Pseudoproline
पेप्टाइड्स के एफ. एम. ओ. सी. ठोस-चरण संश्लेषण के दौरान एकत्रीकरण को कम करने के लिए कृत्रिम रूप से बनाए गए डाइपेप्टाइड्स स्यूडोप्रोलिन (स्यूडो-प्रोलिन भी) व्युत्पन्न हैं। इतिहास बड़े पेप्टाइड्स का रासायनिक संश्लेषण अभी भी ठोस चरण पेप्टाइड संश्लेषण (एस. पी. पी. एस.) के दौरान कम विलयन की समस्याओं या पूरी तरह से संरक्षित पेप्टाइड टुकड़ों की सीमित घुलनशीलता से सीमित हैः यहां तक कि असुरक्षित पेप्टाइड ब्लॉकों के स्व-संयोजन से कीमोसेलेक्टिव बंधन विधियां भी बाधित होती हैं। बढ़ती पेप्टाइड श्रृंखला की पसंदीदा संरचना और इसके भौतिक रासायनिक गुणों के बीच संबंध की व्याख्या से पता चलता है कि β-पत्रक (बीटा-पत्रक) का गठन अक्सर विलयन और घुलनशीलता में महत्वपूर्ण कमी के समानांतर होता है। बाहरी कारकों द्वारा पेप्टाइड्स के विलयन को बढ़ाने के प्रयासों के अलावा, कुछ प्रयास, अर्थात। एन-प्रतिस्थापित एच. एम. बी. एमिनो एसिड व्युत्पन्न और सूडोप्रोलिन (ऊपर दाईं ओर चित्र देखें) को एकत्रीकरण और द्वितीयक संरचना निर्माण के लिए जिम्मेदार पेप्टाइड्स के आंतरिक गुणों को संशोधित करने के लिए सूचित किया गया है। स्यूडोप्रोलिन में सेरीन-(ओक्सा) या थ्रेओनिन-व्युत्पन्न ऑक्साज़ोलिडीन [ओक्सा (5-मी)] और सिस्टीन-व्युत्पन्न थियाज़ोलिडीन (टीएचजेड) होते हैं जो प्रोलिन जैसी वलय संरचना के साथ होते हैं (ऊपर दाईं ओर देखें)। मटर और सहकर्मियों ने सेर (siPro) के साथ सेरीन, थ्रेओनिन और सिस्टीन के ऑक्सा-और थियाप्रोलिन व्युत्पन्न को परिभाषित किया है। Thr (siPro), और Cys (siPro), क्रमशः, जहाँ संक्षिप्त नाम siPro प्रोलिन के साथ संबंध को इंगित करता है (स्थिति 4 में विषमआण्विक वलय प्रतिस्थापन के साथ)। प्रोलाइन रिंग की स्थिति 2 में प्रतिस्थापन के साथ स्यूडोप्रोलिन को सेर/थ्र/सिस-(प्रो) नाम दिया गया है। सी2-प्रतिस्थापित स्यूडोप्रोलिन के पूर्ववर्ती अवशेषों के साथ एक सिस-एमाइड बंधन के लिए वरीयता के कारण, उनके समावेश के परिणामस्वरूप पेप्टाइड रीढ़ की हड्डी की एक किंक संरचना होती है, इस प्रकार पेप्टाइड एकत्रीकरण, आत्म-संघ, या β-संरचना गठन को रोका जाता है। इसलिए, स्यूडोप्रोलिन एक साथ दो कार्यों को पूरा करते हैंः वे (1) सेर, थ्र और सिस के लिए अस्थायी साइड-चेन सुरक्षा के रूप में और (2) पेप्टाइड संश्लेषण के दौरान और बाद की श्रृंखला असेंबली में विलयन और युग्मन दर बढ़ाने के लिए घुलनशील निर्माण खंडों के रूप में कार्य करते हैं। स्यूडोप्रोलिन मुक्त अमीनो एसिड के एल्डिहाइड या कीटोन के साथ प्रतिक्रिया करके प्राप्त किए जाते हैं। एन-टर्मिनल स्यूडोप्रोलिन युक्त बढ़ती पेप्टाइड श्रृंखला में एमिनो एसिड व्युत्पन्न के युग्मन के परिणामस्वरूप आमतौर पर ऑक्साज़ोलिडीन (थियाज़ोलिडीन) वलय प्रणाली की स्टेरिक रूप से बाधित प्रकृति और नाइट्रोजन परमाणु की न्यूक्लिओफिलिसिटी में कमी के कारण कम पैदावार होती है। नतीजतन, पेप्टाइड संश्लेषण में उपयोग के लिए एफ. एम. ओ. सी.-एक्स. ए. ए. 1-ओ. एच./टी. एच. एच.-ओ. एच. प्रकार के उपयुक्त रूप से संरक्षित डाइपेप्टाइड व्युत्पन्नों का पूर्वरूपण बेहतर है। ऑक्साज़ोलिडीन-और थियाज़ोलिडीन-रिंग-युक्त डाइपेप्टाइड व्युत्पन्न तैयार करने के लिए दो वैचारिक रूप से अलग-अलग दृष्टिकोण संभव हैंः (1) एसिड फ्लोराइड या एन-कार्बोक्सीयनहाइड्राइड (एन. सी. ए.) का उपयोग करके सेर-या थ्र-व्युत्पन्न ऑक्साज़ोलिडीन या सिस-व्युत्पन्न थियाज़ोलिडीन का इन सीटू एसिलेशन; और (2) सी-टर्मिनल सेर या थ्र युक्त डाइपेप्टाइड्स (पोस्ट-इंसर्शन) में ऑक्साज़ोलिडीन सिस्टम का सीधा सम्मिलन। चयन की विधि वेलआई के रूप में स्यूडोप्रोलिन की प्रकृति पर निर्भर करती है जैसा कि चक्रीय प्रणाली के सी2 में प्रतिस्थापन पर निर्भर करती है। लाभ स्यूडोप्रोलिन सिंथेटिक पेप्टाइड्स की गुणवत्ता में सुधार के लिए एक शक्तिशाली उपकरण है। स्यूडोप्रोलिन डाइपेप्टाइड्स ने लंबे और कठिन दोनों पेप्टाइड्स के संश्लेषण के लिए सफलता दर में बहुत वृद्धि की है। स्यूडोप्रोलिन डाइपेप्टाइड्स को अन्य एमिनो एसिड व्युत्पन्न के समान ही पेश किया जा सकता है। सेरीन और थ्रेओनिन युक्त पेप्टाइड्स के एफ. एम. ओ. सी. ठोस चरण पेप्टाइड संश्लेषण (एस. पी. पी. एस.) में स्यूडोप्रोलिन (ऑक्साज़ोलिडीन) डाइपेप्टाइड्स के नियमित उपयोग से कच्चे उत्पादों की गुणवत्ता और उपज में उल्लेखनीय सुधार होता है और विफल अनुक्रमों के अनावश्यक दोहराव संश्लेषण से बचने में मदद मिलती है। स्यूडोप्रोलिन डाइपेप्टाइड्स विशेष रूप से अव्यवहारिक पेप्टाइड्स, लंबे पेप्टाइड्स/छोटे प्रोटीन और चक्रीय पेप्टाइड्स के संश्लेषण में प्रभावी साबित हुए हैं, जो कई मामलों में पेप्टाइड्स के उत्पादन को सक्षम करते हैं जो अन्यथा नहीं बनाए जा सकते थे। इन डाइपेप्टाइड्स का उपयोग करना बेहद आसान हैः बस एक सेरीन या थ्रेओनिन अवशेष को उपयुक्त स्यूडोप्रोलिन डाइपेप्टाइड के साथ पेप्टाइड अनुक्रम में पूर्ववर्ती एमिनो एसिड अवशेष के साथ प्रतिस्थापित करें (अपनी दाहिनी ओर की आकृति देखें)। मूल अनुक्रम को दरार और संरक्षण पर पुनः उत्पन्न किया जाता है। अनुप्रयोग हाल के वर्षों में, कई पेप्टाइड्स, जैसे टी-20 (जिसे डी. पी. 178 भी कहा जाता है), एप्टिफाइबेटाइड, ज़िकोनोटाइड, प्राम्लिंटाइड, एक्सेनाटाइड और बिवालिरुडिन को यू. एस. खाद्य और औषधि प्रशासन द्वारा अनुमोदित किया गया है और विभिन्न बीमारियों के उपचार में उपयोग के लिए बाजार में उपलब्ध हैं। इससे भी महत्वपूर्ण बात यह है कि 2004 के अंत में, 600 से अधिक पेप्टाइड या तो विकास या उन्नत पूर्व-नैदानिक चरणों में थे। सुधार परंपरागत रूप से, ठोस-चरण संश्लेषण सभी प्रकार के पेप्टाइड्स के संश्लेषण के लिए पॉलीस्टीरिन-आधारित रेजिन पर निर्भर करता है। हालाँकि, उनकी उच्च हाइड्रोफोबिसिटी के कारण, इन रेजिन की कुछ सीमाएँ हैं, विशेष रूप से जटिल पेप्टाइड्स के संश्लेषण में, और ऐसे मामलों में, पॉलीइथिलीन ग्लाइकोल (पी. ई. जी.) आधारित रेजिन अक्सर बेहतर परिणाम देते पाए जाते हैं। जटिल पेप्टाइड्स की असेंबली में तेजी लाने के लिए एक और शक्तिशाली रणनीति सूडोप्रोलिन डाइपेप्टाइड्स को नियोजित करना है। ये व्युत्पन्न श्रृंखलाओं के बीच बातचीत को बाधित करते हैं जो आमतौर पर समग्र अनुक्रमों में खराब युग्मन पैदावार का कारण होते हैं। 40 एमिनो एसिड अवशेषों तक लगभग सभी पेप्टाइड्स के संश्लेषण के लिए रासायनिक उपकरणों का एक बड़ा शस्त्रागार अब उपलब्ध है। हालांकि, कई छोटे आकार के पेप्टाइड्स और कई बड़े पेप्टाइड्स और/या प्रोटीन अभी भी शास्त्रीय तरीकों से उपलब्ध नहीं हैं। हाल ही में, RANTES (24-91) का एक कुशल चरणबद्ध ठोस-चरण संश्लेषण प्रकाशित किया गया था। आर. ए. एन. टी. ई. एस. सी. डी. 8 + टी कोशिकाओं द्वारा उत्पादित एक प्रमुख एच. आई. वी-दमनकारी कारक है। सेरीन प्रोटीज CD26/डाइपेप्टिडाइल-पेप्टिडेज IV (CD26/DPP IV) RANTES (1-91) से RANTES (24-91) तक एक NH2-टर्मिनल ट्रंकेशन को प्रेरित करता है, जो एक एम-उष्णकटिबंधीय एचआईवी-1 स्ट्रेन द्वारा मोनोसाइट्स के संक्रमण को रोकता है। यह विधि पी. ई. जी. आधारित केममैट्रिक्स राल और स्यूडोप्रोलिन डाइपेप्टाइड्स के लाभों को जोड़ती है। स्यूडोप्रोलिन मोनोमर के लिए सीधा युग्मन। सेनको और उनके सहयोगियों ने सबसे पहले पॉलीपेप्टाइड संश्लेषण में व्यक्तिगत, एकल अवशेषों के सूडोप्रोलिन व्युत्पन्न की प्रभावशीलता की पुष्टि की। साहित्य के अनुसार, सेर (ेडिबिप्रो) का रूपांतरण उत्कृष्ट था, हालांकि थ्र (िडिबिप्रो) एक विस्तृत श्रृंखला में भिन्न था। स्यूडोप्रोलिन मोनोमर का एसिलेशन एसिलेटिंग अवशेष की रासायनिक प्रकृति पर भी निर्भर करता था। माने और उनके सहयोगियों ने सफलतापूर्वक एक मानव विकास हार्मोन (एच. जी. एच.)-व्युत्पन्न पॉलीपेप्टाइड का संश्लेषण किया, जिसे प्राप्त करना पहले से ही चुनौतीपूर्ण था, जिसमें सेर (एस. सी. पी. ओ.) का उपयोग किया गया था, जबकि जे. आर. 10 ने थ्र (एस. सी. पी. ओ.) का उपयोग किया था। सेन्को एट अल पर निर्माण। Szaniszló और सहकर्मियों के काम ने हाल ही में Thr की एसिलेटिंग दक्षता में सुधार किया है और इसे अपने निरंतर प्रवाह पेप्टाइड सिंथेसाइज़र में शामिल किया है। प्रोलाइन पेप्टिडोमिमेटिक्स (जैसे पेप्टोइड्स और β-पेप्टाइड्स) पेप्टाइड्स से संबंधित अणु हैं, लेकिन अलग-अलग गुणों के साथ। पेप्टाइड संश्लेषण अनुवाद राइबोसोम संदर्भ चक्रीय अमीनो एसिड पेप्टाइड्स