Photolyase
ஃபோட்டோலியேஸ்கள் () என்பது புற ஊதா ஒளியின் வெளிப்பாட்டால் ஏற்படும் சேதத்தை சரிசெய்யும் டிஎன்ஏ பழுதுபார்க்கும் என்சைம்கள் ஆகும். இந்த என்சைம்களுக்கு அவற்றின் சொந்த செயல்பாட்டிற்கும் உண்மையான டிஎன்ஏ பழுதுபார்ப்பிற்கும் புலப்படும் ஒளி (நிறமாலையின் ஊதா/நீல முனையிலிருந்து) தேவைப்படுகிறது. ஃபோட்டோலியேஸ்களை உள்ளடக்கிய டிஎன்ஏ பழுதுபார்க்கும் பொறிமுறை ஃபோட்டோரியேக்டிவேஷன் என்று அழைக்கப்படுகிறது. அவை முக்கியமாக பைரிமிடின் டைமர்களை ஒரு சாதாரண ஜோடி பைரிமிடின் தளங்களாக மாற்றுகின்றன. செயல்பாட்டு ஃபோட்டோலியேஸ்கள் நிரப்பு டிஎன்ஏ இழைகளை பிணைக்கின்றன மற்றும் டிஎன்ஏவின் ஒரே இழையில் ஒரு ஜோடி தைமின் அல்லது சைட்டோசின் தளங்கள் சகப்பிணைப்புடன் இணைக்கப்படும்போது எழும் சில வகையான பைரிமிடின் டைமர்களை உடைக்கின்றன. இந்த டைமெரைசேஷனின் பிணைப்பு நீளம் சாதாரண பி-டிஎன்ஏ கட்டமைப்பின் பிணைப்பு நீளத்தை விட குறைவாக உள்ளது, இது பிரதி மற்றும் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனுக்கான தவறான வார்ப்புருவை உருவாக்குகிறது. மிகவும் பொதுவான சகப்பிணைப்பு ஒரு சைக்ளோபியூட்டேன் பாலத்தை உருவாக்குவதை உள்ளடக்கியது. ஃபோட்டோலியேஸ்கள் இந்த புண்களுக்கு அதிக உறவைக் கொண்டுள்ளன, மேலும் அவை தலைகீழாக பிணைக்கப்பட்டு அவற்றை மீண்டும் அசல் தளங்களுக்கு மாற்றுகின்றன. பரிணாம ஃபோட்டோலியேஸ் என்பது ஒரு பைலோஜெனெட்டிகல் பழைய நொதியாகும், இது பாக்டீரியா முதல் பூஞ்சை வரை தாவரங்கள் மற்றும் விலங்குகள் வரை பல உயிரினங்களில் உள்ளது மற்றும் செயல்படுகிறது. தாவரங்களில் புற ஊதா தூண்டப்பட்ட சேதத்தை சரிசெய்வதில் ஃபோட்டோலியேஸ் குறிப்பாக முக்கியமானது. ஃபோட்டோலியேஸ் பொறிமுறை மனிதர்கள் மற்றும் பிற நஞ்சுப் பாலூட்டிகளில் இனி வேலை செய்யாது, அதற்கு பதிலாக அவை குறைந்த செயல்திறன் கொண்ட நியூக்ளியோடைடு பிரித்தெடுத்தல் பழுதுபார்க்கும் பொறிமுறையை நம்பியுள்ளன, இருப்பினும் அவை பல கிரிப்டோக்ரோம்களைத் தக்கவைத்துக்கொள்கின்றன. ஃபோட்டோலியேஸ்கள் ஃபிளாவோபிரோடைன்கள் மற்றும் இரண்டு ஒளி அறுவடை கோஃபாக்டர்களைக் கொண்டுள்ளன. பல ஃபோட்டோலியேஸ்கள் இரண்டாவது கோஃபாக்டரை பிணைக்கும் N-முனைய களத்தைக் கொண்டுள்ளன. அனைத்து ஃபோட்டோலியேஸ்களும் இரண்டு எலக்ட்ரான் குறைக்கப்பட்ட FADH-ஐக் கொண்டுள்ளன; அவை இரண்டாவது கோஃபாக்டரின் அடிப்படையில் இரண்டு முக்கிய வகுப்புகளாகப் பிரிக்கப்பட்டுள்ளன, அவை ஃபோலேட் ஃபோட்டோலியேஸ்களில் உள்ள டெரின் மெத்தனைல்டெட்ராஹைட்ரோஃபோலேட் (MTHF) அல்லது டீசாஃப்ளேவின் ஃபோட்டோலியேஸ்களில் உள்ள டீசாஃப்ளேவின் 8-ஹைட்ராக்ஸி-7,8-டைடெமெத்தில்-5-டீசாஃபோஃப்ளேவின் (8-HDF) ஆக இருக்கலாம். வினையூக்கி செயல்பாட்டிற்கு எஃப்ஏடி மட்டுமே தேவைப்பட்டாலும், இரண்டாவது கோஃபாக்டர் குறைந்த ஒளி நிலைகளில் எதிர்வினை விகிதத்தை கணிசமாக துரிதப்படுத்துகிறது. நொதி எலக்ட்ரான் பரிமாற்றத்தின் மூலம் செயல்படுகிறது, இதில் குறைக்கப்பட்ட ஃபிளேவின் FADH-ஒளி ஆற்றலால் செயல்படுத்தப்படுகிறது மற்றும் பைரிமிடின் டைமரை உடைக்க எலக்ட்ரான் நன்கொடையாளராக செயல்படுகிறது. வரிசை ஒற்றுமைகளின் அடிப்படையில் டிஎன்ஏ ஃபோட்டோலியேஸ்களை ஒரு சில வகுப்புகளாக வகைப்படுத்தலாம்ஃ கிளாஸ் 1 சிபிடி ஃபோட்டோலியேஸ்கள் என்பது கிராம்-நெகட்டிவ் மற்றும் கிராம்-பாசிட்டிவ் பாக்டீரியாவிலிருந்து சைக்ளோபியூட்டேன் பைரிமிடின் டைமர் (சிபிடி) புண்களை செயலாக்கும் என்சைம்கள், ஹாலோபிலிக் ஆர்க்கியா ஹாலோபாக்டீரியம் ஹாலோபியம். வகுப்பு 2 CPD ஃபோட்டோலியேஸ்கள் CPD புண்களையும் செயலாக்குகின்றன. அவை தாலெ கிரெஸ் அராபிடோப்ஸிஸ் தலியானா மற்றும் அரிசி போன்ற தாவரங்களில் காணப்படுகின்றன. தாவரம் மற்றும் பூஞ்சை கிரிப்டோக்ரோம்கள் வகுப்பு 1 CPD களைப் போலவே உள்ளன. நீல ஒளி தூண்டப்பட்ட மரபணு வெளிப்பாடு மற்றும் சர்க்காடியன் தாளங்களின் பண்பேற்றத்தை மத்தியஸ்தம் செய்யும் நீல ஒளி ஒளி ஏற்பிகள் அவை. கிளாஸ் 3 சிபிடி லைசஸ் தாவர கிரிப்டோக்ரோம்களுக்கு ஒரு சகோதரி குழுவை உருவாக்குகிறது, அவை கிளாஸ் 1 சிபிடிகளுக்கு ஒரு சகோதரி குழுவாகும். க்ரை-டாஷ் குழு சிபிடி லைசேஸ்கள் ஒற்றை-இழையுள்ள டிஎன்ஏவுக்கு மிகவும் குறிப்பிட்டவை. உறுப்பினர்களில் விப்ரியோ காலரா, செனோப்பஸ் லேவிஸின் எக்ஸ் 1 கிரி மற்றும் அராபிடோப்ஸிஸ் தலியானாவின் அட்க்ரை 3 ஆகியவை அடங்கும். டிஏஎஸ்ஹெச் ஆரம்பத்தில் ட்ரோசோபிலா, அராபிடோப்ஸிஸ், சினெகோசிஸ்டிஸ் மற்றும் ஹ்யூமன் ஆகியவற்றின் பெயரால் பெயரிடப்பட்டது, நான்கு வகை வகைகள் ஆரம்பத்தில் இந்த லைசஸ் குடும்பத்தைக் கொண்டிருப்பதாக கருதப்பட்டது. அதன் பிறகு இந்த வகைப்பாடு மாறியது. அவர்களின் பெயரின் "அழுகை" பகுதி அவை கிரிப்டோக்ரோம்கள் என்ற ஆரம்ப அனுமானங்கள் காரணமாக இருந்தது. யூகாரியோடிக் (6-6) டிஎன்ஏ ஃபோட்டோலியேஸ்கள் விலங்கு கிரிப்டோக்ரோம்களுடன் ஒரு குழுவை உருவாக்குகின்றன, அவை சர்க்காடியன் தாளங்களைக் கட்டுப்படுத்துகின்றன. இவை ட்ரோசோபிலா மற்றும் மனிதர்கள் உள்ளிட்ட பல்வேறு உயிரினங்களில் காணப்படுகின்றன. கிரிப்டோக்ரோம்கள் அவற்றின் சொந்த விரிவான குழுவைக் கொண்டுள்ளன. ஃபீஸ்-பிசிபி குழு என்றும் அழைக்கப்படும் பாக்டீரியல் 6-4 லைசேஸ் (), அனைத்து ஃபோட்டோலைசேஸ்களுடனும் ஒப்பிடுகையில் அவற்றின் சொந்த வெளிப்புறக் குழுவை உருவாக்குகின்றன. சிபிடிகளின் 2 ஆம் வகுப்பு அல்லாத கிளை பிரிண்ட்ஸ் (PR00147) போன்ற சில அமைப்புகளில் 1 ஆம் வகுப்பாக வகைப்படுத்தப்படுகிறது. சிறிய குழுக்களின் உறுப்பினர்கள் ஒப்புக் கொள்ளப்பட்டாலும், வழிமுறைகளில் உள்ள வேறுபாடுகள் காரணமாக எழுத்தாளர்களிடையே பைலோஜெனி பெரிதும் மாறுபடும், இது எல்லாவற்றையும் பொருத்த முயற்சிக்கும் ஆசிரியர்களுடன் சில குழப்பங்களுக்கு வழிவகுக்கிறது (FeS-BCP ஐத் தவிர) இரண்டு வகுப்பு வகைப்பாட்டிற்குள். கிரிப்டோக்ரோம்கள் டிஎன்ஏ பழுதுபார்க்கும் செயல்பாட்டை இழந்த ஃபோட்டோலியேஸ்கள் உட்பட ஒரு பாலிபைலெடிக் குழுவை உருவாக்குகின்றன, அதற்கு பதிலாக சர்க்காடியன் தாளங்களைக் கட்டுப்படுத்துகின்றன. பயன்பாடு நீல-பச்சை பாசி அனசிஸ்டிஸ் நிடுலன்களிலிருந்து ஃபோட்டோலியேஸை ஹெலா செல்களுக்குச் சேர்ப்பது புற ஊதா பி வெளிப்பாட்டிலிருந்து டிஎன்ஏ சேதத்தை ஓரளவு குறைத்தது. கிரிப்டோக்ரோம்கள் என்ற களத்தைக் கொண்ட மனித புரதங்கள்ஃ சிஆர்ஒய்1; சிஆர்ஒய்2 பெயரிடல் இந்த நொதி வகுப்பின் முறையான பெயர் டியோக்ஸிரைபோசைக்ளோபுடடிபைரிமிடின் பைரிமிடின்-லைஸ் ஆகும். பொதுவாகப் பயன்படுத்தப்படும் பிற பெயர்களில் ஃபோட்டோரியேக்டிவேட்டிங் என்சைம், டிஎன்ஏ ஃபோட்டோலியேஸ், டிஎன்ஏ-ஃபோட்டோரியேக்டிவேட்டிங் என்சைம், டிஎன்ஏ சைக்ளோபியூட்டேன் டைபிரிமைடின் ஃபோட்டோலியேஸ், டிஎன்ஏ ஃபோட்டோலியேஸ், டியோக்ஸிரிபோநியூக்ளிக் ஃபோட்டோலியேஸ், டியோக்ஸிரிபோடிபிரிமைடின் ஃபோட்டோலியேஸ், ஃபோட்டோலியேஸ், பிஆர்இ, பிஆர்பி ஃபோட்டோலியேஸ், டியோக்ஸிரிபோநியூக்ளிக் சைக்ளோபியூட்டேன் டைபிரிமைடின் ஃபோட்டோலியேஸ், ஃப்ராஸ் ஏ ஃபோட்டோலியேஸ், டைபிரிமைடின் ஃபோட்டோலியேஸ் (ஃபோட்டோஸெ இந்த நொதி லைசஸ் குடும்பத்தைச் சேர்ந்தது, குறிப்பாக கார்பன்-கார்பன் லைசஸின் "கேட்ச்-ஆல்" வகுப்பில் உள்ளது. குறிப்புகள் மேலும் வாசிப்பு வெளிப்புற இணைப்புகள் ஈசி 4.1.99 டிஎன்ஏ பழுதுபார்க்கும் அறியப்பட்ட கட்டமைப்பின் ஃபிளேவோபுரோட்டீன்களின் நொதிகள்