Downstream-peptide motif
டவுன்ஸ்ட்ரீம்-பெப்டைட் மையக்கருத்து என்பது சயனோபாக்டீரியல் இனமான சினெகோகாக்கஸ் மற்றும் புரோக்ளோரோகாக்கஸில் உள்ள உயிர் தகவலியல் மூலம் அடையாளம் காணப்பட்ட ஒரு பாதுகாக்கப்பட்ட ஆர்என்ஏ கட்டமைப்பைக் குறிக்கிறது மற்றும் அத்தகைய பாக்டீரியாவை பாதிக்கும் ஒரு பேஜ் ஆகும். சாகுபடி செய்யப்படாத பாக்டீரியாவிலிருந்து டிஎன்ஏவின் கடல் மாதிரிகளிலும் இது கண்டறியப்பட்டது, அவை சயனோபாக்டீரியாவின் பிற இனங்கள். டவுன்ஸ்ட்ரீம்-பெப்டைட் ஆர்என்ஏக்கள் குறுகிய திறந்த வாசிப்பு பிரேம்களின் (ஓஆர்எஃப்) மேல்நோக்கி காணப்படுகின்றன, அவை குறுகிய பெப்டைடுகளை (பொதுவாக 17 முதல் 100 அமினோ அமிலங்களுக்கு இடையில்) குறியாக்கம் செய்யும் என்று கணிக்கப்பட்டுள்ளது. நைட்ரஜன் ஆதாரங்களின் போதிய விநியோகத்துடன் செல்கள் வளர்க்கப்படும்போது ORF களில் ஒன்று வெளிப்படையாக கட்டுப்படுத்தப்படுகிறது. டவுன்ஸ்ட்ரீம்-பெப்டைட் மையக்கருத்து ஜிஎல்என்ஏ ஆர்என்ஏ மையக்கருத்து எனப்படும் வேறுபட்ட கேண்டிடேட் ஆர்என்ஏ கட்டமைப்புடன் ஒரு கட்டமைப்பு ஒற்றுமையைக் கொண்டுள்ளது, இது சயனோபாக்டீரியாவில் ஒரு செயல்பாட்டு குளுட்டமைன் பிணைப்பு ரைபோஸ்விட்ச் என்று காட்டப்பட்டது. மிகவும் குறிப்பிடத்தக்க ஒற்றுமை இரண்டு மையக்கருத்துக்களின் பி 1 தண்டுக்குள் நியூக்ளியோடைடு பாதுகாப்பு ஆகும், மேலும் இதுவும் பிற ஒற்றுமைகளும் முன்பு விவாதிக்கப்பட்டன. டவுன்ஸ்ட்ரீம்-பெப்டைட் ஆர்என்ஏக்கள் பல ஆதாரங்களின் அடிப்படையில் ரைபோஸ்விட்சுகளுடன் ஒத்திருக்கின்றன என்று கருதப்பட்டது. முதலாவதாக, ஜிஎல்என்ஏ ஆர்என்ஏக்கள் பெரும்பாலும் நைட்ரஜன் வளர்சிதை மாற்றத்தில் ஈடுபட்டுள்ள பல வகை மரபணுக்களின் 5 'மொழிபெயர்க்கப்படாத பகுதிகளில் அமைந்துள்ளன. இது, மற்றும் பிற சான்றுகள், ஜிஎல்என்ஏ ஆர்என்ஏக்கள் ரைபோஸ்விட்ச்கள் என்று கூறுகின்றன, மேலும் டவுன்ஸ்ட்ரீம்-பெப்டைட் ஆர்என்ஏக்களுடன் அவற்றின் கட்டமைப்பு ஒற்றுமை டவுன்ஸ்ட்ரீம்-பெப்டைட் ஆர்என்ஏக்களும் ரைபோஸ்விட்ச்கள் என்று கூறுகிறது. இரண்டாவதாக, கீழ்நிலை ஓஆர்எஃப்களை ஒழுங்குபடுத்துவதில் சிஸ்-ஒழுங்குமுறை பாத்திரத்துடன் ஒத்துப்போகும் இடத்தில் டவுன்ஸ்ட்ரீம்-பெப்டைடுகள் தொடர்ந்து நிலைநிறுத்தப்படுகின்றன, இருப்பினும் ஓஆர்எஃப்களின் உயிரியல் பங்கு தெரியவில்லை. மூன்றாவதாக, சூடோக்னாட் அமைப்பு மிதமான சிக்கலைக் கொண்டுள்ளது, இது ரைபோஸ்விட்சுகளின் பொதுவானது. இறுதியாக, நைட்ரஜன் கிடைப்பதன் மூலம் கீழ்நிலை ORF இன் ஒழுங்குமுறையைக் கவனிப்பது தனிமத்தின் சிஸ்-ஒழுங்குமுறைப் பங்கைக் குறிக்கிறது. இந்த கருதுகோள் உயிர்வேதியியல் மற்றும் மரபணு தரவுகளால் ஆதரிக்கப்படுகிறது. முதலாவதாக, டவுன்ஸ்ட்ரீம்-பெப்டைட் ஆர்என்ஏக்கள் மற்றும் ஜிஎல்என்ஏ ஆர்என்ஏக்கள் இரண்டும் தேர்ந்தெடுக்கப்பட்ட குளுட்டமைனை பிணைக்கின்றன. இரண்டாவதாக, டவுன்ஸ்ட்ரீம்-பெப்டைட் மையக்கருத்தின் நிருபர் மரபணு பகுப்பாய்வு, இந்த ஆர். என். ஏ குளுட்டமைன் பிணைப்பின் மீது நிருபர் மரபணு வெளிப்பாட்டை ஊக்குவிக்கிறது என்பதை வெளிப்படுத்தியது, எனவே இது ஒரு செயல்பாட்டு ரைபோஸ்விட்ச் என்று கருதப்படலாம். டவுன்ஸ்ட்ரீம்-பெப்டைட் மையக்கருத்தால் கட்டுப்படுத்தப்படக்கூடிய சாத்தியமான உயிரணுக்கள், அவற்றின் 5 'யு. டி. ஆரில் டவுன்ஸ்ட்ரீம்-பெப்டைட் மையக்கருத்தை அடிக்கடி சுமந்து செல்லும் மரபணுக்கள் மற்றும் டியுஎஃப்4278 ஐக் கொண்ட சிறிய, அறியப்படாத புரதங்களை குறியாக்கம் செய்கின்றன மற்றும் குளுட்டமைன் சிந்த்டேஸின் உத்தேச கட்டுப்பாட்டாளர்களாக உள்ளன. இந்த கருதுகோள் DUF4278-கொண்ட குளூட்டமைன் சிந்த்டேஸ் தடுப்பு காரணி IF17 குறியீட்டு மரபணு gifB இன் வெளிப்பாடு கட்டமைப்பு ரீதியாக தொடர்புடைய ஜிஎல்என்ஏ ஆர்என்ஏ மையக்கருத்தால் கட்டுப்படுத்தப்படுவதாகக் காட்டப்பட்டுள்ளது என்ற கண்டுபிடிப்பால் ஆதரிக்கப்படுகிறது. டவுன்ஸ்ட்ரீம்-பெப்டைட் ஆர்என்ஏக்கள் yfr6 எனப்படும் கணிக்கப்பட்ட குறியீட்டு அல்லாத ஆர்என்ஏவை ஒன்றுடன் ஒன்று இணைக்கின்றன, இது 200 நியூக்ளியோடைடுகளுக்கு மேல் நீளம் கொண்டது, ஆனால் மேல்நோக்கிய பகுதி (டவுன்ஸ்ட்ரீம்-பெப்டைட் மையக்கருத்துடன் தொடர்புடையது) மட்டுமே ஆர்என்ஏ கட்டமைப்பாக செயல்படுகிறது என்று முன்மொழியப்பட்டது. yfr14 என்று அழைக்கப்படும் ஒரு தனித்துவமான கணிக்கப்பட்ட குறியீட்டு அல்லாத ஆர்என்ஏ, yfr6 மற்றும் டவுன்ஸ்ட்ரீம்-பெப்டைட் ஆர்என்ஏக்கள் இரண்டையும் ஒன்றுடன் ஒன்று இணைக்கிறது. இருப்பினும், டவுன்ஸ்ட்ரீம்-பெப்டைட் ரைபோஸ்விச்சின் இப்போது நிறுவப்பட்ட பாத்திரத்திற்கு அப்பால் yfr6 அல்லது yfr14 ஏதேனும் செயல்பாட்டைக் கொண்டிருக்கிறதா என்பது தெளிவாகத் தெரியவில்லை. குறிப்புகள் வெளிப்புற இணைப்புகள் சிஸ்-ஒழுங்குமுறை ஆர்என்ஏ கூறுகள் ரைபோஸ்விச்