ORF8
ORF8 என்பது சர்பெகோவைரஸ் துணை இனத்தின் கரோனாவைரஸ்களில் உள்ள பீடாகோரோனாவைரஸ் NS8 புரதம் என்ற வைரஸ் துணை புரதத்தை குறியாக்கம் செய்யும் ஒரு மரபணு ஆகும். இது மரபணுவின் மிகக் குறைந்த பாதுகாக்கப்பட்ட மற்றும் மிகவும் மாறுபட்ட பகுதிகளில் ஒன்றாகும். சில வைரஸ்களில், ஒரு நீக்குதல் இப்பகுதியை ORF8a மற்றும் ORF8b என்று அழைக்கப்படும் இரண்டு சிறிய திறந்த வாசிப்பு கட்டமைப்புகளாகப் பிரிக்கிறது-இது பல SARS-CoV வைரஸ் தனிமைப்படுத்தல்களில் SARS தொற்றுநோயின் பிற்பகுதியில் இருந்து, அதே போல் சில பேட் கரோனாவைரஸ்களிலும் உள்ளது. இந்த காரணத்திற்காக முழு நீள மரபணு மற்றும் அதன் புரதம் சில நேரங்களில் ORF8ab என்று அழைக்கப்படுகின்றன. SARS-CoV-2 இல் எடுத்துக்காட்டப்பட்ட முழு நீள மரபணு, அறியப்படாத செயல்பாட்டின் இம்யூனோகுளோபூலின் களத்துடன் ஒரு புரதத்தை குறியாக்கம் செய்கிறது, இது புரவலன் நோயெதிர்ப்பு மண்டலத்துடன் தொடர்புகளை உள்ளடக்கியிருக்கலாம். இது ORF7a புரதத்துடன் கட்டமைப்பில் ஒத்திருக்கிறது, இது மரபணு நகல் மூலம் தோன்றியிருக்கலாம் என்று கூறுகிறது. SARS-CoV-2 இல் உள்ள அமைப்பு ORF8 121 அமினோ அமில எச்சங்களின் புரதத்தை N-முனைய சமிக்ஞை வரிசையுடன் குறியாக்கம் செய்கிறது. ORF8 டைசல்பைடு பிணைப்புகளால் சகப்பிணைப்புடன் இணைக்கப்பட்ட ஒரு டைமரை உருவாக்குகிறது. இது ORF7a புரதத்துடன் தொலைதூர ஒற்றுமையுடன் இம்யூனோகுளோபூலின் போன்ற களத்தைக் கொண்டுள்ளது. இதே போன்ற ஒட்டுமொத்த மடிப்பு இருந்தபோதிலும், ORF8 இல் செருகுவது வெவ்வேறு புரத-புரத தொடர்புகளுக்கு காரணமாக இருக்கலாம் மற்றும் கூடுதல் டைமரைசேஷன் இடைமுகத்தை உருவாக்குகிறது. ORF7a ஐப் போலல்லாமல், ORF8 இல் ஒரு டிரான்ஸ்மெம்பிரேன் ஹெலிக்ஸ் இல்லை, எனவே இது ஒரு டிரான்ஸ்மெம்பிரேன் புரதம் அல்ல, இருப்பினும் இது ஒரு சவ்வு-நங்கூரம் வடிவத்தைக் கொண்டிருக்கலாம் என்று பரிந்துரைக்கப்படுகிறது. SARS-CoV மற்றும் SARS-CoV-2 இல் உள்ள ORF8 மிகவும் வேறுபட்டவை, 20 சதவீதத்திற்கும் குறைவான வரிசை அடையாளத்துடன். SARS-CoV இல் உள்ள முழு நீள ORF8 122 எச்சங்களின் புரதத்தை குறியாக்கம் செய்கிறது. பல SARS-CoV தனிமைப்படுத்தல்களில் இது ORF8a மற்றும் ORF8b என பிரிக்கப்பட்டுள்ளது, தனித்தனியாக 39-எச்சம் ORF8a மற்றும் 84-எச்சம் ORF8b புரதங்களை வெளிப்படுத்துகிறது. ORF8a மற்றும் ORF8b புரதங்கள் ஒரு புரதச் சேர்மத்தை உருவாக்கலாம் என்று பரிந்துரைக்கப்படுகிறது. SARS-CoV-2 புரதத்தின் டைமெரைசேஷனுக்கு காரணமான சிஸ்டைன் எச்சம் SARS-CoV வரிசையில் பாதுகாக்கப்படவில்லை. ORF8ab புரதமும் டைசல்பைடு-இணைக்கப்பட்ட மல்டிமர்களை உருவாக்கும் என்று தெரிவிக்கப்பட்டுள்ளது. மொழிபெயர்ப்புக்கு பிந்தைய மாற்றங்கள் முழு நீள SARS-CoV ORF8ab புரதம் N-கிளைகோசைலேஷன் மூலம் மொழிபெயர்ப்புக்கு பிந்தைய மாற்றத்திற்கு உட்பட்டது, இது SARS-CoV-2 புரதத்தில் பாதுகாக்கப்படும் என்று கணிக்கப்பட்டுள்ளது. சோதனை நிலைமைகளின் கீழ், 8பி மற்றும் 8ஏபி இரண்டும் எங்கும் காணப்படுகின்றன. வெளிப்பாடு மற்றும் உள்ளூர்மயமாக்கல் மற்ற துணை புரதங்களுக்கான மரபணுக்களுடன், ORF8 மரபணு கட்டமைப்பு புரதங்களை குறியாக்கம் செய்வதற்கு அருகில், கரோனாவைரஸ் ஆர்என்ஏ மரபணுவின் 5 'முனையில் அமைந்துள்ளது. ORF6, ORF7a மற்றும் ORF7b ஆகியவற்றுடன் சேர்ந்து, ORF8 சவ்வு (M) மற்றும் நியூக்ளியோகாப்ஸிட் (N) மரபணுக்களுக்கு இடையில் அமைந்துள்ளது. SARS-CoV-2 ORF8 புரதம் எண்டோபிளாஸ்மிக் ரெட்டிகுலம் (ER) க்கு கடத்துவதற்கான ஒரு சமிக்ஞை வரிசையைக் கொண்டுள்ளது மற்றும் சோதனை ரீதியாக ER க்கு உள்ளூர்மயமாக்கப்பட்டுள்ளது. இது அநேகமாக ஒரு சுரக்கும் புரதமாகும். SARS-CoV ORF8a, ORF8b அல்லது ORF8ab புரதங்களின் உள்ளூர்மயமாக்கல் குறித்து இலக்கியத்தில் மாறுபட்ட அறிக்கைகள் உள்ளன. ORF8b இயற்கையான நிலைமைகளின் கீழ் குறிப்பிடத்தக்க மட்டங்களில் வெளிப்படுத்தப்படுகிறதா என்பது தெளிவாகத் தெரியவில்லை. முழு நீள ORF8ab ER இல் உள்ளூர்மயமாக்கப்பட்டதாகத் தெரிகிறது. செயல்பாடு ORF8 புரதத்தின் செயல்பாடு தெரியவில்லை. SARS-CoV அல்லது SARS-CoV-2 இல் வைரஸ் பிரதிபலிப்புக்கு இது அவசியமில்லை, இருப்பினும் ORF8 இன் இழப்பு வைரஸ் பிரதிபலிப்பின் செயல்திறனை பாதிக்கிறதா என்பதற்கு முரண்பட்ட சான்றுகள் உள்ளன. ORF8 புரதத்திற்கு அடிக்கடி பரிந்துரைக்கப்படும் ஒரு செயல்பாடு புரவலன் நோயெதிர்ப்பு மண்டலத்துடன் தொடர்பு கொள்கிறது. SARS-CoV-2 புரதம் நோயெதிர்ப்பு தப்பிக்கும் அல்லது புரவலன் நோயெதிர்ப்பு மறுமொழிகளை அடக்குவதன் மூலம் நோயெதிர்ப்பு மாற்றத்தில் ஒரு பங்கைக் கொண்டிருப்பதாக கருதப்படுகிறது. இது ஒரு வகை I இன்டர்ஃபெரான் எதிரியாகவும், வகுப்பு I எம். எச். சி. யைக் குறைக்கவும் இருப்பதாக தெரிவிக்கப்பட்டுள்ளது. SARS-CoV-2 ORF8 புரதம் மிகவும் நோயெதிர்ப்பு சக்தி கொண்டது மற்றும் COVID-19 உள்ள அல்லது அதிலிருந்து மீட்கப்பட்ட நோயாளிகளில் புரதத்திற்கு அதிக அளவு ஆன்டிபாடிகள் கண்டறியப்பட்டுள்ளன. ORF8 ஒரு டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் இன்ஹிபிட்டர் என்று ஒரு ஆய்வு சுட்டிக்காட்டுகிறது. SARS-CoV ORF8a புரதம் மல்டிமர்களாக கூடி ஒரு வைரோபோரினை உருவாக்குகிறது என்று பரிந்துரைக்கப்படுகிறது. ORF8 இன் பரிணாம வரலாறு சிக்கலானது. இது சர்பெகோவைரஸ் மரபணுவின் மிகக் குறைந்த பாதுகாக்கப்பட்ட பகுதிகளில் ஒன்றாகும். இது அடிக்கடி பிறழ்வுகள் மற்றும் நீக்குதல்களுக்கு உட்பட்டது, மேலும் இது "ஹைபர்வேறியபிள்" மற்றும் மறுசீரமைப்பு ஹாட்ஸ்பாட் என்று விவரிக்கப்பட்டுள்ளது. இப்பகுதியில் உள்ள ஆர்என்ஏ இரண்டாம் நிலை கட்டமைப்புகள் மரபணு உறுதியற்ற தன்மையுடன் தொடர்புடையவை என்று பரிந்துரைக்கப்படுகிறது. SARS-CoV இல், ORF8 பகுதி மூதாதையர் பேட் கரோனாவைரஸ்கள் இடையே மறுசீரமைப்பின் மூலம் தோன்றியதாக கருதப்படுகிறது. SARS-CoV இல் இந்த பிராந்தியத்தின் மிகவும் தனித்துவமான அம்சங்களில் ஒன்று 29-நியூக்ளியோடைடு நீக்குதலின் தோற்றமாகும், இது முழு நீள திறந்த வாசிப்பு சட்டகத்தை இரண்டு சிறிய ORF களாக பிரிக்கிறது, ORF8a மற்றும் ORF8b. SARS தொற்றுநோயின் ஆரம்பத்தில் இருந்து வைரஸ் தனிமைப்படுத்தல்கள் ஒரு முழு நீளம், அப்படியே ORF8 ஐக் கொண்டுள்ளன, ஆனால் பிளவு அமைப்பு பின்னர் தொற்றுநோயால் வெளிப்பட்டது. இதே போன்ற பிளவு கட்டமைப்புகள் பேட் கரோனாவைரஸ்களில் காணப்படுகின்றன. SARS-CoV-2 வகைகளிலும் பிறழ்வுகள் மற்றும் நீக்குதல்கள் காணப்படுகின்றன. SARS-CoV இல் உள்ள அவதானிப்புகளின் அடிப்படையில், ORF8 இல் ஏற்படும் மாற்றங்கள் புரவலன் தழுவலுடன் தொடர்புடையதாக இருக்கலாம் என்று பரிந்துரைக்கப்படுகிறது, ஆனால் ORF8 மனித புரவலன்களில் உடற்தகுதியை பாதிக்காது. SARS-CoV இல், ORF8 இல் அதிக டிஎன்/டிஎஸ் விகிதம் காணப்படுகிறது, இது நேர்மறையான தேர்வுடன் அல்லது நிதானமான தேர்வுடன் ஒத்துப்போகிறது. ORF8 ஒரு புரதத்தை குறியாக்கம் செய்கிறது, அதன் இம்யூனோகுளோபூலின் களம் (Ig) ORF7a உடன் தொலைதூர ஒற்றுமையைக் கொண்டுள்ளது. ORF8 என்பது ORF7a இலிருந்து மரபணு நகல் மூலம் உருவாகியிருக்கலாம் என்று பரிந்துரைக்கப்படுகிறது, இருப்பினும் சில உயிர் தகவலியல் பகுப்பாய்வுகள் வைரஸ்களில் ஒப்பீட்டளவில் அசாதாரணமான நகலை ஆதரிக்க ஒற்றுமை மிகவும் குறைவாக இருக்கலாம் என்று கூறுகின்றன. இம்யூனோகுளோபூலின் களங்கள் கரோனாவைரஸ்களில் அசாதாரணமானவை; ORF8 மற்றும் ORF7a உடன் பீடாகோரோனாவைரஸ்களின் துணைக்குழுவைத் தவிர, ஒரு சிறிய எண்ணிக்கையிலான பேட் ஆல்பாக்கோரோனாவைரஸ்கள் மட்டுமே Ig களங்களைக் கொண்டுள்ளன என்று அடையாளம் காணப்பட்டுள்ளன, அதே நேரத்தில் அவை கம்மாகோரோனாவைரஸ்கள் மற்றும் டெல்டாகோரோனாவைரஸ்களிலிருந்து இல்லை. MERS-CoV இல் ORF8 குறிப்பிடத்தக்க வகையில் இல்லை. பீட்டா மற்றும் ஆல்பா ஐஜி களங்கள் சுயாதீனமான கையகப்படுத்தல்களாக இருக்கலாம், அங்கு ஓஆர்எஃப்8 மற்றும் ஓஆர்எஃப்7ஏ ஆகியவை புரவலன் புரதங்களிலிருந்து பெறப்பட்டிருக்கலாம். ORF8 இல்லாதது அந்த வம்சாவளிகளில் மரபணு இழப்பை பிரதிபலிக்கும் வாய்ப்பும் உள்ளது. குறிப்புகள் கரோனாவைரஸ் புரதங்கள்