Podospora anserina
போடோஸ்போரா அன்செரினா என்பது சோர்டாரியல்ஸ் வரிசையில் இருந்து வரும் ஒரு இழையுள்ள அஸ்கோமைசெட் பூஞ்சை ஆகும். இது முதுமை (முதுமை), பிரையன்ஸ், பாலியல் இனப்பெருக்கம் மற்றும் மையடிக் இயக்கி ஆகியவற்றின் மூலக்கூறு உயிரியல் ஆய்வுக்கான ஒரு மாதிரி உயிரினமாக கருதப்படுகிறது. இது ஒரு கட்டாய பாலியல் மற்றும் சூடோஹோமோத்தாலிக் வாழ்க்கைச் சுழற்சியைக் கொண்டுள்ளது. இது ஒரு நோய்க்கிருமி அல்லாத கொப்ரோஃபிலஸ் பூஞ்சை ஆகும், இது குதிரைகள், முயல்கள், பசுக்கள் மற்றும் செம்மறி ஆடுகள் போன்ற தாவர உண்ணும் விலங்குகளின் சாணத்தை குடியேற்றுகிறது. வகைபிரித்தல் போடோஸ்போரா அன்செரினா முதலில் மாலின்வெர்னியா அன்செரினா ராபென்ஹார்ஸ்ட் (1857) என்று பெயரிடப்பட்டது. போடோஸ்போரா அன்செரினா பின்னர் நீஸ்லில் (1883) வெளியிடப்பட்டது, இது இன்று அதன் பொதுவான ஆய்வக திரிபு 'நீஸ்லில்' குறிக்க பயன்படுத்தப்படுகிறது. இது ப்ளூரேஜ் அன்செரினா (செஸ்) என்றும் அழைக்கப்படுகிறது. குன்ட்ஸ். பி. அன்செரினாவின் மரபியல் ரைசெட் மற்றும் எங்கெல்மேன் (1949) இல் வகைப்படுத்தப்பட்டது மற்றும் எஸ்ஸர் (1974) ஆல் மதிப்பாய்வு செய்யப்பட்டது. 18S rRNA மற்றும் புரோட்டீன் ஆர்த்தோலோகஸ் ஷேர் 60-70% ஹோமோலஜியின் அடிப்படையில் 75 மில்லியன் ஆண்டுகளுக்கு முன்பு நியூரோஸ்போரா க்ராஸ்ஸாவிலிருந்து பி. அன்செரினா பிரிந்ததாக மதிப்பிடப்பட்டுள்ளது. அஸ்பெர்கிலஸ் நிடுலன்ஸ் மற்றும் போடோஸ்போரா அன்செரினா இடையேயான மரபணு கொத்து ஆர்த்தோலாக்ஸ் 63 சதவீதம் ஒரே மாதிரியான முதன்மை அமினோ அமில வரிசையைக் கொண்டுள்ளன (இந்த இனங்கள் தனித்துவமான வகுப்புகளைச் சேர்ந்தவை என்றாலும்) மற்றும் ஒப்பிடப்பட்ட புரோட்டியோம்களின் சராசரி அமினோ அமிலம் 10 சதவீதம் குறைவாக உள்ளது, இது தனித்துவமான இனங்கள் இன்னும் பகிரப்பட்ட மரபணுக்களின் கருதுகோள்களுக்கு வழிவகுக்கிறது. ஆராய்ச்சி போடோஸ்போரா என்பது மரபியல், வயதான (முதுமை, செல் சிதைவு), அஸ்கோமைசெட் வளர்ச்சி, ஹெட்டோரோக்யாரியான் பொருந்தாத தன்மை, பூஞ்சை, ப்ரியன்கள் மற்றும் மைட்டோகாண்ட்ரியல் மற்றும் பெராக்ஸிசோமல் உடலியல் ஆகியவற்றில் இனச்சேர்க்கை ஆகியவற்றை ஆய்வு செய்வதற்கான ஒரு மாதிரி உயிரினமாகும். போடோஸ்போரா சிக்கலான (முழு) உருளைக்கிழங்கு டெக்ஸ்ட்ரோஸ், கார்ன்மீல் அகர்/குழம்பு அல்லது செயற்கை ஊடகத்தில் கூட எளிதில் வளர்க்கப்படுகிறது, மேலும் நவீன மூலக்கூறு கருவிகளைப் பயன்படுத்தி கையாள எளிதானது. அதன் உகந்த வளர்ச்சி வெப்பநிலை மற்றும் ஆய்வக நிலைமைகளின் கீழ் 7 முதல் 11 நாட்களில் அதன் வாழ்க்கைச் சுழற்சியை முடிக்க முடியும். பெரும்பாலான ஆராய்ச்சிகள் 1920 களில் மாதிரியாக எடுக்கப்பட்ட பிரெஞ்சு விகாரங்களின் ஒரு சிறிய தொகுப்பில் செய்யப்பட்டுள்ளன, குறிப்பாக எஸ் மற்றும் எஸ் என்று பெயரிடப்பட்ட விகாரங்கள். ஹெட்-எஸ் லோகஸைத் தவிர இந்த இரண்டு விகாரங்களும் மிகவும் ஒத்ததாக அறியப்படுகின்றன. 2008 ஆம் ஆண்டில் வெளியிடப்பட்ட குறிப்பு மரபணு S + உடன் ஒத்திருக்கிறது, இது ஒரு + இனச்சேர்க்கை வகையுடன் S திரிபுகளின் ஹாப்லோயிட் வழித்தோன்றலாகும். கூடுதலாக, மற்ற இரண்டு மக்கள் தொகை மாதிரிகள் எடுக்கப்பட்டுள்ளன, ஒன்று ஜெர்மனியின் யூசிங்கனில், மற்றொன்று நெதர்லாந்தின் வாகனிங்கனில், இவை இரண்டும் பூஞ்சைகளில் உள்ள மையடிக் இயக்கத்தின் தோற்ற வகை வெளிப்பாடான வித்தியைக் கொல்லுவதைப் படிக்கப் பயன்படுத்தப்பட்டுள்ளன. கூடுதலாக பல ஆய்வகத்திலிருந்து பெறப்பட்ட விகாரங்கள் உள்ளனஃ விரும்பத்தக்க மரபணு நீக்கங்கள் அல்லது அல்லெலிக் பிறழ்வுகளை உருவாக்குவதற்காக மாற்றங்களின் போது புரோட்டோபிளாஸ்ட்களில் ஒரே மாதிரியான மறுசீரமைப்பை அதிகரிக்க αPaKu70 பயன்படுத்தப்படுகிறது. ப்ரோட்டோபிளாஸ்ட்களை நேரியல் டிஎன்ஏவுடன் மாற்றுவதன் மூலம் ஒரு αPaKu70 திரிபு அடையப்படலாம், இது ஒரு ஆண்டிபயாடிக் கேசட்டுடன் பாகூ 70 மரபணுவை பக்கவாட்டில் வைக்கிறது, பின்னர் திரிபுகளைத் தேர்ந்தெடுத்து பிசிஆர் மூலம் சரிபார்க்கப்படுகிறது. எஸ் திரிபிலிருந்து பெறப்பட்டது. எம்என்19 என்பது முதுமையைப் படிக்கப் பயன்படுத்தப்படும் ஒரு நீண்டகால திரிபு ஆகும். இது மாங்கனீசு (எம்என்) மீது வளர்க்கப்படும் திரிபு ஏ +-84-11 இலிருந்து பெறப்படுகிறது. இந்த குறிப்பிட்ட திரிபு தாவர வளர்ச்சியை உள்ளடக்கிய ஒரு இனம் குழாயில் 2 ஆண்டுகளுக்கும் மேலாக வாழ்ந்ததாக தெரிவிக்கப்பட்டுள்ளது. αiδviv என்பது ஒரு அழியாத திரிபு, இது முதுமையின் எந்த அறிகுறியையும் காட்டாது. இது மஞ்சள் நிறமியை உருவாக்குகிறது. காட்டு வகை மற்றும் i இன் பற்றாக்குறையுடன் ஒப்பிடும்போது viv இன் பற்றாக்குறை நாட்களில் ஆயுட்காலம் 2.3 ஆகவும், i இன் பற்றாக்குறை 1.6 ஆகவும் அதிகரித்தது. இருப்பினும், முழு ஆய்வின் போது எந்த முதியுற்ற தன்மையையும் காட்டவில்லை மற்றும் ஒரு வருடத்திற்கும் மேலாக தாவரமாக இருந்தது. இந்த மரபணுக்கள் ஒருங்கிணைந்தவை மற்றும் உடல் ரீதியாக நெருக்கமாக இணைக்கப்பட்டுள்ளன. ஏஎல்2 ஒரு நீண்ட காலம் வாழும் திரிபு ஆகும். அல்-2 கொண்ட லீனியர் மைட்டோகாண்ட்ரியல் பிளாஸ்மிட்டை செருகுவது அதிகரித்த ஆயுட்காலத்தைக் காட்டுகிறது. இருப்பினும், அல்-2 க்கு ஒத்த தன்மையைக் கொண்ட இயற்கையான தனிமைப்படுத்தல்கள் அதிகரித்த ஆயுட்காலத்தைக் காட்டவில்லை. கிரிஸியா என்பது நீண்ட காலம் வாழும் திரிபு மற்றும் செம்பு உறிஞ்சும் பிறழ்வு ஆகும். இந்த திரிபு தாமிரத்துடன் குறைந்த தொடர்பைக் கொண்டுள்ளது, இதனால் செல்களுக்குள் செம்பு அளவுகள் குறைகின்றன, இது சயனைடு-எதிர்ப்பு மாற்று ஆக்சிடேஸ், PAAOX, பாதை (செம்பு சார்ந்த மைட்டோகாண்ட்ரியல் சைட்டோக்ரோம் சி ஆக்சிடேஸ் (COX) வளாகத்திற்கு பதிலாக) பயன்படுத்த வழிவகுக்கிறது. இந்த திரிபு மிகவும் நிலையான எம். டி. டி. என். ஏவையும் வெளிப்படுத்துகிறது. செம்பு பயன்பாடு αx1 திரிபைப் போன்றது. δex1 என்பது ஒரு 'அழியாத திரிபு' ஆகும், இது 12 ஆண்டுகளுக்கும் மேலாக வளர்க்கப்படுகிறது, இன்னும் முதுமையின் அறிகுறிகளைக் காட்டவில்லை. இந்த திரிபு சயனைடு-எதிர்ப்பு, சாலிசைல்ஹைட்ராக்ஸமிக் அமிலம் (SHAM)-உணர்திறன் பாதை வழியாக சுவாசிக்கிறது. இந்த நீக்குதல் COX வளாகத்தை சீர்குலைக்கிறது. வயதான போடோஸ்போரா அன்செரினா ஒரு திட்டவட்டமான ஆயுட்காலத்தைக் கொண்டுள்ளது மற்றும் வயதான தோற்றத்தை (மெதுவான வளர்ச்சி, குறைந்த வான்வழி ஹைபா மற்றும் தொலைதூர ஹைபாவில் அதிகரித்த நிறமி உற்பத்தி மூலம்) காட்டுகிறது. இருப்பினும், தனிமைப்படுத்தப்பட்டவை அதிகரித்த ஆயுட்காலம் அல்லது அழியாமையைக் காட்டுகின்றன, ஏனெனில் வயதான செயல்முறையைப் படிப்பதற்காக அழியாத விகாரங்களை உருவாக்க அல்லது ஆயுட்காலத்தை அதிகரிக்க பல மரபணு கையாளுதல்கள் செய்யப்பட்டுள்ளன. பொதுவாக, மைட்டோகாண்ட்ரியன் மற்றும் மைட்டோகாண்ட்ரியல் குரோமோசோம் ஆய்வு செய்யப்படுகிறது. சுவாசத்தின் போது எதிர்வினையாற்றும் ஆக்ஸிஜன் இனங்கள் உற்பத்தி செய்யப்படுவதால் மூச்சுத்திணறல் ஏற்படுகிறது, அவை ஆயுட்காலத்தை கட்டுப்படுத்துகின்றன மற்றும் காலப்போக்கில் குறைபாடுள்ள மைட்டோகாண்ட்ரியல் டி. என். ஏ குவியலாம். இந்த அறிவின் மூலம், ஊட்டச்சத்து கிடைக்கும் தன்மை, சுவாசம் (ஏடிபி தொகுப்பு) மற்றும் சைட்டோக்ரோம் சி ஆக்சிடேஸ் போன்ற ஆக்சிடேஸ்கள் மீது கவனம் செலுத்தப்பட்டது. கரோட்டினாய்டுகள், தாவரங்களில் காணப்படும் மற்றும் மனிதர்களுக்கு ஆரோக்கிய நன்மைகளை வழங்கும் நிறமிகள், போடோஸ்போராவின் மாறுபட்ட மூதாதையர் நியூரோஸ்போரா க்ராஸா போன்ற பூஞ்சைகளில் இருப்பதாக அறியப்படுகிறது; என். க்ராஸ்ஸாவில் (மற்றும் பிற பூஞ்சைகள்) கார்டெனாய்டுகள் அனைத்து மரபணுக்களும் புற ஊதா கதிர்வீச்சு பாதுகாப்பை வழங்குகின்றன. அல்-2 போடோஸ்போரா அன்செரினாவின் அதிகப்படியான வெளிப்பாடு ஆயுட்காலம் 31 சதவீதம் அதிகரித்துள்ளது. கலோரி கட்டுப்பாடு ஆய்வுகள், சர்க்கரை போன்ற ஊட்டச்சத்துக்களைக் குறைத்தல், ஆயுள் காலம் அதிகரித்தல், மெதுவான வளர்சிதை மாற்றத்தின் காரணமாக இருக்கலாம், இதனால் எதிர்வினை ஆக்ஸிஜன் இனங்கள் உற்பத்தி அல்லது தூண்டப்பட்ட உயிர்வாழும் மரபணுக்கள் குறைந்துள்ளன என்பதைக் காட்டுகின்றன. மேலும், ஊடுருவல் செம்பு அளவுகள் வளர்ச்சியுடன் தொடர்புடையதாக இருப்பது கண்டறியப்பட்டது. இது கிரிஸியா-நீக்கப்பட்ட மற்றும் எக்ஸ் 1-நீக்கப்பட்ட விகாரங்களிலும், அதே போல் ஒரு காட்டு வகை வகைகளிலும் ஆய்வு செய்யப்பட்டது. கிரிசியா இல்லாத போடோஸ்போரா, ஒரு செம்பு டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணி, ஊடுருவல் செம்பு அளவைக் குறைத்தது, இது ஒரு மாற்று சுவாசப் பாதையைப் பயன்படுத்த வழிவகுத்தது, இதன் விளைவாக குறைந்த ஆக்ஸிஜனேற்ற அழுத்தத்தை உருவாக்கியது. பின்வரும் மரபணுக்கள், அல்லெலிக் மற்றும் இணக்கமற்றவை, தாவர இணக்கமின்மையில் ஈடுபடுவதாகக் கண்டறியப்பட்டுள்ளது (குளோன் செய்யப்பட்ட மற்றும் வகைப்படுத்தப்பட்டவை மட்டுமே பட்டியலிடப்பட்டுள்ளன): ஹெட்-சி, ஹெட்-சி, ஹெட்-எஸ், ஐடிஐ-2, ஐடிஐ-1, இடிஐ-3, மோட்-ஏ, மோட்-டி, மோட்-இ, பிஎஸ்பி-ஏ. போடோஸ்போரா அன்செரினாவில் குறைந்தது 9 ஹெட் லோகிகள் உள்ளன. என்சைம்கள் போடோஸ்போரா அன்செரினா லாக்கேஸ்களை உற்பத்தி செய்வதாக அறியப்படுகிறது, இது ஒரு வகை பினோலோக்சிடேஸ் ஆகும். மரபியல் ஜெல் எலக்ட்ரோபோரேசிஸின் அசல் மரபணு ஆய்வுகள் 7 குரோமோசோம்கள் மற்றும் 1 மைட்டோகாண்ட்ரியல் குரோமோசோம் கொண்ட மரபணு அளவு, மெகாபேஸ்கள் ஆகியவற்றைக் கண்டறிய வழிவகுத்தன. 1980களில் மைட்டோகாண்ட்ரியல் குரோமோசோம் வரிசைப்படுத்தப்பட்டது. பின்னர், 2003 ஆம் ஆண்டில், பி. ஏ. சி குளோன்கள் மற்றும் நேரடி வரிசைமுறையைப் பயன்படுத்தி குரோமோசோம் வி இன் சென்ட்ரோமியரின் எல்லையை ஒட்டிய பகுதிகளை வரிசைப்படுத்த ஒரு சோதனை ஆய்வு தொடங்கப்பட்டது. 2008 ஆம் ஆண்டில், ஒரு 10x முழு மரபணு வரைவு வரிசை வெளியிடப்பட்டது. மரபணு அளவு இப்போது 35-36 மெகாபேஸ்களாக மதிப்பிடப்பட்டுள்ளது. குறைந்த ஒத்த மறுசீரமைப்பு செயல்திறன் காரணமாக பூஞ்சைகளில் மரபணு கையாளுதல் கடினம் மற்றும் இது அல்லீல் மாற்றீட்டைப் பயன்படுத்தி மரபணு ஆய்வுகளைத் தடுக்கிறது. 2005 ஆம் ஆண்டில், காஸ்மிட் பிளாஸ்மிட் மாற்றத்தை உள்ளடக்கிய அஸ்பெர்கிலஸ் நிடுலன்களுக்கான மாதிரியின் அடிப்படையில் மரபணு நீக்கத்திற்கான ஒரு முறை உருவாக்கப்பட்டது. 2008 ஆம் ஆண்டில் போடோஸ்போராவுக்கான ஒரு சிறந்த அமைப்பு உருவாக்கப்பட்டது, இது ஹோமோலோகஸ் அல்லாத முனை இணைக்கும் புரதங்கள் (கு (புரதம்), போடோஸ்போராவில் பாகூ 70 என்று அழைக்கப்படுகிறது) இல்லாத ஒரு திரிபைப் பயன்படுத்தி உருவாக்கப்பட்டது. உருமாற்றிகளின் 100% விரும்பிய ஒரே மாதிரியான மறுசீரமைப்புக்கு உட்படுத்தப்படுவதாகக் கூறப்படும் இந்த முறை அல்லெலிக் மாற்றீட்டிற்கு வழிவகுக்கிறது, மேலும் மாற்றத்திற்குப் பிறகு, குறிவைக்கப்பட்ட மரபணு நீக்குதல் அல்லது அல்லெலிக் பரிமாற்றம் (எ. கா. புள்ளி பிறழ்வு). இரண்டாம் நிலை வளர்சிதை மாற்றங்கள் அனைத்து களங்களிலும் உள்ள பல உயிரினங்கள் இரண்டாம் நிலை வளர்சிதை மாற்றங்களை உற்பத்தி செய்கின்றன என்பது அனைவரும் அறிந்ததே, மேலும் இந்த விஷயத்தில் பூஞ்சைகள் ஏராளமாக உள்ளன. 1990 களில் போடோஸ்போரா பேரினத்திற்கான தயாரிப்பு சுரங்கம் நன்கு நடந்து கொண்டிருந்தது. போடோஸ்போரா அன்செரினாவிலிருந்து பென்டகெடைடுகள் என வகைப்படுத்தப்பட்ட இரண்டு புதிய இயற்கை பொருட்கள், குறிப்பாக பென்சோகுயினோன்களின் வழித்தோன்றல்கள் கண்டுபிடிக்கப்பட்டன; இவை பூஞ்சை எதிர்ப்பு, பாக்டீரியா எதிர்ப்பு மற்றும் சைட்டோடாக்ஸிக் செயல்பாடுகளைக் காட்டின. பாக்டீரியாக்கள் மற்றும் புரோக்கரியோட்டுகள் மற்றும் யூகாரியோட்டுகளுக்கு இடையில் கிடைமட்ட மரபணு பரிமாற்றம் பொதுவானது, ஆனால் யூகாரியோடிக் உயிரினங்களுக்கு இடையில் மிகவும் அரிதானது. பூஞ்சைகளுக்கு இடையில், இரண்டாம் நிலை வளர்சிதை மாற்றக் கிளஸ்டர்கள் கிடைமட்ட மரபணு பரிமாற்றத்திற்கு நல்ல வேட்பாளர்கள், எடுத்துக்காட்டாக, ஸ்டெரிக்மாடோசிஸ்டின் உற்பத்தி செய்யும் ஒரு செயல்பாட்டு எஸ். டி மரபணு கிளஸ்டர் போடோஸ்போரா அன்செரினாவில் கண்டறியப்பட்டது மற்றும் முதலில் அஸ்பெர்கிலஸிலிருந்து பெறப்பட்டது. இந்த கிளஸ்டர் நன்கு பாதுகாக்கப்பட்டுள்ளது, குறிப்பாக, டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன்-காரணி பிணைப்பு தளங்கள் உட்பட. ஸ்டெரிக்மாடோசிஸ்டின் தானே நச்சுத்தன்மை வாய்ந்தது மற்றும் மற்றொரு நச்சு வளர்சிதை மாற்றமான அஃப்ளாடாக்சினின் முன்னோடியாகும். மேலும் காண்கஃ பூஞ்சை பிரையன்ஸ் PXMP3 வைரஸ் வகைப்பாடு OLIGO ப்ரைமர் பகுப்பாய்வு மென்பொருள் புள்ளி பிறழ்வு அமிலாய்டு குறிப்புகள் வெளிப்புற இணைப்புகள் லாசியோஸ்பேரியேசி டாக்ஸா 1857 மாதிரி உயிரினங்களில் விவரிக்கப்பட்ட கோட்லோப் லுட்விக் ராபென்ஹார்ஸ்ட் பூஞ்சையால் பெயரிடப்பட்டது