OpenAtom
ओपन एटम सुपरकम्प्यूटर पर अनुकरण के लिए चार्म + + में लिखा गया एक व्यापक समानांतर क्वांटम रसायन विज्ञान अनुप्रयोग है। इसके विकासात्मक संस्करण को लीनसीपी कहा जाता था। भौतिक विज्ञान, रसायन विज्ञान, ठोस-अवस्था भौतिकी और जैवभौतिकी में कई महत्वपूर्ण समस्याओं के लिए मौलिक क्वांटम यांत्रिक सिद्धांतों पर आधारित एक प्रतिरूपण दृष्टिकोण की आवश्यकता होती है। एक विशेष दृष्टिकोण जो अपेक्षाकृत कुशल और उपयोगी साबित हुआ है वह है कार-पैरिनेलो एब इनिशियो मॉलिक्यूलर डायनामिक्स (सी. पी. ए. आई. एम. डी.)। इसका व्यापक रूप से सैकड़ों से हजारों परमाणुओं से युक्त प्रणालियों का अध्ययन करने के लिए उपयोग किया जाता है। सी. पी. ए. आई. एम. डी. संगणनाओं में उच्च संचार ओवरहेड के साथ कई परस्पर निर्भर चरण शामिल हैं जिनमें कई समवर्ती विरल 3डी फास्ट फूरियर ट्रांसफॉर्म (3डी-एफ. एफ. टी.), गैर-वर्ग मैट्रिक्स गुणन और कुछ समवर्ती घने 3डी-एफ. एफ. टी. शामिल हैं। विभिन्न उप-संगणनों के बीच जटिल निर्भरताओं के कारण कुछ सौ प्रोसेसरों से परे इस दृष्टिकोण का समानांतरकरण चुनौतीपूर्ण है, जो जटिल संचार अनुकूलन और भार संतुलन समस्याओं का कारण बनता है। चार्म + + और प्रोसेसर वर्चुअलाइजेशन की इसकी अवधारणा का उपयोग करते हुए, चरणों को कई आभासी प्रोसेसरों में अलग किया जाता है, जो बदले में, भौतिक प्रोसेसरों पर लचीले ढंग से मैप किए जाते हैं, जिससे काम के महत्वपूर्ण इंटरलीविंग की अनुमति मिलती है। इंटरलीविंग को वास्तुकला की दृष्टि से स्वतंत्र तरीकों और नेटवर्क टोपोलॉजी जागरूक मानचित्रण तकनीकों दोनों के माध्यम से बढ़ाया जाता है। ओपन एटम ने आई. बी. एम. ब्लू जीन/क्यू के 262,144 कोर और ब्लू वाटर्स के 131,072 कोर, एन. सी. एस. ए. में एक क्रे एक्स. ई. 6/एक्स. के. 7 प्रणाली तक अच्छा विस्तार दिखाया है। ओपन एटम वेबपेज पर डाउनलोड करने के लिए ओपन एटम मुफ्त में उपलब्ध है। प्रकाशित लेख वेबसाइट पर भी पाए जा सकते हैं। चार्म + + एनएएमडी क्वांटम केमिस्ट्री और सॉलिड स्टेट फिजिक्स सॉफ्टवेयर की सूची बाहरी लिंक ओपन एटम लीनसीपी चार्म + + पाईनी एम. डी. कम्प्यूटेशनल केमिस्ट्री सॉफ्टवेयर आणविक गतिकी सॉफ्टवेयर भी देखें।