SET domain
एस. ई. टी. क्षेत्र एक प्रोटीन क्षेत्र है जिसमें आमतौर पर मिथाइलट्रांसफेरेज गतिविधि होती है। इसे मूल रूप से ड्रोसोफिला ट्रिथोरैक्स प्रोटीन में मौजूद एक बड़े संरक्षित क्षेत्र के हिस्से के रूप में पहचाना गया था और बाद में इसे ड्रोसोफिला सु (वार) 3-9 और 'एन्हांसर ऑफ जेस्टे' प्रोटीन में पहचाना गया था, जिससे संक्षिप्त नाम सेट [सु (वार) 3-9, एन्हांसर-ऑफ-जेस्टे और ट्रिथोरैक्स] प्राप्त होता है। संरचना एस. ई. टी. डोमेन आम तौर पर एक बड़े मल्टीडोमेन प्रोटीन के एक हिस्से के रूप में दिखाई देता है, और हाल ही में अलग-अलग डोमेन संरचनाओं के साथ बहुत अलग प्रोटीन की तीन संरचनाओं का वर्णन किया गया हैः न्यूरोस्पोरा क्रासा डी. आई. एम.-5, हिस्टोन लाइसिन मिथाइलट्रांसफेरेस (एच. के. एम. टी.) के एस. यू. (वार) परिवार का एक सदस्य जो लाइसिन 9 पर हिस्टोन एच. 3 को मिथाइलेट करता है, मानव एस. ई. टी. डी. 7 (जिसे एस. ई. टी. 7 या एस. ई. टी. 9 भी कहा जाता है), जो लाइसिन 4 बगीचे मटर रुबिस्को एल. एस. एम. टी. पर एच. 3 को मिथाइलेट करता है, एक एंजाइम जो हिस्टोन को संशोधित नहीं करता है, लेकिन इसके बजाय एंजाइम रुबिस्को की बड़ी उप-इकाई की लचीली पूंछ में लाइसिन 14 को मिथाइलेट करता है। एस. ई. टी. डोमेन अपने आप में एक असामान्य संरचना साबित हुई। हालांकि तीनों अध्ययनों में, इलेक्ट्रॉन घनत्व मानचित्रों ने एडोमेट या एडोएचसी कोफैक्टर के स्थान का खुलासा किया, एसईटी डोमेन में कैनॉनिकल/एडोमेट-निर्भर मिथाइलट्रांसफेरेज फोल्ड के साथ कोई समानता नहीं है। एस. ई. टी. डोमेन टायरोसिन के सी-टर्मिनल रूपांकन में सख्ती से संरक्षित सब्सट्रेट लाइसिन के प्रोटोनेटेड एमिनो समूह से एक प्रोटॉन को निकालने में शामिल किया जा सकता है, जिससे एडोमेट कोफैक्टर के सल्फोनियम मिथाइल समूह पर इसके न्यूक्लियोफिलिक हमले को बढ़ावा मिलता है। शास्त्रीय प्रकार के एडोमेट-निर्भर प्रोटीन मिथाइलट्रैनफरेसेस के विपरीत, जो अपने पॉलीपेप्टाइड सब्सट्रेट को कोफैक्टर के शीर्ष पर बांधते हैं, रुबिस्को एलएसएमटी संरचना से यह उल्लेख किया गया है कि एडोमेट एक अलग दरार में बांधता प्रतीत होता है, यह सुझाव देते हुए कि कैसे एक पॉलीपेप्टाइड सब्सट्रेट को एंजाइम से छोड़े बिना मिथाइलेशन के कई दौर के अधीन किया जा सकता है। इसके विपरीत, एस. ई. टी. 7/9 अपने सब्सट्रेट में केवल एक मिथाइल समूह को जोड़ने में सक्षम है। कार्य यह प्रदर्शित किया गया है कि एस. ई. टी. डोमेन और मायोट्यूबुलरिन से संबंधित प्रोटीन का जुड़ाव विकास नियंत्रण को संशोधित करता है। एस. ई. टी. डोमेन-युक्त ड्रोसोफिला मेलानोगास्टर (फल मक्खी) प्रोटीन, जेस्टे को बढ़ाता है, खंड निर्धारण में एक कार्य करता है और स्तनधारी होमोलॉग जीन प्रतिलेखन और क्रोमैटिन संरचना के विनियमन में शामिल हो सकता है। हिस्टोन लाइसिन मिथाइलेशन हिस्टोन कोड का हिस्सा है जो क्रोमैटिन कार्य और जीन कार्य के एपिजेनेटिक नियंत्रण को नियंत्रित करता है। हिस्टोन लाइसिन मिथाइलट्रांसफेरेस (एच. एम. टी. ए. एस.) विभिन्न स्वीकारक लाइसिनों के लिए अपनी सब्सट्रेट विशिष्टता के साथ-साथ मिथाइल समूहों (एक, दो, या तीन) की संख्या के लिए उनकी उत्पाद विशिष्टता दोनों में भिन्न होते हैं। केवल एक अपवाद के साथ, एच. एम. टी. एस. एस. ई. टी. परिवार से संबंधित हैं जिन्हें एस. ई. टी. डोमेन के आसपास के अनुक्रमों के अनुसार वर्गीकृत किया जा सकता है। मानव एस. ई. टी. 7/9, एक मोनो-मिथाइलेज पर संरचनात्मक अध्ययनों ने हिस्टोन-लक्ष्य के लिए एंजाइम की विशिष्टता के लिए आणविक आधार और मिथाइलेशन विशिष्टताओं को निर्धारित करने में एस. ई. टी. क्षेत्र में अपरिवर्तनीय अवशेषों की भूमिकाओं का खुलासा किया है। एस. यू. वी. 39 एस. ई. टी. परिवार में पाए जाने वाले एन-टर्मिनल प्री-एस. ई. टी. डोमेन () में नौ अपरिवर्तनीय सिस्टीन अवशेष होते हैं जिन्हें परिवर्तनीय लंबाई के क्षेत्र द्वारा अलग किए गए दो खंडों में वर्गीकृत किया जाता है। ये 9 सिस्टीन एक त्रिकोणीय समूह बनाने के लिए 3 जस्ता आयनों का समन्वय करते हैं, जहां प्रत्येक जस्ता आयन को 4 चार सिस्टीन द्वारा समन्वित किया जाता है ताकि एक टेट्राहेड्रल विन्यास दिया जा सके। इस क्षेत्र का कार्य संरचनात्मक है, जो यादृच्छिक कुंडल के 2 लंबे खंडों को एक साथ रखता है। पोस्ट-एस. ई. टी. डोमेन () सहित सी-टर्मिनल क्षेत्र हिस्टोन टेल के साथ बातचीत नहीं करने पर और जस्ता के अभाव में अव्यवस्थित हो जाता है। एस. ई. टी. के बाद के डोमेन में तीन संरक्षित सिस्टीन एक जस्ता-बाध्यकारी साइट बनाते हैं जब एस. ई. टी. डोमेन सक्रिय साइट के करीब गाँठ जैसी संरचना में एक चौथे संरक्षित सिस्टीन के साथ जोड़ा जाता है। एस. ई. टी. के बाद का संरचित क्षेत्र सी-टर्मिनल अवशेष लाता है जो एस-एडेनोसिल-एल-मेथियोनीन-बाइंडिंग और हिस्टोन टेल इंटरैक्शन में भाग लेते हैं। तीन संरक्षित सिस्टीन अवशेष एच. एम. टीज़ गतिविधि के लिए आवश्यक हैं, क्योंकि सेरीन के साथ प्रतिस्थापन एच. एम. टीज़ गतिविधि को समाप्त कर देता है। इस डोमेन वाले मानव जीन एन्कोडिंग प्रोटीन के उदाहरणों में शामिल हैंः ए. एस. एच. 1. एल., एस. ई. टी. डोमेन (ए. डब्ल्यू. एस.) ई. एच. एम. टी. 1 (एफ. पी. 13812), ई. एच. एम. टी. 2 (बी. ए. टी. 8), ई. जेड. एच. 1, ई. जेड. एच. 2 एम. एल. एल., एम. एल. एल. 2, एम. एल. एल. 3, एम. एल. एल. 5 एन. एस. डी. 1 पी. आर. डी. एम. 1, पी. आर. डी. एम. 2, पी. आर. डी. एम. 5 एस. ई. टी. डी. 1 ए., एस. ई. टी. डी. 2, एस. ई. टी. डी. 3, एस. ई. टी. डी. 4, एस. ई. टी. डी. 5, एस. ई. टी. डी. 6, एस. ई. टी. डी. 7, एस. ई. टी. डी. 8, एस. ई. टी. डी. बी. 1, एस. ई