Activity-based proteomics
गतिविधि-आधारित प्रोटिओमिक्स, या गतिविधि-आधारित प्रोटीन प्रोफाइलिंग (एबीपीपी) एक कार्यात्मक प्रोटिओमिक तकनीक है जो रासायनिक जांच का उपयोग करती है जो एंजाइमों के यांत्रिक रूप से संबंधित वर्गों के साथ प्रतिक्रिया करती है। विवरण एबीपीपी की मूल इकाई जांच है, जिसमें आम तौर पर दो तत्व होते हैंः एक प्रतिक्रियाशील समूह (आरजी, जिसे कभी-कभी "वारहेड" कहा जाता है) और एक टैग। इसके अतिरिक्त, कुछ जांचों में एक बाध्यकारी समूह हो सकता है जो चयनात्मकता को बढ़ाता है। प्रतिक्रियाशील समूह में आमतौर पर एक विशेष रूप से डिज़ाइन किया गया इलेक्ट्रोफाइल होता है जो एक सक्रिय एंजाइम के सक्रिय स्थल में एक न्यूक्लियोफिलिक अवशेष से सहसंयोजक रूप से जुड़ा होता है। एक एंजाइम जो बाधित या अनुवाद के बाद संशोधित होता है, वह गतिविधि-आधारित जांच के साथ प्रतिक्रिया नहीं करेगा। टैग या तो एक रिपोर्टर हो सकता है जैसे कि फ्लोरोफोर या एक एफ़िनिटी लेबल जैसे कि बायोटिन या एक एल्काइन या एज़ाइड जिसका उपयोग हुइस्जेन 1,3-द्विध्रुवीय साइक्लोऑडिशन (जिसे क्लिक केमिस्ट्री के रूप में भी जाना जाता है) के साथ किया जाता है। लाभ ए. बी. पी. पी. का एक प्रमुख लाभ प्रोटीन या एम. आर. एन. ए. की प्रचुरता तक सीमित होने के बजाय सीधे एंजाइम सक्रिय साइट की उपलब्धता की निगरानी करने की क्षमता है। सेरीन हाइड्रोलेसेस और मेटालोप्रोटीज जैसे एंजाइमों के वर्गों के साथ जो अक्सर अंतर्जात अवरोधकों के साथ बातचीत करते हैं या जो निष्क्रिय ज़ाइमोजेन के रूप में मौजूद होते हैं, यह तकनीक पारंपरिक तकनीकों पर एक मूल्यवान लाभ प्रदान करती है जो गतिविधि के बजाय बहुतायत पर भरोसा करती हैं। बहुआयामी प्रोटीन पहचान प्रौद्योगिकी हाल के वर्षों में एबीपीपी को टेंडम मास स्पेक्ट्रोमेट्री के साथ जोड़ा गया है जिससे एक ही नमूने से सैकड़ों सक्रिय एंजाइमों की पहचान की जा सकती है। एबीपीपी-मडपीआईटी (बहुआयामी प्रोटीन पहचान प्रौद्योगिकी) के रूप में जानी जाने वाली यह तकनीक विशेष रूप से प्रोफाइलिंग अवरोधक चयनात्मकता के लिए उपयोगी है क्योंकि एक अवरोधक की शक्ति का एक साथ सैकड़ों लक्ष्यों के खिलाफ परीक्षण किया जा सकता है। ए. बी. पी. पी. को पहली बार 1990 के दशक में प्रोटीज के अध्ययन में बताया गया था। मास स्पेक्ट्रोमेट्री प्रोटिओमिक्स संबंधित अवरोधक एमएएफपी और डीआईएफपी कीमोप्रोटोमिक्स संदर्भ प्रोटिओमिक्स जीनोमिक्स प्रोटीन विधियाँ मास स्पेक्ट्रोमेट्री भी देखें।