METTL26
METTL26, முன்பு C16orf13 என பெயரிடப்பட்டது, இது மெத்தில் டிரான்ஸ்ஃபெரேஸ் லைக் 26 க்கான புரத-குறியீட்டு மரபணு ஆகும், இது JFP2 என்றும் அழைக்கப்படுகிறது. இந்த மரபணுவின் செயல்பாடு தெரியவில்லை என்றாலும், பல்வேறு புற்றுநோய் திசுக்களில் இது அதிக அளவில் வெளிப்படுத்தப்படுவதாக பல்வேறு தரவுகள் வெளிப்படுத்தியுள்ளன. இந்த மரபணுவின் வெளிப்பாட்டின் வெளிப்பாடு மனிதர்களில் நோய் விளைவுகளுடன் இணைக்கப்பட்டுள்ளது. மரபணு METTL26 மனிதர்களில் குரோமோசோம் 16 இன் குறுகிய கையில், பதின்மூன்றாவது திறந்த வாசிப்பு சட்டகத்தில் அமைந்துள்ளது. 1, 2, 3, 4 மற்றும் 7 என பெயரிடப்பட்ட இந்த மரபணுவின் ஐந்து டிரான்ஸ்கிரிப்ட் வகைகள் உள்ளன. மிக நீளமான சிடிஎன்ஏ டிரான்ஸ்கிரிப்ட் (டிரான்ஸ்கிரிப்ட் மாறுபாடு 1) 854 அடிப்படை ஜோடிகளைக் கொண்டுள்ளது. இந்த டிரான்ஸ்கிரிப்ட் ஆறு எக்ஸான்களால் ஆனது, இவை அனைத்தும் புரதத்தில் சேர்க்கப்பட்டுள்ள முக்கிய சூப்பர் குடும்பமான மெத்தில் டிரான்ஸ்ஃபெரேஸ்கள் சூப்பர் குடும்பத்திற்கு பங்களிக்கின்றன. இந்த மரபணுவின் முதன்மை டிரான்ஸ்கிரிப்ட் 1,919 அடிப்படை ஜோடிகள் நீளமானது. டாட்லெட் நிரலைப் பயன்படுத்தி, மனித மரபணுவை அதன் சிம்பன்சி ஆர்த்தோலாகுடன் ஒப்பிடுகையில் ஒரு புள்ளி பிளாட் கட்டப்பட்டது. கதைக்களம் மரபணுவின் தொடக்கத்திலும் முடிவிலும் வரிசை பாதுகாப்பைக் குறிக்கிறது, இது 5 'மற்றும் 3' மொழிபெயர்க்கப்படாத பகுதிகளில் பாதுகாப்பு மற்றும் ஒற்றுமையைக் குறிக்கிறது. 5 'யு. டி. ஆர் மற்றும் 3' யு. டி. ஆரில் உள்ள இந்த வரிசை ஒற்றுமை கடந்தகால பாலூட்டி இனங்களை விரிவுபடுத்தவில்லை, மேலும் மனித மரபணுவின் டாட் பிளாட்டில் தொலைதூர தொடர்புடைய இனங்களான செனோப்பஸ் டிராபிகலிஸ் போன்றவற்றுடன் கிட்டத்தட்ட எந்த ஒற்றுமையும் இல்லை. எஸ். டி. எஸ். சி உயிரியல் பணிமனையை பயன்படுத்தி நடத்தப்பட்ட பல வரிசை சீரமைப்பு, மரபணுவின் மேல் பகுதியில் உள்ள விலங்கினங்களை விட தொலைதூரத்தில் உள்ள உயிரினங்களிடையே சிறிய வரிசை ஒற்றுமையை வெளிப்படுத்துகிறது. மனித C16orf13 மரபணுவில் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் தளத்தின் தொடக்கத்திற்கு அருகில், மேல்நோக்கிய தரவு கிடைக்கக்கூடிய விலங்கினங்களிடையே அதிக பாதுகாப்பு உள்ளது, குறிப்பாக மனித, ஒராங்குட்டன் மற்றும் ரீசஸ் குரங்கு C16orf13 மரபணு ஆர்த்தலாக்ஸ். விலங்கினங்களிடையே உயர் வரிசை ஒற்றுமை விளம்பரதாரர் பகுதி, 5 'யு. டி. ஆர் மற்றும் சி 16ஆர்ஃப் 13 மரபணு முழுவதும் தெளிவாகத் தெரிகிறது. கீழே உள்ள வரைபடம் C16orf13 டிரான்ஸ்கிரிப்ட் மாறுபாடு 1 க்கான தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட மரபணு ஆர்த்தோலாக்களைக் காட்டுகிறது. இந்தத் தரவுகள் NCBI BLAST இலிருந்து சேகரிக்கப்படுகின்றன. திசு விநியோகம் என். சி. பி. ஐ யுனிஜீனில் இருந்து மனித வெளிப்பாடு சுயவிவரம் இந்த மரபணு உடலில் உள்ள பல்வேறு திசுக்களில் பரவலான வெளிப்பாட்டைக் கொண்டுள்ளது என்று கூறுகிறது. இந்த வெளிப்பாடு சுயவிவரம் இந்த மரபணு ஒரு "வீட்டு பராமரிப்பு மரபணு" என்று கூறுகிறது, இது திசுக்களைப் பொருட்படுத்தாமல் அனைத்து உயிரணுக்களிலும் முக்கியமான விளைவுகளை ஏற்படுத்துகிறது. அட்ரீனல் சுரப்பி, நுரையீரல் மற்றும் பாராதைராய்டு ஆகியவற்றில் மிக உயர்ந்த அளவிலான வெளிப்பாடு தோன்றுகிறது. இந்த மிக உயர்ந்த மூன்று இடங்களைத் தவிர பல கூடுதல் தளங்கள் உள்ளன, அங்கு மரபணு உயர் மட்டங்களில் வெளிப்படுத்தப்படுகிறது. மரபணு வெளிப்படுத்தப்படாத சில திசுக்களில் உண்மையான ஒற்றுமை இல்லை என்று தெரிகிறது. கிட்டத்தட்ட அனைத்து உயிரணுக்களின் "வீட்டு பராமரிப்பு" செயல்பாட்டில் மரபணு ஈடுபட்டுள்ளது என்பதைக் குறிப்பிடுவதைத் தவிர, இந்த வெளிப்பாடு தரவு குறிப்பிட்ட செயல்பாட்டிற்கு எந்த தடயத்தையும் தருவதாகத் தெரியவில்லை. C16orf13 மரபணு குரோமோசோம் 16 இன் முடிவில் அமைந்துள்ளது, இது நீக்குதல் பிறழ்வுகளுக்கு உட்பட்டது. C16orf13 மரபணுவைச் சுற்றியுள்ள மரபணுக்களில் வலதுபுறத்தில் கற்பனையான புரதம் LOC100287175 மற்றும் LOC100138285 மற்றும் இடதுபுறத்தில் RaB40C மற்றும் WFIKN1 ஆகியவை அடங்கும். இந்த மரபணு LOC100138285 உடன் மைனஸ் ஸ்ட்ராண்டில் அமைந்துள்ளது. சுற்றியுள்ள மற்ற மரபணுக்கள் பிளஸ் ஸ்ட்ராண்டில் எதிர் வழியில் அமைந்துள்ளன. மரபணு சுற்றுப்புறம் கீழே உள்ள திட்டவட்டத்தில் குறிப்பிடப்பட்டுள்ளது, முதலில் NCBI மரபணுவிலிருந்து. புரதம் இந்த மரபணு குறியீடு செய்யும் புரதம் யுபிஎஃப்0585 என்று அழைக்கப்படுகிறது, அங்கு யுபிஎஃப் அறியப்படாத புரத செயல்பாட்டைக் குறிக்கிறது. இந்த புரதத்தின் ஐந்து ஐசோஃபார்ம்கள் உள்ளன, அவை மரபணுவின் ஐந்து ஸ்ப்லைஸ் வகைகளுடன் தொடர்புடையவை. ஐசோஃபார்ம்களுக்கு a, b, c, d மற்றும் g என்று பெயரிடப்பட்டுள்ளது மேலே குறிப்பிட்டுள்ளபடி, இந்த அமினோ அமில வரிசையின் BLAST தேடலில் கண்டறியப்பட்ட பாதுகாக்கப்பட்ட களம் ஒரு மெத்தில் டிரான்ஸ்ஃபெரேஸ் சூப்பர்ஃபேமிலி ஆகும். பாதுகாப்பு எஸ். டி. எஸ். சி உயிரியல் பணிமனையில் உள்ள புரதக் கருவிகளைப் பயன்படுத்தி நடத்தப்படும் பல வரிசை சீரமைப்பு, மெத்தில் டிரான்ஸ்ஃபெரேஸ் களத்திற்கான குறியீட்டிற்கு அறியப்பட்ட பிராந்தியத்தில், ஆர்க்கியா வரை தொலைதூர தொடர்புடைய புரத ஆர்த்தோலாக்களுக்கிடையே சில வரிசை ஒற்றுமையை வெளிப்படுத்துகிறது. புரதத்தின் மெத்தில் டிரான்ஸ்ஃபெரேஸ் சூப்பர்ஃபேமிலி பகுதி பல்வேறு வகையான இனங்களில் மிகவும் நெருக்கமாக தொடர்புடைய ஆர்த்தோலோகஸ் புரதங்களில் மிகவும் பாதுகாக்கப்பட்டதாகத் தெரிகிறது. C16orf13 பூஞ்சை மற்றும் தாவரங்களில் உள்ள தொலைதூர ஆர்த்தோலாக்கள் உட்பட பல இனங்களில் ஹோமோலோக்குகளைக் கொண்டுள்ளது. இந்த புரதத்தின் அறியப்பட்ட இணைப்புகள் எதுவும் இல்லை இந்த மரபணுவும் அதன் புரதமும் விலங்கினங்கள் மற்றும் பாலூட்டிகளில், குறிப்பாக செயல்பாட்டு மெத்தில் டிரான்ஸ்ஃபெரேஸ் களத்தில் மிகவும் பாதுகாக்கப்பட்டுள்ளன. கீழே உள்ள வரைபடம் C16orf13 டிரான்ஸ்கிரிப்ட் மாறுபாடு 1 க்கான தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட புரத ஆர்த்தோலாக்களைக் காட்டுகிறது. இந்தத் தரவுகள் NCBI BLAST இலிருந்து சேகரிக்கப்படுகின்றன. முன்னறிவிக்கப்பட்ட பண்புகள் புரதத்திற்குள் ஆல்பா ஹெலிஸ்கள் மற்றும் பீட்டா தாள்கள் ஏற்படுவதைக் கணிக்க வழிமுறைகளைப் பயன்படுத்தி புரதத்தின் இரண்டாம் நிலை கட்டமைப்பைக் கணிக்க முடியும். புரத அமைப்பு பற்றிய பகுப்பாய்வு SDSC உயிரியல் பணிமனையில் CHOFAS, GOR4 மற்றும் PELE வழிமுறைகளைப் பயன்படுத்தி நடத்தப்பட்டது. பகுப்பாய்வுகள் ஒருங்கிணைக்கப்பட்டு அருகிலுள்ள வரைபடத்தில் சேர்க்கப்பட்டன. ஒன்றுக்கு மேற்பட்ட வெளியீடுகளில் தோன்றிய கட்டமைப்புகள் மட்டுமே சேர்க்கப்பட்டன. இந்த புரதத்திற்கு அறியப்பட்ட சில தொடர்புகள் உள்ளன. ஜெனீகார்ட்ஸ் தரவுத்தளத்திலோ அல்லது MINT தரவுத்தளத்திலோ எந்த தொடர்புகளும் காணப்படவில்லை. ஒரு ஸ்டிரிங் தேடலின் விளைவாக இரண்டு மரபணு வெளியீடுகள் ஏற்பட்டன. இருப்பினும், இந்த இரண்டு மரபணு தொடர்புகளும் மரபணு சுற்றுப்புறத்தின் சான்றுகள் பிரிவில் உள்ளன, இது இந்த மரபணுக்கள் எந்தவொரு அர்த்தமுள்ள வழியிலும் தொடர்பு கொள்கின்றன அல்லது ஒரே நேரத்தில் வெளிப்படுத்தப்படுகின்றன என்பதைக் குறிக்க வேண்டிய அவசியமில்லை. இந்த புரதத்துடனான தொடர்புகளுக்கு தற்போது வலுவான சான்றுகள் எதுவும் இல்லை. மைக்ரோஅரே சோதனைகளின் நோய் இணைப்பு தரவு இந்த மரபணுவின் வெளிப்பாட்டை பல்வேறு திசுக்களில், குறிப்பாக மார்பக மற்றும் இரைப்பை புற்றுநோயுடன் இணைத்துள்ளது. கூடுதலாக, இந்த மரபணுவின் வெளிப்பாட்டின் கீழ் நோய், குறிப்பாக இணைப்பு திசு நோய், ஊட்டச்சத்து மற்றும் வளர்சிதை மாற்றக் கோளாறுகள் மற்றும் செரிமானக் கோளாறுகள் ஆகியவற்றுடன் இணைக்கப்பட்டுள்ளது. கேன்எஸ்ஏஆர் பணிமனை தரவுத்தளம் மனித குரோமோசோம் 16 இல் உள்ள பல்வேறு புற்றுநோய்கள் குறிப்புகள் மரபணுக்களுடன் சி16ஆர்எஃப்13 மரபணுவின் வெளிப்பாட்டின் மேல் அல்லது கீழ் இணைக்கக்கூடிய மைக்ரோ அரே தரவை வெளிப்படுத்துகிறது.