ORF9b
ओ. आर. एफ. 9. बी. (जिसे पहले कभी-कभी ओ. आर. एफ. 13 कहा जाता था) एक जीन है जो सार्स-कोव और सार्स-कोव-2 सहित उपजाति सारबेकोवायरस के कोरोनावायरस में एक वायरल सहायक प्रोटीन को कूटबद्ध करता है। यह एक अतिव्यापी जीन है जिसका खुला पठन ढांचा पूरी तरह से एन जीन के भीतर निहित है, जो कोरोनावायरस न्यूक्लियोकैप्सिड प्रोटीन को कूटबद्ध करता है। एन्कोडेड प्रोटीन सार्स-कोव में 97 एमिनो एसिड अवशेष और सार्स-कोव-2 में 98 होता है, दोनों ही मामलों में प्रोटीन डाइमर बनता है। वैज्ञानिक साहित्य में इस जीन के लिए उपयोग किए जाने वाले नामकरण में विसंगति रही है। सार्स-कोव पर कुछ कार्यों में, इसे ओ. आर. एफ. 13 के रूप में संदर्भित किया गया है। इसे कभी-कभी ORF9a के रूप में भी संदर्भित किया जाता है, जिसके परिणामस्वरूप SARS-CoV में 76 कोडॉन का एक डाउनस्ट्रीम ORF होता है, जो N जीन के साथ भी ओवरलैप होता है, जिसे ORF9b नामित किया जाता है। अनुशंसित नामकरण लंबे ओआरएफ को 9बी और डाउनस्ट्रीम, छोटे ओआरएफ को ओआरएफ9सी के रूप में संदर्भित करता है। संरचना ORF9b प्रोटीन SARS-CoV में 97 एमिनो एसिड अवशेष और SARS-CoV-2 में 98 है। यह केंद्र में एक हाइड्रोफोबिक गुहा के साथ एक बीटा शीट-समृद्ध होमोडिमर बनाता है जो लिपिड को बांधता है। लिपिड-बाइंडिंग गुहा प्रोटीन को झिल्ली में लंगर डालने के लिए एक असामान्य तंत्र के रूप में काम कर सकती है। SARS-CoV-2 ORF9b प्रोटीन के एक टुकड़े को संरचनात्मक रूप से टॉम 70 के साथ एक प्रोटीन परिसर में चिह्नित किया गया है जिसमें ORF9b अलगाव में देखी गई बीटा-शीट संरचना के बजाय एक अल्फा हेलिक्स बनाता है। यह फोल्ड स्विचिंग व्यवहार जैव सूचना विज्ञान की भविष्यवाणियों के अनुरूप भी है और सार्स-कोव होमोलॉग के लिए भी हो सकता है। अभिव्यक्ति और स्थानीयकरण ओ. आर. एफ. 9. बी. दो अतिव्यापी जीनों में से एक है जो पूरी तरह से एन जीन एन्कोडिंग कोरोनावायरस न्यूक्लियोकैप्सिड प्रोटीन के खुले पठन ढांचे के भीतर निहित है, दूसरा ओ. आर. एफ. 9. सी. है। ओ. आर. एफ. 9. बी. अपने बाइसट्रोनिक सबजेनोमिक आर. एन. ए. से राइबोजोम रिसाव स्कैनिंग द्वारा व्यक्त किया जाता है। अपने पड़ोसी ओ. आर. एफ. 9. सी. के विपरीत, इसकी लंबाई सारबेकोवायरस में अच्छी तरह से संरक्षित है और इस बात के मजबूत प्रमाण हैं कि यह एक कार्यात्मक प्रोटीन-कोडिंग जीन है। सार्स-कोव में, प्रोटीन एंडोप्लाज्मिक रेटिकुलम (ई. आर.) और इंट्रासेल्युलर वेसिकल्स में स्थानीयकृत होता है। इसका परमाणु स्थानीयकरण अनुक्रम नहीं है लेकिन निष्क्रिय प्रसार द्वारा कोशिका नाभिक में प्रवेश कर सकता है; हालाँकि इसमें नाभिक से बाहर निकलने के लिए एक परमाणु निर्यात अनुक्रम है। सार्स-कोव-2 में, यह कथित तौर पर माइटोकॉन्ड्रियल झिल्ली से जुड़ा हुआ है। ओ. आर. एफ. 9. बी. प्रोटीन का कार्य अच्छी तरह से वर्णित नहीं है। यह वायरल प्रतिकृति के लिए आवश्यक नहीं है। वायरल प्रोटीन अंतःक्रिया ओ. आर. एफ. 9. बी. प्रोटीन के ओ. आर. एफ. 6, गैर-संरचनात्मक प्रोटीन 5, गैर-संरचनात्मक प्रोटीन 14 और कोरोनावायरस लिफाफा प्रोटीन सहित कई अन्य वायरल प्रोटीन के साथ अंतःक्रिया करने की सूचना मिली है। यह परिपक्व SARS-CoV विरियन में पाया गया है और इस प्रकार एक मामूली वायरल संरचनात्मक प्रोटीन हो सकता है। मेजबान कोशिका प्रभाव ओ. आर. एफ. 9. बी. प्रोटीन मेजबान की प्रतिरक्षा प्रणाली प्रतिक्रिया को संशोधित करने में शामिल हो सकता है। सार्स-कोव-2 प्रोटीन को बाहरी झिल्ली (टी. ओ. एम.) परिसर के माइटोकॉन्ड्रियल ट्रांसलोकेस के एक घटक टॉम 70 के साथ अपनी बातचीत के माध्यम से इंटरफेरॉन प्रतिक्रिया को दबाने के लिए बताया गया है। संदर्भ कोरोनावायरस प्रोटीन