Rosetta@home
Rosetta@home என்பது பேக்கர் ஆய்வகத்தால் நடத்தப்படும் பெர்க்லி ஓபன் இன்ஃப்ராஸ்ட்ரக்சர் ஃபார் நெட்வொர்க் கம்ப்யூட்டிங் (BOINC) இயங்குதளத்தில் புரத அமைப்பு முன்கணிப்பை ஆராய்ச்சி செய்யும் ஒரு தன்னார்வ கம்ப்யூட்டிங் திட்டமாகும். Rosetta@home செப்டம்பர் 19,2020 நிலவரப்படி சராசரியாக 487,946 ஜிகாப்லோப்களில் சுமார் ஐம்பத்தைந்து ஆயிரம் செயலில் உள்ள தன்னார்வ கணினி செயலாக்கத்தின் உதவியுடன் புரத-புரத டாக்கிங் மற்றும் புதிய புரதங்களை வடிவமைப்பதை நோக்கமாகக் கொண்டுள்ளது. ஃபோல்டிட், ஒரு Rosetta@home வீடியோ கேம், ஒரு க்ரவுட்ஸோர்சிங் அணுகுமுறையுடன் இந்த இலக்குகளை அடைவதை நோக்கமாகக் கொண்டுள்ளது. திட்டத்தின் பெரும்பகுதி புரோட்டியோமிக்ஸ் முறைகளின் துல்லியம் மற்றும் வலுவான தன்மையை மேம்படுத்துவதற்கான அடிப்படை ஆராய்ச்சியை நோக்கமாகக் கொண்டிருந்தாலும், Rosetta@home மலேரியா, அல்சைமர் நோய் மற்றும் பிற நோய்கள் குறித்த பயன்பாட்டு ஆராய்ச்சிகளையும் செய்கிறது. அனைத்து BOINC திட்டங்களைப் போலவே, Rosetta@home தன்னார்வலர்களின் கணினிகளிலிருந்து செயலற்ற கணினி செயலாக்க வளங்களைப் பயன்படுத்தி தனிப்பட்ட பணி அலகுகளில் கணக்கீடுகளைச் செய்கிறது. முடிக்கப்பட்ட முடிவுகள் ஒரு மைய திட்ட சேவையகத்திற்கு அனுப்பப்படுகின்றன, அங்கு அவை சரிபார்க்கப்பட்டு திட்ட தரவுத்தளங்களில் ஒருங்கிணைக்கப்படுகின்றன. இந்த திட்டம் குறுக்கு-தளமாகும், மேலும் பல்வேறு வகையான வன்பொருள் உள்ளமைவுகளில் இயங்குகிறது. பயனர்கள் தங்கள் தனிப்பட்ட புரத அமைப்பு கணிப்பின் முன்னேற்றத்தை Rosetta@home ஸ்கிரீன் சேவரில் காணலாம். நோய் தொடர்பான ஆராய்ச்சிக்கு கூடுதலாக, கட்டமைப்பு உயிர் தகவலியலில் புதிய முறைகளுக்கான சோதனை கட்டமைப்பாக Rosetta@home நெட்வொர்க் செயல்படுகிறது. இத்தகைய முறைகள் பின்னர் ரோசெட்டா டாக் அல்லது ஹ்யூமன் புரோட்டியம் ஃபோல்டிங் ப்ராஜெக்ட் மற்றும் மைக்ரோபயோம் இம்யூனிட்டி ப்ராஜெக்ட் போன்ற பிற ரோசெட்டா அடிப்படையிலான பயன்பாடுகளில் பயன்படுத்தப்படுகின்றன, இது Rosetta@home இன் பெரிய மற்றும் மாறுபட்ட தன்னார்வ கணினிகளில் போதுமான அளவு உருவாக்கப்பட்டு நிலையானதாக நிரூபிக்கப்பட்ட பிறகு. Rosetta@home இல் உருவாக்கப்பட்ட புதிய முறைகளுக்கான இரண்டு குறிப்பாக முக்கியமான சோதனைகள் புரத அமைப்பு முன்கணிப்புக்கான நுட்பங்களின் விமர்சன மதிப்பீடு (CASP) மற்றும் தொடர்புகளின் கணிப்பின் விமர்சன மதிப்பீடு (CAPRI) சோதனைகள், புரத அமைப்பு முன்கணிப்பு மற்றும் புரத-புரத டாக்கிங் முன்கணிப்பில் முறையே கலையின் நிலையை மதிப்பிடும் இரு வருடாந்திர சோதனைகள் ஆகும். ரோசெட்டா தொடர்ந்து முன்னணி டாக்கிங் முன்கணிப்பாளர்களில் ஒன்றாக உள்ளது, மேலும் இது கிடைக்கக்கூடிய சிறந்த மூன்றாம் நிலை கட்டமைப்பு முன்கணிப்பாளர்களில் ஒன்றாகும். SARS-CoV-2 ஆல் ஏற்படும் COVID-19 தொற்றுநோய்க்கு எதிரான போராட்டத்தில் பங்கேற்க விரும்பும் புதிய பயனர்களின் வருகையுடன், Rosetta@home மார்ச் 28,2020 நிலவரப்படி அதன் கணினி சக்தியை 1.7 பெட்டாஃப்ளாப்ஸ் வரை அதிகரித்துள்ளது. செப்டம்பர் 9,2020 அன்று, ஆராய்ச்சியாளர்கள் SARS-CoV-2 க்கு எதிரான 10 சக்திவாய்ந்த வைரஸ் தடுப்பு மருந்துகளை விவரிக்கும் ஒரு கட்டுரையை வெளியிட்டனர். Rosetta@home இந்த ஆராய்ச்சிக்கு பங்களித்தது, மேலும் இந்த வைரஸ் தடுப்பு மருந்துகள் 2022 ஆம் ஆண்டின் தொடக்கத்தில் தொடங்கக்கூடிய கட்டம் 1 மருத்துவ பரிசோதனைகளை நோக்கி செல்கின்றன. Rosetta@home குழுவின் கூற்றுப்படி, ரோசெட்டா தன்னார்வலர்கள் ஒரு நானோ துகள்கள் தடுப்பூசியின் வளர்ச்சிக்கு பங்களித்தனர். இந்த தடுப்பூசி உரிமம் பெற்றது மற்றும் ஐவிஎக்ஸ்-411 என்று அழைக்கப்படுகிறது, இது ஜூன் 2021 இல் கட்டம் I/II மருத்துவ பரிசோதனையைத் தொடங்கியது, மேலும் ஜிபிபி 510 இது எஸ். கே பயோசைன்ஸால் உருவாக்கப்பட்டு ஏற்கனவே தென் கொரியாவில் கட்டம் III மருத்துவ பரிசோதனைக்கு அங்கீகரிக்கப்பட்டுள்ளது. என்எல்-201, ஒரு புற்றுநோய் மருந்து வேட்பாளர், இது முதன்முதலில் புரோட்டீன் டிசைன் நிறுவனத்தில் (ஐபிடி) உருவாக்கப்பட்டது மற்றும் ஜனவரி 2019 காகிதத்தில் வெளியிடப்பட்டது, மே 2021 இல் நியோலூகின் தெரபியூட்டிக்ஸின் ஆதரவுடன் ஒரு கட்டம் 1 மனித மருத்துவ பரிசோதனையைத் தொடங்கியது, இது ஐபிடியின் ஒரு ஸ்பின்-ஆஃப் ஆகும். Rosetta@home என்எல்-201 இன் வளர்ச்சியில் ஒரு பங்கைக் கொண்டிருந்தது மற்றும் புரத வடிவமைப்புகளை சரிபார்க்க உதவிய "முன்னோக்கி மடிப்பு" சோதனைகளுடன் பங்களித்தது. கணினி தளம் விண்டோஸ், லினக்ஸ் மற்றும் மேகோஸ் இயக்க முறைமைகளுக்கு Rosetta@home பயன்பாடு மற்றும் BOINC தன்னார்வ கணினி தளம் கிடைக்கின்றன; BOINC மற்ற பலவற்றிலும் இயங்குகிறது, எ. கா., ஃப்ரீபிஎஸ்டி. Rosetta@home இல் பங்கேற்பதற்கு குறைந்தபட்சம் 500 மெகா ஹெர்ட்ஸ் கடிகார வேகம் கொண்ட ஒரு மத்திய செயலாக்க அலகு (CPU), 200 மெகாபைட் இலவச வட்டு இடம், 512 மெகாபைட் இயற்பியல் நினைவகம் மற்றும் இணைய இணைப்பு தேவைப்படுகிறது. ஜூலை 20,2016 நிலவரப்படி, ரோசெட்டா மினி பயன்பாட்டின் தற்போதைய பதிப்பு 3.73 ஆகும். தற்போதைய பரிந்துரைக்கப்பட்ட BOINC நிரல் பதிப்பு 7.6.22 ஆகும். நிலையான ஹைபர்டெக்ஸ்ட் டிரான்ஸ்பர் புரோட்டோகால் (HTTP) (போர்ட் 80) பயனரின் BOINC கிளையன்ட் மற்றும் வாஷிங்டன் பல்கலைக்கழகத்தில் உள்ள Rosetta@home சேவையகங்களுக்கிடையேயான தகவல்தொடர்புக்கு பயன்படுத்தப்படுகிறது; கடவுச்சொல் பரிமாற்றத்தின் போது HTTPS (போர்ட் 443) பயன்படுத்தப்படுகிறது. BOINC கிளையண்டின் ரிமோட் மற்றும் லோக்கல் கண்ட்ரோல் போர்ட் 31416 மற்றும் போர்ட் 1043 ஐப் பயன்படுத்துகிறது, அவை ஃபயர்வாலுக்கு பின்னால் இருந்தால் குறிப்பாக அன்லாக் செய்யப்பட வேண்டும். தனிப்பட்ட புரதங்கள் பற்றிய தரவைக் கொண்ட பணிக்குழுக்கள் வாஷிங்டன் பல்கலைக்கழகத்தில் பேக்கர் ஆய்வகத்தில் அமைந்துள்ள சேவையகங்களிலிருந்து தன்னார்வலர்களின் கணினிகளுக்கு விநியோகிக்கப்படுகின்றன, அவை ஒதுக்கப்பட்ட புரதத்திற்கான கட்டமைப்பு கணிப்பைக் கணக்கிடுகின்றன. கொடுக்கப்பட்ட புரதத்தின் மீது நகல் கட்டமைப்பு கணிப்புகளைத் தவிர்க்க, ஒவ்வொரு பணி அலகு ஒரு சீரற்ற விதை எண்ணுடன் துவக்கப்படுகிறது. இது ஒவ்வொரு கணிப்புக்கும் புரதத்தின் ஆற்றல் நிலப்பரப்பில் இறங்கும் ஒரு தனித்துவமான பாதையை வழங்குகிறது. Rosetta@home இலிருந்து புரத அமைப்பு கணிப்புகள் கொடுக்கப்பட்ட புரதத்தின் ஆற்றல் நிலப்பரப்பில் உலகளாவிய குறைந்தபட்சத்தின் தோராயங்கள் ஆகும். அந்த உலகளாவிய குறைந்தபட்சம் புரதத்தின் மிகவும் ஆற்றல்மிக்க சாதகமான இணக்கத்தை குறிக்கிறது, அதாவது, அதன் சொந்த நிலை. Rosetta@home வரைகலை பயனர் இடைமுகத்தின் (GUI) ஒரு முதன்மை அம்சம் ஒரு ஸ்கிரீன் சேவர் ஆகும், இது உருவகப்படுத்தப்பட்ட புரத மடிப்பு செயல்முறையின் போது தற்போதைய பணிக்குழுவின் முன்னேற்றத்தைக் காட்டுகிறது. தற்போதைய ஸ்கிரீன் சேவரின் மேல்-இடதுபுறத்தில், இலக்கு புரதம் மிகக் குறைந்த ஆற்றல் கட்டமைப்பிற்கான அதன் தேடலில் வெவ்வேறு வடிவங்களை (இணக்கங்கள்) ஏற்றுக்கொள்வது காட்டப்பட்டுள்ளது. வலதுபுறத்தில் உடனடியாக சித்தரிக்கப்பட்டுள்ளது மிக சமீபத்தில் ஏற்றுக்கொள்ளப்பட்ட கட்டமைப்பாகும். மேல் வலதுபுறத்தில் தற்போதைய சிதைவின் மிகக் குறைந்த ஆற்றல் இணக்கம் காட்டப்பட்டுள்ளது; அதற்குக் கீழே புரதத்தின் உண்மை அல்லது சொந்த அமைப்பு ஏற்கனவே தீர்மானிக்கப்பட்டிருந்தால். திரை சேமிப்பில் மூன்று வரைபடங்கள் சேர்க்கப்பட்டுள்ளன. நடுவில், ஏற்றுக்கொள்ளப்பட்ட மாதிரியின் வெப்ப இயக்கவியல் இலவச ஆற்றலுக்கான வரைபடம் காட்டப்படுகிறது, இது ஏற்றுக்கொள்ளப்பட்ட மாதிரி மாறும்போது ஏற்ற இறக்கமாக இருக்கும். ஏற்றுக்கொள்ளப்பட்ட மாதிரியின் வேர்-பொருள்-சதுர விலகல் (ஆர். எம். எஸ். டி) இன் வரைபடம், ஏற்றுக்கொள்ளப்பட்ட மாதிரி சொந்த மாதிரியுடன் கட்டமைப்பு ரீதியாக எவ்வளவு ஒத்திருக்கிறது என்பதை அளவிடுகிறது, இது மிகவும் வலதுபுறம் காட்டப்பட்டுள்ளது. ஏற்றுக்கொள்ளப்பட்ட ஆற்றல் வரைபடத்தின் வலதுபுறத்திலும், ஆர். எம். எஸ். டி வரைபடத்திற்குக் கீழும், இந்த இரண்டு செயல்பாடுகளின் முடிவுகளும் ஒரு ஆற்றல் மற்றும் ஆர். எம். எஸ். டி பிளாட்டை உருவாக்கப் பயன்படுத்தப்படுகின்றன, ஏனெனில் மாதிரி படிப்படியாக சுத்திகரிக்கப்படுகிறது. அனைத்து BOINC திட்டங்களைப் போலவே, Rosetta@home பயனரின் கணினியின் பின்னணியில் இயங்குகிறது, செயலற்ற கணினி சக்தியைப் பயன்படுத்தி, புரவலன் இயக்க முறைமையில் ஒரு கணக்கில் உள்நுழையும் போது அல்லது அதற்கு முன். சாதாரண கணினி பயன்பாடு பாதிக்கப்படாமல் இருக்க மற்ற பயன்பாடுகளுக்கு அவை தேவைப்படுவதால் நிரல் CPU இலிருந்து வளங்களை விடுவிக்கிறது. பல நிரல் அமைப்புகளை பயனர் கணக்கு விருப்பத்தேர்வுகள் மூலம் குறிப்பிடலாம், அவற்றுள் பின்வருவன அடங்கும்ஃ நிரல் பயன்படுத்தக்கூடிய CPU வளங்களின் அதிகபட்ச சதவீதம் (நீடித்த திறனில் இயங்கும் கணினியிலிருந்து மின் நுகர்வு அல்லது வெப்ப உற்பத்தியைக் கட்டுப்படுத்த), நிரல் இயங்கக்கூடிய நாளின் நேரங்கள் மற்றும் பல. திட்ட முக்கியத்துவம் மரபணு வரிசைமுறை திட்டங்களின் பெருக்கத்துடன், உயிரணுக்களுக்குள் செயல்பாடுகளைச் செய்யும் பல புரதங்களின் அமினோ அமில வரிசை அல்லது முதன்மை கட்டமைப்பை விஞ்ஞானிகள் ஊகிக்க முடியும். ஒரு புரதத்தின் செயல்பாட்டை நன்கு புரிந்துகொள்ளவும், பகுத்தறிவு மருந்து வடிவமைப்பில் உதவவும், விஞ்ஞானிகள் புரதத்தின் முப்பரிமாண மூன்றாம் நிலை கட்டமைப்பை அறிந்து கொள்ள வேண்டும். புரத 3டி கட்டமைப்புகள் தற்போது எக்ஸ்ரே படிகவியல் அல்லது நியூக்ளியர் காந்த அதிர்வு (என். எம். ஆர்) ஸ்பெக்ட்ரோஸ்கோபி மூலம் சோதனை ரீதியாக தீர்மானிக்கப்படுகின்றன. செயல்முறை மெதுவாக உள்ளது (முதல் முறையாக ஒரு புரதத்தை எவ்வாறு படிகப்படுத்துவது என்பதைக் கண்டுபிடிக்க வாரங்கள் அல்லது மாதங்கள் கூட ஆகலாம்) மற்றும் விலை உயர்ந்தது (ஒரு புரதத்திற்கு சுமார் 100,000 அமெரிக்க டாலர்கள்). துரதிர்ஷ்டவசமாக, புதிய வரிசைகள் கண்டுபிடிக்கப்படும் விகிதம் கட்டமைப்பு நிர்ணய விகிதத்தை விட அதிகமாக உள்ளது-தேசிய உயிரி தொழில்நுட்ப தகவல் மையத்தின் (என். சி. பி. ஐ) தேவையற்ற (என். ஆர்) புரத தரவுத்தளத்தில் கிடைக்கும் 7,400,000 புரத வரிசைகளில், 52,000 க்கும் குறைவான புரதங்களின் 3டி கட்டமைப்புகள் தீர்க்கப்பட்டு புரதங்கள் குறித்த கட்டமைப்பு தகவல்களுக்கான முக்கிய களஞ்சியமான புரத தரவு வங்கியில் டெபாசிட் செய்யப்பட்டுள்ளன. Rosetta@home இன் முக்கிய குறிக்கோள்களில் ஒன்று, தற்போதுள்ள முறைகளைப் போலவே புரத கட்டமைப்புகளையும் துல்லியமாக கணிப்பதாகும், ஆனால் கணிசமாக குறைந்த நேரமும் பணமும் தேவைப்படும் வகையில். எக்ஸ்-ரே படிகவியல் மற்றும் என். எம். ஆர் ஸ்பெக்ட்ரோஸ்கோபி போன்ற பாரம்பரிய நுட்பங்களுடன் பகுப்பாய்வு செய்வது விதிவிலக்காக கடினமாக இருக்கும் சவ்வு புரதங்களின் (எ. கா., ஜி புரதம்-இணைக்கப்பட்ட ஏற்பிகள் (ஜி. பி. சி. ஆர்)) கட்டமைப்பு மற்றும் அடைப்பைத் தீர்மானிக்கும் முறைகளையும் Rosetta@home உருவாக்குகிறது, இருப்பினும் நவீன மருந்துகளுக்கான பெரும்பாலான இலக்குகளைக் குறிக்கிறது. புரதக் கட்டமைப்பு முன்கணிப்பின் முன்னேற்றம் புரதக் கட்டமைப்பு முன்கணிப்புக்கான நுட்பங்களின் இரு வருடாந்திர விமர்சன மதிப்பீடு (சிஏஎஸ்பி) பரிசோதனையில் மதிப்பிடப்படுகிறது, இதில் உலகெங்கிலும் உள்ள ஆராய்ச்சியாளர்கள் புரதத்தின் அமினோ அமில வரிசையிலிருந்து ஒரு புரதத்தின் கட்டமைப்பைப் பெற முயற்சிக்கின்றனர். இந்த சில நேரங்களில் போட்டி பரிசோதனையில் அதிக மதிப்பெண் பெறும் குழுக்கள் புரத அமைப்பு முன்கணிப்பில் கலையின் நிலை என்ன என்பதற்கான நடைமுறை தரமான தாங்கிகளாக கருதப்படுகின்றன. ரோசெட்டா, Rosetta@home அடிப்படையாகக் கொண்ட நிரல், 2002 இல் CASP5 முதல் பயன்படுத்தப்படுகிறது. 2004 CASP6 பரிசோதனையில், ரோசெட்டா CASP இலக்கு T0281 க்கான சமர்ப்பிக்கப்பட்ட மாதிரியில் அணு நிலை தெளிவுத்திறனுக்கு நெருக்கமான, ஏபி இன்ஷியோ புரத அமைப்பு கணிப்பை முதன்முதலில் உருவாக்கியதன் மூலம் வரலாற்றை உருவாக்கியது. ஏபி இன்டிஷியோ மாடலிங் என்பது புரத அமைப்பு முன்கணிப்பின் குறிப்பாக கடினமான வகையாகக் கருதப்படுகிறது, ஏனெனில் இது கட்டமைப்பு ஒத்திசைவிலிருந்து தகவல்களைப் பயன்படுத்துவதில்லை, மேலும் வரிசை ஒத்திசைவு மற்றும் புரதத்திற்குள் உடல் தொடர்புகளை மாதிரியாக்குதல் ஆகியவற்றிலிருந்து தகவல்களை நம்பியிருக்க வேண்டும். Rosetta@home 2006 முதல் CASP இல் பயன்படுத்தப்படுகிறது, அங்கு CASP7 இல் உள்ள ஒவ்வொரு வகை கட்டமைப்பு முன்கணிப்பிலும் இது சிறந்த முன்கணிப்பாளர்களில் ஒன்றாகும். இந்த உயர்தர கணிப்புகள் Rosetta@home தன்னார்வலர்களால் கிடைக்கப்பெற்ற கணிப்பு சக்தியால் இயக்கப்பட்டன. கணினி சக்தியை அதிகரிப்பது Rosetta@home இணக்க இடத்தின் அதிக பகுதிகளை மாதிரி செய்ய அனுமதிக்கிறது (ஒரு புரதம் கருதக்கூடிய வடிவங்கள்), இது லெவின்தாலின் முரண்பாட்டின் படி, புரத நீளத்துடன் அதிவேகமாக அதிகரிக்கும் என்று கணிக்கப்பட்டுள்ளது. புரத-புரத அடைப்பு முன்கணிப்பிலும் ரோசெட்டா பயன்படுத்தப்படுகிறது, இது பல சிக்கலான புரதங்கள் அல்லது நாற்கர கட்டமைப்பின் கட்டமைப்பை தீர்மானிக்கிறது. இந்த வகை புரதத் தொடர்பு ஆன்டிஜென்-ஆன்டிபாடி மற்றும் என்சைம்-இன்ஹிபிட்டர் பிணைப்பு மற்றும் செல்லுலார் இறக்குமதி மற்றும் ஏற்றுமதி உள்ளிட்ட பல செல்லுலார் செயல்பாடுகளை பாதிக்கிறது. இந்த தொடர்புகளை தீர்மானிப்பது மருந்து வடிவமைப்பிற்கு முக்கியமானது. புரத அமைப்பு முன்கணிப்பில் சி. ஏ. எஸ். பி அளவீடுகள் எவ்வாறு முன்னேறுகின்றன என்பதைப் போலவே புரத அடைப்பு புலத்தின் நிலையை மதிப்பிடும் பரஸ்பர தொடர்புகளின் கணிப்பு விமர்சன மதிப்பீடு (சி. ஏ. பி. ஆர். ஐ) பரிசோதனையில் ரோசெட்டா பயன்படுத்தப்படுகிறது. Rosetta@home இன் திட்ட தன்னார்வலர்களால் வழங்கப்பட்ட கணினி சக்தி CAPRI 2007 இல் ரோசெட்டாவின் செயல்திறனில் ஒரு முக்கிய காரணியாக மேற்கோள் காட்டப்பட்டுள்ளது, அங்கு அதன் டாக்கிங் கணிப்புகள் மிகவும் துல்லியமானவை மற்றும் முழுமையானவை. 2008 ஆம் ஆண்டின் தொடக்கத்தில், இயற்கையில் இதற்கு முன்பு காணப்படாத ஒரு செயல்பாட்டைக் கொண்ட ஒரு புரதத்தை கணக்கீட்டு ரீதியாக வடிவமைக்க ரோசெட்டா பயன்படுத்தப்பட்டது. இது 2004 ஆம் ஆண்டிலிருந்து ஒரு உயர்மட்ட காகிதத்தை திரும்பப் பெறுவதன் மூலம் ஈர்க்கப்பட்டது, இது முதலில் ஒரு புரதத்தின் கணக்கீட்டு வடிவமைப்பை அதன் இயற்கையான வடிவத்துடன் ஒப்பிடுகையில் மேம்பட்ட நொதி செயல்பாட்டை விவரிக்கிறது. புரதம் எவ்வாறு தயாரிக்கப்பட்டது என்பதை விவரிக்கும் டேவிட் பேக்கரின் குழுவின் 2008 ஆராய்ச்சிக் கட்டுரை, அது கிடைக்கச் செய்த கணினி வளங்களுக்கு Rosetta@home ஐ மேற்கோள் காட்டியது, இந்த புரத வடிவமைப்பு முறைக்கான கருத்தின் முக்கியமான ஆதாரத்தை பிரதிநிதித்துவப்படுத்தியது. இந்த வகை புரத வடிவமைப்பு மருந்து கண்டுபிடிப்பு, பசுமை வேதியியல் மற்றும் உயிரியல் சிகிச்சை ஆகியவற்றில் எதிர்கால பயன்பாடுகளைக் கொண்டிருக்கலாம். நோய் தொடர்பான ஆராய்ச்சி புரத அமைப்பு, டாக்கிங் மற்றும் வடிவமைப்பை கணிப்பதில் அடிப்படை ஆராய்ச்சிக்கு கூடுதலாக, Rosetta@home உடனடி நோய் தொடர்பான ஆராய்ச்சியிலும் பயன்படுத்தப்படுகிறது. டேவிட் பேக்கரின் Rosetta@home இதழில் ஏராளமான சிறிய ஆராய்ச்சி திட்டங்கள் விவரிக்கப்பட்டுள்ளன. பிப்ரவரி 2014 நிலவரப்படி, சமீபத்திய வெளியீடுகள் பற்றிய தகவல்களும், படைப்புகளின் சுருக்கமான விளக்கமும் மன்றத்தில் புதுப்பிக்கப்படுகின்றன. மன்ற நூல் 2016 முதல் இனி பயன்படுத்தப்படவில்லை, மேலும் ஆராய்ச்சி குறித்த செய்திகளை திட்டத்தின் பொது செய்தி பிரிவில் காணலாம். அல்சைமர் நோய் ரோசட்டா மென்பொருள் தொகுப்பின் ஒரு கூறு, ரோசட்டா டிசைன், அமிலாய்டோஜெனிக் புரதங்களின் எந்த பகுதிகள் அமிலாய்டு போன்ற ஃபைப்ரில்களை உருவாக்க அதிக வாய்ப்புள்ளது என்பதை துல்லியமாக கணிக்க பயன்படுத்தப்பட்டது. ஆர்வமுள்ள புரதத்தின் ஹெக்ஸாபெப்டைடுகளை (ஆறு அமினோ அமில நீள துண்டுகள்) எடுத்துக்கொள்வதன் மூலமும், அறியப்பட்ட ஃபைப்ரில் உருவாக்கும் ஹெக்ஸாபெப்டைடைப் போன்ற ஒரு கட்டமைப்பிற்கு மிகக் குறைந்த ஆற்றல் பொருத்தத்தைத் தேர்ந்தெடுப்பதன் மூலமும், ரோசெட்டா டிசைன் சீரற்ற புரதங்களைப் போல ஃபைப்ரில்களை உருவாக்க இரண்டு மடங்கு பெப்டைடுகளை அடையாளம் காண முடிந்தது. அல்சைமர் நோயை ஏற்படுத்துவதாக அனுமானிக்கப்பட்ட ஃபைப்ரில் உருவாக்கும் புரதமான அமிலாய்டு பீட்டாவுக்கான கட்டமைப்புகளைக் கணிக்க அதே ஆய்வில் Rosetta@home பயன்படுத்தப்பட்டது. ஃபைப்ரில்கள் உருவாவதைத் தடுக்கக்கூடிய ரோசட்டா வடிவமைக்கப்பட்ட புரதங்களில் ஆரம்ப ஆனால் இன்னும் வெளியிடப்படாத முடிவுகள் தயாரிக்கப்பட்டுள்ளன, இருப்பினும் இது நோயைத் தடுக்க முடியுமா என்பது தெரியவில்லை. ரோசெட்டாவின் மற்றொரு கூறு, ரோசெட்டா டாக், ஆந்த்ராக்ஸ் நச்சுத்தன்மையை உருவாக்கும் மூன்று புரதங்கள்-ஆபத்தான காரணி (எல். எஃப்), எடிமா காரணி (ஈ. எஃப்) மற்றும் பாதுகாப்பு ஆன்டிஜென் (பி. ஏ) ஆகியவற்றுக்கு இடையிலான தொடர்புகளை மாதிரியாக்குவதற்கான சோதனை முறைகளுடன் இணைந்து பயன்படுத்தப்பட்டது. கணினி மாதிரி LF மற்றும் PA க்கு இடையிலான கப்பல்துறை துல்லியமாக கணித்தது, LF-PA வளாகத்தில் அந்தந்த புரதங்களின் எந்த களங்கள் ஈடுபட்டுள்ளன என்பதை நிறுவ உதவுகிறது. இந்த நுண்ணறிவு இறுதியில் ஆராய்ச்சியில் பயன்படுத்தப்பட்டது, இதன் விளைவாக மேம்பட்ட ஆந்த்ராக்ஸ் தடுப்பூசிகள் கிடைத்தன. ஹெர்பெஸ் சிம்ப்ளக்ஸ் வைரஸ் 1 ரோசெட்டா டாக் ஒரு ஆன்டிபாடி (இம்யூனோகுளோபூலின் ஜி) மற்றும் குளிர் புண் வைரஸ், ஹெர்பெஸ் சிம்ப்ளக்ஸ் வைரஸ் 1 (எச்எஸ்வி-1) வெளிப்படுத்திய மேற்பரப்பு புரதத்திற்கு இடையில் டாக்கிங் செய்ய பயன்படுத்தப்பட்டது, இது வைரஸ் எதிர்ப்பு ஆன்டிபாடியை சிதைக்க உதவுகிறது. ரோசெட்டடாக்கால் கணிக்கப்பட்ட புரத வளாகம் குறிப்பாக கடினமாகப் பெறக்கூடிய சோதனை மாதிரிகளுடன் நெருக்கமாக உடன்பட்டது, புரத-புரத இடைமுகங்களை மாடலிங் செய்வதில் எக்ஸ்-ரே படிகவியல் கொண்டிருக்கும் சில சிக்கல்களைத் தீர்க்கும் திறன் இந்த டாக்கிங் முறைக்கு உள்ளது என்று ஆராய்ச்சியாளர்கள் முடிவு செய்தனர். பில் & மெலிண்டா கேட்ஸ் அறக்கட்டளையின் 19,4 மில்லியன் டாலர் மானியத்தால் நிதியளிக்கப்பட்ட ஆராய்ச்சியின் ஒரு பகுதியாக, மனித நோயெதிர்ப்பு குறைபாடு வைரஸுக்கு (எச். ஐ. வி) பல சாத்தியமான தடுப்பூசிகளை வடிவமைப்பதில் எச். ஐ. வி பயன்படுத்தப்பட்டுள்ளது. உலகளாவிய சுகாதார முன்முயற்சியில் பெரிய சவால்களுடன் தொடர்புடைய ஆராய்ச்சியில், ரோசெட்டா கணக்கீட்டு ரீதியாக புதிய ஹோமிங் எண்டோநியூக்ளீஸ் புரதங்களை வடிவமைக்கப் பயன்படுத்தப்படுகிறது, இது அனோபிலீஸ் காம்பியாவை ஒழிக்கலாம் அல்லது கொசுக்களால் மலேரியாவை பரப்ப முடியாது. புரத-டி. என். ஏ தொடர்புகளை குறிப்பாக, ஹோமிங் எண்டோநியூக்ளியேஸ்களைப் போலவே, மாதிரியாக்கவும் மாற்றவும் முடியும், ரோசெட்டா போன்ற கணக்கீட்டு புரத வடிவமைப்பு முறைகள் மரபணு சிகிச்சையில் முக்கிய பங்கு வகிக்கின்றன (இதில் சாத்தியமான புற்றுநோய் சிகிச்சைகள் அடங்கும்). SARS-CoV-2 ஸ்பைக் புரதத்தின் அணு அளவிலான கட்டமைப்பை ஆய்வகத்தில் அளவிடுவதற்கு சில வாரங்களுக்கு முன்பு துல்லியமாக கணிக்க COVID-19 ரோசெட்டா மூலக்கூறு மாடலிங் தொகுப்பு சமீபத்தில் பயன்படுத்தப்பட்டது. ஜூன் 26,2020 அன்று, ஆய்வகத்தில் SARS-CoV-2 வைரியன்களை நடுநிலையாக்கும் வைரஸ் தடுப்பு புரதங்களை உருவாக்குவதில் வெற்றி பெற்றதாகவும், இந்த சோதனை வைரஸ் தடுப்பு மருந்துகள் விலங்கு சோதனை சோதனைகளுக்கு உகந்ததாக இருப்பதாகவும் இந்த திட்டம் அறிவித்தது. ஒரு பின்தொடர்தலில், 10 SARS-CoV-2 மினிப்ரோடைன் தடுப்பான்களை விவரிக்கும் ஒரு கட்டுரை செப்டம்பர் 9 அன்று சயின்ஸ் இதழில் வெளியிடப்பட்டது. இந்த தடுப்பான்களில் இரண்டு, எல். சி. பி 1 மற்றும் எல். சி. பி 3, மோலார் மற்றும் வெகுஜன அடிப்படையில் SARS-CoV-2 க்கு எதிராக உருவாக்கப்படும் சிறந்த மோனோக்ளோனல் ஆன்டிபாடிகளை விட பல மடங்கு அதிக சக்தி வாய்ந்தவை. கூடுதலாக, இந்த தடுப்பான்கள் உயர்ந்த வெப்பநிலையில் தங்கள் செயல்பாட்டைத் தக்க வைத்துக் கொள்கின்றன, ஒரு ஆன்டிபாடியை விட 20 மடங்கு சிறியவை, இதனால், 20 மடங்கு அதிக நடுநிலையான தளங்களைக் கொண்டுள்ளன, இது உள்நாட்டில் நிர்வகிக்கப்படும் மருந்தின் சாத்தியமான செயல்திறனை அதிகரிக்கிறது. தடுப்பான்களின் சிறிய அளவு மற்றும் அதிக நிலைத்தன்மை அவை ஒரு ஜெல் சூத்திரத்திற்கு போதுமானதாக இருக்கும் என்று எதிர்பார்க்கப்படுகிறது, அவை நாசி மூலம் பயன்படுத்தப்படலாம் அல்லது சுவாச அமைப்பில் நேரடியாக நிர்வகிக்க ஒரு தூளாக இருக்கும். வரும் மாதங்களில் இந்த தடுப்பான்களை சிகிச்சை மற்றும் நோய்த்தடுப்பு மருந்துகளாக உருவாக்குவதில் ஆராய்ச்சியாளர்கள் பணியாற்றுவார்கள். ஜூலை 2021 நிலவரப்படி, இந்த வைரஸ் தடுப்பு மருந்துகள் 2022 ஆம் ஆண்டின் தொடக்கத்தில் மருத்துவ பரிசோதனைகளைத் தொடங்கும் என்று கணிக்கப்பட்டது, மேலும் பில் & மெலிண்டா கேட்ஸ் அறக்கட்டளையிலிருந்து முன்கூட்டிய மற்றும் ஆரம்பகால மருத்துவ பரிசோதனைகளுக்கான நிதியைப் பெற்றன. விலங்கு சோதனை சோதனைகளில், இந்த வைரஸ் தடுப்பு மருந்துகள் ஆல்பா, பீட்டா மற்றும் காமா உள்ளிட்ட கவலைக்குரிய மாறுபாடுகளுக்கு எதிராக பயனுள்ளதாக இருந்தன. கணக்கீட்டு ரீதியாக வடிவமைக்கப்பட்ட 2 மில்லியனுக்கும் அதிகமான SARS-CoV-2 ஸ்பைக்-பிணைப்பு புரதங்களைத் திரையிட Rosetta@home பயன்படுத்தப்பட்டது, இதனால் இந்த ஆராய்ச்சிக்கு பங்களித்தது. புரோட்டீன் டிசைன் இன்ஸ்டிடியூட்டில் உள்ள Rosetta@home குழுவின் கூற்றுப்படி, Rosetta@home தன்னார்வலர்கள் வைரஸ் தடுப்பு மருந்து வேட்பாளர்களின் வளர்ச்சிக்கும் புரத நானோ துகள்கள் தடுப்பூசிக்கும் பங்களித்தனர். ஐவிஎக்ஸ்-411 தடுப்பூசி ஏற்கனவே ஐகோசாவாக்ஸ் நடத்தும் கட்டம் 1 மருத்துவ பரிசோதனையில் உள்ளது, அதே தடுப்பூசி, மற்றொரு உற்பத்தியாளருக்கு உரிமம் பெற்றது மற்றும் ஜிபிபி 510 என்ற பெயரில், எஸ். கே பயோசைன்ஸ் நடத்தும் கட்டம் III சோதனைக்கு தென் கொரியாவில் அங்கீகரிக்கப்பட்டுள்ளது. வைரஸ் தடுப்பு மருந்துகளும் கட்டம் 1 மருத்துவ பரிசோதனைகளை நோக்கி செல்கின்றன. புற்றுநோய் ஆராய்ச்சியாளர்கள் நியோலூகின்-2/15 எனப்படும் ஐஎல்-2 ஏற்பி அகோனிஸ்ட்டை வடிவமைத்துள்ளனர், இது ஏற்பியின் ஆல்பா துணைக்குழுவுடன் தொடர்பு கொள்ளாது. இத்தகைய நோய் எதிர்ப்பு சக்தி சமிக்ஞை மூலக்கூறுகள் புற்றுநோய் சிகிச்சையில் பயனுள்ளதாக இருக்கும். இயற்கையான ஐஎல்-2 ஆல்பா துணைக்குழுவுடன் தொடர்பு கொள்வதால் நச்சுத்தன்மையால் பாதிக்கப்படுகையில், வடிவமைக்கப்பட்ட புரதம் மிகவும் பாதுகாப்பானது, குறைந்தபட்சம் விலங்கு மாதிரிகளில். Rosetta@home வடிவமைப்புகளை சரிபார்க்க உதவிய "முன்னோக்கி மடிப்பு சோதனைகளில்" பங்களித்தது. நியூயார்க்கரில் செப்டம்பர் 2020 இல் வெளியான ஒரு அம்சத்தில், டேவிட் பேக்கர், நியோலூகின்-2/15 மனித மருத்துவ பரிசோதனைகளை "இந்த ஆண்டின் பிற்பகுதியில்" தொடங்கும் என்று கூறினார். Neoleukin-2/15 பேக்கர் ஆய்வகத்தின் ஸ்பின்-ஆஃப் நிறுவனமான Neoleukin ஆல் உருவாக்கப்படுகிறது. டிசம்பர் 2020 இல், நியோலூகின் என்எல்-201 இன் கட்டம் 1 மருத்துவ பரிசோதனையைத் தொடங்குவதற்காக உணவு மற்றும் மருந்து நிர்வாகத்துடன் ஒரு புலனாய்வு புதிய மருந்து விண்ணப்பத்தை சமர்ப்பிப்பதாக அறிவித்தது, இது நியோலூகின்-2/15 இன் மேலும் வளர்ச்சியாகும். இதேபோன்ற ஒரு விண்ணப்பம் ஆஸ்திரேலியாவில் சமர்ப்பிக்கப்பட்டது மற்றும் நியோலூகின் கட்டம் 1 மருத்துவ பரிசோதனையில் 120 பங்கேற்பாளர்களைப் பதிவு செய்ய நம்புகிறார். கட்டம் 1 மனித மருத்துவ சோதனை மே 5,2021 அன்று தொடங்கியது. ரோசட்டா மென்பொருள் ரோசட்டா என்பது Rosetta@home இல் கட்டமைப்பு முன்கணிப்பைச் செய்வதற்கான மென்பொருளாகும். ஒரு BOINC கிளஸ்டர் தவிர, ரோசெட்டா ஒரு உள்ளூர் கணினியில் அல்லது ஒரு உள்ளூர் சூப்பர் கம்ப்யூட்டரில் இயங்க முடியும். பிற உயிர் தகவலியல் நிரல்களைப் போலவே, இணைய இடைமுகத்திலிருந்து ரோசெட்டாவை இயக்க ஆன்லைன் பொது சேவையகங்கள் உள்ளன. மென்பொருள் கல்வி சமூகத்திற்கு இலவசமாக உரிமம் பெற்றது மற்றும் மருந்து நிறுவனங்களுக்கு கட்டணத்திற்கு கிடைக்கிறது. முதலில் 1998 ஆம் ஆண்டில் வாஷிங்டன் பல்கலைக்கழகத்தில் பேக்கர் ஆய்வகத்தால் கட்டமைப்பு முன்கணிப்புக்கான ஒரு தொடக்க அணுகுமுறையாக அறிமுகப்படுத்தப்பட்டது, ரோசெட்டா பின்னர் பல வளர்ச்சி நீரோடைகள் மற்றும் தனித்துவமான சேவைகளாக கிளைத்துள்ளது, இது மேக்ரோமோலிகுலர் டாக்கிங் மற்றும் புரத வடிவமைப்பு போன்ற அம்சங்களை வழங்குகிறது. ரோசெட்டாவின் ஆரம்ப வளர்ச்சியில் ஈடுபட்ட பல பட்டதாரி மாணவர்களும் பிற ஆராய்ச்சியாளர்களும் பின்னர் மற்ற பல்கலைக்கழகங்களுக்கும் ஆராய்ச்சி நிறுவனங்களுக்கும் குடிபெயர்ந்தனர், பின்னர் ரோசெட்டா திட்டத்தின் பல்வேறு பகுதிகளை மேம்படுத்தியுள்ளனர். புரதங்களின் அமினோ அமில வரிசைகளின் கட்டமைப்பு "அர்த்தத்தை" புரிந்துகொள்ள முயற்சிக்கும்போது, ரோசெட்டா இயங்குதளம் அதன் பெயரை ரோசெட்டா கல்லில் இருந்து பெறுகிறது. ரோசெட்டா குறியீட்டின் வளர்ச்சி ரோசெட்டா காமன்ஸ் மூலம் செய்யப்படுகிறது. ரோசெட்டா CASP மற்றும் CAPRI இல் பங்கேற்கிறது. ஃபோர்ட்ரானில் எழுதப்பட்ட அதன் அசல் பதிப்பால் அனுமதிக்கப்பட்டதை விட எளிதாக வளர்ச்சியை அனுமதிக்க ரோசெட்டா சி + + இல் மீண்டும் எழுதப்பட்டது. இந்த புதிய பதிப்பு பொருள் சார்ந்ததாகும், இது பிப்ரவரி 8,2008 அன்று வெளியிடப்பட்டது. ரோசட்டா டிசைன் ரோசட்டா டிசைன், ரோசட்டாவை அடிப்படையாகக் கொண்ட புரத வடிவமைப்பிற்கான ஒரு கணினி அணுகுமுறை, 2000 ஆம் ஆண்டில் புரோட்டீன் ஜி இன் மடிப்பு பாதையை மறுவடிவமைப்பு செய்வதற்கான ஒரு ஆய்வுடன் தொடங்கியது. 2002 ஆம் ஆண்டில் ரோசட்டா டிசைன் டாப் 7 ஐ வடிவமைக்கப் பயன்படுத்தப்பட்டது, இது 93-அமினோ அமிலம் நீளமான α/β புரதமாகும், இது இயற்கையில் இதற்கு முன்பு பதிவு செய்யப்படாத ஒட்டுமொத்த மடிப்பைக் கொண்டிருந்தது. இந்த புதிய இணக்கம் ரோசெட்டாவால் எக்ஸ்-ரே படிகவியல் மூலம் தீர்மானிக்கப்பட்ட கட்டமைப்பின் 1.2 ஆர். எம். எஸ். டி க்குள் கணிக்கப்பட்டது, இது வழக்கத்திற்கு மாறாக துல்லியமான கட்டமைப்பு கணிப்பைக் குறிக்கிறது. ரோசெட்டா மற்றும் ரோசெட்டா டிசைன் முதன்முதலில் ஒரு புதிய புரதத்தின் கட்டமைப்பை வடிவமைத்து துல்லியமாக கணிப்பதன் மூலம் பரவலான அங்கீகாரத்தைப் பெற்றனர், இது சயின்ஸ் இதழில் இரண்டு நேர்மறையான கடிதங்களைத் தூண்டும் இரட்டை அணுகுமுறையை விவரிக்கும் 2002 கட்டுரையில் பிரதிபலித்தது, மேலும் 240 க்கும் மேற்பட்ட பிற அறிவியல் கட்டுரைகளால் மேற்கோள் காட்டப்பட்டது. அந்த ஆராய்ச்சியின் புலப்படும் தயாரிப்பு, டாப் 7, அக்டோபர் 2006 இல் ஆர். சி. எஸ். பி பி. டி. பியின் 'மாதத்தின் மூலக்கூறு' ஆக இடம்பெற்றது; அதன் கணிக்கப்பட்ட மற்றும் எக்ஸ்ரே படிக கட்டமைப்புகளின் அந்தந்த மையங்களின் (எச்சங்கள் 60-79) ஒரு சூப்பர்போசிஷன் Rosetta@home லோகோவில் இடம்பெற்றுள்ளது. டேவிட் பேக்கரின் ஆய்வகத்தின் முன்னாள் முதுகலை உதவியாளரும், இப்போது சேப்பல் ஹில்லில் உள்ள வட கரோலினா பல்கலைக்கழகத்தில் இணை பேராசிரியருமான பிரையன் குஹ்ல்மேன், ரோசெட்டா டிசைனை ஒரு ஆன்லைன் சேவையாக வழங்குகிறார். 2002 ஆம் ஆண்டில் முதல் CAPRI பரிசோதனையின் போது ரொசெட்டா மென்பொருள் தொகுப்பில் ரொசெட்டா டாக் சேர்க்கப்பட்டது, இது புரத-புரத டாக்கிங் முன்கணிப்புக்கான பேக்கர் ஆய்வகத்தின் வழிமுறையாகும். அந்த பரிசோதனையில், ரோசெட்டா டாக் ஸ்ட்ரெப்டோகாக்கல் பியோஜெனிக் எக்ஸோடாக்சின் ஏ மற்றும் டி செல்-ஏற்பி β-சங்கிலிக்கு இடையிலான கப்பல்துறைக்கான உயர் துல்லியமான கணிப்பைச் செய்தது, மேலும் போர்சின் α-அமைலேஸ் மற்றும் ஒட்டக எதிர்ப்பு மருந்துக்கு இடையிலான சிக்கலுக்கான நடுத்தர துல்லியமான கணிப்பைச் செய்தது. ரோசெட்டா டாக் முறை ஏழு சாத்தியமான கணிப்புகளில் இரண்டு ஏற்றுக்கொள்ளக்கூடிய துல்லியமான கணிப்புகளை மட்டுமே செய்திருந்தாலும், முதல் CAPRI மதிப்பீட்டில் பத்தொன்பது கணிப்பு முறைகளில் ஏழாவது இடத்தைப் பிடிக்க இது போதுமானதாக இருந்தது. வாஷிங்டன் பல்கலைக்கழகத்தில் இருந்தபோது ரோசெட்டா டாக்கிற்கு அடித்தளம் அமைத்த ஜெஃப்ரி கிரே, ஜான்ஸ் ஹாப்கின்ஸ் பல்கலைக்கழகத்தில் தனது புதிய பதவியில் இந்த முறையை தொடர்ந்து பயன்படுத்தியதால், ரோசெட்டா டாக்கின் வளர்ச்சி அடுத்தடுத்த CAPRI சுற்றுகளுக்கு இரண்டு கிளைகளாக பிரிந்தது. பேக்கர் ஆய்வகத்தின் உறுப்பினர்கள் கிரே இல்லாத நிலையில் ரோசெட்டா டாக்கை மேலும் உருவாக்கினர். இரண்டு பதிப்புகளும் பக்க சங்கிலி மாடலிங், டிகோய் தேர்வு மற்றும் பிற பகுதிகளில் சற்று வேறுபட்டன. இந்த வேறுபாடுகள் இருந்தபோதிலும், பேக்கர் மற்றும் கிரே முறைகள் இரண்டும் இரண்டாவது CAPRI மதிப்பீட்டில் சிறப்பாக செயல்பட்டன, 30 முன்கணிப்பு குழுக்களில் முறையே ஐந்தாவது மற்றும் ஏழாவது இடத்தைப் பிடித்தன. ஜெஃப்ரி கிரேயின் ரோசெட்டா டாக் சேவையகம் வணிகரீதியான பயன்பாட்டிற்கான இலவச டாக்கிங் முன்கணிப்பு சேவையாக கிடைக்கிறது. அக்டோபர் 2006 இல், ரோசெட்டா டாக் Rosetta@home உடன் ஒருங்கிணைக்கப்பட்டது. இந்த முறை புரத முதுகெலும்பை மட்டுமே பயன்படுத்தி ஒரு வேகமான, கச்சா டாக்கிங் மாதிரி கட்டத்தைப் பயன்படுத்தியது. இதைத் தொடர்ந்து ஒரு மெதுவான முழு அணு சுத்திகரிப்பு கட்டம் ஏற்பட்டது, இதில் ஒருவருக்கொருவர் தொடர்புடைய இரண்டு ஊடாடும் புரதங்களின் நோக்குநிலை மற்றும் புரத-புரத இடைமுகத்தில் பக்க சங்கிலி தொடர்புகள் ஒரே நேரத்தில் மிகக் குறைந்த ஆற்றல் இணக்கத்தை கண்டறிய உகந்ததாக இருந்தன. முதுகெலும்பு நெகிழ்வுத்தன்மை மற்றும் லூப் மாடலிங்கிற்கான திருத்தப்பட்ட மடிப்பு-மர பிரதிநிதித்துவங்களுடன் இணைந்து, Rosetta@home நெட்வொர்க்கால் வழங்கப்பட்ட பெருமளவில் அதிகரித்த கம்ப்யூட்டிங் சக்தி, மூன்றாவது CAPRI மதிப்பீட்டில் 63 முன்கணிப்பு குழுக்களில் ரோசெட்டா டாக்கை ஆறாவது இடத்தைப் பிடித்தது. ரோபட்டா தி ரோபட்டா (ரோசட்டா பீட்டா) சேவையகம் என்பது பேக்கர் ஆய்வகத்தால் வணிகரீதியான தொடக்க மற்றும் ஒப்பீட்டு மாடலிங்கிற்காக வழங்கப்படும் ஒரு தானியங்கி புரத அமைப்பு முன்கணிப்பு சேவையாகும். இது 2002 ஆம் ஆண்டில் CASP5 முதல் இரு வருடாந்திர CASP சோதனைகளில் தானியங்கி முன்கணிப்பு சேவையகமாக பங்கேற்றுள்ளது, தானியங்கி சேவையக முன்கணிப்பு பிரிவில் சிறந்த செயல்திறனை வெளிப்படுத்துகிறது. ராபெட்டா பின்னர் CASP6 மற்றும் 7 இல் போட்டியிட்டது, அங்கு இது தானியங்கி சேவையகம் மற்றும் மனித முன்கணிப்பு குழுக்களிடையே சராசரியை விட சிறப்பாக செயல்பட்டது. இது CAMEO3D தொடர்ச்சியான மதிப்பீட்டிலும் பங்கேற்கிறது. ரோபட்டா பணிகள் பேக்கர் ஆய்வக சேவையகங்கள், ஜானேலியா ரிசர்ச் கேம்பஸ் இயந்திரங்கள் மற்றும் Rosetta@home பங்கேற்பாளர் கணினிகளில் இயங்குகின்றன. CASP6 போல புரதக் கட்டமைப்பை மாதிரியாக்குவதில், ரோபட்டா முதலில் BLAST, PSI-BLAST மற்றும் 3D-ஜூரி ஆகியவற்றைப் பயன்படுத்தி கட்டமைப்பு ஒத்திசைவுகளைத் தேடுகிறது, பின்னர் இலக்கு வரிசையை அதன் தனிப்பட்ட களங்களில் பகுப்பாய்வு செய்கிறது, அல்லது சுயாதீனமாக புரதங்களின் மடிப்பு அலகுகள், வரிசையை கட்டமைப்பு குடும்பங்களுடன் பொருத்துவதன் மூலம் ப்ஃபாம் தரவுத்தளத்தில். கட்டமைப்பு ஒத்திசைவுகளைக் கொண்ட களங்கள் பின்னர் ஒரு "வார்ப்புரு அடிப்படையிலான மாதிரியை" (அதாவது, ஒத்திசைவு மாதிரியாக்கம்) நெறிமுறையைப் பின்பற்றுகின்றன. இங்கே, பேக்கர் ஆய்வகத்தின் உள் சீரமைப்பு திட்டமான கே * ஒத்திசைவு, வரிசை ஒத்திசைவுகளின் ஒரு குழுவை உருவாக்குகிறது, மேலும் இவை ஒவ்வொன்றும் ரோசெட்டா டி நோவோ முறையால் ஒரு சிதைவை (சாத்தியமான அமைப்பு) உருவாக்க வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளது. குறைந்த தெளிவுத்திறன் கொண்ட ரோசட்டா ஆற்றல் செயல்பாட்டால் தீர்மானிக்கப்படும் மிகக் குறைந்த ஆற்றல் மாதிரியை எடுத்துக்கொள்வதன் மூலம் இறுதி கட்டமைப்பு கணிப்பு தேர்ந்தெடுக்கப்படுகிறது. கண்டறியப்பட்ட கட்டமைப்பு ஒத்திசைவுகள் இல்லாத களங்களுக்கு, ஒரு டி நோவோ நெறிமுறை பின்பற்றப்படுகிறது, இதில் உருவாக்கப்பட்ட டிகோய்களின் தொகுப்பிலிருந்து மிகக் குறைந்த ஆற்றல் மாதிரி இறுதி கணிப்பாக தேர்ந்தெடுக்கப்படுகிறது. இந்த கள கணிப்புகள் பின்னர் புரதத்திற்குள் உள்ள களங்களுக்கு இடையேயான, மூன்றாம் நிலை-நிலை தொடர்புகளை ஆராய ஒன்றாக இணைக்கப்பட்டுள்ளன. இறுதியாக, பக்க சங்கிலி பங்களிப்புகள் மான்டே கார்லோ இணக்கத் தேடலுக்கான நெறிமுறையைப் பயன்படுத்தி வடிவமைக்கப்படுகின்றன. CASP8 இல், ரோசெட்டாவின் உயர் தெளிவுத்திறன் கொண்ட அனைத்து அணு சுத்திகரிப்பு முறையைப் பயன்படுத்த ரோபெட்டா அதிகரிக்கப்பட்டது, இது இல்லாதது CASP7 இல் உள்ள Rosetta@home நெட்வொர்க்கை விட ரோபெட்டா குறைவான துல்லியமாக இருப்பதற்கு முக்கிய காரணமாக மேற்கோள் காட்டப்பட்டது. CASP11 இல், GREMLIN எனப்படும் தொடர்புடைய புரதங்களில் உள்ள எச்சங்களின் இணை பரிணாமம் மூலம் புரத தொடர்பு வரைபடத்தை கணிக்க ஒரு வழி சேர்க்கப்பட்டது, இது புதிய மடிப்பு வெற்றிகளை அதிகப்படுத்த அனுமதிக்கிறது. பிற ரோசெட்டா சேவையகங்கள் ரோசெட்டா பல பொது சேவையகங்களிலிருந்து ஆன்லைன் சேவையாக கிடைக்கிறது. ஆர்என்ஏ கட்டமைப்பு முன்கணிப்பு மற்றும் வடிவமைப்பு முதல் லிகாண்ட் டாக்கிங் மற்றும் ஆன்டிபாடி மாடலிங் வரை பல்வேறு செயல்பாடுகளை ரோஸி வழங்குகிறது. மே 9,2008 அன்று, Rosetta@home பயனர்கள் தன்னார்வ கம்ப்யூட்டிங் திட்டத்தின் ஒரு ஊடாடும் பதிப்பை பரிந்துரைத்த பிறகு, பேக்கர் ஆய்வகம் ரோசட்டா தளத்தை அடிப்படையாகக் கொண்ட ஆன்லைன் புரத அமைப்பு முன்கணிப்பு விளையாடான ஃபோல்டிட்டை பகிரங்கமாக வெளியிட்டது. ஃபோல்டிட் 59,000 க்கும் மேற்பட்ட பதிவு செய்யப்பட்ட பயனர்களைக் கொண்டிருந்தது. இலக்கு புரதத்தின் முதுகெலும்பு மற்றும் அமினோ அமில பக்க சங்கிலிகளை மிகவும் ஆற்றல்மிக்க சாதகமான இணக்கங்களாக கையாள இந்த விளையாட்டு பயனர்களுக்கு கட்டுப்பாடுகளின் தொகுப்பை வழங்குகிறது (எடுத்துக்காட்டாக, குலுக்குதல், அசைத்தல், புனரமைத்தல்). பயனர்கள் தனித்தனியாக தனிப்பாடலாசிரியர்களாகவும் அல்லது ஒட்டுமொத்தமாக பரிணாம வளர்ச்சியாளர்களாகவும் தீர்வுகளில் பணியாற்றலாம், அவர்கள் தங்கள் கட்டமைப்பு கணிப்புகளை மேம்படுத்தும்போது எந்த வகையிலும் புள்ளிகளைப் பெறுகிறார்கள். ஃபோல்டிட் ஒரு தனிப்பயனாக்கப்பட்ட "தொழில்முறை பயன்முறையின்" கீழ் ரோசெட்டாவுக்கு ஒரு GUI முனையமாக வேலை செய்ய முடியும். ஆல்ஃபாஃபோல்டால் ஈர்க்கப்பட்ட ரோஸ் டி. டி. ஏஃபோல்ட், எச்சங்களுக்கு இடையிலான தூரத்தையும் நோக்குநிலையையும் கணிக்க ஒரு நரம்பியல் வலையமைப்பைப் பயன்படுத்துகிறது. இந்த கணிப்புகள் ரோசட்டா மென்பொருளை ஒரு கட்டமைப்பை உருவாக்குவதில் வழிநடத்துகின்றன. MIT உரிமத்தின் கீழ் RoseTTAFold திறந்த மூலமாகும். பேக்கர் அல்லாத ஆய்வக கிளைகள் சீனாவில் உள்ள ஜியானி யாங் ஆய்வகம் ரோசெட்டாவின் மாற்றியமைக்கப்பட்ட பதிப்பை டிஆர்-ரோசெட்டா எக்ஸ் 2 (உருமாற்றம்-கட்டுப்படுத்தப்பட்ட ரோசெட்டா) என்று அழைக்கிறது. இது வழக்கமான ரோசெட்டா மடிப்பு வழிமுறையை வழிநடத்த ரோஸ் டிடிஏஃபோல்டிலிருந்து வேறுபட்ட ஆழமான கற்றல் அடிப்படையிலான தொடர்பு முன்கணிப்பு முறையைப் பயன்படுத்துகிறது. டிரோரோசெட்டா ரோஸ் டிடிஏஃபோல்டுக்கு முந்தையது. ஒத்த தன்னார்வ கம்ப்யூட்டிங் திட்டங்களுடன் ஒப்பீடு பல தன்னார்வ கணக்கிடப்பட்ட திட்டங்கள் உள்ளன, அவை Rosetta@home போன்ற படிப்புப் பகுதிகளைக் கொண்டுள்ளன, ஆனால் அவற்றின் ஆராய்ச்சி அணுகுமுறையில் வேறுபடுகின்றனஃ Folding@home புரத ஆராய்ச்சியில் ஈடுபட்டுள்ள அனைத்து முக்கிய தன்னார்வ கம்ப்யூட்டிங் திட்டங்களிலும், Folding@home மட்டுமே BOINC தளத்தைப் பயன்படுத்தவில்லை. Rosetta@home மற்றும் Folding@home இரண்டும் அல்சைமர் நோய் போன்ற புரதத்தை தவறாக மடிக்கும் நோய்களைப் பற்றி ஆய்வு செய்கின்றன, ஆனால் Folding@home மிகவும் பிரத்தியேகமாக செய்கிறது. Folding@home கிட்டத்தட்ட பிரத்தியேகமாக அனைத்து அணு மூலக்கூறு இயக்கவியல் மாதிரிகளைப் பயன்படுத்துகிறது, புரதங்கள் எவ்வாறு, ஏன் மடிக்கப்படுகின்றன என்பதைப் புரிந்துகொள்ள (அல்லது தவறாக மடிக்கக்கூடியவை, பின்னர் நோய்களை ஏற்படுத்துவதற்கு திரட்டப்படுகின்றன). வேறு வார்த்தைகளில் கூறுவதானால், Folding@home இன் வலிமை புரத மடிப்பு செயல்முறையை மாதிரியாக்குகிறது, அதே நேரத்தில் Rosetta@home இன் வலிமை புரத வடிவமைப்பை கணக்கிடுவது மற்றும் புரத அமைப்பு மற்றும் டாக்கிங் ஆகியவற்றைக் கணிப்பது ஆகும். சில Rosetta@home இன் முடிவுகள் சில Folding@home திட்டங்களுக்கு அடிப்படையாகப் பயன்படுத்தப்படுகின்றன. ரோசெட்டா மிகவும் சாத்தியமான கட்டமைப்பை வழங்குகிறது, ஆனால் அது மூலக்கூறு எடுக்கும் வடிவமா அல்லது அது சாத்தியமானதா இல்லையா என்பது திட்டவட்டமாக இல்லை. Folding@home பின்னர் Rosetta@home இன் முடிவுகளை சரிபார்க்க பயன்படுத்தப்படலாம், மேலும் கூடுதல் அணு நிலை தகவல்களையும், மூலக்கூறு எவ்வாறு வடிவத்தை மாற்றுகிறது என்பதற்கான விவரங்களையும் வழங்க முடியும். இரண்டு திட்டங்களும் அவற்றின் கணினி சக்தி மற்றும் புரவலன் பன்முகத்தன்மையிலும் கணிசமாக வேறுபடுகின்றன. மத்திய செயலாக்க அலகுகள் (CPU கள்), கிராபிக்ஸ் செயலாக்க அலகுகள் (GPU கள்) மற்றும் (முன்பு) பிஎஸ் 3 களின் புரவலன் தளத்திலிருந்து சராசரியாக 6,650 டெராஃப்ளோப்ஸ், Folding@home Rosetta@home ஐ விட கிட்டத்தட்ட 108 மடங்கு அதிக கணினி சக்தியைக் கொண்டுள்ளது. உலக சமூக கட்டத்தின் துணைத் திட்டமான மனித புரோட்டியம் மடிப்பு திட்டத்தின் (எச். பி. எஃப்) கட்டம் I மற்றும் கட்டம் II இரண்டும் பல்வேறு மரபணுக்களின் கட்டமைப்பு மற்றும் செயல்பாட்டு சிறுகுறிப்புகளை உருவாக்க ரோசெட்டா திட்டத்தை பயன்படுத்தியுள்ளன. அவர் இப்போது உயிரியலாளர்களுக்கான தரவுத்தளங்களை உருவாக்க அதைப் பயன்படுத்தினாலும், மனித புரோட்டியம் மடிப்பு திட்டத்தின் தலைமை விஞ்ஞானியான ரிச்சர்ட் போனியோ, தனது முனைவர் பட்டத்தைப் பெறும்போது டேவிட் பேக்கரின் ஆய்வகத்தில் ரோசெட்டாவின் அசல் வளர்ச்சியில் தீவிரமாக இருந்தார். HPF1, HPF2 மற்றும் Rosetta@home இடையேயான உறவு பற்றிய கூடுதல் தகவல்களை ரிச்சர்ட் போனியோவின் இணையதளத்தில் காணலாம். Predictor@home போல Rosetta@home, Predictor@home புரத அமைப்பு முன்கணிப்பில் நிபுணத்துவம் பெற்றது. Rosetta@home அதன் கட்டமைப்பு முன்கணிப்புக்கு ரோசெட்டா நிரலைப் பயன்படுத்துகிறது, Predictor@home dTASSER முறையைப் பயன்படுத்துகிறது. 2009 இல், Predictor@home மூடப்பட்டது. BOINC இல் உள்ள பிற புரதம் தொடர்பான தன்னார்வ கம்ப்யூட்டிங் திட்டங்களில் QMC@home, Docking@home, POEM@home, சிமாப் மற்றும் டான்பாகு ஆகியவை அடங்கும். RALPH@home, புதிய பயன்பாட்டு பதிப்புகள், வேலை அலகுகள் மற்றும் புதுப்பிப்புகள் Rosetta@home க்குச் செல்வதற்கு முன்பு சோதிக்கும் Rosetta@home ஆல்பா திட்டம் BOINC இல் இயங்குகிறது. தன்னார்வ பங்களிப்புகள் Rosetta@home தனிப்பட்ட திட்ட உறுப்பினர்கள் அதன் ஆராய்ச்சிக்காக நன்கொடையாக வழங்கிய கணினி சக்தியைப் பொறுத்தது. 150 நாடுகளைச் சேர்ந்த சுமார் 53,000 பயனர்கள் Rosetta@home இன் செயலில் உறுப்பினர்களாக இருந்தனர், சுமார் 54,800 கணினிகளிலிருந்து செயலற்ற செயலி நேரத்தை 1.7 பெட்டாஃப்ளோப்ஸின் ஒருங்கிணைந்த சராசரி செயல்திறனுக்காக பங்களித்தனர். பயனர்களுக்கு அவர்களின் பங்களிப்பின் அளவீடாக BOINC வரவுகள் வழங்கப்படுகின்றன. ஒவ்வொரு பணிக்குழுவிற்கும் வழங்கப்படும் கிரெடிட் என்பது அந்த பணிக்குழுவிற்கு உற்பத்தி செய்யப்படும் டிகோய்களின் எண்ணிக்கை, அந்த பணிக்குழுவிற்கு அனைத்து கணினி புரவலன்களும் சமர்ப்பித்த டிகோய்களுக்கான சராசரி கோரப்பட்ட கிரெடிட்டால் பெருக்கப்படுகிறது. இந்த தனிப்பயன் அமைப்பு நிலையான BOINC கிளையன்ட் மற்றும் உகந்த BOINC கிளையன்ட் கொண்ட பயனர்களுக்கு வழங்கப்பட்ட கடன் மற்றும் விண்டோஸ் மற்றும் லினக்ஸ் இயக்க முறைமைகளில் Rosetta@home ஐ இயக்கும் பயனர்களுக்கு இடையிலான கடன் வேறுபாடுகள் ஆகியவற்றுக்கு இடையே குறிப்பிடத்தக்க வேறுபாடுகளை நிவர்த்தி செய்ய வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளது. CPU வேலையின் வினாடிக்கு வழங்கப்படும் கடன் தொகை மற்ற BOINC திட்டங்களை விட Rosetta@home க்கு குறைவாக உள்ளது. மொத்தக் கடன் அடிப்படையில் 40க்கும் மேற்பட்ட BOINC திட்டங்களில் Rosetta@home பதின்மூன்றாவது ஆகும். CASP பரிசோதனைக்கு சமர்ப்பிக்கப்பட்ட புரத கட்டமைப்புகளைக் கணிக்கும் பயனர்கள் அவர்களின் முடிவுகள் குறித்து அறிவியல் வெளியீடுகளில் அங்கீகரிக்கப்படுகிறார்கள். கொடுக்கப்பட்ட பணிக்குழுவிற்கான மிகக் குறைந்த ஆற்றல் கட்டமைப்பைக் கணிக்கும் பயனர்கள், அவர்கள் உறுப்பினராக இருக்கும் எந்தக் குழுவுடனும் சேர்ந்து, Rosetta@home முகப்புப்பக்கத்தில் நாளின் முன்கணிப்பாளராகக் காட்டப்படுகிறார்கள். Rosetta@home சுயவிவரத்தை உருவாக்கிய பயனர்களிடமிருந்து, முகப்புப்பக்கத்தில் இருக்க ஒவ்வொரு நாளும் தோராயமாக ஒரு பயனர் தேர்ந்தெடுக்கப்படுகிறார். குறிப்புகள் வெளிப்புற இணைப்புகள் பேக்கர் லேப் பேக்கர் லேப் வலைத்தளம் டேவிட் பேக்கரின் Rosetta@home இதழ் BOINC இயங்குதள கண்ணோட்டம் மற்றும் BOINC ஐ நிறுவுவதற்கான வழிகாட்டி மற்றும் Rosetta@home BOINCstats-Rosetta@home விரிவான பங்களிப்பு புள்ளிவிவரங்கள் RALPH@home வலைத்தளத்திற்கான விரிவான பங்களிப்பு புள்ளிவிவரங்கள் Rosetta@home யூடியூபில் வீடியோ டேவிட் பேக்கர் மற்றும் ஆய்வக உறுப்பினர்களால் வழங்கப்பட்ட Rosetta@home இன் கண்ணோட்டம் ரோசட்டா தளத்தை உருவாக்குவதற்கான ரோசட்டா காமன்ஸ் அகாடமிக் கூட்டுறவு ரோசட்டா குஹ்ல்மன் ஆய்வக வலைப்பக்கத்தின் வளர்ச்சியில் மைல்கல் ஆவணங்களின் பட்டியல், ரோசட்டா டிசைன் ஆன்லைன் ரோசட்டா சேவைகளின் ரோசட்டா காமன்ஸ் பட்டியல் கிடைக்கக்கூடிய சேவையகங்களின் ரோபட்டா புரோட்டீன் கட்டமைப்பு முன்கணிப்பு சேவையகம் ROSIE டாக் மல்டிஃபங்க்ஸ்னல் சர்வர்-செட் ரோசட்டா டிசைன் புரோட்டீன் டிசைன் சர்வர் ரோசட்டா பேக்ரப் நெகிழ்வான முதுகெலும்பு/புரத வடிவமைப்பு சர்வர் சமூகத்தில் அறிவியல் இலவச அறிவியல் மென்பொருள் தன்னார்வலர் கம்ப்யூட்டிங் திட்டங்கள் பயோ இன்ஃபர்மேட்டிக்ஸ் மென்பொருள் புரோட்டீன் அமைப்பு மூலக்கூறு மாடலிங் தனியுரிம குறுக்கு-தள மென்பொருள்