SCRN3
सेकर्निन-3 (एस. सी. आर. एन. 3) एक प्रोटीन है जिसे मानव एस. सी. आर. एन. 3 जीन द्वारा कूटबद्ध किया जाता है। एस. सी. आर. एन. 3 पेप्टिडेज़ सी69 परिवार और सेकर्निन उप-परिवार से संबंधित है। इस परिवार के एक हिस्से के रूप में, प्रोटीन से सिस्टीन-प्रकार की एक्सोपेप्टिडेज़ गतिविधि और डाइपेप्टिडेज़ गतिविधि को सक्षम करने के साथ-साथ प्रोटीयोलिसिस में शामिल होने की भविष्यवाणी की जाती है। यह मस्तिष्क, थायराइड और 25 अन्य ऊतकों में सर्वव्यापी रूप से व्यक्त किया जाता है। इसके अतिरिक्त, एस. सी. आर. एन. 3 स्तनधारियों, पक्षियों, मछलियों, उभयचरों और अकशेरुकी सहित विभिन्न प्रजातियों में संरक्षित है। एस. सी. आर. एन. 3 को कोशिका द्रव्य का एक अभिन्न घटक होने की भविष्यवाणी की गई है। जीन एस. सी. आर. एन. 3 को आमतौर पर एफ. एल. जे. 23142 और एस. ई. एस. 3 के रूप में भी जाना जाता है। लोकस होमो सेपियन्स सेकर्निन-3 (एस. सी. आर. एन. 3) एक प्रोटीन-कोडिंग जीन है। यह गुणसूत्र 2 पर पाया जा सकता है, जिसका विशिष्ट स्थान '+' स्ट्रैंड पर 2q31.1 है। जीन 33,846 आधार जोड़े लंबा होता है और इसमें 8 एक्सोन होते हैं। एस. सी. आर. एन. 3 प्रोटीन-कोडिंग जीन का सबसे आम प्रतिलेख प्रतिलेख संस्करण 1 है, जो 3052 आधार जोड़े लंबा है। एस. सी. आर. एन. 3 एक उच्च स्तर पर व्यक्त किया जाता है, जो इस रिलीज में औसत जीन का 2.4 गुना है। मानव एस. सी. आर. एन. 3 में 8 अलग-अलग समरूप हैं। अभिव्यक्ति एस. सी. आर. एन. 3 का एम. आर. एन. ए. मनुष्यों में मध्यम पाया गया। एस. सी. आर. एन. 3 अधिकांश प्रमुख ऊतकों में व्यक्त किया जाता है। एम. आर. एन. ए. अन्य ऊतकों के सापेक्ष मस्तिष्क, थायरॉइड, हृदय और प्रोस्टेट में थोड़े ऊंचे स्तर पर व्यक्त किया जाता है, हालांकि अंतर्निहित प्रवृत्ति विभिन्न ऊतकों के बीच अपेक्षाकृत सुसंगत सर्वव्यापी अभिव्यक्ति थी। चूहे के मस्तिष्क और भ्रूण दोनों के मूल स्थान पर संकरण में एस. सी. आर. एन. 3 के विश्लेषण में, मजबूत अभिव्यक्ति के कोई विशिष्ट क्षेत्र नहीं पाए गए, इसके बजाय एक मध्यम अभिव्यक्ति दिखाई दे रही थी, यह पुष्टि करते हुए कि एस. सी. आर. एन. 3 में अधिकांश ऊतकों के भीतर सर्वव्यापी अभिव्यक्ति होने की संभावना है। इम्यूनोहिस्टोकेमिस्ट्री डेटा ने यह भी संकेत दिया कि मानव एससीआरएन3 में कम ऊतक, एकल कोशिका, प्रतिरक्षा कोशिका और मस्तिष्क क्षेत्र की विशिष्टता होती है, जो एक बार फिर सर्वव्यापी अभिव्यक्ति के साक्ष्य को जोड़ती है। एस. सी. आर. एन. 3 जीन का प्रोटीन ट्रांसक्रिप्ट संस्करण 1 सबसे आम प्रोटीन आइसोफॉर्म, सेकर्निन-3 आइसोफॉर्म 1 को कूटबद्ध करता है, जो 424 एमिनो एसिड लंबा होता है। अपरिवर्तित एस. सी. आर. एन. 3 प्रोटीन का आणविक भार लगभग 48.413 के. डी. ए. है और एस. सी. आर. एन. 3 का सैद्धांतिक आइसोइलेक्ट्रिक बिंदु (पी. आई.) 5.38 है। सैद्धांतिक आइसोइलेक्ट्रिक बिंदु, प्रोटीन की संरचना में अम्लीय अमीनो एसिड की प्रबलता के साथ मिलकर, सुझाव देता है कि एससीआरएन3 एक अपेक्षाकृत अम्लीय प्रोटीन है। इसके अतिरिक्त, मनुष्यों में एससीआरएन3 की सापेक्ष प्रोटीन प्रचुरता अन्य मानव प्रोटीनों की तुलना में 6.13 पीपीएम पर मध्यम रूप से अधिक पाई गई। डोमेन एस. सी. आर. एन. 3 में एक ही उल्लेखनीय डोमेन है, जिसे पेप्टिडेज़ _ सी69 डोमेन या संक्षेप में पी. पी. डी. डोमेन के रूप में पहचाना जाता है। यह क्षेत्र प्रोटीन के अमीनो एसिड स्थिति 5 से 226 तक फैला हुआ है। इस क्षेत्र के भीतर पाए जाने वाले अनुक्रम पेप्टिडेस सी69 परिवार की विशेषता हैं, और विशेष रूप से सेसर्निन उप-परिवार, जिसे मुख्य रूप से डाइपेप्टिडेस के रूप में जाना जाता है। इस परिवार के भीतर, तुलनात्मक अनुक्रम और संरचनात्मक विश्लेषण से उत्प्रेरक न्यूक्लियोफाइल के रूप में एक सिस्टीन का पता चला, एक विशेषता जो सेसर्निन-3 पर पाई जा सकती है। संरचना एस. सी. आर. एन. 3 की अनुमानित तृतीयक संरचना के भीतर, सबसे अधिक संरक्षित अमीनो एसिड मुख्य रूप से प्रोटीन के आंतरिक भाग के भीतर पाए गए थे। इससे पता चलता है कि सबसे अधिक संरक्षित अमीनो एसिड, अंदर होने के कारण, प्रोटीन की संरचना प्रदान करने के साथ-साथ आंतरिक कार्यक्षमता प्रदान करने के लिए महत्वपूर्ण हैं। कोशिका के भीतर स्थानीयकरण, एस. सी. आर. एन. 3 के मुख्य रूप से कोशिका द्रव्य में व्यक्त होने की भविष्यवाणी की जाती है। साइटोप्लाज्मिक स्थानीयकरण की भविष्यवाणी 5 अतिरिक्त ऑर्थोलॉग (मौरेमिस रीवेसी, गैलस गैलस, माइक्रोसीसिलिया यूनिकोलर, डेनिओ रेरियो और एनोफेलिस गैम्बिया) के बीच सुसंगत थी, जो मानव एस. सी. आर. एन. 3 के अनुमानित साइटोप्लाज्मिक उपकोशिकीय स्थानीयकरण की पुष्टि करती है। अनुवाद के बाद के संशोधन एस. सी. आर. एन. 3 कई अनुमानित अनुवाद के बाद के संशोधनों के अधीन है, जिसमें फॉस्फोराइलेशन, सर्वव्यापीकरण, सुमॉयलेशन, लाइसिन एसिटिलेशन और ओ-बीटा-जी. एल. सी. एन. ए. सी. संलग्नक साइट शामिल हैं। इसके अतिरिक्त, सेकर्निन-3 ने रिवर्स-पोलेरिटी गतिविधि-आधारित प्रोटीन प्रोफाइलिंग (आरपी-एबीपीपी) के उपयोग के माध्यम से प्राकृतिक रूप से होने वाले अनुमानित एन-टर्मिनल ग्लायोक्सिलिल (ग्लॉक्स) इलेक्ट्रोफाइल का पहला उदाहरण प्रदान किया। हाइड्राज़िन जांच का उपयोग करते हुए, यह पुष्टि की गई कि सिस्टीन (सिस) अवशेष अनुवाद के बाद ग्लॉक्स में परिवर्तित हो गया था। इसने सेकर्निन-3 में पहली बार एक इलेक्ट्रोफिलिक एन-टर्मिनल ग्लाइऑक्सीलिल समूह की पहचान की, हालांकि एक कोफैक्टर के रूप में प्रोटीन और ग्लॉक्स दोनों के कार्यों को अभी तक प्रयोगात्मक रूप से मान्य नहीं किया गया है। होमोलॉजी/इवोल्यूशन पैरालॉग एस. सी. आर. एन. 3 में दो ज्ञात पैरालॉग हैं, एस. सी. आर. एन. 2 और एस. सी. आर. एन. 1, जो क्रमशः एस. सी. आर. एन. 3 प्रोटीन अनुक्रम के लिए एक 67.4% और 63.8% समानता साझा करते हैं। दोनों पैरालॉग एस. सी. आर. एन. 3 से मध्यम रूप से संबंधित हैं। एस. सी. आर. एन. 2 एस. सी. आर. एन. 3 के समान प्रजाति समूहों में पाया गया था। एस. सी. आर. एन. 1 को स्तनधारियों, पक्षियों, सरीसृपों, उभयचरों और कार्टिलाजिनस मछलियों सहित कम प्रजाति समूहों में संरक्षित किया गया था, लेकिन अन्य मछलियों या अकशेरुकी जीवों में नहीं। मानव जीन एस. सी. आर. एन. 3 के लिए 100 से अधिक ऑर्थोलॉग मौजूद हैं। ज्ञात ऑर्थोलॉग कशेरुकी और अकशेरुकी जीवों में मौजूद पाए गए थे, लेकिन पौधों, बैक्टीरिया या कवक में नहीं। पाए गए 20 ऑर्थोलॉग की विचलन तिथि की तुलना होमो सेपियन्स के सापेक्ष की गई थी। अकशेरुकी जीव मानव एस. सी. आर. एन. 3 के लिए सबसे दूर से संबंधित ऑर्थोलॉग हैं, जिसमें ऑर्थोलॉग के इस समूह से विचलन की सबसे दूर की औसत तारीख 69.4 करोड़ साल पहले है। एस. सी. आर. एन. 3 के लिए आणविक विकास की सापेक्ष दर मध्यम रूप से अधिक थी, जो फाइब्रिनोजेन अल्फा की विकास दर की तुलना में थोड़ी कम थी, और साइटोक्रोम सी. एस. सी. आर. एन. 3 की विकास दर की तुलना में अधिक तेज थी। परस्पर प्रोटीन पी. एस. सी. क्यू. यू. आई. सी. की खोज ने 5 प्रोटीनों की पहचान की जो मानव एस. सी. आर. एन. 3 प्रोटीन के साथ परस्पर क्रिया करते हैं। संदर्भ मानव गुणसूत्र 2 पर आनुवंशिकी प्रोटीन जीन