Cyclodeaminase domain
आणविक जीवविज्ञान में, एक-कार्बन इकाइयों को फोलेट पूल में प्रवाहित करने में साइक्लोडायमिनेज़ डोमेन कार्य वाले एंजाइम। ज्यादातर मामलों में, यह क्षेत्र एक फॉर्माइडोयल्टेट्राहाइड्रोफोलेट साइक्लोडायमिनेज़ के रूप में कार्य करता है, जो प्रतिक्रिया (1) में दिखाए गए अनुसार फॉर्माइडोयल्टेट्राहाइड्रोफोलेट के मेथेनाइल्टेट्राहाइड्रोफोलेट में चक्रण को उत्प्रेरित करता है। मिथाइलट्रॉफिक जीवाणु मिथाइलबैक्टीरियम एक्स्टोर्क्वेन्स में, हालांकि, यह एक मेथेनाइलटेट्राहाइड्रोफोलेट साइक्लोहाइड्रोलेज के रूप में कार्य करता है, जो फॉर्मिलटेट्राहाइड्रोफोलेट और मिथाइलनेट्राहाइड्रोफोलेट के अंतःपरिवर्तन को उत्प्रेरित करता है, जैसा कि प्रतिक्रिया (2) में दिखाया गया है। (1) 5-फॉर्माइडोयल्टेट्राहाइड्रोफोलेट = 5,10-मेथेनाइल्टेट्राहाइड्रोफोलेट + एनएच (3) (2) 10-फॉर्माइल्टेट्राहाइड्रोफोलेट = 5,10-मेथेनाइल्टेट्राहाइड्रोफोलेट + एच (2) ओ प्रोकैरियोट्स में, यह डोमेन ज्यादातर अपने आप होता है, जबकि यूकेरियोट्स में यह एक ग्लूटामेट फॉर्माइमिनोट्रांसफेरेज डोमेन (जो मार्ग में पिछले चरण को उत्प्रेरित करता है) से जुड़ जाता है ताकि द्वि-कार्यात्मक एंजाइम फॉर्मिमिनोट्रांसफेरेज साइक्लोडायमिनेज बनाया जा सके। यूकेरियोटिक एंजाइम होमोडिमर्स का एक गोलाकार टेट्रामर है, जबकि प्रोकैरियोटिक एंजाइम एक डाइमर है। थर्मोटोगोआ मारिटिमा से साइक्लोडायमिनेज़ एंजाइम की क्रिस्टल संरचना का अध्ययन किया गया है। यह एक होमोडिमर है, जहां प्रत्येक मोनोमर छह अल्फा हेलिक्स से बना होता है, जो एक ऊपर और नीचे पेचदार बंडल में व्यवस्थित होता है, जिससे एक नया तह बनता है। सक्रिय स्थल का स्थान ज्ञात नहीं है, लेकिन अनुक्रम संरेखण ने डिमर इंटरफेस के भीतर एक गहरी जेब में स्थित संरक्षित अवशेषों के दो समूहों का खुलासा किया। यह जेब प्रतिक्रिया उत्पाद को समायोजित करने के लिए काफी बड़ी थी और यह माना जाता था कि यह सक्रिय स्थल है। संदर्भ प्रोटीन परिवार