FAM193A
வரிசை ஒற்றுமை கொண்ட குடும்பம் 193 உறுப்பினர் ஏ என்பது மனிதர்களில் குரோமோசோம் 4 இன் லோகஸ் p16.3 இல் அமைந்துள்ள எஃப்ஏஎம்193ஏ மரபணுவால் குறியிடப்பட்ட ஒரு புரதமாகும். FAM193A ஆனது C4orf8, குரோமோசோம் 4 திறந்த வாசிப்பு சட்டகம் 8, RES 4-22, புரதம் IT143, மற்றும் கற்பனையான புரதம் LOC86032 என்றும் அழைக்கப்படுகிறது. என்செம்பிளைப் பயன்படுத்தி எஃப்ஏஎம்193ஏ மரபணு முழுவதும் ஸ்ப்ளைசிங்கின் மாறுபாட்டை ஒப்பிடுகையில், 11 டிரான்ஸ்கிரிப்ட்கள் கண்டறியப்பட்டன, அவற்றில் மூன்று தவறான அல்லது துண்டிக்கப்பட்ட புரதங்கள் மற்றும் இரண்டு சி. டி. எஸ் அல்லாத டிரான்ஸ்கிரிப்ட்களிலிருந்து இன்ட்ரான்கள் தக்கவைக்கப்பட்டன. குறிப்பிடப்பட்ட அனைத்து டிரான்ஸ்கிரிப்ட்களும் எக்ஸான் 1 ஐப் பொறுத்தவரை ஒரே தொடக்க புள்ளியை வெளிப்படுத்துகின்றன. இந்த தொடர்ச்சி 5 'யு. டி. ஆர் முழுவதும் அனைத்து மாற்று ஸ்ப்லைஸ் எம். ஆர். என். ஏக்களிலும் காணப்படுகிறது, ஸ்ப்லைஸ் மாறுபாடு 4 இல் தவிர. வெளிப்படுத்தப்பட்ட புரதத்திற்குள் மூன்று பகுதிகள் உள்ளன, அவை மையக்கருத்துக்களைக் கொண்டிருக்கலாம்; ஒரு சுருள்-சுருளுக்குள் லியூசின் சிப்பர். இந்த மூன்று மையக்கருத்துக்களும் எக்ஸான் 5,16 மற்றும் 17 க்குள் உள்ளன. பகுதிகள் வெளிப்படுத்தப்படுகின்றன அல்லது முற்றிலும் தவறவிடப்படுகின்றன மற்றும் பிற பகுதிகள் வெளிப்படுத்தப்படுகின்றன. திசு விநியோகம் FAM193A என்ற மரபணு அதன் EST சுயவிவரம் Hs.652364 இலிருந்து, கரு, நிணநீர் முனை, நரம்பு, கருப்பை, விந்தணு, குரல்வளை திசுக்கள் மற்றும் ஓரளவு இரத்தத்தில் உள்ள புள்ளியின் தீவிரத்தை பரிசோதிப்பதன் மூலம் மிக ஏராளமாக வெளிப்படுத்தப்படுகிறது. மரபணு பல சுகாதார நிலைகள் மூலம் வெளிப்படுத்தப்படுகிறது, எடுத்துக்காட்டாக, அட்ரீனல், காண்ட்ரோசார்கோமா மற்றும் கருப்பை கட்டிகள், இது மென்மையான திசு/தசை திசு கட்டிகளிலும் சிக்கியுள்ளது. பிரசவத்திற்கு முந்தைய எல். சி. எம் மைக்ரோஅரே தரவுகளுக்குள் BRAINSPAN.org இலிருந்து ஒரு மைக்ரோஅரே மூளை முழுவதும் எங்கும் மனிதர்களில் எஃப்ஏஎம்193ஏ வெளிப்பாட்டின் மிகுதியைக் காட்டுகிறது. மூன்று ஆய்வுகளில் ஒன்று FAM193A (A _ 24 _ P126465) இன் மிகக் குறைந்த மரபணு வெளிப்பாட்டைக் காட்டியது. மைக்ரோஅரேயில் இருந்து சமிக்ஞை தீவிரத்தைப் பொறுத்தவரை மிக முக்கியமான கட்டமைப்புகள்; ஆக்ஸிபிடல் லோப், ஹிப்போகாம்பல் உருவாக்கம், குளோபஸ் பாலிடஸ், பாராஹிப்போகாம்பல் கைரஸ், அமிக்டாலா, ஆனால் இன்சுலாவில் ஒப்பீட்டளவில் சிறிய வெளிப்பாடு. ஒழுங்குமுறை FAM193A வெளியிடப்பட்ட இலக்கியங்களிலிருந்து தொகுக்கப்பட்ட பல குறிப்பிட்ட இரசாயன-மரபணு தொடர்புகளைக் கொண்டுள்ளது. இயற்கையாக நிகழும் மைக்கோடாக்சின், அஃப்ளாடாக்சினுடனான தொடர்புகள், நாள்பட்ட கொறித்துண்ணிகள் உயிரியல் மதிப்பீடுகளைப் பயன்படுத்துவதன் மூலம் மதிப்பிடப்பட்ட புற்றுநோய் திறனுக்காக ஆராயப்பட்டது. இந்த கலவை FAM193A mRNA இன் வெளிப்பாட்டை அதிகரிக்கிறது மற்றும் படிநிலைக் கிளஸ்டரிங் மூலம் இந்த மரபணுவை மேக்ரோ மூலக்கூறுகள், செல்லுலார் அமைப்பு மற்றும் ஒழுங்குமுறை தொடர்பான செயல்முறைகளில் உட்படுத்துகிறது. டைஹைட்ரோடெஸ்டோஸ்டிரோன் என்பது ஆண் பாலியல் ஹார்மோனின் ஆண்ட்ரோஜன் ஆகும். புரோஸ்டேட் செல்களின் பராமரிப்பு மற்றும் வளர்ச்சியில் ஆண்ட்ரோஜன் முக்கிய பங்கு வகிக்கிறது. 6, 24 மற்றும் 48 மணி நேரம் டைஹைட்ரோடெஸ்டோஸ்டிரோன் மற்றும் பைக்கலுடமைடு ஆகியவற்றுடன் சிகிச்சையளிக்கப்பட்ட புரோஸ்டேட் புற்றுநோய் செல் லைன் எல். என். சி. ஏ. பி ஐப் பயன்படுத்தி ஒரு ஆய்வில், ஆராய்ச்சியாளர்கள் 56 வெவ்வேறு டிரான்ஸ்கிரிப்ட்களை பதிவு செய்தனர், அவை டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணிகள், செல் சுழற்சி கட்டுப்பாட்டாளர்கள், வளர்சிதை மாற்ற நொதிகள் மற்றும் கற்பனையான புரதங்களுக்கு ஒத்த தன்மையைக் காட்டின. இவற்றில் FAM193A மரபணு வெளிப்பாடு 48 மணி நேரத்திற்கு டைஹைட்ரோடெஸ்டோஸ்டிரோன் முன்னிலையில் கட்டுப்படுத்தப்படுகிறது. NCBI இன் cBLAST ஐப் பயன்படுத்தி கட்டமைப்பு ஐந்து கட்டமைப்புகள் FAM193A உடன் ஓரளவு சீரமைக்கப்பட்டுள்ளன. கட்டமைப்புகளில் இரண்டு மட்டுமே சங்கிலி ஏ, ஆர். என். ஏ பாலிமரேஸ் Ii ஸ்கிசோசாக்கரோமைசஸ் பாம்பே மற்றும் சங்கிலி ஏ ட்ரோபோமயோசின் ஆகியவற்றிலிருந்து பரிசோதிக்கப்பட்டன. வளர்ந்து வரும் ஈஸ்ட் Saccharomyces cerevisiae இன் நொதியின் முந்தைய கட்டமைப்புடன் ஒப்பிடுவது தொடக்க தளத் தேர்வு மற்றும் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணி தொடர்புகளில் சிக்கியுள்ள பகுதிகளில் உள்ள வேறுபாடுகளை வெளிப்படுத்துகிறது. டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் பொறிமுறையின் இந்த அம்சங்கள் எஸ். பாம்பே மற்றும் எஸ். செரிவிசியே இடையே வேறுபடுகின்றன, ஆனால் அவை எஸ். பாம்பே மற்றும் மனிதர்களிடையே பாதுகாக்கப்பட்டுள்ளன. கட்டமைப்பு வேறுபாடுகளுக்கு வெளிப்படையாக காரணமாக இருக்கும் அமினோ அமில மாற்றங்கள் எஸ். பாம்பே மற்றும் மனிதர்களிடையே பாதுகாக்கப்பட்டுள்ளன, இது எஸ். பாம்பே அமைப்பு மனித நொதிக்கு ஒரு நல்ல வாடகையாக இருக்கலாம் என்று பரிந்துரைக்கிறது. FAM193A இன் கணிக்கப்பட்ட இரண்டாம் நிலை அமைப்பு predictprotein.org மூலம் பரிசோதிக்கப்பட்டது, எஞ்சியுள்ளவற்றில் 3/4 க்கும் மேற்பட்டவை அவற்றின் மேற்பரப்பில் 16 சதவீதத்திற்கும் அதிகமாக வெளிப்படுத்துகின்றன என்பதைக் காட்டுகிறது. இந்த நிரல் FAM193A தோராயமாக 1⁄2 ஆல்பா ஹேலிகல் என்பதைக் காட்டுகிறது. ஒரு புதிய மரபணு, IRIZIO உள்ளது, இது PAX3-FOXO1 இணைவு மரபணுவுடன் ஒத்துழைக்கிறது மற்றும் குழந்தைகளில் ராப்டோமியோசார்கோமஜெனிசிஸுக்கு பங்களிக்கக்கூடும். இந்த புதிய மரபணு தேசிய உயிரி தொழில்நுட்ப தகவல் அடிப்படை உள்ளூர் சீரமைப்பு தேடல் கருவியைப் பயன்படுத்தி FAM193 A க்கு ஒத்ததாக உள்ளது, இது ஒட்டுமொத்தமாக 53 சதவீதம் ஒத்த தன்மையை வெளிப்படுத்தியது. மேலும், இரண்டு புரதங்களின் கடைசி 76 அமினோ அமிலங்களில் (89 சதவீதம் ஒத்த தன்மை) மிக உயர்ந்த ஒற்றுமை உள்ளது. குவான்டிடேட்டிவ் ட்ரேட் லோகஸ் குவான்டிடேட்டிவ் ட்ரேட் லோகஸ்ஃ தொடர்புடைய மரபணுக்கள் ஆர்த்தோலாக்ஸ் ப்ரைமேட்ஸ், சிம்ப் மற்றும் கிப்பன், மனிதர்கள் தொடர்பாக ஆர்த்தோலாக்ஸ் புரதங்களின் மிக நெருக்கமான குழுவைக் குறிக்கின்றன (E வரம்பு = 0.0-0.0), இவை மற்றவற்றுடன் பல வரிசை சீரமைப்பை (MSA) உருவாக்க பயன்படுத்தப்பட்டன. மனிதர்களுக்கு மிக நெருக்கமான கிளேடுகளின் எம். எஸ். ஏ அனைத்தும் ஒரே நகல் நிகழ்வின் கீழ் விழுந்தன. பறவை (ஜீப்ரா ஃபிஞ்ச், கோழி, வான்கோழி) மற்றும் மீன் (ஜீப்ரா மீன், பஃபர்ஃபிஷ்). நகல் நிகழ்வுக்கு முன்பு இந்த புரதத்தை அடைந்த விலங்குகள் அவை. இவை மனித மரபணுவிற்கு எதிராக பிளாஸ்டிங் செய்வதன் மூலம் கண்டறியப்பட்டன. மனித மரபணுவிற்கு எதிராக பி. எல். ஏ. எஸ். டி. பி. யைத் தேடும் ஆர். என். ஏ டிரான்ஸ்கிரிப்ட்கள் முக்கியத்துவம் வாய்ந்த முடிவுகளைத் தரவில்லை. இதேபோல், BLASTp ஐப் பயன்படுத்தி தொலைதூர தொடர்புடைய விலங்குகள் கண்டுபிடிக்கப்பட்டன, ஆனால் பொருந்திய புரத வரிசைகளில், சிறிய பகுதிகள் மட்டுமே FAM193A உடன் தொடர்புடையவை. ஒரு இணைப்பிற்கான ஆதரவான FAM193B, FAM193A இன் C-முனைய முடிவுக்கு ஒத்த தன்மையைக் காட்டுகிறது. FAM193B இன் நீளம் 2961 nts ஆகவும், FAM193A இன் நீளம் 4710 ஆகவும் உள்ளது, மேலும் உயிரியல் பணிமனையை பயன்படுத்தி சீரமைக்கும்போது குறைந்த மதிப்பெண்-4490 ஐப் பெற்றது. குறிப்புகள்