Strictly standardized mean difference
सांख्यिकी में, सख्ती से मानकीकृत औसत अंतर (एस. एस. एम. डी.) प्रभाव के आकार का एक माप है। यह दो समूहों में से एक से दो यादृच्छिक मूल्यों के बीच अंतर के मानक विचलन द्वारा विभाजित माध्य है। इसे शुरू में उच्च-थ्रूपुट स्क्रीनिंग (एच. टी. एस.) में गुणवत्ता नियंत्रण और हिट चयन के लिए प्रस्तावित किया गया था और यादृच्छिक मूल्यों वाले किसी भी दो समूहों की तुलना के लिए प्रभाव के आकार को मापने वाला एक सांख्यिकीय पैरामीटर बन गया है। पृष्ठभूमि हाई-थ्रूपुट स्क्रीनिंग (एच. टी. एस.) में, गुणवत्ता नियंत्रण (क्यू. सी.) महत्वपूर्ण है। एच. टी. एस. परख में एक महत्वपूर्ण क्यू. सी. विशेषता यह है कि सकारात्मक नियंत्रण, परीक्षण यौगिक और नकारात्मक नियंत्रण एक दूसरे से कितना भिन्न होते हैं। एच. टी. एस. परख में दो प्रकार के कुओं की तुलना का उपयोग करके इस क्यू. सी. विशेषता का मूल्यांकन किया जा सकता है। संकेत-से-शोर अनुपात (एस/एन), संकेत-से-पृष्ठभूमि अनुपात (एस/बी), और जेड-कारक को दो जांच किए गए प्रकार के कुओं की तुलना के माध्यम से एचटीएस परख की गुणवत्ता का मूल्यांकन करने के लिए अपनाया गया है। हालांकि, एस/बी परिवर्तनशीलता पर किसी भी जानकारी को ध्यान में नहीं रखता है और एस/एन केवल एक समूह में परिवर्तनशीलता को पकड़ सकता है और इसलिए जब दोनों समूहों में अलग-अलग परिवर्तनशीलता होती है तो परख की गुणवत्ता का आकलन नहीं कर सकता है। झांग जेएच एट अल। जेड-कारक का प्रस्ताव रखा। एस/एन और एस/बी पर जेड-कारक का लाभ यह है कि यह दोनों तुलना समूहों में परिवर्तनशीलता को ध्यान में रखता है। नतीजतन, एच. टी. एस. परख में जेड-कारक का व्यापक रूप से क्यू. सी. मीट्रिक के रूप में उपयोग किया गया है। जेड-कारक में निरपेक्ष संकेत गणितीय रूप से अपने सांख्यिकीय अनुमान को प्राप्त करना असुविधाजनक बनाता है। दो समूहों के बीच अंतर को मापने के लिए एक बेहतर व्याख्यात्मक पैरामीटर प्राप्त करने के लिए, झांग एक्सएचडी ने एचटीएस परख में सकारात्मक नियंत्रण और नकारात्मक नियंत्रण के बीच अंतर का मूल्यांकन करने के लिए एसएसएमडी का प्रस्ताव रखा। डी +-संभाव्यता (यानी, दो समूहों के बीच अंतर सकारात्मक होने की संभावना) के साथ इसके मजबूत संबंध के कारण एसएसएमडी का एक संभावित आधार है। कुछ हद तक, डी +-संभावना अच्छी तरह से स्थापित संभावित सूचकांक पी (एक्स> वाई) के बराबर है जिसका अध्ययन किया गया है और कई क्षेत्रों में लागू किया गया है। अपने संभावित आधार पर समर्थित, एस. एस. एम. डी. का उपयोग उच्च-थ्रूपुट स्क्रीनिंग में गुणवत्ता नियंत्रण और हिट चयन दोनों के लिए किया गया है। अवधारणा सांख्यिकीय पैरामीटर एक सांख्यिकीय पैरामीटर के रूप में, एस. एस. एम. डी. (के रूप में निरूपित) को दो समूहों से क्रमशः दो यादृच्छिक मूल्यों के अंतर के औसत और मानक विचलन के अनुपात के रूप में परिभाषित किया गया है। मान लीजिए कि यादृच्छिक मूल्यों वाले एक समूह का माध्य और विचरण होता है और दूसरे समूह का माध्य और विचरण होता है। फिर, इन दो समूहों की तुलना के लिए एस. एस. एम. डी. को इस प्रकार परिभाषित किया गया है यदि दोनों समूह स्वतंत्र हैं, यदि दो स्वतंत्र समूहों में समान भिन्नताएं हैं, तो उस स्थिति में जहां दो समूह सहसंबद्ध हैं, की गणना से बचने के लिए आमतौर पर उपयोग की जाने वाली रणनीति पहले दोनों समूहों से युग्मित टिप्पणियों को प्राप्त करना और फिर युग्मित टिप्पणियों के आधार पर एस. एस. एम. डी. का अनुमान लगाना है। जनसंख्या माध्य और एस. एस. एम. डी. के साथ युग्मित अंतर के आधार पर, एस. एस. एम. डी. सांख्यिकीय अनुमान है उस स्थिति में जहां दो समूह स्वतंत्र हैं, झांग एक्स. एच. डी. ने एस. एस. एम. डी. का अधिकतम-आजीविका अनुमान (एम. एल. ई.) और विधि-क्षण (एम. एम.) अनुमान प्राप्त किया। मान लीजिए कि समूह 1 और 2 में नमूना माध्य और नमूना भिन्नताएँ हैं। एस. एस. एम. डी. का एम. एम. अनुमान तब होता है जब दोनों समूहों में समान विचरण के साथ सामान्य वितरण होता है, तो एस. एस. एम. डी. का समान रूप से न्यूनतम विचरण निष्पक्ष अनुमान (यू. एम. वी. यू. ई.) है, जहां दो समूहों में नमूना आकार हैं और। एस. एस. एम. डी. का यू. एम. वी. यू. ई. अनुमान एस. एस. एम. डी. टी-सांख्यिकीय और कोहेन डी के समान दिखता है, लेकिन वे एक दूसरे के साथ अलग हैं जैसा कि चित्रित किया गया है। एस. एस. एम. डी. दो समूहों के बीच अंतर के मानक विचलन के लिए औसत का अनुपात है। जब लॉग-परिवर्तन का उपयोग करके डेटा को पूर्व-संसाधित किया जाता है जैसा कि हम सामान्य रूप से एच. टी. एस. प्रयोगों में करते हैं, तो एस. एस. एम. डी. एक नकारात्मक संदर्भ के संबंध में लॉग फोल्ड परिवर्तन के मानक विचलन द्वारा विभाजित लॉग फोल्ड परिवर्तन का माध्य है। दूसरे शब्दों में, एस. एस. एम. डी. औसत गुना परिवर्तन (लॉग पैमाने पर) है जो गुना परिवर्तन (लॉग पैमाने पर) की परिवर्तनशीलता द्वारा दंडित किया जाता है। गुणवत्ता नियंत्रण के लिए, एच. टी. एस. परख की गुणवत्ता के लिए एक सूचकांक एक परख प्लेट में सकारात्मक नियंत्रण और नकारात्मक संदर्भ के बीच अंतर का परिमाण है। हिट चयन के लिए, एक यौगिक (यानी, एक छोटा अणु या एक एस. आई. आर. एन. ए.) के प्रभावों के आकार को यौगिक और एक नकारात्मक संदर्भ के बीच अंतर के परिमाण द्वारा दर्शाया जाता है। एस. एस. एम. डी. सीधे दो समूहों के बीच अंतर के परिमाण को मापता है। इसलिए, एस. एस. एम. डी. का उपयोग एच. टी. एस. प्रयोगों में गुणवत्ता नियंत्रण और हिट चयन दोनों के लिए किया जा सकता है। गुणवत्ता नियंत्रण 384-कुएँ या 1536-कुएँ के मंच में एक प्लेट में सकारात्मक और नकारात्मक नियंत्रण के लिए कुओं की संख्या आमतौर पर यथोचित रूप से बड़ी होने के लिए डिज़ाइन की जाती है। मान लीजिए कि एक प्लेट में सकारात्मक और नकारात्मक नियंत्रणों में नमूना माध्य, नमूना विचलन और नमूना आकार होते हैं। आम तौर पर, यह धारणा कि एक प्लेट में नियंत्रणों में समान भिन्नता होती है। ऐसे मामले में, उस प्लेट में गुणवत्ता का आकलन करने के लिए एस. एस. एम. डी. का अनुमान कहाँ लगाया जाता है। जब समान विचरण की धारणा नहीं होती है, तो उस प्लेट में गुणवत्ता का आकलन करने के लिए एस. एस. एम. डी. का अनुमान इस प्रकार लगाया जाता है यदि नियंत्रणों में स्पष्ट रूप से बाहरी हैं, तो एस. एस. एम. डी. का अनुमान लगाया जा सकता है कि क्रमशः सकारात्मक और नकारात्मक नियंत्रणों में माध्य और माध्य निरपेक्ष विचलन कहाँ हैं। एच. टी. एस. परीक्षणों में जेड-कारक आधारित क्यू. सी. मानदंड का लोकप्रिय रूप से उपयोग किया जाता है। हालाँकि, यह प्रदर्शित किया गया है कि यह क्यू. सी. मानदंड बहुत या बेहद मजबूत सकारात्मक नियंत्रण वाले परख के लिए सबसे उपयुक्त है। आर. एन. ए. आई. एच. टी. एस. परख में, एक मजबूत या मध्यम सकारात्मक नियंत्रण आमतौर पर एक बहुत या बेहद मजबूत सकारात्मक नियंत्रण की तुलना में अधिक शिक्षाप्रद होता है क्योंकि इस नियंत्रण की प्रभावशीलता रुचि के हिट के समान होती है। इसके अलावा, दो एच. टी. एस. प्रयोगों में सकारात्मक नियंत्रणों के सैद्धांतिक रूप से प्रभावों के अलग-अलग आकार हैं। नतीजतन, मध्यम नियंत्रण के लिए क्यूसी सीमा इन दो प्रयोगों में मजबूत नियंत्रण के लिए उन से अलग होनी चाहिए। इसके अलावा, यह आम बात है कि एक ही प्रयोग में दो या दो से अधिक सकारात्मक नियंत्रणों को अपनाया जाता है। दोनों नियंत्रणों के लिए समान जेड-कारक-आधारित क्यू. सी. मानदंडों को लागू करने से असंगत परिणाम मिलते हैं जैसा कि साहित्य में दर्शाया गया है। निम्नलिखित तालिका में सूचीबद्ध एस. एस. एम. डी.-आधारित क्यू. सी. मानदंड एक एच. टी. एस. परख में सकारात्मक नियंत्रण के प्रभाव आकार को ध्यान में रखते हैं जहां सकारात्मक नियंत्रण (जैसे कि एक अवरोध नियंत्रण) में सैद्धांतिक रूप से नकारात्मक संदर्भ से कम मान होते हैं। अनुप्रयोग में, यदि सकारात्मक नियंत्रण के प्रभाव का आकार जैविक रूप से ज्ञात है, तो इस तालिका के आधार पर संबंधित मानदंड को अपनाएं। अन्यथा, निम्नलिखित रणनीति को यह निर्धारित करने में मदद करनी चाहिए कि कौन से क्यू. सी. मानदंड को लागू किया जाना चाहिएः (i) कई छोटे अणुओं में एक सकारात्मक नियंत्रण के साथ एच. टी. एस. परीक्षण, आमतौर पर मानदंड डी (और कभी-कभी मानदंड सी) को अपनाया जाना चाहिए क्योंकि इस नियंत्रण का आमतौर पर बहुत या बेहद मजबूत प्रभाव होता है; (ii) आर. एन. ए. आई. एच. टी. एस परीक्षण के लिए जिसमें कोशिका व्यवहार्यता मापी गई प्रतिक्रिया है, मानदंड डी को कोशिकाओं के बिना नियंत्रण के लिए अपनाया जाना चाहिए (अर्थात्, बिना कोशिकाओं वाले कुएं) या पृष्ठभूमि नियंत्रण; (iii) एक वायरल परीक्षण में जिसमें मेजबान कोशिकाओं में वायरस की मात्रा रुचि है, मानदंड सी आमतौर पर उपयोग किया जाता है, और मानदंड डी का उपयोग कभी-कभी एस. आई. आर. एन. ए. से युक्त सकारात्मक नियंत्रण के लिए किया जाता है। इसी तरह के एस. एस. एम. डी.-आधारित क्यू. सी. मानदंडों का निर्माण एच. टी. एस. परख के लिए किया जा सकता है जहां सकारात्मक नियंत्रण (जैसे सक्रियण नियंत्रण) में सैद्धांतिक रूप से नकारात्मक संदर्भ से अधिक मूल्य होते हैं। एच. टी. एस. प्रयोगों में एस. एस. एम. डी.-आधारित क्यू. सी. मानदंडों को कैसे लागू किया जाए, इसके बारे में अधिक जानकारी एक पुस्तक में पाई जा सकती है। एच. टी. एस. परख में, एक प्राथमिक लक्ष्य वांछित आकार के अवरोध या सक्रियण प्रभाव वाले यौगिकों का चयन करना है। यौगिक प्रभाव के आकार को एक परीक्षण यौगिक और एक नकारात्मक संदर्भ समूह के बीच अंतर के परिमाण द्वारा दर्शाया जाता है जिसमें कोई विशिष्ट अवरोध/सक्रियण प्रभाव नहीं होता है। एच. टी. एस. स्क्रीन में वांछित आकार के प्रभाव वाले यौगिक को हिट कहा जाता है। हिट चुनने की प्रक्रिया को हिट चयन कहा जाता है। बड़े प्रभाव वाले हिट का चयन करने की दो मुख्य रणनीतियाँ हैं। एक है यौगिकों को उनके प्रभावों द्वारा श्रेणीबद्ध करने और/या वर्गीकृत करने के लिए कुछ मीट्रिक (ओं) का उपयोग करना और फिर सबसे बड़ी संख्या में शक्तिशाली यौगिकों का चयन करना जो सत्यापन परख के लिए व्यावहारिक हैं। दूसरी रणनीति यह परीक्षण करने की है कि क्या एक यौगिक का प्रभाव पूर्व-निर्धारित स्तर तक पहुंचने के लिए पर्याप्त मजबूत है। इस रणनीति में, गलत-नकारात्मक दरों (एफएनआर) और/या गलत-सकारात्मक दरों (एफपीआर) को नियंत्रित किया जाना चाहिए। एस. एस. एम. डी. न केवल प्रभावों के आकार को श्रेणीबद्ध कर सकता है, बल्कि एस. एस. एम. डी. के जनसंख्या मूल्य () के आधार पर निम्नलिखित तालिका में दिखाए गए प्रभावों को भी वर्गीकृत कर सकता है। प्रतिकृतियों के बिना स्क्रीन के लिए एस. एस. एम. डी. का अनुमान प्रतिकृतियों वाले स्क्रीन के लिए अलग है। प्रतिकृतियों के बिना एक प्राथमिक स्क्रीन में, यह मानते हुए कि एक परीक्षण किए गए यौगिक के लिए एक कुएं में मापा गया मूल्य (आमतौर पर लॉग पैमाने पर) है और उस प्लेट में नकारात्मक संदर्भ में नमूना आकार, नमूना माध्य, मध्य, मानक विचलन और मध्य निरपेक्ष विचलन है, इस यौगिक के लिए एसएसएमडी का अनुमान लगाया जाता है। जब किसी परख में आउटलायर होते हैं जो आमतौर पर एच. टी. एस. प्रयोगों में आम होते हैं, तो एस. एस. एम. डी. का एक मजबूत संस्करण प्रतिकृतियों के साथ एक पुष्टिकरण या प्राथमिक स्क्रीन का उपयोग करके प्राप्त किया जा सकता है, प्रतिकृतियों के साथ आई-थ परीक्षण यौगिक के लिए, हम यौगिक के मापा मूल्य (आमतौर पर लॉग पैमाने पर) और एक प्लेट में नकारात्मक नियंत्रण के औसत मूल्य के बीच युग्मित अंतर की गणना करते हैं, फिर प्रतिकृतियों में युग्मित अंतर का औसत और भिन्नता प्राप्त करते हैं। इस यौगिक के लिए एस. एस. एम. डी. का अनुमान है कि कई मामलों में, वैज्ञानिक एच. टी. एस. प्रयोगों में हिट चयन के लिए एस. एस. एम. डी. और औसत गुना परिवर्तन दोनों का उपयोग कर सकते हैं। दोहरे फ्लैशलाइट प्लॉट एक परख में सभी परीक्षण यौगिकों के लिए औसत गुना परिवर्तन और एस. एस. एम. डी. दोनों को प्रदर्शित कर सकता है और एच. टी. एस. प्रयोगों में हिट का चयन करने के लिए दोनों को एकीकृत करने में मदद कर सकता है। एच. टी. एस. प्रयोगों में हिट चयन के लिए एस. एस. एम. डी. के उपयोग को चरण-दर-चरण सचित्र किया गया है सी इफेक्ट साइज हाई-थ्रूपुट स्क्रीनिंग जेड-फैक्टर हिट चयन एस. एम. सी. वी. सी +-संभावना कंट्रास्ट वेरिएबल डुअल-फ्लैशलाइट प्लॉट आगे पढ़ने के लिए झांग एक्स. एच. डी. (2011) "इष्टतम हाई-थ्रूपुट स्क्रीनिंगः जीनोम-स्केल आर. एन. ए. आई. अनुसंधान के लिए व्यावहारिक प्रयोगात्मक डिजाइन और डेटा विश्लेषण, कैम्ब्रिज विश्वविद्यालय प्रेस" संदर्भ प्रभाव आकार वर्णनात्मक आँकड़े