HIKESHI
ஹைகேஷி என்பது நுரையீரல் மற்றும் பல்லுயிர் உயிரின வளர்ச்சியில் முக்கியமான ஒரு புரதமாகும், இது மனிதர்களில் ஹைகேஷி மரபணுவால் குறியிடப்படுகிறது. ஹைகேஷி மனிதர்களில் குரோமோசோம் 11 மற்றும் எலிகளில் குரோமோசோம் 7 இல் காணப்படுகிறது. ஒத்த வரிசைகள் (ஆர்த்தோலாக்ஸ்) பெரும்பாலான விலங்கு மற்றும் பூஞ்சை இனங்களில் காணப்படுகின்றன. குரோமோசோம் 7 ரின்சிக் 6 புரதத்தில் உள்ள சுட்டி ஹோமோலோக், ஆபத்தான மரபணு l7Rn6 மரபணுவால் குறியிடப்பட்டுள்ளது. ஜீன் ஹைகேஷி என்பது ஹோமோ சேபியன்ஸில் உள்ள ஒரு புரதக் குறியீட்டு மரபணு ஆகும். மரபணுவுக்கான மாற்று பெயர்கள் FLJ43020, HSPC138, HSPC179, மற்றும் L7RN6 ஆகும். குரோமோசோம் 11 இன் நீண்ட கையில் q14.2 பகுதியில் அமைந்துள்ள, இன்ட்ரான்கள் மற்றும் எக்ஸான்கள் உட்பட முழு மரபணுவும் பிளஸ் ஸ்ட்ராண்டில் 42,698 அடிப்படை ஜோடிகள் ஆகும். ஹைகேஷி மாறுபாடு 1 இன் எம். ஆர். என். ஏ 1,33,4,5 மற்றும் 7 எக்ஸான்களை உள்ளடக்கியது, இது 1,183 அடிப்படை ஜோடிகள் ஆகும், அடிப்படை ஜோடிகள் 239 முதல் 832 வரை குறியீட்டு பகுதிகளைக் குறிக்கின்றன. மாற்று பிளவு மாறுபாடு 1 என்பது மிக நீளமான மற்றும் மிகவும் பொதுவான புரத குறியீட்டு மாறுபாடு ஆகும். மற்ற மூன்று முக்கிய மாறுபாடுகள் ஒரு மாற்று எக்ஸான் வரிசையைப் பயன்படுத்துகின்றன, இது வாசிப்பு சட்டகத்தை தூக்கி எறிந்து, எம்ஆர்என்ஏ வரிசையை முன்கூட்டியே முடிவுக்குக் கொண்டுவருகிறது மற்றும் புரதச் சிதைவுக்கு உட்படுகிறது. கீழே உள்ள அட்டவணை வெவ்வேறு வகைகள் மற்றும் எக்ஸான் பயன்பாட்டைக் காட்டுகிறது. மேலே உள்ள அட்டவணையில் காட்டப்பட்டுள்ள நான்கு வகைகள் மனித உயிரணுக்களில் காணப்படும் மிகவும் பொதுவான ஐசோஃபார்ம்கள் ஆகும். இரண்டு மாற்று விளம்பரதாரர்களைப் பயன்படுத்தும் மொத்தம் 13 மாற்று ஸ்ப்லைஸ் செய்யப்பட்ட வரிசைகள் மற்றும் மூன்று ஸ்ப்லைஸ் செய்யப்படாத வடிவங்கள் உள்ளன. எம்ஆர்என்ஏ மாறுபாடுகள் 8 வெவ்வேறு எக்ஸான்கள், மாற்று, ஒன்றுடன் ஒன்று எக்ஸான்கள் மற்றும் இன்ட்ரான்களின் தக்கவைப்பு ஆகியவற்றின் கலவையில் வேறுபடுகின்றன. மாற்று பிளவுகளைத் தவிர, எம்ஆர்என்ஏக்கள் 3 'முனையில் துண்டிக்கப்படுவதன் மூலம் வேறுபடுகின்றன. மாறுபாடு 1 என்பது ஒரு புரதத்திற்கான குறியீட்டைக் காட்டும் பத்து எம்ஆர்என்ஏக்களில் ஒன்றாகும், மீதமுள்ளவை முட்டாள்தனமான மத்தியஸ்த எம்ஆர்என்ஏ சிதைவுக்கு கட்டுப்பட்டதாகத் தெரிகிறது. C11orf73 ஐசோஃபார்ம்ஸ் விளம்பரதாரரின் ஏஸ் வியூ பிரதிநிதித்துவம் விளம்பரதாரர் பகுதி, GXP 47146, ஜெனோமாடிக்ஸின் எல்டோராடோ கருவியைப் பயன்படுத்தி கண்டறியப்பட்டது. 840 பிபி வரிசை ஹைகேஷி மரபணுவுக்கு முன் டிஎன்ஏ புள்ளிகள் 86012753 முதல் 86013592 வரை அமைந்துள்ளது. விளம்பரதாரர் 12 ஆர்த்தோலாக்களில் 12 இல் பாதுகாக்கப்படுகிறார் மற்றும் 6 தொடர்புடைய டிரான்ஸ்கிரிப்ட்களுக்கான குறியீடுகள். ஜெனோமேட்டிக்ஸ் எல்டோராடோ கருவியிலிருந்து பாதுகாக்கப்பட்ட டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் காரணி பிணைப்பு தளங்கள்ஃ எம்ஆர்என்ஏ உற்பத்தியை நிறுத்துவது மரபணுவின் சிடிஎன்ஏ-க்குள் குறியிடப்பட்டுள்ளது. ஒரு எம்ஆர்என்ஏ உற்பத்தியின் இறுதி முடிவு பொதுவாக மூன்று முக்கிய அம்சங்களைக் கொண்டுள்ளதுஃ பாலி ஏ சமிக்ஞை, பாலி ஏ வால் மற்றும் ஒரு ஸ்டெம் லூப் கட்டமைப்பை உருவாக்கக்கூடிய வரிசையின் ஒரு பகுதி. பாலி ஏ சமிக்ஞை என்பது மிகவும் பாதுகாக்கப்பட்ட தளம், ஆறு நியூக்ளியோடைடு நீண்ட வரிசை. யூகாரியோட்டுகளில் இந்த வரிசை AATAA மற்றும் பாலி A தளத்திலிருந்து 10-30 நியூக்ளியோடைடுகள் பற்றி அமைந்துள்ளது. ஏ. ஏ. டி. ஏ. ஏ வரிசை என்பது மிகவும் பாதுகாக்கப்பட்ட, யூகாரியோடிக் பாலிஏ சமிக்ஞையாகும், இது சமிக்ஞை வரிசைக்குப் பிறகு எம். ஆர். என். ஏ தயாரிப்பு <ஐ. டி 1> அடிப்படை ஜோடிகளின் பாலிடெனைலேஷனுக்கு சமிக்ஞை செய்கிறது. C11orf73 க்கான பாலிஏ தளம் ஜிடிஏ ஆகும். மரபணு வெளிப்பாடு ஹைகேஷி சராசரியை விட 2.3 மடங்கு அதிக அளவில் எங்கும் வெளிப்படுத்தப்படுவதாக தீர்மானிக்கப்பட்டது. C11orf73 அதிக எண்ணிக்கையிலான மனித திசுக்களில் வெளிப்படுகிறது. யூனிஜீனில் வெளிப்பாடு சுயவிவரங்களுக்கும் EST சுயவிவரத்திற்கும் இடையில், 11 திசுக்கள் மட்டுமே C11orf73 ஐ வெளிப்படுத்தவில்லை என்று காட்டப்பட்டது, பெரும்பாலும் திசுவில் உள்ள சிறிய மாதிரி அளவுகள் காரணமாக இருக்கலாம். மனித ஹைகேஷி மரபணு C11orf73 என்ற பண்பற்ற புரதத்திற்கான குறியீட்டை உருவாக்குகிறது. ஒரே மாதிரியான சுட்டி L7rn6 மரபணு குரோமோசோம் 7 ரின்சிக் 6 இல் ஆபத்தான மரபணு எனப்படும் புரதத்தை குறியாக்கம் செய்கிறது. 1 mfgclvagrl vqtaaqqva dkfvfdlpdy Esinhvvvfm lgtipfpegm ggsvyfsypd 61 sngmpvqll gfvtngkpsa iffkisglksg egsqhpgam nivrtpsvaq igisvellds 121 mqtpvgna avssvdsftq ftqkmldnfy nfassfavsq aqmtpspsem fipanvvlkw 181 yenfqrrlaq nPLfwkt குறியிடப்பட்ட மனித புரதம் 197 அமினோ அமிலங்கள் நீளமானது. சுட்டி புரதத்துடன் ஒப்புமை மூலம், மனித ஹைகேஷி புரதத்தின் கற்பனையான செயல்பாடு நுரையீரல் உயிரணுக்களில் உள்ள சுரக்கும் கருவியின் அமைப்பு மற்றும் செயல்பாடாகும். DUF775 (அறியப்படாத செயல்பாட்டு 775 இன் களம்) என்று அழைக்கப்படும் புரத களம் மனித ஹைகேஷி மற்றும் சுட்டி L7rn6 புரதங்கள் இரண்டிலும் அமைந்துள்ளது. DUF775 களம் 197 அமினோ அமிலங்கள் நீளமானது, புரதத்தின் அதே நீளம். வரையறையின்படி DUF 775 சூப்பர் குடும்பத்தை உருவாக்கும் பிற புரதங்களில் C11orf73 இன் அனைத்து ஆர்த்தோலாக்களும் அடங்கும். ஹைட்ரோபதி பகுப்பாய்வு புரதத்தில் விரிவான ஹைட்ரோபோபிக் பகுதிகள் இல்லை என்பதைக் காட்டுகிறது, எனவே, ஹைகேஷி ஒரு சைட்டோபிளாஸ்மிக் புரதம் என்று முடிவு செய்யப்படுகிறது. C11orf73 க்கான ஐசோ எலக்ட்ரிக் புள்ளி 5.108 இது அதிக அமில சூழலில் உகந்த முறையில் செயல்படுகிறது என்பதைக் குறிக்கிறது. C11orf73 வரிசைக்கான ஒரே SNP, அல்லது ஒற்றை-நியூக்ளியோடைடு பாலிமார்பிசம், புரதத்திற்குள் ஒரு அமினோ அமில மாற்றத்தை ஏற்படுத்துகிறது. மற்ற எஸ். என். பி. களின் பற்றாக்குறை பெரும்பாலும் ஹைகேஷியின் உயர் மட்ட பாதுகாப்பு மற்றும் புரதத்தில் ஒரு பிறழ்வு உயிரினத்தின் மீது ஏற்படுத்தும் ஆபத்தான விளைவு காரணமாக இருக்கலாம். எஸ்என்பி-க்கான பினோட்டைப் தெரியவில்லை. ஹைகேஷியைச் சுற்றியுள்ள மரபணுக்கள் சிசிடிசி81, எம்இ3 மற்றும் ஈஇடி ஆகும். சுற்றியுள்ள மரபணுக்களின் செயல்பாட்டைப் பார்ப்பதன் மூலம் மரபணுவின் சாத்தியமான செயல்பாட்டைப் பற்றி நன்கு புரிந்துகொள்வதற்காக மரபணு சுற்றுப்புறம் பார்க்கப்படுகிறது. சி. சி. டி. சி. 81 மரபணு குறியீடுகள் ஒரு பண்பற்ற புரத தயாரிப்புக்கானவை மற்றும் பிளஸ் ஸ்ட்ராண்டில் அமைந்துள்ளன. சி. சி. டி. சி. 81 என்பது 81 ஐசோஃபார்ம் 1 கொண்ட சுருள்-சுருள் களத்தைக் குறிக்கிறது. எம்இ3 மரபணு மைட்டோகாண்ட்ரியல் மாலிக் என்சைம் 3 முன்னோடியைக் குறிக்கிறது. மாலிக் என்சைம் என்ஏடி + அல்லது என்ஏடிபி + ஐ ஒரு கோஃபாக்டராகப் பயன்படுத்தி மாலேட்டின் ஆக்ஸிஜனேற்ற டீகார்பாக்சிலேஷனை பைருவேட்டாக ஊக்குவிக்கிறது. பாலூட்டி திசுக்களில் மாலிக் என்சைமின் 3 தனித்துவமான ஐசோஃபார்ம்கள் உள்ளனஃ ஒரு சைட்டோசோலிக் என்ஏடிபி (+)-சார்ந்த ஐசோஃபார்ம், ஒரு மைட்டோகாண்ட்ரியல் என்ஏடிபி (+)-சார்ந்த ஐசோஃபார்ம் மற்றும் ஒரு மைட்டோகாண்ட்ரியல் என்ஏடி (+)-சார்ந்த ஐசோஃபார்ம். இந்த மரபணு ஒரு மைட்டோகாண்ட்ரியல் என். ஏ. டி. பி (+)-சார்ந்த ஐசோஃபார்மை குறியாக்கம் செய்கிறது. இந்த மரபணுவுக்கு பல மாற்று ஸ்ப்லைஸ் செய்யப்பட்ட டிரான்ஸ்கிரிப்ட் வகைகள் கண்டறியப்பட்டுள்ளன, ஆனால் சில வகைகளின் உயிரியல் செல்லுபடியாகும் தன்மை தீர்மானிக்கப்படவில்லை. EED மரபணு என்பது கரு எக்டோடெர்ம் வளர்ச்சி ஐசோஃபார்ம் b ஐக் குறிக்கிறது மற்றும் இது பாலிகோம்ப்-குரூப் (பிசிஜி) குடும்பத்தின் உறுப்பினராகும். பிசிஜி குடும்ப உறுப்பினர்கள் மல்டிமெரிக் புரத வளாகங்களை உருவாக்குகிறார்கள், அவை அடுத்தடுத்த உயிரணு தலைமுறைகளில் மரபணுக்களின் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனல் அடக்குமுறை நிலையை பராமரிப்பதில் ஈடுபட்டுள்ளன. இந்த புரதம் ஜெஸ்டே 2 இன் மேம்பாட்டாளர், இன்டெக்ரின் பீட்டா 7 இன் சைட்டோபிளாஸ்மிக் வால், நோயெதிர்ப்பு குறைபாடு வைரஸ் வகை 1 (எச். ஐ. வி-1) எம்ஏ புரதம் மற்றும் ஹிஸ்டோன் டீசிடிலேஸ் புரதங்களுடன் தொடர்பு கொள்கிறது. இந்த புரதம் ஹிஸ்டோன் டீஅசிட்டிலேஷன் மூலம் மரபணு செயல்பாட்டை அடக்குவதற்கு மத்தியஸ்தம் செய்கிறது, மேலும் ஒருங்கிணைப்பு செயல்பாட்டின் ஒரு குறிப்பிட்ட கட்டுப்பாட்டாளராக செயல்படக்கூடும். இந்த மரபணுவுக்கு தனித்துவமான ஐசோஃபார்ம்களை குறியாக்கம் செய்யும் இரண்டு டிரான்ஸ்கிரிப்ட் வகைகள் அடையாளம் காணப்பட்டுள்ளன. தொடர்புகள் ஸ்டிரிங் மற்றும் சிக்மா-ஆல்ட்ரிச்சின் பிடித்த ஜீன் திட்டங்கள் C11orf73 உடன் சாத்தியமான புரத தொடர்புகளை பரிந்துரைத்தன. ஏ. ஆர். ஜி. யு. எல்1, சி. ஆர். எச். பி. பி மற்றும் ஈ. இ. டி ஆகியவை உரைச் சுரங்கத்திலிருந்து பெறப்பட்டன, எச். என். எஃப்4ஏ சிக்மா-ஆல்ட்ரிச்சிலிருந்து வந்தது. ஏ. ஆர். ஜி. யு. எல். 1 என்பது அறியப்படாத செயல்பாட்டைக் கொண்ட ஒரு அறியப்படாத புரதமாகும். சி. ஆர். எச். பி. பி என்பது கார்டிகோட்ரோபின் வெளியிடும் ஹார்மோன் பிணைப்பு புரதமாகும், இது ஹைகேஷியை உள்ளடக்கிய அல்லது செயல்படுத்தும் ஒரு சமிக்ஞை அடுக்கில் பங்கு வகிக்கக்கூடும். EED, C11orf73 இன் அண்டை புரதமாகும், இது ஒரு கரு எக்டோடெர்ம் வளர்ச்சி புரதமாகும் மற்றும் இது பாலிகோம்ப்-குரூப் (பிசிஜி) குடும்பத்தின் உறுப்பினராகும். பிசிஜி குடும்ப உறுப்பினர்கள் மல்டிமெரிக் புரத வளாகங்களை உருவாக்குகிறார்கள், அவை அடுத்தடுத்த உயிரணு தலைமுறைகளில் மரபணுக்களின் டிரான்ஸ்கிரிப்ஷனல் அடக்குமுறை நிலையை பராமரிப்பதில் ஈடுபட்டுள்ளன. எச்என்எஃப்4ஏ ஒரு டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் ரெகுலேட்டர் மற்றும் எச்என்எஃப்4ஏ சி11ஆர்எஃப்73 இன் வெளிப்பாட்டை ஒழுங்குபடுத்துகிறதா அல்லது அதனுடன் வெறுமனே தொடர்பு கொள்கிறதா என்பது தெரியவில்லை. [12 பரிணாம வரலாறு உயிரினங்களின் பரிணாம வரலாற்றை ஒரு பைலோஜெனெடிக் மரத்தை உருவாக்குவதற்கான நேரக் குறிப்புகளாக ஆர்த்தோலாக்களின் வரிசைகளைப் பயன்படுத்தி தீர்மானிக்க முடியும். CLUSTALW பல வரிசைகளை ஒப்பிடுகிறது, C11orf73 இன் ஆர்த்தோலாக்குகளின் அடிப்படையில் அத்தகைய பைலோஜெனெடிக் மரத்தை உருவாக்கவும் நிரலைப் பயன்படுத்தலாம். வலதுபுறத்தில் உள்ள மரம் வேறுபட்ட நேரத்தின் அடிப்படையில் ஒரு காலவரிசையுடன் உருவாக்கப்பட்ட பைலோஜெனெடிக் மரத்தைக் காட்டுகிறது. ஹைகேஷி ஆர்த்தோலாக்களால் செய்யப்பட்ட மரம் இலக்கிய பைலோஜெனெடிக் மரத்துடன் ஒத்திருக்கிறது, மீன், பறவைகள் மற்றும் பூஞ்சை போன்ற ஒத்த உயிரினங்களை கூட ஒன்றிணைக்கிறது. ஆர்த்தலாக்ஸ் ஹோமோலோகஸ் வரிசைகள் ஒரு இனப்பெருக்க நிகழ்வால் பிரிக்கப்பட்டால் அவை ஆர்த்தோலோகஸ் ஆகும்ஃ ஒரு இனம் இரண்டு தனித்தனி இனங்களாகப் பிரியும் போது, இதன் விளைவாக வரும் இனங்களில் ஒரு மரபணுவின் மாறுபட்ட நகல்கள் ஆர்த்தோலோகஸ் என்று கூறப்படுகிறது. ஆர்த்தோலாக்ஸ் அல்லது ஆர்த்தோலாக்ஸ் மரபணுக்கள் என்பது வெவ்வேறு இனங்களில் உள்ள மரபணுக்கள் ஆகும், அவை ஒரு பொதுவான மூதாதையரிடமிருந்து தோன்றியதால் ஒருவருக்கொருவர் ஒத்திருக்கின்றன. எலும்பியல் வரிசைகள் உயிரினங்களின் வகைப்பாட்டு வகைப்பாடு மற்றும் பைலோஜெனெடிக் ஆய்வுகளில் பயனுள்ள தகவல்களை வழங்குகின்றன. உயிரினங்களின் தொடர்பைக் கண்டறிய மரபணு வேறுபாட்டின் வடிவத்தைப் பயன்படுத்தலாம். மிகவும் நெருக்கமாக தொடர்புடைய இரண்டு உயிரினங்கள் இரண்டு ஆர்த்தோலாக்களுக்கு இடையில் மிகவும் ஒத்த டிஎன்ஏ வரிசைகளைக் காட்ட வாய்ப்புள்ளது. மாறாக, மற்றொரு உயிரினத்திலிருந்து பரிணாம ரீதியாக மேலும் அகற்றப்படும் ஒரு உயிரினம் ஆய்வு செய்யப்படும் ஆர்த்தோலாக்குகளின் வரிசையில் அதிக வேறுபாட்டைக் காட்ட வாய்ப்புள்ளது. குரோமோசோமின் அட்டவணை 11 திறந்த வாசிப்பு சட்டகம் 73 எலும்பியல் அட்டவணை புரதத்தின் பெயர், சேர்க்கை எண்கள், நியூக்ளியோடைடு அடையாளம், புரத அடையாளம் மற்றும் ஈ-மதிப்புகள் ஆகியவற்றுடன் 13 வரிசைகளை (12 எலும்பியல், 1 அசல் வரிசை) காட்டுகிறது. அணுகல் எண்கள் என்பிஐ புரோட்டீன் தரவுத்தளத்திலிருந்து அடையாளம் காணும் எண்கள் ஆகும். நியூக்ளியோடைடு வரிசையை புரதத்தின் வரிசைப் பக்கத்திலிருந்து டிபிஎஸ்ஓயுஆர்சிஇ-இலிருந்து அணுகலாம், இது அணுகல் எண்ணைக் கொடுக்கிறது மற்றும் நியூக்ளியோடைடின் வரிசைப் பக்கத்திற்கான இணைப்பாகும். ஒவ்வொரு ஆர்த்தோலாக் மற்றும் அதன் அந்தந்த உயிரினத்திற்கான நியூக்ளியோடைடு மற்றும் புரத வரிசை ஆகிய இரண்டின் நீளமும் அட்டவணையில் பட்டியலிடப்பட்டுள்ளது. வரிசை நீளங்களுக்கு அடுத்ததாக அசல் ஹைகேஷி மரபணுவுக்கு ஆர்த்தோலாக்கின் அடையாளங்கள் உள்ளன. அடையாளங்கள் மற்றும் மின்-மதிப்புகள் உலகளாவிய சீரமைப்பு திட்டமான ALIGN ஐப் பயன்படுத்தி SDSC உயிரியல் பணிமனை மற்றும் NCBI இலிருந்து BLAST ஐப் பயன்படுத்தி பெறப்பட்டன. பெரும்பாலும் நேரியல் வளைவை உருவாக்க உயிரினத்தின் வேறுபாடு நேரத்திற்கு எதிராக ஆர்த்தோலாக்கின் சதவீத அடையாளத்தை வரைபடம் காட்டுகிறது. வளைவுக்குள் உள்ள இரண்டு முக்கிய மூட்டுகள் முறையே சுமார் 450 மில்லியன் ஆண்டுகள் மற்றும் 1150 மில்லியன் ஆண்டுகளுக்கு முன்பு மரபணு நகலெடுப்பின் நேரங்களைக் குறிக்கின்றன. மரபணு நகல்களின் இணைப்புகள் அநேகமாக ஹைகேஷியின் மிகவும் பாதுகாக்கப்பட்ட ஆர்த்தோலாக்களிலிருந்து மிகவும் வேறுபட்டவை, இது பிளிங்க் அல்லது பிளாஸ்ட் கருவிகளைப் பயன்படுத்தி கண்டுபிடிக்கப்படவில்லை. மதிப்பு m (100 அமினோ அமிலப் பிரிவில் ஏற்பட்ட அமினோ அமில மாற்றங்களின் மொத்த எண்ணிக்கை), இது n இன் திருத்தப்பட்ட மதிப்பு (வார்ப்புரு வரிசையிலிருந்து அமினோ அமில வேறுபாடுகளின் எண்ணிக்கை), λ ஐக் கணக்கிடவும் பயன்படுத்தப்படுகிறது (ஆண்டுக்கு சராசரி அமினோ அமில மாற்றங்கள், பொதுவாக λE9 மதிப்புகளில் குறிப்பிடப்படுகின்றன). m/100 =-ln (1-n/100) λ = (m/100)/(2 * T) குறிப்புகள் வெளிப்புற இணைப்புகள் மனித புரதங்கள்