Chemical table file
केमिकल टेबल फाइल (सी. टी. फाइल) पाठ-आधारित रासायनिक फाइल प्रारूपों का एक परिवार है जो अणुओं और रासायनिक प्रतिक्रियाओं का वर्णन करता है। उदाहरण के लिए, एक प्रारूप, एक अणु में प्रत्येक परमाणु, उस परमाणु के x-y-z निर्देशांक और परमाणुओं के बीच बंधन को सूचीबद्ध करता है। फाइल प्रारूप परिवार में कई फाइल प्रारूप हैं। प्रारूप एम. डी. एल. सूचना प्रणाली (एम. डी. एल.) द्वारा बनाए गए थे, जिसे सिमेक्स टेक्नोलॉजीज द्वारा अधिग्रहित किया गया था और फिर एक्सेलरीज़ कॉर्प के साथ विलय कर दिया गया था, और अब इसे बी. आई. ओ. वी. आई. ए. कहा जाता है, जो डसॉल्ट समूह के डसॉल्ट सिस्टम्स की सहायक कंपनी है। सीटी फाइल एक खुला प्रारूप है, बायोविया अपने विनिर्देशन को प्रकाशित करता है। बायोविया के लिए उपयोगकर्ताओं को सी. टी. फाइल प्रारूप विनिर्देशों को डाउनलोड करने के लिए पंजीकरण करने की आवश्यकता होती है। मोलफाइल एक एम. डी. एल. मोलफाइल एक अणु के परमाणुओं, बंधनों, संपर्क और निर्देशांक के बारे में जानकारी रखने के लिए एक फ़ाइल प्रारूप है। मोलफाइल में कुछ शीर्षक जानकारी होती है, कनेक्शन टेबल (सीटी) जिसमें परमाणु जानकारी होती है, फिर बंधन कनेक्शन और प्रकार, इसके बाद अधिक जटिल जानकारी के लिए अनुभाग होते हैं। मोलफाइल पर्याप्त रूप से आम है कि अधिकांश, यदि सभी नहीं, तो केमिनफॉर्मेटिक्स सॉफ्टवेयर सिस्टम/एप्लिकेशन प्रारूप को पढ़ने में सक्षम हैं, हालांकि हमेशा एक ही डिग्री तक नहीं। यह कुछ कम्प्यूटेशनल सॉफ्टवेयर जैसे मैथेमेटिका द्वारा भी समर्थित है। वर्तमान वास्तविक मानक संस्करण मोलफाइल वी2000 है, हालांकि, हाल ही में, वी3000 प्रारूप उन अनुप्रयोगों के लिए एक संभावित संगतता समस्या प्रस्तुत करने के लिए व्यापक रूप से प्रसारित हो रहा है जो अभी तक वी3000-सक्षम नहीं हैं। काउंट लाइन ब्लॉक विनिर्देशन बॉन्ड ब्लॉक विनिर्देशन बॉन्ड ब्लॉक बॉन्ड लाइनों से बना है, प्रति बॉन्ड एक लाइन, निम्नलिखित प्रारूप के साथः 111 222 टी. टी. टी. एस. एस. एक्स. एक्स. आर. आर. सी. सी. सी. जहां मूल्यों को निम्नलिखित तालिका में वर्णित किया गया हैः विस्तारित कनेक्शन टेबल (वी3000) विस्तारित (वी3000) मॉल्फाइल में एक नियमित मॉल्फाइल "कोई संरचना नहीं" होता है जिसके बाद एक एकल मॉल्फाइल परिशिष्ट होता है जिसमें कनेक्शन टेबल (सी. टी. ए. बी.) का मुख्य भाग होता है। निम्नलिखित चित्र एक एलेनाइन संरचना और इसके अनुरूप विस्तारित मॉल्फाइल दोनों को दर्शाता है। ध्यान दें कि "कोई संरचना नहीं" को "वी2000" संस्करण टिकट के बजाय "वी3000" के साथ चिह्नित किया गया है। संस्करण के अलावा शीर्षलेख में दो अन्य परिवर्तन हैंः परिशिष्ट पंक्तियों की संख्या हमेशा 999 के रूप में लिखी जाती है, चाहे वास्तव में कितनी भी हों। (सभी वर्तमान पाठक गिनती की अवहेलना करेंगे और एम एंड पर रुकेंगे।) "आयामी कोड" को अधिक स्पष्ट रूप से बनाए रखा जाता है। इस प्रकार "3डी" का वास्तव में अर्थ है 3डी, हालाँकि यदि कोई गैर-शून्य जेड-निर्देशांक पाए जाते हैं तो "2डी" की व्याख्या 3डी के रूप में की जाएगी। वी2000 मोलफाइल के विपरीत, वी3000 विस्तारित आरग्रुप मोलफाइल में गैर-आरग्रुप मोलफाइल के समान हेडर प्रारूप होता है। काउंट लाइन ए काउंट लाइन की आवश्यकता होती है, और यह पहले होनी चाहिए। यह परमाणुओं, बंधनों, 3डी वस्तुओं और एस समूहों की संख्या को निर्दिष्ट करता है। यह यह भी निर्दिष्ट करता है कि चिरल झंडा सेट किया गया है या नहीं। वैकल्पिक रूप से, गणना रेखा मोलरेगनो को निर्दिष्ट कर सकती है। इसका उपयोग केवल तभी किया जाता है जब रेग्नो 999999 (मोलफाइल हेडर लाइन में प्रारूप की सीमा) से अधिक हो। गणना पंक्ति का प्रारूप हैः एस. डी. एफ. एस. डी. एफ. एम. डी. एल. द्वारा विकसित रासायनिक-डेटा फ़ाइल प्रारूपों के एक परिवार में से एक है; यह विशेष रूप से संरचनात्मक जानकारी के लिए है। "एस. डी. एफ". का अर्थ संरचना-डेटा प्रारूप है, और एस. डी. एफ. फाइलें वास्तव में मोलफाइल (एम. डी. एल. मोलफाइल) प्रारूप को लपेटती हैं। कई अभिलेखों को चार डॉलर संकेतों ($$$$) वाली रेखाओं द्वारा सीमांकित किया जाता है। इस प्रारूप की एक प्रमुख विशेषता संबद्ध डेटा को शामिल करने की इसकी क्षमता है। संबद्ध डेटा आइटमों को निम्नानुसार दर्शाया गया हैः> <अद्वितीय _ आईडी> एक्ससीए3464366> <क्लोगपी> 5.825 <विक्रेता> सिग्मा> <आणविक भार> 499.611 एकाधिक-पंक्ति डेटा आइटम भी समर्थित हैं। एम. डी. एल. एस. डी. एफ.-प्रारूप विनिर्देशन के लिए आवश्यक है कि यदि किसी पाठ क्षेत्र की एक पंक्ति 200 वर्णों से अधिक है तो एक हार्ड-कैरिज-रिटर्न वर्ण डाला जाए। व्यवहार में इस आवश्यकता का अक्सर उल्लंघन किया जाता है, क्योंकि कई स्माइल्स और इनची स्ट्रिंग्स उस लंबाई से अधिक हैं। परिवार के अन्य प्रारूप परिवार के अन्य, कम उपयोग किए जाने वाले प्रारूप हैंः आरएक्सएनफाइल-एकल रासायनिक प्रतिक्रिया का प्रतिनिधित्व करने के लिए; आरडीफाइल-संबंधित डेटा के साथ रिकॉर्ड की सूची का प्रतिनिधित्व करने के लिए। प्रत्येक अभिलेख में रासायनिक संरचनाएं, प्रतिक्रियाएं, पाठ्य और सारणीबद्ध डेटा हो सकते हैं; आरजीफाइल-मार्कश संरचनाओं का प्रतिनिधित्व करने के लिए (बहिष्कृत, मॉल्फाइल वी3000 मार्कश संरचनाओं का प्रतिनिधित्व कर सकता है); एक्सडीफाइल-एक्सएमएल प्रारूप में रासायनिक जानकारी का प्रतिनिधित्व करने के लिए। प्रारूपों के बीच रासायनिक फ़ाइल format#Converting भी देखें संदर्भ बाहरी लिंक एड्रॉइट रिपॉजिटरी एड्रॉइट डी. आई. से एस. डी. फ़ाइलों (एस. डी. एफ.) को संसाधित करने के लिए भुगतान सॉफ्टवेयर। एस. डी. फ़ाइलों (एस. डी. एफ.) को संसाधित करने के लिए एस. डी. एफ. टूलकिट मुक्त सॉफ्टवेयर। एन. सी. आई./सी. ए. डी. डी. केमिकल आइडेंटिफायर रिज़ॉल्वर रासायनिक नामों, सी. ए. एस. रजिस्ट्री नंबरों, एस. एम. आई. एल. ई. एस., आई. एन. सी. आई., आई. एन. सी. आई. के. से एस. डी. फाइल (एस. डी. एफ.) उत्पन्न करता है। के. एन. आई. एम. ई. डेटा में हेरफेर करने और डेटामाइनिंग करने के लिए मुफ्त सॉफ्टवेयर है, एस. डी. फाइलों (एस. डी. एफ.) को भी पढ़ और लिख सकता है। तुलनात्मक विष विज्ञान डैशबोर्ड सेवा पर्यावरण संरक्षण एजेंसी (ई. पी. ए.) द्वारा प्रदान की जाती है जो रासायनिक नामों, सी. ए. एस. रजिस्ट्री नंबर, स्माइल्स, आई. एन. सी. आई., आई. एन. सी. आई. के.,. कम्प्यूटेशनल रसायन विज्ञान फाइल प्रारूपों से एस. डी. फाइल (एस. डी. एफ.) उत्पन्न करती है।