Transcription factor II B
டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணி II B (TFIIB) என்பது ஒரு பொதுவான டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணியாகும், இது ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் II முன்முயற்சி வளாகத்தை (பிஐசி) உருவாக்குவதில் ஈடுபட்டுள்ளது மற்றும் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் துவக்கத்தை தூண்டுவதில் உதவுகிறது. டிஎன்ஏ-டிபிபி (டாடா-பைண்டிங் புரதம்) வளாகத்தை பிணைத்து உறுதிப்படுத்துவதன் மூலமும், ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் II மற்றும் பிற டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணிகளை ஆட்சேர்ப்பு செய்வதன் மூலமும் பிஐசி உருவாக்கத்திற்கு ஒரு தளத்தை டிஎஃப்ஐஐபி வழங்குகிறது. இது மரபணுவால் குறியிடப்பட்டுள்ளது, மேலும் இது ஆர்க்கியல் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணி B க்கு ஒத்ததாகவும், பாக்டீரியா சிக்மா காரணிகளுக்கு ஒத்ததாகவும் உள்ளது. அமைப்பு TFIIB என்பது 316 அமினோ அமிலங்களைக் கொண்ட ஒற்றை 33kDa பாலிபெப்டைடு ஆகும். டி. எஃப். ஐ. ஐ. பி நான்கு செயல்பாட்டு பகுதிகளைக் கொண்டுள்ளதுஃ சி-முனைய மைய களம்; பி லிங்கர்; பி ரீடர் மற்றும் அமினோ முனைய துத்தநாக ரிப்பன். டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணி IID இன் TATA-பிணைப்பு புரதத்தின் (TBP) துணை அலகு மற்றும் RNA பாலிமரேஸ் II இன் RPB1 துணை அலகு ஆகியவற்றுடன் TFIIB புரத-புரத தொடர்புகளை உருவாக்குகிறது. டிஎஃப்ஐஐபி பி அங்கீகார உறுப்பு (பிஆர்இ) உடன் வரிசை-குறிப்பிட்ட புரத-டிஎன்ஏ தொடர்புகளை உருவாக்குகிறது, இது டாடா உறுப்பைச் சுற்றியுள்ள ஒரு விளம்பர உறுப்பு. செயல்பாட்டின் வழிமுறை பிஐசி உருவாக்கம் மற்றும் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் துவக்கத்தில் டிஎஃப்ஐஐபி செயல்பாட்டின் பொறிமுறையில் ஆறு படிகள் உள்ளனஃ ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் II டிஎஃப்ஐஐபி பி கோர் மற்றும் பி ரிப்பன் மூலம் டிஎன்ஏவுக்கு நியமிக்கப்படுகிறது. ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் II டிஎன்ஏவை அவிழ்த்து விடுகிறது, இது டிஎஃப்ஐஐபி பி லிங்கர் மற்றும் பி ரீடர் (திறந்த சிக்கலான உருவாக்கம்) உதவியுடன் உதவுகிறது. ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் II ஒரு டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் தொடக்க தளத்தைத் தேர்ந்தெடுக்கிறது, இது டிஎஃப்ஐஐபி பி ரீடரின் உதவியுடன் உள்ளது. ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் II முதல் பாஸ்போடிஸ்டர் பிணைப்பை உருவாக்குகிறது. ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் II புதிய ஆர்என்ஏ மற்றும் டிஎஃப்ஐஐபி பி ரீடர் வளையத்திற்கு இடையிலான மோதல்கள் காரணமாக குறுகிய கருக்கலைப்பு டிரான்ஸ்கிரிப்ட்களை உருவாக்குகிறது. புதிய ஆர்என்ஏவை 12-13 நியூக்ளியோடைடுகளுக்கு விரிவுபடுத்துவது டிஎஃப்ஐஐபியுடன் மேலும் மோதல்கள் காரணமாக டிஎஃப்ஐஐபி வெளியேற்றத்திற்கு வழிவகுக்கிறது. ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் II உடனான தொடர்புகள் டிஎஃப்ஐஐபியின் செயல்பாட்டு பகுதிகள் ஒவ்வொன்றும் ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் II இன் வெவ்வேறு பகுதிகளுடன் தொடர்பு கொள்கின்றன. அமினோ முனையம் பி ரிப்பன் ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் II இன் கப்பல்துறை களத்தில் அமைந்துள்ளது மற்றும் செயலில் உள்ள தளத்தை நோக்கி பிளவு வரை நீண்டுள்ளது. பி ரிப்பனை விரிவுபடுத்துவது பி ரீடர் ஆகும், இது ஆர்என்ஏ வெளியேறும் சுரங்கப்பாதை வழியாக டிஎன்ஏ-ஆர்என்ஏ கலப்பினத்தின் பிணைப்பு தளத்திற்கும் செயலில் உள்ள தளத்திற்கும் நீண்டுள்ளது. பி லிங்கர் என்பது ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் II இன் பிளவுகளில் காணப்படும் பி ரீடர் மற்றும் பி கோர் இடையே உள்ள பகுதியாகும், மேலும் இது சுவரில் மேலே காணப்படும் சி முனையம் பி மையத்தை அடையும் வரை சுவரொட்டி மற்றும் கிளாம்ப் சுருள்-சுருள் மூலம் தொடர்கிறது. பி ரீடர் மற்றும் பி லிங்கர் மிகவும் பாதுகாக்கப்பட்ட எச்சங்களைக் கொண்டுள்ளன, அவை ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் II சுரங்கப்பாதை வழியாக செயலில் உள்ள தளத்தை நோக்கி நிலைநிறுத்தப்பட்டு இறுக்கமான பிணைப்பை உறுதி செய்கின்றன, இந்த முக்கிய எச்சங்கள் இல்லாமல் விலகல் ஏற்படும். இந்த இரண்டு களங்களும் ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் II இன் சில நெகிழ்வான பகுதிகளின் நிலையை டிஎன்ஏவின் துல்லியமான நிலைப்பாட்டை அனுமதிக்கவும், புதிய என். டி. பி. க்களை புதிய ஆர்என்ஏ சங்கிலியில் சேர்க்கவும் அனுமதிக்கும் என்று கருதப்படுகிறது. ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் II ஐ பிணைக்கும்போது, பி ரீடர் மற்றும் பி லிங்கர் ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் II இன் முன்முனைவு களத்தை சிறிது மாற்றியமைக்கின்றன, இது ஒரு அத்தியாவசிய இரண்டாவது மெக்னீசியம் அயனியை செயலில் உள்ள தளத்தில் பிணைக்க அனுமதிக்கிறது. இது ஒரு பீட்டா தாள் மற்றும் ஒரு வரிசைப்படுத்தப்பட்ட வளையத்தை உருவாக்குகிறது, இது டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் தொடங்கப்படும்போது கட்டமைப்பின் ஸ்திரத்தன்மைக்கு உதவுகிறது. திறந்த மற்றும் மூடிய வளாகங்கள் திறந்த மற்றும் மூடிய இணைவுகள் டிஎன்ஏவின் நிலை மற்றும் பிஐசி-க்குள் உள்ள வார்ப்புரு அல்லாத இழையிலிருந்து வார்ப்புரு இழைகள் பிரிக்கப்பட்டுள்ளதா என்பதைக் குறிக்கின்றன. குமிழியை உருவாக்க டிஎன்ஏ திறக்கும் இடம் பி-கோர், பி-லிங்கர் மற்றும் பி-ரீடர் மற்றும் ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் II இன் சில பகுதிகளால் வரிசையாக அமைக்கப்பட்ட ஒரு சுரங்கப்பாதைக்கு மேலே உள்ளது. பி லிங்கர் டிஎன்ஏ திறக்கும் புள்ளியுடன் நேரடியாக சீரமைக்கப்பட்டுள்ளது மற்றும் திறந்த வளாகத்தில் இது இரண்டு டிஎன்ஏ இழைகளுக்கு இடையில் காணப்படுகிறது, இது ஊக்குவிப்பு உருகுவதில் ஒரு பங்கைக் கொண்டுள்ளது என்பதைக் குறிக்கிறது, ஆனால் வினையூக்கி ஆர்என்ஏ தொகுப்பில் இது ஒரு பங்கைக் கொண்டிருக்கவில்லை. டிஎஃப்ஐஐபி இரண்டு இணக்கங்களிலும் ஒரே மாதிரியான கட்டமைப்பை வைத்திருந்தாலும், கோர் மற்றும் பி ரீடருக்கு இடையிலான சில மூலக்கூறுகளுக்கிடையேயான தொடர்புகள் டிஎன்ஏ திறப்பில் பாதிக்கப்படுகின்றன. டிஎன்ஏ உருகிய பிறகு டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் துவக்குபவர் (இன்ஆர்) டிஎன்ஏவில் அமைந்திருக்க வேண்டும், எனவே டிஎஸ்எஸ் ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் II ஆல் அடையாளம் காணப்பட்டு டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் தொடங்கலாம். டிஎன்ஏவை 'டெம்ப்ளேட் சுரங்கப்பாதை' வழியாக அனுப்புவதன் மூலம் இது செய்யப்படுகிறது, மேலும் டிஎன்ஏ ஸ்கேன் செய்யப்பட்டு, இனரைத் தேடி, ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் செயலில் உள்ள தளத்தால் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் தொடக்க தளம் சரியான இடத்தில் அமைந்துள்ளது என்பதை உறுதி செய்யும் நிலையில் வைக்கப்படுகிறது. TFIIB இன் B ரீடர் டெம்ப்ளேட் சுரங்கப்பாதையில் காணப்படுகிறது மற்றும் Inr ஐக் கண்டுபிடிப்பதில் முக்கியமானது, B ரீடரில் உள்ள பிறழ்வுகள் TSS ஐ மாற்றுகின்றன, எனவே தவறான டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் நிகழ்கிறது (PIC உருவாக்கம் மற்றும் DNA உருகுதல் இன்னும் நடைபெறுகிறது என்றாலும்). ஈஸ்ட் இன்ர் மையக்கருத்து 28 வது இடத்தில் கண்டிப்பாக பாதுகாக்கப்பட்ட ஒரு எச்சத்தைக் கொண்டிருப்பதால் ஈஸ்ட் இந்த சீரமைப்புக்கு ஒரு சிறந்த எடுத்துக்காட்டு மற்றும் திறந்த சிக்கலான மாதிரியில் ஒரு நிரப்பு டி எச்சத்தை பி ரீடர் ஹெலிக்ஸில் காணலாம். இந்த டி எச்சம் மாற்றப்படும்போது, பி ரீடரின் பங்கை வலியுறுத்தும் வகையில் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் கணிசமாக குறைவான செயல்திறன் கொண்டது. பி ரீடர் வளையம் செயலில் உள்ள இடத்தில் என். டி. பி. க்களை உறுதிப்படுத்துவதாகவும், அதன் நெகிழ்வுத்தன்மை காரணமாக, ஆர்என்ஏ மூலக்கூறின் ஆரம்ப தொகுப்பின் போது நியூக்ளிக் அமிலங்கள் தொடர்பில் இருக்க அனுமதிக்கிறது (அதாவது. வளர்ந்து வரும் ஆர்என்ஏ-டிஎன்ஏ கலப்பினத்தை உறுதிப்படுத்துகிறது) வெளியீடு ஆர்என்ஏ டிரான்ஸ்கிரிப்ட் 7 நியூக்ளியோடைடுகளை நீளமாக அடையும் போது, டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் நீளமான கட்டத்திற்குள் நுழைகிறது, இதன் தொடக்கம் டிஎன்ஏ குமிழி உடைந்து டிஎஃப்ஐஐபி வெளியேற்றப்படுவதன் மூலம் வகைப்படுத்தப்படுகிறது. 6 தளங்கள் நீளமாக இருக்கும்போது புதிய ஆர்என்ஏ பி லிங்கர் ஹெலிக்ஸுடன் மோதுகிறது, மேலும் 12-13 தளங்களுக்கு மேலும் நீட்டிக்கப்பட்டால் அது பி-ரீடர் மற்றும் பி-ரிப்பனுடன் மோதும், இது பிரிவினைக்கு வழிவகுக்கும் என்று கருதப்படுகிறது. டிஎன்ஏ டுப்லெக்ஸ் சுவரொட்டிக்கு மேலே உள்ள பி இணைப்பாளருடன் மோதுகிறது (டிஎன்ஏவை இரட்டை ஹெலிக்ஸாக மாற்றியமைப்பதன் மூலம் ஏற்படுகிறது). பாஸ்பரிலேஷன் டி. எஃப். ஐ. ஐ. பி செரின் 65 இல் பாஸ்பரிலேட்டட் செய்யப்படுகிறது, இது பி ரீடர் களத்தில் காணப்படுகிறது. இந்த பாஸ்போரிலேஷன் இல்லாமல், டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் துவக்கம் ஏற்படாது. இதை ஆதரிக்க கூடுதல் சான்றுகள் தேவைப்பட்டாலும், பொது டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணி டி. எஃப். ஐ. ஐ. எச் இந்த பாஸ்போரிலேஷனுக்கு கைனேஸாக செயல்பட முடியும் என்று பரிந்துரைக்கப்படுகிறது. டிஎஃப்ஐஐபி டிஎன்ஏவின் நீளத்தின் போது ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் II வளாகத்துடன் பயணிக்கவில்லை என்றாலும், மரபணு சுழற்சியில் இது ஒரு பங்கைக் கொண்டுள்ளது என்று சமீபத்தில் பரிந்துரைக்கப்படுகிறது, இது ஊக்குவிப்பாளரை மரபணுவின் முனையத்துடன் இணைக்கிறது. இருப்பினும், சமீபத்திய ஆராய்ச்சி டி. எஃப். ஐ. ஐ. பி குறைப்பு செல்களுக்கு ஆபத்தானது அல்ல என்றும் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் அளவுகள் கணிசமாக பாதிக்கப்படவில்லை என்றும் காட்டுகிறது. ஏனென்றால், 90 சதவீதத்திற்கும் அதிகமான பாலூட்டி ஊக்குவிப்பாளர்களில் டி. எஃப். ஐ. ஐ. பி பிணைக்க தேவையான பி. ஆர். இ (பி அங்கீகார உறுப்பு) அல்லது டாடா பெட்டி வரிசை இல்லை. இது தவிர, டி. எஃப். ஐ. ஐ. பி அளவுகள் பல்வேறு வகையான உயிரணுக்களிலும், உயிரணு சுழற்சியின் வெவ்வேறு புள்ளிகளிலும் ஏற்ற இறக்கமாக இருப்பதைக் காட்டுகின்றன, இது அனைத்து ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் II டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனுக்கும் தேவையில்லை என்பதற்கான ஆதாரங்களை ஆதரிக்கிறது. மரபணு சுழற்சி ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் II இன் சி முனைய களத்தில் காணப்படும் பாஸ்போரிலேட்டட் செரின் எச்சங்கள் மற்றும் பாலிடெனைலேஷன் காரணிகளுக்கு இடையிலான தொடர்புகளை நம்பியுள்ளது. எஸ்எஸ்யூ72 மற்றும் சிஎஸ்டிஎஃப்-64 போன்ற இந்த பாலியாடினைலேஷன் காரணிகளுடன் விளம்பரதாரர்களின் தொடர்புக்கு டிஎஃப்ஐஐபி தேவைப்படுகிறது. மரபணு வளைய உருவாக்கம் மற்றும் டிஎன்ஏ குமிழி சரிவு ஆகிய இரண்டும் டிஎஃப்ஐஐபி பாஸ்பரிலேஷனின் விளைவாகும் என்றும் பரிந்துரைக்கப்படுகிறது; இருப்பினும், இந்த மரபணு வளைய உருவாக்கம் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் துவக்கத்திற்கு ஒரு காரணமா அல்லது விளைவா என்பது தெளிவாகத் தெரியவில்லை. பிற டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் வளாகங்களில் உள்ள ஒற்றுமைகள் ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் III டிஎஃப்ஐஐபிக்கு மிகவும் ஒத்த காரணியைப் பயன்படுத்துகிறது, இது பிஆர்எஃப் (டிஎஃப்ஐஐபி-தொடர்பான காரணி) என்று அழைக்கப்படுகிறது, இதில் பாதுகாக்கப்பட்ட துத்தநாக ரிப்பன் மற்றும் சி முனைய மையமும் உள்ளது. இருப்பினும், பி ரீடர் மற்றும் பி லிங்கர் காணப்படும் அதே நிலைகளில் பிஆர்எஃப் இன்னும் மிகவும் பாதுகாக்கப்பட்ட வரிசைகளைக் கொண்டிருந்தாலும், கட்டமைப்பு மிகவும் நெகிழ்வான லிங்கர் பகுதியில் வேறுபடுகிறது. இந்த பாதுகாக்கப்பட்ட பகுதிகள் அநேகமாக TFIIB இல் உள்ள களங்களைப் போன்ற செயல்பாடுகளைச் செய்கின்றன. ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் I TFIIB ஐப் போன்ற ஒரு காரணியைப் பயன்படுத்துவதில்லை; இருப்பினும், மற்றொரு அறியப்படாத காரணி அதே செயல்பாட்டை நிறைவேற்றுகிறது என்று கருதப்படுகிறது. பாக்டீரியா அமைப்புகளில் டி. எஃப். ஐ. ஐ. பி-க்கு நேரடி ஒத்த கருத்து இல்லை, ஆனால் பாக்டீரியா பாலிமரேஸை இதேபோன்ற முறையில் எந்த வரிசை ஒற்றுமையும் இல்லாமல் பிணைக்கும் புரதங்கள் உள்ளன. குறிப்பாக பாக்டீரியா புரதமான σ70 பாலிமரேஸை பி-லிங்கர், பி-ரிப்பன் மற்றும் பி-கோர் போன்ற புள்ளிகளில் பிணைக்கும் களங்களைக் கொண்டுள்ளது. இது குறிப்பாக σ3 பகுதி மற்றும் பகுதி 4 இணைப்பியில் தெளிவாகத் தெரிகிறது, இது பாலிமரேஸ் செயலில் உள்ள தளத்தில் டி. என். ஏவை உறுதிப்படுத்தக்கூடும். மருத்துவ முக்கியத்துவம் வைரஸ் தடுப்பு செயல்பாடு சமீபத்திய ஆய்வுகள் குறைக்கப்பட்ட டி. எஃப். ஐ. ஐ. பி அளவுகள் உயிரணுக்களுக்குள் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் அளவை பாதிக்காது என்பதைக் காட்டுகின்றன, இது ஓரளவு கருதப்படுகிறது, ஏனெனில் 90 சதவீதத்திற்கும் அதிகமான பாலூட்டி ஊக்குவிப்பாளர்களில் பி. ஆர். இ அல்லது டாடா பெட்டி இல்லை. இருப்பினும், ஹெர்பெஸ் சிம்ப்ளக்ஸ் வைரஸின் இன் விட்ரோ டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் மற்றும் ஒழுங்குமுறைக்கு டி. எஃப். ஐ. ஐ. பி முக்கியமானது என்று நிரூபிக்கப்பட்டுள்ளது. டி. எஃப். ஐ. ஐ. பி-க்கும் சைக்ளின் ஏ-க்கும் உள்ள ஒற்றுமையே இதற்குக் காரணம் என்று கருதப்படுகிறது. பிரதிபலிப்புக்கு உட்படும் பொருட்டு, வைரஸ்கள் பெரும்பாலும் சைக்ளின்கள் மற்றும் பிற புரதங்களைப் பயன்படுத்தி செல் சுழற்சியின் மூலம் புரவலன் உயிரணுக்களின் முன்னேற்றத்தைத் தடுக்கின்றன. டி. எஃப். ஐ. ஐ. பி சைக்ளின் ஏ போன்ற கட்டமைப்பைக் கொண்டிருப்பதால், டி. எஃப். ஐ. ஐ. பியின் குறைந்த அளவுகள் வைரஸ் தடுப்பு விளைவுகளை ஏற்படுத்தக்கூடும் என்று பரிந்துரைக்கப்படுகிறது. நரம்பியக்கடத்தல் ஆய்வுகள் டி. பி. பி. யுடன் டி. எஃப். ஐ. ஐ. பி பிணைப்பு டி. பி. பி. யில் உள்ள பாலிக்ளூடமைன் பாதையின் நீளத்தால் பாதிக்கப்படுகிறது என்பதைக் காட்டுகின்றன. நரம்பியக்கடத்தல் நோய்களில் காணப்படும் போன்ற நீட்டிக்கப்பட்ட பாலிக்ளூடமைன் பாதைகள் டி. எஃப். ஐ. ஐ. பியுடன் அதிக தொடர்புகளை ஏற்படுத்துகின்றன. இது இந்த நோய்களில் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனை பாதிக்கும் என்று கருதப்படுகிறது, ஏனெனில் இது மூளையில் உள்ள பிற ஊக்குவிப்பாளர்களுக்கு டி. எஃப். ஐ. ஐ. பி கிடைப்பதை குறைக்கிறது, ஏனெனில் டி. எஃப். ஐ. ஐ. பி அதற்கு பதிலாக விரிவாக்கப்பட்ட பாலிக்ளூட்டமைன் பாதைகளுடன் தொடர்பு கொள்கிறது. குறிப்புகள் வெளிப்புற இணைப்புகள் மூலக்கூறு மரபியல் புரதங்கள் மரபணு வெளிப்பாடு படியெடுத்தல் காரணிகள்