PAUP*
பப் * (பார்ஸிமோனி மற்றும் பிற முறைகளைப் பயன்படுத்தி பைலோஜெனெடிக் பகுப்பாய்வு) என்பது டேவிட் எல். ஸ்வோஃபோர்ட் எழுதிய பரிணாம மரங்களை (பைலோஜெனிகள்) ஊகிப்பதற்கான ஒரு கணக்கீட்டு பைலோஜெனெடிக்ஸ் திட்டமாகும். முதலில், பெயர் குறிப்பிடுவது போல, பிஏயுபி பார்ஸிமோனியை மட்டுமே செயல்படுத்தியது, ஆனால் பதிப்பு 4 முதல் (நிரல் பிஏயுபி * என்று அறியப்பட்டபோது) இது தொலைதூர அணி மற்றும் சாத்தியக்கூறு முறைகளையும் ஆதரிக்கிறது. பதிப்பு 3 மெக்கின்டோஷ் கணினிகளில் இயங்கியது மற்றும் ஒரு பணக்கார, பயனர் நட்பு வரைகலை இடைமுகத்தை ஆதரித்தது. நெக்ஸஸ் தரவு வடிவமைப்பைப் பகிர்ந்து கொள்ளும் மேக்க்ளேட் திட்டத்துடன் சேர்ந்து, பல பைலோஜெனெட்டிஸ்டுகளுக்கு விருப்பமான பைலோஜெனெடிக் மென்பொருளாக PAUP * இருந்தது. பதிப்பு 4 விண்டோஸ் (வரைகலை ஷெல் மற்றும் கட்டளை வரி) மற்றும் யுனிக்ஸ் (கட்டளை வரி மட்டும்) தளங்களுக்கான ஆதரவைச் சேர்த்தது. இருப்பினும், மேகிண்டோஷுக்கான வரைகலை பயனர் இடைமுகம் 10.14 ஐ விட உயர்ந்த மேக் ஓஎஸ் எக்ஸ் பதிப்புகளை ஆதரிக்கவில்லை (இருப்பினும் மேக் ஓஎஸ் இன் பிற்கால பதிப்புகளுக்கான ஜியுஐ திட்டமிடப்பட்டுள்ளது). ஜீனியஸிற்கான சொருகி வடிவமாகவும் PAUP * கிடைக்கிறது. பிஏயுபி *, இப்போது பிஏயுபி * (* பிஏயுபியைப் பயன்படுத்தி பைலோஜெனெடிக் பகுப்பாய்வு) என்ற சுய-குறிப்பு தலைப்பைக் கொண்டுள்ளது, இது விரைவான புதுப்பிப்புகளுக்கு உட்பட்டுள்ளது, மேலும் இது இப்போது "இனங்கள் மரம்" முறை எஸ். வி. டி. குவார்டெட்டுகளை உள்ளடக்கியது, இது பைலோஜெனெடிக்ஸுக்கான பார்சிமோனி, சாத்தியக்கூறு மற்றும் தூர முறைகளுக்கு கூடுதலாக உள்ளது. குறிப்புகள் வெளிப்புற இணைப்புகள் அதிகாரப்பூர்வ சோதனை பதிப்பு வலைத்தளம் பைலோஜெனெடிக்ஸ் மென்பொருள்