Jmol
जे. एम. ओ. एल. 3-आयामों में रासायनिक संरचनाओं के आणविक प्रतिरूपण के लिए कंप्यूटर सॉफ्टवेयर है। Jmol एक अणु का 3D प्रतिनिधित्व देता है जिसका उपयोग शिक्षण उपकरण के रूप में या रसायन विज्ञान और जैव रसायन में अनुसंधान के लिए किया जा सकता है। यह प्रोग्रामिंग भाषा जावा में लिखा गया है, इसलिए यदि जावा स्थापित है तो यह ऑपरेटिंग सिस्टम विंडोज, मैकओएस, लिनक्स और यूनिक्स पर चल सकता है। यह जी. एन. यू. लेसर जनरल पब्लिक लाइसेंस (एल. जी. पी. एल.) संस्करण 2 के तहत जारी किया गया एक मुक्त और मुक्त स्रोत सॉफ्टवेयर है। एक स्वतंत्र अनुप्रयोग और एक सॉफ्टवेयर विकास किट (एस. डी. के.) मौजूद है जिसे बायोक्लिप्स और टेवर्ना जैसे अन्य जावा अनुप्रयोगों में एकीकृत किया जा सकता है। एक लोकप्रिय विशेषता एक एप्लेट है जिसे विभिन्न तरीकों से अणुओं को प्रदर्शित करने के लिए वेब पृष्ठों में एकीकृत किया जा सकता है। उदाहरण के लिए, अणुओं को बॉल-एंड-स्टिक मॉडल, स्पेस-फिलिंग मॉडल, रिबन आरेख आदि के रूप में प्रदर्शित किया जा सकता है। जे. एम. ओ. एल. रासायनिक फाइल प्रारूपों की एक विस्तृत श्रृंखला का समर्थन करता है, जिसमें प्रोटीन डेटा बैंक (पी. डी. बी.), क्रिस्टलोग्राफिक सूचना फाइल (सी. आई. एफ.), एम. डी. एल. मोलफाइल (एम. ओ. एल.) और रासायनिक मार्कअप भाषा (सी. एम. एल.) शामिल हैं। एक जावास्क्रिप्ट-ओनली (एच. टी. एम. एल. 5) संस्करण, जे. एस. एम. ओ. एल. भी है, जिसका उपयोग बिना जावा वाले कंप्यूटरों पर किया जा सकता है। जे. एम. ओ. एल. एप्लेट, अन्य क्षमताओं के अलावा, चाइम प्लग-इन का एक विकल्प प्रदान करता है, जो अब सक्रिय विकास के तहत नहीं है। जबकि जे. एम. ओ. एल. में कई विशेषताएं हैं जिनकी चाइम में कमी है, यह सभी चाइम कार्यों को पुनः पेश करने का दावा नहीं करता है, विशेष रूप से, स्कल्प्ट मोड। चाइम के लिए प्लग-इन इंस्टॉलेशन और माइक्रोसॉफ्ट विंडोज पर इंटरनेट एक्सप्लोरर 6 या फ़ायरफ़ॉक्स 2 या मैक ओएस 9 पर नेटस्केप कम्युनिकेटर 4 की आवश्यकता होती है। Jmol को जावा इंस्टॉलेशन की आवश्यकता होती है और यह विभिन्न प्रकार के प्लेटफार्मों पर काम करता है। उदाहरण के लिए, जे. एम. ओ. एल. मोज़िला फ़ायरफ़ॉक्स, इंटरनेट एक्सप्लोरर, ओपेरा, गूगल क्रोम और सफारी में पूरी तरह से कार्यात्मक है। स्क्रीनशॉट्स भी देखें रसायन विज्ञान विकास किट (सी. डी. के.) आणविक यांत्रिकी मॉडलिंग के लिए सॉफ्टवेयर की तुलना मुक्त और मुक्त स्रोत सॉफ्टवेयर पैकेजों की सूची आणविक ग्राफिक्स प्रणालियों की सूची आणविक ग्राफिक्स संपादक प्रोटिओपीडिया पी. एम. ओ. एल. सैमसन स्माइल्स संदर्भ बाहरी लिंक विकी वेबसाइटों, विकि और मूड की सूची के साथ जे. एम. ओ. एल. विस्तार लिनक्स के लिए बायोमॉडल मोलव्यू रसायन विज्ञान सॉफ्टवेयर जावा में प्रोग्राम किया गया मुक्त सॉफ्टवेयर (प्रोग्रामिंग भाषा) आणविक मॉडलिंग सॉफ्टवेयर