H3T45P
H3T45P என்பது டிஎன்ஏ பேக்கேஜிங் புரதமான ஹிஸ்டோன் H3 க்கு ஒரு எபிஜெனெடிக் மாற்றமாகும். இது ஹிஸ்டோன் எச்3 புரதத்தின் 45வது த்ரியோனின் எச்சமான பாஸ்பரிலேஷனைக் குறிக்கும் ஒரு அடையாளமாகும். அப்போப்டொசிஸின் போது, டிஎன்ஏ நிக்கிங் மற்றும்/அல்லது துண்டு துண்டுகளை செயல்படுத்தும் நியூக்ளியோசோமின் உள்ளே உள்ள கட்டமைப்பு மாற்றங்களுக்கு எச்3டி45 பாஸ்பரிலேஷன் தேவைப்படுகிறது. H3T45 எச்சம் ஒரு நியூக்ளியோசோம் கேட் கீப்பராகத் தோன்றுகிறது, இது டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் இலக்கு தளங்களில் டிஎன்ஏ அணுகலை ஒழுங்குபடுத்துகிறது. இது உயிரணு பெருக்கத்துடன் வரும் தேவையான உயிரணு விரிவாக்கத்தை செயல்படுத்த மரபணு வெளிப்பாட்டை ஒருங்கிணைக்கும் ஒரு புதிய ஒழுங்குமுறை வலையமைப்பாக இருக்கலாம். இது புற்றுநோய் சிகிச்சைகள் மற்றும் ஒரு பயோமார்க்கராக குறிப்பாக ஒரு தனித்துவமான இலக்காக இருக்கலாம். நியூக்ளியோசோம் டிஎன்ஏ நுழைவு-வெளியேறும் பகுதியின் பாஸ்பரிலேஷன் டிஎன்ஏ பிணைப்பு வளாகங்களுக்கான அணுகலை மேம்படுத்துகிறது, மேலும் பாஸ்பரிலேஷன் மற்றும் அசிட்டிலேஷன் ஆகியவற்றின் கலவையானது டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் ஒழுங்குமுறை வளாகங்களுக்கான டிஎன்ஏ அணுகலை வியத்தகு முறையில் மாற்றும் திறனைக் கொண்டுள்ளது. பெயரிடல் இந்த மாற்றத்தின் பெயர் ஹிஸ்டோன் எச்3 புரத துணைக்குழுவில் த்ரோயோனின் 45 இன் புரத பாஸ்பரிலேஷனைக் குறிக்கிறதுஃ செரின்/த்ரோயோனின்/டைரோசின் பாஸ்பரிலேஷன் எதிர்மறையாக சார்ஜ் செய்யப்பட்ட பாஸ்பேட் குழுவைச் சேர்ப்பது புரத கட்டமைப்பில் பெரிய மாற்றங்களுக்கு வழிவகுக்கும், இது புரத செயல்பாட்டைக் கட்டுப்படுத்துவதில் பாஸ்பரிலேஷனின் நன்கு வகைப்படுத்தப்பட்ட பங்கிற்கு வழிவகுக்கும். ஹிஸ்டோன் பாஸ்பரிலேஷன் என்ன கட்டமைப்பு தாக்கங்களைக் கொண்டுள்ளது என்பது தெளிவாகத் தெரியவில்லை, ஆனால் ஹிஸ்டோன் பாஸ்பரிலேஷன் ஒரு பிந்தைய மொழிபெயர்ப்பு மாற்றமாக தெளிவான செயல்பாடுகளைக் கொண்டுள்ளது. மாற்றத்தின் மருத்துவ விளைவு இன் விட்ரோ மற்றும் விவோவில், H3T45ph க்கு காரணமான கைனேஸ் புரதம் கைனேஸ் சி-டெல்டா ஆகும். H3T45ph அதன் நியூக்ளியோசோமல் இருப்பிடத்தின் காரணமாக டிஎன்ஏ நிக்கிங் மற்றும்/அல்லது துண்டு துண்டுகளை ஊக்குவிக்க நியூக்ளியோசோமின் உள்ளே கட்டமைப்பு மாற்றங்களை ஏற்படுத்துகிறது. H3T45 ஒரு ஹிஸ்டோன் கைனேஸ் காம்ப்ளக்ஸ் மூலம் பாஸ்பரிலேட்டட் செய்யப்படுகிறது, இதில் பாதுகாக்கப்பட்ட S-கட்ட ரெப்ளிகேஷன் ஸ்டார்ட் என்சைம் Cdc7, அதன் செயல்படுத்தும் புரதம் Dbf4 மற்றும் பல கூறுகள் அடங்கும். H3T45 எச்சம் ஒரு நியூக்ளியோசோம் கேட் கீப்பராகத் தோன்றுகிறது, இது டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் இலக்கு தளங்களில் டிஎன்ஏ அணுகலை ஒழுங்குபடுத்துகிறது. இது உயிரணு பெருக்கத்துடன் வரும் தேவையான உயிரணு விரிவாக்கத்தை செயல்படுத்த மரபணு வெளிப்பாட்டை ஒருங்கிணைக்கும் ஒரு புதிய ஒழுங்குமுறை வலையமைப்பாக இருக்கலாம். H3T45 பாஸ்பரிலேஷன் H3K56 அசிட்டிலேஷனை ஊக்குவிக்கிறது. நியூக்ளியோசோம் டிஎன்ஏ நுழைவு-வெளியேறும் பகுதியின் பாஸ்பரிலேஷன் டிஎன்ஏ பிணைப்பு வளாகங்களுக்கான அணுகலை மேம்படுத்துகிறது, மேலும் பாஸ்பரிலேஷன் மற்றும் அசிட்டிலேஷன் ஆகியவற்றின் கலவையானது டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் ஒழுங்குமுறை வளாகங்களுக்கான டிஎன்ஏ அணுகலை வியத்தகு முறையில் மாற்றும் திறனைக் கொண்டுள்ளது. யூகாரியோடிக் உயிரணுக்களின் மரபணு டிஎன்ஏ ஹிஸ்டோன்கள் எனப்படும் சிறப்பு புரத மூலக்கூறுகளைச் சுற்றி மூடப்பட்டுள்ளது. டிஎன்ஏவின் சுழற்சியால் உருவாகும் வளாகங்கள் குரோமாட்டின் என்று அழைக்கப்படுகின்றன. ஹிஸ்டோன் பாஸ்போரிலேஷன் போன்ற ஹிஸ்டோன்களின் மொழிபெயர்ப்புக்குப் பிந்தைய மாற்றம் புரதத்தை மாற்றுவதன் மூலம் குரோமாட்டின் கட்டமைப்பை மாற்றியமைப்பதாகக் காட்டப்பட்டுள்ளதுஃ டிஎன்ஏ அல்லது புரதம்ஃ புரத தொடர்புகள். ஹிஸ்டோன் மொழிபெயர்ப்புக்குப் பிந்தைய மாற்றங்கள் குரோமாட்டின் கட்டமைப்பை மாற்றியமைக்கின்றன. மிகவும் பொதுவாக தொடர்புடைய ஹிஸ்டோன் பாஸ்போரிலேஷன் டிஎன்ஏ சேதத்திற்கு செல்லுலார் பதில்களின் போது நிகழ்கிறது, பாஸ்போரிலேட்டட் ஹிஸ்டோன் எச் 2 ஏ டிஎன்ஏ உடைப்பு தளத்தைச் சுற்றியுள்ள பெரிய குரோமாட்டின் களங்களைப் பிரிக்கும் போது. ஹிஸ்டோன்களின் மாற்றங்கள் ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் II இயக்கிய டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனை நேரடியாக பாதிக்கிறதா என்று ஆராய்ச்சியாளர்கள் ஆராய்ந்தனர். டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனில் அவற்றின் விளைவுகளை சோதிக்க ஹிஸ்டோன்களை மாற்றியமைக்க அறியப்பட்ட புரதங்களை ஆராய்ச்சியாளர்கள் தேர்வு செய்கிறார்கள், மேலும் மன அழுத்தத்தால் தூண்டப்பட்ட கைனேஸ், எம்எஸ்கே 1, ஆர்என்ஏ தொகுப்பைத் தடுக்கிறது என்பதைக் கண்டறிந்தனர். குரோமாடினில் இல்லாத டிஎன்ஏ வார்ப்புருக்கள் எம்எஸ்கே1 இன் விளைவுகளை எதிர்ப்பதால், வார்ப்புரு குரோமாடினில் இருக்கும்போது எம்எஸ்கே1 மூலம் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனைத் தடுப்பது மிகவும் உணர்திறன் கொண்டது. செரின் 1 இல் எம்எஸ்கே1 பாஸ்பரிலேட்டட் ஹிஸ்டோன் எச்2ஏ மற்றும் செரின் 1-ஐ அலனைனாக மாற்றுவது எம்எஸ்கே1 மூலம் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனைத் தடுப்பதைத் தடுத்தது என்று காட்டப்பட்டது. எனவே ஹிஸ்டோன்களின் அசிட்டிலேஷன் எம்எஸ்கே 1 என ஒரு கைனேஸ் மூலம் ஒரு தடுப்பு பாஸ்பரிலேஷனை அடக்குவதன் மூலம் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனைத் தூண்டும் என்று முடிவுகள் பரிந்துரைத்தன. மாற்றியமைப்பின் பொறிமுறையும் செயல்பாடும் பாஸ்பரிலேஷன் அமினோ அமிலங்களின் பக்கச் சங்கிலியில் ஒரு சார்ஜ் செய்யப்பட்ட மற்றும் ஹைட்ரோஃபிலிக் குழுவை அறிமுகப்படுத்துகிறது, இது அருகிலுள்ள அமினோ அமிலங்களுடனான தொடர்புகளை மாற்றுவதன் மூலம் ஒரு புரதத்தின் கட்டமைப்பை மாற்றக்கூடும். p53 போன்ற சில புரதங்கள் பல பாஸ்பரிலேஷன் தளங்களைக் கொண்டுள்ளன, இது சிக்கலான, பல நிலை ஒழுங்குமுறையை எளிதாக்குகிறது. புரதங்களை எளிதில் பாஸ்போரிலேட்டட் மற்றும் டீபாஸ்போரிலேட்டட் செய்ய முடியும் என்பதால், இந்த வகை மாற்றம் செல்கள் வெளிப்புற சமிக்ஞைகள் மற்றும் சுற்றுச்சூழல் நிலைமைகளுக்கு பதிலளிக்க ஒரு நெகிழ்வான பொறிமுறையாகும். கினேஸ்கள் பாஸ்பரிலேட் புரதங்கள் மற்றும் பாஸ்பேடேஸ்கள் டீபாஸ்பரிலேட் புரதங்கள். பல நொதிகள் மற்றும் ஏற்பிகள் பாஸ்பரிலேஷன் மற்றும் டீபாஸ்பரிலேஷன் மூலம் "ஆன்" அல்லது "ஆஃப்" செய்யப்படுகின்றன. மாற்றியமைக்கக்கூடிய பாஸ்பரிலேஷன் பல என்சைம்கள் மற்றும் ஏற்பிகளில் கட்டமைப்பில் ஒரு இணக்கமான மாற்றத்தை ஏற்படுத்துகிறது, இதனால் அவை செயல்படுத்தப்படுகின்றன அல்லது செயலிழக்கச் செய்கின்றன. பாஸ்பரிலேஷன் பொதுவாக யூகாரியோடிக் புரதங்களில் உள்ள செரின், த்ரியோனின், டைரோசின் மற்றும் ஹிஸ்டிடின் எச்சங்களில் நிகழ்கிறது. யூகாரியோடிக் புரதங்களின் ஹிஸ்டிடின் பாஸ்பரிலேஷன் டைரோசின் பாஸ்பரிலேஷனை விட மிகவும் அடிக்கடி தோன்றுகிறது. புரோக்கரியோடிக் புரதங்களில் பாஸ்பரிலேஷன் செரின், த்ரியோனின், டைரோசின், ஹிஸ்டிடின் அல்லது அர்ஜினைன் அல்லது லைசின் எச்சங்களில் ஏற்படுகிறது. ஒரு அமினோ அமில எச்சத்தின் துருவமற்ற ஆர் குழுவில் ஒரு பாஸ்பேட் (பிஓ43-) மூலக்கூறைச் சேர்ப்பது ஒரு புரதத்தின் ஹைட்ரோபோபிக் பகுதியை ஒரு மூலக்கூறின் துருவ மற்றும் மிகவும் ஹைட்ரோஃபிலிக் பகுதியாக மாற்றும். இந்த வழியில் புரத இயக்கவியல் புரதத்தில் உள்ள பிற ஹைட்ரோபோபிக் மற்றும் ஹைட்ரோஃபிலிக் எச்சங்களுடன் நீண்ட தூர அலஸ்டரி வழியாக புரதத்தின் கட்டமைப்பில் ஒரு இணக்கமான மாற்றத்தைத் தூண்டும். எபிஜெனெடிக் தாக்கங்கள் ஹிஸ்டோன்-மாற்றியமைக்கும் வளாகங்கள் அல்லது குரோமாட்டின் மறுவடிவமைப்பு வளாகங்கள் மூலம் ஹிஸ்டோன் வால்களின் பிந்தைய மொழிபெயர்ப்பு மாற்றம் உயிரணுவால் விளக்கப்படுகிறது மற்றும் சிக்கலான, ஒருங்கிணைந்த டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனல் வெளியீட்டிற்கு வழிவகுக்கிறது. ஒரு ஹிஸ்டோன் குறியீடு ஒரு குறிப்பிட்ட பிராந்தியத்தில் உள்ள ஹிஸ்டோன்களுக்கு இடையிலான சிக்கலான தொடர்பு மூலம் மரபணுக்களின் வெளிப்பாட்டை ஆணையிடுகிறது என்று கருதப்படுகிறது. ஹிஸ்டோன்களின் தற்போதைய புரிதல் மற்றும் விளக்கம் இரண்டு பெரிய அளவிலான திட்டங்களிலிருந்து வருகிறதுஃ ENCODE மற்றும் எபிஜெனோமிக் சாலை வரைபடம். எபிஜெனோமிக் ஆய்வின் நோக்கம் முழு மரபணுவிலும் எபிஜெனெடிக் மாற்றங்களை ஆராய்வதாகும். இது குரோமாட்டின் நிலைகளுக்கு வழிவகுத்தது, இது வெவ்வேறு புரதங்கள் மற்றும்/அல்லது ஹிஸ்டோன் மாற்றங்களை ஒன்றாக தொகுப்பதன் மூலம் மரபணு பகுதிகளை வரையறுக்கிறது. மரபணுவில் உள்ள புரதங்களின் பிணைப்பு இருப்பிடத்தைப் பார்த்து ட்ரோசோபிலா உயிரணுக்களில் குரோமாட்டின் நிலைகள் ஆராயப்பட்டன. சிஐபி-வரிசைமுறையின் பயன்பாடு வெவ்வேறு பிணைப்புகளால் வகைப்படுத்தப்படும் மரபணுவில் உள்ள பகுதிகளை வெளிப்படுத்தியது. ட்ரோசோபிலாவிலும் பல்வேறு வளர்ச்சி நிலைகள் விவரிக்கப்பட்டன, ஹிஸ்டோன் மாற்றத்தின் பொருத்தத்திற்கு முக்கியத்துவம் அளிக்கப்பட்டது. பெறப்பட்ட தரவைப் பார்த்தால், ஹிஸ்டோன் மாற்றங்களின் அடிப்படையில் குரோமாட்டின் நிலைகளின் வரையறைக்கு வழிவகுத்தது. சில மாற்றங்கள் வரைபடமாக்கப்பட்டன மற்றும் செறிவூட்டல் சில மரபணு பகுதிகளில் உள்ளூர்மயமாக்கப்படுவதைக் காண முடிந்தது. மனித மரபணு குரோமாட்டின் நிலைகளுடன் குறிப்பிடப்பட்டுள்ளது. இந்த சிறுகுறிப்பு நிலைகள் அடிப்படை மரபணு வரிசையிலிருந்து சுயாதீனமாக ஒரு மரபணுவைக் குறிக்க புதிய வழிகளாகப் பயன்படுத்தப்படலாம். டிஎன்ஏ வரிசையிலிருந்து இந்த சுதந்திரம் ஹிஸ்டோன் மாற்றங்களின் எபிஜெனெடிக் தன்மையை செயல்படுத்துகிறது. மேம்படுத்திகள் போன்ற வரையறுக்கப்பட்ட வரிசை இல்லாத ஒழுங்குமுறை கூறுகளை அடையாளம் காண்பதற்கும் குரோமாட்டின் நிலைகள் பயனுள்ளதாக இருக்கும். இந்த கூடுதல் அளவிலான சிறுகுறிப்பு செல் குறிப்பிட்ட மரபணு ஒழுங்குமுறை பற்றிய ஆழமான புரிதலை அனுமதிக்கிறது. முறைகள் ஹிஸ்டோன் அடையாளத்தை பல்வேறு வழிகளில் கண்டறியலாம்ஃ குரோமாட்டின் நோயெதிர்ப்பு அளவீட்டு வரிசைமுறை (சிஐபி-வரிசைமுறை) டிஎன்ஏ செறிவூட்டலின் அளவை ஒரு முறை இலக்கு புரதத்துடன் பிணைக்கப்பட்டு நோயெதிர்ப்பு குறைபாட்டை அளவிடுகிறது. இது நல்ல உகப்பாக்கத்தில் விளைகிறது மற்றும் உயிரணுக்களில் நிகழும் டிஎன்ஏ-புரத பிணைப்பை வெளிப்படுத்த விவோவில் பயன்படுத்தப்படுகிறது. ஒரு மரபணு பகுதியில் வெவ்வேறு ஹிஸ்டோன் மாற்றங்களுக்கான பல்வேறு டிஎன்ஏ துண்டுகளை அடையாளம் காணவும் அளவிடவும் சிஐபி-செக் பயன்படுத்தப்படலாம். 2. மைக்ரோகோக்கல் நியூக்ளியேஸ் வரிசைமுறை (எம்என்ஏஎஸ்-செக்யூ) நன்கு நிலைநிறுத்தப்பட்ட நியூக்ளியோசோம்களால் பிணைக்கப்பட்ட பகுதிகளை ஆராய பயன்படுத்தப்படுகிறது. நியூக்ளியோசோம் நிலைப்பாட்டை அடையாளம் காண மைக்ரோகோக்கல் நியூக்ளியேஸ் நொதியின் பயன்பாடு பயன்படுத்தப்படுகிறது. நன்கு நிலைநிறுத்தப்பட்ட நியூக்ளியோசோம்கள் வரிசைகளின் செறிவூட்டலைக் கொண்டிருப்பதைக் காணலாம். 3. நியூக்ளியோசோம் இல்லாத (திறந்த குரோமாட்டின்) பகுதிகளைப் பார்க்க டிரான்ஸ்போசேஸ் அணுகக்கூடிய குரோமாட்டின் வரிசைமுறைக்கான (ஏடிஏசி-செக்) மதிப்பீடு பயன்படுத்தப்படுகிறது. இது நியூக்ளியோசோம் உள்ளூர்மயமாக்கலை முன்னிலைப்படுத்த ஹைபராக்டிவ் டிஎன்5 டிரான்ஸ்போசானைப் பயன்படுத்துகிறது. குறிப்புகள் எபிஜெனெடிக்ஸ் பிந்தைய மொழிபெயர்ப்பு மாற்றம்