Protein fold class
மூலக்கூறு உயிரியலில், புரத மடிப்பு வகுப்புகள் புரத மூன்றாம் நிலை கட்டமைப்பு இடவியலின் பரந்த பிரிவுகளாகும். ஒத்த அமினோ அமிலம் மற்றும் இரண்டாம் நிலை கட்டமைப்பு விகிதாச்சாரங்களைப் பகிர்ந்து கொள்ளும் புரதங்களின் குழுக்களை அவை விவரிக்கின்றன. ஒவ்வொரு வகுப்பிலும் பல, சுயாதீனமான புரத சூப்பர் குடும்பங்கள் உள்ளன (அதாவது. அவை ஒருவருக்கொருவர் பரிணாம ரீதியாக தொடர்புடையவை அல்ல). பொதுவாக அங்கீகரிக்கப்பட்ட வகுப்புகள் புரதத்தின் நான்கு பெரிய வகுப்புகள் பொதுவாக இரண்டு முக்கிய கட்டமைப்பு வகைப்பாடு தரவுத்தளங்களால் (எஸ். சி. ஓ. பி மற்றும் கேத்) ஒப்புக் கொள்ளப்படுகின்றன. ஆல்-α ஆல்-α புரதங்கள் என்பது கட்டமைப்பு களங்களின் ஒரு வகுப்பாகும், இதில் இரண்டாம் நிலை அமைப்பு முற்றிலும் α-ஹெலிச்களால் ஆனது, சுற்றுவட்டாரத்தில் ஒரு சில தனிமைப்படுத்தப்பட்ட β-தாள்களைத் தவிர. பொதுவான எடுத்துக்காட்டுகளில் புரோமோடோமைன், குளோபின் மடிப்பு மற்றும் ஹோமியோடோமைன் மடிப்பு ஆகியவை அடங்கும். ஆல்-β ஆல்-β புரதங்கள் என்பது கட்டமைப்பு களங்களின் ஒரு வகுப்பாகும், இதில் இரண்டாம் நிலை அமைப்பு முற்றிலும் β-தாள்களால் ஆனது, சுற்றுவட்டாரத்தில் ஒரு சில தனிமைப்படுத்தப்பட்ட α-ஹெலிஸ்களைத் தவிர. எஸ்எச்3 களம், பீட்டா-உந்துசக்தி களம், இம்யூனோகுளோபூலின் மடிப்பு மற்றும் பி3 டிஎன்ஏ பிணைப்பு களம் ஆகியவை பொதுவான எடுத்துக்காட்டுகளாகும். α + βα + β புரதங்கள் என்பது கட்டமைப்பு களங்களின் ஒரு வகுப்பாகும், இதில் இரண்டாம் நிலை அமைப்பு α-ஹெலிசஸ் மற்றும் β-ஸ்ட்ராண்ட்களால் ஆனது, அவை முதுகெலும்பு வழியாக தனித்தனியாக நிகழ்கின்றன. எனவே β-இழைகள் பெரும்பாலும் எதிர் இணையாக உள்ளன. பொதுவான எடுத்துக்காட்டுகளில் ஃபெரெடாக்ஸின் மடிப்பு, ரிபோநியூக்ளீஸ் ஏ மற்றும் எஸ். எச் 2 களம் ஆகியவை அடங்கும். α/βα/β புரதங்கள் என்பது கட்டமைப்பு களங்களின் ஒரு வகுப்பாகும், இதில் இரண்டாம் நிலை அமைப்பு முதுகெலும்பு வழியாக மாறி மாறி α-ஹெலிசஸ் மற்றும் β-ஸ்ட்ராண்ட்களால் ஆனது. எனவே β-இழைகள் பெரும்பாலும் இணையாக உள்ளன. ஃபிளாவோடொக்சின் மடிப்பு, டிஐஎம் பீப்பாய் மற்றும் ரிபோநியூக்ளீஸ் இன்ஹிபிட்டர் போன்ற லியூசின் நிறைந்த-மீண்டும் மீண்டும் (எல்ஆர்ஆர்) புரதங்கள் பொதுவான எடுத்துக்காட்டுகளில் அடங்கும். கூடுதல் வகுப்புகள் மெம்பிரேன் புரதங்கள் மெம்பிரேன் புரதங்கள் உயிரியல் சவ்வுகளுடன் செருகுவதன் மூலம் அல்லது சகப்பிணைப்புடன் இணைக்கப்பட்ட கொழுப்பு வழியாக இணைக்கப்படுவதன் மூலம் தொடர்பு கொள்கின்றன. கரையக்கூடிய குளோபுலர் புரதங்கள், நார்ச்சத்து புரதங்கள் மற்றும் ஒழுங்கற்ற புரதங்களுடன் அவை பொதுவான புரத வகைகளில் ஒன்றாகும். அனைத்து நவீன மருத்துவ மருந்துகளிலும் 50 சதவீதத்திற்கும் அதிகமானவற்றின் இலக்காக அவை உள்ளன. பெரும்பாலான மரபணுக்களில் உள்ள அனைத்து மரபணுக்களிலும் 20-30% சவ்வு புரதங்களை குறியாக்கம் செய்கிறது என்று மதிப்பிடப்பட்டுள்ளது. உட்புற ஒழுங்கற்ற புரதங்கள் உட்புற ஒழுங்கற்ற புரதங்கள் ஒரு நிலையான அல்லது வரிசைப்படுத்தப்பட்ட முப்பரிமாண கட்டமைப்பைக் கொண்டிருக்கவில்லை. இடுபொருள்கள் முழுமையாக கட்டமைக்கப்படாதவை முதல் ஓரளவு கட்டமைக்கப்பட்டவை வரை நிலைகளின் நிறமாலையை உள்ளடக்கியது மற்றும் சீரற்ற சுருள்கள், (முன்-) உருகிய கோளங்கள் மற்றும் நெகிழ்வான இணைப்பிகளால் இணைக்கப்பட்ட பெரிய பல கள புரதங்கள் ஆகியவை அடங்கும். அவை புரதத்தின் முக்கிய வகைகளில் ஒன்றாகும் (குளோபுலர், ஃபைப்ரஸ் மற்றும் மெம்பரேன் புரதங்களுடன்). சுருள் சுருள் புரதங்கள் சுருள் சுருள் புரதங்கள் செல்களுக்கு வெளியே உள்ள மேட்ரிக்ஸில் ஈடுபடும் நீண்ட, கரையாத இழைகளை உருவாக்குகின்றன. கெராட்டின், கொலாஜன், எலாஸ்டின் மற்றும் ஃபைப்ரோயின் உள்ளிட்ட பல ஸ்க்லெரோபுரோட்டின் சூப்பர்ஃபேமிலிகள் உள்ளன. அத்தகைய புரதங்களின் பாத்திரங்களில் பாதுகாப்பு மற்றும் ஆதரவு, இணைப்பு திசு, தசைநாண்கள், எலும்பு மேட்ரிக்ஸ் மற்றும் தசை நார்ச்சத்து ஆகியவை அடங்கும். சிறிய புரதங்கள் சிறிய புரதங்கள் பொதுவாக ஒரு மூன்றாம் நிலை கட்டமைப்பைக் கொண்டுள்ளன, அவை டைசல்பைடு பாலங்கள் (சிஸ்டைன் நிறைந்த புரதங்கள்), உலோக ஈந்தணைவிகள் (உலோக-பிணைப்பு புரதங்கள்) மற்றும் ஹீம் போன்ற இணை காரணிகளால் பராமரிக்கப்படுகின்றன. வடிவமைக்கப்பட்ட புரதங்கள் பல புரத கட்டமைப்புகள் பகுத்தறிவு வடிவமைப்பின் விளைவாகும் மற்றும் இயற்கையில் இல்லை. புரதங்கள் புதிதாக வடிவமைக்கப்படலாம் அல்லது அறியப்பட்ட புரத அமைப்பு மற்றும் அதன் வரிசையில் கணக்கிடப்பட்ட மாறுபாடுகளைச் செய்வதன் மூலம் வடிவமைக்கப்படலாம் (புரத மறுவடிவமைப்பு என்று அழைக்கப்படுகிறது). பகுத்தறிவு புரத வடிவமைப்பு அணுகுமுறைகள் குறிப்பிட்ட கட்டமைப்புகளுக்கு மடிக்கும் புரத-வரிசை கணிப்புகளை உருவாக்குகின்றன. இந்த கணிக்கப்பட்ட வரிசைகள் பின்னர் பெப்டைட் தொகுப்பு, தளத்தால் இயக்கப்படும் பிறழ்வு அல்லது செயற்கை மரபணு தொகுப்பு போன்ற முறைகள் மூலம் சோதனை ரீதியாக சரிபார்க்கப்படலாம். புரோட்டீன் சூப்பர்ஃபேமிலி SCOP தரவுத்தள CATH தரவுத்தள FSSP தரவுத்தள குறிப்புகள் புரோட்டீன் மடிப்புகளையும் பார்க்கவும்