B-box zinc finger
आणविक जीवविज्ञान में बी-बॉक्स-प्रकार का जिंक फिंगर डोमेन लंबाई में लगभग 40 एमिनो एसिड अवशेषों का एक छोटा प्रोटीन डोमेन है। बी-बॉक्स जस्ता उंगलियों को दो समूहों में विभाजित किया जा सकता है, जहां प्रकार 1 और 2 बी-बॉक्स डोमेन अपने सर्वसम्मति अनुक्रम और 7-8 जस्ता-बाध्यकारी अवशेषों के अंतराल में भिन्न होते हैं। कई प्रोटीनों में दोनों प्रकार के 1 और 2 बी-बॉक्स होते हैं, जो इन दोनों क्षेत्रों के बीच कुछ स्तर की सहयोगात्मकता का सुझाव देते हैं। विभिन्न जीवों के 1500 से अधिक प्रोटीनों में ऑक्यूरेंस बी-बॉक्स डोमेन पाए जाते हैं। वे टीआरआईएम (त्रिपक्षीय रूपांकन) प्रोटीन में पाए जाते हैं जिसमें एक एन-टर्मिनल रिंग फिंगर (मूल रूप से ए-बॉक्स कहा जाता है), उसके बाद 1-2 बी-बॉक्स डोमेन और एक कुंडलित-कॉइल डोमेन (जिसे रिंग, बी-बॉक्स, कुंडलित-कॉइल के लिए आरबीसीसी भी कहा जाता है) होता है। टीआरआईएम प्रोटीन में एक प्रकार 2 बी-बॉक्स डोमेन होता है, और इसमें एक प्रकार 1 बी-बॉक्स भी हो सकता है। जिन प्रोटीनों में रिंग या कुंडलित-कुंडल डोमेन नहीं होते हैं, उनमें बी-बॉक्स डोमेन मुख्य रूप से टाइप 2 होता है। कई प्रकार 2 बी-बॉक्स प्रोटीन सर्वव्यापीकरण में शामिल हैं। बी-बॉक्स जिंक फिंगर डोमेन वाले प्रोटीन में प्रतिलेखन कारक, रिबोन्यूक्लियोप्रोटीन और प्रोटो-ऑन्कोप्रोटीन शामिल हैं; उदाहरण के लिए, एम. आई. डी. 1, एम. आई. डी. 2, टी. आर. आई. एम. 9, टी. एन. एल., टी. आर. आई. एम. 36, टी. आर. आई. एम. 63, टी. आर. आई. एफ. आई. सी., एन. सी. एल. 1 और कॉन्स्टैंस जैसे प्रोटीन। माइक्रोट्यूबुल-संबंधित ई3 लाइगेज एम. आई. डी. 1 (ई. सी.) में एक प्रकार 1 बी-बॉक्स जिंक फिंगर डोमेन होता है। एम. आई. डी. 1 विशेष रूप से अल्फा-4 को बांधता है, जो बदले में फॉस्फेट 2ए (पी. पी. 2एसी) की उत्प्रेरक उप-इकाई को भर्ती करता है। प्रोटीजॉम-मध्यस्थ क्षरण के लिए पी. पी. 2. ए. सी. के लक्ष्यीकरण के लिए यह परिसर आवश्यक है। एम. आई. डी. 1 बी-बॉक्स दो जस्ता आयनों का समन्वय करता है और जेड. जेड., पी. एच. डी., आर. आई. एन. जी. और एफ. वाई. वी. ई. जस्ता उंगलियों के समान बीटा/बीटा/अल्फा क्रॉस-ब्रेस संरचना को अपनाता है। डोमेन के प्रोकैरियोटिक होमोलॉग कई जीवाणु वंशावली और मेथेनोजेनिक आर्किया में मौजूद हैं, और अक्सर पेप्टिडेज़ डोमेन जैसे कि रॉम्बोइड जैसे सेरीन पेप्टिडेज़ और Zn-निर्भर मेटालोपेप्टिडेज़ में संलयन दिखाते हैं। अन्य संस्करणों में आम तौर पर ट्रांसमेम्ब्रेन हेलिक्स होते हैं और डी. एन. ए. जे., एफ. एच. ए., एस. एच. 3, डब्ल्यू. डी. 40 और टेट्राट्रिकोपेप्टाइड रिपीट्स जैसे डोमेन में संलयन भी दिखाई दे सकते हैं। ये संघ एक साथ प्रोटिओलिटिक प्रसंस्करण, तह या झिल्ली से जुड़े प्रोटीन की स्थिरता में बी-बॉक्स जिंक फिंगर डोमेन के प्रोकैरियोटिक होमोलॉग के लिए एक भूमिका का सुझाव देते हैं। डोमेन वास्तुकला वाक्यविन्यास उल्लेखनीय रूप से ए. एन. 1 जिंक फिंगर और एल. आई. एम. डोमेन के प्रोकैरियोटिक होमोलॉग में देखे जाने के समान है। संदर्भ प्लांट टी. एफ. डी. बी.: प्लांट ट्रांसक्रिप्शन फैक्टर डेटाबेस पर बाहरी लिंक सी. ओ. जैसे परिवार, डी. बी. बी. परिवार जिंक फिंगर प्रोटीन डोमेन भी देखें