Formate-nitrite transporter
ஃபார்மேட்-நைட்ரைட் டிரான்ஸ்போர்ட்டர் (எஃப்என்டி) குடும்பம் மேஜர் இன்ட்ரின்சிக் புரோட்டீன் (எம்ஐபி) சூப்பர் குடும்பத்தைச் சேர்ந்தது. எஃப்என்டி குடும்ப உறுப்பினர்கள் கிராம்-நெகட்டிவ் மற்றும் கிராம்-பாசிட்டிவ் பாக்டீரியா, ஆர்க்கியா, ஈஸ்ட், தாவரங்கள் மற்றும் குறைந்த யூகாரியோட்டுகளிலிருந்து வரிசைப்படுத்தப்பட்டுள்ளனர். எஃப்என்டி குடும்பத்தின் புரோக்கரியோடிக் புரதங்கள் கட்டமைப்பு ரீதியாக தொடர்புடைய சேர்மங்களான ஃபார்மேட் மற்றும் நைட்ரைட்டின் போக்குவரத்தில் செயல்படுகின்றன. அமைப்பு ஈஸ்ட் புரதத்தைத் தவிர (627 அமினோ அசைல் எச்சங்கள்), குடும்பத்தின் அனைத்து சிறப்பியல்பு உறுப்பினர்களும் நீளத்தில் 256-285 எச்சங்களைக் கொண்டுள்ளனர் மற்றும் 6-8 புட்டேடிவ் டிரான்ஸ்மெம்பிரேன் α-ஹீலிக்கல் ஸ்பானர்களை (TMS கள்) வெளிப்படுத்துகிறார்கள். ஒரு வழக்கில், ஈ. கோலை ஃபோகா (டிசி #1.A.16.1.1) புரதத்தின் 6 டிஎம்எஸ் இடவியல் நிறுவப்பட்டுள்ளது. ஈஸ்ட் புரதம் இதேபோன்ற வெளிப்படையான இடவியலைக் கொண்டுள்ளது, ஆனால் சுமார் 400 எச்சங்களின் பெரிய சி-முனைய ஹைட்ரோஃபிலிக் நீட்டிப்பைக் கொண்டுள்ளது. ஈ. கோலியின் ஃபோகா என்பது ஒரு சமச்சீர் பென்டாமர் ஆகும், ஒவ்வொரு துணைக்குழுவும் ஆறு டிஎம்எஸ்-களைக் கொண்டுள்ளது. பைலோஜென்டி பைலோஜெனெடிக் மரம் செயல்பாடு மற்றும் உயிரின பைலோஜெனிக்கு ஏற்ப கிளஸ்டரிங் காட்டுகிறது. பைருவேட்-ஃபார்மேட் லைஸ் (பி. எஃப். எல்) உடன் தொடர்புடைய பாக்டீரியாவின் புட்டேடிவ் ஃபார்மேட் எஃப்ளக்ஸ் டிரான்ஸ்போர்ட்டர்கள் (எஃப். ஓ. சி. ஏ; TC#s 1.A.16.1.1 மற்றும் 1.A.16.1.3) கிளஸ்டர் I ஐக் கொண்டுள்ளன; ஃபோர்மேட் டீஹைட்ரஜனேசுடன் தொடர்புடைய பாக்டீரியா மற்றும் ஆர்க்கியாவின் புட்டேடிவ் ஃபார்மேட் உறிஞ்சுதல் ஊடுருவல்கள் (எஃப். டி. எச். சி; TC#s 1.A.16.2.1 மற்றும் 1.A.16.2.3) கிளஸ்டர் II ஐக் கொண்டுள்ளன; நைட்ரைட் உறிஞ்சும் ஊடுருவல்கள் (என். ஆர். சி, TC#s 1.A.16.2.5,1.A.16.3.1, மற்றும் 1.A.16.3.4) கிளஸ்டர் III ஐக் கொண்டுள்ளன, மேலும் ஒரு ஈஸ்ட் புரதம் கிளஸ்டர் IV ஐக் கொண்டுள்ளது. செயல்பாடு எஃப்என்டி குடும்பத்தின் புரதங்களுக்கான ஆற்றல் இணைப்பு வழிமுறைகள் விரிவாக வகைப்படுத்தப்படவில்லை. எச். சி. ஓ மற்றும் நோ அப்டேக்குகள் எச் + சிம்போர்ட்டுடன் இணைக்கப்படலாம். எச். சி. ஓ வெளியேற்றம் சவ்வு ஆற்றலால் ஒரு யூனிபோர்ட் பொறிமுறையால் அல்லது எச் + ஆன்டிபோர்ட் மூலம் இயக்கப்படலாம். ஈ. கோலியின் ஃபோகா இருதரப்பு வடிவமைப்பு போக்குவரத்தை ஊக்குவிக்கிறது மற்றும் ஒரு சேனல் வகை பொறிமுறையால் செயல்படக்கூடும். ஃபோகா, குறுகிய சங்கிலி அமிலங்களை கொண்டு செல்கிறது. FocA அதன் செயல்பாட்டு முறையை அதிக வெளிப்புற pH இல் ஒரு செயலற்ற ஏற்றுமதி சேனலில் இருந்து குறைந்த pH இல் இரண்டாம் நிலை செயலில் உள்ள ஃபார்மேட்/H + இறக்குமதியாளருக்கு மாற்ற முடியும். pH 4 இல் உள்ள சால்மோனெல்லா டைஃபிமூரியம் ஃபோக்காவின் படிக அமைப்பு, இந்த சுவிட்ச் பென்டாமெரிக் சேனலில் உள்ள தனிப்பட்ட புரோட்டோமர்களின் அமினோ முனையத்தின் ஒரு பெரிய மறுசீரமைப்பை உள்ளடக்கியது என்பதைக் காட்டுகிறது. அமினோ-முனைய ஹெலிஸ்கள் ஒரு ஒருங்கிணைந்த, கூட்டுறவு நடவடிக்கையில் போக்குவரத்தைத் திறக்கின்றன அல்லது தடுக்கின்றன, இது ஃபோகா எவ்வாறு pH-சார்ந்த வழியில் இணைக்கப்பட்டுள்ளது என்பதைக் குறிக்கிறது. புரோட்டீன் pH 7 இல் ஒரு குறிப்பிட்ட ஃபார்மேட் சேனலாக செயல்படுகிறது என்றும், pH ஐ 5.1 ஆக மாற்றும்போது அது மூடுகிறது என்றும் எலக்ட்ரோஃபிசியாலஜிக்கல் ஆய்வுகள் காட்டுகின்றன. போக்குவரத்து எதிர்வினை எஃப்என்டி குடும்பத்தின் வெவ்வேறு உறுப்பினர்களால் ஊக்குவிக்கப்படக்கூடிய போக்குவரத்து எதிர்வினைகள் பின்வருமாறுஃ (1) ஆர்சிஓ அல்லது என்ஓ (அவுட்) ஆர்சிஓ அல்லது என்ஓ (இன்), (2) எச்ஸிஓ (இன்) எச்ஸிஓ (அவுட்), (3) எச்எஸ்-(அவுட்) எச்எஸ்-(இன்). எஃப்என்டி குடும்பத்தைச் சேர்ந்த தற்போது வகைப்படுத்தப்பட்ட உறுப்பினர்களின் பிரதிநிதி பட்டியலை டிரான்ஸ்போர்ட்டர் வகைப்பாடு தரவுத்தளத்தில் காணலாம். சில சிறப்பியல்பு உறுப்பினர்களில் பின்வருவன அடங்கும்ஃ ஃபோகா மற்றும் ஃபோக்பி (முறையே TC#s 1.A.16.1.1 மற்றும் 1.A.16.1.2), எஸ்செரிச்சியா கோலியிலிருந்து, ஃபார்மேட்டின் இருதரப்பு போக்குவரத்தில் ஈடுபட்டுள்ள டிரான்ஸ்போர்ட்டர்கள். FdhC, மெத்தனோபாக்டீரியம் மாரிபாலுடிஸ் (TC #1.A.16.2.3) மற்றும் மெத்தனோதெர்மோபாக்டர் தெர்மோஃபார்மிகம் (TC #1.A.16.2.1) ஆகியவற்றிலிருந்து, ஒரு சாத்தியமான ஃபார்மேட் டிரான்ஸ்போர்ட்டர். இ. கோலியிலிருந்து (டிசி #1.A.16.3.1) வந்த நிர்சி, ஒரு சாத்தியமான நைட்ரைட் டிரான்ஸ்போர்ட்டர். கிளாமிடமோனாஸ் ரீன்ஹார்ட்டியின் (கிளாமிடமோனாஸ் ஸ்மித்) நார் 1 (டிசி #1.A.16.2.4), 355 அமினோ அசைல் எச்சங்களின் நைட்ரைட் உறிஞ்சும் போர்ட்டர். பி. சப்டிலிஸ் கற்பனையான புரதம் YwcJ (iPA-48R) (TC #1.A.16.3.2). புரதக் குடும்பங்கள் புரதக் குடும்பங்கள் சவ்வுப் புரதங்கள் சவ்வுப் புரதங்கள் சவ்வுப் புரதங்கள் சவ்வுப் புரதங்கள் சவ்வுப் புரதங்கள் போக்குவரத்து புரதங்கள் ஒருங்கிணைந்த சவ்வுப் புரதங்கள்