Conserved signature indels
புரத வரிசைகளில் பாதுகாக்கப்பட்ட கையொப்ப செருகல்கள் மற்றும் நீக்குதல்கள் (சிஎஸ்ஐ) பைலோஜெனெடிக் உறவுகளைப் புரிந்துகொள்வதற்கான மூலக்கூறு குறிப்பான்களின் முக்கியமான வகையை வழங்குகின்றன. அரிய மரபணு மாற்றங்களால் கொண்டுவரப்பட்ட சிஎஸ்ஐக்கள், பொதுவாக வரையறுக்கப்பட்ட அளவு கொண்ட பயனுள்ள பைலோஜெனெடிக் குறிப்பான்களை வழங்குகின்றன, மேலும் அவற்றின் நம்பகத்தன்மையை உறுதிப்படுத்த அவை இருபுறமும் பாதுகாக்கப்பட்ட பகுதிகளால் சூழப்பட்டுள்ளன. இண்டெல்ஸ் தன்னிச்சையான செருகல்கள் அல்லது நீக்குதல்கள் என்றாலும், சிஎஸ்ஐக்கள் புரதத்தின் பாதுகாக்கப்பட்ட பகுதிகளுக்குள் இருக்கும் புரத இண்டெல்ஸ் மட்டுமே என்று வரையறுக்கப்படுகின்றன. ஒரு குறிப்பிட்ட கிளேடு அல்லது இனங்களின் குழுவிற்கு மட்டுப்படுத்தப்பட்ட சிஎஸ்ஐக்கள், பொதுவாக பொதுவான பரிணாம வம்சாவளியைச் சேர்ந்த நல்ல பைலோஜெனெடிக் குறிப்பான்களை வழங்குகின்றன. இத்தகைய மாற்றங்களின் அரிதான மற்றும் மிகவும் குறிப்பிட்ட தன்மை காரணமாக, அவை ஒன்றிணைந்த அல்லது இணையான பரிணாமத்தால் (அதாவது. ஹோமோபிளாசி) மற்றும் எனவே அவை சினபோமோர்பியைக் குறிக்க வாய்ப்புள்ளது. வெவ்வேறு தளங்களில் அல்லது வெவ்வேறு இனங்களுக்கிடையேயான பரிணாம விகிதங்களில் உள்ள வேறுபாடுகள் போன்ற பிற குழப்பமான காரணிகளும் பொதுவாக ஒரு சிஎஸ்ஐயின் விளக்கத்தை பாதிக்காது. ஒரு வெளி-குழு இனங்களில் சிஎஸ்ஐகளின் இருப்பு அல்லது இல்லாமையை தீர்மானிப்பதன் மூலம், சிஎஸ்ஐயின் மூதாதையர் வடிவம் ஒரு செருகல் அல்லது நீக்குதல் என்பதை ஒருவர் ஊகிக்க முடியும், மேலும் இது உயிரினங்களுக்கிடையே வேரூன்றிய பைலோஜெனெடிக் உறவை உருவாக்க பயன்படுத்தப்படலாம். அடையாளம் காணப்பட்ட பெரும்பாலான சிஎஸ்ஐக்கள் அதிக முன்கணிப்பு மதிப்பை வெளிப்படுத்துவதாகக் கண்டறியப்பட்டுள்ளது, மேலும் அவை பொதுவாக முதலில் அடையாளம் காணப்பட்ட இனங்களின் கிளேடுகளுக்கான தனித்துவத்தைத் தக்க வைத்துக் கொள்கின்றன. எனவே, அவற்றின் இருப்பு அல்லது இல்லாததன் அடிப்படையில், வெவ்வேறு சூழல்களில் இந்த குழுக்களைச் சேர்ந்த அறியப்பட்ட மற்றும் முன்பு அறியப்படாத இனங்கள் இரண்டையும் அடையாளம் காண முடியும். வகை குழு குறிப்பிட்ட குழு குறிப்பிட்ட சிஎஸ்ஐக்கள் பொதுவாக ஒரு குறிப்பிட்ட வகைப்பாட்டைச் சேர்ந்த வெவ்வேறு இனங்களால் பகிர்ந்து கொள்ளப்படுகின்றன (எ. கா. பேரினம், குடும்பம், வகுப்பு, வரிசை, பைலம்) ஆனால் அவை மற்ற குழுக்களில் இல்லை. இந்த சிஎஸ்ஐக்கள் பெரும்பாலும் இனங்களின் குழுவின் மூதாதையர்களில் அறிமுகப்படுத்தப்பட்டிருக்கலாம், வகைப்பாட்டின் உறுப்பினர்கள் வேறுபடுவதற்கு முன்பு. ஒரு குறிப்பிட்ட வகைப்பாட்டின் உறுப்பினர்களை மற்ற அனைத்து உயிரினங்களிலிருந்தும் வேறுபடுத்துவதற்கான மூலக்கூறு வழிமுறைகளை அவை வழங்குகின்றன. எக்ஸ் வகைப்பாட்டைச் சேர்ந்த அனைத்து இனங்களிலும் காணப்படும் 5aa CSI இன் உதாரணத்தை படம் 1 காட்டுகிறது. இது வேறு எந்த இனத்திலும் காணப்படாததால் இது இந்த வகைப்பாட்டின் தனித்துவமான பண்பு ஆகும். இந்த வகைப்பாட்டின் இனங்களின் பொதுவான மூதாதையரில் இந்த கையொப்பம் அறிமுகப்படுத்தப்பட்டிருக்கலாம். இதேபோல் மற்ற குழு-குறிப்பிட்ட கையொப்பங்களை (காட்டப்படவில்லை) A1 மற்றும் A2 அல்லது B1 மற்றும் B2 போன்றவற்றால் அல்லது X1 மற்றும் X2 அல்லது X3 மற்றும் X4 போன்றவற்றால் பகிர்ந்து கொள்ளலாம். இந்த வரைபடத்தில் உள்ள ஏ, பி, சி, டி மற்றும் எக்ஸ் குழுக்கள் பல்வேறு பாக்டீரியா அல்லது யூகாரியோடிக் பைலாவுடன் ஒத்திருக்கலாம். குழு குறிப்பிட்ட சிஎஸ்ஐக்கள் கடந்த காலத்தில் பல பாக்டீரியா பைலா மற்றும் அதற்குள் உள்ள துணைக்குழுக்களின் பைலோஜெனெடிக் உறவைத் தீர்மானிக்கப் பயன்படுத்தப்பட்டுள்ளன. எடுத்துக்காட்டாக, ஒரு 3 அமினோ அமில செருகல், மிகவும் பாதுகாக்கப்பட்ட பகுதிக்குள் (82-124 அமினோ அமிலம்), அத்தியாவசிய 50S ரைபோசோமல் புரதம் L7/L12 இல் ஃபைலம் தெர்மோடோகோடாவின் (முன்பு தெர்மோடோகாய்) உறுப்பினர்களால் தனித்துவமாக பகிர்ந்து கொள்ளப்பட்டது. இது வேறு எந்த பாக்டீரியா இனங்களிலும் இல்லை, மேலும் மற்ற அனைத்து பாக்டீரியாவிலிருந்தும் தெர்மோடகோட்டாவின் உறுப்பினர்களை வகைப்படுத்த பயன்படுத்தப்படலாம். தெர்மோடோகொட்டாவிற்குள் உள்ள துணைக்குழுக்களை வகைப்படுத்த குழு குறிப்பிட்ட சிஎஸ்ஐகளும் பயன்படுத்தப்பட்டன. மல்டி குரூப் அல்லது மெயின்-லைன் மெயின்-லைன் சிஎஸ்ஐக்கள் என்பது ஒரு பாதுகாக்கப்பட்ட செருகல் அல்லது நீக்குதல் பல முக்கிய ஃபைலாக்களால் பகிரப்படுகிறது, ஆனால் மற்ற ஃபைலாக்களிலிருந்து இல்லை. படம் 2 ஒரு பாதுகாக்கப்பட்ட பகுதியில் காணப்படும் 5aa CSI இன் உதாரணத்தைக் காட்டுகிறது, இது பொதுவாக பைலா X, Y மற்றும் Z க்கு சொந்தமான இனங்களில் உள்ளது, ஆனால் இது மற்ற பைலாக்களில் (A, B மற்றும் C) இல்லை. இந்த கையொப்பம் வகை X, Y மற்றும் Z மற்றும் A, B மற்றும் C ஆகியவற்றின் ஒரு குறிப்பிட்ட உறவைக் குறிக்கிறது. ஆர்க்கியா), இண்டெல் ஒரு செருகல் அல்லது நீக்குதல் என்பதை ஊகிக்க முடியும், மேலும் இந்த இரண்டு குழுக்களில் ஏ, பி, சி அல்லது எக்ஸ், ஒய், இசட் மூதாதையர்கள். பல பாக்டீரியா பைலாவின் பைலோஜெனெடிக் உறவைத் தீர்மானிக்க கடந்த காலத்தில் மெயின்-லைன் சிஎஸ்ஐக்கள் பயன்படுத்தப்பட்டுள்ளன. கைரேஸ் B இன் பாதுகாக்கப்பட்ட பகுதிக்குள் (அமினோ அமிலங்களுக்கு இடையில் 529-751) சுமார் 150-180 அமினோ அமிலங்களின் பெரிய CSI, பொதுவாக பல்வேறு சூடோமோனடோட்டா, கிளாமிடியோட்டா, பிளாக்டோமைசெட்டோட்டா மற்றும் அக்விஃபிகோட்டா இனங்களுக்கு இடையில் பகிர்ந்து கொள்ளப்படுகிறது. இந்த சிஎஸ்ஐ மற்ற மூதாதையர் பாக்டீரியா பைலா மற்றும் ஆர்க்கியாவில் இல்லை. இதேபோல், சூடோமோனடோட்டா, பாக்டீரியாய்டோட்டா, குளோரோபயோட்டா, கிளாமிடியோட்டா, பிளாக்டோமைசெட்டோட்டா மற்றும் அக்விஃபோட்டா ஆகியவற்றைச் சேர்ந்த பல்வேறு இனங்களில் ஆர். பி. ஓ. பி ஹோமோலோக்குகளில் (அமினோ அமிலங்களுக்கு இடையில் 919-1058) சுமார் 100 அமினோ அமிலங்களின் பெரிய சிஎஸ்ஐ உள்ளது. இந்த சிஎஸ்ஐ மற்ற மூதாதையர் பாக்டீரியா பைலா மற்றும் ஆர்க்கியாவில் இல்லை. இரண்டு நிகழ்வுகளிலும் சிஎஸ்ஐ இல்லாத குழுக்கள் மூதாதையர்கள் என்பதை ஒருவர் ஊகிக்க முடியும். சிஎஸ்ஐகளை அடிப்படையாகக் கொண்ட பரிணாம ஆய்வுகள் பாக்டீரியா பைலோஜெனியில் ஒரு முக்கிய பிரச்சினை என்னவென்றால், வெவ்வேறு பாக்டீரியா இனங்கள் ஒருவருக்கொருவர் எவ்வாறு தொடர்புடையவை மற்றும் ஒரு பொதுவான மூதாதையரிடமிருந்து அவற்றின் கிளை வரிசை ஆகியவற்றைப் புரிந்துகொள்வதாகும். தற்போது பெரும்பாலான பைலோஜெனெடிக் மரங்கள் 16S rRNA அல்லது பிற மரபணுக்கள்/புரதங்களை அடிப்படையாகக் கொண்டவை. இந்த மரங்களால் எப்போதும் முக்கிய பைலோஜெனெடிக் கேள்விகளை அதிக அளவிலான உறுதியுடன் தீர்க்க முடியாது. இருப்பினும் சமீபத்திய ஆண்டுகளில் உலகளவில் விநியோகிக்கப்பட்ட பல புரதங்களில் பாதுகாக்கப்பட்ட இண்டெல்ஸின் (சிஎஸ்ஐ) கண்டுபிடிப்பு மற்றும் பகுப்பாய்வுகள் இந்த தேடலில் உதவியுள்ளன. அவற்றுக்கு வழிவகுக்கும் மரபணு நிகழ்வுகள் முக்கியமான பரிணாம கிளை புள்ளிகளில் நிகழ்ந்ததாக அனுமானிக்கப்படுகின்றன, மேலும் அவற்றின் இனங்கள் விநியோக முறைகள் கிளை வரிசை மற்றும் வெவ்வேறு பாக்டீரியா பைலாவுக்கிடையேயான தொடர்புகள் பற்றிய மதிப்புமிக்க தகவல்களை வழங்குகின்றன. தெர்மோடகோட்டா சமீபத்தில் தெர்மோடகோட்டா குழுவின் பைலோஜெனெடிக் உறவு சிஎஸ்ஐ அணுகுமுறையின் அடிப்படையில் வகைப்படுத்தப்பட்டது. இதற்கு முன்பு இந்த பைலம் இனத்தை மற்ற அனைத்து பாக்டீரியாவிலிருந்தும் தெளிவாக வேறுபடுத்தக்கூடிய உயிர்வேதியியல் அல்லது மூலக்கூறு குறிப்பான்கள் எதுவும் அறியப்படவில்லை. முழு தெர்மோடகோட்டா பைலம் அல்லது அதன் வெவ்வேறு துணைக்குழுக்களுக்கு குறிப்பிட்ட 60 க்கும் மேற்பட்ட சிஎஸ்ஐக்கள் கண்டுபிடிக்கப்பட்டன. 18 சிஎஸ்ஐக்கள் பல்வேறு தெர்மோடகோட்டா இனங்களில் தனித்துவமாக உள்ளன மற்றும் பைலமுக்கு மூலக்கூறு குறிப்பான்களை வழங்குகின்றன. கூடுதலாக, பல்வேறு தெர்மோடகோட்டா துணைக்குழுக்களுக்கு குறிப்பிட்ட பல சிஎஸ்ஐக்கள் இருந்தன. 12 சிஎஸ்ஐக்கள் டிடி தவிர பல்வேறு தெர்மோடகோட்டா இனங்களைக் கொண்ட ஒரு கிளேடுக்கு குறிப்பிட்டவை. விடுங்கள். 14 சிஎஸ்ஐக்கள் ஃபெர்விடோபாக்டீரியம் மற்றும் தெர்மோசிஃபோ இனங்களைக் கொண்ட ஒரு கிளேடுக்கு குறிப்பிட்டவை மற்றும் 18 சிஎஸ்ஐக்கள் தெர்மோசிஃபோன் இனத்திற்கு குறிப்பிட்டவை. கடைசியாக 16 சிஎஸ்ஐக்கள் சில அல்லது அனைத்து தெர்மோடகோட்டா இனங்கள் அல்லது ஆர்க்கியா, அக்விஃபிகோட்டா, பேசில்லோட்டா, சூடோமோனடோட்டா, டீனோகோக்கோட்டா, ஃபுசோபெக்டிரியோட்டா, டிக்ட்யோகுளோமோட்டா, குளோரோஃப்ளெக்சோட்டா மற்றும் யூகாரியோட்டுகள் போன்ற பிற வகை இனங்களிலிருந்து சில இனங்களால் பகிர்ந்து கொள்ளப்பட்டதாக தெரிவிக்கப்பட்டது. இந்த சிஎஸ்ஐகளில் சிலவற்றின் பகிரப்பட்ட இருப்பு இந்த குழுக்களுக்கு இடையிலான பக்கவாட்டு மரபணு பரிமாற்றத்தின் (எல்ஜிடி) காரணமாக இருக்கலாம். இருப்பினும், பொதுவாக மற்ற வகைப்பாடுகளுடன் பகிர்ந்து கொள்ளப்படும் சிஎஸ்ஐகளின் எண்ணிக்கை தெர்மோடோகொட்டாவுக்கு குறிப்பிட்டதை விட மிகக் குறைவு, மேலும் அவை எந்த குறிப்பிட்ட வடிவத்தையும் வெளிப்படுத்துவதில்லை. எனவே அவை தெர்மோடோகொட்டாவின் வேறுபாட்டில் குறிப்பிடத்தக்க தாக்கத்தை ஏற்படுத்தாது. ஆர்க்கியா மெசோபிலிக் தெர்மோபிரோடியோட்டா சமீபத்தில் நைட்ரோசாஸ்பேரோட்டா (முன்பு தாமர்சியோட்டா) என்று அழைக்கப்படும் ஆர்க்கியாவின் புதிய பைலத்தில் வைக்கப்பட்டது. இருப்பினும், இந்த ஆர்க்கியாவின் குழுவை ஃபைலம் தெர்மோபுரோட்டோட்டாவிலிருந்து (முன்பு கிரெனார்சியோட்டா) வேறுபடுத்தக்கூடிய மூலக்கூறு குறிப்பான்கள் மிகக் குறைவு. சிஎஸ்ஐ அணுகுமுறையைப் பயன்படுத்தி ஒரு விரிவான பைலோஜெனெடிக் ஆய்வு இந்த பைலாவை மூலக்கூறு அடிப்படையில் வேறுபடுத்துவதற்காக நடத்தப்பட்டது. 6 சிஎஸ்ஐக்கள் தனித்துவமாக பல்வேறு நைட்ரோசாஸ்பேரோட்டாவில் காணப்பட்டன, அதாவது செனார்சியம் சிம்பியோசம், நைட்ரோசோபுமிலஸ் மாரிடிமஸ் மற்றும் பல பண்படுத்தப்படாத கடல் தெர்மோபுரோட்டோட்டா. நைட்ரோசாஸ்பேரோட்டா மற்றும் தெர்மோபிரோடியோட்டாவைச் சேர்ந்த இனங்களுக்கு இடையில் பொதுவாகப் பகிர்ந்து கொள்ளப்பட்ட 3 சிஎஸ்ஐக்கள் கண்டறியப்பட்டன. கூடுதலாக, தெர்மோபிரோடியோட்டாவின் வெவ்வேறு வரிசைகளுக்கு குறிப்பிட்ட பல சிஎஸ்ஐக்கள் கண்டறியப்பட்டன-சல்போலோபால்களுக்கான 3 சிஎஸ்ஐக்கள், தெர்மோபிரோடேல்களுக்கான 5 சிஎஸ்ஐக்கள், கடைசியாக சல்போலோபால்கள் மற்றும் டெசல்புரோகோக்கல்களுக்கு பொதுவான 2 சிஎஸ்ஐக்கள். விவரிக்கப்பட்ட கையொப்பங்கள் தெர்மோபிரோடியோட்டா மற்றும் நைட்ரோசாஸ்பேரோட்டாவை வேறுபடுத்துவதற்கான புதுமையான வழிமுறைகளை வழங்குகின்றன, கூடுதலாக அவை தொடர்புடைய இனங்களின் வகைப்பாடு மற்றும் அடையாளத்திற்கான ஒரு கருவியாக பயன்படுத்தப்படலாம். பாஸ்டூரெல்லேல்ஸ் வரிசையின் உறுப்பினர்கள் தற்போது முக்கியமாக 16 எஸ்ஆர்ஆர்என்ஏ மரத்தின் கிளைகளில் அவற்றின் நிலையின் அடிப்படையில் வேறுபடுகிறார்கள். இந்த வரிசையின் உறுப்பினர்களை மற்ற பாக்டீரியாவிலிருந்து வேறுபடுத்தக்கூடிய மூலக்கூறு குறிப்பான்கள் தற்போது மிகக் குறைவு. இந்த வரிசையில் இனங்களுக்கிடையேயான பைலோஜெனெடிக் உறவுகளை தெளிவுபடுத்த ஒரு சிஎஸ்ஐ அணுகுமுறை சமீபத்தில் பயன்படுத்தப்பட்டது; 40 க்கும் மேற்பட்ட சிஎஸ்ஐக்கள் கண்டுபிடிக்கப்பட்டன, அவை அனைத்து அல்லது பெரும்பாலான இனங்களால் தனித்துவமாக பகிர்ந்து கொள்ளப்பட்டன. இந்த பாஸ்ட்யூரெல்லல்களுக்குள் இரண்டு முக்கிய கிளேடுகள் உருவாகின்றனஃ கிளேட் I, அக்ரிகேடிபாக்டர், பாஸ்ட்யூரெல்லா, ஆக்டினோபாசிலஸ் சுக்சினோஜெனஸ், மான்ஹைமியா சுக்சினிஸ்பிரோடூசன்ஸ், ஹீமோஃபிலஸ் இன்ஃப்ளூயன்ஸா மற்றும் ஹீமோஃபிலஸ் சோம்னஸ் ஆகியவற்றை உள்ளடக்கியது, 13 சிஎஸ்ஐகளால் ஆதரிக்கப்பட்டது. ஆக்டினோபாசிலஸ் ப்ளூரோ நிமோனியா, ஆக்டினோபாசிலஸ் மைனர், ஹீமோஃபிலஸ் டுக்ரேயி, மான்ஹைமியா ஹீமோலிடிகா மற்றும் ஹீமோஃபிலஸ் ஒட்டுண்ணிகள் ஆகியவற்றை உள்ளடக்கிய கிளேட் II, 9 சிஎஸ்ஐகளால் ஆதரிக்கப்பட்டது. இந்த முடிவுகளின் அடிப்படையில், பாஸ்டூரெல்லேல்ஸ் அதன் தற்போதைய ஒரு குடும்பத்திலிருந்து இரண்டு வெவ்வேறு குடும்பங்களாக பிரிக்கப்பட வேண்டும் என்று முன்மொழியப்பட்டது. கூடுதலாக, விவரிக்கப்பட்ட கையொப்பங்கள் கண்டுபிடிக்கப்படாத பாஸ்டூரெல்லேல்ஸ் இனங்களை அடையாளம் காண புதிய வழிகளை வழங்கும். காம்மாபுரோட்டியோபாக்டீரியா இந்த வகை காம்மாபுரோட்டியோபாக்டீரியா பாக்டீரியாவின் மிகப்பெரிய குழுக்களில் ஒன்றாகும். இது தற்போது 16s rRNA-அடிப்படையிலான பைலோஜெனெடிக் மரங்களால் மட்டுமே மற்ற பாக்டீரியாவிலிருந்து வேறுபடுகிறது. இந்த வகுப்புக்கு அல்லது அதன் வெவ்வேறு துணைக்குழுக்களுக்கு தனித்துவமான மூலக்கூறு பண்புகள் எதுவும் அறியப்படவில்லை. இந்த வகுப்பின் பைலோஜெனியை நன்கு புரிந்துகொள்ள ஒரு விரிவான சிஎஸ்ஐ அடிப்படையிலான ஆய்வு நடத்தப்பட்டது. முதலாவதாக, உலகளவில் விநியோகிக்கப்பட்ட பல புரதங்களின் ஒருங்கிணைந்த வரிசைகளை அடிப்படையாகக் கொண்ட ஒரு பைலோஜெனெடிக் மரம் உருவாக்கப்பட்டது. கம்மாபிரோடியோபாக்டீரியா வகுப்பின் வெவ்வேறு வரிசைகளின் கிளை வரிசை (மிக சமீபத்தியது முதல் ஆரம்பகால திசைதிருப்பல் வரை) பின்வருமாறுஃ என்டரோபாக்டீரியல்ஸ்> பாஸ்டியூரெல்லல்ஸ்> வைப்ரியோனல்ஸ், ஏரோமோனாடல்ஸ்> ஆல்டெரோமோனாடல்ஸ்> ஓசியானோஸ்பிரில்லல்ஸ், சூடோமோனாடல்ஸ்> குரோமாடியல்ஸ், லெஜியோனெல்லல்ஸ், மெத்திலோகக்கலஸ், சான்தோமோனாடல்ஸ், கார்டியோபாக்டீரியல்ஸ், தியோட்ரிச்சல்ஸ். கூடுதலாக, கம்மாப்ரோடியோபாக்டீரியா வகுப்பின் பெரும்பாலான இனங்களுக்கு தனித்துவமான 4 சிஎஸ்ஐக்கள் கண்டுபிடிக்கப்பட்டன. ஏ. ஐ. சி. ஏ. ஆர் டிரான்ஸ்ஃபார்மிலேஸில் உள்ள ஒரு 2 ஏஏ நீக்குதல் ஃபிரான்சிஸெல்லா துலாரென்சிஸ் தவிர அனைத்து காம்மாப்ரோடியோபாக்டீரியாவாலும் தனித்துவமாக பகிர்ந்து கொள்ளப்பட்டது. ஆர்என்ஏ பாலிமரேஸ் பி-துணைக்குழுவில் உள்ள 4 ஏஏ நீக்குதல் மற்றும் ரைபோசோமல் புரத எல் 16 இல் உள்ள 1 ஏஏ நீக்குதல் ஆகியவை என்டரோபாக்டீரியல்ஸ், பாஸ்டூரெல்லேல்ஸ், வைப்ரியோனல்ஸ், ஏரோமோனாடேல்ஸ் மற்றும் ஆல்டெரோமோனாடேல்ஸ் வரிசைகளைச் சேர்ந்த பல்வேறு இனங்களில் தனித்துவமாகக் காணப்பட்டன, ஆனால் அவை மற்ற காம்மாப்ரோடியோபாக்டீரியாவில் காணப்படவில்லை. கடைசியாக, லியூசில்-டி. ஆர். என். ஏ சிந்தெடேஸில் 2 ஏஏ நீக்குதல் பொதுவாக கிளாஸ் கம்மாப்ரோடியோபாக்டீரியா மற்றும் ஓசியானோஸ்பைரில்லேல்ஸ் வரிசையின் சில உறுப்பினர்களின் மேலே உள்ள வரிசைகளில் இருந்தது. மற்றொரு சிஎஸ்ஐ அடிப்படையிலான ஆய்வில் சான்தோமோனாடேல்ஸ் வரிசைக்கு பிரத்தியேகமான 4 சிஎஸ்ஐகளையும் அடையாளம் கண்டுள்ளது. ஒன்றாக எடுத்துக் கொண்டால், இந்த இரண்டு உண்மைகளும் சான்தோமோனாடேல்ஸ் என்பது மற்ற கம்மாப்ரோடியோபாக்டீரியாவின் மூதாதையரான ஒரு மோனோஃபைலிடிக் குழு என்பதைக் காட்டுகிறது, இது சான்தோமோனாடேல்ஸ் ஒரு சுயாதீனமான உட்பிரிவு என்பதை மேலும் காட்டுகிறது, மேலும் இது கம்மப்ரோடியோபாக்டீரியா கிளேடுக்குள் ஆழமான கிளை வம்சாவளிகளில் ஒன்றாகும். பூஞ்சை தாவரங்கள், விலங்குகள் மற்றும் பூஞ்சைகளுக்கு இடையிலான துல்லியமான பைலோஜெனெடிக் உறவு நன்கு புரிந்து கொள்ளப்படவில்லை. இந்த உறவை தெளிவுபடுத்த ஒரு சிறிய சிஎஸ்ஐ அடிப்படையிலான ஆய்வு நடத்தப்பட்டது. விலங்குகள் மற்றும் பூஞ்சைகளை ஒரு மோனோஃபைலிடிக் குழுவாக ஒன்றாக வைக்கவும், தாவரங்களை விலக்கவும் நான்கு சிஎஸ்ஐக்கள் பயன்படுத்தப்பட்டன. இந்த சிஎஸ்ஐக்கள் நீளமான காரணி எல் மற்றும் எனோலேஸ் ஆகிய இரண்டு அத்தியாவசிய செல்லுலார் புரதங்களில் காணப்பட்டன. இருப்பினும், பாரம்பரியமாக, பூஞ்சைக்கும் விலங்குகளுக்கும் இடையிலான இந்த குறிப்பிட்ட உறவு ஆதரிக்கப்படவில்லை. குறிப்புகள் மூலக்கூறு உயிரியல்