Microbiome-wide association study
माइक्रोबायोम-वाइड एसोसिएशन स्टडी (एम. डब्ल्यू. ए. एस.), जिसे अन्यथा मेटाजेनम-वाइड एसोसिएशन स्टडी (एम. जी. डब्ल्यू. ए. एस.) के रूप में जाना जाता है, एक सांख्यिकीय पद्धति है जिसका उपयोग विभिन्न जीवों में एक परिभाषित माइक्रोबायोम के पूर्ण मेटाजेनम की जांच करने के लिए किया जाता है ताकि यह निर्धारित किया जा सके कि क्या माइक्रोबायोम की कुछ विशेषता (उदाहरण के लिए, जीन या प्रजाति) एक मेजबान विशेषता से जुड़ी है। एम. डब्ल्यू. ए. एस. को व्यापक रूप से उपयोग किए जाने वाले जीनोम-वाइड एसोसिएशन अध्ययन (जी. डब्ल्यू. ए. एस.) से मेटाजेनॉमिक्स के क्षेत्र द्वारा अपनाया गया है। जबकि एम. डब्ल्यू. ए. एस. ध्वन्यात्मक और वैचारिक रूप से जी. डब्ल्यू. ए. एस. से जुड़ा हुआ है, कई प्रमुख अंतर हैंः मानव जीनोम की तुलना में माइक्रोबायोम में लगभग 150 गुना अधिक जीन हैं। जी. डब्ल्यू. ए. एस. को केवल प्रजातियों के गुणसूत्रों की पूर्वनिर्धारित संख्या के साथ महत्वपूर्ण रूप से संबंधित जीन का पता लगाना चाहिए। दूसरी ओर, एम. डब्ल्यू. ए. एस. को विश्लेषण करना चाहिए, हालांकि कई विशेषताएँ अनिर्धारित संख्या में सूक्ष्मजीवों में हैं। नतीजतन, कई परीक्षण समस्याओं का सामना करने की बहुत अधिक संभावना है। जबकि मेजबान आबादी में जीनोम पर जीन का एक अपेक्षाकृत समान संग्रह होता है, किसी भी दिए गए माइक्रोबायोम की आनुवंशिक भिन्नता विभिन्न मेजबानों और वातावरण के बीच काफी भिन्न हो सकती है। माइक्रोबायोम का जीनोम किसी दिए गए मेजबान में अस्थायी रूप से भी भिन्न हो सकता है जबकि जी. डब्ल्यू. ए. एस. में मेजबान का जीनोम उनके पूरे जीवनकाल में तय होता है। प्राप्त माइक्रोबायोम डेटासेट स्वाभाविक रूप से संरचनात्मक और अंतःक्रियात्मक होते हैं। यह धारणा कि एक यूक्लिडियन स्थान में जीन मौजूद हैं, संरचनात्मक डेटा की गैर-रैखिक प्रकृति द्वारा उल्लंघन किया जाता है। एम. डब्ल्यू. ए. एस. में माइक्रोबायोम की किस विशेषता का उपयोग किया जाएगा, इसे वर्गीकृत करने के कई तरीके हैं। एम. डब्ल्यू. ए. एस. का आकलन एक विशिष्ट वर्गीकरण स्तर (प्रजाति, वंश, जाति आदि) का उपयोग करके किया जा सकता है। ), ऑपरेशनल टैक्सोनोमिक यूनिट (ओटीयू) या एम्प्लिकन सीक्वेंस वैरिएंट (एएसवी), ट्रांसक्रिप्टोम, प्रोटिओम, और बहुत कुछ। प्रयुक्त दृष्टिकोण अनुसंधान परिकल्पना पर निर्भर करता है क्योंकि प्रत्येक विधि अक्सर अलग-अलग परिणाम देती है। अक्सर, एक वर्गीकरण स्तर या ओटीयू/एएसवी आधारित दृष्टिकोण का उपयोग विशिष्ट माइक्रोबायोम विशेषता और वांछित फेनोटाइप के बीच सहसंबंध निर्धारित करने के लिए किया जाता है। कई विधियों का उपयोग किया जा सकता है, जैसे कि मशीन लर्निंग दृष्टिकोण जैसे यादृच्छिक वन, और गहन शिक्षण। डी. ई. एस. ई. क्यू. 2 और ए. एन. सी. ओ. एम. जैसे कार्यक्रमों के साथ फीचर एसोसिएशन भी स्थापित किया जा सकता है। हालाँकि, उपलब्ध उपकरणों की विस्तृत श्रृंखला द्वारा स्थापित सहसंबंध हमेशा कार्य-कारण में परिवर्तित नहीं हो सकते हैं। शोधकर्ता अनुक्रमिक परीक्षण के माध्यम से कार्य-कारण निर्धारित करते हैं। संदर्भ मेटाजेनॉमिक्स