DEPDC5
DEPDC5 (அல்லது DEP களம் கொண்ட 5) என்பது சரியாக புரிந்து கொள்ளப்படாத செயல்பாட்டைக் கொண்ட ஒரு மனித புரதமாகும், ஆனால் பல ஆய்வுகளில் புற்றுநோயுடன் தொடர்புடையது. இது குரோமோசோம் 22 இல் அமைந்துள்ள அதே பெயரின் மரபணுவால் குறியிடப்பட்டுள்ளது. செயல்பாடு DEPDC5 இன் செயல்பாடு இன்னும் அறியப்படவில்லை, ஆனால் இது DEPDC5 மற்றும் டிஸ்வீவெல்ட்-1 (DVL1) இன் DEP களங்களுக்கு இடையிலான ஒத்த தன்மையின் அடிப்படையில் ஊடுருவல் சமிக்ஞை கடத்தலில் சிக்கியுள்ளது. இந்த மரபணுவில் உள்ள பிறழ்வுகள் குவிய கால்-கை வலிப்பு நிகழ்வுகளுடன் தொடர்புடையவை (டோய்ஃ 10.1038/ng.2601). ஹோமோ சேபியன்ஸில், டி. இ. பி. டி. சி 5 மரபணு பி. ஆர். ஆர். எல் 14 மற்றும் ஒய். டபிள்யூ. எச். ஏ. எச் மரபணுக்களுக்கு இடையில் குரோமோசோம் 22,22q12.2-q12.3 இன் நீண்ட கையில் உள்ளூர்மயமாக்கப்பட்டுள்ளது. இந்த மரபணுவின் மருத்துவ பொருத்தமானது ஒரு இன்ட்ரோனிக் எஸ்என்பி (ஆர்எஸ்1012068) ஐ உள்ளடக்கியது, இது 2 மடங்கு ஹெபடோசெல்லுலர் புற்றுநோய்-ஆபத்து அதிகரிப்புடன் தொடர்புடையது. கட்டமைப்பு களங்கள் டி. இ. பி. டி. இ. பி. களம் அதன் பெயரை டிஷெவெல்ட், ஈகிள்-10 மற்றும் பிளெக்ஸ்ட்ரின் புரதங்களிலிருந்து பெறுகிறது, அவை ஒவ்வொன்றும் இந்த களத்தின் மாறுபாட்டைக் கொண்டுள்ளன. இது 82 எச்சங்களைக் கொண்டுள்ளது மற்றும் சி-முனையத்திலிருந்து 343 அமினோ அமிலங்களைக் கொண்டுள்ளது. ஒரு ஸ்விஸ்-மாடல் களத்திற்குள் உள்ள இரண்டு பீட்டா தாள்கள் மற்றும் மூன்று ஆல்பா ஹெலிக்ஸ்களை முன்னறிவிக்கிறது. அதன் சரியான செயல்பாடு தெரியவில்லை என்றாலும், DEPDC5 DEP களம் NCBI இல் ஒரு CBLAST ஐச் செய்யும்போது DVL1 இன் DEP களத்துடன் மிக உயர்ந்த கட்டமைப்பு ஒற்றுமையைக் கொண்டுள்ளது. சீரமைப்பு 1.00e-08 இன் மதிப்பைப் பெறுகிறது மற்றும் இரண்டு புரதங்களின் DEP களங்களுக்கு இடையில் 30 சதவீத அடையாளத்தைக் குறிக்கிறது. டிவிஎல்1 இல், டிஇபி களம் டபிள்யூஎன்டி சமிக்ஞை பாதையின் ஒரு பகுதியாக பிளாஸ்மா சவ்வுக்கு புரதத்தை உள்ளூர்மயமாக்குவதில் ஈடுபட்டுள்ளது. DUF 3608 DUF 3608 களம் N-முனையத்திலிருந்து 99 அமினோ அமிலங்களைக் கொண்டுள்ளது மற்றும் 280 அமினோ அமிலங்களைக் கொண்டுள்ளது. இந்த களத்திற்குள் குறைந்தது ஒரு பீட்டா தாள் மற்றும் இரண்டு ஆல்பா ஹெலிக்ஸ்களை PELE கணித்துள்ளது. இது 26 மிகவும் பாதுகாக்கப்பட்ட எச்சங்களையும், மொழிபெயர்ப்புக்குப் பிந்தைய பல மாற்றங்களையும் கொண்டுள்ளது. இந்த இரண்டு நிகழ்வுகளும் இந்தக் கட்டுரையில் பின்னர் விவரிக்கப்பட்டுள்ளன. DUF 3608 இன் செயல்பாட்டிற்கான சான்றுகள் ஈஸ்ட் ஹோமோலோக் இம்ல்1பி இல் கண்டுபிடிக்கப்பட்டுள்ளன. IMLP1 இன் DUF 3608 இரண்டு புரத கூட்டாளர்களான Npr2 மற்றும் Npr3 உடன் பிணைக்க உதவும் என்று கருதப்படுகிறது. ஒன்றாக, இந்த மூன்று புரதங்களும் இம்ல் 1-என். பி. ஆர் 2-என். பி. ஆர் 3 வளாகத்தை உருவாக்குகின்றன மற்றும் "நைட்ரஜன் அல்லாத பட்டினி" தன்னியக்க ஒழுங்குமுறையில் ஈடுபட்டுள்ளன. இதைக் கண்டுபிடித்த ஆராய்ச்சியாளர்கள் DUF 3608 ஐ RANS என்று மறுபெயரிட முன்மொழிந்தனர் (நைட்ரஜன் அல்லாத பட்டினி நிலைமைகளின் கீழ் தூண்டப்பட்ட தானியங்கிக்கு தேவைப்படுகிறது). இரண்டாம் கட்டமைப்பு முன்கணிப்பு கருவி PELE இன் ஒருமித்த கருத்தின் அடிப்படையில், DEPDC5 குறைந்தது பத்து ஆல்பா ஹெலிக்ஸ் மற்றும் ஒன்பது பீட்டா தாள்களைக் கொண்டுள்ளது. இந்த இரண்டாம் நிலை கட்டமைப்புகளின் இருப்பிடங்கள் கீழே உள்ள படத்தில் விளக்கப்பட்டுள்ளனஃ சிவப்பு சிறப்பம்சங்கள் ஆல்பா ஹெலிக்ஸ் மற்றும் நீல சிறப்பம்சங்கள் பீட்டா தாள்கள் ஆகும். எலும்பியல் பூஞ்சை என்பது மனித டி. இ. பி. டி. சி 5 க்கு ஆர்த்தோலோகஸ் புரதத்தைக் கொண்ட மிகவும் தொலைதூர தொடர்புடைய உயிரினங்களாகும், இதில் சாக்கரோமைசஸ் செரிவிசியா மற்றும் அல்புகோ லைபாச்சி அடங்கும். பூஞ்சைகளில், புரதத்தின் பெயர் இம்ல்1பி, அல்லது வெற்றிட சவ்வு தொடர்பான புரதம் இம்ல்1 ஆகும். பிற உயிரினங்களில் உள்ள பெயர் மாறுபாடுகளில் சிஜி12090 (ட்ரோசோபிலா) மற்றும் ஏஜிஏபி007010 (கொசு) ஆகியவை அடங்கும். மனிதர்களுக்கும் பிற முதுகெலும்புள்ள உயிரினங்களுக்கும் இடையே பாதுகாப்பு அதிகமாக உள்ளது, இது சிக்லிட்களில் 74 சதவீதம் அடையாளம் முதல் சிம்பன்சிகளில் 99 சதவீதம் அடையாளம் வரை உள்ளது. பின்வரும் அட்டவணை மனித DEPDC5 க்கு ஆர்த்தோலோகஸ் 20 புரதங்களின் பகுப்பாய்வை சுருக்கமாகக் கூறுகிறது. விலங்குகள் மற்றும் பூஞ்சைகள் பிரிக்கப்பட்டதிலிருந்து 30 எச்சங்கள் பாதுகாக்கப்பட்டுள்ளன, அவற்றில் 26 டி. யு. எஃப் 3608 களத்தில் அமைந்துள்ளன. பின்வரும் பல வரிசை சீரமைப்பு DUF களத்தின் இந்த பாதுகாப்பை விளக்குகிறது; முதுகெலும்பற்ற மற்றும் பூஞ்சை கிளேடுகளின் பிரதிநிதிகள் முற்றிலும் பாதுகாக்கப்பட்ட எச்சங்கள் பச்சை நிறத்துடன் மனித DUF 3608 உடன் சீரமைக்கப்பட்டுள்ளனர். அறியப்பட்ட மனித DEPDC5 இணைப்புகள் எதுவும் இல்லை, ஆனால் ஒரு ஒத்த DEP களத்தைக் கொண்ட 64 மனித புரதங்கள் உள்ளன. மனித டி. இ. பி. டி. சி 5 இன் மிகவும் தொலைதூர தொடர்புடைய ஆர்த்தோலாக் ஈஸ்ட் புரதமான இம்ல் 1 க்கு அடையாளம் காணப்பட்ட இணைப்புகள் எதுவும் இல்லை. ஆர். டி-பி. சி. ஆர் பகுப்பாய்வு மற்றும் டிஎன்ஏ மைக்ரோஅரே ஆய்வுகள் மூலம் வெளிப்பாடு டிஇபிடிசி5 வெளிப்பாடு மனித திசுக்களில் எங்கும் நிறைந்ததாக வகைப்படுத்தப்பட்டுள்ளது, இது கீழே உள்ள விளக்கப்படத்தில் காட்டப்பட்டுள்ளது. ஹெபடோசெல்லுலர் புற்றுநோயால் பாதிக்கப்பட்ட நோயாளிகள் பற்றிய ஒரு ஆய்வில் கட்டி அல்லாத திசுக்களை விட கட்டி திசுக்களில் அதிக டி. இ. பி. டி. சி 5 வெளிப்பாடு காணப்பட்டது. இதற்கு நேர்மாறாக, மூன்று மரபணுக்களின் ஒரே மாதிரியான நீக்குதல், ஒன்று டி. இ. பி. டி. சி 5, இரண்டு கிளியோபிளாஸ்டோமா வழக்குகளில் கண்டறியப்பட்டது. பிற வெளிப்பாடு முரண்பாடுகளில் எம். டி. ஏ-எம். பி-221 மார்பக புற்றுநோய் செல் வரிசையில் பூஜ்ஜிய வெளிப்பாடு மற்றும் பி116 (ZAP70 எதிர்மறை) செல் வரிசையில் குறைந்த வெளிப்பாடு ஆகியவை அடங்கும். மொழிபெயர்ப்புக்குப் பிந்தைய மாற்றங்கள் மனித DEPDC5 புரதத்திற்கான எக்ஸ்பேஸி மற்றும் பாஸ்போசைட் பிளஸில் தொகுக்கப்பட்ட புரோட்டியோமிக் கருவிகள் மூலம் பின்வரும் மொழிபெயர்ப்புக்குப் பிந்தைய மாற்றங்கள் கணிக்கப்பட்டன. தொடர்பு DEPDC5 புரோட்டாசோம் துணை அலகு பி. எஸ். எம். ஏ 3 உடன் தொடர்பு கொள்ளலாம், இது கோமிம்யூனோப்ரீசிபிடேஷன் மற்றும் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணி எம். ஒய். சி ஆகியவற்றால் நிரூபிக்கப்பட்டுள்ளது. டி. இ. பி. டி. சி. 5 என். பி. ஆர். எல் 2 மற்றும் என். பி. ஆர். எல் 3 உடன் "கேடோர் 1" வளாகத்தில் உள்ளது. குறிப்புகள்