EteRNA
इटर्ना एक ब्राउज़र-आधारित "एक उद्देश्य के साथ खेल" है, जिसे कार्नेगी मेलन विश्वविद्यालय और स्टैनफोर्ड विश्वविद्यालय के वैज्ञानिकों द्वारा विकसित किया गया है, जो उपयोगकर्ताओं को आर. एन. ए. अणुओं के तह से संबंधित पहेलियों को हल करने के लिए संलग्न करता है। इस परियोजना को बिल और मेलिंडा गेट्स फाउंडेशन, स्टैनफोर्ड विश्वविद्यालय और राष्ट्रीय स्वास्थ्य संस्थान द्वारा समर्थित किया गया है। पूर्व वित्तपोषकों में राष्ट्रीय विज्ञान प्रतिष्ठान शामिल है। फोल्डिट के समान-इटर्ना विकसित करने वाले कुछ शोधकर्ताओं द्वारा बनाया गया-पहेलियाँ उन पहेलियों को हल करने के लिए मानव समस्या-समाधान क्षमताओं का लाभ उठाती हैं जो वर्तमान कंप्यूटर मॉडल के लिए कम्प्यूटेशनल रूप से श्रमसाध्य हैं। शोधकर्ताओं को आरएनए फोल्डिंग यांत्रिकी के बारे में मौलिक प्रश्नों का उत्तर देने के लिए "क्राउडसोर्सिंग" और इटर्ना खिलाड़ियों की सामूहिक बुद्धिमत्ता का लाभ उठाने की उम्मीद है। आर. एन. ए. अणुओं के तह पैटर्न का मूल्यांकन करने के लिए कंप्यूटर भविष्यवाणियों के साथ सीधे तुलना करने के लिए शीर्ष वोट किए गए डिजाइनों को स्टैनफोर्ड जैव रसायन प्रयोगशाला में संश्लेषित किया जाता है, जिससे अंततः कंप्यूटर मॉडल में सुधार होता है। अंततः, इटर्ना शोधकर्ताओं को उम्मीद है कि वे आर. एन. ए. के संश्लेषण की अनुमति देने के लिए "नियमों का एक पूर्ण और दोहराने योग्य सेट" निर्धारित करेंगे जो लगातार अपेक्षित आकारों में मुड़ते हैं। इटर्ना परियोजना के नेताओं को उम्मीद है कि इन बुनियादी सिद्धांतों को निर्धारित करने से आरएनए-आधारित नैनो मशीनों और स्विचों के डिजाइन में सुविधा हो सकती है। इटर्ना के रचनाकार इटर्ना खिलाड़ियों के समाधानों से सुखद रूप से आश्चर्यचकित हुए हैं, विशेष रूप से गैर-शोधकर्ताओं की जिनकी "रचनात्मकता इस बात से बाधित नहीं है कि उन्हें क्या लगता है कि एक सही उत्तर कैसा दिखना चाहिए"। 2016 तक, इटर्ना के पास लगभग 250,000 पंजीकृत खिलाड़ी हैं। गेमप्ले खिलाड़ियों को एक दिए गए लक्ष्य आकार के साथ प्रस्तुत किया जाता है जिसमें एक आर. एन. ए. स्ट्रैंड को मोड़ना होता है। खिलाड़ी चार आर. एन. ए. न्यूक्लियोटाइड्स (एडेनिन, साइटोसिन, ग्वानोसिन और यूरेसिल) में से किसी को भी विभिन्न स्थानों पर रखकर अनुक्रम को बदल सकता है; यह प्रणाली की मुक्त ऊर्जा को बदल सकता है और आर. एन. ए. स्ट्रैंड की तह गतिशीलता को नाटकीय रूप से प्रभावित कर सकता है। इटर्ना में, अलग-अलग प्रतिबंध, जैसे कि कुछ आधारों की संख्या और तीन आधार जोड़ी प्रकारों की संख्या के साथ-साथ बंद आधार, कभी-कभी लगाए जाते हैं। कभी-कभी एक अणु भी शामिल किया जाता है, जो आर. एन. ए. के साथ जुड़ता है और प्रणाली की मुक्त ऊर्जा पर महत्वपूर्ण प्रभाव डालता है। कुछ और उन्नत पहेलियों में, खिलाड़ियों को एक ही समय में दो या तीन अलग-अलग लक्ष्य आकारों के साथ प्रस्तुत किया जा सकता है; खिलाड़ी द्वारा उत्पन्न एकल अनुक्रम को अलग-अलग परिस्थितियों (एक बाध्यकारी अणु की उपस्थिति या अनुपस्थिति) के तहत संबंधित आकारों में मोड़ना चाहिए। इटर्ना पहेलियों को मोटे तौर पर तीन प्रकारों में वर्गीकृत किया गया हैः चुनौती, खिलाड़ी पहेली और क्लाउड लैब। चुनौती खेल-निर्माताओं द्वारा खिलाड़ियों को इटर्ना के कामकाज से परिचित कराने के साथ-साथ खिलाड़ियों को प्रयास करने के लिए पूर्व-निर्धारित पहेलियों की श्रृंखला प्रदान करने के लिए तैयार की गई पहेली है। खिलाड़ी पहेलियाँ खिलाड़ियों द्वारा उत्पन्न की जाती हैं, और क्लाउड लैब वह जगह है जहाँ खिलाड़ियों को समीक्षा, वोट या प्रयास करने के लिए सक्रिय, प्रस्तावित और संग्रहीत प्रयोगशाला परियोजनाओं को प्रस्तुत किया जाता है। नए खिलाड़ियों को एक प्रारंभिक पहेली प्रगति के माध्यम से निर्देशित किया जाता है जो आर. एन. ए. संरचना और तह की बुनियादी अवधारणाओं का परिचय देता है। जैसे-जैसे खिलाड़ी बढ़ती जटिलता की पहेलियों से गुजरते हैं, विभिन्न खेल इंटरफेस तत्वों का वर्णन किया जाता है। 30 पहेलियों को पूरा करने और सभी पाँच इटर्ना एसेन्शियल्स बैज अर्जित करने के बाद, खिलाड़ी क्लाउड लैब तक पहुँच प्राप्त करते हैं जहाँ वे प्रयोगशाला अनुसंधान में भाग ले सकते हैं। एक बार जब खिलाड़ी पर्याप्त संख्या में आर. एन. ए. पहेलियों को पूरा कर लेते हैं, तो वे अन्य खिलाड़ियों के लिए पहेलियाँ उत्पन्न करने का मौका खोलते हैं। 2016 में, इटर्ना ने ओपनटीबी नामक अपनी पहली जैव चिकित्सा चुनौती शुरू की, जो तपेदिक के लिए एक नया नैदानिक उपकरण विकसित करने की एक पहल है। यह परियोजना सार्वजनिक डेटा का उपयोग करके स्टैनफोर्ड शोधकर्ताओं द्वारा खोजे गए एक जीन अभिव्यक्ति "हस्ताक्षर" का उपयोग करती है, और इसका उद्देश्य एक खुला स्रोत, कागज-आधारित नैदानिक किट बनाना है जिसे आसानी से दुनिया भर के क्लीनिकों में तैनात किया जा सकता है। ओपन सोर्स किट का विकास एम. आई. टी. के लिटिल डिवाइसेस लैब के सहयोग से किया गया है। खिलाड़ियों ने चुनौती के दूसरे दौर तक जीन हस्ताक्षर का पता लगाने के लिए आर. एन. ए. को सफलतापूर्वक डिजाइन किया, और फरवरी 2018 तक वास्तविक रोगी के नमूनों के साथ परीक्षण जारी है। ओपनटीबी की सफलता के बाद, एटर्ना ने अगस्त 2017 में ओपनसीआरआईएसपीआर लॉन्च किया, जो खिलाड़ियों को सीआरआईएसपीआर जीन संपादन में उपयोग किए जाने वाले एकल गाइड आरएनए (एसजीआरएनए) को डिजाइन करने के लिए चुनौती देता है। परियोजना का लक्ष्य एस. जी. आर. एन. ए. का एक नया वर्ग बनाना है जिसे एक अन्य छोटे अणु (जैसे थियोफिलिन) द्वारा संशोधित किया जा सकता है, जिससे शरीर में जीन संपादन को आवश्यकतानुसार चालू या बंद किया जा सके। नवंबर 2017 में राउंड 1 के समापन पर, खिलाड़ियों ने संश्लेषण के लिए 90,000 से अधिक आर. एन. ए. डिजाइन प्रस्तुत किए थे, जो अब तक प्रस्तुतियों का सबसे बड़ा सेट है। सार्स-कोव-2 महामारी के जवाब में, एटर्ना एम. आर. एन. ए. अणुओं को स्थिर करने के तरीकों को विकसित करने के लिए ओपनवैकसिन सहयोग में शामिल हो गया, जिन्हें गहरे हिमांक की आवश्यकता के बिना संग्रहीत और भेजा जा सकता है। खिलाड़ियों ने न्यूक्लियोटाइड स्तर पर छोटे आर. एन. ए. अणुओं की स्थिरता की जांच के लिए 6000 डिज़ाइन प्रस्तुत किए, और परिणामों का उपयोग संरचित नैनोलुसिफ़ेरेस को डिज़ाइन करने के लिए किया, जिनका विट्रो में क्षरण और विवो में प्रोटीन अभिव्यक्ति के लिए परीक्षण किया गया था। ओपनवैक्सिन अनुसंधान के परिणामस्वरूप स्थिर एम. आर. एन. ए. चिकित्सीय डिजाइन करने के लिए नए तरीके और सिद्धांत सामने आए, जिसमें संभावित रूप से वर्तमान शेल्फ जीवन से तीन गुना अधिक टीके शामिल हैं। सिंथेटिक जीव विज्ञान 2019 में, इटर्ना ने आई. एस. ए. टी. कोशिका-मुक्त राइबोजोम निर्माण मंच पर संशोधित एस्चेरिचिया कोलाई राइबोजोम के तह को बढ़ाने के लिए नॉर्थवेस्टर्न विश्वविद्यालय में जेवेट लैब के सहयोग से राइबोजोम इंजीनियरिंग परियोजना ओपन राइबोजोम की शुरुआत की। खिलाड़ियों द्वारा डिज़ाइन किए गए बीस 16S और बीस 23S अनुक्रमों के प्रोटीन उत्पादन का मूल्यांकन चार प्रतिक्रिया-आधारित पुनरावृत्तियों की एक श्रृंखला में किया जा रहा है। राइबोसोम को अद्वितीय पॉलिमर को संश्लेषित करने में सक्षम आणविक मशीनों के रूप में फिर से तैयार किया जा रहा है। अगस्त 2011 तक, लगभग 26,000 खिलाड़ियों ने आर. एन. ए. अनुक्रम डिजाइनों में योगदान दिया था और इन विट्रो परीक्षण के लिए 305 से अधिक डिजाइनों को संश्लेषित किया गया है। जनवरी 2014 में, इटर्ना के परिणाम पी. एन. ए. एस. पत्रिका में प्रकाशित किए गए हैं, जिसमें "इटर्ना प्रतिभागियों" को पेपर में सह-लेखकों के रूप में सूचीबद्ध किया गया है। इटर्ना गेमर्स ने सभी 100 आर. एन. ए. द्वितीयक संरचना डिजाइन चुनौतियों को हल करने में सुपर कंप्यूटर-संचालित एल्गोरिदम को हराया, जबकि उपयोग किए गए छह एल्गोरिदम में से सबसे अच्छा स्कोर 54 है। आर. एन. ए. के रासायनिक अनुक्रमों में हेरफेर करके गेमर्स ने वांछित आकारों के स्थिर रूप बनाए। खिलाड़ियों द्वारा तैयार की गई रणनीतियों ने विशिष्ट संरचनात्मक विशेषताओं की पहचान की जो व्युत्क्रम आर. एन. ए. को मोड़ना मुश्किल बनाती हैं। इटर्ना शोधकर्ताओं को उम्मीद है कि उनकी रणनीतियों को एल्गोरिदम में एकीकृत करके, स्वचालित आरएनए माध्यमिक संरचना डिजाइन में सुधार प्राप्त किया जा सकता है। चुनौतियों के परिणाम फरवरी 2016 में जर्नल ऑफ मॉलिक्यूलर बायोलॉजी में प्रकाशित किए गए थे। यह एक वीडियो गेम के माध्यम से भर्ती किए गए गैर-विशेषज्ञ नागरिक वैज्ञानिकों द्वारा प्रमुख लेखन योगदान और सह-नेतृत्व लेखकत्व पर आधारित पहला पेपर था। इटर्ना नागरिक वैज्ञानिकों ने 7 + एडेनोसिन के तारों को पढ़ते समय SHAPE और DMS रासायनिक जांच में विसंगति की खोज की, और बाद में अपने निष्कर्षों को जैव रसायन में प्रकाशित किया। यह नागरिक वैज्ञानिकों द्वारा विशेष रूप से लिखा गया पहला पेपर है जिसे सहकर्मी-समीक्षा पत्रिका में प्रकाशित किया गया है। यह भी देखें कि एक उद्देश्य के साथ नागरिक विज्ञान फोल्डिट गेम क्राउडसोर्सिंग परियोजनाओं की सूची गंभीर खेल संदर्भ बाहरी लिंक इटर्ना विकी नागरिक विज्ञान 2010 वीडियो गेम ब्राउज़र गेम मानव-आधारित गणना गेम पहेली वीडियो गेम आर. एन. ए. कार्नेगी मेलन विश्वविद्यालय स्टैनफोर्ड विश्वविद्यालय संयुक्त राज्य अमेरिका में विकसित वीडियो गेम