Transmembrane protein 89
ट्रांसमेम्ब्रेन प्रोटीन 89 (टी. एम. ई. एम. 89) एक प्रोटीन है जिसे मनुष्यों में टी. एम. ई. एम. 89 जीन द्वारा कूटबद्ध किया जाता है। जीन संरचना TMEM89 जीन गुणसूत्र 3 (3p21.31) के माइनस स्ट्रैंड पर 48,658,192 से 48,659,288 तक पाया जाता है और 1,011 न्यूक्लियोटाइड्स लंबा होता है। जीन में दो एक्सोन होते हैं। इन दोनों एक्सॉन के वैकल्पिक रूप से विभाजित होने की भविष्यवाणी नहीं की गई है। जीन अभिव्यक्ति TMEM89 जीन वृषण में सबसे अधिक व्यक्त किया जाता है। टी. एम. ई. एम. 89 अन्य ऊतकों जैसे पेट, गुर्दे, हृदय, अंडाशय, थायराइड, बृहदान्त्र, अस्थि मज्जा और अधिवृक्क ऊतकों में भी निम्न स्तर पर व्यक्त किया जाता है। यह जीन भ्रूण के हृदय, पेट, गुर्दे और आंतों के ऊतकों में भी व्यक्त किया जाता है। इम्यूनोहिस्टोकेमिस्ट्री डेटा ने बृहदान्त्र, फैलोपियन ट्यूब, गुर्दे और वृषण ऊतकों की कोशिका झिल्ली में स्थित टी. एम. ई. एम. 89 भी पाया है। टी. एम. ई. एम. 89 जीन की अभिव्यक्ति भी एक माउस सेरिबैलम से मस्तिष्क के ऊतकों में कम मात्रा में पाई गई है। जीन अभिव्यक्ति पड़ोस मानव टी. एम. ई. एम. 89 मानव प्रोटीन एटलस अभिव्यक्ति समूह 23: शुक्राणु-फ्लैगेलम और गोल्गी संगठन का एक हिस्सा है। 15 निकटतम अभिव्यक्ति पड़ोसियों में ओआर4एम1, एएनटीएक्सआरएल, टीजीआईएफ2एलएक्स, सीपीएक्ससीआर1, सी3ओआरएफ84, सीएक्सओआरएफ66, सीएलडीएन17, सी11ओआरएफ94, यूएसपी50, एसपीडीवाईई4, एमएमपी20, एसएसएमईएम1, सी17ओआरएफ98, एसपीएसीए1 और एलवाईजेडएल1 शामिल हैं। अमर एच. आई. पी. ओ. डी. लाइन कोशिकाओं की तुलना में अम्नीओटिक द्रव व्युत्पन्न एच. ए. के. पी. सी.-पी कोशिकाओं में विभेदक जीन अभिव्यक्ति टी. एम. ई. एम. 89 अभिव्यक्ति बहुत अधिक होती है। टी. एम. ई. एम. 89 अभिव्यक्ति उन कोशिकाओं में अधिक होती है जिनमें मैक्रोफेज माइग्रेशन इनहिबिटोरी फैक्टर (एम. आई. एफ.) नियंत्रण की तुलना में कम हो जाता है। टी. एम. ई. एम. 89 अभिव्यक्ति मानव भ्रूण स्टेम कोशिकाओं से कार्डियोमायोसाइट्स में सबसे कम है, मानव भ्रूण स्टेम कोशिकाओं में अभिव्यक्ति की तुलना में, धड़कते कार्डियोमायोसाइट्स के साथ भ्रूण निकाय, और भ्रूण के दिल से कार्डियोमायोसाइट्स। नैदानिक महत्व टी. एम. ई. एम. 89 की जीन अभिव्यक्ति को ऊपरी पथ मूत्रमार्ग कार्सिनोमा में विनियमित पाया गया था, और इसलिए इस प्रकार के कार्सिनोमा के लिए एक संभावित बायोमार्कर स्रावी प्रोटीन के रूप में भविष्यवाणी की गई थी। टी. एम. ई. एम. 89 जीन को एस. एन. पी. विश्लेषण में ऑटिज्म स्पेक्ट्रम विकार की गंभीरता का एक संभावित परिवर्तक पाया गया था। टी. एम. ई. एम. 89 की जीन अभिव्यक्ति का उपयोग एक मॉडल में भी किया गया था जो चरण 1 वृषण रोगाणु कोशिका ट्यूमर में संभावित पुनरावृत्ति के लिए जोखिम स्कोर की भविष्यवाणी करता था। प्रोटीन संरचना प्राथमिक मानव टी. एम. ई. एम. 89 प्रोटीन 159 एमिनो एसिड लंबा होता है। इस प्रोटीन का आणविक द्रव्यमान ~ 17.5kDa और एक आइसोइलेक्ट्रिक बिंदु ~ 10 पी. आई. है। अधिक बुनियादी पी. आई. वाले प्रोटीन आमतौर पर माइटोकॉन्ड्रिया या प्लाज्मा झिल्ली से जुड़े होते हैं और उनमें कम प्रोटीन अंतःक्रिया होती है। प्रोटीन संरचना में दो टोपोलॉजिकल डोमेन (एक्स्ट्रासेलुलर और साइटोप्लाज्मिक) और एक हेलिकल ट्रांसमेम्ब्रेन डोमेन होते हैं। मानव टी. एम. ई. एम. 89 प्रोटीन एमिनो एसिड हिस्टिडीन, ल्यूसीन और ट्रिप्टोफैन से भरपूर होता है। एमिनो एसिड एस्पार्टेट, एस्पेराजिन और फेनिलएलनिन मानव टी. एम. ई. एम. 89 प्रोटीन में कम मात्रा में मौजूद होते हैं। ई. डी. जैसे एमिनो एसिड पैटर्न मानव टी. एम. ई. एम. 89 प्रोटीन में कम मात्रा में मौजूद होते हैं, जबकि के. आर.-ई. डी. पैटर्न उच्च मात्रा में मौजूद होता है। मानव टी. एम. ई. एम. 89 प्रोटीन के बाह्य कोशिकीय क्षेत्र के भीतर, नियमित अंतराल के साथ 3 सिस्टीन होते हैं। साइटोप्लाज्मिक डोमेन में, अमीनो एसिड 3-5 और 25-27 से दो सकारात्मक अमीनो एसिड रन होते हैं। इन विभिन्न अमीनो एसिड पैटर्न और प्रोटीन डोमेन को दाईं ओर के आंकड़ों में देखा जा सकता है। द्वितीयक टी. एम. ई. एम. 89 प्रोटीन केवल α-हेलिक्स और स्ट्रैंड से बना होता है। α-हेलिक्स तीनों क्षेत्रों में पूरे प्रोटीन में वितरित किए जाते हैं। तृतीयक मानव टी. एम. ई. एम. 89 की तृतीयक संरचना की भविष्यवाणी अल्फाफोल्ड और आई-टैसर सॉफ्टवेयर का उपयोग करके की गई थी। इन संरचनाओं को दाईं ओर देखा जा सकता है। अनुवाद के बाद के संशोधन टी. एम. ई. एम. 89 प्रोटीन में एमिनो एसिड 47-52 से एक अनुमानित एन-मिरिस्टिलेशन साइट, एमिनो एसिड 106-111 से एक अनुमानित एस. आर. सी. होमोलॉजी 3 (एस. एच. 3) बाइंडिंग डोमेन और एमिनो एसिड एस117 पर एक संरक्षित अनुमानित फॉस्फोराइलेशन साइट है। एन-मिरिस्टिलेशन एक प्रोटीन लिपिड संशोधन है जिसकी भूमिका प्रोटीन-प्रोटीन अंतःक्रिया, कोशिका संकेत, और एंडोमेम्ब्रेन और प्लाज्मा झिल्ली के लिए प्रोटीन को लक्षित करने में होती है। एसएच3 बाइंडिंग डोमेन वाले प्रोटीन आमतौर पर सिग्नल ट्रांसडक्शन पाथवे, साइटोस्केलेटन संगठन, झिल्ली तस्करी, या ऑर्गेनेल असेंबली में शामिल होते हैं। प्रोटीन फॉस्फोराइलेशन एक महत्वपूर्ण प्रक्रिया है जिसमें संकेत पारगमन, प्रोटीन संश्लेषण, कोशिका विभाजन, कोशिका वृद्धि, विकास और उम्र बढ़ना शामिल है। अंतःक्रिया मानव टी. एम. ई. एम. 89 प्रोटीन सी4ए, आर. बी. एम. 15बी, जी. ओ. एल. जी. ए. 6ए, पी. एफ. के. एफ. बी. 4, डी. ओ. सी. के. 3, एम. ए. पी. के. ए. पी. के. 3, जेड. एन. एफ. 557 और जेड. बी. टी. बी. 47 प्रोटीन के साथ अंतःक्रिया करता है। होमोलॉग ऑर्थोलॉग टी. एम. ई. एम. 89 के ऑर्थोलॉग केवल स्तनधारियों में पाए जाते हैं। मोनोट्रेम एकमात्र स्तनधारी वर्गीकरण है जिसमें टी. एम. ई. एम. 89 ऑर्थोलॉग नहीं होता है। नीचे मानव टी. एम. ई. एम. 89 के कुछ अर्थोलॉग के बारे में जानकारी के साथ एक तालिका दी गई है। इन ऑर्थोलॉग का उपयोग कई अनुक्रम संरेखण और दाईं ओर एन-मिरिस्टिलेशन साइट संरेखण बनाने के लिए किया गया था। मानव टी. एम. ई. एम. 89 प्रोटीन के कोशिका द्रव्य और बाह्य कोशिकीय क्षेत्रों के भीतर संरक्षित क्षेत्र क्षेत्र सबसे अधिक संरक्षित प्रतीत होते हैं, जैसा कि दाईं ओर के आंकड़ों में देखा गया है। इनमें से कुछ संरक्षित अमीनो एसिड साइटोप्लाज्मिक और बाह्य कोशिकीय क्षेत्रों में α-हेलिक्स का हिस्सा हैं। मानव गुणसूत्र 3 पर संदर्भ जीन