Transcriptome-wide association study
டிரான்ஸ்கிரிப்டோம்-வைட் அசோசியேஷன் ஸ்டடி (டி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ்) என்பது ஒரு மரபணு முறையாகும், இது மரபணு வெளிப்பாட்டின் மரபணு கூறுகள் மற்றும் ஒரு பண்பு மரபணு கூறுகளை ஒப்பிட்டு இரண்டு கூறுகளுக்கு இடையில் ஒரு தொடர்பு இருக்கிறதா என்பதை தீர்மானிக்க பயன்படுத்தப்படலாம். மரபணு அளவிலான தொடர்பு ஆய்வுகளைத் தொடர்ந்து வேட்பாளர் மரபணு பகுப்பாய்வில் வேட்பாளர் காரண மரபணுக்களை அடையாளம் காண்பதற்கும் முன்னுரிமை அளிப்பதற்கும் டி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் பயனுள்ளதாக இருக்கும். டி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் ஒரு குறிப்பிட்ட திசுவின் ஆர்என்ஏ தயாரிப்புகளைப் பார்த்து, வெளிப்படுத்தப்படும் மரபணுக்கள் மற்றும் மரபணு வெளிப்பாடு நிலைகளைப் பார்க்கும் திறன்களை ஆராய்ச்சியாளர்களுக்கு வழங்குகிறது, இது திசு வகையைப் பொறுத்து மாறுபடும். டி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் என்பது மதிப்புமிக்க மற்றும் நெகிழ்வான உயிர் தகவலியல் கருவிகளாகும், இது மரபணுக்கள் மற்றும் சிக்கலான பண்புகள் மற்றும் நோய்களின் வெளிப்பாடுகளுக்கு இடையிலான தொடர்புகளைப் பார்க்கிறது. மரபணு வெளிப்பாட்டிற்கும் வெளிப்படுத்தப்பட்ட பண்புக்கும் இடையிலான தொடர்பைப் பார்ப்பதன் மூலம், குறிப்பிட்ட பண்புகள் மற்றும் நோய்களின் வளர்ச்சியில் அவை வகிக்கும் பங்கிற்கு மரபணு ஒழுங்குமுறை வழிமுறைகளை ஆராய முடியும். டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் பகுப்பாய்வு என்பது ஒரு உயிரினத்திற்குள் கொடுக்கப்பட்ட செல், திசு அல்லது உறுப்பில் இருக்கும் அனைத்து ஆர். என். ஏ டிரான்ஸ்கிரிப்ட்களின் கூட்டுத்தொகையாகும். டிரான்ஸ்கிரிப்டோம்களில் எம்ஆர்என்ஏ இரண்டும் அடங்கும், இது மைய கோட்பாட்டிற்கு இடைநிலையாக செயல்படுகிறது; அதே போல் குறியீட்டு அல்லாத ஆர்என்ஏக்கள் புரதத் தொகுப்பில் பிற பாத்திரங்களை வகிக்கலாம். மத்திய கோட்பாட்டில், டிஎன்ஏ எவ்வாறு டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் மற்றும் மொழிபெயர்ப்பு மூலம் புரதங்களை உருவாக்க முடியும் என்பதை இது விவரிக்கிறது. ஆர்என்ஏக்கள் ஒரு செல்லில் மாறுபட்ட செறிவுகளில் உள்ளன, மேலும் அவை மைய கோட்பாட்டிற்கு வெளியே பல்வேறு பாத்திரங்களை வகிக்கின்றன, மேலும் அவை நீளம் மற்றும் செயல்பாட்டின் அடிப்படையில் அடையாளம் காணப்படுகின்றன. செயல்பாட்டு கூறுகள் மூலம் தான் மரபணுக்களின் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனல் மற்றும் டிரான்ஸ்லேஷனல் செயல்பாடுகளை கட்டுப்படுத்த முடியும். டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் பகுப்பாய்வு தற்போதுள்ள அனைத்து ஆர்என்ஏக்களையும் பற்றிய தகவல்களைப் பெறுவதற்கு பயனுள்ளதாக இருக்கும், மேலும் திசு சார்ந்த மரபணு வழிமுறைகளைப் பற்றிய மதிப்புமிக்க நுண்ணறிவை வழங்க முடியும். மனித மூளையின் ஒரு பகுதி டிரான்ஸ்கிரிப்டோமை அடையாளம் காண நிகழ்த்தப்பட்ட ஒரு பரிசோதனையில் 1990 களில் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் முதன்முதலில் ஆராயப்பட்டது. ஆராய்ச்சியாளர்களால் 609 எம்ஆர்என்ஏ வரிசைகளை அடையாளம் காண முடிந்தது. அப்போதிருந்து, அடுத்த தலைமுறை வரிசைமுறை முறைகளில் பல முன்னேற்றங்கள் செய்யப்பட்டுள்ளன. இந்த முறைகள் மற்றும் மைக்ரோஅரேக்கள் மற்றும் ஆர்என்ஏ-செக் போன்ற புதிய தொழில்நுட்பங்களின் முன்னேற்றங்கள் காரணமாக டிரான்ஸ்கிரிப்டோம்களை இப்போது வழக்கமாக உருவாக்க முடிகிறது. இரண்டு முறைகளுக்கும் கணக்கிடப்பட்ட இமேஜிங் மற்றும் உயர் வாசிப்புகள் மற்றும் புள்ளிவிவர பகுப்பாய்வு தேவைப்படுகிறது. எம்ஆர்என்ஏக்கள் மூலம் மரபணு வெளிப்பாடு பற்றிய தகவல்களைப் பெறுவதன் மூலம், பல பயன்பாடுகள் கண்டுபிடிக்கப்பட்டுள்ளன. டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் பகுப்பாய்வு நோய் செயல்முறைகள் மற்றும் நோய் முன்னேற்றங்களில் ஒழுங்குமுறை கூறுகளை அடையாளம் காண்பதில் நன்மை பயக்கும் என்று நிரூபிக்கப்பட்டுள்ளது, நோய் செயல்முறைகளை அடையாளம் காண்பதன் மூலம் மருந்து வளர்ச்சிக்கு உதவியது, சிகிச்சை உத்திகளைப் பற்றிய நுண்ணறிவை வழங்குகிறது, மேலும் உயிரியல் மற்றும் உயிரற்ற சுற்றுச்சூழல் காரணிகளுக்கு பதிலளிக்கக்கூடிய மரபணுக்களை அடையாளம் காணும் திறனை மேம்படுத்தியுள்ளது. முறைகள் ஒரு மரபணு அளவிலான சங்க ஆய்வு அல்லது ஜி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் என்பது ஒரு மரபணு கருவியாகும், இது ஒற்றை நியூக்ளியோடைடு பாலிமார்பிசம் அல்லது எஸ். என். பி. களைப் பயன்படுத்துகிறது, இது ஒரு பண்பு அல்லது நோய் ஒரு குறிப்பிட்ட மரபணு மாறுபாட்டுடன் இணைக்கப்பட்டுள்ளதா என்பதை அடையாளம் காணும். ஒரு குறிப்பிட்ட மாறுபாட்டின் அதிர்வெண்கள் கொடுக்கப்பட்ட பண்புடன் பொதுவாக தொடர்புடையதா அல்லது எதிர்பார்த்ததை விட அதிகமாக உள்ளதா என்பதைக் கவனிப்பதன் மூலம்; பண்பு மற்றும் மாறுபாட்டிற்கு இடையில் ஒரு தொடர்பு உருவாக்கப்படுகிறது. இருப்பினும், இணைப்பு சமநிலையின்மை மற்றும் மரபணுவின் பெரிய அளவு காரணமாக இந்த தொடர்புகளில் பல ஒரு தனிநபர் முழுவதும் உருவாக்கப்படலாம். ஜி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் மரபணு முழுவதும் குறிப்பான்களை அடையாளம் காண்பதில் மதிப்புமிக்க நுண்ணறிவை வழங்கினாலும், எஸ். என். பி. களின் பெரும்பகுதி குறியீட்டு அல்லாத எம்ஆர்என்ஏ பகுதிகளில் உள்ளன, மேலும் பல அறியப்படாத செயல்பாடுகளைக் கொண்டுள்ளன, அவை நிலையான முறைகள் மூலம் தீர்மானிக்க கடினமாக உள்ளன, ஏனெனில் மரபணுவின் இந்த பகுதிகளால் எந்த தயாரிப்பும் உற்பத்தி செய்யப்படவில்லை. டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன்-வைட் அசோசியேஷன் ஆய்வுகள் ஜி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் முடிவுகளிலிருந்து தகவல்களை எடுக்க முடியும், மேலும் இந்த முடிவுகளை குறிப்பு தரவுகளாகப் பயன்படுத்த முடியும், பின்னர் மரபணுக்களை அடையாளம் கண்டு முன்னுரிமை அளிக்க உதவும். இந்த பகுப்பாய்வைச் செய்ய, மரபணு வெளிப்பாட்டிற்கான ஒரு குறிப்பு குழு பெறப்பட வேண்டும், அதாவது ஒரு வெளிப்பாடு அளவு பண்பு இடம் (eQTL), இது மரபணு வெளிப்பாடு ஒழுங்குமுறையைக் காட்ட உதவுகிறது. குறிப்பு பலகையைப் பயன்படுத்தி, மரபணுக்களின் வெளிப்பாடு மாறுபாட்டைக் குறிக்க ஒரு முன்கணிப்பு மாதிரியை உருவாக்க முடியும். இம்ப்யூட்டேஷன் என்பது ஒரு குறிப்பு குழுவின் அடிப்படையில் அவற்றின் மரபணுவில் இருக்கும் மாறுபாட்டின் மூலம் மற்ற உயிரினங்களில் உள்ள மரபணுக்களின் வெளிப்பாட்டு அளவை நீங்கள் கணிக்கக்கூடிய செயல்முறையாகும். ஒரு திசுவிற்குள் உள்ள மரபணு வெளிப்பாட்டின் அளவைக் கணிப்பதன் மூலம், சுற்றுச்சூழல் மற்றும் எபிஜெனெடிக் விளைவுகள் போன்ற பிற மாறிகள் அகற்றப்படுகின்றன, ஏனெனில் இந்த கணிப்பு தற்போதுள்ள மாறுபாடு மற்றும் எதிர்பார்க்கப்படும் மரபணு வெளிப்பாட்டின் அளவை மட்டுமே அடிப்படையாகக் கொண்டது. இருப்பினும், இது மரபணு வெளிப்பாட்டு கணிப்புகளுடன் தவறுகளுக்கு வழிவகுக்கும், ஏனெனில் சூழல் மற்றும் எபிஜெனெடிக் மாற்றங்கள் இரண்டும் மரபணு வெளிப்பாட்டின் அளவை மாற்ற முடியும். சிஸ்-மரபணு கூறுகள் eQTL களின் முதன்மை மையமாக உள்ளன, ஏனெனில் இவை ஒரு மரபணுவின் 1 மெகாபேஸிற்குள் இருக்கும் கூறுகள். அந்த ஆய்விலிருந்து குறிப்பிடத்தக்க எஸ். என். பி. களின் மரபணு வெளிப்பாட்டைக் கணிக்க முன்கணிப்பு மாதிரியை ஜி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் மாதிரிகளுக்கு பயன்படுத்தலாம். வெளிப்பாடு நிலைகள் மதிப்பிடப்பட்ட பிறகு, கணிக்கப்பட்ட வெளிப்பாடு மற்றும் மரபணு வகைகளின் நிலைகளை தனிநபரின் தோற்றவழிகளுடன் தொடர்புபடுத்துவதன் மூலம் மரபணு-பண்பு இணைப்பு சோதனைகள் செய்யப்படுகின்றன. அடிப்படையில், ஒரு டி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் ஜி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் முடிவுகளை எடுக்க முடியும் மற்றும் பண்பு தொடர்புடைய மரபணுக்களின் வெளிப்பாடு நிலைகளில் ஒவ்வொரு மாறுபாட்டின் விளைவுகளையும் கணிக்க முடியும், மேலும் மரபணு முழுவதும் பண்பு தொடர்புடைய ஒவ்வொரு இடத்திற்கும் இதைச் செய்ய முடியும். ஜி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் முடிவுகளைப் போலவே, முடிவுகளையும் மன்ஹாட்டன் சதித்திட்டத்தில் விளக்க முடியும். புள்ளிவிவர ரீதியாக குறிப்பிடத்தக்க முடிவுகளைக் கொண்டதாகக் கருதப்படும் எந்தவொரு இடமும் அதிக பி மதிப்பைக் கொண்டிருக்கும், மேலும் இது அந்த இடம் ஆராயப்படும் பண்பு அல்லது நோயுடன் தொடர்புடையதாக இருக்கலாம் என்பதைக் குறிக்கிறது. எந்தவொரு புள்ளிவிவர ரீதியாக குறிப்பிடத்தக்க பி-மதிப்புகளும் அதிக பதிவு பி-மதிப்பைக் கொண்டுள்ளன மற்றும் பான்ஃபெரோனி திருத்தக் கோட்டிற்கு மேலே காட்டப்படுகின்றன. மன்ஹாட்டன் பிளாட் என்று பெயரிடப்பட்டுள்ளது, ஏனெனில் புள்ளிவிவர ரீதியாக குறிப்பிடத்தக்க மரபணுக்கள் பிளாட்டில் "வானளாவிய கட்டிடங்களாக" தோன்றுகின்றன, மேலும் இந்த பண்புடன் தொடர்புடைய பல மரபணுக்கள் இருக்கும்போது, பிளாட் மன்ஹாட்டன் ஸ்கைலைனை ஒத்திருக்கிறது. மன்ஹாட்டன் பிளாட் படம் ஜி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் ஆய்வுக்கானது என்றாலும், டி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் முடிவுகள் அதே வழியில் காட்டப்படுகின்றன. புள்ளியியல் ரீதியாக குறிப்பிடத்தக்க இடம் என்பது எஸ். என். பி. களுடன் கணிசமாக தொடர்புடைய மரபணுக்கள் ஆகும், அவற்றின் வெளிப்பாடு பண்பு அல்லது ஆர்வமுள்ள நோயுடன் தொடர்புடையது. ப்ரீடிஎக்ஸ்கேன் மற்றும் ஃபியூஷன் இரண்டும் டி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் மென்பொருளாகும், அவை மரபணு-பண்பு தொடர்புகளை ஆராய மரபணு ஆய்வுகளில் பயன்படுத்தப்பட்டுள்ளன. ப்ரீடிஎக்ஸ்கேன் என்பது நன்கு உருவாக்கப்பட்ட டி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் மென்பொருளாகும், இது மரபணு ரீதியாக ஒழுங்குபடுத்தப்பட்ட வெளிப்பாட்டை மதிப்பிடும் திறனைக் கொண்டுள்ளது மற்றும் ஆராயப்படும் பினோட்டைப்புடன் தொடர்புகளை தீர்மானிக்கும் திறனைக் கொண்டுள்ளது. கவனிக்கப்பட்ட மரபணு வெளிப்பாடு மற்றும் குறிப்பு தரவுத்தொகுப்பிலிருந்து பெறப்பட்ட சிஸ்-எஸ். என். பி. களின் நிலைகளுக்கு எடையைக் கொடுக்க இது தண்டிக்கப்பட்ட பின்னடைவு மாதிரியைப் பயன்படுத்துகிறது. மென்பொருள் பின்னர் மரபணு-பண்பு இணைப்பு சோதனைகளைச் செய்ய தனிப்பட்ட மரபணு வகை தரவைப் பயன்படுத்துகிறது. ஃப்யூஷன் என்பது மற்றொரு டி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் மென்பொருளாகும், இது சங்க சோதனைகளை உருவாக்க வேறுபட்ட புள்ளிவிவர பகுப்பாய்வைப் பயன்படுத்துகிறது. இந்த மாதிரியில், முன்கணிப்பு மாதிரியிலிருந்து அனுமான முறைகள் பேய்சியன் ஸ்பார்ஸ் லீனியர் கலப்பு மாதிரியின் அடிப்படையில் கணக்கிடப்படுகின்றன. இந்த மென்பொருளின் நன்மை என்னவென்றால், தனிப்பட்ட மரபணு வகை தரவுகளில் சங்க சோதனைகளைச் செய்ய முடியும், ஆனால் இந்த மென்பொருள் குற்றச்சாட்டைப் பயன்படுத்தி பெரிய அளவிலான தரவுத் தொகுப்புகளிலிருந்தும் தகவல்களை எடுக்க முடியும். நன்மைகள் மரபணுக்களின் செயல்பாடு மற்றும் மரபணு செயல்பாடுகள் மற்றும் மரபணு வெளிப்பாட்டிற்கு இடையிலான தொடர்பு குறித்து ஆராய்ச்சியாளர்களுக்கு இது வழங்கும் நுண்ணறிவு மூலம் இந்த முறையின் நன்மைகள் உள்ளன. டி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ். ஜி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ்ஸிலிருந்து முடிவுகளை எடுக்கும் ஆற்றலைக் கொண்டுள்ளது மற்றும் நோய் வழிமுறைகளைப் புரிந்துகொள்ள உதவும் வகையில் முடிவுகளை விரிவுபடுத்துகிறது. கூடுதலாக, இந்த முறை முன்பு ஜி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் பகுப்பாய்வால் அடையாளம் காணப்பட்ட இருப்பிடத்தைப் பயன்படுத்துவதால், குறைவான தளங்கள் பகுப்பாய்வு செய்யப்படுவதால் டி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் உடன் தொடர்புடைய குறைந்த சோதனைச் சுமை உள்ளது. பகுப்பாய்வு செய்யப்படும் இடங்களின் எண்ணிக்கையைக் குறைப்பதன் மூலம், இது பகுப்பாய்வு செய்யப்பட்ட தளங்களின் ஆழமான பகுப்பாய்வை அனுமதிக்கிறது, மேலும் குறிப்பிடத்தக்க இடத்தின் செயல்பாடுகள் மற்றும் தொடர்புகளுக்கு மேலும் நுண்ணறிவை வழங்க முடியும். குழப்பமான காரணிகளின் விளைவுகளைக் குறைக்கும் நன்மையும் டி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ்-க்கு உள்ளது. ஒரு முன்கணிப்பு மாதிரியை உருவாக்கும் போது, அது மரபணு வெளிப்பாட்டை மட்டுமே பார்க்கிறது, மொத்த வெளிப்பாடு அல்ல. மொத்த வெளிப்பாடு சுற்றுச்சூழல் மற்றும் வெளிப்பாட்டின் நிலைகளுக்கு எபிஜெனெடிக் மாற்றங்கள் போன்ற காரணிகளை உள்ளடக்கியது, மேலும் அவை முன்கணிப்பு மாதிரியில் கணக்கிடப்படவில்லை. இந்த காரணிகளைக் கணக்கிடாமல் இருப்பதன் மூலம், இது மரபணு வெளிப்பாட்டின் கணிக்கப்பட்ட நிலைகளின் துல்லியத்தைக் குறைக்கலாம்; இருப்பினும், இது முடிவுகளில் குழப்பமான மாறிகளின் விளைவுகளையும் குறைக்கிறது. டி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ்ஸின் மற்றொரு நன்மை என்னவென்றால், முடிவுகள் திசு சார்ந்தவை. மரபணு வெளிப்பாட்டின் அளவு மரபணுக்கள் இருக்கும் திசுக்களைப் பொறுத்து வேறுபடுகிறது, ஏனெனில் ஒவ்வொரு திசுவிலும் குறிப்பிட்ட பிளவுபடுத்தும் வடிவங்கள் மற்றும் ஒழுங்குமுறையின் வடிவங்கள் உள்ளன. திசு குறிப்பிட்ட முடிவுகளைக் கொண்டிருப்பதன் மூலம், இந்த ஆய்வுகளின் மூலம் பெறக்கூடிய தகவல்களை இது மேலும் மேம்படுத்துகிறது, ஏனெனில் திசு வகைகளால் மரபணு கட்டுப்பாடு எவ்வாறு வேறுபடுகிறது என்பதையும், செயல்பாடுகள் எவ்வாறு கட்டுப்படுத்தப்படுகின்றன என்பதையும், திசுக்களுக்கு இடையில் பொதுவான ஒழுங்குமுறை வழிமுறைகள் இருந்தால் அல்லது ஒழுங்குமுறை வழிமுறைகள் இருந்தால் வெவ்வேறு திசுக்களில் வெவ்வேறு செயல்பாடுகளைக் கொண்டுள்ளன. டி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் குறுக்கு திசு முறைகள் பெரிய அளவில் நோய்கள் மற்றும் பண்புகளுக்கான சாத்தியமான காரண மரபணுக்களை அடையாளம் காணும் வாய்ப்பையும் கொண்டுள்ளன, இருப்பினும், ஒற்றை திசு முறைகள் ஒரு குறிப்பிட்ட வழக்கு அடிப்படையில் தொடர்புகளை தீர்மானிக்கும் திறனைக் கொண்டுள்ளன. வரம்புகள் டி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ்ஸின் பல குறைபாடுகள் மரபணு வகைகளின் அடிப்படையில் மரபணு வெளிப்பாட்டு அளவைக் கணிக்கப் பயன்படுத்தப்படும் மாதிரியின் முன்கணிப்பு திறன்களின் தாக்கங்களாகும். டி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ்ஸின் ஒரு குறைபாடு என்னவென்றால், இது முக்கியமாக சிஸ்-மரபணு கூறுகளை அனுமானத்திற்காகப் பார்க்கிறது மற்றும் பெரும்பாலான ஆய்வுகளில், எந்த டிரான்ஸ்-மரபணு கூறு வகைகளையும் அடையாளம் காணவில்லை. டிரான்ஸ்-ஜெனெடிக் கூறு மாறுபாடுகள் மரபணுவின் 1 மெகாபேஸ் வரம்பிற்கு வெளியே உள்ள எந்தவொரு ஒழுங்குமுறை வழிமுறைகளாகவும் இருப்பதால் இது டி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ்-க்கு ஒரு பாதகமாக செயல்படுகிறது, மேலும் அவை ஆர்வமுள்ள மரபணுவிலிருந்து குறிப்பிடத்தக்க தூரத்தில் இருந்தாலும், பல ஒழுங்குமுறை வழிமுறைகள் நீண்ட தூரம் செயல்படும் திறனைக் கொண்டுள்ளன மற்றும் வெளிப்பாட்டை இன்னும் பாதிக்கலாம். இந்த கூறுகளை கணக்கில் எடுத்துக் கொள்ளாமல் இருப்பதன் மூலம், இது கணிக்கப்பட்ட மரபணு வெளிப்பாடு நிலைகளின் துல்லியத்தை குறைக்கிறது மற்றும் எதிர்பார்க்கப்பட்ட மற்றும் கவனிக்கப்பட்ட வெளிப்பாடு நிலைகளுக்கு இடையில் விலகலை ஏற்படுத்தும். மேலே குறிப்பிட்டுள்ளபடி, இந்த ஆய்வுகளின் மற்றொரு குறைபாடு என்னவென்றால், மரபணு வெளிப்பாட்டை ஒழுங்குபடுத்துவதற்கான சுற்றுச்சூழல் மற்றும் எபிஜெனெடிக் வழிமுறைகள் மரபணு வெளிப்பாட்டிற்கான முன்கணிப்பு மாதிரியுடன் கணக்கில் எடுத்துக் கொள்ளப்படுவதில்லை, இது கணிக்கப்பட்ட மரபணு வெளிப்பாடு நிலைகள் மற்றும் கவனிக்கப்பட்ட வெளிப்பாடு நிலைகளில் தவறுகளுக்கு வழிவகுக்கும் ஆற்றலையும் கொண்டுள்ளது. டி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ்-க்கு மற்றொரு சவால் என்னவென்றால், மரபணுக்கள் குறைந்த பாரம்பரிய அளவைக் கொண்டிருக்கும்போது துல்லியமான மரபணு வெளிப்பாட்டு அளவைக் கணிப்பது கடினம். eQTLகள் பரம்பரைத் தன்மையின் அளவை நம்பியுள்ளன, மேலும் குறைந்த பரம்பரைத் தன்மையைக் கவனிக்கும்போது, அது தவறான நேர்மறைகளைக் கடைப்பிடிப்பதை பாதிக்கலாம் மற்றும் TWAS க்கு பயன்படுத்தப்படும் மாதிரியின் முன்கணிப்பு திறன்களை எதிர்மறையாக பாதிக்கலாம். கூடுதலாக, டி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ்-க்கு மற்றொரு சவால், ஜி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் முடிவுகளைப் போலவே, இந்த ஆய்வுகள் முடிவுகளிலிருந்து தொடர்புகளை மட்டுமே நிரூபிக்க முடியும். ஆர்வமுள்ள மரபணு அல்லது இருப்பிடத்திற்கும் பண்பு அல்லது நோய்க்கும் இடையே ஒரு புள்ளிவிவர ரீதியாக குறிப்பிடத்தக்க தொடர்பைக் காணலாம் என்றாலும், எந்த காரண உறவையும் பெற முடியாது. ஒரு காரண உறவை நிறுவுவதற்காக, காரண உறவுகளை அடையாளம் காண மரபணுக்களின் நாக்-அவுட்கள் அல்லது தளத்தால் இயக்கப்படும் பிறழ்வுக்கான தலைகீழ் மரபியல் அணுகுமுறையைப் பயன்படுத்தி மேலும் ஆய்வுகள் செய்யப்பட வேண்டும். டி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் முடிவுகளுடன் மற்றொரு சிக்கல் திசு சார்பு மற்றும் மையக் கட்டுப்பாடு ஆகியவற்றின் தாக்கங்கள் ஆகும். ஒவ்வொரு திசுவிலும் உள்ள மரபணு ஒழுங்குமுறை வழிமுறைகளின் தனித்துவம் காரணமாக, ஒவ்வொரு லோக்கி சங்கத்தின் திசு குறிப்பிட்ட தன்மையையும், இந்த சங்கங்கள் திசு வகைகளுக்கு இடையில் எவ்வாறு வேறுபடுகின்றன என்பதையும் தீர்மானிக்க பல சோதனைகள் செய்யப்பட வேண்டும். ஒரு நேரத்தில் ஒன்றுக்கு மேற்பட்ட இடங்களின் வெளிப்பாட்டைக் கட்டுப்படுத்தும் ஒரு ஒழுங்குமுறை பொறிமுறையின் விளைவாக இணை ஒழுங்குமுறை ஏற்படுகிறது. ஒன்றுக்கு மேற்பட்ட இருப்பிடங்களைக் கட்டுப்படுத்துவதன் மூலம், ஒரே பொறிமுறையால் மட்டுமே கட்டுப்படுத்தப்படும் பிற மரபணுக்கள் அல்லது இருப்பிடங்களுடன் ஆர்வமுள்ள இருப்பிடத்திற்கு இடையே தொடர்புகள் வரையப்படலாம் மற்றும் ஆர்வமுள்ள பண்பு அல்லது நோயுடன் எந்த தொடர்பும் இல்லாமல் இருக்கலாம், இது தவறான நேர்மறையான முடிவுகளுக்கு வழிவகுக்கும். ஸ்கிசோஃப்ரினியாவுடன் தொடர்புடைய இருப்பிடத்தை ஜி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் ஆய்வு செய்ததைத் தொடர்ந்து ஸ்கிசோஃப்ரினியா ஒரு டி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் ஆய்வு செய்யப்பட்டது. ஜி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் முடிவுகளிலிருந்து, 100 க்கும் மேற்பட்ட ஆபத்து இடங்கள் கண்டுபிடிக்கப்பட்டன. வெளிப்பாட்டுத் தரவைப் பயன்படுத்தி 157 குறிப்பிடத்தக்க இருப்பிடங்களை அடையாளம் காண ஒரு டி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் பயன்படுத்தப்பட்டது, மேலும் டி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ்ஸிலிருந்து அடையாளம் காணப்பட்ட 35 இருப்பிடங்கள் ஜி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் இருப்பிடத்துடன் இணைக்கப்படவில்லை. ஒழுங்குமுறை இலக்கு விசாரணைகளைப் பயன்படுத்தி முடிவுகள் மேலும் சுருக்கப்பட்டன. இவற்றில் 42 மரபணுக்கள் குரோமாட்டின் பினோட்டைப்களுடன் புள்ளிவிவர ரீதியாக குறிப்பிடத்தக்க தொடர்பைக் கொண்டிருப்பது கண்டறியப்பட்டது, இது மேலும் ஆராயக்கூடிய ஒரு ஒழுங்குமுறை பொறிமுறையாகும். எம். ஏ. பி. கே. 3 என்பது நரம்பியல் வளர்ச்சி பினோட்டைப்களில் பெரிய தாக்கத்தை ஏற்படுத்தும் ஒரு சங்கமாகும், மேலும் இது ஒரு கேண்டிடேட் காரண மரபணுவாக மேலும் முன்னுரிமை அளிக்கப்பட்டது. மார்பக புற்றுநோய் 2018 ஆம் ஆண்டில், மார்பக புற்றுநோய்க்கான காரண மரபணுக்களை அடையாளம் காண ஒரு டி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் பயன்படுத்தப்பட்டது. மரபணு மாதிரிகள் மற்றும் ஐரோப்பிய வம்சாவளியைச் சேர்ந்த 229,000 பெண்களை நிறுவ புற்றுநோய் மரபணு அட்லஸிலிருந்து தரவு சேகரிக்கப்பட்டது. இந்த ஆய்வில், 8,597 மரபணுக்கள் மதிப்பீடு செய்யப்பட்டன. ஜி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் ஆய்வுகள் மூலம், சுமார் 170 இருப்பிடங்கள் மார்பக புற்றுநோயின் குறைந்தது ஒரு மாறுபாட்டுடன் தொடர்புடையவை. இந்த ஆய்வில், மார்பக புற்றுநோயின் ஒரு மாறுபாட்டுடன் 17 மரபணுக்களுக்கு தொடர்பு இருப்பது கண்டறியப்பட்டது. தொடர்புகளைக் கொண்ட 199 மரபணுக்களில், 48 பான்ஃபெரோனி-திருத்த வரம்பைப் பயன்படுத்தி புள்ளிவிவர ரீதியாக குறிப்பிடத்தக்கவை என்று அடையாளம் காணப்பட்டன (மேலே உள்ள மன்ஹாட்டன் சதித்திட்டத்தில் காணப்படுவது போல). இவற்றில் 14 மார்பக புற்றுநோயின் அபாயத்துடன் தொடர்புடையதாக முன்னர் தெரிவிக்கப்படவில்லை. அறியப்பட்ட ஆபத்து உள்ள மற்ற 34 மரபணுக்களில் 23 உள்ளன, அவை எந்த தொடர்புடைய ஆபத்து எஸ். என். பி. களையும் கொண்டிருக்கவில்லை. மரபணு நாக்-டவுன்களைப் பயன்படுத்தி, அதிக கணிக்கப்பட்ட அளவிலான வெளிப்பாட்டைக் கொண்ட 13 மரபணுக்கள் அதிகரித்த ஆபத்துடன் தொடர்புடையவை என்று கண்டறியப்பட்டது. கீழே தள்ளப்பட்டபோது, ஆய்வு செய்யப்பட்ட 11 மரபணுக்கள் மார்பக புற்றுநோயின் செல் வரிசையில், குறிப்பாக 184A1 சாதாரண மார்பக உயிரணுக்களில் ஒரு விளைவைக் கொண்டிருந்தன என்று ஆய்வுகள் காட்டுகின்றன. இந்த மரபணுக்களில் பின்வருவன அடங்கும்ஃ பிஐடிடி1, என்ஆர்பிஎஃப்2 மற்றும் ஏபிஹெச்டி8. ஆய்வில் அடையாளம் காணப்பட்ட அனைத்து மரபணுக்களும், மேல் மற்றும் கீழ்-ஒழுங்குபடுத்தப்பட்டவை ஒப்பீட்டளவில் அதிக சிஸ்-பரம்பரைத்தன்மையைக் கொண்டிருந்தன. பார்கின்சன் நோய் ஒரு டி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் ஆய்வு 2021 இல் முடிக்கப்பட்டது, இது மிக சமீபத்திய பார்கின்சன் நோய் (பி. டி) ஜி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் ஐப் பயன்படுத்தியது, இது 480.000 நபர்களைப் பயன்படுத்தியது. அந்த முடிவுகளிலிருந்து, 18 மரபணுக்கள் பி. டி உடன் புள்ளிவிவர ரீதியாக குறிப்பிடத்தக்க தொடர்பைக் கொண்டிருப்பது கண்டறியப்பட்டது. இவற்றில் மிகவும் குறிப்பிடத்தக்கது எல். ஆர். ஆர். சி 37ஏ2 ஆகும், இது அனைத்து 13 மூளை திசுக்களிலும் தொடர்புடையது என்று கண்டறியப்பட்டது. டி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் அட்லஸ் என்பது பல டி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் ஆய்வுகளின் கண்டுபிடிப்புகளை ஒருங்கிணைக்க வடிவமைக்கப்பட்ட ஒரு தளமாகும். இந்த அட்லஸ் கிட்டத்தட்ட உள்ளது மற்றும் பொதுமக்களுக்கு அணுகக்கூடியது. டி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் அட்லஸில் வெளியிடப்பட்ட முடிவுகள் மற்றும் கண்டுபிடிப்புகள் எதிர்கால ஆய்வுகள் மற்றும் மரபணு ஒழுங்குமுறை வழிமுறைகளைப் புரிந்துகொள்ள உதவும் வகையில் ஒருங்கிணைக்கப்பட்டு ஒருங்கிணைக்க முடியும். முடிவுகளின் ஒருங்கிணைப்பை மேம்படுத்த முடிவுகள் காட்சி முறையில் வழங்கப்படுகின்றன. தற்போது, ஏப்ரல் 25,2022 நிலவரப்படி, 257 பண்புகள் மற்றும் 22,247 மரபணுக்களில் பரவியுள்ள 200 வெளியீடுகளிலிருந்து 401,226 டி. டபிள்யூ. ஏ. எஸ் சங்கங்கள் வெளியிடப்பட்டுள்ளன. குறிப்புகள் மரபியல்