப்பை ஊக்குவிக்கிறது. மேலும் காண்க ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் குறிப்புகள் மரபணு வெளிப்பாடு புரதங்கள்