SHIFTCOR
ஷிஃப்ட்கோர் (ஷிப்ட் கரெக்ஷன்) என்பது இலவசமாக கிடைக்கும் வலை சேவையகமாகும், மேலும் புரத வேதியியல் ஷிப்ட் மறு-குறிப்புக்கான தனித்துவமான கணினி நிரலாகும். உயிரியல் மூலக்கூறு என். எம். ஆரில் இரசாயன மாற்றம் குறிப்பு குறிப்பாக பரவலான பிரச்சினையாகும், தற்போதுள்ள என். எம். ஆர் இரசாயன மாற்றம் பணிகளில் 25 சதவீதம் வரை முறையற்ற முறையில் குறிப்பிடப்படுகிறது. இந்த குறிப்பு சிக்கல்களில் சில 1 முதல் 2.5 பிபிஎம் வரை முறையான பிழைகளுக்கு வழிவகுக்கும் (குறிப்பாக 13சி மற்றும் 15என் இரசாயன மாற்றங்களில்). இந்த அளவிலான பிழைகள் புரதங்களுக்கிடையேயான பணிகளை ஒப்பிடுவதற்கான அல்லது வேதியியல் மாற்றங்களை கட்டமைப்பு ரீதியாக விளக்கும் எந்தவொரு முயற்சியிலும் பேரழிவை ஏற்படுத்தும். எந்த புரதங்கள் தவறாக ஒதுக்கப்பட்டுள்ளன அல்லது முறையற்ற முறையில் குறிப்பிடப்பட்டுள்ளன என்பதைக் கண்டறிவது சவாலானது, அதே போல் பிழைகள் கண்டறியப்பட்டவுடன் அவற்றை சரிசெய்ய முடியும். ஷிஃப்ட்கோர் திட்டம் இந்த இரசாயன மாற்ற குறிப்பு சிக்கல்களை அடையாளம் கண்டு சரிசெய்ய உதவும் வகையில் வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளது. குறிப்பாக இது பெப்டைடுகள் மற்றும் புரதங்களின் 1H, 13C மற்றும் 15N முதுகெலும்பு இரசாயன மாற்றங்களை ஒப்பிடுகிறது, அடையாளம் காட்டுகிறது, சரிசெய்கிறது மற்றும் மறுபரிசீலனை செய்கிறது, கவனிக்கப்பட்ட இரசாயன மாற்றங்களை 3D கட்டமைப்பிலிருந்து பெறப்பட்ட கணிக்கப்பட்ட இரசாயன மாற்றங்களுடன் ஒப்பிடுவதன் மூலம் (PDB ஆயத்தொகுதிகளைப் பயன்படுத்தி) ஆர்வமுள்ள புரதத்தின் (கள்) [1]. கணிக்கப்பட்ட இரசாயன மாற்றங்கள் ஷிஃப்ட்எக்ஸ் நிரலைப் பயன்படுத்தி கணக்கிடப்படுகின்றன. ஷிஃப்ட்கோர் திட்டம் முதலில் ரெஃப்டிபி எனப்படும் ஒழுங்காக மறு-குறிப்பிடப்பட்ட புரத வேதியியல் ஷிப்ட் பணிகளின் தரவுத்தளத்தை உருவாக்க பயன்படுத்தப்பட்டது. ரெஃப்டிபி என்பது 2000 க்கும் மேற்பட்ட சரியாக குறிப்பிடப்பட்ட புரத வேதியியல் ஷிப்ட் பணிகளின் வலை அணுகக்கூடிய தரவுத்தளமாகும். முதலில் ஒரு தனித்த நிரலாக மட்டுமே கிடைத்தாலும், ஷிஃப்ட்கோர் பின்னர் ஒரு வலை சேவையகமாக பொதுவான பயன்பாட்டிற்காக வெளியிடப்பட்டது. கெமிக்கல் ஷிப்ட் என்எம்ஆர் புரோட்டீன் ஸ்ட்ரக்சர் டேட்டாபேஸ் புரோட்டீன் கெமிக்கல் ஷிப்ட் ரீ-ரெஃபரன்சிங் புரோட்டீன் செகண்டரி ஸ்ட்ரக்சர் புரோட்டீன் கெமிக்கல் ஷிப்ட் பிரடிக்ஷன் கெமிக்கல் ஷிப்ட் இன்டெக்ஸ் புரோட்டீன் என்எம்ஆர் ரெஃபரன்ஸ் வெளிப்புற இணைப்புகள் ஷிப்ட்எக்ஸ் ரெஃப்டிபி நியூக்ளியர் காந்த அதிர்வு மென்பொருள் புரோட்டீன் முறைகள் புரோட்டீன் ஸ்ட்ரக்சர் பயோபிசிக்ஸ் வேதியியல் மென்பொருள் உயிரியல் தரவுத்தளங்கள்