The Proteolysis Map
புரோட்டியோலிசிஸ் எம்ஏபி (பிஎம்ஏபி) என்பது புரோட்டியேஸ்களை மையமாகக் கொண்ட ஒரு ஒருங்கிணைந்த வலை வளமாகும். அதன் களம் இப்போது ஒரு மோசடி/ஸ்பேம் உலாவி விரிவாக்கத்துடன் இணைக்கப்பட்டுள்ளது. புரோட்டியோலிடிக் நெட்வொர்க்குகள் மற்றும் வளர்சிதை மாற்ற பாதைகள் பற்றிய பகுத்தறிவில் புரோட்டீஸ் ஆராய்ச்சியாளர்களுக்கு உதவுவதற்காக ரேஷனல் பி. எம். ஏ. பி வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளது. வரலாறு மற்றும் நிதியுதவி பி. எம். ஏ. பி முதலில் கலிபோர்னியாவின் லா ஜோலாவில் உள்ள பர்ன்ஹாம் மருத்துவ ஆராய்ச்சி நிறுவனத்தில் உருவாக்கப்பட்டது. 2004 ஆம் ஆண்டில் தேசிய சுகாதார நிறுவனங்கள் (என்ஐஎச்) ஜெஃப்ரி டபிள்யூ ஸ்மித் தலைமையிலான ஒரு குழுவைத் தேர்ந்தெடுத்து, புரோட்டியோலிடிக் பாதைகள் (சிபிபி) மையத்தை நிறுவியது. பயோமெடிக்கல் ஆராய்ச்சிக்கான என்ஐஎச் சாலை வரைபடத்தின் ஒரு பகுதியாக, புரதங்களின் நடத்தையை ஆய்வு செய்வதற்கும், அந்த அறிவை விஞ்ஞான சமூகத்திற்கு பெருமளவில் வழங்குவதற்கும் இந்த மையம் தொழில்நுட்பத்தை உருவாக்குகிறது. ஃபோகல் பாயிண்ட் புரோட்டீஸ்கள் என்பது புரதங்களில் உள்ள பெப்டைட் பிணைப்புகளை பிளவுபடுத்துவதன் மூலம் மனித உடலில், உயிரணுவிற்கு உள்ளேயும் வெளியேயும் என்ன நடக்கிறது என்பதைக் கட்டுப்படுத்தும் என்சைம்களின் ஒரு வகுப்பாகும். இந்த செயல்பாட்டின் மூலம், அவை நான்கு அத்தியாவசிய உயிரணு செயல்பாடுகளை நிர்வகிக்கின்றனஃ வேறுபாடு, இயக்கம், பிரிவு மற்றும் உயிரணு இறப்பு-மேலும் இரத்த உறைதலில் உயிர்வேதியியல் அடுக்கு விளைவு போன்ற முக்கியமான செல்களுக்கு வெளியே உள்ள அத்தியாயங்களை செயல்படுத்துகின்றன. அவர்கள் இல்லாமல் வாழ்க்கை இருக்க முடியாது. புரோட்டியேஸ்களுக்கான விரிவான ஆன்லைன் வகைப்பாடு அமைப்பு (பெப்டிடேஸ்கள் என்றும் குறிப்பிடப்படுகிறது) மெரோப்ஸ் தரவுத்தளத்தில் டெபாசிட் செய்யப்படுகிறது. குறிக்கோள் புரோட்டியோலிடிக் பாதைகள் அல்லது புரோட்டியோலிசிஸ் என்பது குறிப்பிட்ட தூண்டுதல்களுக்கு பதிலளிக்கும் வகையில் ஏற்படும் புரோட்டியேஸ்களால் கட்டுப்படுத்தப்படும் நிகழ்வுகளின் தொடர் ஆகும். இரத்த உறைதல் மற்றும் இன்சுலின் உற்பத்தி ஆகியவை புரோட்டியோலிடிக் பாதைகளாக கருதப்படலாம். புரதத்தின் செயல்பாடு, கட்டுப்பாடு மற்றும் தடுப்பு ஆகியவை குளுக்கோஸ் அளவை மாற்றுவதற்கான புரோட்டீஸ் எதிர்வினைகள் மற்றும் பிற புரோட்டீஸ்களை கீழ்நோக்கி தூண்டுகின்றன. தரவுத்தள உள்ளடக்கம் பி. எம். ஏ. பி ஐந்து தரவுத்தளங்களை ஒருங்கிணைக்கிறது. புரோட்டீஸ் டிபி மற்றும் சப்ஸ்ட்ரேட் டிபி, மூலக்கூறு தகவல்கள் நிறைந்த மாறும் 'மூலக்கூறு பக்கங்களை' உருவாக்கும் தானியங்கி சிறுகுறிப்பு குழாய் மூலம் இயக்கப்படுகின்றன. கட் டிபி 6,600 க்கும் மேற்பட்ட புரோட்டியோலிடிக் நிகழ்வுகள் பற்றிய தகவல்களைக் கொண்டுள்ளது, மேலும் ப்ரோடீஸ்களின் அடி மூலக்கூறு அங்கீகாரத் தனித்துவத்தின் தகவல்களுக்கு சுயவிவர டிபி அர்ப்பணிக்கப்பட்டுள்ளது. பாதைடிபி வளர்சிதை மாற்ற பாதைகளின் குவிப்பைத் தொடங்கியுள்ளது, அதன் செயல்பாட்டை ஒரு விதி அடிப்படையிலான முறையில் மாறும் வகையில் மாதிரியாக்கலாம். கற்பனை நெட்வொர்க்குகள் இலக்கியத்திலிருந்து அரை தானியங்கி முறையில் அகற்றுவதன் மூலம் ஊகிக்கப்படுகின்றன. புரோட்டீஸ் மென்பொருள் கருவிகள் தனிப்பட்ட புரோட்டீஸ்கள் மற்றும் புரோட்டியோம் அளவிலான தரவுத்தொகுப்புகளை பகுப்பாய்வு செய்ய உதவும். பயன்பாடு பி. எம். ஏ. பி. யில் பிரபலமான இடங்கள் புரோட்டீஸ் மூலக்கூறு பக்கங்கள் மற்றும் அடி மூலக்கூறு பக்கங்கள் ஆகும். புரோட்டீஸ் மூலக்கூறு பக்கங்கள் ப்ரோட்டீஸின் பப்மெட் இலக்கியத்தில் சமீபத்திய செய்திகளைக் காட்டுகின்றன, அறியப்பட்ட புரோட்டியோலிடிக் நிகழ்வுகள், புரத கள இருப்பிடம் மற்றும் புரத அமைப்பு பார்வை, அத்துடன் பிற உயிர் தகவலியல் தரவுத்தளப் பிரிவில் குறுக்கு சிறுகுறிப்பு. சப்ஸ்டிரேட் மூலக்கூறு பக்கங்கள் புரத களங்களையும், கொடுக்கப்பட்ட புரத இலக்கு ஆர்வத்திற்கான சோதனை ரீதியாக பெறப்பட்ட புரோட்டீஸ் வெட்டு தளங்களையும் காட்டுகின்றன. சைட்டோஸ்கேப் கம்ப்யூடேஷனல் ஜெனோமிக்ஸ் மெட்டபாலிக் நெட்வொர்க் மாடலிங் புரோட்டீன்-புரோட்டீன் தொடர்பு முன்கணிப்பு குறிப்புகள் வெளிப்புற இணைப்புகள் அதிகாரப்பூர்வ வலைத்தளம் புரோட்டியோலிசிஸ் கட் சைட் தரவுத்தளம்-பயனர்களிடமிருந்து தொகுக்கப்பட்ட நிபுணர் சிறுகுறிப்பு பாதுகாக்கப்பட்ட வெட்டு தளங்கள் வரைகலை இடைமுகம் பாதுகாக்கப்பட்ட வெட்டு முன்கணிப்பு மெரோப்ஸ்-பெப்டிடேஸ் தரவுத்தளம் மூலக்கூறு உயிரியல் தரவுத்தளங்கள் உயிரியல் தகவலியல் மென்பொருள் அமைப்புகள் உயிரியல் கணித மற்றும் கோட்பாட்டு உயிரியல் புரோட்டீன் களங்கள் புரோட்டீன் குடும்பங்கள் புற சவ்வு புரதங்கள் பிந்தைய மொழிபெயர்ப்பு திட்டமிடப்பட்ட செல் இறப்பு அப்போப்டொசிஸ்