SAAM II
"உருவகப்படுத்துதல் பகுப்பாய்வு மற்றும் மாடலிங்" பதிப்பு 2. க்கான சுருக்கமான SAAM II, உயிரியல் துறையில் அறிவியல் ஆராய்ச்சிக்காக வடிவமைக்கப்பட்ட ஒரு புகழ்பெற்ற கணினி நிரலாகும். இது மருந்து வளர்ச்சி, தடமறிதல், வளர்சிதை மாற்றக் கோளாறுகள் மற்றும் மருந்தக இயக்கவியல்/மருந்தக இயக்கவியல் ஆராய்ச்சியில் ஒரு விளக்கமான மற்றும் ஆய்வுக் கருவியாகும். இது சிக்கலான உயிரியல் அமைப்புகளை மாதிரியாக்குவதற்கு பரவலாகப் பயன்படுத்தப்படும் அணுகுமுறையான பல-உட்பிரிவு மாதிரி கோட்பாட்டின் கொள்கைகளை அடிப்படையாகக் கொண்டது. SAAM II மாதிரிகளின் கட்டுமானம் மற்றும் உருவகப்படுத்துதலை எளிதாக்குகிறது, ஆராய்ச்சியாளர்களுக்கு ஒரு நட்பு பயனர் இடைமுகத்தை வழங்குகிறது, இது எளிய மற்றும் சிக்கலான (நேரியல் மற்றும் நேரியல் அல்லாத) கட்டமைப்புகள் மற்றும் தரவுகளின் விரைவான ஓட்டம் மற்றும் பல பொருத்துதல்களை அனுமதிக்கிறது. SAAM II பல மருந்து மற்றும் மருந்தியல் பள்ளிகளால் மருந்து மேம்பாடு, ஆராய்ச்சி மற்றும் கல்வி கருவியாக பயன்படுத்தப்படுகிறது. அம்சங்கள் கம்பார்ட்மெண்டல் தொகுதி SAAM II ஒரு பயனர் நட்பு இடைமுகத்தை வழங்குகிறது, இது குறியீட்டின் தேவையை நீக்குகிறது. கம்பார்ட்மெண்டல் தொகுதிக்குள், வட்டங்கள், அம்புகள் மற்றும் பெட்டிகள் போன்ற பல்வேறு மாதிரி கூறுகளை இழுத்துச் செல்வதன் மூலம் பயனர்கள் மாதிரிகளை சிரமமின்றி உருவாக்க முடியும். மாதிரியின் நடத்தையை உருவகப்படுத்த, மாதிரி நிலைமைகளை உருவாக்குவது ஒரு நேரடியான செயல்முறையாகும். இழுத்தல் மற்றும் சொட்டு சோதனை உருவாக்கும் சின்னங்களைப் பயன்படுத்துவதன் மூலம், பயனர்கள் நேரடியாக உள்ளீடுகள் மற்றும் மாதிரி தளங்களை எளிதாக குறிப்பிடலாம். பிரிவு அல்லாத தொகுதி (எண் தொகுதி) எண் தொகுதியும் கிடைக்கிறது, ஆனால் குறைவாக அடிக்கடி பயன்படுத்தப்படுகிறது; இது முன் வரையறுக்கப்பட்ட செயல்பாடுகளால் மாதிரியின் சமன்பாடுகள் அல்லது மாதிரியின் தரவை நேரடியாக எழுத உங்களை அனுமதிக்கிறது. பிந்தையது தரவின் ஒரு பிரிவு அல்லாத பகுப்பாய்வை மேற்கொள்ள உங்களை அனுமதிக்கிறது. என்ஐஎச் நிதியுதவியுடன், பாப்கைனடிக்ஸ் குறிப்பாக SAAM II க்குள் கட்டப்பட்ட கம்பார்ட்மெண்டல் மாடல்களின் மக்கள்தொகை பகுப்பாய்விற்காக உருவாக்கப்பட்டது. பாப்கைனடிக்ஸ் மக்கள்தொகை அளவுரு மதிப்பீட்டிற்கான இரண்டு அணுகுமுறைகளின் கணக்கீட்டை வழங்குகிறதுஃ நிலையான இரண்டு-நிலை மற்றும் மறு செய்கை இரண்டு-நிலை முறைகள். மக்கள்தொகையை பகுப்பாய்வு செய்வதில் எளிமை, கணக்கீட்டு செயல்திறன் மற்றும் குறைந்தபட்ச அனுமானங்கள் விரும்பப்படும்போது இரண்டு கட்ட முறைகள் விரும்பப்படலாம். சரிபார்ப்பு SAAM II இலிருந்து பெறப்பட்ட முடிவுகள் பல ஆண்டுகளாக விரிவான பயன்பாடு, பிற திட்டங்களில் மாடலிங் பிரதி மற்றும் சக மதிப்பாய்வு செய்யப்பட்ட பத்திரிகைகளில் வெளியீடு மூலம் மறைமுக சரிபார்ப்பைப் பெற்றுள்ளன. மென்பொருளின் எண் செயல்திறனின் சரிபார்ப்பு வின் நான்லினுக்கு எதிராக மேற்கொள்ளப்பட்டது. பொதுவாக, அளவுரு மதிப்பீடுகள் மற்றும் மாதிரி கணிப்புகளின் அடிப்படையில் SAAM II மற்றும் வின்நோன்லின் இடையே நல்ல உடன்பாடு (<1 சதவீதம் வேறுபாடு) இருந்தது. பயன்பாடுகள் மற்றும் குறிப்பிடத்தக்க படைப்புகள் 1. மருந்தியல் இயக்கவியல் மற்றும் மருந்தியல் இயக்கவியல் (பி. கே./பி. டி.) ஆராய்ச்சிஃ மேம்பட்ட சிகிச்சை விளைவுகளுக்கான மருந்து அளவீட்டு முறைகளை உகந்ததாக்குதல். உடலில் மருந்து உறிஞ்சுதல், விநியோகம், வளர்சிதை மாற்றம் மற்றும் வெளியேற்றத்தை மாதிரியாக்குதல். போதைப்பொருள்-மருந்து தொடர்புகளை ஆய்வு செய்தல் மற்றும் அவற்றின் விளைவுகளை கணிப்பது. மறைமுக மற்றும் தனிப்பயன் பி. டி. 2. மக்கள்தொகை மருந்தியல் இயக்கவியல்ஃ இரண்டு கட்ட முறைகளுடன் பல்வேறு நோயாளிகளின் மக்கள் தொகையில் மருந்து பதில்களை பகுப்பாய்வு செய்தல். தனிப்பயனாக்கப்பட்ட மருந்துஃ தனிப்பட்ட நோயாளியின் பண்புகளின் அடிப்படையில் மருந்து அளவை தையல் செய்வது. 3. அமைப்புகள் உயிரியல்ஃ சிக்கலான உயிரியல் நெட்வொர்க்குகள் மற்றும் செல்லுலார் செயல்முறைகளை மாதிரியாக்குதல். சமிக்ஞை கடத்தல் பாதைகள் மற்றும் ஒழுங்குமுறை நெட்வொர்க்குகளைப் புரிந்துகொள்வது. நோய் பாதைகள் மற்றும் மூலக்கூறு தொடர்புகளை ஆய்வு செய்தல். 4. உயிரி தொழில்நுட்பம்ஃ மருந்து மற்றும் உயிரி தொழில்நுட்பத் தொழில்களுக்கான உயிரி செயல்முறைகளின் வடிவமைப்பு மற்றும் உகப்பாக்கம். உயிரியல் உலைகள் மற்றும் உயிரியல் வினையூக்கிகளின் நடத்தையை கணிப்பது. 5. வளர்சிதை மாற்ற நோய்கள் ஆராய்ச்சிஃ வளர்சிதை மாற்றக் கோளாறுகள் மற்றும் அவற்றின் அடிப்படை வழிமுறைகளைப் படிப்பது. குளுக்கோஸ்-இன்சுலின் இயக்கவியல் மற்றும் நீரிழிவு ஆராய்ச்சியில் அதன் பொருத்தத்தை பகுப்பாய்வு செய்தல். 6. ட்ரேசர் ஆய்வுகள்ஃ ரேடியோலேபிள் செய்யப்பட்ட சேர்மங்களின் இயக்கவியலின் அளவு மதிப்பீடு. உடலில் ட்ரேசர் விநியோகம் மற்றும் அகற்றல் குறித்து ஆய்வு செய்தல். 7. சோதனை வடிவமைப்புஃ அளவுரு மதிப்பீடு மற்றும் மாதிரி சரிபார்ப்புக்கான தரவை சேகரிக்க உகந்த சோதனைகளை வடிவமைத்தல். வெவ்வேறு சோதனை நிலைமைகளுக்கு மாதிரி அளவுருக்களின் உணர்திறனை மதிப்பீடு செய்தல். 8. கல்வியில் உயிரியல் மாதிரியாக்கம்ஃ உயிரியல் அறிவியல் மற்றும் அமைப்புகள் மாதிரியாக்கம் கற்பிப்பதற்கான ஒரு கல்வி கருவியாக SAAM II. கல்வி அமைப்புகளில் மருந்தியல் இயக்கவியல் மற்றும் அமைப்புகள் உயிரியல் பற்றிய கருத்துக்களை நிரூபித்தல். 9. சக மதிப்பாய்வு செய்யப்பட்ட வெளியீடுகள்ஃ SAAM II பல்வேறு ஆராய்ச்சி ஆய்வுகளில் பயன்படுத்தப்படுகிறது மற்றும் ஆண்டுக்கு 50 க்கும் மேற்பட்ட சக மதிப்பாய்வு செய்யப்பட்ட அறிவியல் பத்திரிகைகளில் மேற்கோள் காட்டப்படுகிறது (கூகிள் ஸ்காலர்). நீரிழிவு எதிர்ப்பு சிகிச்சைகளின் இன்சுலின் மேம்பாடுகளை அளவிட மருத்துவ பரிசோதனைகளில் பயன்படுத்தப்படும் குளுக்கோஸ்-இன்சுலின் குறைந்தபட்ச மாதிரிகள் SAAM II இல் செயல்படுத்தப்படுகின்றன என்பது குறிப்பிடத்தக்கது. SAAM II வளர்ச்சி மற்றும் விநியோகம் 1950 களின் முற்பகுதியில், மோன்ஸ் பெர்மனும் என்ஐஎச் இல் உள்ள மற்றவர்களும் கதிர்வீச்சு அளவீட்டில் உள்ள சிக்கல்கள் குறித்து பணியாற்றினர். சேகரிக்கப்படும் நிலையற்ற (இயக்க) தரவை பகுப்பாய்வு செய்வதற்கான சிறந்த வழி கம்பார்ட்மெண்டல் மாதிரிகள் (வேறுபட்ட சமன்பாடுகளின் அமைப்புகள்) என்று மோன்ஸ் முடிவு செய்தார். அவர் ஒரு மென்பொருள் கருவியின் வளர்ச்சியைத் தொடங்கினார், அது இறுதியில் SAAM என்று அறியப்பட்டது. SAAM இன் சக்தி அதன் அகராதியாகும், இது ஒரு பயனருக்கு அவர்களின் மாதிரியை வரைவதற்கு உதவியது, பின்னர் அகராதி மற்றும் விதிகளின் தொகுப்பைப் பயன்படுத்தி, ஓவியத்திலிருந்து நேரடியாக ஒரு உள்ளீட்டு கோப்பை உருவாக்குகிறது. SAAM இந்த தகவலை எடுத்து மாதிரியை விவரிக்கும் வேறுபட்ட சமன்பாடுகளின் அமைப்பை உருவாக்கியது. இதன் பொருள் என்னவென்றால், பயனர் உயிரியல்/மருந்தியல் பற்றி சிந்திக்க முடியும், அதே நேரத்தில் நிரல் கணிதம் மற்றும் புள்ளிவிவரங்களை திரைக்குப் பின்னால் செய்கிறது. இது மிகவும் பிரபலமான திட்டமாக இருந்தது, ஆனால் ஒருவர் என்ஐஎச்-ஐப் பார்வையிட்டு, திட்டத்தை எவ்வாறு பயன்படுத்துவது என்பதை அறிய மோன்ஸுடன் இணைந்து பணியாற்ற வேண்டியிருந்தது. 1986 மற்றும் 1994 க்கு இடையில், என்ஐஎச்-ஐச் சேர்ந்த லோரன் ஜெக் உதவியுடன் பேராசிரியர் டேவிட் ஃபாஸ்டர் தலைமையிலான பயோ இன்ஜினியரிங் மையத்தில் உள்ள இயக்க பகுப்பாய்வுக்கான வள மையத்தின் மூலம் வாஷிங்டன் பல்கலைக்கழகம் செயல்பட்டு, ஒரு மூலோபாய பயனர் இடைமுகம் உட்பட குறியீட்டை மீண்டும் எழுதியது, இது SAAM II க்கு வழிவகுத்தது. முதல் பதிப்பு 1993 இல் சூரியனில் வெளியிடப்பட்டது. பிசி பதிப்பு 1994 இல் வெளியிடப்பட்டது. பல மானியங்கள் மூலம், 2000-2012 காலகட்டத்தில், ஃபாஸ்டர் மற்றும் விசினி நவீன பதிப்பு 2.1 ஐ உருவாக்குவதில் பணியாற்றினர், இதில் பாப்கைனெட்டிக்ஸ் எனப்படும் மக்கள்தொகை பகுப்பாய்வு ஆட்-ஆன் அடங்கும். 2012 ஆம் ஆண்டில், வர்ஜீனியாவில் உள்ள மருத்துவ தானியங்கி நிறுவனமான எப்சிலன் குழுமம் மென்பொருளை மேம்படுத்துவதற்கும் விநியோகிப்பதற்கும் வணிக உரிமங்களுக்கு உரிமம் பெற்றது. 2022 ஆம் ஆண்டில், தற்போதைய பதிப்பு 2.3 வரை SAAM II மென்பொருளை உருவாக்கி விநியோகிக்கும் வணிக உரிமைகள் வாஷிங்டனை தலைமையிடமாகக் கொண்ட ஆலோசனை மற்றும் மென்பொருள் நிறுவனமான நானோமத் எல். எல். சி. க்கு உரிமம் பெற்றன. SAAM II இன் தலைமை மற்றும் நிர்வாகத்தை உயிரியல் மற்றும் மருந்தியல் அமைப்புகளின் கணக்கீட்டு மாதிரியாக்கத்தில் அனுபவம் கொண்ட விஞ்ஞானி சிமோன் பெராஸ்ஸோலோ ஏற்றுக்கொண்டார். முக்கிய கணக்கீட்டு வழிமுறைகள் SAAM II சாதாரண வேறுபட்ட சமன்பாட்டை (ODE) தீர்ப்பதற்கு மூன்று வகையான ஒருங்கிணைப்பாளர்களைப் பயன்படுத்துகிறதுஃ RK 4-5 வது வரிசைஃ 4 வது-5 வது வரிசை ரஞ்ச்-குட்டா முறைகள், இது ODE களைத் தீர்ப்பதற்கான ஒரு எண் நுட்பமாகும். மேட்ரிக்ஸ் எக்ஸ்பொனென்ஷியலின் பேட் தோராயம்ஃ இந்த முறை பேட் தோராயங்களைப் பயன்படுத்தி மேட்ரிக்ஸ் எக்ஸ்பொனென்ஷியலை தோராயமாக மதிப்பிடுவதை அடிப்படையாகக் கொண்டது, இது ODE களைத் தீர்ப்பதற்கான திறமையான அணுகுமுறையை வழங்குகிறது. ரோசென்ப்ரோக் முறைகள்ஃ SAAM II வழக்கமான ரோசென்ப்ரோக் முறைகளைப் பயன்படுத்துகிறது, அவை கடினமான ODE களுக்கு (பரவலாக மாறுபட்ட நேர அளவுகோல்களைக் கொண்டவை) பொருத்தமான மறைமுகமான ரஞ்ச்-குட்டா முறைகளின் ஒரு வகுப்பாகும். SAAM II பல தரவு பொருத்துதலுக்கான அளவுரு உகப்பாக்கத்தை பயன்படுத்துகிறது, காஸ்-நியூட்டன் வழிமுறையிலிருந்து பெறப்பட்ட மாற்றியமைக்கப்பட்ட நேரியல் அல்லாத எடையுள்ள நேரியல் அல்லாத குறைந்தபட்ச சதுர முறையைப் பயன்படுத்துகிறது. பின்னடைவு பணிகளில், பயனர்கள் தரவு அல்லது மாதிரியில் உள்ள பிழையின் அடிப்படையில் ஒரு எடை திட்டத்தை உருவாக்க நெகிழ்வுத்தன்மையைக் கொண்டுள்ளனர். கூடுதலாக, SAAM II ஒரு பேய்சியன் மேக்ஸிமம் ஏ போஸ்டிரியோரி (MAP) விருப்பத்தை வழங்குகிறது, இது பயனர்கள் பேய்சியன் அளவுரு மதிப்பீட்டை ஆராய அனுமதிக்கிறது. இந்த அம்சம் அளவுரு மதிப்பீட்டு செயல்பாட்டில் முன் அறிவு மற்றும் நிச்சயமற்ற தன்மையை இணைப்பதன் மூலம் பகுப்பாய்வை மேம்படுத்துகிறது. அளவுரு மதிப்பீடுகளின் நம்பகத்தன்மையை மதிப்பிடுவதற்கு, SAAM II பிந்தைய மற்றும் நடைமுறை அடையாள அம்சங்களை வழங்குகிறது. சிக்கலான கட்டமைப்புகள் மற்றும் பல அறியப்படாத மாறிகள் விஷயத்தில், அளவுரு அடையாளத்தின் தரத்தை மதிப்பீடு செய்ய இவை ஃபிஷரின் தகவல் அணி மற்றும் மதிப்பீடுகளின் கோவேரியன்ஸ் அணி ஆகியவற்றைப் பயன்படுத்துகின்றன. மேலும், SAAM II உள்ளூர் அளவுரு உணர்திறன், தொகுதி பகுப்பாய்வு மற்றும் சிலிகோ மக்கள்தொகை அம்சங்களை உள்ளடக்கியது, இவை இரண்டும் மாதிரியின் நடத்தை பற்றிய நுண்ணறிவுகளைப் பெறுவதற்கும் மாதிரி விளைவுகளில் அளவுரு மாற்றங்களின் தாக்கத்தை மதிப்பிடுவதற்கும் வசதியான கருவிகளாகும். பொறியியல், இயற்பியல் மற்றும் மருந்தியல் பள்ளிகள் போன்ற பல அமெரிக்க மற்றும் உலகளாவிய நிறுவனங்களில் பாடத்திட்டங்களில் கல்வி சாம் II ஐக் காணலாம். குறிப்புகள் வாஷிங்டன் பல்கலைக்கழகத்தின் உயிர் தகவலியல் மென்பொருள் திட்டங்கள்