Hp53int1
मानव प्रोटीन 53 इंट्रॉन 1 (Hp53int1) मनुष्यों में Hp53int1 जीन द्वारा कूटबद्ध एक प्रोटीन है। जीन Hp53int1 जीन गुणसूत्र 17p.13 पर स्थित होता है, जो लंबाई में एक डीएनए अनुक्रम 1125 आधार जोड़े द्वारा कूटबद्ध होता है, जो क्षेत्र 7,685,260 bp-7,686,371 bp को कवर करता है। Hp53int1 जीन के दो उपनाम हैं, WRAP53int1 और TP53int1, गुणसूत्र 17 पर WRAP53 और TP53int1 जीन के साथ इसके ओवरलैप के अनुसार। Hp53int1, p53p2 प्रारंभ स्थल के नीचे की ओर स्थित है। Hp53int1 में कई एक्सॉन नहीं हैं, और इसलिए कोई आइसोफॉर्म नहीं है। TP53 के साथ महत्वपूर्ण संबंध Hp53int1 जीन को TP53 के समान दिशा में लिखा जाता है और यह TP53 प्रोटीन युक्त मायलोइड ल्यूकेमिया कोशिकाओं HL-60 और U937 में मौजूद होता है। यह टी. पी. 53 जीन और बाद के प्रोटीन के साथ एक मजबूत संबंध का सुझाव देता है, जिसमें प्रतिलेखन कारकों, प्रवर्तक संकेतों, ऊतक अभिव्यक्ति और उपकोशिकीय स्थानीयकरण का एक हिस्सा शामिल है। हालांकि ये जीन समान नहीं हैं, यह संबंध कार्य, संरचना और अभिव्यक्ति के लिए संकेत दे सकता है। एम. आर. एन. ए. प्रतिलेख एच. पी. 53इन्ट1 को लंबाई में 1125 आधार जोड़े के पॉलीएडेनाइलेटेड प्रतिलेख द्वारा कूटबद्ध किया जाता है। आधार जोड़े 633.926 और आधार जोड़े 496.1000 के बीच एक नियामक पॉली ए पूंछ अनुक्रम के बीच एक दोहराव अनुक्रम है। आधार जोड़े 633 और 926 के बीच दोहराव अनुक्रम अलू एससी उप-परिवार दोहराव के समान होने के लिए जाना जाता है, एक अनुक्रम जो मनुष्यों और नरवानरों में सबसे प्रचुर मात्रा में दोहराव अनुक्रमों की विशेषता है, और जो संभवतः लगभग 32 मिलियन साल पहले अन्य अलू उप-परिवार परिसरों से अलग हो गया था। प्रवर्तक अनुक्रम एचपी53इन्ट1 जीन के प्रवर्तक अनुक्रम को लंबाई में 540 आधार जोड़े दिखाया गया था। प्रतिलेखन कारकों एस. एम. ए. डी. 2, एस. आर. वाई. और ई. टी. वी. 7 में मूल रूप से संरक्षण अंक क्रमशः 2.99,2.73 और 3.03 थे, जिसमें 4 का मान उच्चतम संरक्षण और-0.5 सबसे कम का संकेत देता है। के. एल. एफ. 2 और के. एल. एफ. 5 का स्कोर 3.73 था। जिन प्रजातियों की तुलना की जा रही थी उनमें हाथी, कुत्ता, रीसस मकाक और मुर्गी शामिल थे। प्रोटीन Hp53int1 प्रोटीन का आणविक भार 13.3 kdal है और इसकी लंबाई 118 अमीनो एसिड है। यह एक बुनियादी प्रोटीन है। 102-110 के बीच एक अत्यधिक संरक्षित अमीनो एसिड अनुक्रम है। सेरीन साइट का वितरण आर्जिनिन और टायरोसिन साइटों की तुलना में काफी अधिक है। अमीनो एसिड 22-25 के बीच एक संभावित कैसिइन किनेज II फॉस्फोराइलेशन साइट है। कैसिइन किनेज II फॉस्फोराइलेशन कोशिका प्रसार में शामिल है। एचपी53इन्ट1 प्रोटीन के लिए विकार के तीन क्षेत्रों की भविष्यवाणी की गई है। पोस्ट ट्रांसलेशनल मॉडिफिकेशन अमीनो एसिड 14-20 के बीच एक संभावित O-β-GlcNAc साइट है। न तो कोई ट्रांसमेम्ब्रेन डोमेन हैं और न ही सिग्नल पेप्टाइड्स। एस5, एस15 और एस20 में एक संरक्षित फॉस्फोराइलेशन स्थल है। संरचना द्वितीयक एचपी53इन्ट1 प्रोटीन में एक अल्फा हेलिक्स और पाँच बीटा शीट्स होने की भविष्यवाणी की गई है। आठ संभावित प्रोटीन बाइंडिंग साइट हैं। तृतीयक उपकोशिकीय स्थानीयकरण एक 56.5% संभावना है कि Hp53int1 प्रोटीन कोशिका द्रव्य के भीतर स्थानीयकृत है। ऊतक अभिव्यक्ति एचपी53इन्ट1 जीन के लिए कम ऊतक विशिष्टता है। वयस्क मानव ऊतकों के विभिन्न नमूनों की तुलना करते समय थाइमस, अंडाशय, लिम्फ नोड्स और श्वेत रक्त कोशिकाओं में उच्च अभिव्यक्ति होती है। समीपस्थ पाचन तंत्र, गैस्ट्रोइंटेस्टाइनल ट्रैक्ट और पुरुष/महिला ऊतकों में आर. एन. ए. अभिव्यक्ति और प्रोटीन अभिव्यक्ति दोनों के लिए एक उच्च अभिव्यक्ति स्कोर था। सप्ताह 10 और 16 के बीच भ्रूण के विकास के दौरान, फेफड़ों और हृदय के ऊतकों में उच्च अभिव्यक्ति होती है। Hp53int1 को अलग-अलग स्थितियों में व्यक्त किया जाता है जिसमें कोशिका प्रसार या एपोप्टोसिस की आवश्यकता होती है, TP53 ट्यूमर सप्रेसर जीन होमोलॉजी और इवोल्यूशन पैरालॉग के साथ इसके अनुरूपता के अनुसार Hp53int1 जीन में कोई पैरालॉग नहीं पाया गया था। ऑर्थोलॉग एन. सी. बी. आई. ब्लास्ट अनुक्रम विश्लेषण और क्लस्टल डब्ल्यू का उपयोग करते हुए एच. पी. 53इंट1 और बीस शीर्ष ब्लास्ट हिट के लिए एक बहु अनुक्रम संरेखण तैयार किया गया था। जबकि इस शोध का उद्देश्य विभिन्न प्रकार के स्तनधारियों, कशेरुकी और अकशेरुकी जीवों में कई ऑर्थोलॉग खोजना था, केवल दो वर्गों में परिणाम थेः प्राइमेट और बैक्टीरिया। इसके अलावा, Hp53int1 के भीतर केवल एक एमिनो एसिड अनुक्रम था और लंबाई में सामान्य 20 एमिनो एसिड के इसके ऑर्थोलॉग थे जो सीधे संरेखित थे)। प्राइमेट जीन गुणसूत्र 13 पर स्थित होते हैं जबकि Hp53int1 गुणसूत्र 17 पर स्थित होता है। परमाणु लिफाफे के भीतर प्राइमेट प्रोटीन के उपकोशिकीय स्थानीयकरण के लिए भी सबूत हैं, जबकि Hp53int1 के लिए सबूत बताते हैं कि यह कोशिका द्रव्य में है। इस प्रकार, यह मान लेना उचित है कि नरवानर सख्त ऑर्थोलॉग नहीं हैं। सख्त Hp53int1 संरेखण केवल बैक्टीरिया में ही क्यों पाए जाते हैं, इसका एक संभावित स्पष्टीकरण बैक्टीरिया और प्राइमेट्स के एक सामान्य पूर्वज के बीच साझा की गई घटना पर एक संभावित पारगमन है। Hp53int1 प्रोटीन संभवतः कोशिकीय प्रसार और एपोप्टोसिस के विनियमन में शामिल है। यह एपोप्टोसिस-रेगुलेटर और सर्वव्यापी रेगुलेटर इंटरैक्टिंग प्रोटीन के उपयोग, टी. पी. 53 (विशेष रूप से एस. एम. ए. डी. 2, एस. आर. वाई. और ई. टी. वी. 7 ट्रांसक्रिप्शन कारकों) के साथ प्रतिलेखन कारकों की इसकी हिस्सेदारी, पी. 53 पी. 2 प्रारंभ स्थल के नीचे की ओर इसका स्थान, इसके कैसिइन किनेज़ II फॉस्फोराइलेशन साइट और ऊतकों में इसकी सर्वव्यापी अभिव्यक्ति द्वारा इंगित किया जाता है। Hp53int1 जीन अभिव्यक्ति वातावरण में तब बढ़ती है जब कोशिका प्रसार को कम करने वाले प्रोटीन अत्यधिक अभिव्यक्त होते हैं, जो सेलुलर वातावरण में इसकी आवश्यकता का सुझाव देते हैं जिन्हें कोशिका विकास को रोकने की आवश्यकता होती है। इसके अलावा, मात्रात्मक विश्लेषण से पता चलता है कि डी. एन. ए. क्षति के लिए कोशिकीय प्रतिक्रिया के सक्रियण के लिए सामान्य एच. पी. 53 प्रोटीन बिल्कुल आवश्यक है। अंतःक्रियाशील प्रोटीन TP53 के लिए निम्नलिखित अंतःक्रियाशील प्रोटीन पाए गए थे, लेकिन उनके गुणसूत्र संबंध के कारण Hp53int1 पर लागू किया जा सकता है। ध्यान देने योग्य महत्वपूर्णः इन अंतःक्रियाशील प्रोटीनों के कार्य सीधे कोशिका विनियमन (सर्वव्यापी, प्रतिलेखन नियामक, एपोप्टोसिस और प्रोटीन-टायरोसिन किनेज) में शामिल होते हैं। एस. एन. पी. एच. पी. 53इन्ट1 के लिए दो चिन्हित एस. एन. पी. एस हैं। एसएनपी 15 टीपी53 प्रवर्तक के सबसे बड़े ओआरएफ के ऊपर की ओर स्थित 43 अवशेषों के क्रम में 32वें स्थान पर आता है। एस. एन. पी. 20 तब 1125 बी. पी. सी. डी. एन. ए. (एच. पी. 53इन्ट1) के 3 'छोर के 45 बी. पी. डाउनस्ट्रीम में स्थित है। नैदानिक महत्व इस बात के प्रमाण हैं कि एचपी53इन्ट1 जीन ट्यूमर दमन में शामिल है। Hp53int1 TP53 एक्सॉन 1 (TAD1) के साथ ओवरलैप करता है। इस क्षेत्र के भीतर उत्परिवर्तन के परिणामस्वरूप वैकल्पिक एक्सॉन अभिव्यक्ति या अपूर्ण विभाजन और ट्यूमर सप्रेसर फ़ंक्शन का नुकसान हो सकता है। ऑस्टियोसारकोमा के संबंध में, टी. पी. 53 के अपूर्ण विभाजन से जुड़े मामलों में टी. ए. डी. 1 के भीतर इन पुनर्व्यवस्थाओं का पता चला है। ये पुनर्व्यवस्थाएँ TP53 इंट्रॉन 1 के पूर्ण अनुक्रम में स्थित हैं, लेकिन उनमें से अधिकांश Hp53int1 प्रतिलेख के एक क्षेत्र में क्लस्टर होंगे, यह सुझाव देते हुए कि इन पुनर्व्यवस्थाओं को इस स्थान के भीतर क्रोमैटिन संरचना द्वारा सुगम बनाया जा सकता है।