Citrate synthase family
आणविक जीवविज्ञान में, प्रोटीन के साइट्रेट सिंथेस परिवार में एंजाइम साइट्रेट सिंथेस, और संबंधित एंजाइम 2-मिथाइलसिट्रेट सिंथेस और ए. टी. पी. साइट्रेट लाइज़ शामिल हैं। साइट्रेट सिंथेस एंजाइमों के एक छोटे से परिवार का सदस्य है जो धातु आयन सह-कारकों की उपस्थिति के बिना सीधे कार्बन-कार्बन बंधन बना सकता है। यह क्रेब्स चक्र में पहली प्रतिक्रिया को उत्प्रेरित करता है, अर्थात् ऑक्सालोएसेटेट और एसिटाइल-कोएंजाइम ए का साइट्रेट और कोएंजाइम ए में रूपांतरण। यह प्रतिक्रिया ऊर्जा उत्पादन और कार्बन आत्मसात करने के लिए महत्वपूर्ण है। प्रतिक्रिया 2-चरणीय प्रक्रिया (एल्डोल-क्लैसेन संघनन के बाद सिट्रिल-सीओए का हाइड्रोलिसिस) में एक गैर-सहसंयोजक रूप से बंधे सिट्रिल-कोएंजाइम ए मध्यवर्ती के माध्यम से आगे बढ़ती है। साइट्रेट सिंथेस एंजाइम दो अलग-अलग संरचनात्मक प्रकारों में पाए जाते हैंः टाइप I एंजाइम (यूकेरियोट्स, ग्राम-पॉजिटिव बैक्टीरिया और आर्किया में पाए जाने वाले) होमोडिमर बनाते हैं और टाइप II एंजाइमों की तुलना में छोटे अनुक्रम होते हैं, जो ग्राम-नेगेटिव बैक्टीरिया में पाए जाते हैं और संरचना में हेक्सामेरिक होते हैं। दोनों प्रकारों में, मोनोमर दो डोमेन से बना होता हैः एक बड़ा अल्फा-हेलिकल डोमेन जिसमें दो संरचनात्मक पुनरावृत्तियाँ होती हैं, जहाँ दूसरी पुनरावृत्ति एक छोटे से अल्फा-हेलिकल डोमेन द्वारा बाधित होती है। इन क्षेत्रों के बीच की दरार सक्रिय स्थल बनाती है, जहाँ साइट्रेट और एसिटाइल-कोएंजाइम ए दोनों जुड़ते हैं। एंजाइम ऑक्सालोएसिटेट लिगैंड के बंधन पर एक संरचनात्मक परिवर्तन से गुजरता है, जिससे सक्रिय साइट दरार बंद हो जाती है ताकि एसिटाइल-सीओए बंधन स्थल बनाया जा सके। डोमेन बंद करने के लिए आवश्यक ऊर्जा सब्सट्रेट के साथ एंजाइम की बातचीत से आती है। टाइप II एंजाइमों में एक अतिरिक्त एन-टर्मिनल बीटा-शीट डोमेन होता है, और कुछ टाइप II एंजाइम एन. ए. डी. एच. द्वारा एलोस्टेरिक रूप से बाधित होते हैं। 2-मिथाइलसिट्रेट सिंथेस ऑक्सालोएसेटेट और प्रोपेनोयल-सीओए के (2आर, 3एस)-2-हाइड्रॉक्सीब्यूटेन-1,2,3-ट्राइकार्बोक्सिलेट और कोएंजाइम ए में परिवर्तन को उत्प्रेरित करता है। यह एंजाइम प्रोपियोनेट पर बैक्टीरिया के विकास के दौरान प्रेरित होता है, जबकि टाइप II हेक्सामेरिक साइट्रेट सिंथेस संरचनात्मक होता है। ए. टी. पी. साइट्रेट लाइज़, साइट्रेट के सी. ओ. ए.-निर्भर दरार को ऑक्सालोएसिटेट और एसिटाइल-सी. ओ. ए. में उत्प्रेरित करता है, जो कार्बन डाइऑक्साइड को ठीक करने के लिए विभिन्न प्रकार के ऑटोट्रॉफिक बैक्टीरिया और आर्किया द्वारा उपयोग किए जाने वाले सी. ओ. 2 एसिमिलेशन के रिडक्टिव ट्राइकार्बोक्सिलिक एसिड मार्ग में एक महत्वपूर्ण कदम है। ए. टी. पी. साइट्रेट लाइज़ दो अलग-अलग उप-इकाइयों से बना है। यूकेरियोट्स में, ए. टी. पी. साइट्रेट लाइज़ एकल बड़े पॉलीपेप्टाइड का एक होमोटेट्रैमर है, और इसका उपयोग माइटोकॉन्ड्रियल उत्पादित साइट्रेट से साइटोसोलिक एसिटाइल-सी. ओ. ए. का उत्पादन करने के लिए किया जाता है। संदर्भ प्रोटीन डोमेन