Scientific workflow system
ஒரு விஞ்ஞான பணிப்பாய்வு அமைப்பு என்பது ஒரு பணிப்பாய்வு மேலாண்மை அமைப்பின் ஒரு சிறப்பு வடிவமாகும், இது ஒரு அறிவியல் பயன்பாட்டில் தொடர்ச்சியான கணக்கீட்டு அல்லது தரவு கையாளுதல் படிகள் அல்லது பணிப்பாய்வை உருவாக்கவும் செயல்படுத்தவும் குறிப்பாக வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளது. பயன்பாடுகள் விநியோகிக்கப்பட்ட விஞ்ஞானிகள் கணினி வளங்கள், தரவுத் தொகுப்புகள் மற்றும் சாதனங்களின் விநியோகிக்கப்பட்ட அமைப்புகளைப் பயன்படுத்தி பெரிய அளவிலான அறிவியல் சோதனைகள் மற்றும் அறிவு கண்டுபிடிப்பு பயன்பாடுகளை நடத்துவதில் ஒத்துழைக்க முடியும். இந்த பார்வையை செயல்படுத்துவதில் அறிவியல் பணிப்பாய்வு அமைப்புகள் முக்கிய பங்கு வகிக்கின்றன. மேலும் சிறப்பு வாய்ந்த அறிவியல் பணிப்பாய்வு அமைப்புகள் ஒரு காட்சி நிரலாக்க முன் முனையை வழங்குகின்றன, பயனர்கள் முனைகளை ஒன்றாக இணைப்பதன் மூலம் தங்கள் பயன்பாடுகளை ஒரு காட்சி வரைபடமாக எளிதில் உருவாக்க உதவுகிறது, மேலும் அத்தகைய பயன்பாடுகளை தள-சுயாதீனமான முறையில் உருவாக்க கருவிகளும் உருவாக்கப்பட்டுள்ளன. பணிப்பாய்வின் வரைபடத்தில் உள்ள ஒவ்வொரு திசையும் பொதுவாக ஒரு பயன்பாட்டின் வெளியீட்டிலிருந்து அடுத்த பயன்பாட்டின் உள்ளீட்டிற்கு ஒரு இணைப்பைக் குறிக்கிறது. அத்தகைய விளிம்புகளின் வரிசையை குழாய் என்று அழைக்கலாம். உயிர் தகவலியல் பணிப்பாய்வு மேலாண்மை அமைப்பு என்பது உயிர் தகவலியலில் கவனம் செலுத்தும் ஒரு சிறப்பு அறிவியல் பணிப்பாய்வு அமைப்பாகும். எளிய கணினிமயமாக்கப்பட்ட அறிவியல் பணிப்பாய்வுகள் என்பது தரவு, நிரல்கள் மற்றும் பிற உள்ளீடுகளை அழைக்கும் ஸ்கிரிப்ட்கள் மற்றும் காட்சிப்படுத்தல்கள் மற்றும் பகுப்பாய்வு முடிவுகளை உள்ளடக்கிய வெளியீடுகளை உருவாக்குகின்றன. கட்டளை-வரி இடைமுகத்துடன் பைதான் போன்ற ஸ்கிரிப்டிங் மொழியைப் பயன்படுத்தி ஆர் அல்லது மேட் லேப் போன்ற நிரல்களில் இவை செயல்படுத்தப்படலாம் அல்லது மிக சமீபத்தில் ஜுபிடர் நோட்புக் போன்ற திறந்த மூல வலை பயன்பாடுகளைப் பயன்படுத்தலாம். பாரம்பரிய வணிக செயல்முறை பணிப்பாய்வுகளிலிருந்து அறிவியல் பணிப்பாய்வுகளை வேறுபடுத்துவதற்கு பல நோக்கங்கள் உள்ளன. இவற்றில் பின்வருவன அடங்கும்ஃ தனிப்பட்ட பயன்பாட்டு விஞ்ஞானிகள் தங்கள் சொந்த பணிப்பாய்வுகளை உருவாக்குவதற்கு பயன்படுத்த எளிதான சூழலை வழங்குதல். விஞ்ஞானிகளுக்கு அவர்களின் பணிப்பாய்வுகளை செயல்படுத்தவும், அவர்களின் முடிவுகளை நிகழ்நேரத்தில் பார்க்கவும் உதவும் ஊடாடும் கருவிகளை வழங்குதல். விஞ்ஞானிகளிடையே பணிப்பாய்வுகளைப் பகிர்ந்து கொள்வதற்கும் மீண்டும் பயன்படுத்துவதற்கும் செயல்முறையை எளிதாக்குதல். பணிப்பாய்வு செயல்படுத்தல் முடிவுகள் மற்றும் பணிப்பாய்வு உருவாக்கும் படிகளின் ஆதாரத்தைக் கண்காணிக்க விஞ்ஞானிகளுக்கு உதவுகிறது. விஞ்ஞானிகள் மீது கவனம் செலுத்துவதன் மூலம், விஞ்ஞான பணிப்பாய்வு அமைப்பை வடிவமைப்பதில் கவனம் செலுத்துவது, முன் வரையறுக்கப்பட்ட வளங்களில் சிக்கலான கணக்கீடுகளைச் செயல்படுத்துவதை உகந்ததாக்குவதற்கான கிரிட் கம்ப்யூட்டிங் சூழல்களால் பொதுவாகக் கருதப்படும் பணிப்பாய்வு திட்டமிடல் நடவடிக்கைகளிலிருந்து விலகி, என்ன தரவு வகைகள், கருவிகள் மற்றும் விநியோகிக்கப்பட்ட வளங்களை விஞ்ஞானிகளுக்கு கிடைக்கச் செய்ய வேண்டும், அவற்றை எவ்வாறு எளிதில் அணுக முடியும் மற்றும் குறிப்பிட்ட சேவைத் தேவைகளுடன் அறிவியல் பணிப்பாய்வுகள் இப்போது இணைய உள்கட்டமைப்பின் ஒரு முக்கியமான அங்கமாக அங்கீகரிக்கப்பட்டுள்ளன, இது மின்-அறிவியலை எளிதாக்குகிறது. பொதுவாக ஒரு மிடில்வேர் அடுக்கின் மேல் உட்கார்ந்து, விஞ்ஞான பணிப்பாய்வுகள் என்பது விஞ்ஞானிகள் தங்கள் பகுப்பாய்வு மற்றும் காட்சிப்படுத்தல் குழாய்களை மாதிரியாக்கலாம், வடிவமைக்கலாம், செயல்படுத்தலாம், பிழைத்திருத்தம் செய்யலாம், மீண்டும் கட்டமைக்கலாம் மற்றும் மீண்டும் இயக்கலாம். நிறுவப்பட்ட அறிவியல் முறையின் ஒரு பகுதி, ஒரு முடிவின் தோற்றம், அது எவ்வாறு பெறப்பட்டது, பயன்படுத்தப்பட்ட சோதனை முறைகள், இயந்திர அளவுத்திருத்தங்கள் மற்றும் அளவுருக்கள் போன்றவை பற்றிய பதிவை உருவாக்குவதாகும். மின்னணு அறிவியலில் இது ஒன்றே, ஆதாரத் தரவு என்பது பணிப்பாய்வு நடவடிக்கைகள், அணுகப்பட்ட சேவைகள் மற்றும் தரவுத்தளங்கள், பயன்படுத்தப்பட்ட தரவுத் தொகுப்புகள் மற்றும் பலவற்றின் பதிவு தவிர. இத்தகைய தகவல்கள் ஒரு விஞ்ஞானிக்கு அவர்களின் பணிப்பாய்வு முடிவுகளை விளக்குவதற்கும், பிற விஞ்ஞானிகளுக்கு சோதனை முடிவில் நம்பிக்கையை ஏற்படுத்துவதற்கும் பயனுள்ளதாக இருக்கும். பணிப்பாய்வுகளைப் பகிர்வது மைஎக்ஸ்பெரிமென்ட் போன்ற சமூக வலைப்பின்னல் சமூகங்கள் அறிவியல் பணிப்பாய்வுகளைப் பகிர்வதற்கும் கூட்டு வளர்ச்சிக்கும் வசதியாக உருவாக்கப்பட்டுள்ளன. கேலக்ஸி நிறுவலில் நேரடியாக பணிப்பாய்வு வரையறைகள் மற்றும் பணிப்பாய்வு முடிவுகளைத் திருத்துவதற்கும் வெளியிடுவதற்கும் கூட்டு வழிமுறைகளை கேலக்ஸி வழங்குகிறது. பகுப்பாய்வு அனைத்து அறிவியல் பணிப்பாய்வு அமைப்புகளுக்கும் அடிப்படையான ஒரு முக்கிய அனுமானம் என்னவென்றால், விஞ்ஞானிகள் தாங்களாகவே ஒரு பணிப்பாய்வு அமைப்பைப் பயன்படுத்தி காட்சி ஓட்ட விளக்கப்படம், தர்க்க வரைபடம் அல்லது பணிப்பாய்வு தர்க்கத்தை விவரிக்க குறியீட்டை எழுதும் கடைசி முயற்சியின் அடிப்படையில் தங்கள் பயன்பாடுகளை உருவாக்க முடியும். சக்திவாய்ந்த பணிப்பாய்வு அமைப்புகள் புரோகிராமர்கள் அல்லாதவர்களுக்கு எளிய ஃப்ளோசார்டிங் கருவிகளைப் பயன்படுத்தி பணிப்பாய்வு படிகளை முதலில் வரைவதை எளிதாக்குகின்றன, பின்னர் பல்வேறு தரவு கையகப்படுத்தல், பகுப்பாய்வு மற்றும் அறிக்கையிடல் கருவிகளில் இணைக்கின்றன. அதிகபட்ச உற்பத்தித்திறனுக்காக, அடிப்படை நிரலாக்கக் குறியீட்டின் விவரங்கள் பொதுவாக மறைக்கப்பட வேண்டும். அத்தகைய பணிப்பாய்வுகளின் பண்புகளை பகுப்பாய்வு செய்ய பணிப்பாய்வு பகுப்பாய்வு நுட்பங்களைப் பயன்படுத்தலாம், அவற்றைச் செயல்படுத்துவதற்கு முன்பு சில பண்புகளை சரிபார்க்கலாம். அறிவியல் பணிப்பாய்வுகளின் கட்டுப்பாட்டு-ஓட்ட அம்சங்களின் சரிபார்ப்பு மற்றும் விவரக்குறிப்புக்கான ஒரு கோட்பாட்டு முறையான பகுப்பாய்வு கட்டமைப்பின் எடுத்துக்காட்டு மற்றும் டிஸ்கவரி நெட் அமைப்பிற்கான அவற்றின் தரவு ஓட்ட அம்சங்கள் கர்சின் மற்றும் பலர் எழுதிய "ஒரு பணிப்பாய்வு பகுப்பாய்வு கருவியின் வடிவமைப்பு மற்றும் செயல்படுத்தல்" என்ற கட்டுரையில் விவரிக்கப்பட்டுள்ளது. பணிப்பாய்வு உலகில் நிரல் பகுப்பாய்வு மற்றும் சரிபார்ப்பை அறிமுகப்படுத்துவதற்கு பணிப்பாய்வு மொழியின் செயல்பாட்டு சொற்பொருள் பற்றிய விரிவான புரிதல் தேவைப்படுகிறது, இதில் பணிப்பாய்வு வரைபடத்தில் உள்ள முனைகள் மற்றும் வளைவுகளின் செயல்பாட்டு பண்புகள், பணிப்பாய்வு வடிவங்களுக்கு இடையிலான செயல்பாட்டு சமநிலைகளைப் புரிந்துகொள்வது மற்றும் பல சிக்கல்கள் அடங்கும். அத்தகைய பகுப்பாய்வு செய்வது கடினம், மேலும் இந்த சிக்கல்களைத் தீர்ப்பதற்கு கணினி அறிவியல் ஆராய்ச்சியில் பயன்படுத்தப்படும் முறையான முறைகளை உருவாக்க வேண்டும் (எ. கா. பெட்ரி வலைகள்) மற்றும் பணிப்பாய்வுகள் மற்றும் பணிப்பாய்வு அமைப்புகள் ஆகிய இரண்டின் பண்புகளைப் பற்றி நியாயப்படுத்த பயனர் நிலை கருவிகளை உருவாக்க இந்த முறையான முறைகளை உருவாக்குதல். கடந்த காலத்தில் இத்தகைய கருவிகளின் பற்றாக்குறை தானியங்கி பணிப்பாய்வு மேலாண்மை தீர்வுகளை ஆரம்பகால தத்தெடுப்பாளர்கள் மற்றும் பணிப்பாய்வு ஆர்வலர்களின் குறுகிய வட்டத்திற்கு வெளியே பயன்படுத்தப்படும் உற்பத்தி நிலை கருவிகள் வரை முதிர்ச்சியடைவதைத் தடுத்தது. குறிப்பிடத்தக்க அறிவியல் பணிப்பாய்வு அமைப்புகள் பின்வருமாறுஃ அண்டுரில், உயிர் தகவலியல் மற்றும் பட பகுப்பாய்வு அப்பாச்சி ஐராவட்டா, ஒரு பொது நோக்க பணிப்பாய்வு மேலாண்மை அமைப்பு அப்பாச்சி ஏர்ஃப்ளோ, ஒரு பொது நோக்க பணிப்பாய்வு மேலாண்மை அமைப்பு அப்பாச்சி டாவெர்னா, உயிர் தகவலியல், வானியல், பல்லுயிர் உயிரியல், மேகக்கணி அடிப்படையிலான உயிர் தகவலியல் தளமான பயோக்ளிப்ஸ், ஒரு வரைகலை பணிமனை, ஒரு ஸ்கிரிப்டிங் சூழலுடன் ஒரு வகையான பணிப்பாய்வாக சிக்கலான செயல்களைச் செய்ய உங்களை அனுமதிக்கும். கூட்டு அறிவு, ஒரு பைதான் அடிப்படையிலான பொது பணிப்பாய்வு மற்றும் ஜேஎஸ்ஓஎன் ஏபிஐ மற்றும் குறுக்கு-தள தொகுப்பு மேலாளர் பொதுவான பணிப்பாய்வு மொழியுடன் கூடிய சோதனை க்ரவுட்ஸோர்சிங் கட்டமைப்பாகும், இது சமூகத்தால் உருவாக்கப்பட்ட ஒய்ஏஎம்எல் அடிப்படையிலான பணிப்பாய்வு மொழியாகும், இது பல இயந்திர செயல்பாடுகளால் ஆதரிக்கப்படுகிறது. க்யூனிஃபார்ம், ஒரு செயல்பாட்டு பணிப்பாய்வு மொழி. நூற்றுக்கணக்கான மரபணு பகுப்பாய்வு கருவிகளுக்கான அணுகலை வழங்கும் ஒரு சக்திவாய்ந்த அறிவியல் பணிப்பாய்வு அமைப்பான மரபியல் ஜீன்பாடர்னை ஆரம்பத்தில் இலக்காகக் கொண்ட கேலக்ஸி என்ற அறிவியல் பணிப்பாய்வு அமைப்பின் ஆரம்பகால எடுத்துக்காட்டுகளில் ஒன்றான டிஸ்கவரி நெட். கெப்ளர், ஒரு அறிவியல் பணிப்பாய்வு மேலாண்மை அமைப்பு கே. என். ஐ. எம். இ, ஒரு திறந்த மூல தரவு பகுப்பாய்வு தளமான பெகாசஸ், ஒரு திறந்த மூல அறிவியல் பணிப்பாய்வு மேலாண்மை அமைப்பு ஆன்லைன் எச். பி. சி, ஆன்லைன் அறிவியல் பணிப்பாய்வு வடிவமைப்பாளர் மற்றும் உயர் செயல்திறன் கணினி கருவித்தொகுப்பு ஆரஞ்சு, திறந்த மூல தரவு காட்சிப்படுத்தல் மற்றும் பகுப்பாய்வு குழாய் சோதனை, கெமின்ஃபார்மேட்டிக்ஸ் பணிப்பாய்வுகளை நிவர்த்தி செய்வதற்கான பல கருவிகளைக் கொண்ட வரைகலை நிரலாக்கம் ஸ்விஃப்ட் இணையான ஸ்கிரிப்டிங் மொழி, உள்ளமைக்கப்பட்ட அறிவியல் பணிப்பாய்வு அமைப்புகளின் பல திறன்களைக் கொண்ட ஸ்கிரிப்டிங் மொழி. விச்ட்ரெயில்ஸ், பைத்தானில் உருவாக்கப்பட்ட ஒரு அறிவியல் பணிப்பாய்வு அமைப்பு 280 க்கும் மேற்பட்ட கணக்கீட்டு தரவு பகுப்பாய்வு பணிப்பாய்வு அமைப்புகள் அடையாளம் காணப்பட்டுள்ளன, இருப்பினும் தரவு பகுப்பாய்வு பணிப்பாய்வுகளுக்கும் அறிவியல் பணிப்பாய்வுகளுக்கும் இடையிலான வேறுபாடு திரவமானது, ஏனெனில் அனைத்து பகுப்பாய்வு பணிப்பாய்வு அமைப்புகளும் அறிவியல் நோக்கங்களுக்காக பயன்படுத்தப்படுவதில்லை. உயிர் தகவலியல் பணிப்பாய்வு மேலாண்மை அமைப்புகள் இ-அறிவியல் கட்டம் கணக்கீட்டு பணிப்பாய்வு இயந்திரம் குறிப்புகள் வெளிப்புற இணைப்புகள் அறிவியல் பணிப்பாய்வு அமைப்புகள்-ஒரு அளவு அனைத்திற்கும் பொருந்த முடியுமா? சிஐபிஇசி '08 இல் உள்ள கட்டுரை பல அறிவியல் பணிப்பாய்வு அமைப்புகளின் அம்சங்களை ஒப்பிடுகிறது. டேட்டாவோன் வலைத்தளத்தின் பணிப்பாய்வு பயன்பாடுகள் பணிப்பாய்வு அமைப்பில் அறிவியல் பணிப்பாய்வுகள் தொடர்பான மென்பொருள் கருவிகளின் பட்டியல்