C12orf50
क्रोमोजोम 12 ओपन रीडिंग फ्रेम 50 (C12orf50) एक प्रोटीन-एन्कोडिंग जीन है जो मनुष्यों में C12orf50 प्रोटीन के लिए एन्कोड करता है। इस जीन के लिए परिग्रहण आईडी NM _ 152589 है। C12orf50 का स्थान 12q21.32 है। यह रिवर्स स्ट्रैंड पर 88429231 से 88373811 (NCBI 37, अगस्त 2010) तक 55.42 kb को कवर करता है। C12orf50 के कुछ पड़ोसी जीन RPS4XP15, LOC107984542 और C12orf29 हैं। आरपीएस4एक्सपी15 ऊपर की ओर सी12ओआरएफ50 है और उसी स्ट्रैंड पर है। LOC107984542 और C12orf29 दोनों डाउनस्ट्रीम हैं। LOC107984542 विपरीत स्ट्रैंड पर है जबकि C12orf29 उसी स्ट्रैंड पर है। C12orf50 में छह समरूप हैं। यह पृष्ठ आइसोफॉर्म X1 पर ध्यान केंद्रित कर रहा है। C12orf50 आइसोफॉर्म X1 1711 न्यूक्लियोटाइड्स लंबा है और इसमें 414 एए की लंबाई वाला प्रोटीन होता है। कार्य ऑन्टोलॉजी सी12ओआरएफ50 के कार्य की ओर इशारा करती है जो एमआरएनए और प्रोटीन बाइंडिंग को सक्षम करना है। यह नाभिक से पॉली (ए) + एम. आर. एन. ए. निर्यात में भी शामिल है। आइसोफॉर्म C12orf50 जीन में 6 आइसोफॉर्म होते हैं। जीन अभिव्यक्ति जीनोम द्वारा विशिष्ट अभिव्यक्ति के साथ मानव ऊतकों के विश्लेषण में, ऊतक-विशिष्टता प्रोटीन-कोडिंग जीन को निर्धारित करने के लिए 27 अलग-अलग ऊतकों का प्रतिनिधित्व करने वाले 95 मानव व्यक्तियों के ऊतक नमूनों पर आरएनए-सेक का प्रदर्शन किया गया था, जिसमें पाया गया कि वृषण को छोड़कर अधिकांश मानव ऊतकों में सी12ओआरएफ50 की अभिव्यक्ति बहुत कम है। C12orf50 की अभिव्यक्ति वृषण की ओर सीमित थी। प्रोटीन असंक्रमित प्रोटीन गुणसूत्र 12 ओपन रीडिंग फ्रेम 50 मनुष्यों में एक प्रोटीन है, जिसे C12orf50 जीन द्वारा कूटबद्ध किया गया है। प्रोटीन परिग्रहण आईडी क्यू8एनए57 है। प्रोटीन की लंबाई 414aa होती है। प्रोटीन का अनुमानित द्रव्यमान 47.2 केडीए है। प्रोटीन में सी. सी. सी. एच.-प्रकार का जेड. एन. फिंगर डोमेन शामिल है। प्रोटीन में सी-एक्स8-सी-एक्स5-सी-एक्स3-एच मोटिफ के साथ सीसीसीएच-प्रकार का जेडएन फिंगर डोमेन है। डोमेन प्रोटीन की शुरुआत में शुरू होता है और 44वें अमीनो एसिड में जाता है। प्रोटीन में तीन अव्यवस्थित क्षेत्र भी होते हैं-136वें अमीनो एसिड से लेकर 33 एए की लंबाई के साथ 168वें, 37 एए की लंबाई के साथ 297वें से 333वें और 69 एए की लंबाई के साथ 346वें से 414वें। अनुमानित आणविक भार 47.3 केडीए है और अनुमानित सम-विद्युत बिंदु 8.79 है। संरचना सी12ओआरएफ50 के लिए अनुमानित तृतीयक संरचना में जिंक फिंगर डोमेन में प्रोटीन की शुरुआत में दो बीटा-शीट और 106-124 एए से एक हेलिक्स होता है। ये स्तनधारी ऑर्थोलॉग में संरक्षित हैं। यहाँ बड़ी संख्या में कुंडलित क्षेत्र भी हैं। प्रवर्तक, 3 'यू. टी. आर. क्षेत्र और 5' यू. टी. आर. बहुत अच्छी तरह से संरक्षित हैं। एमिनो एसिड 87 से 111 तक हेलिक्स से पहले और शुरुआत में एक नकारात्मक समूह (अम्लीय क्षेत्र) होता है। स्थानीयकरण नाभिक में होने की एक 47.8% संभावना है और कोशिका द्रव्य में होने की एक 30.4% संभावना है। इसकी पुष्टि सिग्मा-एल्ड्रिच द्वारा इम्यूनोहिस्टोकेमिस्ट्री और इम्यूनोफ्लोरेसेंस द्वारा की गई थी जो नाभिक और कोशिका द्रव्य दोनों में सकारात्मकता दिखा रहा था। एक परमाणु स्थान संकेत और अम्लीय क्षेत्र है। ऑर्थोलॉग यह भी पुष्टि करते हैं कि C12orf50 नाभिक और कोशिका द्रव्य में स्थानीयकृत है। प्रोटीन अंतःक्रियाएँ दो प्रोटीन (जी. ए. पी. डी. एच. एस. और जी. ओ. एल. जी. ए. 2) हैं जो सी12ओ. आर. एफ. 50 के साथ अंतःक्रिया करते हैं। ग्लिसराल्डेहाइड-3-फॉस्फेट डिहाइड्रोजनेज, शुक्राणुजन्य (जी. ए. पी. डी. एच. एस.) एंजाइम विभिन्न ऊर्जा उत्पादक मार्गों के बीच बदलाव को विनियमित करने में महत्वपूर्ण भूमिका निभा सकता है, और यह शुक्राणु गतिशीलता और पुरुष प्रजनन क्षमता के लिए आवश्यक है। अनुवाद के बाद के संशोधनों सी12ओआरएफ50 के विभिन्न फॉस्फोराइलेशन, सी-मैनोसिलेशन और ओ-ग्लाइकोसिलेशन से गुजरने की भविष्यवाणी की गई है। फॉस्फोराइलेशन स्थल अमीनो एसिड 262,349 और 370 पर हैं। ओ-ग्लाइकोसिलेशन स्थल अमीनो एसिड 139,238 और 374 हैं। सी-मनोसिलेशन स्थल अमीनो एसिड 13,102,292 और 388 हैं। इवोल्यूशन C12orf50 की विकास दर फाइब्रिनोजेन अल्फा के करीब है, जो इसे अपेक्षाकृत तेज बनाती है। C12orf50 के लिए ऑर्थोलॉग स्तनधारियों, सरीसृपों, पक्षियों और उभयचर कैसिलियन में पाए गए हैं। मेंढक, मछली, अकशेरुकी या कवक के लिए कोई ऑर्थोलॉग नहीं पाए गए। प्लैटिपस के अपवाद के साथ स्तनधारी ऑर्थोलॉग ने मनुष्यों के साथ सबसे अधिक समानता साझा की। स्तनधारियों से मनुष्यों के विचलन की सीमा 6.4-180 मिलियन वर्ष थी। सरीसृप ऑर्थोलॉग अगले समान थे और लगभग 318 मिलियन वर्ष पहले अलग हो गए थे। फिर पक्षी उसी समय मनुष्यों से अलग हो गए जब सरीसृप थे। उभयचर कैसिलियन सबसे कम समान थे और वे लगभग 351.7 मिलियन वर्ष पहले अलग हो गए थे। होमोलॉजी ऑर्थोलॉग्स C12orf50 में स्तनधारियों, पक्षियों, सरीसृपों और सीसिलियन उभयचरों में ऑर्थोलॉग्स हैं। उभयचर मेंढकों, अकशेरुकी जीवों, पौधों, कवक या खमीर में कोई ऑर्थोलॉग नहीं पाए गए। नीचे दी गई तालिका में कुछ अर्थोलॉग दिखाए गए हैं जो ब्लास्ट पर पाए जा सकते हैं। पैरालॉग C12orf50 में दो पैरालॉग हैंः ZC3H11A और ZC3H11B। जिंक द फिंगर डोमेन को दोनों पैरालॉग में माना जाता है। संदर्भ