Lumi (software)
லுமி என்பது இலுமினா வெளிப்பாடு மற்றும் மெத்திலேஷன் மைக்ரோஅரே தரவுகளின் பகுப்பாய்வு மற்றும் புரிதலுக்கான ஒரு இலவச, திறந்த மூல மற்றும் திறந்த மேம்பாட்டு மென்பொருள் திட்டமாகும். இந்த திட்டம் 2006 கோடையில் தொடங்கப்பட்டது மற்றும் பயோ கண்டக்டரின் கட்டமைப்பில் இல்லுமினாவின் வழிமுறைகள் மற்றும் தரவு மேலாண்மை கருவிகளை வழங்குவதற்காக அமைக்கப்பட்டது. இது புள்ளிவிவர ஆர் நிரலாக்க மொழியை அடிப்படையாகக் கொண்டது. அம்சங்கள் லுமி தொகுப்பு ஆய்வு-நிலை இல்லுமினா வெளிப்பாடு மற்றும் மெத்திலேஷன் மைக்ரோஅரே தரவுகளுக்கான பகுப்பாய்வு குழாயை வழங்குகிறது, இதில் ஆய்வு-அடையாளங்காட்டி மேலாண்மை (என். யூ. ஐ. டி), புதுப்பிக்கப்பட்ட ஆய்வு-முதல்-மரபணு வரைபடம் மற்றும் ரெஃப்செக் (என். யூ. ஐ. டி பிளாஸ்ட்) இன் சமீபத்திய வெளியீட்டைப் பயன்படுத்தி சிறுகுறிப்பு, ஆய்வு-தீவிர மாற்றம் (விஎஸ்டி) மற்றும் இயல்பாக்கம் (ஆர்எஸ்என்), தரக் கட்டுப்பாடு (க்யூஏ/க்யூசி) மற்றும் இல்லுமினா மெத்திலேஷன் தரவுகளுக்கான குறிப்பிட்ட முன் செயலாக்க முறைகள் ஆகியவை அடங்கும். இலுமினா-குறிப்பிட்ட அம்சங்களுடன் எக்ஸ்பிரசெட் பொருளை விரிவுபடுத்துவதன் மூலம், வேறுபட்ட மரபணுக்களைக் கண்டறிந்து மரபணு ஆன்டாலஜி பகுப்பாய்வு செய்ய லிம்மா மற்றும் கோஸ்டாட்ஸ் போன்ற பிற பயோ கண்டக்டர் தொகுப்புகளுடன் வேலை செய்ய லுமி வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளது. லூமி திட்டம் 2006 கோடையில் வடமேற்கு பல்கலைக்கழகத்தின் ராபர்ட் எச். லூரி விரிவான புற்றுநோய் மையத்தின் உயிர் தகவலியல் மையத்தில் தொடங்கப்பட்டது. இலுமினா எக்ஸ்பிரஷன் பீட் அரே தரவுகளின் பகுப்பாய்விற்காக முதலில் லுமி வடிவமைக்கப்பட்டது. 2010 முதல் (பதிப்பு> 2), இலுமினா மெத்திலேஷன் மைக்ரோஅரே தரவை பகுப்பாய்வு செய்வதற்கான செயல்பாடுகள் சேர்க்கப்பட்டன. திட்டக் குழுவில் டாக்டர். பான் டூ, சைமன் எம். லின் மற்றும் வாரன் ஏ. கிப்பே. புற்றுநோய்களில் ரெட்டினோயிக் அமிலங்களின் விளைவு குறித்த ஆய்வில் தனது ஆய்வகத்தில் பெறப்பட்ட புதிய இல்லுமினா மைக்ரோஅரே தரவுகளின் தொகுப்பை பகுப்பாய்வு செய்ய டாக்டர் செர்டார் ஈ. புலனின் ஒத்துழைப்புக்கான கோரிக்கையின் பேரில் இந்த திட்டம் தொடங்கப்பட்டது. திட்டத்தின் மென்பொருள் மேம்பாட்டுக்கு டாக்டர் பான் டு தலைமை தாங்கினார். தரவு மாற்றம் மற்றும் இயல்பாக்குதல் செயல்முறைகளுக்கு பீட் அரேக்களின் பணிநீக்கத்தின் தனித்துவமான வடிவமைப்பைப் பயன்படுத்திய முதல் மென்பொருள் தொகுப்பு லுமி ஆகும். லுமியின் முதல் வெளியீடு ஜனவரி 3,2007 அன்று பயோ கண்டக்டர் வலைத்தளம் மூலம் வெளியிடப்பட்டது. அதன் முறையான வெளியீட்டிற்கு முன்பு, இது நோர்வே ரேடியம் மருத்துவமனை, லைடன் பல்கலைக்கழக மருத்துவ மையம், யுனிவர்சிட்டி வான் ஆம்ஸ்டர்டாம், யுனிவர்சிட்டா டிக்லி ஸ்டடி டி ப்ரெசியா, யுசி டேவிஸ், வெய்ன் ஸ்டேட் பல்கலைக்கழகம், என்ஐஎச், எம். டி. ஆண்டர்சன் புற்றுநோய் மையம், கேஸ் வெஸ்டர்ன் ரிசர்வ் பல்கலைக்கழகம், ஹார்வர்ட் பல்கலைக்கழகம், வாஷிங்டன் பல்கலைக்கழகம் மற்றும் வால்டர் மற்றும் எலிசா ஹால் மருத்துவ ஆராய்ச்சி நிறுவனம். மூலக்கூறு உயிரியலில் ஈரமான ஆய்வகத் தரவுகளின் புள்ளிவிவர பகுப்பாய்வுக்கான ஒருங்கிணைந்த மென்பொருளான பயோ கண்டக்டர், இல்லுமினா இன்க் மற்றும் அதன் பீட் அரே தொழில்நுட்பம் ஆகியவற்றைப் பார்க்கவும் வெளிப்புற இணைப்புகள் லுமி மென்பொருள் வெளியீட்டு வலைத்தளம் பழைய லுமி வலைத்தளம் அதிகாரப்பூர்வ பயோ கண்டக்டர் வலைத்தளம் இலவச அறிவியல் மென்பொருள் இலவச ஆர் (நிரலாக்க மொழி) மென்பொருள் மைக்ரோரேஸ்