Hydrocarbonoclastic bacteria
ஹைட்ரோகார்பனோக்ளாஸ்டிக் பாக்டீரியா (ஹைட்ரோகார்பன் சீரழிக்கும் பாக்டீரியா, எண்ணெய் சீரழிக்கும் பாக்டீரியா அல்லது எச். சி. பி என்றும் அழைக்கப்படுகிறது) என்பது ஹைட்ரோகார்பன் சேர்மங்களை கார்பன் மற்றும் ஆற்றலின் ஆதாரமாக சிதைத்து பயன்படுத்தக்கூடிய புரோக்கரியோட்டுகளின் பன்முகக் குழுவாகும். உலகெங்கிலும் உள்ள பெரும்பாலான சூழல்களில் இருந்தபோதிலும், இந்த சிறப்பு பாக்டீரியாக்களில் பல கடலில் வாழ்கின்றன மற்றும் மாசுபட்ட கடல் நீரில் இருந்து தனிமைப்படுத்தப்பட்டுள்ளன. வகைபிரித்தல் மற்றும் விநியோகம் ஹைட்ரோகார்பன்-சிதைவு பாக்டீரியாவின் வகைபிரித்தல் பன்முகத்தன்மை நாம் அதிக வகைபிரிவை கருத்தில் கொண்டால் வியத்தகு முறையில் மாறவில்லை, பல ஆய்வுகள் 25 வகையான ஹைட்ரோகார்பன்-சிதைவு பாக்டீரியாக்கள் மற்றும் கடல் சூழல்களிலிருந்து தனிமைப்படுத்தப்பட்ட 25 வகையான பூஞ்சைகள் பற்றிய தகவல்களை வழங்கியுள்ளன. எண்ணெயிலிருந்து தனிமைப்படுத்தப்பட்ட கோர்டோனியா, ப்ரெவிபாக்டீரியம், ஏரோமைக்ரோபியம், டயட்ஜியா, பர்க்ஹோல்டேரியா மற்றும் மைக்கோபாக்டீரியம் போன்ற பாக்டீரியா இனங்கள் ஹைட்ரோகார்பன் சீரழிவுக்கான சாத்தியமான உயிரினங்களாக நிரூபிக்கப்பட்டுள்ளன. செர்னிலியா மற்றும் பலர். ஒன்பது சயனோபாக்டீரியாக்கள், ஐந்து பச்சை ஆல்காக்கள், ஒரு சிவப்பு ஆல்கா, ஒரு பழுப்பு ஆல்கா மற்றும் இரண்டு டயாட்டம்கள் நாப்தலீனை ஆக்சிஜனேற்றம் செய்ய முடியும் என்பதைக் கவனித்தனர். வெப்பநிலை முக்கியமானது, ஏனெனில் இது நுண்ணுயிர் உடலியல் மற்றும் பன்முகத்தன்மையை பாதிக்கிறது; வெப்பநிலை குறைவதால் பொதுவாக உயிரியல் சிதைவு விகிதம் குறைகிறது. ஹைட்ரோகார்பனோக்ளாஸ்டிக் பாக்டீரியாக்கள் டயசோபிலிக் ஆகும், அதாவது. அவை நைட்ரஜன் சேர்மங்களில் மிகவும் மோசமான சூழலில் வாழ முடியும், இது சுற்றுச்சூழல் முழுவதும் தங்களை விநியோகிக்க அனுமதிக்கிறது. அவை சுற்றுச்சூழல் நட்பு பயோசானைடேஷனுக்கு மிகவும் பயனுள்ளதாக இருக்கும்; ஏரோபிக் நிலைமைகளின் கீழ் மிக விரைவான மற்றும் முழுமையான சீரழிவு ஏற்படுகிறது. எண்ணெய் கசிவுகள் இருக்கும் கடல் சூழல்களில் ஹைட்ரோகார்பன்கள் நிகழ்கின்றன, இது அவை நைட்ரஜன் ஆதாரங்களிலிருந்து ஊட்டச்சத்து ரீதியாக சுயாதீனமானவை என்பதைப் புரிந்துகொள்ள உதவுகிறது, இது வளிமண்டல நைட்ரஜனை சரிசெய்யும் திறன் காரணமாகும். நைஜீரியாவில் உள்ள லாகோஸ் நகரில், கச்சா எண்ணெயை சீரழிக்கக்கூடிய மாசுபட்ட ஓட்டத்திலிருந்து தனிமைப்படுத்தப்பட்ட ஒன்பது பாக்டீரியா விகாரங்களான சூடோமோனாஸ் ஃப்ளோரெசென்ஸ், பி. எருகினோசா, பேசிலஸ் சப்டிலிஸ், பேசிலஸ் எஸ். பி., அல்காலிஜென்ஸ் எஸ். பி., அசினடோபாக்டர் லோஃபி, ஃபிளாவோபாக்டீரியம் எஸ். பி., மைக்ரோகோக்கஸ் ரோஸஸ் மற்றும் கோரினெபாக்டீரியம் எஸ். பி. ஆகியவை கண்டறியப்பட்டன; வடகிழக்கு இந்தியாவிலும் அவை கண்டறியப்பட்டன. மெக்ஸிகோ வளைகுடாவில் நடந்த லூசியானா சம்பவத்தில், சுமார் 100 விகாரங்கள் கண்டறியப்பட்டு ஆய்வு செய்யப்பட்டன, தனிமைப்படுத்தப்பட்டவை அனைத்தும் புரோட்டியோபாக்டீரியா பைலம் மற்றும் மூன்று வகுப்புகளைச் சேர்ந்தவை என்பதை வெளிப்படுத்துகின்றன (ஆல்டெரோமோனாடேல்ஸ், ரோடோஸ்பைரில்லல்ஸ் மற்றும் என்டெரோபாக்டீரியல்ஸ்). இந்த உயிரினங்கள் பொதுவாக மிகக் குறைந்த எண்ணிக்கையில் உள்ளன, அவை வேகமாக வளர்ந்து பெருகும்போது கார்பன் மற்றும் ஆற்றல் போன்ற ஹைட்ரோகார்பன்களை விட ஒரு நன்மையை அளிக்கின்றன. அமெரிக்கா, ஜெர்மனி, இங்கிலாந்து, ஸ்பெயின், இத்தாலி, சிங்கப்பூர், சீனா, மேற்கு பிலிப்பைன்ஸ், ஜப்பான், அண்டார்டிகாவுக்கு அருகிலுள்ள மத்திய அட்லாண்டிக் ரிட்ஜ் மற்றும் கிழக்கு பசிபிக் பெருங்கடலில் உள்ள ஆழமான நீர் வண்டல்கள் உள்ளிட்ட உலகெங்கிலும் உள்ள எண்ணெய் பாதிக்கப்பட்ட சூழல்களில் அல்கானிவோராக்ஸ் போன்ற பாக்டீரியாக்கள் கண்டறியப்பட்டுள்ளன. உடலியல் மற்றும் வளர்சிதை மாற்ற ஹைட்ரோகார்பனோக்ளாஸ்டிக் பாக்டீரியாக்கள் இரண்டு அடிப்படை பண்புகளைக் கொண்டுள்ளனஃ (1) குறிப்பிட்ட சவ்வு-பிணைக்கப்பட்ட டைஆக்சிஜனேஸ்கள் மற்றும் (2) நீரில் கரையாத ஹைட்ரோகார்பன்களுடன் தொடர்பை மேம்படுத்துவதற்கான வழிமுறைகள். எண்ணெய் மாசுபாடு ஏற்படும் இடங்களில் நுண்ணுயிர் உயிரியல் சிதைவு ஏற்படுகிறது. இருப்பினும், உயிரியல் சிதைவு விகிதங்கள் மெதுவாக உள்ளன, இதன் விளைவாக தண்ணீரிலும் கடற்கரையிலும் உள்ள கடல்வாழ் உயிரினங்களில் கடுமையான நச்சு விளைவுகள் ஏற்படுகின்றன. பெட்ரோலியத்தில் உள்ள ஹைட்ரோகார்பன்கள் அவற்றின் வேதியியல் தன்மையைப் பொறுத்து தண்ணீரில் வேறுபட்ட நடத்தையைக் கொண்டுள்ளன. இந்த செயல்முறை வானிலை என்று அழைக்கப்படுகிறது, குறைந்த மூலக்கூறு எடை கொண்டவை மேற்பரப்பை அடையும் போது ஆவியாதல் அடைகின்றன. மீதமுள்ளவர்கள் இதைச் செய்யக்கூடிய பாக்டீரியாவால் தாக்கப்படுகிறார்கள். இந்த பாக்டீரியாக்கள் எண்ணெயுடன் ஒட்டிக்கொள்வதில்லை மற்றும் செல் மேற்பரப்பில் அதிக ஹைட்ரோபோபசிட்டி இல்லை. சீரழிவின் அடுத்த கட்டம் உயர் செல் மேற்பரப்பு ஹைட்ரோபோபிசிட்டி கொண்ட நுண்ணுயிரிகளை உள்ளடக்கியது, அவை எஞ்சியிருக்கும் உயர் மூலக்கூறு எடை ஹைட்ரோகார்பன்களைக் கடைப்பிடிக்க முடியும். ஹைட்ரோபோபிக் ஃபிம்ப்ரியா, ஃபைப்ரில்கள், கொழுப்புகள் மற்றும் வெளிப்புற சவ்வின் புரதங்கள் மற்றும் கிராமிசிடின் எஸ் மற்றும் ப்ராடிஜியோசின் போன்ற செல் மேற்பரப்பின் சில சிறிய மூலக்கூறுகள் காரணமாக ஒட்டுதல் ஏற்படுகிறது. அனைத்து பெட்ரோலியப் பொருட்களும் கச்சா எண்ணெயிலிருந்து பெறப்படுகின்றன, அதன் முக்கிய கூறுகள் ஹைட்ரோகார்பன்கள் ஆகும், அவை நான்கு பகுதிகளாகப் பிரிக்கப்படலாம்ஃ நிறைவுற்ற, நறுமண, பிசின் மற்றும் நிலக்கீல் பின்னங்கள். நுண்ணுயிர் சீரழிவுக்கு ஹைட்ரோகார்பன்களின் எளிதில் பாதிக்கப்படக்கூடிய தன்மையை பொதுவாக பின்வருமாறு வகைப்படுத்தலாம்ஃ நேரியல் ஆல்கேன்கள் கிளை ஆல்கேன்கள்> சிறிய நறுமணங்கள்> சுழற்சி ஆல்கேன்கள். உயர் மூலக்கூறு எடை கொண்ட பாலிசைக்ளிக் நறுமண ஹைட்ரோகார்பன்கள் (PAHs) போன்ற சில சேர்மங்கள் சிதைக்கப்படாமல் போகலாம், நிலக்கீல் மற்றும் பிசின்கள் உயிரியல் சீரழிவுக்கு மறுசீரமைப்பாகக் கருதப்படுகின்றன. அல்கேன் சீரழிவு பாதைகள் அல்கேன்கள் பல வேறுபட்ட பாதைகள் மூலம் கடலில் ஏரோபிக் முறையில் எளிதில் மக்கும். முனைய ஆக்சிஜனேற்றம் சூடோமோனாஸ் புட்டிடா மூலம் நடுத்தர நீளமுள்ளவற்றின் சீரழிவு ஆல்கேன் ஹைட்ராக்சிலேஸிலிருந்து தொடங்குகிறது, இந்த நொதி மூன்று கூறுகளால் ஆனதுஃ சவ்வு-பிணைக்கப்பட்ட ஆக்ஸிஜனேஸ் கூறு மற்றும் ரூப்ரெடாக்ஸின் மற்றும் ரூப்ரெடாக்ஸின் ரிடக்டேஸ் எனப்படும் இரண்டு கரையக்கூடிய கூறுகள். அல்கேன் ஹைட்ராக்சிலேஸ் மூலம் n-அல்கேன்களின் மெத்தில் குழுவின் ஆக்சிஜனேற்றத்திலிருந்து, n-அல்கேனோல்கள் வெளியிடப்படுகின்றன, அவை n-அல்கேனல்களில் சவ்வு-பிணைக்கப்பட்ட ஆல்கஹால் டீஹைட்ரஜனேஸ் மூலம் மேலும் ஆக்சிஜனேற்றப்படுகின்றன. n-ஆல்கனால்கள் பின்னர் கொழுப்பு அமிலங்களாகவும் பின்னர் அசைல் CoA ஆகவும் மாற்றப்படுகின்றன, முறையே ஆல்டிஹைட் டீஹைட்ரஜனேஸ் மற்றும் அசைல்-CoA செயற்கை மூலம். CH3-R-CH3-> CH3-R-CH2OH-> CH3-R-COOH-> (CH2OH)-R-COOH CH3-R-CH2OH-> (CH2OH)-R-CH2OH-> (CH2OH)-R-COOH-> (CH2OH)-R-COOH (CH2OH)-R-COOH (CH2OH)-R-COOH-> CHO-R-COOH-> HOOC-R-COOH துணை முனைய ஆக்சிஜனேற்றம் இந்த பாதை இரண்டாம் நிலை ஆல்கஹால்களின் வெளியீட்டிற்கு வழிவகுக்கிறது. என்-ஆல்கேன்கள் மோனோஆக்சிஜனேஸ் மூலம் இரண்டாம் நிலை ஆல்கஹால்களாகவும், பின்னர் கீட்டோன்களாகவும், இறுதியாக கொழுப்பு அமிலங்களாகவும் ஆக்சிஜனேற்றப்படுகின்றன. R1-(CH2) (CH2)-R2-> R1-(CH2) (CHOH)-R2-> R1-(CH2) (CO)-R2-> R1-(CH2) O (CO)-R2-> R1-COOH + R2-COOH சைக்ளோஅல்கேன் சீரழிவு பாதைகள் சைக்ளோஅல்கேன்கள் ஒரு இணை ஆக்சிஜனேற்ற பொறிமுறையால் சீரழிக்கப்படுகின்றன, இது ஒரு சுழற்சி ஆல்கஹால் மற்றும் ஒரு கீட்டோன் உருவாவதற்கு வழிவகுக்கும் செயல்முறையாகும். ஒரு மோனோஆக்சிஜனேஸ் சுழற்சி கீட்டோனுக்குள் ஒரு ஆக்ஸிஜனை அறிமுகப்படுத்துகிறது மற்றும் சுழற்சி வளையம் பிளவுபடுத்தப்படுகிறது. நறுமண ஹைட்ரோகார்பன் சீரழிவு பாதைகள் நறுமண சேர்மங்களுக்கு வெவ்வேறு பாதைகள் உள்ளன, டோலுயீனைக் கருத்தில் கொண்டு குறைந்தது ஐந்து அறியப்படுகின்றன, இவை ஒவ்வொன்றும் குறிப்பிட்ட பாக்டீரியா இனங்களில் உள்ளன, பர்க்ஹோல்டேரியா எஸ். பி. டோலுயீன் வளர்சிதை மாற்றத்திற்கான பல பாதைகளைப் பயன்படுத்துவதில் திரிபு JS150 தனித்துவமானதுஃ TOL பாதைஃ இந்த பாதை அதற்கு குறியீடு செய்யும் ஒத்த பெயர் கொண்ட பிளாஸ்மிட்டின் பெயரைப் பெறுகிறது. டோலுயீன் ஆல்கஹால் ஆக பென்சைல் ஆகவும், பென்சால்டிகைட் ஆகவும், பின்னர் பென்சோயேட் ஆகவும் சீரழிக்கப்படுகிறது, இது மேலும் டி. சி. ஏ சுழற்சியின் இடைநிலைகளாக மாற்றப்படுகிறது. F1 பாதைஃ P.putida இந்த பாதையை மேற்கொள்ள முடியும், இது இரண்டு ஹைட்ராக்சில் குழுக்களை டோலுயீனில் அறிமுகப்படுத்துவதில் உள்ளது, இது சிஸ்-டோலுயீன் டைஹைட்ரோடியோலை உருவாக்குகிறது. இந்த இடைநிலை பின்னர் 3-மெத்தில்காடெசோலாக மாற்றப்படுகிறது. கேஆர்1 பாதைஃ சூடோமோனாஸ் மென்டோசினா கேஆர்1, டோலுயீன் 4-மோனோஆக்சிஜனேஸ் நொதி மூலம் டோலுயீனை பி-கிரெசோலாக மாற்ற முடியும். அதைத் தொடர்ந்து, மெத்தில் பக்கச் சங்கிலியின் ஆக்சிஜனேற்றம் மூலம் பி-ஹைட்ராக்ஸிபென்சோயேட் உருவாகிறது. பிகே01: சூடோமோனாஸ் பிக்கெட்டி பிகேஓ1 டோலுயீனை டோலுயீன் 3-மோனோஆக்சிஜீஸ் நொதியுடன் எம்-கிரெசோலாக ஆக்சிஜனேற்றுகிறது, இது மற்றொரு மோனோஆக்சிஜனேஸ் மூலம் 3-மெத்தில்காடெசோலாக ஆக்சிஜனேற்றப்படுகிறது. ஜி 4: புக்ஹோல்டேரியா செபாசியா ஜி 4 இல் ஜி 4 பாதை காணப்பட்டது, அங்கு டோலுயீன் 2-மோனோஆக்சிஜனேஸ் மூலம் ஓ-கிரெசோலாக மாற்றப்படுகிறது, பின்னர் மற்றொரு மோனோஆக்சிஜனேஸ் அதை 3-மெத்தில்காடெசோலாக மாற்றுகிறது. காற்றில்லா சீரழிவு பாதைகள் கடல் வண்டல்களில் சிக்கியுள்ள எண்ணெய் கூறுகள் காற்றில்லா நிலைமைகளில் தொடர்ந்து நீடிக்கின்றன. நைட்ரேட் குறைப்பு, சல்பேட் குறைப்பு, மீத்தேன் உற்பத்தி, Fe3 + குறைப்பு அல்லது ஒளிச்சேர்க்கை ஹைட்ரோகார்பன் ஆக்சிஜனேற்றத்துடன் இணைக்கப்படும்போது சில ஹைட்ரோகார்பன்கள் காற்றில்லா நிலைமைகளின் கீழ் ஆக்சிஜனேற்றப்படலாம். அனேரோபிக் பாக்டீரியம் திரிபு எச். டி-1 அல்லது டெட்ரடெக்கெய்ன் முன்னிலையில் வளர்கிறது. ஹைட்ரோகார்பன்கள் இல்லாத நிலையில், டெட்ரடெக்கேன் சிதைக்கப்படுகிறது, மேலும் முக்கிய வளர்சிதை மாற்ற இடைநிலை 1-டோடீசீன் காரணிகள் உயிரியல் சிதைவை பாதிக்கின்றன ஹைட்ரோகார்பன்களின் உயிரியல் சிதைவு பல இரசாயன, இயற்பியல் மற்றும் உயிரியல் காரணிகளால் கட்டுப்படுத்தப்படுகிறது. பயோசர்பாக்டண்டுகள்ஃ பாக்டீரியா மற்றும் ஹைட்ரோகார்பன்களுக்கு இடையிலான தொடர்பு அடிப்படையானது, ஏனெனில் முதல் சீரழிவு படி ஆக்ஸிஜனேஸின் பயன்பாட்டை உள்ளடக்கியது. ஒட்டுதல் மற்றும் குழம்பு உட்செலுத்துதல் வழிமுறைகளால் தொடர்பு விரும்பப்படுகிறது ஹைட்ரோகார்பன்களை உடைக்கும் பாக்டீரியாக்கள் பெரும்பாலும் இரண்டாம் நிலை வளர்சிதை மாற்றங்களாக உயிர் உட்செலுத்திகளை உற்பத்தி செய்கின்றன. இவற்றை குறைந்த மூலக்கூறு எடை மூலக்கூறுகளாகப் பிரிக்கலாம், அவை மேற்பரப்பு மற்றும் இடைமுக பதட்டங்களை திறம்பட குறைக்கின்றன, மேலும் அதிக மூலக்கூறு எடை பாலிமர்கள் மேற்பரப்புகளுடன் உறுதியாக பிணைக்கின்றன. சில பயோ எமல்ஸிபையர்கள் நீரில் கரையாத ஹைட்ரோபோபிக் அடி மூலக்கூறுகளில் பாக்டீரியாவின் வளர்ச்சியை ஊக்குவிக்கின்றன, அவற்றின் உயிர் கிடைக்கும் தன்மையை அதிகரிப்பதன் மூலமும், அவற்றின் மேற்பரப்பை அதிகரிப்பதன் மூலமும், மேற்பரப்புகளிலிருந்து அவற்றை உறிஞ்சி, அவற்றின் கரையக்கூடிய தன்மையை அதிகரிப்பதன் மூலமும். பயோசர்ஃபாக்டண்டுகள் ஒரு ஆம்பிஃபிலிக் தன்மையைக் கொண்டுள்ளன, இது அவற்றை உற்பத்தி செய்யும் நுண்ணுயிரிகளை ஹைட்ரோபோபிக் அடி மூலக்கூறுகளை சுரண்ட அனுமதிக்கிறது, இது இயக்கத்தை அனுமதிக்கிறது, போட்டியாளர்களைத் தவிர்க்கிறது. ஹைட்ரோபோபிக் பகுதி பொதுவாக நிறைவுற்ற அல்லது நிறைவுறா கொழுப்பு அமிலங்கள், கொழுப்பு ஹைட்ராக்ஸி அமிலங்கள் அல்லது கொழுப்பு ஆல்கஹால்களை 8 முதல் 18 கார்பன் அணுக்களுக்கு இடையில் சங்கிலி நீளத்துடன் கொண்டுள்ளது. ஹைட்ரோஃபிலிக் கூறுகள் சிறிய ஹைட்ராக்சில், பாஸ்பேட் அல்லது கார்பாக்சிலிக் குழுக்கள் அல்லது கார்போஹைட்ரேட்டுகள் அல்லது பெப்டைடுகளின் பகுதிகளைக் கொண்டுள்ளன. பயோசர்பாக்டண்டுகள் பெரும்பாலும் எதிர்மின் அயனி மற்றும் அயனி அல்லாத சேர்மங்களாகும். வளர்ச்சிக்கான ஊட்டச்சத்து தேவைகள்ஃ எச். சி. பி. க்கு அதிக அளவு நைட்ரஜன் மற்றும் பாஸ்பரஸ் தேவைப்படுகிறது. 1 கிலோ ஆக்சிஜனேற்றப்பட்ட ஹைட்ரோகார்பனுக்கு 150 கிராம் நைட்ரஜன் மற்றும் 30 கிராம் பாஸ்பரஸ் தேவை என்று மதிப்பிடப்பட்டுள்ளது. வெப்பநிலைஃ பெட்ரோலிய ஹைட்ரோகார்பன்களின் உயிரியல் சிதைவு 20 டிகிரி செல்சியஸ் முதல் 50 டிகிரி செல்சியஸ் வரை உகந்த வெப்பநிலையில் நிகழ்கிறது, அதே நேரத்தில் குறைந்த வெப்பநிலையில் சீரழிவு விகிதம் மெதுவாக இருக்கும். pH மற்றும் ஆக்ஸிஜன்ஃ பாக்டீரியாவுக்கு ஒரு நடுநிலை pH தேவைப்படுகிறது, இதில் அதே எண்ணெய் நுண்ணுயிர் வளர்ச்சிக்கு மிகவும் அமிலத்தன்மை கொண்ட சூழல்களை நடுநிலையாக்க உதவும். ஏரோபிக் சீரழிவுக்கு ஆக்ஸிஜன் முக்கியமானது. இந்த நேரத்தில், ஹைட்ரோகார்பனோக்ளாஸ்டிக் பாக்டீரியாவின் சூழலியல் பற்றிய பெரும்பாலான ஆய்வுகள் முக்கியமாக கடல் சூழல்களில் காணப்படும் பரந்த அளவிலான இனக்குழுவைக் குறிக்கின்றன. அவை ஒவ்வொன்றும் வெவ்வேறு வளர்சிதை மாற்றத்தால் வகைப்படுத்தப்படுவதால், இந்த உயிரினங்கள் அனைத்து வகையான ஹைட்ரோகார்பன் சேர்மங்களையும் மிகவும் திறமையான முறையில் சிதைக்கும் பொருட்டு ஒன்றிணைந்து செயல்படுகின்றன. கார்பன் உயிர் வேதியியல் சுழற்சியிலும் அவை ஒரு அடிப்படை பாத்திரத்தை வகிக்கின்றன, மேலும் சில இனங்கள் வெவ்வேறு கடல் உயிரினங்களுடன் சிக்கலான உறவுகளை உருவாக்க முடியும் என்பதை பல ஆய்வுகள் காட்டுகின்றன. ஒரு குறிப்பிட்ட கடல் பகுதியில் எண்ணெய் வெளியீடு (அல்லது எந்த வகையான ஹைட்ரோகார்பன் கலவை) நிகழும்போது, நிறைய பாக்டீரியா இனங்கள் அதை குடியேற்றத் தொடங்குகின்றன, ஏற்கனவே அங்கு இருக்கும் நுண்ணுயிர் சமூகத்தை மாற்றுகின்றன. அந்த சமூகங்களின் இயக்கவியலை பகுப்பாய்வு செய்வது உயிரியல் சிதைவுடன் தொடர்புடைய பொதுவான வடிவங்களைக் கண்டறிய வழிவகுத்துள்ளது, மேலும் அந்த தகவல்கள் உயிரியல் சிகிச்சை முறைகளை மேம்படுத்துவதற்கு பயனுள்ளதாக இருக்கும். ஹைட்ரோகார்பன்களின் இருப்பு அதிகரிக்கும் போது ஊட்டச்சத்துக்களின் அளவு மாறுவதால் நுண்ணுயிர் சமூகம் சிட்டு ஷஃபிளில் உள்ளதுஃ இந்த சுற்றுச்சூழல் சூழ்நிலையில் ஹைட்ரோகார்பன்களை ஆற்றல் ஆதாரமாகப் பயன்படுத்தக்கூடிய மற்றும் அவ்வாறு செய்ய அனைத்து நொதிகளையும் கொண்ட உயிரினங்களை மட்டுமே தேர்ந்தெடுக்க முடியும். கூடுதலாக, பெரும்பாலான எண்ணெய் உயிரியல் சிதைவு இனங்களுக்கு அவற்றின் கேடபாலிக் செயல்முறைகளை மேற்கொள்ள குறிப்பிட்ட அளவு பாஸ்பரஸ் மற்றும் நைட்ரஜன் தேவைப்படுகிறது. எனவே, ஹைட்ரோகார்பனோக்ளாஸ்டிக் பாக்டீரியா விகிதம் முக்கியமாக நைட்ரஜன் மற்றும் பாஸ்பரஸ் கிடைப்பதன் மூலம் மட்டுப்படுத்தப்பட்டுள்ளது என்று கூறலாம். இன் விட்ரோ மற்றும் இன் சிட்டு ஆகிய இரண்டிலும் நடத்தப்பட்ட பல சோதனைகள் எண்ணெய் கசிவு போன்ற நிகழ்வுகளின் போது ஓ. எச். சி. பி. க்கள் (கட்டாய ஹைட்ரோகார்பனோக்ளாஸ்டிக் பாக்டீரியா) வகிக்கும் அடிப்படை பங்கைக் காட்டியது. ஹைட்ரோகார்பன்கள் வெளியிடப்படும்போது பூக்கும் முதல் நுண்ணுயிரிகளின் எண்ணிக்கை ஜெனரலிஸ்டுகள் என்று அழைக்கப்படுபவை, அவை ஹைட்ரோகார்பன்களில் உள்ள மிக எளிய பிணைப்புகளை (குறிப்பிட்ட என்சைம்கள் மூலம்) உடைக்க முடியும் (பொதுவாக அவை என்-ஆல்கேன் சிதைவுகள்); அவற்றில், மிகவும் பொதுவான பேரினம் அல்கானிவோராக்ஸ் (மிக முக்கியமான இனங்கள் அல்கானிவோராக்ஸ் போர்க்குமென்சிஸ்) ஆகும், இது அலிஃபாடிக் ஹைட்ரோகார்பன் சேர்மங்களை சிதைக்க முடியும். அதைத் தொடர்ந்து, வல்லுநர்கள் வலுவான மற்றும் மிகவும் சிக்கலான வரம்புகளை சீரழிக்க பொது நிபுணர்களை மாற்றுகிறார்கள்; அவற்றில் மிகவும் அறியப்பட்ட இனங்களில் ஒன்று சைக்ளோக்ளாஸ்டிகஸ் ஆகும், இது எடுத்துக்காட்டாக, PAH (பாலிசைக்ளிக் நறுமண ஹைட்ரோகார்பன்கள்) போன்ற நறுமண ஹைட்ரோகார்பன்களை சீரழிக்க முடியும். இப்போது வரை, ஹைட்ரோகார்பனோக்ளாஸ்டிக் ஆர்க்கியா இனங்கள் எதுவும் கண்டுபிடிக்கப்படவில்லை, ஏனெனில் அவை எண்ணெய் கசிவு விளைவுகளுக்கு மிகவும் உணர்திறன் கொண்டவை என்று தோன்றுகிறது, கடற்கரைகள் மற்றும் கடலோர நீரில் மேற்கொள்ளப்பட்ட பல ஆய்வுகள் காட்டுகின்றன. ஆயினும்கூட, ஆர்க்கியா இனங்கள் ஒரு சூழலின் சுற்றுச்சூழல் நிலையின் குறிப்பான்களாகப் பயன்படுத்தப்படலாம். உயிரியல் சிகிச்சை செயல்முறைகளின் போது பிற கடல் உயிரினங்களுடனான உறவுகள் ஹைட்ரோகார்பனோக்ளாஸ்டிக் பாக்டீரியா உயிரியல் சிகிச்சை மற்றும் உயிரியல் சிதைவு செயல்முறைகளின் போது சுற்றுச்சூழல் வலையமைப்பின் ஒரு பகுதியாக அமைகிறது, இதில் பல நேரடி மற்றும் மறைமுக உறவுகள் மற்றும் பிற சமூகங்களுடனும் சுற்றியுள்ள சூழலுடனும் தொடர்புகள் உள்ளன. ஊட்டச்சத்துக்களைக் கட்டுப்படுத்துவதற்கான போட்டி, புரோட்டோசோவா மூலம் வேட்டையாடுதல், பேஜ்கள் மூலம் லைசிஸ் மற்றும் ஹைட்ரோகார்பன்களின் சீரழிவைக் குறைக்கும் அல்லது அதிகரிக்கும் கூட்டுறவு தொடர்புகள் ஆகியவை இத்தகைய தொடர்புகளில் அடங்கும். ஊட்டச்சத்துக்கள் கிடைப்பதும், ஊட்டச்சத்துக்கள் மறுசுழற்சி செய்யப்படுவதும் உயிரியல் சீரழிவு சமூகங்களின் முக்கிய அம்சங்களாகும். முன்பு கூறியபடி, பாஸ்பரஸ் மற்றும் நைட்ரஜனின் அளவு ஒரு நுண்ணுயிர் மக்கள்தொகையின் கட்டமைப்பை மாற்றியமைக்க முடியும், இதன் விளைவாக சுற்றுச்சூழல் அமைப்பில் சில மூலக்கூறுகளின் இருப்பு மூலம் வடிவமைக்கப்படும் சமூகத்தின் கலவை. ஃபேஜ்களுடனான வேட்டையாடுதல் மற்றும் தொடர்புகள் ஹைட்ரோகார்பனோக்ளாஸ்டிக் பாக்டீரியா சமூகத்தின் வளர்ச்சியையும் பாதிக்கின்றன. பயோமாஸ் வருவாயின் அதிகரிப்பு (இது பாக்டீரியோபேஜ்கள் லைசிஸ் அல்லது புரோட்டோசோவா வேட்டையாடலின் செயல்பாட்டைத் தூண்டுவதன் மூலம் பெறப்படலாம்) உயிரியல் நிவாரணத்தைத் தூண்டுவதன் மூலம் ஹைட்ரோகார்பனோக்ளாஸ்டிக் மக்கள்தொகைக்கு பயனளிக்கும். உண்மையில், சூழலில் எண்ணெய் இருப்பது புரோஃபேஜ்கள் மற்றும் ஏராளமான பாக்டீரியாக்களின் அடுத்தடுத்த லைசிஸைத் தூண்டும். அதே நேரத்தில், பேஜஸ் லைசிஸால் ஏற்படும் ஊட்டச்சத்துக்கள் மறுசுழற்சி ஊட்டச்சத்துக்கள் மற்றும் ஹைட்ரோகார்பன்கள் (ஆற்றல் வளமாகப் பயன்படுத்தப்படுகிறது) ஆகிய இரண்டின் இருப்பு மூலம் விரும்பப்படும் அந்த இனங்களின் மலர்ச்சியைத் தூண்டும். மறுபுறம், புரோட்டோசோவா இருப்பது சுற்றுச்சூழல் அமைப்பில் பாக்டீரியாக்களின் எண்ணிக்கையின் வளர்ச்சியைக் கட்டுப்படுத்துவதன் மூலம் எதிர் சூழ்நிலையை உருவாக்கலாம் (இது உயிரியல் சிதைவில் எதிர்மறையான விளைவை ஏற்படுத்துகிறது). அதனால்தான் கடல் சூழல்களில் வேட்டையாடுபவர்களுடனான தொடர்புகள் அடிப்படையானவை. இருப்பினும், குறிப்பிட்ட சந்தர்ப்பங்களில், வேட்டையாடுபவர்களின் இருப்பு பாக்டீரியா சீரழிவை அதிகரிக்கும், இது பென்சீன் அல்லது டோலுயீனுக்கு நிகழ்கிறது. மேலும், பேஜ்களில் என்ன நடக்கிறது என்பதைப் போலவே, வேட்டையாடும் செயல்பாடும் ஒரு ஊட்டச்சத்து வளையத்தை உருவாக்குகிறது, ஏனெனில் வேட்டையாடுபவர்கள் ஊட்டச்சத்துக்களை மீண்டும் கனிமமாக்க முடியும், இது பாக்டீரியா வளர்ச்சியை அதிகரிக்கிறது. உயிரியல் வேதியியல் கார்பன் சுழற்சியில் பங்கு ஹைட்ரோகார்பனோக்ளாஸ்டிக் பாக்டீரியா நீண்ட கார்பன் சேர்மங்களை ஆக்சிஜனேற்றம் செய்ய முடியும் என்பதால், அவற்றின் வளர்சிதை மாற்றம் உயிரியல் வேதியியல் கார்பன் சுழற்சியில் உயிரியல் எதிர்வினைகளின் பெரிய குடும்பத்தின் ஒரு பகுதியாகும். ஹைட்ரோகார்பன்கள், குறிப்பாக ஆல்கேன்கள், எண்ணற்ற உயிரினங்களால் கழிவுகளாகவும், பாதுகாப்பிற்காகவும், கட்டமைப்பு கூறுகளாகவும், வேதியியல் செறிவூட்டிகளாகவும் உற்பத்தி செய்யப்படுகின்றன. எனவே, இந்த வகை உயிரியல் சிதைவு ஹைட்ரோகார்பன் சேர்மங்களின் முக்கிய மூழ்கிகளில் ஒன்றையும், கடல் சூழல்களில் கார்பன் டை ஆக்சைடு ஆதாரங்களில் ஒன்றையும் குறிக்கிறது. முடிவில், ஹைட்ரோகார்பனோக்ளாஸ்டிக் பாக்டீரியாக்கள் இயற்கை மூலங்களிலிருந்து ஹைட்ரோகார்பன்களை அணிதிரட்டி, ஆக்சிஜனேற்றப்பட்ட கார்பன் அணுக்களைப் பயன்படுத்தி அவற்றின் வளர்சிதை மாற்ற மையப் பாதைகளில் அவற்றை அறிமுகப்படுத்தலாம். அந்த ஆக்சிஜனேற்றப்பட்ட மூலக்கூறுகள் கார்பன் சுழற்சியின் உயிரியல் கட்டத்தில் நுழைகின்றன, மேலும் முதன்மை மற்றும் இரண்டாம் நிலை நுகர்வோரால் வேட்டையாடுவதன் மூலம் ஒருங்கிணைக்கப்படலாம் அல்லது உயிரணுக்களின் மரணத்திற்குப் பிறகு அவற்றைக் கருதலாம். உயிரி தொழில்நுட்ப பயன்பாடுகள் ஹைட்ரோகார்பன்-சிதைக்கும் பாக்டீரியாக்கள் பல்வேறு பயன்பாடுகளைக் கொண்டுள்ளன, ஆனால் சுற்றுச்சூழல் நுண்ணுயிரியல் துறையில் அவற்றின் பங்கு குறிப்பாக முக்கியத்துவம் வாய்ந்தது. கடல் ஹைட்ரோகார்பனோக்ளாஸ்டிக் பாக்டீரியாக்கள் உயிரியல் சிகிச்சைக்கு சக்திவாய்ந்த கருவிகளாகும், ஏனெனில் அவை அவற்றின் கேடபாலிக் பன்முகத்தன்மை காரணமாக அசுத்தமான எண்ணெய்களை சிதைத்து மாற்றும். அந்த வகையில், உயிரி தொழில்நுட்பத்தைப் பயன்படுத்துவதன் மூலம் எண்ணெய் கசிவுகள் அல்லது மனித நடவடிக்கைகளின் மாசுபாட்டிற்குப் பிறகு கடலோரப் பகுதிகள் மற்றும் கடலோரப் பகுதிகள் போன்ற அசுத்தமான தளங்களை சுத்தம் செய்வதை துரிதப்படுத்த முடியும், ஆனால் அவற்றின் சேதத்தைக் கட்டுப்படுத்தவும் குறைக்கவும் முடியும். அவை பொதுவாக எண்ணெய் கசிவு அல்லது பிற மாசுபாட்டிற்குப் பிறகு பூக்கின்றன, மேலும் அவை வளர்சிதை மாற்றத்தில் மிகவும் பல்துறை என்பதால், அவை குறைந்தபட்ச ஊடகங்களில் வளர முடியும். இதற்கு ஒரு எடுத்துக்காட்டு நைட்ரஜன்-சரிசெய்தல் மற்றும் கனமான எண்ணெய்-சிதைக்கும் பாக்டீரியம் அசோஸ்பிரில்லம் ஒலிக்ளாஸ்டிக்கம் ஆகும், இது எண்ணெய் உற்பத்தி கலவையிலிருந்து தனிமைப்படுத்தப்பட்டது. ஆனால் ஏ. ஒலிக்ளாஸ்டிக்கம் மட்டுமே எண்ணெயில் வளரக்கூடிய ஒரே திரிபு அல்ல, 2013 ஆம் ஆண்டு ஆய்வில் குறைந்தது 125 திரிபுகள் உள்ளன, அவை கச்சா எண்ணெயுடன் குறைந்தபட்ச நடுத்தரத்தில் வளரத் தழுவியுள்ளன. அணுகுமுறைகளால் கண்டறியப்பட்ட முக்கிய பாக்டீரியாக்கள் புரோட்டியோபாக்டீரியாக்கள் மற்றும் மிகவும் ஏராளமான இனங்கள் அசினடோபாக்டர் மற்றும் ஸ்டெனோட்ரோபோமன்ஸ் இனங்களில் இருந்தன. மோனோ மற்றும் டையாக்சிஜனேஸ்கள், ஆக்சிஜனேஸ்கள், டீஹைட்ரஜனேஸ்கள் மற்றும் பிற என்சைம்களின் அசாதாரண காப்பகமாக இருப்பதால் அவை உயிர்ச்சேர்க்கையிலும் பயன்படுத்தப்படுகின்றன. மேலும், அவை ஹைட்ரோகார்பன் நிறைந்த சூழல்களில் வளரத் தழுவியிருப்பதால், அவை பெரும்பாலும் தொழில்துறை ஆர்வமுள்ள பாலிமெரிக் சேமிப்பு பொருட்கள் மற்றும் அதிக குழம்பு செயல்பாட்டைக் கொண்ட பயோ-டிடர்ஜென்ட்கள் போன்ற சிறப்பியல்பு சேர்மங்களை ஒருங்கிணைக்கிறது. இதற்கு ஒரு எடுத்துக்காட்டு ஒலீஜினஸ் ஈஸ்ட் யாரோவியா லிபோலிடிகாவின் பயன்பாடு ஆகும். இந்த ஈஸ்ட் ஒரு பல்துறை கொழுப்பு வளர்சிதை மாற்றத்தைக் கொண்டிருப்பதால், குறிப்பிட்ட பாக்டீரியா மரபணுக்களுடன் இணைந்து, வெவ்வேறு கொழுப்புகள் (பெட்ரோலியம், ஆல்கேன், தாவர எண்ணெய், கொழுப்பு அமிலம்), கொழுப்புகள் மற்றும் எண்ணெய்களை ஐசோப்ரெனாய்டு-பெறப்பட்ட சேர்மங்கள் (கரோட்டினாய்டுகள், பாலினிக் கரோட்டினாய்டு எஸ்டர்), மெழுகு எஸ்டர்கள் (WE), பாலிஹைட்ராக்ஸிஅல்கனோயேட்டுகள் (PHA கள்) மற்றும் இலவச ஹைட்ராக்சிலேட்டட் கொழுப்பு அமிலங்கள் (HFA கள்) போன்ற தொழில்துறை மதிப்புமிக்க கொழுப்பு-பெறப்பட்ட சேர்மங்களாக மாற்றுவதற்கு குறிப்பிட்ட நொதி பாதைகளைப் பயன்படுத்தலாம். குறிப்புகள் வெளிப்புற இணைப்புகள் நுண்ணுயிரியல் உயிரியல் சிகிச்சை நுண்ணுயிர் மக்கள் தொகை உயிரியல் நுண்ணுயிர் வளர்ச்சி மற்றும் ஊட்டச்சத்து உயிரியல் சிதைவு ஹைட்ரோகார்பன்-சிதைவு பாக்டீரியா எண்ணெய் கசிவு நிவாரண தொழில்நுட்பங்கள்