C13orf46
गुणसूत्र 13 ओपन रीडिंग फ्रेम 46 एक प्रोटीन है जिसे मनुष्यों में C13orf46 जीन द्वारा कूटबद्ध किया जाता है। मनुष्यों में, C13orf46 फेफड़ों, पेट, प्रोस्टेट, प्लीहा और थाइमस सहित ऊतकों में निम्न स्तर पर सर्वव्यापी रूप से व्यक्त किया जाता है। यह जीन आठ वैकल्पिक रूप से विभाजित एम. आर. एन. ए. प्रतिलेखों को कूटबद्ध करता है, जो पाँच अलग-अलग प्रोटीन समरूपों का उत्पादन करते हैं। C13orf46 का एक वैकल्पिक नाम LOC100507747 है। C13orf46 47,563 आधार जोड़े में फैला हुआ है, जिसमें 11 एक्सोन हैं, और 13q34 पर गुणसूत्र 13 के माइनस स्ट्रैंड पर है। जीन पड़ोसी C13orf46 के आसपास के पड़ोसी जीनों में LINC00454, LINC00452, स्विन्ग, आर. ए. एस. ए. 3 और एल. ओ. सी. 124903221 शामिल हैं। एल. आई. एन. सी. 00454 और एल. आई. एन. सी. 00452 (लॉन्ग इंटरजेनिक नॉनप्रोटीन कोडिंग आर. एन. ए. 454 और 452) दोनों लंबे गैर-कोडिंग आर. एन. ए. (एल. एन. सी. आर. एन. ए.) हैं जो एपिजेनेटिक जीन अभिव्यक्ति, क्रोमैटिन रीमॉडलिंग और जीन प्रतिलेखन और अनुवाद के स्तर को नियंत्रित करते हैं। LINC00454 और LINC00452 दोनों अभिव्यक्ति वृषण तक ही सीमित हैं। LINC00454 को कारक X की कमी से जोड़ा गया है जबकि LINC00452 को डिम्बग्रंथि कार्सिनोजेनेसिस को बढ़ावा देने के लिए पाया गया है। स्विंगन (एस. डब्ल्यू. आई./एस. एन. एफ. कॉम्प्लेक्स इंटरैक्टिंग जी. ए. एस. 6 एनहांसर नॉन-कोडिंग आर. एन. ए.) भी एक एल. एन. सी. आर. एन. ए. है जो सी13ओ. आर. एफ. 46 के पड़ोसी है। स्विंगन क्रोमैटिन के मैट्रिक्स से जुड़े और एक्टिन पर निर्भर नियामकों के साथ बातचीत करके जी. ए. एस. 6 (ग्रोथ अरेस्ट स्पेसिफिक 6) ऑन्कोजीन के सक्रियण को नियंत्रित करता है। आर. ए. एस. ए. 3 (आर. ए. एस. पी. 21 प्रोटीन सक्रियक 3) जीन रास जी. टी. पी. एस. सक्रियकारी प्रोटीन को कूटबद्ध करता है। यह प्रोटीन रास पी21 की गतिविधि को उत्तेजित करने के लिए इनोसिटोल 1,3,4,5-टेट्राकिसफॉस्फेट को बांधता है और रास संकेत मार्ग को नकारात्मक रूप से नियंत्रित करता है। आर. ए. एस. ए. 3. सबसे अधिक वसा, लिम्फ नोड्स और प्लीहा में व्यक्त किया जाता है। एन्कोडेड प्रोटीन को कोशिका झिल्ली में स्थानीयकृत किया जाता है। एम. आर. एन. ए. सी13ओ. आर. एफ. 46 के लिए आठ अलग-अलग प्रतिलेख रूपों की पहचान की गई है। इन प्रतिलेख रूपों को वैकल्पिक रूप से 11 अलग-अलग एक्सॉनों की विविधताओं को शामिल करने के लिए जोड़ा जाता है। अनुवादित विभिन्न प्रतिलेखन प्रकार के आधार पर, 5 अलग-अलग संभावित प्रोटीन समरूपों को C13orf46 द्वारा कूटबद्ध किया जाता है। C13orf46 द्वारा कूटबद्ध सबसे आम प्रोटीन उत्पाद आइसोफॉर्म 1 है, जो 212 एमिनो एसिड लंबा है। प्रोटीन C13orf46 जीन के प्राथमिक प्रोटीन आइसोफॉर्म में 212 एमिनो एसिड होते हैं। सबसे लंबा कूटबद्ध समरूप, जिसे C13orf46 प्रोटीन समरूप X1 के रूप में जाना जाता है, 624 एमिनो एसिड लंबा है। C13orf46 जीन द्वारा कूटबद्ध अन्य प्रोटीन समरूप C13orf46 प्रोटीन के इन दो संस्करणों में से किसी एक के समान हैं। प्राथमिक 212 एमिनो एसिड प्रोटीन के विभिन्न रूपों को प्रतिलेखन प्रकार 1, X5, X6 और X7 द्वारा कूटबद्ध किया जाता है। सबसे लंबे C13orf46 प्रोटीन आइसोफॉर्म के परिवर्तनों को ट्रांसक्रिप्ट संस्करण X1, X2, X3 और X4 द्वारा कूटबद्ध किया जाता है। प्रोटीन आइसोफॉर्म 1 गुण और संरचना C13orf46 आइसोफॉर्म 1 का सैद्धांतिक आइसोइलेक्ट्रिक बिंदु 4.84 है और अनुमानित आणविक भार 23.4 kDA है। इस आइसोफॉर्म के भीतर ग्लूटामिक एसिड (15.1%) और एस्पार्टिक एसिड (7.5%) की उच्च सापेक्ष मात्रा पाई जाती है, जबकि अमीनो एसिड फेनिललैनिन (0.9%) और थ्रेओनिन (0.5%) प्रोटीन संरचना के भीतर कम प्रचुर मात्रा में पाए जाते हैं। C13orf46 आइसोफॉर्म 1 में एक ग्लूटामिक एसिड समृद्ध क्षेत्र भी होता है जहाँ कई ग्लूटामिक एसिड और लाइसिन डबल्ट मौजूद होते हैं, जिनमें से कुछ साथ-साथ होते हैं। कुल मिलाकर प्रोटीन के भीतर कुल 14 गुणक पाए जाते हैं, जिनमें से 12 आवेशित होते हैं। C13orf46 आइसोफॉर्म 1 में कोई चार्ज क्लस्टर, हाइड्रोफोबिक खंड या ट्रांसमेम्ब्रेन खंड होने की भविष्यवाणी नहीं की गई है। संरचना C13orf46 प्रोटीन आइसोफॉर्म 1 में यादृच्छिक मुक्त कुंडल के क्षेत्रों के अलावा 7 अल्फा हेलिक्स और 2 बीटा स्ट्रैंड शामिल होने की भविष्यवाणी की गई है। C13orf46 आइसोफॉर्म 1 में दो पहचाने गए अव्यवस्थित क्षेत्र हैं जो अमीनो एसिड अवशेष 1 से 148 और 168 से 190 के बीच फैले हुए हैं। इसके अलावा, C13orf46 आइसोफॉर्म 1 में एक ग्लूटामिक एसिड समृद्ध क्षेत्र है जो एमिनो एसिड अवशेष 109 से 191 तक फैला हुआ है। विनियमन और अनुवाद के बाद के संशोधनों सी13ओआरएफ46 आइसोफॉर्म 1 में कई अनुवाद के बाद के संशोधनों जैसे कि फॉस्फोराइलेशन, ओ-जीएलसीएनएसाइलेशन, म्यूसिन प्रकार गैलएनएसी ओ-ग्लाइकोसिलेशन, पाल्मिटोयलेशन और सुमॉयलेशन से गुजरने की भविष्यवाणी की गई है। पी. के. ए., पी. के. सी., सी. के. आई. आई., पी. के. जी., जी. एस. के. 3, सी. डी. सी. 2, आर. एस. के. और ए. टी. एम. ऐसे काइनेस हैं जो मानव सी13ओ. आर. एफ. 46 आइसोफॉर्म 1 को बांधते हैं और फॉस्फोरिलेट करते हैं। प्रोटीन पर एक अनुमानित फॉस्फोप्रोटीन-बाध्यकारी फॉस्फोसाइट भी है। प्रोटीन आइसोफॉर्म X1 गुण C13orf46 आइसोफॉर्म X1 का सैद्धांतिक आइसोइलेक्ट्रिक बिंदु 9.33 है और अनुमानित आणविक भार 66.7 kDA है। C13orf46 आइसोफॉर्म X1 प्रोटीन में अन्य मानव प्रोटीन की तुलना में सेरीन (18.4%) और ल्यूसीन (18.8%) की सापेक्ष मात्रा बहुत अधिक होती है और इसमें प्रोलिन (14.4%) की मात्रा भी अधिक होती है। प्रोटीन के भीतर लगभग समान मात्रा में सेरीन और ल्यूसीन पाए जाते हैं। C13orf46 आइसोफॉर्म X1 प्रोटीन भी ग्लूटामिक एसिड (1.3%), फेनिललैनिन (0.3%) और लाइसिन (0.5%) की सामान्य मात्रा से कम मात्रा से बना होता है और इसमें वेलिन (2.4%) की मात्रा भी कम होती है। एस्पेराजिन C13orf46 आइसोफॉर्म X1 प्रोटीन के भीतर नहीं पाया जाता है। इस समरूप के भीतर, 100 अमीनो एसिड गुणक पाए जाते हैं, जिनमें से 5 आवेशित होते हैं। प्रोटीन के भीतर कोई आवेश समूह, हाइड्रोफोबिक खंड या ट्रांसमेम्ब्रेन डोमेन की भविष्यवाणी नहीं की जाती है। संरचना C13orf46 आइसोफॉर्म X1 में अल्फा हेलिक्स, बीटा शीट और मुक्त यादृच्छिक कुंडल क्षेत्रों का संयोजन होने की भविष्यवाणी की गई है। C13orf46 आइसोफॉर्म X1 की अनुमानित संरचना के भीतर 22 अनुमानित अल्फा हेलिसेस और 18 अनुमानित बीटा शीट्स हैं। C13orf46 आइसोफॉर्म X1 में 26 पुनरावृत्तियों की एक श्रृंखला होती है, जो अनुक्रम संरचना और लंबाई में भिन्न होती है। 26 चिन्हित पुनरावृत्ति अनुक्रमों में से, 14 अनुक्रमों में 20 अमीनो एसिड शामिल थे, जबकि 5 पुनरावृत्तियों में 21 अमीनो एसिड शामिल थे, 3 पुनरावृत्तियों में 22 अमीनो एसिड शामिल थे, और 4 पुनरावृत्तियां 23 अमीनो एसिड लंबी थीं। प्रत्येक पुनरावृत्ति अनुक्रम या तो एमिनो एसिड मेथियोनीन, आइसोल्यूसीन या ल्यूसीन के साथ होता है। 26 पुनरावृत्तियों के भीतर अमीनो एसिड की मुख्य अनुक्रम संरचना एम. एल. एल. एल. एस. टी. जी. सी. एस. एस. एस. पी. डी. ए. पी. एल. एच. क्यू है। 26 पुनरावृत्तियों का संरेखण इंगित करता है कि पुनरावृत्ति अनुक्रम का सबसे संरक्षित भाग एमिनो एसिड सेरीन के तीन गुना के साथ अनुक्रमों के बीच में होता है। डोमेन और रूपांकनों C13orf46 आइसोफॉर्म X1 में अमीनो एसिड अवशेष 69 से 87 के बीच एक अनुमानित डाइमराइजेशन डोमेन है। विनियमन और पोस्ट ट्रांसलेशनल संशोधन C13orf46 आइसोफॉर्म X1 में कई पोस्ट-ट्रांसलेशनल संशोधनों जैसे कि फॉस्फोराइलेशन, O-GlcNAसाइलेशन, म्यूसिन प्रकार GalNAc O-ग्लाइकोसिलेशन, पाल्मिटोयलेशन और सुमॉयलेशन से गुजरने की भविष्यवाणी की गई है। मानव सी13ओआरएफ46 आइसोफॉर्म एक्स1 प्रोटीन में 11 अनुमानित पीपीबीडी-विशिष्ट बाध्यकारी फॉस्फोसाइट भी हैं। 26 पुनरावृत्तियों में से 23 में से तीसरे सेरीन पर सबसे अधिक संरक्षित फॉस्फोराइलेशन स्थल होते हैं। पी. के. सी., पी. के. जी., पी. के. ए., पी. 38. एम. ए. पी. के., जी. एस. के. 3, डी. एन. ए. पी. के., सी. के. आई., सी. डी. के. 5, सी. के. आई. आई. और सी. डी. सी. 2 ऐसे काइनेस हैं जो मानव सी13ओ. एफ. 46 आइसोफॉर्म एक्स1 प्रोटीन को बांधते और फॉस्फोरिलेट करते हैं। अनुमानित फॉस्फोराइलेटेड स्थलों के भी ऐसे स्थल होने की भविष्यवाणी की गई है जहाँ ओ-ग्लाइकोसिलेशन हो सकता है। प्रोटीन अंतःक्रिया C13orf46 प्रोटीन आइसोफॉर्म X1 में MAPK और p38 अंतःक्रियाशील रूपांकनों के अलावा कई अनुमानित S-चरण साइक्लिन बंधन स्थल हैं। अभिव्यक्ति आर. एन. ए. अनुक्रमण से पता चलता है कि सी13ओ. आर. एफ. 46 की अभिव्यक्ति मध्यवर्ती स्तरों पर फेफड़ों, प्रोस्टेट, अग्न्याशय और पेट में सबसे अधिक देखी जाती है। C13orf46 में अस्थि मज्जा, प्लीहा, थायराइड, लिम्फ नोड, पित्ताशय और थाइमस में भी अभिव्यक्ति का स्तर कम होता है। कोशिकीय स्थानीयकरण C13orf46 आइसोफॉर्म 1 के ज्यादातर नाभिक के भीतर स्थानीयकृत होने की भविष्यवाणी की गई है। इस प्रोटीन आइसोफॉर्म को कोशिका झिल्ली पर भी स्थानीयकृत किया जा सकता है। C13orf46 आइसोफॉर्म X1 के ज्यादातर नाभिक या कोशिका द्रव्य के भीतर स्थानीयकृत होने की भविष्यवाणी की गई है। होमोलॉजी ऑर्थोलॉग्स C13orf46 जीन में मानव C13orf46 आइसोफॉर्म 1 प्रोटीन और C13orf46 आइसोफॉर्म X1 प्रोटीन के लिए ऑर्थोलॉग हैं, जो प्राइमेट, स्तनधारियों, पक्षियों, सरीसृपों, मछलियों और अकशेरुकी जीवों में पाए जाते हैं। मानव C13orf46 आइसोफॉर्म 1 प्रोटीन के लिए आइसोफॉर्म 1 ऑर्थोलॉग केवल नरवानर और स्तनधारियों में पाए जाने के लिए जाने जाते हैं, यह सुझाव देते हुए कि C13orf46 आइसोफॉर्म 1 प्रोटीन को एन्कोडिंग करने वाले C13orf46 जीन का यह हिस्सा लगभग 99 मिलियन साल पहले दिखाई दिया था। आइसोफॉर्म X1 मानव C13orf46 आइसोफॉर्म X1 प्रोटीन के लिए अनुमानित ऑर्थोलॉग प्राइमेट, स्तनधारियों, पक्षियों, सरीसृपों, मछलियों और बैक्टीरियल फाइलम लीजियोनेला के अकशेरुकी जीवों में पाए जाते हैं। पैरालॉग्स ह्यूमन C13orf46 आइसोफॉर्म X1 प्रोटीन में म्यूसिन, विशेष रूप से म्यूसिन-1 के बीच एक अनुमानित पैरालॉग है। म्यूसिन उपकला ऊतकों पर सुरक्षात्मक बलगम अवरोध बनाने में भूमिका निभाते हैं। एम. यू. सी. 1 जीन गुणसूत्र 1 पर 1क्यू22 पर स्थित होता है, जिसमें 11 एक्सोन होते हैं, और इसमें 22 अलग-अलग समरूप होते हैं। म्यूसिन अत्यधिक ओ-ग्लाइकोसिलेटेड होते हैं और इनमें प्रोलिन, सेरीन और थ्रेओनिन के साथ प्रचुर मात्रा में टेंडम रिपीट डोमेन होते हैं। दोहराए जाने वाले क्षेत्रों के आसपास सिस्टीन समृद्ध क्षेत्र हैं। म्यूसिन जीन हमेशा एक समान वंश को साझा नहीं करते हैं, अभिसारी विकास के लिए प्रवण होते हैं, और सामान्य विकासवादी इतिहास के बजाय उनकी कार्यक्षमता के आधार पर समूहीकृत होते हैं। संदर्भ