The Proteolysis Map
प्रोटीयोलिसिस एमएपी (पीएमएपी) एक एकीकृत वेब संसाधन था जो प्रोटीज पर केंद्रित था। इसका डोमेन अब एक घोटाले/स्पैम ब्राउज़र विस्तारक से जुड़ जाता है। तर्कसंगत पी. एम. ए. पी. को प्रोटीयोज शोधकर्ताओं को प्रोटीयोलिटिक नेटवर्क और चयापचय मार्गों के बारे में तर्क करने में सहायता करने के लिए डिज़ाइन किया गया था। इतिहास और वित्तपोषण पी. एम. ए. पी. मूल रूप से बर्नहैम इंस्टीट्यूट फॉर मेडिकल रिसर्च, ला जोला, कैलिफोर्निया में बनाया गया था। 2004 में राष्ट्रीय स्वास्थ्य संस्थान (एन. आई. एच.) ने सेंटर ऑन प्रोटियोलिटिक पाथवेज (सी. पी. पी.) की स्थापना के लिए जेफरी डब्ल्यू. स्मिथ के नेतृत्व में एक दल का चयन किया। बायोमेडिकल अनुसंधान के लिए एन. आई. एच. रोडमैप के हिस्से के रूप में, केंद्र प्रोटीन के व्यवहार का अध्ययन करने और उस ज्ञान को बड़े पैमाने पर वैज्ञानिक समुदाय को वितरित करने के लिए प्रौद्योगिकी विकसित करता है। फोकल प्वाइंट प्रोटीज एंजाइमों का एक वर्ग है जो प्रोटीन में पेप्टाइड बंधनों को तोड़कर मानव शरीर में कोशिका के अंदर और बाहर जो कुछ भी होता है, उसे नियंत्रित करता है। इस गतिविधि के माध्यम से, वे चार आवश्यक कोशिका कार्यों को नियंत्रित करते हैंः विभेदन, गतिशीलता, विभाजन और कोशिका मृत्यु-और महत्वपूर्ण बाह्य कोशिकीय प्रकरणों को सक्रिय करते हैं, जैसे कि रक्त के थक्के में जैव रासायनिक कैस्केड प्रभाव। इनके बिना जीवन संभव नहीं था। प्रोटीज के लिए व्यापक ऑनलाइन वर्गीकरण प्रणाली (जिसे पेप्टिडेस भी कहा जाता है) MEROPS डेटाबेस में जमा की जाती है। लक्ष्य प्रोटीयोलिटिक मार्ग, या प्रोटीयोलिसिस, प्रोटीज द्वारा नियंत्रित घटनाओं की श्रृंखला है जो विशिष्ट उत्तेजनाओं के जवाब में होती है। रक्त के थक्के बनने और इंसुलिन के उत्पादन को प्रोटीयोलिटिक मार्ग के रूप में देखा जा सकता है। प्रोटीन की सक्रियता, विनियमन और अवरोध ग्लूकोज के स्तर को बदलने के लिए प्रोटीज प्रतिक्रियाएं हैं और अन्य प्रोटीज को नीचे की ओर ट्रिगर करती हैं। डाटाबेस सामग्री पी. एम. ए. पी. पाँच डाटाबेस को एकीकृत करता है। प्रोटीजडीबी और सबस्ट्रेटडीबी, एक स्वचालित एनोटेशन पाइपलाइन द्वारा संचालित होते हैं जो आणविक जानकारी से भरपूर गतिशील 'अणु पृष्ठ' उत्पन्न करते हैं। कटडीबी के पास 6,600 से अधिक प्रोटीयोलिटिक घटनाओं की जानकारी है, और प्रोफाइलडीबी प्रोटीज की सब्सट्रेट पहचान विशिष्टता की जानकारी के लिए समर्पित है। पाथवेडीबी ने चयापचय मार्गों का संचय शुरू कर दिया है जिनके कार्य को नियम-आधारित तरीके से गतिशील रूप से मॉडल किया जा सकता है। काल्पनिक नेटवर्क का अनुमान साहित्य से अर्ध-स्वचालित निष्कासन द्वारा लगाया जाता है। प्रोटीज सॉफ्टवेयर उपकरण व्यक्तिगत प्रोटीज और प्रोटिओम-वाइड डेटासेट का विश्लेषण करने में मदद कर सकते हैं। उपयोग पी. एम. ए. पी. में लोकप्रिय गंतव्य प्रोटीज मॉलिक्यूल पेज और सबस्ट्रेट मॉलिक्यूल पेज हैं। प्रोटीज अणु पृष्ठ प्रोटीज के पबमेड साहित्य में हाल के समाचार, ज्ञात प्रोटिओलिटिक घटनाएँ, प्रोटीन डोमेन स्थान और प्रोटीन संरचना दृश्य के साथ-साथ अन्य जैव-सूचनात्मक डेटाबेस अनुभाग में एक क्रॉस एनोटेशन दिखाते हैं। सब्सट्रेट मॉलिक्यूल पेज प्रोटीन डोमेन प्रदर्शित करते हैं और रुचि के दिए गए प्रोटीन लक्ष्य के लिए प्रयोगात्मक रूप से व्युत्पन्न प्रोटीज कट-साइट प्रदर्शित करते हैं। साइटोस्केप कम्प्यूटेशनल जीनोमिक्स मेटाबोलिक नेटवर्क मॉडलिंग प्रोटीन-प्रोटीन अंतःक्रिया भविष्यवाणी संदर्भ बाहरी लिंक आधिकारिक वेबसाइट प्रोटियोलिसिस कट साइट डेटाबेस-उपयोगकर्ताओं से क्यूरेटेड विशेषज्ञ एनोटेशन प्रोटेस कट साइट ग्राफिकल इंटरफेस प्रोटेस कटिंग प्रेडिक्टर मेरॉप्स-पेप्टिडेस डेटाबेस आणविक जीव विज्ञान डेटाबेस जैविक सूचना विज्ञान सॉफ्टवेयर सिस्टम जीव विज्ञान गणितीय और सैद्धांतिक जीव विज्ञान प्रोटीन डोमेन प्रोटीन परिवार परिधीय झिल्ली प्रोटीन पोस्ट-ट्रांसलेशनल संशोधन क्रमादेशित कोशिका मृत्यु एपोप्टोसिस