MatrixDB
मैट्रिक्सडीबी एक जैविक डेटाबेस है जो बाह्य कोशिकीय प्रोटीन और पॉलीसेकेराइड्स के बीच आणविक अंतःक्रिया पर केंद्रित है। मैट्रिक्सडीबी बाह्य कोशिकीय प्रोटीनों की बहुआयामी प्रकृति को ध्यान में रखता है (उदाहरण के लिए, कोलेजन, लैमिनिन और थ्रोम्बोस्पॉन्डिन बहुआयामी हैं)। डेटाबेस को शुरू में 2009 में जारी किया गया था और इसका रखरखाव यू. एम. आर. 5246, क्लाउड बर्नार्ड विश्वविद्यालय ल्योन 1 में सिल्वी रिकार्ड-ब्लम के शोध समूह द्वारा किया जाता है। मैट्रिक्सडीबी यूनिजीन और ह्यूमन प्रोटीन एटलस से जुड़ा हुआ है। यह उपयोगकर्ताओं को अनुकूलित ऊतक-और रोग-विशिष्ट अंतःक्रिया नेटवर्क बनाने की भी अनुमति देता है, जिसका आगे साइटोस्केप या मेडुसा का उपयोग करके विश्लेषण और कल्पना की जा सकती है। मैट्रिक्सडीबी इंटरनैशनल मॉलिक्यूलर एक्सचेंज कंसोर्टियम (आई. एम. ई. एस.) का एक सक्रिय सदस्य है, जो इंटरैक्शन डेटा के प्रमुख सार्वजनिक प्रदाताओं का एक समूह है। अन्य भाग लेने वाले डेटाबेस में बायोमॉलिक्यूलर इंटरेक्शन नेटवर्क डेटाबेस (बी. आई. एन. डी.), इंटैक्ट, मॉलिक्यूलर इंटरेक्शन डेटाबेस (एम. आई. एन. टी.), एम. आई. पी. एस., एम. पी. ए. टी. और बायोग्रिड शामिल हैं। आई. एम. ई. एक्स. के डेटाबेस प्रयास के दोहराव को रोकने, गैर-अतिव्यापी स्रोतों से डेटा एकत्र करने और क्यूरेटेड इंटरैक्शन डेटा को साझा करने के लिए मिलकर काम करते हैं। आई. एम. ई. एक्स. संघ ने अंतःक्रिया डेटा की व्याख्या और आदान-प्रदान के लिए एच. यू. पी. ओ.-पी. एस. आई.-एम. आई. एक्स. एम. एल. मानक प्रारूप विकसित करने के लिए भी काम किया। मैट्रिक्सडीबी में हस्तचालित क्यूरेशन द्वारा साहित्य से निकाले गए अंतःक्रिया डेटा शामिल हैं और पी. एस. आई. सी. क्यू. यू. आई. सी. वेब सेवा के माध्यम से आई. एम. ई. एक्स. भागीदार डेटाबेस द्वारा प्रदान किए गए बाह्य कोशिकीय प्रोटीन से जुड़े प्रासंगिक डेटा के साथ-साथ मानव प्रोटीन संदर्भ डेटाबेस से डेटा तक पहुंच प्रदान करता है। संदर्भ बाहरी लिंक http://matrixdb.univ-lyon1.fr http://www.icbms.fr/aspe जैविक डेटाबेस पॉलीसेकेराइड्स