ORF3c
ओ. आर. एफ. 3. सी. सार्स-कोव और सार्स-कोव-2 सहित उपजाति सरबेकोवायरस के कोरोना वायरस में पाया जाने वाला एक जीन है। यह पहली बार सार्स-कोव-2 जीनोम में पहचाना गया था और अज्ञात कार्य के 41 एमिनो एसिड गैर-संरचनात्मक प्रोटीन को कूटबद्ध करता है। यह सार्स-कोव जीनोम में भी मौजूद है, लेकिन सार्स-कोव-2 होमोलॉग की पहचान होने तक इसकी पहचान नहीं की गई थी। SARS-CoV-2 के सहायक प्रोटीन के लिए उपयोग किए जाने वाले नामकरण के बारे में वैज्ञानिक साहित्य में महत्वपूर्ण भ्रम है, विशेष रूप से ORF3a के साथ कई अतिव्यापी जीन। ओआरएफ3सी जीन के अनुमानित प्रोटीन उत्पाद को कम से कम एक बार "3बी प्रोटीन" के रूप में संदर्भित किया गया है, लेकिन इसे गैर-समरूप जीन ओआरएफ3बी के साथ भ्रमित नहीं होना चाहिए। इसे ORF3h और ORF3a.iORF1 नामों से भी वर्णित किया गया है। सार्स-कोव-2 के लिए अनुशंसित नामकरण इस जीन के लिए ओआरएफ3सी शब्द का उपयोग करता है। तुलनात्मक जीनोमिक्स ओ. आर. एफ. 3. सी. एक अतिव्यापी जीन है जिसका खुला पठन ढांचा सार्स-कोव-2 जीनोम में ओ. आर. एफ. 3. ए. और ओ. आर. एफ. 3. डी. दोनों को अतिव्यापी करता है। यह संभावित रूप से एक ही अनुक्रम क्षेत्र एन्कोडिंग कार्यात्मक प्रोटीन के सभी तीन संभावित पठन फ्रेमों का एक दुर्लभ उदाहरण है। सारबेकोवायरस अनुक्रमों के जैव सूचना विज्ञान विश्लेषण से पता चलता है कि ओ. आर. एफ. 3. सी. का अनुक्रम और लंबाई अच्छी तरह से संरक्षित है, जो दर्शाता है कि यह एक कार्यात्मक प्रोटीन को कूटबद्ध करने की संभावना है। ऐसा प्रतीत होता है कि यह शुद्धिकरण चयन के अधीन है। राइबोसोम प्रोफाइलिंग प्रयोग इस बात की पुष्टि करते हैं कि ओ. आर. एफ. 3. सी. जीन एक प्रोटीन उत्पाद को व्यक्त करता है। अपेक्षाकृत छोटे 41-अवशेष प्रोटीन में एक ट्रांसमेम्ब्रेन डोमेन होने की भविष्यवाणी की गई है और इसमें एक वाइरोपोरिन की सूचक विशेषताएं हैं। संदर्भ कोरोनावायरस प्रोटीन वायरल गैर-संरचनात्मक प्रोटीन