Sticky and blunt ends
டிஎன்ஏ முனைகள் நேரியல் டிஎன்ஏ மூலக்கூறுகளின் முனைகளின் பண்புகளைக் குறிக்கின்றன, அவை மூலக்கூறு உயிரியலில் முனையத்தில் உள்ள நிரப்பு இழைகளின் வடிவத்தின் அடிப்படையில் "ஒட்டும்" அல்லது "அப்பட்டமானவை" என்று விவரிக்கப்படுகின்றன. ஒட்டும் முனைகளில், ஒரு ஸ்ட்ராண்ட் மற்றொன்றை விட நீளமானது (பொதுவாக குறைந்தபட்சம் ஒரு சில நியூக்ளியோடைடுகளால்), அதாவது நீண்ட ஸ்ட்ராண்ட் தளங்களைக் கொண்டுள்ளது, அவை இணைக்கப்படாமல் விடப்படுகின்றன. அப்பட்டமான முனைகளில், இரண்டு இழைகளும் சம நீளத்தைக் கொண்டுள்ளன-அதாவது. அவை ஒரே அடிப்படை நிலையில் முடிவடைகின்றன, இரு இழைகளிலும் இணைக்கப்படாத தளங்கள் எதுவும் இல்லை. இந்த கருத்து மூலக்கூறு உயிரியல், குளோனிங் அல்லது துணை குளோனிங் திசையன் டிஎன்ஏவில் டிஎன்ஏ செருகும் போது பயன்படுத்தப்படுகிறது. இத்தகைய முனைகள் குறிப்பிட்ட இடங்களில் மூலக்கூறின் பாஸ்போடிஸ்டர் முதுகெலும்பை உடைக்கும் கட்டுப்பாட்டு என்சைம்களால் உருவாக்கப்படலாம், அவை எக்ஸோனியூக்ளியேஸ்கள் மற்றும் எண்டோநியூக்ளியேஸ்கள் எனப்படும் பெரிய வகை என்சைம்களைச் சேர்ந்தவை. அருகிலுள்ள இடங்களில் இரு இழைகளின் முதுகெலும்புகளையும் வெட்டும் ஒரு கட்டுப்பாட்டு நொதி ஒரு தடுமாற்றமான வெட்டை விட்டுச் செல்கிறது, இரண்டு ஒன்றுடன் ஒன்று ஒட்டும் முனைகளை உருவாக்குகிறது, அதே நேரத்தில் ஒரு நேரான வெட்டு செய்யும் நொதி (இரு இழைகளிலும் ஒருவருக்கொருவர் நேராக குறுக்கே உள்ள இடங்களில்) இரண்டு அப்பட்டமான முனைகளை உருவாக்குகிறது. ஒற்றை இழையுள்ள டிஎன்ஏ மூலக்கூறுகள் ஒரு ஒற்றை இழையுள்ள வட்டமற்ற டிஎன்ஏ மூலக்கூறு இரண்டு ஒரே மாதிரியான முனைகளைக் கொண்டுள்ளது, 3 'முனை மற்றும் 5' முனை (பொதுவாக "மூன்று முதன்மை முனை" மற்றும் "ஐந்து முதன்மை முனை" என்று உச்சரிக்கப்படுகிறது). எண்கள் டியோக்ஸிரைபோஸில் உள்ள கார்பன் அணுக்களின் எண்ணிக்கையைக் குறிக்கின்றன, இது டிஎன்ஏ மூலக்கூறின் முதுகெலும்பை உருவாக்கும் ஒரு முக்கிய பகுதியாகும். டிஎன்ஏவின் முதுகெலும்பாக ஒரு டியோக்ஸிரைபோஸின் 5 'கார்பன் மற்றொரு 3' கார்பனுடன் ஒரு பாஸ்போடைஸ்டர் பிணைப்பு இணைப்பின் மூலம் இணைக்கப்பட்டுள்ளது. இந்த டியோக்ஸிரைபோஸின் 5 'கார்பன் மீண்டும் அடுத்த 3' கார்பனுடன் இணைக்கப்பட்டுள்ளது, மேலும் பல. இரட்டை இழைகள் கொண்ட மூலக்கூறுகளில் மாறுபாடுகள் டிஎன்ஏவின் ஒரு மூலக்கூறு இரட்டை இழைகளாக இருக்கும்போது, டிஎன்ஏ பொதுவாக இருப்பதைப் போல, இரண்டு இழைகளும் எதிர் திசைகளில் ஓடுகின்றன. எனவே, மூலக்கூறின் ஒரு முனையில் ஸ்ட்ராண்ட் 1 இன் 3 'முனையும், ஸ்ட்ராண்ட் 2 இன் 5' முனையும், மறுமுனையில் நேர்மாறாகவும் இருக்கும். இருப்பினும், மூலக்கூறு இரண்டு ஸ்ட்ராண்டட் என்ற உண்மை பல வேறுபட்ட மாறுபாடுகளை அனுமதிக்கிறது. பிளண்ட் முடிவடைகிறது இரட்டை சிக்கலான மூலக்கூறின் எளிய டிஎன்ஏ முனை அப்பட்டமான முனை என்று அழைக்கப்படுகிறது. பிளண்ட் முனைகள் ஒத்திசைவற்ற முனைகள் என்றும் அழைக்கப்படுகின்றன. ஒரு அப்பட்டமான மூலக்கூறில், இரண்டு இழைகளும் ஒரு அடிப்படை ஜோடியில் முடிவடைகின்றன. இரண்டு மூலக்கூறுகளை ஒன்றாக இணைக்க டிஎன்ஏ லிகேஸைப் பயன்படுத்தும் போது, அப்பட்டமான முனைகளுடன் மகசூல் கணிசமாக குறைவாக இருப்பதால், பயோடெக்னாலஜியில் பிளண்ட் முனைகள் எப்போதும் விரும்பப்படுவதில்லை. சப்க்ளோனிங் செய்யும் போது, செருகப்பட்ட டி. என். ஏவை விரும்பிய எதிர் நோக்குநிலையில் செருகுவதில் இது குறைபாட்டைக் கொண்டுள்ளது. மறுபுறம், அப்பட்டமான முனைகள் எப்போதும் ஒருவருக்கொருவர் இணக்கமாக இருக்கும். அப்பட்டமான முனையுள்ள டிஎன்ஏவின் ஒரு சிறிய துண்டுக்கு இங்கே ஒரு எடுத்துக்காட்டுஃ 5 '-GATCTGACTGATGCGT-3'-CTAGACTGACT-5 'ஓவர்ஹாங்ஸ் மற்றும் ஒட்டும் முனைகள் அல்லாத பிளண்ட் முனைகள் பல்வேறு ஓவர்ஹாங்குகளால் உருவாக்கப்படுகின்றன. ஓவர்ஹாங் என்பது டிஎன்ஏ மூலக்கூறின் முடிவில் இணைக்கப்படாத நியூக்ளியோடைடுகளின் நீட்சி ஆகும். இந்த இணைக்கப்படாத நியூக்ளியோடைடுகள் இரு இழைகளிலும் இருக்கலாம், இது 3 'அல்லது 5' மேல்புறங்களை உருவாக்குகிறது. இந்த ஓவர்ஹாங்குகள் பெரும்பாலான சந்தர்ப்பங்களில் பாலிண்ட்ரோமிக் ஆகும். ஒரு ஓவர்ஹாங்கின் எளிய வழக்கு ஒற்றை நியூக்ளியோடைடு ஆகும். இது பெரும்பாலும் அடினைன் ஆகும் மற்றும் சில டிஎன்ஏ பாலிமரேஸ்களால் 3 'ஓவர்ஹாங்காக உருவாக்கப்படுகிறது. பொதுவாக இது அத்தகைய நொதியால் உருவாக்கப்பட்ட பி. சி. ஆர் தயாரிப்புகளை குளோனிங் செய்ய பயன்படுத்தப்படுகிறது. இந்த தயாரிப்பு 3 'தைமின் ஓவர்ஹாங்குடன் ஒரு நேரியல் டிஎன்ஏ மூலக்கூறுடன் இணைக்கப்பட்டுள்ளது. அடினின் மற்றும் தைமின் ஒரு அடிப்படை ஜோடியை உருவாக்குவதால், இது இரண்டு மூலக்கூறுகளையும் ஒரு லிகேஸ் மூலம் இணைக்க உதவுகிறது, இது ஒரு வட்ட மூலக்கூறை உருவாக்குகிறது. ஏ-ஓவர்ஹாங்கிற்கு ஒரு எடுத்துக்காட்டு இங்கேஃ 5 '-ஏ. டி. சி. டி. ஜி. ஏ. சி. டி. ஏ-3'-டி. ஏ. ஜி. ஏ. சி. டி. ஜி. ஏ-5 'நீளமான ஓவர்ஹாங்குகள் ஒத்திசைவான முனைகள் அல்லது ஒட்டும் முனைகள் என்று அழைக்கப்படுகின்றன. டிஎன்ஏவை வெட்டும்போது அவை பெரும்பாலும் கட்டுப்பாடு எண்டோநியூக்ளியேஸ்களால் உருவாக்கப்படுகின்றன. பெரும்பாலும் அவை இரண்டு டிஎன்ஏ இழைகளையும் ஒருவருக்கொருவர் நான்கு அடிப்படை ஜோடிகளை வெட்டி, ஒரு மூலக்கூறில் நான்கு-அடிப்படை 3 'ஓவர்ஹாங்கையும், மற்றொன்றில் ஒரு நிரப்பு 3' ஓவர்ஹாங்கையும் உருவாக்குகின்றன. இந்த முனைகள் ஒரு தசைநாரால் எளிதில் மீண்டும் இணைக்கப்படுவதால் அவை ஒத்திசைவு என்று அழைக்கப்படுகின்றன. எடுத்துக்காட்டாக, இந்த இரண்டு "ஒட்டும்" முனைகளும் இணக்கமானவைஃ 5 '-ஏ. டி. சி. டி. ஜி. ஏ. டி. ஜி. சி. டி-3'-ஏ. டி. ஜி. சி. டி. ஜி. ஏ. டி. ஜி. சி. டி-3 '-ஏ. டி. ஜி. சி. டி. ஜி. ஏ. டி. ஜி. சி. டி-3'-ஏ. டி. ஜி. சி. டி. ஜி. ஏ. டி. ஜி. சி. டி-3 '-ஏ. ஜி. சி. டி. ஜி. ஏ. டி. ஜி. ஜி. டி-3' மேலும், வெவ்வேறு கட்டுப்பாடு எண்டோநியூக்ளியேஸ்கள் பொதுவாக வெவ்வேறு ஓவர்ஹாங்குகளை உருவாக்குவதால், டிஎன்ஏவின் ஒரு பகுதியை வெளியேற்றுவதன் மூலம் ஒரு பிளாஸ்மிட்டை உருவாக்க முடியும் (ஒவ்வொரு முனையிலும் வெவ்வேறு நொதியைப் பயன்படுத்தி) பின்னர் அதே என்சைம்களால் ஒழுங்கமைக்கப்பட்ட முன லிகேஸ் செயல்படுவதற்கு ஓவர்ஹாங்ஸ் நிரப்பு இருக்க வேண்டும் என்பதால், இரண்டு மூலக்கூறுகளும் ஒரு நோக்குநிலையில் மட்டுமே சேர முடியும். இது பெரும்பாலும் மூலக்கூறு உயிரியலில் மிகவும் விரும்பத்தக்கது. டிஎன்ஏவின் ஒவ்வொரு இழையிலும், பொதுவாக தைமினுடன் அடினைன் ஜோடியையும், குவானைனுடன் சைட்டோசின் ஜோடியையும் கீழே விவரிக்கப்பட்டுள்ளபடி இணையான நிரப்பு இழையை உருவாக்குவதையும் காண்கிறோம். இந்த முறையில் ஒருவருக்கொருவர் ஒத்திருக்கும் இரண்டு நியூக்ளியோடைடு வரிசைகள் நிரப்பு என்று குறிப்பிடப்படுகின்றனஃ 5 '-ஏ. டி. சி. டி. ஜி. ஏ. சி. டி-3'-டி. ஏ. ஜி. ஏ. சி. டி. ஜி. ஏ-5 'ஒரு சிதைந்த முனை என்பது இரட்டை இழைகள் கொண்ட (அல்லது பிற பல இழைகள் கொண்ட) டி. என். ஏ மூலக்கூறின் ஒரு பகுதியைக் குறிக்கிறது, இறுதியில் குறிப்பிடத்தக்க விகிதத்தில் நிரப்பு அல்லாத வரிசைகள் உள்ளன; அதாவது, அருகிலுள்ள இழைகளில் உள்ள நியூக்ளியோடைடுகள் சரியாக பொருந்தாத ஒரு வரிசைஃ 5'-ஏ. டி. சி. டி. ஜி. ஏ. ஜி. ஜி. ஏ-3 '-டி. ஏ. ஜி. ஏ. சி. டி. ஜி. ஏ. டி. ஏ. சி. டி. ஏ. ஜி-5' தவறாக பொருந்தக்கூடிய நியூக்ளியோடைடுகள் பிணைப்பைத் தவிர்க்க முனைகின்றன இரட்டை ஸ்ட்ராண்டட் டிஎன்ஏவின் நடுவில் நிரப்பு அல்லாத வரிசைகளும் சாத்தியமானாலும், முனைகளிலிருந்து விலகி பொருந்தாத பகுதிகள் "ஃப்ரேட்" என்று குறிப்பிடப்படுவதில்லை. கண்டுபிடிப்பு ரொனால்ட் டபிள்யூ. டேவிஸ் முதன்முதலில் எக்கோஆர்ஐ, கட்டுப்பாடு எண்டோநியூக்லீஸின் செயல்பாட்டின் விளைவாக ஒட்டும் முனைகளைக் கண்டுபிடித்தார். வலிமை ஒட்டும் இறுதி இணைப்புகள் அவற்றின் ஸ்திரத்தன்மையில் வேறுபட்டவை. ஸ்திரத்தன்மையை மதிப்பிடுவதற்கு உருவாக்கத்தின் இலவச ஆற்றலை அளவிட முடியும். ஒலிகோ நியூக்ளியோடைடு புற ஊதா வெப்ப சிதைவு வளைவுகள் தொடர்பான தரவுகளிலிருந்து வெவ்வேறு வரிசைகளுக்கு இலவச ஆற்றல் தோராயங்கள் செய்யப்படலாம். மேலும் மூலக்கூறு இயக்கவியல் உருவகப்படுத்துதல்களின் கணிப்புகள் சில ஒட்டும் இறுதி இணைப்புகள் மற்றவர்களை விட நீட்சியில் மிகவும் வலுவானவை என்பதைக் காட்டுகின்றன. குறிப்புகள் சாம்ப்ரூக், ஜோசப்; டேவிட் ரஸ்ஸல் (2001). மூலக்கூறு குளோனிங்ஃ ஒரு ஆய்வக கையேடு. நியூயார்க்ஃ கோல்ட் ஸ்பிரிங் ஹார்பர் ஆய்வக அச்சகம்,. டிஎன்ஏ மரபியல் நுட்பங்கள் மூலக்கூறு உயிரியல்