Vitamin B12-binding domain
आणविक जीवविज्ञान में, विटामिन बी12-बाध्यकारी क्षेत्र एक प्रोटीन क्षेत्र है जो कोबालामिन (विटामिन बी12) से जुड़ता है। यह कोबालामिन कोफैक्टर के दो अलग-अलग रूपों को बांध सकता है, जिसमें कोबाल्ट या तो मिथाइल समूह (मिथाइलकोबालामिन) या 5 '-डीऑक्सीएडेनोसिन (एडेनोसिलकोबालामिन) से जुड़ा होता है। कोबालामिन-बाइंडिंग डोमेन मुख्य रूप से जानवरों और प्रोकैरियोट्स में मौजूद एंजाइमों के दो परिवारों में पाए जाते हैं, जो कोबाल्ट-कार्बन बंधन पर अलग-अलग प्रकार की प्रतिक्रियाएं करते हैं। जिन एंजाइमों को मिथाइलकोबलामिन की आवश्यकता होती है, वे मिथाइल स्थानांतरण प्रतिक्रियाएं करते हैं। जिन एंजाइमों को एडेनोसिलकोबालामिन की आवश्यकता होती है, वे उन प्रतिक्रियाओं को उत्प्रेरित करते हैं जिनमें पहला कदम एडेनोसिलकोबालामिन का विभाजन होता है जिससे कोब (II) एलामिन और 5 '-डीऑक्सीएडेनोसिल रेडिकल बनते हैं, और इस प्रकार रेडिकल जनरेटर के रूप में कार्य करते हैं। दोनों प्रकार के एंजाइमों में बी12-बाइंडिंग डोमेन कोबालामिन कोफैक्टर्स के कोबाल्ट परमाणु को बांधने के लिए एक हिस्टिडीन का उपयोग करता है। यह हिस्टिडाइन एक डी. एक्स. एच. एक्स. एक्स. जी. अनुक्रम में अंतर्निहित है, जो डोमेन का सबसे संरक्षित प्राथमिक अनुक्रम रूपांकन है। कोबालामिन-बाइंडिंग डोमेन वाले प्रोटीनों में शामिल हैंः पशु और प्रोकैरियोटिक मेथियोनीन सिंथेस (), जो मिथाइल-कोबालामिन से होमोसिस्टीन में एक मिथाइल समूह के हस्तांतरण को उत्प्रेरित करते हैं, जिससे एंजाइम-बाउंड कोब (I) एलामिन और मेथियोनीन प्राप्त होते हैं। पशु और प्रोकैरियोटिक मिथाइलमैलोनिल-सीओए उत्परिवर्तन (), जो प्रोपियोनिल-सीओए के माध्यम से कई एमिनो एसिड, विषम-श्रृंखला फैटी एसिड और कोलेस्ट्रॉल के ट्राइकार्बाक्सिलिक एसिड चक्र में क्षरण में शामिल हैं। प्रोकैरियोटिक लाइसिन 5,6-एमिनोम्यूटेज ()। प्रोकैरियोटिक ग्लूटामेट म्यूटेज ()। प्रोकैरियोटिक मिथाइलिनग्लूटेरेट म्यूटेज ()। प्रोकैरियोटिक आइसोब्यूट्रिल-सीओए उत्परिवर्तन ()। कोबालामिन-बाइंडिंग डोमेन की मूल संरचना की विशेषता पांच-फंसे हुए अल्फा/बीटा (रॉसमैन) तह है, जिसमें तीन परतों (अल्फा/बीटा/अल्फा) में 4-5 अल्फा हेलिक्स से घिरे 5 समानांतर बीटा-शीट होते हैं। कोबालामिन को बांधने पर, बंधन स्थल के महत्वपूर्ण तत्व संरचित प्रतीत होते हैं, जिसमें एक अल्फा-हेलिक्स भी शामिल है जो कोफैक्टर के न्यूक्लियोटाइड 'पूंछ' को समायोजित करते हुए दरार के एक तरफ बनता है। कोबालामिन में, कोबाल्ट परमाणु या तो मुक्त (डी. एम. बी.-ऑफ) हो सकता है या पी. एच. के अनुसार डाइमिथाइलबेंजिमिडाज़ोल (डी. एम. बी.-ऑन) से बंधा हो सकता है। जब कोबालामिन-बाइंडिंग डोमेन से बंधे होते हैं, तो डाइमिथाइलबेंजिमिडाज़ोल लिगैंड को डी. एक्स. एच. एक्स. एक्स. जी. मोटिफ के सक्रिय हिस्टिडीन (हिस-ऑन) द्वारा प्रतिस्थापित किया जाता है। हिस्टिडाइन द्वारा डाइमिथाइलबेंजिमिडाज़ोल का प्रतिस्थापन उत्प्रेरक और सक्रियण चक्रों के बीच स्विच करने की अनुमति देता है। मेथियोनीन सिंथेस में कोबालामिन कोफैक्टर कोबालामिन-बाइंडिंग डोमेन और लगभग 90 अवशेष एन-टर्मिनल डोमेन के बीच सैंडविच किया जाता है जो एक पेचदार बंडल बनाता है जिसमें दो जोड़े एंटीपैरलल हेलिसेस होते हैं। यह एन-टर्मिनल डोमेन एक 4-हेलिकल बंडल कैप बनाता है, इस एंजाइम के सक्रिय संरचना में रूपांतरण में, 4-हेलिकल कैप कोबालामिन कोफैक्टर को सक्रियण डोमेन को बांधने की अनुमति देने के लिए घूमता है। संदर्भ प्रोटीन क्षेत्र