Tissue heterogeneity
ऊतक विषमता इस तथ्य को संदर्भित करती है कि जैविक नमूनों से उत्पन्न डेटा को लक्षित ऊतक या प्रोफाइलिंग के अंग की तुलना में अन्य ऊतकों या अंगों से उत्पन्न कोशिकाओं द्वारा समझौता किया जा सकता है। यह जैविक प्रक्रियाओं (जैसे प्रतिरक्षा कोशिका घुसपैठ), नमूना संदूषण, या नमूना लेबलिंग में गलतियों के कारण हो सकता है। ऊतक विषमता आम तौर पर उपयोग किए जाने वाले, संदर्भ जीन अभिव्यक्ति डेटासेट जैसे कि जीनोटाइप-ऊतक अभिव्यक्ति परियोजना (जी. टी. ई. एक्स.) को प्रभावित करती है। कैंसर के नमूने अक्सर विविधता की अलग-अलग डिग्री प्रदर्शित करते हैं, क्योंकि उनमें कई उप-क्लोन, प्रतिरक्षा कोशिकाओं और अन्य प्रकार की कोशिकाओं की ट्यूमर कोशिकाएं होती हैं। कैंसर के अलावा, कई जीन अभिव्यक्ति अध्ययन ऊतक विषमता से प्रभावित होते हैं। सार्वजनिक रूप से उपलब्ध जीन-अभिव्यक्ति अध्ययनों में ऊतक विषमता की व्यापकता 1 प्रतिशत और 40 प्रतिशत के बीच अनुमानित है, जो मूल के ऊतकों के आधार पर भिन्न होती है। ज्ञात ऊतक विषमता का उपयोग विभेदक जीन-अभिव्यक्ति विश्लेषण में नमूनों के वजन के लिए किया जा सकता है ताकि विषमता के प्रभाव को कम किया जा सके। वैकल्पिक रूप से, कोशिका प्रकारों की संरचना का अनुमान लगाने के लिए सेलुलर डीकॉन्वोल्यूशन एल्गोरिदम द्वारा जीन अभिव्यक्ति प्रोफ़ाइल का विश्लेषण किया जा सकता है। संदर्भ ऊतक (जीव विज्ञान)