Consensus CDS Project
सर्वसम्मति कोडिंग अनुक्रम (सी. सी. डी. एस.) परियोजना प्रोटीन-कोडिंग क्षेत्रों के एक डेटासेट को बनाए रखने के लिए एक सहयोगी प्रयास है जो मानव और चूहे संदर्भ जीनोम सभाओं पर समान रूप से टिप्पणी की जाती है। सी. सी. डी. एस. परियोजना एक स्थिर पहचानकर्ता (सी. सी. डी. एस. आई. डी.) के साथ संदर्भ माउस और मानव जीनोम पर समान प्रोटीन एनोटेशन को ट्रैक करती है, और यह सुनिश्चित करती है कि वे लगातार राष्ट्रीय जैव प्रौद्योगिकी सूचना केंद्र (एन. सी. बी. आई.), एन्सेम्बल और यू. सी. एस. सी. जीनोम ब्राउज़र द्वारा दर्शाए जाते हैं। सी. सी. डी. एस. डेटासेट की अखंडता को सख्त गुणवत्ता आश्वासन परीक्षण और चल रहे मैनुअल क्यूरेशन के माध्यम से बनाए रखा जाता है। प्रेरणा और पृष्ठभूमि जैविक और जैव चिकित्सा अनुसंधान जीनोम संयोजनों पर जीन और उनके उत्पादों की सटीक और सुसंगत व्याख्या पर निर्भर करने लगे हैं। जीनोम के संदर्भ एनोटेशन विभिन्न स्रोतों से उपलब्ध हैं, जिनमें से प्रत्येक के अपने स्वतंत्र लक्ष्य और नीतियां हैं, जिसके परिणामस्वरूप कुछ एनोटेशन भिन्नता होती है। सी. सी. डी. एस. परियोजना की स्थापना प्रोटीन-कोडिंग जीन एनोटेशन के एक स्वर्ण मानक सेट की पहचान करने के लिए की गई थी जो भाग लेने वाले एनोटेशन समूहों द्वारा मानव और चूहे संदर्भ जीनोम असेंबलियों पर समान रूप से एनोटेट किए जाते हैं। सी. सी. डी. एस. जीन समूह जो विभिन्न भागीदारों की सर्वसम्मति से प्राप्त हुए हैं, उनमें अब 18,000 से अधिक मानव और 20,000 से अधिक माउस जीन शामिल हैं (सी. सी. डी. एस. रिलीज इतिहास देखें)। सी. सी. डी. एस. डेटासेट प्रत्येक नए रिलीज के साथ अधिक वैकल्पिक स्प्लिसिंग घटनाओं का तेजी से प्रतिनिधित्व कर रहा है। योगदान देने वाले समूहों में शामिल हैंः राष्ट्रीय जैव प्रौद्योगिकी सूचना केंद्र (एन. सी. बी. आई.) यूरोपीय जैव सूचना विज्ञान संस्थान (ई. बी. आई.) वेलकम ट्रस्ट सेंगर संस्थान (डब्ल्यू. टी. एस. आई.) ह्यूगो जीन नामकरण समिति (एच. जी. एन. सी.) माउस जीनोम सूचना विज्ञान (एम. जी. आई.) मैनुअल एनोटेशन निम्न द्वारा प्रदान किया जाता हैः डब्ल्यू. टी. एस. आई. में एन. सी. बी. आई. मानव और कशेरुकी विश्लेषण और एनोटेशन (एच. ए. वी. ए. एन. ए.) में संदर्भ अनुक्रम (रेफरेन्स सीक्वेंस)। (एन. सी. बी. आई.) और एनसेम्बल (जिसमें मैनुअल हावाना एनोटेशन शामिल हैं) द्वारा प्रदान किए गए मैनुअल और स्वचालित जीनोम एनोटेशन के संयोजन की तुलना मिलान करने वाले जीनोमिक निर्देशांक के साथ एनोटेशन की पहचान करने के लिए की जाती है। गुणवत्ता आश्वासन परीक्षण यह सुनिश्चित करने के लिए कि सी. डी. एस. उच्च गुणवत्ता के हैं, कई गुणवत्ता आश्वासन (क्यू. ए.) परीक्षण किए जाते हैं (तालिका 1)। सभी परीक्षण प्रत्येक सी. सी. डी. एस. निर्माण के एनोटेशन तुलना चरण के बाद किए जाते हैं और एनोटेशन तुलना से पहले किए गए व्यक्तिगत एनोटेशन समूह क्यू. ए. परीक्षणों से स्वतंत्र होते हैं। क्यू. ए. परीक्षणों में विफल होने वाले एनोटेशनों की एक दौर की मैनुअल जाँच की जाती है जो परिणामों में सुधार कर सकती है या क्यू. ए. विफलता के आधार पर एनोटेशन मिलानों को अस्वीकार करने के निर्णय तक पहुँच सकती है। समीक्षा प्रक्रिया सी. सी. डी. एस. डाटाबेस इस मायने में अद्वितीय है कि समीक्षा प्रक्रिया को कई सहयोगियों द्वारा किया जाना चाहिए, और कोई भी परिवर्तन करने से पहले समझौता किया जाना चाहिए। यह एक सहयोगी समन्वय प्रणाली के साथ संभव हुआ है जिसमें एक कार्य प्रक्रिया प्रवाह और विश्लेषण और चर्चा के लिए मंच शामिल हैं। सी. सी. डी. एस. डेटाबेस एक आंतरिक वेबसाइट संचालित करता है जो क्यूरेटर संचार, सहयोगी मतदान, विशेष रिपोर्ट प्रदान करने और सी. सी. डी. एस. अभ्यावेदन की स्थिति पर नज़र रखने सहित कई उद्देश्यों को पूरा करता है। जब एक सहयोगी सी. सी. डी. एस. समूह का सदस्य एक सी. सी. डी. एस. आई. डी. की पहचान करता है जिसे समीक्षा की आवश्यकता हो सकती है, तो अंतिम परिणाम पर निर्णय लेने के लिए एक मतदान प्रक्रिया का उपयोग किया जाता है। मैनुअल क्यूरेशन कोऑर्डिनेटेड मैनुअल क्यूरेशन को एक प्रतिबंधित-पहुंच वेबसाइट और एक चर्चा ई-मेल सूची द्वारा समर्थित किया जाता है। उच्च आवृत्ति पर देखे गए विशिष्ट संघर्षों को संबोधित करने के लिए सी. सी. डी. एस. उपचार दिशानिर्देश स्थापित किए गए थे। सी. सी. डी. एस. क्यूरेशन दिशानिर्देशों की स्थापना ने परस्पर विरोधी मतों की संख्या को कम करके और सर्वसम्मति समझौते तक पहुंचने के लिए चर्चा में बिताए गए समय को कम करके सी. सी. डी. एस. क्यूरेशन प्रक्रिया को अधिक कुशल बनाने में मदद की है। सी. सी. डी. एस. उपचार दिशानिर्देशों का एक लिंक यहाँ पाया जा सकता है। सी. सी. डी. एस. डेटा सेट के लिए स्थापित क्यूरेशन नीतियों को रेफसेक और हवाना एनोटेशन दिशानिर्देशों में एकीकृत किया गया है और इस प्रकार, दोनों समूहों द्वारा प्रदान की गई नई एनोटेशन सुसंगत होने की अधिक संभावना है और इसके परिणामस्वरूप सी. सी. डी. एस. आई. डी. के अतिरिक्त होने की संभावना है। ये मानक विशिष्ट समस्या क्षेत्रों को संबोधित करते हैं, एनोटेशन दिशानिर्देशों का एक व्यापक समूह नहीं हैं, और किसी भी सहयोगी समूह की एनोटेशन नीतियों को प्रतिबंधित नहीं करते हैं। उदाहरणों में शामिल हैं, दीक्षा कोडॉन के चयन के लिए मानकीकृत उपचार दिशानिर्देश और अपस्ट्रीम ओ. आर. एफ. और प्रतिलेखों की व्याख्या जो मूर्खतापूर्ण-मध्यस्थ क्षय के लिए उम्मीदवार होने की भविष्यवाणी की जाती है। क्यूरेशन लगातार होता है, और कोई भी सहयोगी केंद्र एक सी. सी. डी. एस. आई. डी. को संभावित अद्यतन या निकासी के रूप में चिह्नित कर सकता है। विरोधाभासी राय को वैज्ञानिक विशेषज्ञों या अन्य एनोटेशन क्यूरेशन समूहों जैसे कि ह्यूगो जीन नामकरण समिति (एचजीएनसी) और माउस जीनोम इंफॉर्मेटिक्स (एमजीआई) के साथ परामर्श करके संबोधित किया जाता है। यदि किसी विवाद का समाधान नहीं किया जा सकता है, तो सहयोगी अधिक जानकारी उपलब्ध होने तक सी. सी. डी. एस. आई. डी. को वापस लेने के लिए सहमत होते हैं। क्यूरेशन चैलेंज और एनोटेशन दिशानिर्देश मूर्खता-मध्यस्थ क्षय (एन. एम. डी.): एन. एम. डी. सबसे शक्तिशाली एम. आर. एन. ए. निगरानी प्रक्रिया है। एन. एम. डी. प्रोटीन में परिवर्तित होने से पहले दोषपूर्ण एम. आर. एन. ए. को समाप्त करता है। यह महत्वपूर्ण है क्योंकि यदि दोषपूर्ण एम. आर. एन. ए. का अनुवाद किया जाता है, तो कटा हुआ प्रोटीन बीमारी का कारण बन सकता है। एन. एम. डी. की व्याख्या करने के लिए विभिन्न तंत्र प्रस्तावित किए गए हैं, जिनमें से एक एक्सॉन जंक्शन कॉम्प्लेक्स (ई. जे. सी.) मॉडल है। इस मॉडल में, यदि स्टॉप कोडन अंतिम एक्सॉन-एक्सॉन जंक्शन के ऊपर की ओर> 50 एन. टी. है, तो प्रतिलिपि को एन. एम. डी. उम्मीदवार माना जाता है। सी. सी. डी. एस. सहयोगी एम. आर. एन. ए. प्रतिलेखों की जांच करने के लिए ई. जे. सी. मॉडल पर आधारित एक रूढ़िवादी विधि का उपयोग करते हैं। एन. एम. डी. उम्मीदवारों के रूप में निर्धारित किसी भी प्रतिलेख को निम्नलिखित स्थितियों को छोड़कर सी. सी. डी. एस. डेटा सेट से बाहर रखा गया हैः एक विशेष स्थान पर सभी प्रतिलेखों का आकलन एन. एम. डी. उम्मीदवारों के रूप में किया जाता है, हालांकि स्थान को पहले प्रोटीन कोडिंग क्षेत्र के रूप में जाना जाता है; प्रायोगिक साक्ष्य यह सुझाव देते हैं कि एन. एम. डी. उम्मीदवार प्रतिलेख से एक कार्यात्मक प्रोटीन का उत्पादन किया जाता है। इससे पहले, एन. एम. डी. उम्मीदवार प्रतिलेखों को रेफसेक और हवाना दोनों द्वारा प्रोटीन कोडिंग प्रतिलेखों के रूप में माना जाता था, और इस तरह, इन एन. एम. डी. उम्मीदवार प्रतिलेखों को सी. सी. डी. एस. डेटा सेट में दर्शाया गया था। रेफसेक समूह और हवाना परियोजना ने बाद में अपनी व्याख्या नीतियों को संशोधित किया है। कई इन-फ्रेम अनुवाद प्रारंभ स्थलः कई कारक अनुवाद आरंभ करने में योगदान करते हैं, जैसे कि अपस्ट्रीम ओपन रीडिंग फ्रेम (यूओआरएफ), माध्यमिक संरचना और अनुवाद प्रारंभ स्थल के आसपास अनुक्रम संदर्भ। एक सामान्य प्रारंभ स्थल कोज़ाक सर्वसम्मति अनुक्रम के भीतर परिभाषित किया गया हैः (जी. सी. सी.) कशेरुकी जीवों में जी. सी. सी. ए. सी. ए. यू. जी. जी। कोष्ठक में अनुक्रम (जी. सी. सी.) अज्ञात जैविक प्रभाव के साथ रूपांकन है। कोज़ाक सर्वसम्मति अनुक्रम के भीतर भिन्नताएँ हैं, जैसे कि जी या ए को ए. यू. जी. के ऊपर की ओर (स्थिति-3 पर) तीन न्यूक्लियोटाइड्स देखा जाता है। कोज़ाक अनुक्रम की स्थिति-3 और + 4 के बीच के आधारों का अनुवाद दक्षता पर सबसे महत्वपूर्ण प्रभाव पड़ता है। इसलिए, एक अनुक्रम (ए/जी) एन. एन. ए. यू. जी. जी. को सी. सी. डी. एस. परियोजना में एक मजबूत कोज़ाक संकेत के रूप में परिभाषित किया गया है। स्कैनिंग तंत्र के अनुसार, छोटी राइबोसोमल उप-इकाई पहले पहुँचने वाले प्रारंभ कोडन से अनुवाद शुरू कर सकती है। स्कैनिंग मॉडल के अपवाद हैंः जब दीक्षा स्थल एक मजबूत कोज़ाक संकेत से घिरा नहीं होता है, जिसके परिणामस्वरूप रिसाव स्कैनिंग होती है। इस प्रकार, राइबोजोम इस ए. यू. जी. को छोड़ देता है और एक डाउनस्ट्रीम स्टार्ट साइट से अनुवाद शुरू करता है; जब एक छोटा ओ. आर. एफ. राइबोजोम को डाउनस्ट्रीम ओ. आर. एफ. पर अनुवाद फिर से शुरू करने की अनुमति दे सकता है। सी. सी. डी. एस. एनोटेशन दिशानिर्देशों के अनुसार, सबसे लंबे ओ. आर. एफ. को एनोटेट किया जाना चाहिए, सिवाय तब जब प्रयोगात्मक प्रमाण हो कि अनुवाद शुरू करने के लिए एक आंतरिक प्रारंभ स्थल का उपयोग किया जाता है। इसके अतिरिक्त, अन्य प्रकार के नए डेटा, जैसे कि राइबोजोम प्रोफाइलिंग डेटा, का उपयोग स्टार्ट कोडॉन की पहचान करने के लिए किया जा सकता है। सी. सी. डी. एस. डेटा सेट प्रति सी. सी. डी. एस. आई. डी. में एक अनुवाद दीक्षा साइट को रिकॉर्ड करता है। अनुवाद के लिए किसी भी वैकल्पिक प्रारंभ साइट का उपयोग किया जा सकता है और इसे सी. सी. डी. एस. सार्वजनिक नोट में बताया जाएगा। अपस्ट्रीम ओपन रीडिंग फ्रेमः ट्रांसक्रिप्ट लीडर्स के भीतर स्थित ए. यू. जी. दीक्षा कोडन को अपस्ट्रीम ए. यू. जी. (यू. ए. यू. जी.) के रूप में जाना जाता है। कभी-कभी, यू. ए. यू. जी. यू. ओ. आर. एफ. से जुड़े होते हैं। यूओआरएफ लगभग 50 प्रतिशत मानव और माउस प्रतिलेखों में पाए जाते हैं। सी. सी. डी. एस. डेटा सेट के लिए यू. ओ. आर. एफ. का अस्तित्व एक और चुनौती है। अनुवाद की शुरुआत के लिए स्कैनिंग तंत्र से पता चलता है कि छोटी राइबोसोमल उप-इकाइयाँ (40S) एक नवजात एम. आर. एन. ए. प्रतिलेख के 5 'छोर पर बांधती हैं और पहले ए. यू. जी. प्रारंभ कोडन के लिए स्कैन करती हैं। यह संभव है कि एक यू. ए. यू. जी. को पहले मान्यता दी जाए, और फिर संबंधित यू. ओ. आर. एफ. का अनुवाद किया जाए। अनुवादित यूओआरएफ एन. एम. डी. उम्मीदवार हो सकता है, हालांकि अध्ययनों से पता चला है कि कुछ यूओआरएफ एन. एम. डी. से बच सकते हैं। एन. एम. डी. से बचने वाले यू. ओ. आर. एफ. के लिए औसत आकार सीमा लगभग 35 एमिनो एसिड है। यह भी सुझाव दिया गया है कि यू. ओ. आर. एफ. एक राइबोसोम दीक्षा परिसर को फंसाकर और प्रोटीन-कोडिंग क्षेत्रों तक पहुंचने से पहले राइबोसोम को एम. आर. एन. ए. प्रतिलेख से अलग करके डाउनस्ट्रीम जीन के अनुवाद को रोकते हैं। वर्तमान में, किसी भी अध्ययन ने अनुवाद संबंधी विनियमन पर यूओआरएफ के वैश्विक प्रभाव की सूचना नहीं दी है। वर्तमान सी. सी. डी. एस. एनोटेशन दिशानिर्देश यू. ओ. आर. एफ. युक्त एम. आर. एन. ए. प्रतिलेखों को शामिल करने की अनुमति देते हैं यदि वे निम्नलिखित दो जैविक आवश्यकताओं को पूरा करते हैंः एम. आर. एन. ए. प्रतिलेख में एक मजबूत कोज़ाक संकेत होता है; एम. आर. एन. ए. प्रतिलेख या तो 35 एमिनो एसिड होता है या प्राथमिक ओपन रीडिंग फ्रेम के साथ ओवरलैप होता है। रीड-थ्रू ट्रांसक्रिप्टः रीड-थ्रू ट्रांसक्रिप्ट को संयुग्मित जीन या सह-प्रतिलेखित जीन के रूप में भी जाना जाता है। रीड-थ्रू ट्रांसक्रिप्ट्स को दो या दो से अधिक अलग-अलग ज्ञात (भागीदार) जीनों में से प्रत्येक से एक एक्सॉन के कम से कम हिस्से के संयोजन के रूप में परिभाषित किया जाता है जो एक ही अभिविन्यास में एक ही गुणसूत्र पर स्थित होते हैं। रीड-थ्रू ट्रांसक्रिप्ट और उनके संबंधित प्रोटीन अणुओं का जैविक कार्य अज्ञात है। हालांकि, सी. सी. डी. एस. डेटा सेट में एक रीड-थ्रू जीन की परिभाषा यह है कि व्यक्तिगत साथी जीन अलग-अलग होने चाहिए, और रीड-थ्रू ट्रांसक्रिप्ट को प्रत्येक विशिष्ट छोटे स्थान के साथ 1 एक्सॉन (या साझा टर्मिनल एक्सॉन के मामले को छोड़कर 2 स्प्लाइस साइटों) को साझा करना चाहिए। निम्नलिखित परिस्थितियों में प्रतिलेखों को पढ़ने के माध्यम से प्रतिलेखों के रूप में नहीं माना जाता हैः जब प्रतिलेखों का उत्पादन अतिव्यापी जीन से किया जाता है, लेकिन वे समान विभाजन स्थलों को साझा नहीं करते हैं; जब प्रतिलेखों का अनुवाद उन जीनों से किया जाता है जिनमें एक दूसरे के सापेक्ष निहित संरचनाएं होती हैं। इस उदाहरण में, सी. सी. डी. एस. सहयोगियों और एच. जी. एन. सी. ने सहमति व्यक्त की है कि रीड-थ्रू ट्रांसक्रिप्ट को एक अलग स्थान के रूप में दर्शाया जाना चाहिए। संदर्भ जीनोम अनुक्रम की गुणवत्ताः जैसा कि सी. सी. डी. एस. डेटा सेट को मानव और चूहे के जीनोमिक एनोटेशन का प्रतिनिधित्व करने के लिए बनाया गया है, मानव और चूहे संदर्भ जीनोम अनुक्रमों के साथ गुणवत्ता की समस्याएं एक और चुनौती बन जाती हैं। गुणवत्ता संबंधी समस्याएं तब होती हैं जब संदर्भ जीनोम को गलत तरीके से इकट्ठा किया जाता है। इसके द्वारा गलत तरीके से इकट्ठा किए गए जीनोम में समय से पहले रुकने वाले कोडन, फ्रेम-शिफ्ट इंडेल्स या संभवतः बहुरूपी छद्मजन हो सकते हैं। एक बार इन गुणवत्ता समस्याओं की पहचान हो जाने के बाद, सी. सी. डी. एस. सहयोगी जीनोम संदर्भ संघ को मुद्दों की रिपोर्ट करते हैं, जो जांच करता है और आवश्यक सुधार करता है। सी. सी. डी. एस. डेटा तक पहुंच सी. सी. डी. एस. परियोजना एन. सी. बी. आई. सी. सी. डी. एस. डेटा सेट पृष्ठ (यहाँ) से उपलब्ध है, जो एफ़. टी. पी. डाउनलोड लिंक और सी. सी. डी. एस. अनुक्रमों और स्थानों के बारे में जानकारी प्राप्त करने के लिए एक प्रश्न इंटरफेस प्रदान करता है। सी. सी. डी. एस. रिपोर्ट को क्वेरी इंटरफेस का उपयोग करके प्राप्त किया जा सकता है, जो सी. सी. डी. एस. डेटा सेट पेज के शीर्ष पर स्थित है। उपयोगकर्ता विशिष्ट सी. सी. डी. एस. जानकारी खोजने के लिए विभिन्न प्रकार के पहचानकर्ताओं जैसे सी. सी. डी. एस. आई. डी., जीन आई. डी., जीन प्रतीक, न्यूक्लियोटाइड आई. डी. और प्रोटीन आई. डी. का चयन कर सकते हैं। सी. सी. डी. एस. रिपोर्ट (चित्र 1) को एक तालिका प्रारूप में प्रस्तुत किया जाता है, जो विशिष्ट संसाधनों के लिए लिंक प्रदान करता है, जैसे कि इतिहास रिपोर्ट, एंट्रेज़ जीन या सी. सी. डी. एस. डेटा सेट से पुनः पूछताछ। अनुक्रम पहचानकर्ता तालिका वी. ई. जी. ए., एनसेम्बल और ब्लिंक में प्रतिलेखन जानकारी प्रस्तुत करती है। गुणसूत्र स्थान तालिका में विशिष्ट कोडिंग अनुक्रम के प्रत्येक व्यक्तिगत एक्सॉन के लिए जीनोमिक निर्देशांक शामिल हैं। यह तालिका कई अलग-अलग जीनोम ब्राउज़रों के लिंक भी प्रदान करती है, जो आपको कोडिंग क्षेत्र की संरचना की कल्पना करने की अनुमति देती है। सटीक न्यूक्लियोटाइड अनुक्रम और विशिष्ट कोडिंग अनुक्रम के प्रोटीन अनुक्रम भी सी. सी. डी. एस. अनुक्रम डेटा के खंड में प्रदर्शित किए जाते हैं। वर्तमान अनुप्रयोग सी. सी. डी. एस. डेटासेट जी. ई. एन. सी. ओ. डी. ई. जीन एनोटेशन परियोजना का एक अभिन्न अंग है और इसका उपयोग विभिन्न शोध क्षेत्रों में उच्च गुणवत्ता वाली कोडिंग एक्सॉन परिभाषा के लिए एक मानक के रूप में किया जाता है, जिसमें नैदानिक अध्ययन, बड़े पैमाने पर एपिजेनोमिक अध्ययन, एक्सोम परियोजनाएं और एक्सॉन सरणी डिजाइन शामिल हैं। स्वतंत्र एनोटेशन समूहों द्वारा सी. सी. डी. एस. एक्सोन की सर्वसम्मत एनोटेशन के कारण, विशेष रूप से एक्सोम परियोजनाओं ने सी. सी. डी. एस. कोडिंग एक्सोन को डाउनस्ट्रीम अध्ययनों के लिए विश्वसनीय लक्ष्य माना है (जैसे, एकल न्यूक्लियोटाइड संस्करण का पता लगाने के लिए), और इन एक्सोन का उपयोग व्यावसायिक रूप से उपलब्ध एक्सोम किट में कोडिंग क्षेत्र लक्ष्यों के रूप में किया गया है। सी. सी. डी. एस. जारी करने का इतिहास सी. सी. डी. एस. डेटा सेट का आकार कम्प्यूटेशनल जीनोम एनोटेशन अपडेट दोनों के साथ बढ़ता रहा है, जो इंटरनेशनल न्यूक्लियोटाइड सीक्वेंस डेटाबेस कोलैबोरेशन (आई. एन. एस. डी. सी.) को प्रस्तुत किए गए नए डेटा सेट को एकीकृत करते हैं, और चल रही क्यूरेशन गतिविधियों पर जो उस एनोटेशन के पूरक या सुधार करते हैं। तालिका 2 प्रत्येक सी. सी. डी. एस. निर्माण के लिए प्रमुख आंकड़ों का सारांश देती है जहां सार्वजनिक सी. सी. डी. एस. आई. डी. वे सभी हैं जिनकी समीक्षा नहीं की गई थी या वर्तमान रिलीज की तारीख के समय अद्यतन या निकासी लंबित थी। रिलीज आंकड़ों का पूरा सेट आधिकारिक सी. सी. डी. एस. वेबसाइट पर उनके रिलीज और सांख्यिकी पृष्ठ पर पाया जा सकता है। भविष्य की संभावनाओं के दीर्घकालिक लक्ष्यों में उन विशेषताओं को जोड़ना शामिल है जो इंगित करते हैं कि ट्रांसक्रिप्ट एनोटेशन भी समान है (यू. टी. आर. सहित) और विभिन्न यू. टी. आर. के साथ स्प्लाइस संस्करणों को इंगित करने के लिए जिनके पास समान सी. सी. डी. एस. आई. डी. है। यह भी अनुमान लगाया जाता है कि जैसे-जैसे अन्य जीवों के लिए अधिक पूर्ण और उच्च गुणवत्ता वाले जीनोम अनुक्रम डेटा उपलब्ध होंगे, इन जीवों से एनोटेशन सी. सी. डी. एस. प्रतिनिधित्व के लिए गुंजाइश में हो सकते हैं। सी. सी. डी. एस. सेट अधिक पूर्ण हो जाएगा क्योंकि स्वतंत्र उपचार समूह उन मामलों पर सहमत होंगे जहां वे शुरू में भिन्न होते हैं, क्योंकि कमजोर रूप से समर्थित जीनों का अतिरिक्त प्रयोगात्मक सत्यापन होता है, और जैसे-जैसे स्वचालित एनोटेशन विधियों में सुधार होता रहता है। सी. सी. डी. एस. सहयोग करने वाले समूहों के बीच संचार जारी है और यह मतभेदों को हल करेगा और सी. सी. डी. एस. अद्यतन चक्रों के बीच परिष्करण की पहचान करेगा। मानव अद्यतन लगभग हर 6 महीने में होने की उम्मीद है और माउस सालाना जारी होता है। GENCODE ह्यूमन जीनोम माउस जीनोम इन्फॉर्मेटिक्स रेफसेक एन्सेम्बल संदर्भ बाहरी लिंक CCDS होम पेज बायोलॉजिकल डेटाबेस जेनेटिक इंजीनियरिंग इन द यूनाइटेड किंगडम जेनेटिक्स डेटाबेस कैम्ब्रिजशायर साउथ कैम्ब्रिजशायर डिस्ट्रिक्ट वेलकम ट्रस्ट में विज्ञान और प्रौद्योगिकी देखें।