ORF8
ओ. आर. एफ. 8 एकटा जीन छैक जे एकटा विषाणु सहायक प्रोटीन, बेटाकोरोनावाइरस एन. एस. 8 प्रोटीनकेँ उपजाति सारबेकोवाइरसक कोरोना वायरसमे कूटबद्ध करैत छैक। यह जीनोम के सबसे कम संरक्षित और सबसे परिवर्तनशील भागों में से एक है। कुछ वायरसों में, एक विलोपन इस क्षेत्र को दो छोटे खुले रीडिंग फ्रेमों में विभाजित करता है, जिन्हें ORF8a और ORF8b कहा जाता है-कई SARS-CoV वायरल आइसोलेट्स में मौजूद एक विशेषता जो बाद में SARS महामारी के साथ-साथ कुछ चमगादड़ कोरोनावायरस में भी पाई जाती है। इस कारण से पूर्ण लंबाई वाले जीन और इसके प्रोटीन को कभी-कभी ORF8ab कहा जाता है। सार्स-कोव-2 में उदाहरण दिया गया पूर्ण-लंबाई का जीन, अज्ञात कार्य के इम्यूनोग्लोबुलिन डोमेन के साथ एक प्रोटीन को कूटबद्ध करता है, जिसमें संभवतः मेजबान प्रतिरक्षा प्रणाली के साथ बातचीत शामिल होती है। यह संरचना में ORF7a प्रोटीन के समान है, यह सुझाव देते हुए कि यह जीन दोहराव के माध्यम से उत्पन्न हुआ हो सकता है। सार्स-कोव-2 में संरचना ओ. आर. एफ. 8 एन-टर्मिनल संकेत अनुक्रम के साथ 121 एमिनो एसिड अवशेषों के प्रोटीन को कूटबद्ध करता है। ओ. आर. एफ. 8 एक डाइमर बनाता है जो डायसल्फ़ाइड बंधनों द्वारा सहसंयोजक रूप से जुड़ा होता है। इसमें ओ. आर. एफ. 7. ए. प्रोटीन के साथ दूर की समानता के साथ एक इम्यूनोग्लोबुलिन जैसा क्षेत्र है। समान समग्र तह के बावजूद, ओ. आर. एफ. 8 में एक सम्मिलन संभवतः विभिन्न प्रोटीन-प्रोटीन अंतःक्रियाओं के लिए जिम्मेदार है और एक अतिरिक्त द्विमितीकरण इंटरफेस बनाता है। ORF7a के विपरीत, ORF8 में एक ट्रांसमेम्ब्रेन हेलिक्स का अभाव है और इसलिए यह एक ट्रांसमेम्ब्रेन प्रोटीन नहीं है, हालांकि यह सुझाव दिया गया है कि इसमें एक झिल्ली-लंगर रूप हो सकता है। सार्स-कोव और सार्स-कोव-2 में ओ. आर. एफ. 8 बहुत भिन्न हैं, जिनकी अनुक्रम पहचान 20 प्रतिशत से कम है। सार्स-कोव में पूर्ण लंबाई वाला ओ. आर. एफ. 8 122 अवशेषों के प्रोटीन को कूटबद्ध करता है। कई सार्स-कोव आइसोलेट्स में यह ओ. आर. एफ. 8ए और ओ. आर. एफ. 8बी में विभाजित होता है, जो अलग-अलग 39-अवशेष ओ. आर. एफ. 8ए और 84-अवशेष ओ. आर. एफ. 8बी प्रोटीन को व्यक्त करता है। यह सुझाव दिया गया है कि ORF8a और ORF8b प्रोटीन एक प्रोटीन कॉम्प्लेक्स बना सकते हैं। सार्स-कोव-2 प्रोटीन के द्विमितीकरण के लिए जिम्मेदार सिस्टीन अवशेष सार्स-कोव अनुक्रम में संरक्षित नहीं है। ओ. आर. एफ. 8. ए. बी. प्रोटीन को डायसल्फाइड से जुड़े मल्टीमर बनाने के लिए भी बताया गया है। अनुवाद के बाद के संशोधन पूर्ण लंबाई वाले SARS-CoV ORF8ab प्रोटीन को एन-ग्लाइकोसिलेशन द्वारा अनुवाद के बाद संशोधित किया जाता है, जिसके SARS-CoV-2 प्रोटीन में संरक्षित होने की भविष्यवाणी की जाती है। प्रयोगात्मक परिस्थितियों में, 8b और 8ab दोनों सर्वव्यापी हैं। अभिव्यक्ति और स्थानीयकरण अन्य सहायक प्रोटीनों के लिए जीन के साथ, ओ. आर. एफ. 8 जीन कोरोनावायरस आर. एन. ए. जीनोम के 5 'छोर पर संरचनात्मक प्रोटीन को कूटबद्ध करने वाले के पास स्थित है। ORF6, ORF7a और ORF7b के साथ, ORF8 झिल्ली (M) और न्यूक्लियोकैप्सिड (N) जीन के बीच स्थित है। सार्स-कोव-2 ओ. आर. एफ. 8 प्रोटीन में एंडोप्लाज्मिक रेटिकुलम (ई. आर.) की तस्करी के लिए एक संकेत अनुक्रम है और इसे प्रायोगिक रूप से ई. आर. में स्थानीयकृत किया गया है। यह संभवतः एक स्रावित प्रोटीन है। SARS-CoV ORF8a, ORF8b, या ORF8ab प्रोटीन के स्थानीयकरण के संबंध में साहित्य में परिवर्तनशील रिपोर्ट हैं। यह स्पष्ट नहीं है कि ORF8b प्राकृतिक परिस्थितियों में महत्वपूर्ण स्तरों पर व्यक्त किया जाता है या नहीं। पूर्ण लंबाई वाला ओ. आर. एफ. 8. ए. बी. ई. आर. में स्थानीयकृत प्रतीत होता है। ORF8 प्रोटीन का कार्य अज्ञात है। यह SARS-CoV या SARS-CoV-2 में से किसी में भी वायरल प्रतिकृति के लिए आवश्यक नहीं है, हालांकि इस बात के परस्पर विरोधी प्रमाण हैं कि क्या ORF8 का नुकसान वायरल प्रतिकृति की दक्षता को प्रभावित करता है। ओ. आर. एफ. 8 प्रोटीन के लिए अक्सर सुझाया जाने वाला एक कार्य मेजबान प्रतिरक्षा प्रणाली के साथ बातचीत करना है। ऐसा माना जाता है कि सार्स-कोव-2 प्रोटीन की प्रतिरक्षा से बचने या मेजबान प्रतिरक्षा प्रतिक्रियाओं को दबाने के माध्यम से प्रतिरक्षण में भूमिका होती है। यह एक प्रकार I इंटरफेरॉन विरोधी और वर्ग I एम. एच. सी. को कम करने के लिए बताया गया है। सार्स-कोव-2 ओ. आर. एफ. 8 प्रोटीन अत्यधिक प्रतिरक्षात्मक है और कोविड-19 से पीड़ित या ठीक हुए रोगियों में प्रोटीन के लिए उच्च स्तर के एंटीबॉडी पाए गए हैं। एक अध्ययन इंगित करता है कि ओ. आर. एफ. 8 एक प्रतिलेखन अवरोधक है। यह सुझाव दिया गया है कि SARS-CoV ORF8a प्रोटीन मल्टीमर्स में इकट्ठा होता है और एक वाइरोपोरिन बनाता है। ओ. आर. एफ. 8 का विकासवादी इतिहास जटिल है। यह सरबेकोवायरस जीनोम के सबसे कम संरक्षित क्षेत्रों में से एक है। यह बार-बार उत्परिवर्तन और विलोपन के अधीन है, और इसे "अतिपरिवर्तनीय" और एक पुनर्संयोजन हॉटस्पॉट के रूप में वर्णित किया गया है। यह सुझाव दिया गया है कि इस क्षेत्र में आर. एन. ए. द्वितीयक संरचनाएं जीनोमिक अस्थिरता से जुड़ी हैं। ऐसा माना जाता है कि सार्स-कोव में, ओ. आर. एफ. 8 क्षेत्र की उत्पत्ति पैतृक चमगादड़ कोरोनावायरस के बीच पुनर्संयोजन के माध्यम से हुई है। सार्स-कोव में इस क्षेत्र की सबसे विशिष्ट विशेषताओं में से एक 29-न्यूक्लियोटाइड विलोपन का उद्भव है जो पूर्ण लंबाई के खुले रीडिंग फ्रेम को दो छोटे ओआरएफ, ओआरएफ8ए और ओआरएफ8बी में विभाजित करता है। सार्स महामारी की शुरुआत से वायरल आइसोलेट्स में एक पूर्ण लंबाई, अक्षुण्ण ओ. आर. एफ. 8 होता है, लेकिन विभाजित संरचना बाद में महामारी में उभरी। इसके बाद से चमगादड़ कोरोनावायरस में इसी तरह की विभाजित संरचनाएं देखी गई हैं। सार्स-कोव-2 प्रकारों में भी उत्परिवर्तन और विलोपन देखे गए हैं। सार्स-कोव में टिप्पणियों के आधार पर, यह सुझाव दिया गया है कि ओ. आर. एफ. 8 में परिवर्तन मेजबान अनुकूलन से संबंधित हो सकते हैं, लेकिन यह संभव है कि ओ. आर. एफ. 8 मानव मेजबानों में स्वास्थ्य को प्रभावित नहीं करता है। सार्स-कोव में, ओ. आर. एफ. 8 में एक उच्च डी. एन./डी. एस. अनुपात देखा गया है, जो सकारात्मक चयन या आराम से चयन के अनुरूप है। ओ. आर. एफ. 8 एक प्रोटीन को कूटबद्ध करता है जिसका इम्यूनोग्लोबुलिन डोमेन (आई. जी.) ओ. आर. एफ. 7ए के समान है। यह सुझाव दिया गया है कि ORF8 संभवतः जीन दोहराव के माध्यम से ORF7a से विकसित हुआ है, हालांकि कुछ जैव सूचना विज्ञान विश्लेषणों से पता चलता है कि समानता दोहराव का समर्थन करने के लिए बहुत कम हो सकती है, जो वायरस में अपेक्षाकृत असामान्य है। कोरोनावायरस में इम्यूनोग्लोबुलिन डोमेन असामान्य हैं; ओ. आर. एफ. 8 और ओ. आर. एफ. 7ए के साथ बीटाकोरोनावायरस के सबसेट के अलावा, केवल एक छोटी संख्या में चमगादड़ अल्फाकोरोनावायरस की पहचान संभावित आई. जी. डोमेन के रूप में की गई है, जबकि वे गैमाकोरोनावायरस और डेल्टाकोरोनावायरस से अनुपस्थित हैं। एम. ई. आर. एस.-सी. ओ. वी. में ओ. आर. एफ. 8 विशेष रूप से अनुपस्थित है। बीटा और अल्फा आई. जी. डोमेन स्वतंत्र अधिग्रहण हो सकते हैं, जहां ओ. आर. एफ. 8 और ओ. आर. एफ. 7ए को मेजबान प्रोटीन से प्राप्त किया गया हो सकता है। यह भी संभव है कि ओ. आर. एफ. 8 की अनुपस्थिति उन वंशावली में जीन हानि को दर्शाती है। संदर्भ कोरोनावायरस प्रोटीन