AutoDock
ஆட்டோடாக் என்பது ஒரு மூலக்கூறு மாடலிங் உருவகப்படுத்துதல் மென்பொருளாகும். இது புரத-லிகாண்ட் டாக்கிங்கிற்கு குறிப்பாக பயனுள்ளதாக இருக்கும். ஆட்டோடாக் 4 குனு பொது பொது உரிமத்தின் கீழ் கிடைக்கிறது. ஆராய்ச்சி சமூகத்தில் மிகவும் மேற்கோள் காட்டப்பட்ட டாக்கிங் மென்பொருள் பயன்பாடுகளில் ஆட்டோடாக் ஒன்றாகும். எச். ஐ. வி/எய்ட்ஸ் மற்றும் கோவிட்-19 க்கு எதிரான வைரஸ் தடுப்பு மருந்துகளைத் தேடுவதற்காக, உலக சமூகக் கட்டமைப்பில் இயங்கும் FightAIDS@Home மற்றும் ஓபன்பாண்டமிக்ஸ்-கோவிட்-19 திட்டங்களால் இது பயன்படுத்தப்படுகிறது. பிப்ரவரி 2007 இல், ஐஎஸ்ஐ மேற்கோள் குறியீட்டின் தேடல் 1,100 க்கும் மேற்பட்ட வெளியீடுகள் முதன்மை ஆட்டோடாக் முறை ஆவணங்களைப் பயன்படுத்தி மேற்கோள் காட்டப்பட்டதைக் காட்டியது. 2009ஆம் ஆண்டு நிலவரப்படி, இந்த எண்ணிக்கை 1,200ஐத் தாண்டியது. ஆட்டோடாக் வினா என்பது ஆட்டோடாக்கின் வாரிசு ஆகும், இது துல்லியம் மற்றும் செயல்திறன் அடிப்படையில் கணிசமாக மேம்படுத்தப்பட்டுள்ளது. இது அப்பாச்சி உரிமத்தின் கீழ் கிடைக்கிறது. ஆட்டோடாக் மற்றும் வினா இரண்டும் தற்போது ஸ்க்ரிப்ஸ் ஆராய்ச்சியால் பராமரிக்கப்படுகின்றன, குறிப்பாக டாக்டர் ஆர்தர் ஜே. ஓல்சன் ஆட்டோடாக் தலைமையிலான கம்ப்யூடேஷனல் ஸ்ட்ரக்சரல் பயாலஜி (சி. சி. எஸ். பி) மையம் பரவலாகப் பயன்படுத்தப்படுகிறது மற்றும் மெர்க் & கோ நிறுவனத்தால் மருத்துவ ரீதியாக அங்கீகரிக்கப்பட்ட முதல் எச். ஐ. வி-1 ஒருங்கிணைப்பு தடுப்பானின் வளர்ச்சியில் பங்கு வகிக்கிறது. ஆட்டோடாக்கின் பயன்பாடு எச். ஐ. வி 1 ஒருங்கிணைந்த தடுப்பான்கள் உட்பட பல மருந்துகளின் கண்டுபிடிப்புக்கு பங்களித்துள்ளது. இயங்குதள ஆதரவு ஆட்டோடாக் லினக்ஸ், மேக் ஓஎஸ் எக்ஸ், எஸ்ஜிஐ ஐரிக்ஸ் மற்றும் மைக்ரோசாப்ட் விண்டோஸ் ஆகியவற்றில் இயங்குகிறது. இது டெபியன், ஃபெடோரா மற்றும் ஆர்ச் லினக்ஸ் உள்ளிட்ட பல லினக்ஸ் விநியோகங்களில் ஒரு தொகுப்பாக கிடைக்கிறது. மைக்ரோசாப்ட் விண்டோஸில் சொந்த 64-பிட் பயன்முறையில் பயன்பாட்டைத் தொகுப்பது மென்பொருளின் வேகமான மிதக்கும்-புள்ளி செயல்பாட்டை செயல்படுத்துகிறது. ஓபன் சிஎல் மற்றும் சியுடிஏ ஆகியவற்றைப் பயன்படுத்தி ஜிபியுக்களுக்கான மேம்பட்ட பதிப்புகள் ஆட்டோடாக் மேம்பட்ட கணக்கீட்டு நடைமுறைகள் ஆட்டோடாக் ஸ்க்ரிப்ஸ் ஆராய்ச்சிக் குழுவால் உருவாக்கப்பட்டுள்ளன. இது CPU இல் உள்ள அசல் தொடர் ஆட்டோடாக் 4.2 (சோலிஸ்-வெட்ஸ்) ஐ விட 4x (குவாட்-கோர் CPU) மற்றும் 56x (ஜிபியு) வரை கவனிக்கப்பட்ட வேகங்களை விளைவிக்கிறது. CUDA பதிப்பு ஸ்க்ரிப்ஸ் ஆராய்ச்சிக் குழுவிற்கும் என்விடியாவிற்கும் இடையிலான ஒத்துழைப்புடன் உருவாக்கப்பட்டது, அதே நேரத்தில் ஓபன்சிஎல் பதிப்பு ஐபிஎம் வேர்ல்ட் கம்யூனிட்டி கிரிட் குழுவின் ஆதரவுடன் மேலும் உகந்ததாக மாற்றப்பட்டது. ஆட்டோடாக் வினா ஆட்டோடாக்கின் வாரிசான ஆட்டோடாக் வினா உள்ளது, இது ஒரு மேம்பட்ட உள்ளூர் தேடல் வழக்கத்தைக் கொண்டுள்ளது மற்றும் மல்டிகோர்/மல்டி-சிபியு கணினி அமைப்புகளைப் பயன்படுத்துகிறது. மென்பொருளைப் பயன்படுத்திய பல உலக சமூக கட்டத் திட்டங்களில் 64-பிட் லினக்ஸ் இயக்க முறைமைகளின் கீழ் கணிசமாக வேகமாக இயங்குவதற்காக ஆட்டோடாக் வினா குறிப்பிடப்பட்டுள்ளது. ஆட்டோடாக் வினா தற்போது பதிப்பு 1.2 இல் உள்ளது, இது ஜூலை 2021 இல் வெளியிடப்பட்டது. மூன்றாம் தரப்பு மேம்பாடுகள் மற்றும் கருவிகள் ஒரு திறந்த மூல திட்டமாக, ஆட்டோடாக் பல மூன்றாம் தரப்பு மேம்பட்ட பதிப்புகளைப் பெற்றுள்ளதுஃ ஆட்டோடாக் வினா (ஸ்மினா) உடன் ஸ்கோரிங் மற்றும் மினிமைசேஷன் என்பது ஆட்டோடாக் வினா இன் ஒரு முட்கரண்டி ஆகும், இது ஸ்கோரிங் செயல்பாட்டு மேம்பாடு மற்றும் ஆற்றல் குறைப்புக்கான மேம்பட்ட ஆதரவுடன் உள்ளது. ஆஃப்-டார்கெட் பைப்லைன் பெரிய திட்டங்களுக்குள் ஆட்டோடாக்கை ஒருங்கிணைக்க அனுமதிக்கிறது. ஒருமித்த மதிப்பெண் கருவித்தொகுப்பு பல மதிப்பெண் செயல்பாடுகள் மற்றும் ஒருமித்த மதிப்பெண் சமன்பாடுகளின் அளவுத்திருத்தத்துடன் ஆட்டோடாக் வினா போஸ்களை மீட்பதை வழங்குகிறது. விஎஸ்எல்ஏபி என்பது ஒரு விஎம்டி செருகுநிரல் ஆகும், இது விஎம்டியிலிருந்து நேரடியாக ஆட்டோடாக்கைப் பயன்படுத்த அனுமதிக்கிறது. ஆட்டோடாக் மூலம் மெய்நிகர் திரையிடலை இயக்குவதற்கு பைஆர்எக்ஸ் ஒரு நல்ல ஜியுஐ வழங்குகிறது. பைஆர்எக்ஸ் ஒரு டாக்கிங் வழிகாட்டியை உள்ளடக்கியது மற்றும் கிளவுட் அல்லது எச். பி. சி கிளஸ்டரில் ஆட்டோடாக் வீனாவை இயக்க இதைப் பயன்படுத்தலாம். பிஓஏபி என்பது ஷெல்-ஸ்கிரிப்ட் அடிப்படையிலான கருவியாகும், இது லிகாண்ட் தயாரிப்பு முதல் போஸ்ட் டாக்கிங் பகுப்பாய்வு வரை மெய்நிகர் திரையிடலுக்காக ஆட்டோடாக்கை தானியக்கமாக்குகிறது. விர்ச்சுவல்ஃப்ளோ கணினி கிளஸ்டர்கள் மற்றும் கிளவுட் ஆகியவற்றில் ஆட்டோடாக் வினா அடிப்படையிலான டாக்கிங் நிரல்களைப் பயன்படுத்தி அல்ட்ரா-பெரிய மெய்நிகர் திரையிடல்களை மேற்கொள்ள அனுமதிக்கிறது, இது பில்லியன் கணக்கான சேர்மங்களை வழக்கமாக திரையிட அனுமதிக்கிறது. எஃப். பி. ஜி. ஏ முடுக்கம் பொது நிரல்படுத்தக்கூடிய சில்லுகளை இணை-செயலிகளாகப் பயன்படுத்தி, குறிப்பாக ஒமிக்ஸான் சோதனை தயாரிப்பு, வேகப்படுத்தல் நிலையான இன்டெல் டூயல் கோர் 2 ஜிகாஹெர்ட்ஸ் CPU இன் வேகத்தை விட 10x-100x வரம்பிற்குள் இருந்தது. புரத-லிகாண்ட் டாக்கிங் மென்பொருளின் டாக்கிங் (மூலக்கூறு) மெய்நிகர் திரையிடல் பட்டியலையும் பார்க்கவும் குறிப்புகள் வெளிப்புற இணைப்புகள் ஆட்டோடாக் முகப்புப்பக்கம் ஆட்டோடாக் வினா முகப்புப்பக்கம் மூலக்கூறு மாடலிங் மென்பொருள் மூலக்கூறு மாடலிங் இலவச மற்றும் திறந்த மூல மென்பொருள்