Ecology of the San Francisco Estuary
सैक्रामेंटो-सैन जोकिन नदी डेल्टा के साथ सैन फ्रांसिस्को मुहाना एक अत्यधिक परिवर्तित पारिस्थितिकी तंत्र का प्रतिनिधित्व करता है। इस क्षेत्र को जल वितरण, नौवहन, कृषि और हाल ही में, उपनगरीय विकास की जरूरतों को पूरा करने के लिए भारी रूप से फिर से तैयार किया गया है। इन जरूरतों ने पानी की आवाजाही और परिदृश्य की प्रकृति में प्रत्यक्ष परिवर्तन किए हैं, और गैर-देशी प्रजातियों की शुरुआत से अप्रत्यक्ष परिवर्तन हुए हैं। नई प्रजातियों ने खाद्य जाल की वास्तुकला को निश्चित रूप से बदल दिया है क्योंकि तटबंधों ने द्वीपों और चैनलों के परिदृश्य को बदल दिया है जो डेल्टा के रूप में जानी जाने वाली जटिल प्रणाली बनाते हैं। यह लेख विशेष रूप से ज्वारनदमुख के निम्न लवणता क्षेत्र (एलएसजेड) की पारिस्थितिकी से संबंधित है। एल. एस. जेड. के लिए एक ऐतिहासिक खाद्य जाल का पुनर्निर्माण कई कारणों से कठिन है। सबसे पहले, उन प्रजातियों का कोई स्पष्ट रिकॉर्ड नहीं है जिन्होंने ऐतिहासिक रूप से मुहाने पर कब्जा कर लिया है। दूसरा, सैन फ्रांसिस्को मुहाना और डेल्टा अपने 10,000 साल के अधिकांश इतिहास के लिए भूवैज्ञानिक और जलवैज्ञानिक संक्रमण में रहे हैं, और इसलिए मुहाना की "प्राकृतिक" स्थिति का वर्णन करना "एक गतिशील लक्ष्य को मारने" के समान है। जलवायु परिवर्तन, हाइड्रोलॉजिकल इंजीनियरिंग, पानी की जरूरतों को बदलना और नई शुरू की गई प्रजातियां मुहाने के खाद्य जाल विन्यास को बदलना जारी रखेंगी। यह मॉडल हाल के परिवर्तनों या प्रजातियों के परिचय के बारे में टिप्पणियों के साथ वर्तमान स्थिति का एक स्नैपशॉट प्रदान करता है, जिन्होंने खाद्य वेब के विन्यास को बदल दिया है। वर्तमान खाद्य जाल की गतिशीलता को समझना मुहाने की कार्यप्रणाली और प्रजातियों की विविधता में सुधार के लिए बहाली के प्रयासों के लिए उपयोगी साबित हो सकता है। भौतिक भूगोल सैन फ्रांसिस्को खाड़ी एक खाड़ी और एक ज्वारनदमुख दोनों है। पूर्व शब्द खुले महासागर से भौतिक शरण प्रदान करने वाले किसी भी इनलेट या कोव को संदर्भित करता है। एक ज्वारनदमुख कोई भी भौतिक विशेषता है जहां ताजा पानी एक महासागर या समुद्र से मिलता है। खाड़ी का उत्तरी भाग एक खारा मुहाना है, जिसमें कई भौतिक तटबंध हैं जिनमें समुद्री और ताजे पानी के प्रवाह दोनों का प्रभुत्व है। ये भौगोलिक अस्तित्व खारे से ताजा (या पश्चिम से पूर्व) की ओर बढ़ रहे हैंः सैन पाब्लो खाड़ी, मध्य खाड़ी के तुरंत उत्तर में; कारक्विनेज़ जलडमरूमध्य, एक संकीर्ण, गहरा चैनल जो सुइसुन खाड़ी की ओर जाता है; और सैक्रामेंटो और सैन जोकिन नदियों का डेल्टा। 20वीं शताब्दी तक, ज्वारनदमुख का एलएसजेड ट्यूल-प्रधान ताजे पानी की आर्द्रभूमि से घिरा हुआ था। खाड़ी क्षेत्र के आसपास भूमि उपयोग और विकास को सुविधाजनक बनाने के लिए इन ऐतिहासिक आर्द्रभूमि में से 80 से 95 प्रतिशत को भर दिया गया है। ऐसा माना जाता है कि पेलैजिक क्षेत्र के किनारों पर निवास स्थान के नुकसान से देशी पेलैजिक मछली प्रजातियों का नुकसान होता है, जिससे शिकार की संवेदनशीलता बढ़ जाती है। वर्तमान में ज्वारीय और बेंथिक मुहाने पर मिट्टी के मैदानों का प्रभुत्व है जो काफी हद तक 19वीं शताब्दी के अंत में सिएरा नेवादा में सोने के खनन से प्राप्त अवसादन का परिणाम हैं। 1950 के दशक में सेंट्रल वैली प्रोजेक्ट के आगमन के साथ उच्च तलछट भार की प्रवृत्ति उलट गई, जिससे बांधों के पीछे अधिकांश तलछट बंद हो गई, और इसके परिणामस्वरूप ज्वारनदमुख से तलछट का वार्षिक शुद्ध नुकसान हुआ। इस प्रकार मिट्टी के मैदान धीरे-धीरे कम होते दिखाई देते हैं, हालांकि मैलापन बहुत अधिक रहता है। पानी की उच्च मैलापन सैन फ्रांसिस्को मुहाने में मौजूद अनूठी स्थिति के लिए जिम्मेदार है जिसमें उच्च पोषक तत्वों की उपलब्धता से उच्च फाइटोप्लांकटन उत्पादन नहीं होता है। इसके बजाय, अधिकांश शैवाल प्रकाश संश्लेषक जीव प्रकाश-सीमित होते हैं। डेल्टा में भी इसी तरह भारी परिवर्तन हुआ है। 19वीं शताब्दी की शुरुआत में, कृषि भूमि को नियमित बाढ़ से बचाने के लिए प्राकृतिक रूप से पाए जाने वाले तटबंधों को स्थायी रूप से मजबूत किया गया था। इनमें से कई फार्म डेल्टा जलमार्ग के बीच में स्थित पीट द्वीपों पर स्थापित किए गए थे। गहन खेती ने मिट्टी की उच्च कार्बन सामग्री को ऑक्सीकृत कर दिया, जिससे मिट्टी के द्रव्यमान का काफी नुकसान हुआ। नतीजतन, ये द्वीप समुद्र तल से लगभग 6 मीटर नीचे कम हो गए हैं या डूब गए हैं। डेल्टा में आज अत्यधिक पके हुए जलमार्ग हैं, जो द्वीपों द्वारा विरामित हैं जो पानी की सतह के बहुत नीचे अपने बेसिन के साथ "तैरते हुए कटोरे" की तरह दिखाई देते हैं। तटबंध गिरने के कारण इन द्वीपों पर बाढ़ का खतरा अधिक है। लवणता में बाद में पूर्व की ओर बदलाव से सैन फ्रांसिस्को मुहाने के पूरे एलएसजेड की पारिस्थितिकी में नाटकीय रूप से बदलाव आने की उम्मीद है। हाइड्रोडायनामिक्स एल. एस. जेड. 2 पी. एस. यू. (व्यावहारिक लवणता इकाइयाँ, लवणता का एक माप) के आसपास केंद्रित है और लगभग 6 पी. एस. यू. से लेकर 0.5 पी. एस. यू. तक होता है। मुहाने के लिए प्राथमिक ताजे पानी का निवेश क्षेत्रीय वर्षा, सैक्रामेंटो नदी और सैन जोकिन नदी के बहाव से प्राप्त होता है। नदी का प्रवाह काफी हद तक ऊपर की ओर जलाशयों को छोड़ने से नियंत्रित होता है। इस प्रवाह का एक महत्वपूर्ण हिस्सा संघीय केंद्रीय घाटी परियोजना और राज्य जल परियोजना द्वारा कृषि और शहरी उपयोग के लिए दक्षिणी कैलिफोर्निया को डेल्टा से निर्यात किया जाता है। इन परिवर्तनों ने नदी के माध्यम से बहिर्वाह में बहुत अधिक भिन्नता को हटा दिया है (यानी, ताजा पानी जो इसे गोल्डन गेट बनाता है), सर्दियों में कम बहिर्वाह और गर्मियों में उच्च बहिर्वाह पैदा करता है जो ऐतिहासिक रूप से नदी के मुहाने में पाया जाता है। औसतन, नदीमुख में मीठे पानी का प्रवाह ऐतिहासिक प्रवाह का 50 प्रतिशत है। फाइटोप्लांकटन, ज़ूप्लांकटन, और लार्वा और वयस्क मछलियाँ निर्यात पंपों में प्रवेश कर सकती हैं, जिससे इन जीवों की प्रचुरता पर संभावित रूप से महत्वपूर्ण लेकिन अज्ञात प्रभाव पड़ता है। यह विशेष रूप से लुप्तप्राय डेल्टा स्मेल्ट के बारे में सच हो सकता है, एक छोटी स्थानिक मछली; असाधारण सिवाय इसके कि इसे ऐतिहासिक विवरणों में अत्यधिक प्रचुर मात्रा में होने के रूप में वर्णित किया गया है। ऐसा माना जाता है कि डेल्टा स्मेल्ट गर्मियों की शुरुआत में डेल्टा में ऊपर की ओर पलायन करता है और पनपता है, जिससे इसके अंडे और लार्वा प्रवेश के लिए उच्च जोखिम में होते हैं। गलाने के लिए प्रबंधन वर्तमान में विवाद का स्रोत है क्योंकि इसकी पारिस्थितिकी कैलिफोर्निया में संरक्षण, विकास और कृषि की असमान जल आवश्यकताओं को टकराव के रास्ते में लाती है। मुहाने से पानी की आवाजाही जटिल है और कई कारकों पर निर्भर करती है। ज्वारीय चक्रों के कारण पानी 24 घंटे की अवधि में चार बार गोल्डन गेट की ओर और उससे दूर जाता है। निम्न लवणता क्षेत्र के लिए एक मार्कर के रूप में 2 पी. एस. यू. का उपयोग करते हुए, उतार-चढ़ाव की दिशा और परिमाण को गोल्डन गेट, या एक्स 2 से किलोमीटर में इसकी दूरी के रूप में ट्रैक किया जा सकता है। क्योंकि एक्स2 की स्थिति प्रवाह, निर्यात और ज्वार सहित कई भौतिक मापदंडों पर निर्भर करती है, इसकी स्थिति दैनिक और मौसमी चक्र पर कई किलोमीटर से अधिक बदल जाती है; एक वर्ष के दौरान, यह उच्च प्रवाह अवधि के दौरान सैन पाब्लो खाड़ी से गर्मियों के सूखे के दौरान डेल्टा तक हो सकती है। एक्स2 की स्थिति की सावधानीपूर्वक निगरानी की जाती है और निर्यात मांग की प्रत्याशा में ऊपर के जलाशयों से पानी छोड़ा जाता है। यह राज्य जल बोर्ड के निर्णय 1641 द्वारा अनिवार्य है और इसके लिए आवश्यक है कि यदि X2 को फरवरी से मई के महीनों के दौरान चिप्स द्वीप (गोल्डन गेट ब्रिज के 75 नदी किलोमीटर ऊपर की ओर) के पूर्व में या कोलिन्सविले के पूर्व में (गोल्डन गेट ब्रिज के 81 नदी किलोमीटर ऊपर की ओर) जनवरी, जून, जुलाई और अगस्त के महीनों के दौरान स्थानांतरित किया जाता है तो राज्य और संघीय पंपिंग को कम किया जाए। (डी-1641 पीपी 150) गुरुत्वाकर्षण परिसंचरण गहराई पर स्तरीकृत उच्च लवणता वाले पानी को भूमि की ओर बहने का कारण बनता है जबकि शीर्ष पर कम लवणता वाला पानी समुद्र की ओर बहता है। गुरुत्वाकर्षण परिसंचरण का प्रभाव उच्च ताजे पानी के प्रवाह की अवधि के दौरान सबसे अधिक स्पष्ट हो सकता है, जो नमक क्षेत्र को बनाए रखने और मुहाने में श्रोणि जीवों के वितरण के लिए एक नकारात्मक प्रतिक्रिया प्रदान करता है। गुरुत्वाकर्षण परिसंचरण के भूमि की ओर किनारे पर मिश्रण महत्वपूर्ण है, अक्सर एक्स 2 के आसपास, जहां पानी का स्तंभ कम स्तरीकृत हो जाता है। कारक्विनेज़ जलडमरूमध्य के पूर्वी छोर पर "बेनिसिया बम्प" पर एक निश्चित मिश्रण क्षेत्र होता है, जहाँ गहरा चैनल नाटकीय रूप से उथला हो जाता है क्योंकि यह सुइसुन खाड़ी में प्रवेश करता है। लवणता बनाए रखने के लिए मिश्रण महत्वपूर्ण है जैसे कि पश्चिम की ओर X2 को थोड़ी दूरी पर ले जाने के लिए ताजे पानी के अत्यधिक बड़े निवेश की आवश्यकता होती है। मिश्रण पेलाजिक जीवों को ज्वारनदमुख में स्थिति बनाए रखने में भी सहायता करता है, जिससे प्रणाली से प्राथमिक और माध्यमिक उत्पादन के विकास को धीमा किया जाता है। पेलाजिक ज़ोन पेलाजिक जीव अपने जीवन का पूरा या कुछ हिस्सा खुले पानी में बिताते हैं, जहाँ निवास को किनारों से नहीं बल्कि लवणता और तापमान के प्रति शारीरिक सहिष्णुता द्वारा परिभाषित किया जाता है। सैन फ्रांसिस्को मुहाने का निम्न लवणता क्षेत्र (एल. एस. जेड.) उन जीवों के समूह के लिए एक निवास स्थान है जो स्थलीय, ताजे पानी और समुद्री प्रभावों के इस अद्वितीय संगम में जीवित रहने के लिए विशिष्ट हैं। जबकि अलग-अलग पारिस्थितिकी वाले कई आवास हैं जो ज्वारनदमुख का हिस्सा हैं (समुद्री, ताजे पानी, अंतर-ज्वारीय दलदल और बेंथिक मडफ़्लैट प्रणालियों सहित) प्रत्येक एलएसजेड से ताजे पानी, पोषक तत्वों, कार्बन और जीवों के निर्यात और आयात द्वारा जुड़ा हुआ है। एल. एस. जेड. में जीवों का वितरण और प्रचुरता अजैविक और जैविक दोनों कारकों पर निर्भर है। अजैविक कारकों में मुहाने का भौतिक भूगोल और जलविज्ञान शामिल है, जिसमें पोषक तत्वों के निवेश, तलछट का भार, अशांति, पर्यावरणीय यादृच्छिकता, जलवायु और मानवजनित प्रभाव शामिल हैं। अजैविक कारक ज्वारीय वातावरण में उत्पादन को बढ़ावा देते हैं, और जैविक कारकों द्वारा मध्यस्थता की जाती है। जैविक कारकों में पोषक तत्वों का सेवन और प्राथमिक उत्पादन, ज़ूप्लैंक्टन का द्वितीयक उत्पादन, खाद्य जाल और पोषण संबंधी गतिशीलता, ऊर्जावान हस्तांतरण, प्रणाली के अंदर और बाहर विकास और फैलाव, जीवित रहने और मृत्यु दर, शिकार और शुरू की गई प्रजातियों से प्रतिस्पर्धा शामिल हैं। पिछली शताब्दी में हुए भूगोल, जल विज्ञान और प्रजातियों की संरचना में नाटकीय परिवर्तनों के कारण सैन फ्रांसिस्को मुहाने के ऐतिहासिक खाद्य जाल को चिह्नित करना मुश्किल है। हालाँकि, 1970 के दशक में शुरू की गई निगरानी खाद्य वेब की ऐतिहासिक गतिशीलता के बारे में कुछ जानकारी देती है। 1980 के दशक से पहले एल. एस. जेड. में एक फाइटोप्लांकटन-संचालित खाद्य जाल का प्रभुत्व था, एक स्थिर मेसोप्लांकटन आबादी जिसमें कॉपपोड यूरीटेमोरा अफिनिस का प्रभुत्व था, और सैन फ्रांसिस्को बे झींगा और माइसिड झींगा द्वारा विशिष्ट बड़े मैक्रोज़ोप्लांकटन थे। ये उत्तरी एंकोवी (एंग्रोलिस मोर्डैक्स) जैसे देशी फिल्टर फीडरों और डेल्टा स्मेल्ट और किशोर सैल्मन जैसे प्लैंकटिवोरों को पोषण और ऊर्जा प्रदान करते हैं। खाद्य वेब परिवर्तन ऐतिहासिक रूप से बढ़ी हुई अशांति द्वारा संचालित किया गया है, और हाल ही में पेश की गई प्रजातियों द्वारा, जैसा कि प्राथमिक और माध्यमिक उत्पादन पर अनुभागों में वर्णित है। विशेष रूप से, शुरू की गई अमूर नदी क्लैम पोटामोकॉर्बुला एम्यूरेन्सिस आबादी की उच्च निकासी दर ने प्लैंकटन घनत्व में दस गुना गिरावट पैदा की है, जिसके परिणामस्वरूप बेंथोस में कार्बन ट्रैप हो गया है और अपशिष्ट अपशिष्ट उत्पादन में अनुमानित वृद्धि हुई है। इस अपशिष्ट की परिकल्पना सूक्ष्मजीव लूप को ईंधन देने के लिए की जाती है, जिसके परिणामस्वरूप कोपेपोड लिम्नोइथोना टेट्रास्पिना जैसे सूक्ष्मजीवों में वृद्धि होती है, जो रोटिफर्स और सिलियेट्स का उपयोग करते हैं। ये परिवर्तन मछली के भंडार में गिरावट का एक कारण हैं। उदाहरण के लिए, उत्तरी एंकोवी, एंग्रोलिस मोर्डैक्स, 1980 के दशक तक निम्न लवणता क्षेत्र में काफी प्रचुर मात्रा में था, जब तक कि मुहाने में इसकी सीमा मध्य और दक्षिण खाड़ी तक ही सीमित नहीं हो गई। यह संभवतः अमूर नदी (पोटामोकॉर्बुला एम्यूरेन्सिस) क्लैम की शुरुआत और प्लैंकटन की उपलब्धता में गिरावट के बाद एक व्यवहार प्रतिक्रिया के कारण है। हाल ही में, एक सामान्य पेलाजिक जीव गिरावट (पी. ओ. डी.) का वर्णन किया गया था, और यह वैज्ञानिक, प्रबंधकीय और राजनीतिक समुदायों के भीतर बहुत चिंता का कारण रहा है। डेल्टा स्मेल्ट, लॉन्गफिन स्मेल्ट, धारीदार बास और थ्रेडफिन शैड सहित कई प्रमुख प्रजातियों को 2001 में शुरू होने वाली प्रचुरता में चरणबद्ध गिरावट के कारण "रुचि की प्रजाति" घोषित किया गया है। इसमें माध्यमिक उत्पादकता में इसी तरह की गिरावट देखी गई और वर्तमान में यह बहुत सारे शोध का स्रोत है। पी. ओ. डी. की व्याख्या करने के लिए कई परिकल्पनाएँ प्रस्तावित की गई हैं, जिनमें खाद्य जाल में गिरावट, डेल्टा से जल निर्यात और शहरी, औद्योगिक या कृषि स्रोतों से विषाक्त पदार्थ शामिल हैं। उत्पादक प्राथमिक उत्पादन और पोषक तत्व ग्रहण फाइटोप्लांकटन द्वारा प्राथमिक उत्पादन प्रकाश संश्लेषण के माध्यम से ऊर्जा और प्रमुख पोषक तत्वों को जैविक रूप से उपलब्ध रूप (यानी भोजन) में स्थिर करता है। फाइटोप्लांकटन का उत्पादन काफी हद तक भौतिक मापदंडों द्वारा संरचित किया जाता हैः पोषक तत्वों की उपलब्धता, सूर्य की रोशनी, अशांति और तापमान। सैन फ्रांसिस्को मुहाने में पोषक तत्वों के कई स्रोत हैं जिनका उपयोग प्राथमिक उत्पादन के लिए किया जा सकता है, जो बड़े पैमाने पर अपशिष्ट जल उपचार सुविधाओं, कृषि और शहरी जल निकासी और समुद्र से प्राप्त होते हैं। इसके बावजूद, मुहाना अद्वितीय है क्योंकि इसमें प्राथमिक उत्पादन की अपेक्षाकृत कम दर होती है। यह संभवतः दो कारकों के कारण हैः अमोनियम के रूप में नाइट्रोजन का बड़ा निवेश, जो फाइटोप्लांकटन द्वारा नाइट्रेट ग्रहण को दबाता है, जो चयापचय की दृष्टि से सस्ता NH4 + पसंद करता है, और उच्च मैलापन, जो प्रकाश संश्लेषण के लिए आवश्यक प्रकाश को पानी के स्तंभ के शीर्ष कुछ सेंटीमीटर तक सीमित करता है। यह अशांति 1850 के दशक में सिएरा नेवादा में हाइड्रोलिक सोने के खनन की विरासत है। ज्वारनदमुख में पानी का उच्च निवास समय फाइटोप्लांकटन बायोमास को जमा करने की अनुमति देता है, जिससे घनत्व बढ़ता है, जबकि कम निवास समय ज्वारनदमुख से फाइटोप्लांकटन को हटा देता है। उत्तरार्द्ध उच्च प्रवाह की अवधि के दौरान मुहाने के मुख्य चैनलों की विशिष्टता है, जब सतह का पानी कणों और प्लैंकटन को नीचे की ओर बहाता है। जड़ी-बूटी जल स्तंभ से फाइटोप्लांकटन को भी हटा देती है। जबकि पेलाजिक खाद्य जाल फाइटोप्लांकटन उत्पादन पर आधारित है, इस उत्पादन का अधिकांश हिस्सा शुरू किए गए अमूर नदी क्लैम (कॉर्बुला एम्यूरेन्सिस) द्वारा शिकार के माध्यम से बेंथोस की ओर मोड़ दिया जाता है। 1980 के दशक के मध्य में सी. एम्यूरेन्सिस की व्यापक शुरुआत के बाद फाइटोप्लांकटन बायोमास के स्तर में परिमाण के एक क्रम से गिरावट आई है, और वे फिर से नहीं बढ़े हैं। प्रकाशसंश्लेषक उत्पादन प्रकाशसंश्लेषक रूप से प्राप्त ऊर्जा का मुख्य स्रोत फाइटोप्लांकटन है। आम तौर पर, डायटम और माइक्रोफ्लेजेलेट्स ज्वारनदमुख में अधिकांश जैव उपलब्ध कार्बन का उत्पादन करते हैं। अन्य प्रकार, विशेष रूप से डिनोफ्लेजेलेट्स, हानिकारक शैवाल खिल सकते हैं, या लाल ज्वार पैदा कर सकते हैं, जो खाद्य जाल में आत्मसात करने के लिए कम आसानी से उपलब्ध हैं। फाइटोप्लांकटन से प्राथमिक उत्पादन दो अलग-अलग कारकों का एक कार्य हैः वृद्धि दर और संचय (चित्र। 1)। हालांकि एलएसजेड शहरी और कृषि स्रोतों से पोषक तत्वों की उच्च सांद्रता के लिए एक सिंक है, फाइटोप्लांकटन उत्पादन दर काफी कम है। नाइट्रेट का विकास के लिए फाइटोप्लांकटन द्वारा इष्टतम रूप से उपयोग किया जाता है, लेकिन अमोनियम (बड़े पैमाने पर सीवेज बहिर्वाह से प्राप्त) का विकास दर पर एक दमनकारी प्रभाव पड़ता है। इस प्रकार, पोषक तत्व-सीमित नहीं होने के बावजूद, फाइटोप्लांकटन नाइट्रोजन के प्रकारों के कारण अधिक धीरे-धीरे बढ़ता है। विकास दर पर एक अन्य दमनकारी कारक मुहाने की उच्च अशांति है, जो प्रकाश संश्लेषित रूप से सक्रिय विकिरण (पी. ए. आर.) की क्षमता को जल स्तंभ के शीर्ष कुछ सेंटीमीटर से परे प्रवेश करने के लिए सीमित करता है। यह फाइटोप्लांकटन प्रकाश संश्लेषण को अपेक्षाकृत उथले फोटिक क्षेत्र तक सीमित करता है। इस प्रकार, जब पानी के स्तंभ को स्तरीकृत किया जाता है, तो मैलापन अधिक होता है, और अमोनियम मौजूद होता है, आमतौर पर फाइटोप्लांकटन की वृद्धि दर को दबा दिया जाता है। फाइटोप्लांकटन का संचय मुख्य रूप से निवास समय का परिणाम है। उत्तरी डेल्टा और सुइसुन खाड़ी में अपेक्षाकृत कम निवास समय है क्योंकि इस क्षेत्र से बहने वाले पानी की उच्च मात्रा डाउनस्ट्रीम प्रवाह और दक्षिणी कैलिफोर्निया को निर्यात के लिए है। चूँकि पानी प्रणाली के इस हिस्से से अधिक तेजी से गुजरता है, इसलिए संचय की दर कम हो जाती है क्योंकि उत्पादकता प्रणाली से बाहर निकल जाती है। इसके विपरीत, दक्षिणी डेल्टा के कुछ हिस्सों में प्रणाली के माध्यम से पानी की कम मात्रा के कारण निवास का समय अधिक होता है; वास्तव में सैन जोकिन नदी से प्रवाह की कमी और निर्यात पंपिंग के कारण पानी कभी-कभी पीछे की ओर बहता है। गर्मियों के दौरान, ज्वारनदमुख के अन्य हिस्सों की तुलना में यहाँ फाइटोप्लांकटन घनत्व अधिक हो सकता है। डिनोफ्लेजेलेट्स या साइनोबैक्टीरियाक हानिकारक शैवाल खिलनाइ (एच. ए. बी.) विषाक्त चयापचय उपोत्पाद उत्पन्न करैत अछि जे ओकरा कतेको जीवसभक लेल हानिकारक बना दैत अछि। उच्च पोषक तत्वों की सांद्रता और तापमान के संयोजन से प्रोत्साहित, एच. ए. बी. का डायाटम और माइक्रोफ्लागेलेट को प्रतिस्पर्धात्मक रूप से छोड़कर, जैव उपलब्ध प्राथमिक उत्पादन को और कम करके खाद्य वेब पर दोगुना नकारात्मक प्रभाव पड़ता है। जबकि कुछ अकशेरुकी जैसे कि बाइवल्व सीधे प्रभावित नहीं हो सकते हैं, वे खाद्य श्रृंखला में विषाक्त पदार्थों का प्रसार कर सकते हैं, शिकारियों को बीमार कर सकते हैं या मार सकते हैं। यह अच्छी तरह से समझा नहीं गया है कि कॉपेपॉड कैसे प्रभावित होते हैं। आक्रामक शैवाल माइक्रोसिस्टिस एरुगिनोसा अब गर्मियों के महीनों के दौरान डेल्टा में आम है और कॉपपॉड उत्पादकता को कम कर सकता है (मनुष्यों के लिए संभावित रूप से कार्सिनोजेनिक होने के अलावा)। विनाशकारी उत्पादन एलएसजेड के माध्यम से भारी मात्रा में तलछट और अपशिष्ट प्रवाह। इनमें से अधिकांश घुलनशील और कणिकीय कार्बनिक पदार्थों (क्रमशः डी. ओ. एम. और पी. ओ. एम.) के रूप में कार्बनिक मलबा है। अपस्ट्रीम स्रोतों के अलावा, जैविक पदार्थ स्थानीय जीव मृत्यु दर और अपशिष्ट उत्पादन से जमा हो सकते हैं। अपभक्षी इस ऊर्जा स्रोत का लाभ उठाते हैं, जिससे संभावित रूप से बड़े महत्व का एक वैकल्पिक और समानांतर खाद्य जाल बनता है। ऐसा इसलिए है क्योंकि हानिकारक खाद्य जाल में कार्बन स्थिरीकरण स्तरीकरण, मैलापन या दिन की लंबाई तक सीमित नहीं है, जो सभी प्रकाश संश्लेषण को सीमित करते हैं। विनाशकारी उत्पादन लगातार होता है, केवल डेल्टा प्रणाली से इनपुट और एडवेक्शन द्वारा सीमित होता है। सूक्ष्मजीव चक्र के माध्यम से डी. ओ. एम. और पी. ओ. एम. को जैव उपलब्ध कार्बन में बदलने के मुख्य कारक बैक्टीरिया हैं। यह तंत्र पोषक तत्व सीमित समुद्री प्रणालियों में विशेष रूप से महत्वपूर्ण है, जहां बैक्टीरिया डूबते अपशिष्ट से पोषक तत्व छोड़ते हैं, जिससे इसे फोटिक क्षेत्र में पुनर्नवीनीकरण किया जा सकता है। सैन फ्रांसिस्को मुहाने में माइक्रोबियल लूप के कार्य पर बहुत कम काम किया गया है, लेकिन यह हो सकता है कि यूट्रोफिक प्रणाली में पोषक तत्वों के पुनर्चक्रण के लिए बैक्टीरिया की भूमिका महत्वपूर्ण न हो। बल्कि, वे फ्लैगेलेट्स, रोटिफर्स और सिलियेट्स द्वारा सीधे चराई के माध्यम से एक वैकल्पिक खाद्य श्रृंखला प्रदान कर सकते हैं। साइक्लोपॉइड कोपेपोड लिम्नोइथोना टेट्रास्पिना की उच्च प्रचुरता प्राथमिक खाद्य स्रोत के रूप में फाइटोप्लांकटन के बजाय सिलियेट्स पर इसकी निर्भरता के कारण हो सकती है। कैलानोइड कोपेपोड्स की प्रमुख प्रजातियां भी पूरक या यहां तक कि प्राथमिक खाद्य स्रोत के रूप में सिलियेट्स का उपयोग कर सकती हैं, लेकिन किस हद तक यह अज्ञात है। द्वितीयक उत्पादन उन जीवों को संदर्भित करता है जो प्राथमिक उत्पादन पर फ़ीड करते हैं और ज्वारीय खाद्य जाल के उच्च ट्रोफिक स्तरों पर ऊर्जा स्थानांतरित करते हैं। ऐतिहासिक रूप से, सैन फ्रांसिस्को मुहाने में द्वितीयक उत्पादन में माइसिड झींगा उत्पादन का प्रभुत्व था। हालांकि, देशी माइसिड नियोमाइसिस मर्सिडीज को काफी हद तक शुरू किए गए एकेंथोमाइसिस बोमनी द्वारा प्रतिस्थापित किया गया है, जो कम घनत्व पर बना रहता है। शुरू किए गए एम्फीपोड गैमुरस डेबेरी ने इस जगह के कुछ हिस्से पर कब्जा कर लिया होगा, लेकिन यह काफी हद तक ताजे पानी तक ही सीमित है। आज, द्वितीयक उत्पादन का मुख्य स्रोत कोपेपोड्स से प्राप्त होता है। ऐसा माना जाता है कि प्राकृतिक देशी कैलानोइड कोपेपोड यूरीटेमोरा अफिनिस को 19वीं शताब्दी के अंत में पेश किया गया था। यह 1980 के दशक तक कम लवणता क्षेत्र के ज़ूप्लैंक्टन पर हावी रहा, जब इसे बड़े पैमाने पर एक अन्य पेश किए गए कैलानोइड कोपेपोड, स्यूडोडायप्टोमस फोर्बेसी द्वारा प्रतिस्थापित किया गया था। पी. फोर्बेसी अमूर नदी क्लैम की लवणता सहिष्णुता की सीमा के बाहर, विशेष रूप से डेल्टा में, मुहाने के मीठे पानी, उच्च निवास क्षेत्रों में एक स्रोत आबादी को बनाए रखते हुए बना रहता है। क्योंकि एक बार प्रमुख ई. अफिनिस में एक अपस्ट्रीम रेंज का अभाव है, यह क्लैम द्वारा शिकार के लिए अधिक संवेदनशील है, और पी. फोर्बेसी के साथ स्पष्ट प्रतिस्पर्धा से पीड़ित है। अन्य कैलानोइड कोपेपोड्स जो महत्वपूर्ण हो सकते हैं, वे हैं हाल ही में पेश किए गए सिनोकैलानस डोएरी और एकार्टिएला साइनेंसिस। इन जीवों के जीवन इतिहास के बारे में बहुत कम जानकारी है, हालांकि उनकी आकृति विज्ञान के आधार पर, वे अन्य कोपेपोड्स का शिकार कर सकते हैं। वे प्रचुरता के अनियमित चक्रों में दिखाई देते हैं, जिसके दौरान वे ज़ूप्लैंक्टन पर हावी हो सकते हैं। फिर भी एक और आक्रामक कोपेपोड, बहुत छोटा साइक्लोपॉइड लिम्नोइथोना टेट्रास्पिना, 1990 के दशक में निम्न लवणता क्षेत्र में दिखाई दिया। तब से, एल. टेट्रास्पिना संख्यात्मक रूप से प्रमुख कोपेपोड बन गया है, जो 10,000/एम 3 के क्रम पर घनत्व तक पहुंच गया है। यह अपने खाद्य स्रोत के रूप में सूक्ष्मजीव लूप पर निर्भर करता है, बैक्टीरिया, सिलियेट्स और रोटिफर्स को खाता है। इसके अलावा, यह अज्ञात कारणों से अमूर नदी क्लैम द्वारा शिकार के लिए अभेद्य लगता है। अपने छोटे आकार के कारण, एल. टेट्रास्पिना आम तौर पर बड़े शिकारियों, विशेष रूप से मछलियों द्वारा उपभोग के लिए उपलब्ध नहीं है, जिससे यह एक ऊर्जावान मृत अंत बन जाता है। उपभोक्ता प्राथमिक उपभोक्ता मुख्य खाद्य स्रोत के रूप में प्राथमिक उत्पादन पर भरोसा करते हैं। एल. एस. जेड. के पेलाजिक वेब के सबसे महत्वपूर्ण उपभोक्ता ऊपर वर्णित रोटिफर्स, फ्लैगेलेट्स और सिलियेट्स के साथ कोपेपोड्स हैं। कैलानोइड कोपेपोड्स की सभी प्रजातियों में हाल ही में शुरू किए गए अमूर नदी क्लैम (कॉर्बुला एम्यूरेन्सिस) से उच्च परभक्षी दबाव के तहत गिरावट आई है। इस वजह से, और क्योंकि कॉपपॉड्स प्रकाश संश्लेषक और हानिकारक दोनों खाद्य स्रोतों पर निर्भर करते हैं, एलएसजेड में कॉपपॉड्स के पास प्राथमिक उत्पादन पर सीमित प्रतिक्रिया होती है, समुद्री और लेंटिक प्रणालियों के विपरीत जहां कॉपपॉड्स कुछ ही दिनों में खिल सकते हैं। बायोमास के मामले में स्यूडोडायप्टोमस फोर्बेसी एल. एस. जेड. का प्रमुख कैलानोइड कोपेपोड है। इसमें पर्याप्त रूप से व्यापक लवणता सहिष्णुता है कि यह कम लवणता और ताजे पानी दोनों में बनी रह सकती है। यह व्यापक वितरण आबादी को संकीर्ण लवणता सहिष्णुता वाली अन्य प्रजातियों के विपरीत, शिकार से ऊपर की ओर शरण बनाए रखने में मदद करता है। 1993 में अपनी शुरुआत के बाद से लिम्नोइथोना टेट्रास्पिना संख्यात्मक रूप से प्रमुख साइक्लोपॉइड कोपेपोड बन गया है। यह मुख्य रूप से सिलियेट्स और माइक्रोफ्लेजेलेट्स पर फ़ीड करता है, लेकिन पी. फोर्बेसी के विपरीत, यह क्लैम या मछली द्वारा शिकार के लिए अपेक्षाकृत अभेद्य है, इसलिए इसकी प्रचुरता है। सक्रिय रूप से, एल. टेट्रास्पिना खाद्य जाल के लिए एक मृत अंत हो सकता है; ये कोपेपोड या तो ज्वार-भाटा और धाराओं द्वारा प्रणाली से बाहर निकल जाते हैं, या मर जाते हैं और बेंथोस में गिर जाते हैं, जहां वे माइक्रोबियल लूप, या डिट्रिटिवोर के लिए उपलब्ध हो सकते हैं। परभक्षी कोपेपोड पूरे डेल्टा में कई परभक्षी कोपेपोड मौजूद हैं, जिनके बारे में अपेक्षाकृत कम जानकारी है। सिनोकैलानस डोएरी, एकार्टिएला साइनेंसिस और टॉर्टानस डेक्सट्रिलोबेटस सभी रूपात्मक रूप से अन्य कोपेपोड्स पर शिकार करने में सक्षम प्रतीत होते हैं। प्रत्येक को 1980 के दशक से शायद गिट्टी जल विनिमय के माध्यम से मुहाने से परिचित कराया गया था। आम तौर पर, वे कॉपपॉड उपभोक्ताओं को नकारात्मक रूप से प्रभावित करने के लिए पर्याप्त मात्रा में नहीं हैं; हालाँकि, एस. डोएरी और ए. साइनेंसिस के आवधिक फूल होते हैं जिनका अच्छी तरह से अध्ययन नहीं किया गया है। मैक्रोइनवर्टेब्रेट्स फ़िल्टर-फीडिंग में सक्षम होते हुए भी, माइसिड (छोटे झींगे जैसे जीव) बड़े पैमाने पर मांसाहारी होते हैं, जो कोपेपोड वयस्कों को खाते हैं। उन्होंने प्लैंकटन और प्लैंकटिवोरस मछलियों के बीच एक ऊर्जावान नाली प्रदान की, जिसमें किशोर मछलियां, स्टर्जन, चिनूक सैल्मन और अमेरिकन शेड शामिल हैं। माइसिड एक बार प्रचुर मात्रा में थे जब तक कि 1980 के दशक के मध्य में देशी नियोमाइसिस मर्सिडीस को आक्रामक एकेंथोमाइसिस बोमनी द्वारा प्रतिस्थापित नहीं किया गया था, जो छोटा और कम प्रचुर मात्रा में है। माइसिड गिरावट को 1980 और 90 के दशक में ज्वारनदमुख में कई मछली प्रजातियों में गिरावट से जोड़ा गया है। झींगा सामान्य मांसाहारी जीव हैं जो बड़े पैमाने पर माइसिड और एम्फीपोड का शिकार करते हैं। क्रेंगन फ़्रांसिस्कोरम ज्वारनदमुख में दो शेष वाणिज्यिक मत्स्य पालन में से एक का प्रतिनिधित्व करता है। जबकि अब "सैन फ्रांसिस्को बे झींगा कॉकटेल" के लिए उपयोग नहीं किया जाता है, उन्हें चारा के लिए काटा जाता है। अन्य शिकारियों में धारीदार बास और चिनूक सैल्मन वयस्क और स्मोल्ट शामिल हैं। चूँकि मछलियाँ एक वर्गीकरण और रूपात्मक रूप से विविध समूह हैं, इसलिए प्रजातियाँ अपने पोषण पारिस्थितिकी में भिन्न होती हैं। आम तौर पर, मछली को चार व्यापक भोजन श्रेणियों में विभाजित किया जा सकता हैः फ़िल्टर फीडर, प्लैंकटिवोर, पिस्किवोर और बेंथिक फीडर। फ़िल्टर फीडर छोटे शिकार, आमतौर पर फाइटो-और ज़ूप्लैंक्टन के लिए पानी के स्तंभ को अंधाधुंध रूप से छानते हैं। मछलियों की इस श्रेणी में थ्रेडफिन शैड (डोरोसोमा पेटेनेंस), अमेरिकन शैड (एलोसा सैपिडिस्सिमा), अंतर्देशीय सिल्वरसाइड्स (मेनिडिया बेरिलिना) और एंकोवीज़ (एंग्रोलिस मॉर्डेक्स) शामिल हैं। कुछ साक्ष्य बताते हैं कि अमूर नदी क्लैम की शुरुआत के बाद प्लैंकटन के निम्न स्तर के कारण इनमें से कुछ प्रजातियां भोजन-सीमित हैं। एंकोवीज ने एलएसजेड को सैन पाब्लो और सेंट्रल बेज में मुहाने के अधिक उत्पादक क्षेत्रों के पक्ष में छोड़ दिया है। प्लैंकटिवोर चुनिंदा रूप से अलग-अलग ज़ूप्लैंक्टन का शिकार करते हैं, जैसे कि कोपेपोड्स, माइसिड और गैमेरिड्स। इस समूह में अधिकांश मछली लार्वा, डेल्टा स्मेल्ट (हाइपोमेसस ट्रांसपैसिफिकस) और लॉन्गफिन स्मेल्ट (स्पिरिंचस थैलिच्थिस), ट्यूल पर्च (हिस्टेरोकार्पस ट्रास्की) और सैल्मन स्मोल्ट शामिल हैं। डेल्टा स्मेल्ट अपनी लुप्तप्राय स्थिति के कारण विशेष रुचि रखता है। यह भोजन-सीमित हो सकता है, लेकिन सबूत कुछ हद तक विरोधाभासी हैं। डेल्टा से ताजे पानी के निर्यात पम्पिंग में अंडे और लार्वा के प्रवेश जैसे अन्य कारक भी गिरावट की व्याख्या कर सकते हैं। एलएसजेड का मुख्य मछुवारा धारीदार बास (मोरोन सैक्साटिलिस) है, जिसे 1890 के दशक में पेश किया गया था और देशी मछलियों का भारी शिकार करता है। सैन फ्रांसिस्को मुहाने में धारीदार बास एक महत्वपूर्ण खेल मत्स्य पालन है, और इस तरह, मुहाने से बायोमास की मामूली वापसी का प्रतिनिधित्व करता है। बेंथिक या नीचे रहने वाली मछलियों में सफेद स्टर्जन (एसिपेन्सर ट्रांसमोंटनस), सफेद कैटफ़िश (एमेयूरस कैटस) और स्टेरी फ्लाउंडर (प्लैटिच्थिस स्टेलेटस) शामिल हैं। अपने आवास अभिविन्यास के कारण, वे मुख्य रूप से एपिबेन्थिक जीवों जैसे एम्फीपोड्स, बे झींगा और बाइवल्व्स को खाते हैं। इन मछलियों को अमूर नदी के क्लैम पर कम से कम कभी-कभी खाने के लिए जाना जाता है, जो उस प्रजाति से ऊर्जा प्रवाह के लिए कुछ चैनलों में से एक का प्रतिनिधित्व करती है, सिवाय हानिकारक उत्पादन के। एल. एस. जेड. में एकमात्र वाणिज्यिक मत्स्य पालन चारा झींगा के लिए है। विभिन्न प्रकार के खेल मत्स्य पालन हैं जो कार्बन के मामूली प्रवाह का प्रतिनिधित्व करते हैं, लेकिन मुहाने के आसपास स्थानीय अर्थव्यवस्थाओं में पूंजी के महत्वपूर्ण प्रवाह का प्रतिनिधित्व करते हैं। अधिकांश मनोरंजक मत्स्य पालन धारीदार बास, स्टर्जन को घेरते हैं और मीठे पानी के डेल्टा में ताजे पानी के बास पेश करते हैं। मत्स्य पालन की यह कमी सैन फ्रांसिस्को मुहाने को अद्वितीय बनाती है। दुनिया भर में लगभग सभी ज्वारनदमुख कम से कम महत्वपूर्ण मत्स्य पालन के अवशेषों का समर्थन करते हैं। सैन फ्रांसिस्को मुहाना एक समय में 1950 के दशक तक सैल्मन, एंकोवी और डंगेनेस केकड़ों के लिए प्रमुख मत्स्य पालन का समर्थन करता था। इन मत्स्य पालन का अंत संभवतः अधिक कटाई की तुलना में निवास स्थान के नुकसान के कारण हुआ था। सैन फ्रांसिस्को मुहाना प्रवासी जलपक्षी के लिए प्रशांत उड़ान मार्ग पर एक प्रमुख पड़ाव है। फिर भी पक्षियों के माध्यम से मुहाने के अंदर या बाहर कार्बन के प्रवाह के बारे में बहुत कम जानकारी है। प्रतिवर्ष लाखों जलपक्षी बे शैलो को शरण के रूप में उपयोग करते हैं। अधिकांश पक्षी बत्तखों का शिकार करते हैं जो जलमग्न जलीय वनस्पतियों को खाते हैं। गोताखोर बत्तख (जैसे स्कैप) सी. एम्यूरेन्सिस जैसे एपिबेन्थिक जीवों को खाते हैं, जो उस अन्यथा मृत छोर से कार्बन के संभावित प्रवाह का प्रतिनिधित्व करते हैं। पक्षियों की दो लुप्तप्राय प्रजातियाँ यहाँ पाई जाती हैंः कैलिफोर्निया लीस्ट टर्न और कैलिफोर्निया क्लैपर रेल। उजागर खाड़ी की मिट्टी तटीय पक्षियों के लिए महत्वपूर्ण भोजन क्षेत्र प्रदान करती है, लेकिन खाड़ी की मिट्टी की अंतर्निहित परतें खाड़ी परिधि के कई हिस्सों के पास संरचनाओं के लिए भूवैज्ञानिक खतरे पैदा करती हैं। मछली पकड़ने वाले पक्षी जैसे डबल-क्रेस्टेड कॉर्मोरेंट और ब्राउन पेलिकन भी मुहाने में रहते हैं, लेकिन उनके पोषण संबंधी प्रभाव का बहुत कम अध्ययन किया गया है। जनवरी 2015 में, वैज्ञानिक सैन फ्रांसिस्को खाड़ी तटरेखा के साथ पक्षियों पर एक भूरे, मोटे, चिपचिपे, गंधहीन पदार्थ कोटिंग की पहचान करने के लिए काम कर रहे थे। सैकड़ों पक्षी मर गए हैं, और सैकड़ों और इस पदार्थ से लेपित हो गए हैं। वैज्ञानिक अन्य वन्यजीवों के बारे में चिंतित हैं जो पदार्थ से खतरे में हो सकते हैं। 1825 से पहले, स्पेनिश, फ्रांसीसी, अंग्रेजी, रूसी और अमेरिकियों को बीवर (कैस्टर कैनाडेंसिस), नदी ऊदबिलाव, मार्टन, मछुआरे, मिंक, लोमड़ी, वीज़ल, बंदरगाह मुहर और समुद्री शेर (ज़लोफ़स कैलिफ़ोर्निया) और समुद्री ऊदबिलाव (एनहाइड्रा लुट्रिस) की विशाल मात्रा में कटाई के लिए खाड़ी क्षेत्र की ओर आकर्षित किया गया था। यह प्रारंभिक फर व्यापार, जिसे कैलिफोर्निया फर रश के रूप में जाना जाता है, किसी भी अन्य एकल कारक से अधिक था, जो पश्चिम और सैन फ्रांसिस्को खाड़ी क्षेत्र को विशेष रूप से विश्व व्यापार के लिए खोलने के लिए जिम्मेदार था। 1817 तक क्षेत्र में समुद्री ऊदबिलाव को व्यावहारिक रूप से समाप्त कर दिया गया था। रूसियों ने 1812 से 1840 तक पास के फरालोन द्वीप समूह में एक सीलिंग स्टेशन बनाए रखा, जो सालाना 1,200 से 1,500 फर मुहरें लेता था, हालांकि अमेरिकी जहाजों ने पहले ही द्वीपों का शोषण कर लिया था। 1818 तक मुहरें तेजी से कम हो गईं जब तक कि केवल 500 सालाना नहीं लिए जा सके और अगले कुछ वर्षों के भीतर, द्वीपों से फर सील को हटा दिया गया जब तक कि उन्होंने 1996 में द्वीपों को फिर से उपनिवेशित करना शुरू नहीं किया। हालाँकि 20वीं शताब्दी के प्रकृतिविदों को संदेह था कि बीवर ऐतिहासिक रूप से तटीय धाराओं या खाड़ी में ही मौजूद थे, पहले के रिकॉर्ड बताते हैं कि कैलिफोर्निया गोल्डन बीवर (कैस्टर कैनाडेंसिस एसएसपी)। सबौरातस) सबसे मूल्यवान जानवरों में से एक था, और जाहिरा तौर पर बहुतायत में पाया गया था। थॉमस मैके ने बताया कि एक साल में हडसन की बे कंपनी ने सैन फ्रांसिस्को खाड़ी के तट पर 4,000 बीवर की खाल ले ली। हाल ही में, बीवर ने उत्तर सैन पाब्लो खाड़ी में खारे नापा सोनोमा दलदल और इसकी सोनोमा खाड़ी और नापा नदी की सहायक नदियों को फिर से उपनिवेशित किया है। बीवर दक्षिण खाड़ी को भी पुनः उपनिवेशित कर रहे हैं, जिसे 1980 के दशक में लेक्सिंगटन जलाशय में ऊपरी लॉस गैटोस क्रीक में स्थानांतरित कर दिया गया था। बाद में वे गुआडालुपे नदी के नीचे की ओर चले गए, और खारे पानी तक पहुंचने पर, इसका उपयोग पूर्व में कोयोट क्रीक और उत्तर-पश्चिम में पालो ऑल्टो में माटाडेरो क्रीक में फिर से उपनिवेश बनाने के लिए किया। उत्तरी अमेरिकी नदी ऊदबिलाव (लोंट्रा कैनाडेंसिस) भी खाड़ी और उसकी सहायक नदियों का पुनः उपनिवेशीकरण कर रहे हैं। खाड़ी में नदी ऊदबिलाव पहली बार 1996 में मुइर बीच पर रेडवुड क्रीक में, और हाल ही में कोर्टे मदेरा क्रीक में, और कोयोट क्रीक पर दक्षिण खाड़ी में, साथ ही 2010 में रिचमंड मरीना में सैन फ्रांसिस्को खाड़ी में भी रिपोर्ट किया गया था। 65 वर्षों में पहली बार, पैसिफिक हार्बर पोर्पोइज़ (फोकोएना फोकोएना) 2009 में खाड़ी में लौट आया। गोल्डन गेट सीटेशियन रिसर्च, सीटेशियन पर शोध पर केंद्रित एक गैर-लाभकारी संगठन, ने एक फोटो-आइडेंटिफिकेशन डेटाबेस विकसित किया है जो वैज्ञानिकों को विशिष्ट पोर्पोइज़ व्यक्तियों की पहचान करने में सक्षम बनाता है और यह पता लगाने की कोशिश कर रहा है कि क्या एक स्वस्थ खाड़ी ने उनकी वापसी की है। प्रशांत बंदरगाह पोर्पोइस प्वाइंट कॉन्सेप्शन, कैलिफोर्निया से लेकर अलास्का और कामचटका प्रायद्वीप और जापान तक फैला हुआ है। हाल के आनुवंशिक अध्ययनों से पता चलता है कि सैन फ्रांसिस्को से रूसी नदी तक एक स्थानीय स्टॉक है और पश्चिमी अटलांटिक हार्बर पोर्पोइस के विपरीत पूर्वी प्रशांत तटीय आबादी शायद ही कभी दूर प्रवास करती है। आम बॉटलनोज़ डॉल्फ़िन (टर्सियोप्स ट्रंकटस) दक्षिणी कैलिफोर्निया बाइट से उत्तर की ओर अपनी वर्तमान सीमा का विस्तार कर रहा है। हाल के दिनों में सैन फ्रांसिस्को खाड़ी क्षेत्र में पहली तटीय बॉटलनोज़ डॉल्फ़िन को 1983 में सैन माटेओ काउंटी तट पर देखा गया था। 2001 में बॉटलनोज़ डॉल्फ़िन को पहली बार गोल्डन गेट ब्रिज के पूर्व में देखा गया था और 2007 में फोटोग्राफिक साक्ष्य द्वारा इसकी पुष्टि की गई थी। बॉटलनोज़ डॉल्फ़िन के चिड़ियाघर के पुरातात्विक अवशेषों से संकेत मिलता है कि बॉटलनोज़ डॉल्फ़िन प्रागैतिहासिक काल में कम से कम 700 साल पहले तक सैन फ़्रांसिस्को की खाड़ी में रहते थे, और खाड़ी से निकाले गए डॉल्फ़िन की खोपड़ी ऐतिहासिक समय में कभी-कभार आगंतुकों का सुझाव देती हैं। जेलीफ़िश जेलीफ़िश हाल तक ज्वारनदमुख में प्रचलित नहीं रही है। चेसापीक खाड़ी जैसे पूर्वी तट के मुहाने में, वे अक्सर शीर्ष स्तर के शिकारी होते हैं, जो मछली और ज़ूप्लैंक्टन दोनों को अंधाधुंध रूप से खाते हैं। एल. एस. जेड. और ताजे पानी के क्षेत्रों में कई छोटे आक्रामक टैक्सों की पहचान की गई है। ये प्रजातियाँ गर्मियों में घूमती हैं, लेकिन बेंथोस में साल भर पॉलीप्स बनाए रखती हैं। प्लैंकटन पर उनका प्रभाव अज्ञात है, लेकिन इसकी मात्रा निर्धारित करने के लिए शोध चल रहा है। पर्याप्त घनत्व में, जेली की क्लैम की सीमा के बाहर कम लवणता वाले क्षेत्रों में रहने से ज़ूप्लैंक्टन को दबाने में सी. अमूरेन्सिस के लिए एक पूरक भूमिका हो सकती है, जहां प्लैंक्टोनिक प्रजातियों को शिकार-मुक्त शरण मिली है। बेंथिक उपभोक्ता बेंथिक समुदाय ने ज्वारनदमुख द्वारा प्रमुख आक्रमणों के कारण ज्वारनदमुख की खाद्य वेब पारिस्थितिकी में असमान रूप से बड़ी भूमिका निभाई है। इन क्लैम के उपयोग, अमूर नदी क्लैम (कॉर्बुला एम्यूरेन्सिस) में एक व्यापक लवणता सहिष्णुता है जो कम लवणता क्षेत्र में फैली हुई है, लेकिन ताजे पानी में नहीं। यह फ़ाइटोप्लांकटन और छोटे ज़ूप्लांकटन, जैसे कि कैलानोइड कोपेपोड नौप्ली को फ़िल्टर करता है। सैन फ्रांसिस्को मुहाने में क्लैम के कुछ शिकारी हैं और यह इसे उच्च घनत्व (दसियों हज़ारों/वर्ग मीटर के क्रम पर) तक बढ़ने की अनुमति देता है। अपनी उच्च निकासी दरों के कारण, यह कुछ दिनों में मुहाने के कुछ हिस्सों के पूरे जल स्तंभ को साफ करने में सक्षम है, जिससे प्लैंकटन की आबादी काफी कम हो जाती है। 1980 के दशक के मध्य में क्लैम के आक्रमण के बाद पारिस्थितिकी तंत्र उत्पादकता में गिरावट का यह मुख्य कारण माना जाता है। उत्पादकता में यह गिरावट अनिवार्य रूप से इस एक प्रजाति द्वारा पेलाजिक नेटवर्क के बेंथिक श्रृंखला में पुनर्निर्देशन के कारण है। चूँकि अमूर नदी का क्लैम प्राथमिक उत्पादकों, उपभोक्ताओं और शिकारियों को खाता है, यह कई पोषण स्तरों को प्रभावित करता है। नतीजतन, लगभग सभी प्लैंकटन स्पष्ट प्रतिस्पर्धा के संकेत प्रदर्शित करते हैं, जिसमें एक पोषण स्तर पर उत्पादन क्लैम की प्रचुरता को बढ़ाकर अन्य सभी को प्रभावित करता है। इसके परिणामस्वरूप एक नकारात्मक प्रतिक्रिया चक्र होता हैः सी. अमूरेन्सिस प्लैंकटन बायोमास को सीमित करता है, जो बदले में सी. अमूरेन्सिस को सीमित करता है। हालांकि, ज्वारीय विकास या अपस्ट्रीम स्रोतों के कारण प्रणाली के बाहर से आने वाले निवेश सी. अम्यूरेंसिस बायोमास को बढ़ा सकते हैं, जिससे प्लैंकटन की सीमा बढ़ सकती है। इस प्रतिक्रिया चक्र को और बढ़ाया जाता है क्योंकि क्लैम एक या दो साल से अधिक समय तक बना रह सकता है, जो कम उत्पादकता के चक्रों के दौरान प्लैंकटन आबादी पर अतिरिक्त दबाव डालता है। सी. अम्युरेन्सिस द्वारा बेंथोस में कार्बन के पुनर्निर्देशन ने एक सीमित श्रृंखला बनाई है, जिससे पेलाजिक वेब अव्यवस्थित हो गया है। क्लैम उत्सर्जन और मृत्यु से हानिकारक उत्पादन जीवाणु उत्पादन को बढ़ावा दे सकता है, जिसे हानिकारक खाद्य जाल, या माइक्रोबियल लूप में प्रसारित किया जा सकता है। जबकि पुनर्नवीनीकरण किए गए पोषक तत्व कुछ फाइटोप्लांकटन विकास का समर्थन कर सकते हैं, यह अंततः सी. अम्यूरेंसिस की बढ़ती आबादी को वापस फ़ीड करता है। लिम्नोइथोना टेट्रास्पिना की हालिया आक्रमण सफलता को इस घटना के संदर्भ में समझा जा सकता है। यह सिलियेट्स और माइक्रोफ्लेजेलेट्स को खाता है जो क्लैम द्वारा चराई जाने के लिए बहुत छोटे होते हैं, जिससे प्रतिस्पर्धा से बचा जा सकता है। इसके अतिरिक्त, एल. टेट्रास्पिना क्लैम या (लगभग) किसी और चीज़ द्वारा शिकार के लिए अभेद्य प्रतीत होता है। माइक्रोबियल फूड वेब का उदय और एल. टेट्रास्पिना कैपिटलाइज़ का आक्रमण खाद्य वेब में ऊर्जा प्रवाह के लिए एक अप्रयुक्त वैकल्पिक मार्ग का परिणाम है, जिसे सी. एम्यूरेन्सिस द्वारा सुगम बनाया गया है। आक्रमण के बाद के पैटर्न एक समान पैटर्न को प्रतिबिंबित कर सकते हैं। कम से कम 19वीं शताब्दी से व्यापार और यातायात बढ़ाने के कार्य के रूप में प्रजातियों का परिचय बढ़ रहा है। परिचय में कई वर्ग शामिल हैं, जिनमें कोपेपोड, झींगा, एम्फीपोड, बाइवल्व, मछली और दोनों जड़ वाले और तैरते हुए पौधे शामिल हैं। कई पेलाजिक प्रजातियों को हाल ही में बड़े जहाजों से सीधे मुहाने में गिट्टी जल छोड़ने के माध्यम से पेश किया गया है। नतीजतन, इनमें से कई पेश की गई प्रजातियां प्रशांत रिम के आसपास के मुहाने से उत्पन्न होती हैं, विशेष रूप से पी. फोर्बेसी और एल. टेट्रास्पिना जैसे कोपेपोड्स। अमूर नदी क्लैम एशिया से निकलती है, और इसने एलएसजेड की पारिस्थितिकी में महत्वपूर्ण और तीव्र परिवर्तन किए हैं, मुख्य रूप से पेलाजिक भोजन को बेंथोस और एक त्वरित माइक्रोबियल लूप में मोड़कर। प्रजातियों को खेल नौकाओं से लगाव के माध्यम से भी पेश किया गया है जो क्षेत्रों के बीच अनुरेखित हैं। यह कई कम लवणता वाले पौधों जैसे एगेरिया डेंसा और जलकुंभी (आइचहोर्निया क्रैसिप्स) का संभावित स्रोत है। इन पौधों ने पानी के प्रवाह को बाधित करके, फाइटोप्लांकटन को छायांकित करके, और धारीदार बास, मोरोन सैक्सेटिलिस जैसी मछली पकड़ने वाली मछलियों के लिए आवास प्रदान करके डेल्टा में गहरे परिवर्तन किए हैं, जिन्हें जानबूझकर 1800 के दशक के अंत में चेसापीक खाड़ी से पेश किया गया था। एहतियाती उपायों के बावजूद, मूल रूप से यूरोप से मीठे पानी के क्वागा मसेल को अगले दो से दस वर्षों के भीतर नाविकों द्वारा पेश किए जाने की उम्मीद है। इसके अलावा, सैन फ्रांसिस्को मुहाने की कम उम्र और अलग-थलग वातावरण के परिणामस्वरूप जैव विविधता की कमी के कारण आक्रामक अकशेरुकी जीवों को सफलता मिली है। भविष्य के आक्रमण आधुनिक खाद्य जाल आक्रमणों और पोषण संबंधी प्रतिस्थापनों की एक श्रृंखला से लिया गया है। यह प्रक्रिया जारी रहने की उम्मीद है, क्योंकि नए जीव आकस्मिक या जानबूझकर परिचय के माध्यम से आते हैं। जो बात कम स्पष्ट है वह यह है कि पिछले परिचय किस हद तक भविष्य के आक्रमणों का मार्ग प्रशस्त करते हैं। यह तीन तरीकों में से एक में हो सकता है। एक प्रारंभिक आक्रमणकारी एक संसाधन प्रदान कर सकता है जो नई प्रणाली में अप्रयुक्त है जब तक कि एक नया शिकारी पेश नहीं किया जाता है (एल. टेट्रास्पिना और माइक्रोबियल लूप, जैसा कि ऊपर वर्णित है)। प्रारंभिक आक्रमणकारी निवास स्थान को बदलकर और इसे बाद के आक्रमणों के लिए उपयुक्त बनाकर नए आक्रमणकारियों को सुविधा प्रदान कर सकते हैं (जेली पॉलीप्स सब्सट्रेट के लिए अमूर नदी क्लैम के गोले का उपयोग करते हुए)। पुराने और नए निवासियों के बीच स्पष्ट प्रतिस्पर्धा नए जीवों के आक्रमण और निपटान की संभावनाओं को बढ़ा सकती है जो अप्रयुक्त संसाधनों का लाभ उठा सकते हैं (शुरू किए गए कोपेपोड पी. फोर्बेसी की अपस्ट्रीम आबादी द्वारा अमूर नदी क्लैम की सब्सिडी, देशी कोपेपोड्स पर दबाव बनाती है)। सारांश सैन फ्रांसिस्को मुहाने का एलएसजेड खाद्य जाल दो समानांतर और विषम दिशाओं में काम करता है। कार्बन का बड़ा हिस्सा बेंथिक और माइक्रोबियल लूप में आत्मसात हो जाता है, जो ऊर्जावान मृत छोरों का प्रतिनिधित्व करते हैं। एक छोटा सा अंश उच्च पेलाजिक ट्रोफिक स्तरों तक पहुँचाया जाता है जो कोपेपोड्स, मछली, पक्षियों और मत्स्य पालन का समर्थन कर सकता है। इन दो संकीर्ण लूपों में खाद्य जाल का यह पुनर्निर्देशन ज्वारनदमुख में मैक्रोइनवर्टेब्रेट्स और मछलियों में गिरावट के लिए जिम्मेदार हो सकता है, जो इन श्रृंखलाओं के बाहर काम करते हैं। ज्वारनदमुख को उच्च स्तर के कार्य के लिए पुनर्स्थापित करना बेंथिक को सब्सिडी दिए बिना पेलाजिक वेब को बढ़े हुए लाभ देने की संभावना पर निर्भर करता है। भविष्य की पारिस्थितिकी सैन फ्रांसिस्को मुहाने के निम्न लवणता क्षेत्र की पारिस्थितिकी को चिह्नित करना मुश्किल है क्योंकि यह अजैविक और जैविक दोनों कारकों के जटिल तालमेल का परिणाम है। इसके अलावा, यह नई पेश की गई प्रजातियों, प्रत्यक्ष मानवजनित प्रभावों और जलवायु परिवर्तन के परिणामस्वरूप तेजी से परिवर्तन से गुजर रहा है। भविष्य के पारिस्थितिक परिवर्तन पारिस्थितिकी तंत्र के व्यापक पैमाने पर संचालित होंगे, विशेष रूप से समुद्र के स्तर में वृद्धि, विवर्तनिक अस्थिरता और बुनियादी ढांचे में गिरावट डेल्टा में तटबंध विफलता का कारण बनती है। जल प्रवाह में परिणामी बैक-सर्ज से डेल्टा में एक्स2 को मजबूर करने, स्थानिक रूप से उन्मुख आवास (जैसे ताजे पानी के दलदल) को खतरे में डालने, कम लवणता क्षेत्र को चैनलाइज़ करने और दक्षिणी कैलिफोर्निया की जल आपूर्ति को खतरे में डालने की उम्मीद है, जिससे पश्चिमी तट के सबसे बड़े मुहाने की प्राकृतिक और मानव पारिस्थितिकी के लिए अज्ञात और अप्रत्याशित परिणाम होंगे। सैन फ्रांसिस्को खाड़ी क्षेत्र के सैन फ्रांसिस्को खाड़ी क्षेत्र हाइड्रोग्राफी में जलमार्गों की सूची भी देखें वाटरशेड परियोजना सैन फ्रांसिस्को मुहाना और वाटरशेड विज्ञान नोट्स संदर्भ एंडरसन, डी. एम., पी. एम. ग्लिबर्ट और जे. एम. बर्कहोल्डर। 2002 में। हानिकारक शैवाल खिलना और यूट्रोफिकेशनः पोषक स्रोत, संरचना और परिणाम। ज्वारनदमुख 25:704-726। बॉल, एम. डी. और जे. एफ. आर्थर। 1979 में। उत्तरी सैन फ्रांसिस्को खाड़ी और डेल्टा में प्लैंकटनिक क्लोरोफिल गतिशीलता। टी. जे. कोनोमोस में पृष्ठ 265-286, संपादक। सैन फ्रांसिस्को खाड़ीः शहरीकृत मुहाना। अमेरिकन एसोसिएशन फॉर द एडवांसमेंट ऑफ साइंस, पैसिफिक डिवीजन, सैन फ्रांसिस्को, सीए। बेनेट, डब्ल्यू. ए. (2006)। हाल के पेलैजिक जीवों में गिरावट के दौरान डेल्टा गंध वृद्धि और उत्तरजीविताः उन्हें ग्रीष्मकालीन ब्लूज़ का कारण क्या है? कालफेड विज्ञान सम्मेलन। सैक्रामेंटो, सीए। बौले पी., डब्ल्यू. जे. के. (2006)। "एक अत्यधिक प्रचुर मात्रा में पारिस्थितिकी, एक समशीतोष्ण मुहाने में साइक्लोपॉइड कोपेपोड की शुरुआत"। समुद्री पारिस्थितिकी प्रगति श्रृंखला 324:219-228। बुरौ, जे. आर. (1998)। "सुइसुन बे, सैक्रामेंटो, सीए में 1994 के एन्ट्रापमेंट ज़ोन अध्ययन के हाइड्रोडायनामिक तत्व के परिणाम।" सैन फ्रांसिस्को खाड़ी-डेल्टा मुहाने के लिए अंतर-एजेंसी पारिस्थितिकी कार्यक्रम तकनीकी रिपोर्ट 56:13-62। कार्लटन, जे. टी., जे. के. थॉम्पसन, एल. ई. शेमेल और एफ. एच. निकोल्स। 1990 में। एशियाई क्लैम पोटामोकॉर्बुला एम्यूरेन्सिस द्वारा सैन फ्रांसिस्को खाड़ी (कैलिफोर्निया, यू. एस. ए.) पर उल्लेखनीय आक्रमण। 1. परिचय और फैलाव। समुद्री पारिस्थितिकी प्रगति श्रृंखला। 66:81-94। कार्लटन, जे। (1996)। "जैविक आक्रमण और क्रिप्टोजेनिक प्रजातियाँ"। पारिस्थितिकी 77 (6)। कोल, बी. ई. और जे. ई. क्लोरन। 1987 में। ज्वारनदमुखों में फाइटोप्लांकटन उत्पादकता का अनुमान लगाने के लिए एक अनुभवजन्य मॉडल। समुद्री पारिस्थितिकी प्रगति श्रृंखला। 36:299-305। कोल, बी. ई., जे. के. थॉम्पसन और जे. ई. क्लोरन (1992)। "एक पुनरावर्तित फ्लूम में इन्फॉनल बाइवल्व्स द्वारा निस्पंदन दरों का मापन"। समुद्री जीव विज्ञान 113:219-225। क्लोरन, जे. ई. 1987. ज्वारनदमुखों में फाइटोप्लांकटन बायोमास और उत्पादकता पर नियंत्रण के रूप में टर्बिडिटी। महाद्वीपीय शेल्फ अनुसंधान 7:1367-1381। कोनोमोस, टी. जे., एड। (1979)। सैन फ्रांसिस्को खाड़ीः शहरीकृत मुहाना। सैन फ्रांसिस्को, सीए, पैसिफिक डिवीजन, अमेरिकन एसोसिएशन फॉर द एडवांसमेंट ऑफ साइंस। डेवेरेल, एस. (1998)। सैक्रामेंटो-सैन जोकिन डेल्टा, सी. ए. एल. एफ. ई. डी. बे-डेल्टा कार्यक्रम में अवसादन शमन। डे, आर. (2007,16 जनवरी, 2007)। "लेक मीड नेशनल रिक्रिएशन एरिया से इनवेसिव मुसेल अपडेट"। 100वीं मेरिडियन पहल, HTTP:// 100th मेरिडियन से। ओ. आर. जी./मिड। एस. पी. डगडेल, आर. सी., वी. हॉग, ए. मार्ची, ए. लैसिटर और एफ. विल्करसन। 2003 में। सैन फ्रांसिस्को खाड़ी में प्राथमिक उत्पादन पर मानवजनित अमोनियम निवेश और प्रवाह का प्रभाव। कालफेड विज्ञान कार्यक्रम, सैक्रामेंटो, सीए। डूरंड, जे। (2006)। सैन फ़्रांसिस्को एस्टुअरी कैल्फ़ेड साइंस प्रोग्राम में कैलानॉइड कॉपपॉड भर्ती विफलता के निर्धारक। सैक्रामेंटो, सीए। एपस्टीन, ई. (2006)। उथल-पुथल वाले तटबंध आपदा के लिए तैयार हैं। सैन फ्रांसिस्को क्रॉनिकल। सैन फ्रांसिस्को। होलीबाग, जे. टी. और पी. एस. वोंग। 1996 में। सैन फ्रांसिस्को खाड़ी में बैक्टीरियोप्लांकटन का वितरण और गतिविधि। जे. टी. होलीबाग, संपादक में पृष्ठ 263-288। सैन फ्रांसिस्को खाड़ीः पारिस्थितिकी तंत्र। अमेरिकन एसोसिएशन फॉर द एडवांसमेंट ऑफ साइंस, सैन फ्रांसिस्को, सीए। जैस्बी, ए. डी., जे. ई. क्लोरन और बी. ई. कोल। 2002 में। वार्षिक प्राथमिक उत्पादनः पोषक तत्वों से भरपूर ज्वारीय पारिस्थितिकी तंत्र में परिवर्तन के प्रतिमान और तंत्र। लिम्नोलॉजी एंड ओशनोग्राफी 47:698-712। जैस्बी, ए. डी., जे. ई. क्लॉर्न और टी. एम. पॉवेल। 1993 में। सैन फ्रांसिस्को खाड़ी में कार्बनिक कार्बन स्रोत और डूबना-नदी के प्रवाह से प्रेरित परिवर्तनशीलता। समुद्री पारिस्थितिकी प्रगति श्रृंखला। 95. जेसबी, ए. डी. और जे. ई. क्लोरन। 2000. सैक्रामेंटो-सैन जोकिन डेल्टा (कैलिफोर्निया, यू. एस. ए.) के कार्बनिक पदार्थ स्रोत और पुनर्वास। जलीय संरक्षणः समुद्री और ताजे पानी के पारिस्थितिकी तंत्र 10:323-352। जेसबी, ए. डी., जे. ई. क्लोरन और बी. ई. कोल। (2002)। वार्षिक प्राथमिक उत्पादनः पोषक तत्वों से भरपूर ज्वारीय पारिस्थितिकी तंत्र में परिवर्तन के पैटर्न और तंत्र। लिम्नोलॉजी एंड ओशनोग्राफी 47 (3): 698-712। किम्मरर, डब्ल्यू. जे., ई. गार्टसाइड और जे. जे. ओर्सी। (1994)। "सैन फ़्रांसिस्को खाड़ी के ज़ूप्लैंक्टन में पर्याप्त गिरावट के संभावित कारण के रूप में एक शुरू किए गए क्लैम द्वारा शिकार।" मार. इकोल। प्रोग। सर। 113: 81-93। किम्मेरर, डब्ल्यू. जे., जे. जे. ओर्सी। 1996 में। क्लैम पोटामोकॉर्बुला एम्यूरेन्सिस की शुरुआत के बाद से सैन फ्रांसिस्को खाड़ी मुहाने के ज़ूप्लैंक्टन में परिवर्तन। जे. टी. होलीबाग, संपादक में पृष्ठ 403-425। सैन फ्रांसिस्को खाड़ीः पारिस्थितिकी तंत्र। अमेरिकन एसोसिएशन फॉर द एडवांसमेंट ऑफ साइंस, सैन फ्रांसिस्को, सीए। किम्मरर, डब्ल्यू. जे., जे. आर. बुरौ और डब्ल्यू. ए. बेनेट। (1998)। "समशीतोष्ण ज्वारनदमुख में जूप्लांकटन का ज्वारीय ऊर्ध्वाधर प्रवास और स्थिति रखरखाव।" लिम्नोल। ओशनोग्र. 43 (7): 1697-1709। किम्मेरर, डब्ल्यू. जे. (2002)। "सैन फ्रांसिस्को मुहाने में परिवर्तनशील ताजे पानी के प्रवाह के लिए भौतिक, जैविक और प्रबंधन प्रतिक्रियाएँ।" नदीमुख 25:1275-1290। किम्मरर, डब्ल्यू. (2004)। "सैन फ्रांसिस्को मुहाने की खुली जल प्रक्रियाः शारीरिक बल से जैविक प्रतिक्रियाओं तक।" सैन फ्रांसिस्को मुहाना और वाटरशेड विज्ञान 2 (1)। किम्मरर, डब्ल्यू. (2006)। "एंकोवीज डैम्पेंस की प्रतिक्रिया सैन फ्रांसिस्को एस्टुअरी फूडवेब पर आक्रामक बाइवल्व कॉर्बुला एम्यूरेन्सिस को प्रभावित करती है।" समुद्री पारिस्थितिकी प्रगति श्रृंखला 324:207-218। ली, सी. ई. (1999)। "कोपपोड यूरीटर्मोरा अफिनिस द्वारा ताजे पानी पर तेजी से और बार-बार आक्रमण।" विकास 53 (5): 1423-1434। लेहमैन, पी. डब्ल्यू. और एस. वालर। 2003 में। डेल्टा में माइक्रोसिस्टिस खिलता है। आई. ई. पी. न्यूज़लेटर 16:18-19। लुंड, जे., ई. हनक, डब्ल्यू. फ्लिनोर, आर. हॉविट, जे. माउंट, पी. मोयल (2007)। सैक्रामेंटो-सैन जोकिन डेल्टा के लिए भविष्य की कल्पना। सैन फ्रांसिस्को, सार्वजनिक नीति संस्थान। मोडलिन, आर. एफ. और जे. जे. ओर्सी (1997)। एकैंथोमिसिस बोमनी, एक नई प्रजाति, और ए. एस्पेराली, माइसिडासिया ने सैक्रामेंटो-सैन जोकिन एस्टुअरी, कैलिफोर्निया (क्रस्टेशियाः माइसिडे) से नई सूचना दी। बायोलॉजिकल सोसाइटी ऑफ वाशिंगटन की कार्यवाही 110 (3): 439-446। मोनिस्मिथ, एस. जी., जे. आर. बुरौ और एम. स्टेसी (1996)। उत्तरी सैन फ्रांसिस्को खाड़ी पर स्तरीकरण गतिशीलता और गुरुत्वाकर्षण परिसंचरण। सैन फ्रांसिस्को खाड़ीः पारिस्थितिकी तंत्र। जे. टी. होलीबाग। सैन फ्रांसिस्को, सीए, अमेरिकन एसोसिएशन फॉर द एडवांसमेंट ऑफ साइंसः 123-153। मोयल, पी. बी., बी. हर्बोल्ड, डी. ई. स्टीवंस और एल. डब्ल्यू. मिलर। (1992)। "सैक्रामेंटो-सैन जोकिन मुहाना, कैलिफोर्निया में जीवन इतिहास और डेल्टा की स्थिति का पता चला।" ट्रांस. एम. मछली। एस. सी. 121: 67-77। मुरेल, एम. सी., जे. टी. होलीबाग, एम. डब्ल्यू. सिल्वर और पी. एस. वोंग। 1999 में। उत्तरी सैन फ्रांसिस्को खाड़ी में बैक्टीरियोप्लांकटन गतिकीः कण संघ और मौसमी ताजे पानी के प्रवाह की भूमिका। लिम्नोलॉजी और ओशनोग्राफी। 44:295-308। मुरेल, एम. सी. और जे. टी. होलीबाग। 2000. कम प्रवाह स्थितियों के दौरान उत्तरी सैन फ्रांसिस्को खाड़ी में घुलित और कण कार्बनिक कार्बन का वितरण और संरचना। ज्वारीय, तटीय और शेल्फ विज्ञान 51:75-90। निकोल्स, एफ. एच., जे. ई. क्लोरन, एस. लुओमा और डी. एच. पीटरसन। 1986 में। एक मुहाने का संशोधन। विज्ञान 231:567-573। निकोल्स, एफ. एच., जे. के. थॉम्पसन और एल. ई. शेमेल। 1990 में। एशियाई क्लैम पोटामोकॉर्बुला एम्यूरेन्सिस द्वारा सैन फ्रांसिस्को खाड़ी (कैलिफोर्निया, यू. एस. ए.) पर उल्लेखनीय आक्रमण। 2. एक पूर्व समुदाय का विस्थापन। समुद्री पारिस्थितिकी प्रगति श्रृंखला। 66:95-101। ओर्सी, जे. जे. और ए. सी. नट्सन। 1979 में। सैक्रामेंटो-सैन जोकिन मुहाने में माइसिड झींगे की भूमिका और उनकी प्रचुरता और वितरण को प्रभावित करने वाले कारक। टी. जे. कोनोमोस में पृष्ठ 401-408, संपादक। सैन फ्रांसिस्को खाड़ीः शहरीकृत मुहाना। अमेरिकन एसोसिएशन फॉर द एडवांसमेंट ऑफ साइंस, पैसिफिक डिवीजन, सैन फ्रांसिस्को। ओरसी, जे. जे. और डब्ल्यू. एल. मेकम। (1986)। कुछ पर्यावरणीय कारकों के संबंध में सैक्रामेंटो-सैन जोकिन डेल्टा में ज़ूप्लैंक्टन वितरण और प्रचुरता। ज्वारनदमुख 9 (4 बी): 326-339। ओरसी, जे. जे. और टी. सी. वाल्टर। (1991)। "स्यूडोडायप्टोमस फोर्बेसी और पी. मैरिनस (कोपेपोडाः कैलानोइडा), कैलिफोर्निया के सैक्रामेंटो-सैन जोकिन मुहाने में नवीनतम कोपेपोड आप्रवासी हैं।" बैल। प्लैंकटन एस. सी. जापान स्पेक्स। खण्ड. (कोपेपोडा पर चौथे अंतर्राष्ट्रीय सम्मेलन की कार्यवाही): 553-562। ओरसी, जे. जे. और एस. ओत्सुका। (1999)। "सैन फ्रांसिस्को मुहाना, कैलिफोर्निया, संयुक्त राज्य अमेरिका में एशियाई कोपेपोड्स एकार्टिएला साइनेंसिस, टोर्टनस डेक्सट्रिलोबेटस (कोपेपोडाः कैलानोइडा), और लिम्नोइथोना टेट्रास्पिना (कोपेपोडाः साइक्लोपोइडा) का परिचय।" प्लैंक। बायो. इकोल। 46: 128-131। पीटरसन, एच. 1997. क्लैम-स्टफ्ड स्टर्जन। आई. ई. पी. न्यूज़लेटर 9:19-19। फिलिप, टी. (2007)। जल समाधान देने का समय। सैक्रामेंटो बी। सैक्रामेंटो, सीए। पॉल्टन, वी. के., जे. आर. लववोर्न और जे. वाई. टेकावा। 2002 में। सैन पाब्लो खाड़ी, कैलिफोर्निया में क्लैम घनत्व और स्कैप फीडिंग व्यवहार। द कोंडोर। 104:518-527। राडोविच, जे। (1963)। "प्रशांत तट पर धारीदार बास, रोकस सैक्साटिलिस के समुद्री आंदोलन पर समुद्र के तापमान का प्रभाव।" कैलिफोर्निया डिपार्टमेंट ऑफ फिश एंड गेम 49:191-205। रिचमैन, एस. ई. और जे. आर. लववोर्न। 2004 में। सैन फ्रांसिस्को खाड़ी से देशी और विदेशी क्लैम के कम स्केप बत्तखों के लिए सापेक्ष चारा मूल्य। पारिस्थितिक अनुप्रयोग 14:1217-1231। रोलवैगन-बोलेंस, जी. सी. और डी. एल. पेनरी। 2003 में। एकार्टिया एसपी की पोषण गतिशीलता। एक बड़े, समशीतोष्ण मुहाने (सैन फ्रांसिस्को खाड़ी, सीए) में। समुद्री पारिस्थितिकी प्रगति श्रृंखला 257:139-158। रोलवैगन-बोलेंस, जी., एस. गिफोर्ड, ए. वध, और एस. एम. बोलेंस। 2006 में। एक समशीतोष्ण मुहाने में प्रोटेस्टः मेटाज़ोन द्वारा विविधता, चराई और खपत। ई. ओ. एस., अमेरिकी भूभौतिकीय संघ के लेनदेन, महासागर विज्ञान बैठक पूरक। 87:36 OS11D-05। स्कोल्हेमर, डी. एच. (2001)। उत्तरी सैन फ़्रांसिस्को खाड़ी में ज्वारीय अशांति अधिकतम के स्थानों पर लवणता, निचले स्थलाकृति और ज्वार का प्रभाव। तटीय और ज्वारीय महीन तलछट प्रक्रियाएँ। डब्ल्यू. एच. मैकएनली और ए. जे. मेहता। एम्स्टर्डम, नीदरलैंड, एल्सेवियरः 343-356। सिट आर. एम., ए. डब्ल्यू. नाइट। 1979 में। ज्वारीय झींगे क्रेंगन फ़्रांसिस्कोरम स्टिम्पसन और पैलेमन मैक्रोडैक्टिलस रथबन द्वारा शिकार। जैविक बुलेटिन 156:356-368। स्मिथ, एस. वी., और जे. टी. होलीबाग (2002)। "सैन फ्रांसिस्को खाड़ी में पानी, नमक और पोषक तत्वों का आदान-प्रदान"। सैन फ्रांसिस्को खाड़ी-डेल्टा मुहाना तकनीकी रिपोर्ट 66 के लिए अंतर-एजेंसी पारिस्थितिक कार्यक्रम। टाउगर, माइक (2005)। डेल्टा में पर्यावरण के सायरन बज रहे हैं। कॉन्ट्रा कोस्टा टाइम्स। ट्रॉट, जे. एस. एस., वारेन जे. फर्ग्यूसन, और एंड्रयू जे. क्लेनफेल्ड, (2006)। केंद्रीय डेल्टा जल एजेंसी बनाम सुधार ब्यूरो। नौवें सर्किट के लिए यूनाइटेड स्टेट्स कोर्ट ऑफ अपील्स। सैन फ्रांसिस्को, सीए। वेसियेर्स, एम. पी. (2006)। ऊपरी सैन फ्रांसिस्को एसुटरी के बेंथोस में रुझान। कालफेड विज्ञान सम्मेलन। सैक्रामेंटो, सीए। वर्नर, आई. और जे. टी. होलीबाग। 1993 में। पोटामोकॉर्बुला एम्यूरेन्सिस (मोलुस्का, पेलिसिओपोडा): फाइटोप्लांकटन और बैक्टीरियोप्लांकटन के लिए निकासी दरों और आत्मसात क्षमताओं की तुलना। लिम्नोलॉजी एंड ओशनोग्राफी 38:949-964। सैन फ्रांसिस्को खाड़ी पर्यावरण कैलिफोर्निया पारिस्थितिकी तंत्र सैन फ्रांसिस्को खाड़ी क्षेत्र में विज्ञान और प्रौद्योगिकी सैन फ्रांसिस्को खाड़ी क्षेत्र सैन फ्रांसिस्को खाड़ी जलविभाजक का पर्यावरण