TRAMP complex
टी. आर. ए. एम. पी. कॉम्प्लेक्स (टी. आर. एफ. 4/एयर 2/एम. टी. आर. 4 पी. पॉलीएडेनाइलेशन कॉम्प्लेक्स) एक बहु-प्रोटीन, हेटेरोट्रिमेरिक कॉम्प्लेक्स है जिसमें वितरणात्मक पॉलीएडेनाइलेशन गतिविधि होती है और पॉलीमरेज़ द्वारा उत्पादित आर. एन. ए. की विस्तृत किस्मों की पहचान करता है। इसकी खोज मूल रूप से सैकरोमाइसेस सेरेविसिया में लाकावा एट अल, वानाकोवा एट अल द्वारा की गई थी। और वायर्स आदि। 2005 में। यह यूकेरियोटिक कोशिकाओं के नाभिक में एक्सोसोम कॉम्प्लेक्स के साथ बातचीत करता है और राइबोसोमल आरएनए और स्नोआरएनए के 3 'अंत प्रसंस्करण और क्षरण में शामिल है। टी. आर. ए. एम. पी. परिसर आर. आर. पी. 6 के लिए निर्धारित आर. एन. ए. की पॉली (ए) पूंछ और कोर एक्सोजोम को 4-5 एडेनोसाइन तक ट्रिम करता है जो प्रतिलेखन पहचान और एक्सोजोम जटिल सक्रियण में सहायता करता है। ट्रेम्प कॉम्प्लेक्स की उपस्थिति में एक्सोसोम की सब्सट्रेट विशिष्टता में सुधार किया जाता है क्योंकि यह एक महत्वपूर्ण सह-कारक के रूप में कार्य करता है और विभिन्न गतिविधियों को बनाए रखने में मदद करता है। इस तरह, ट्रैम्प व्यापक आर. एन. ए. पोलीमरेज़ II प्रतिलेखन के माध्यम से उत्पन्न गैर-कोडिंग प्रतिलेखों की कोशिका से छुटकारा पाने के साथ-साथ कार्यात्मक कोडिंग और गैर-कोडिंग आर. एन. ए. के जैवजनन और कारोबार में कार्य करने में महत्वपूर्ण भूमिका निभाता है। ट्रैम्प कॉम्प्लेक्स प्रत्यक्ष या अप्रत्यक्ष रूप से विभिन्न अन्य आर. एन. ए. प्रक्रियाओं को भी प्रभावित करता है। यह आर. एन. ए. निर्यात, स्प्लिसिंग, हेटेरो-क्रोमेटिक जीन साइलेन्सिंग में शामिल है और जीनोम की स्थिरता बनाए रखने में मदद करता है। घटक गैर-कैनॉनिकल पॉली (ए) पॉलीमरेज़ पोल (ए) पॉलीमरेज़ ने डी. एन. ए. टोपोइज़ोमेरेज़ टॉप1पी के साथ विभिन्न आनुवंशिक अंतःक्रियाएँ दिखाईं और इसलिए उन्हें टोपोइज़ोमेरेज़ से संबंधित कार्य टी. आर. एफ. 4पी और टी. आर. एफ. 5पी कहा गया क्योंकि डी. एन. ए. के साथ इस अंतःक्रिया का जीनोमिक स्थिरता में एक महत्वपूर्ण हिस्सा है। कोशिका में टी. आर. एफ. 4. पी. टी. आर. एफ. 5. पी. की तुलना में अधिक सांद्रता में होता है और फीनोटाइप पर भी इसका अधिक प्रभाव पड़ता है। टी. आर. एफ. 4. पी. पूरे नाभिक में मौजूद होता है जबकि टी. आर. एफ. 5. पी. मुख्य रूप से नाभिक में पाया जाता है। टी. आर. एफ. 4. पी. संरचना में एक केंद्रीय क्षेत्र और एक उत्प्रेरक क्षेत्र होता है जो विहित बहुलकों की संरचना के समान होता है। सी. आई. डी. 1 परिवार से संबंधित टी. आर. ए. एम. पी. परिसर के गैर-कैनॉनिकल पॉली (ए) पोलीमरेज़ (टी. आर. एफ. 4. पी. या टी. आर. एफ. 5. पी.) में आर. एन. ए. मान्यता रूपांकन (आर. आर. एम.) नहीं होता है, इसलिए गैर-कैनॉनिकल पॉलीमरेज़ द्वारा पॉलीएडीनाइलेशन के लिए एयर1/एयर2 जैसे अतिरिक्त प्रोटीन की आवश्यकता होती है। जिंक नकल प्रोटीन जिंक नकल प्रोटीन एयर1पी/एयर2पी (आर्जिनिन मिथाइलट्रांसफेरेज-इंटरैक्टिंग रिंग-फिंगर प्रोटीन) मुख्य रूप से आर. एन. ए. के बंधन में शामिल होते हैं। पाँच सी. सी. एच. सी. (सी का अर्थ है सिस्टीन और एच का अर्थ है हिस्टिडीन) जिंक नकल मोटिफ हैं जो सी और एन टर्मिनलों के बीच मौजूद हैं। एयर2पी प्रोटीन में, चौथे और पांचवें जिंक नकल की अलग-अलग भूमिकाएँ होती हैं। चौथी जिंक नकल की आर. एन. ए. बंधन में भूमिका होती है जबकि पाँचवीं नकल प्रोटीन-प्रोटीन अंतःक्रियाओं के लिए महत्वपूर्ण है। एयर2पी, टीआरएफ4पी के केंद्रीय क्षेत्र के साथ अंतःक्रिया करता है और टीआरएफ4पी की पॉलीएडीनाइलेशन गतिविधि इस अंतःक्रिया पर निर्भर करती है क्योंकि नकल्स का विलोपन या उत्परिवर्तन पॉलीएडीनाइलेशन गतिविधि में बाधा डालता है। एयर1पी एन. पी. एल. 3. पी. (एक प्रोटीन जो जिम्मेदार एम. आर. एन. ए. निर्यात है) के मिथाइलेशन को रोकने के लिए जिम्मेदार है। एयर1पी/एयर2पी भी असामान्य एम. आर. एन. पी. को टी. आर. ए. एम. पी. मार्ग पर निर्देशित करता है और उनके क्षरण के बारे में लाता है। स्की2 जैसे हेलिकेस एम. टी. आर. 4. पी. हेलिकेस एम. टी. आर. 4. पी. की खोज गर्मी प्रतिरोधी उत्परिवर्तकों की जांच के दौरान की गई थी जो नाभिक में पॉली (ए) आर. एन. ए. इकट्ठा करते हैं और मुख्य रूप से अनवाइंडिंग गतिविधि में शामिल होते हैं। एम. टी. आर. 4. पी. (जिसे डी. ओ. बी. 1. पी. भी कहा जाता है) एक एस. एफ. 2 हेलिकेस है और डी. ई. एक्स. एच.-बॉक्स आर. एन. ए. हेलिकेस परिवार से संबंधित है जिसमें दो आर. सी. ए. जैसे डोमेन शामिल हैं। इसमें डब्ल्यू. एच. डोमेन (विंग्ड हेलिक्स डोमेन), एक आर्क डोमेन (जिसे स्टंक और के. ओ. डब्ल्यू. डोमेन [किप्राइड्स, ओज़ौनिस, वूज़ डोमेन] भी कहा जाता है) और हेलिकल बंडल डोमेन भी शामिल हैं। हेलिकेस कोर की सतह पर डब्ल्यूएच और पेचदार बंडल डोमेन की पैकिंग के परिणामस्वरूप एसएसआरएनए के लिए एक चैनल का निर्माण होता है। एम. टी. आर. 4. पी. को क्यू-मोटिफ द्वारा मध्यस्थता किए गए आर. एन. ए. डुप्लेक्स अनवाइंडिंग के लिए ए. टी. पी. या डी. ए. टी. पी. हाइड्रोलिसिस की आवश्यकता होती है। एम. टी. आर. 4. पी. की अनवाइंडिंग गतिविधि के लिए युग्मित क्षेत्र के लिए एक एकल-फंसे क्षेत्र 3 'भी आवश्यक है। एक्सोजोम के विभिन्न घटकों के साथ सीधे संपर्क के माध्यम से, एम. टी. आर. 4. पी. परमाणु एक्सोजोम में टी. आर. ए. एम. पी. परिसर के आर. एन. ए. सब्सट्रेट को उचित रूप से जोड़ने में मदद करता है। कैनॉनिकल और गैर-कैनॉनिकल पॉलीमरेज़ के बीच अंतर गैर-कैनॉनिकल और कैनॉनिकल पॉली (ए) पॉलीमरेज़ के बीच का अंतर यह है कि कैनॉनिकल पॉलीमरेज़ एमआरएनए को बनाए रखने में मदद करते हैं और इसकी गतिविधि एमआरएनए में एक विशिष्ट अनुक्रम द्वारा नियंत्रित होती है जबकि गैर-कैनॉनिकल पॉलीमरेज़ का पॉलीएडीनैलेशन आरएनए में एक अलग विनियमित अनुक्रम का उपयोग करता है और अपक्षय या प्रसंस्करण के लिए आरएनए को निर्दिष्ट करता है। कैनोनिकल पोलीमरेज़ डी. एन. ए. पोलीमरेज़ β सुपरफ़ैमिली से संबंधित हैं जबकि गैर-कैनोनिकल पोलीमरेज़ सी. आई. डी. 1 परिवार से संबंधित हैं, एक और मुख्य अंतर पॉली (ए) पूंछ की लंबाई है; कैनोनिकल पोलीमरेज़ कई एडेनाइलेट्स जोड़ सकते हैं इस प्रकार उत्पादित आर. एन. ए. में लंबी पॉली (ए) पूंछ होती है जबकि दूसरी ओर गैर-कैनोनिकल पोलीमरेज़ पॉली (ए) पूंछ की छोटी लंबाई के साथ आर. एन. ए. का उत्पादन कर सकते हैं क्योंकि वे केवल कुछ एडेनाइलेट्स जोड़ सकते हैं। 3 '-> 5' एक्सोन्यूक्लीज़ कॉम्प्लेक्स एक्सोज़ोम के साथ अंतःक्रिया ट्रैम्प कॉम्प्लेक्स एक्सोज़ोम नामक 3 '-> 5' एक्सोन्यूक्लीज़ कॉम्प्लेक्स की मदद से विभिन्न आर. एन. ए. का क्षरण या प्रसंस्करण करता है। आर. एन. एस. पी. एच. डोमेन प्रोटीन, आर. आर. पी. 41पी, आर. आर. पी. 42पी, आर. आर. पी. 43पी, आर. आर. पी. 45पी, आर. आर. पी. 46पी और एम. टी. आर. 3पी के हेक्सामेरिक रिंग में एस. सेरेविसिया का एक्सोजोम शामिल होता है। एक्सोजोम टीआरएएमपी कॉम्प्लेक्स इनविट्रो की मदद से आरआरपी6पी की उपस्थिति में आरएनए क्षरण को अधिक कुशलता से ला सकता है। इसके अलावा, आर. एन. ए. क्षरण को विभिन्न एक्सोजोम सह-कारकों की उपस्थिति में बढ़ाया जाता है जिन्हें सह-प्रतिलेखन के रूप में भर्ती किया जाता है। स्की कॉम्प्लेक्स जिसमें स्की2पी, स्की3पी, स्की8पी शामिल हैं, सभी एमआरएनए क्षरण मार्गों के लिए साइटोप्लाज्मिक एक्सोजोम द्वारा आवश्यक है। स्की7पी प्रोटीन के साथ साइटोप्लाज्मिक एक्सोजोम विभिन्न असामान्य राइबोसोम और एमआरएनए से जुड़ जाता है और उनका क्षरण लाता है। घटकों के बीच अंतर-संबंध TRAMP परिसर के सभी घटक एक दूसरे से परस्पर संबंधित हैं। पॉली (ए) पोलीमरेज़ जैसे टी. आर. एफ. 4. पी./टी. आर. एफ. 5. पी. की गतिविधि के लिए जिंक नकल प्रोटीन आवश्यक हैं। इसी तरह एक्सोसोम द्वारा लाए गए आर. एन. ए. क्षरण को स्की2 जैसे हेलिकेस और एम. टी. आर. 4. पी. की अनवाइंडिंग गतिविधि द्वारा उत्तेजित किया जाता है जो एक कोफैक्टर के रूप में कार्य करता है। टीआरएएमपी परिसर में टीआरएफ4पी/एयर2पी द्वारा एमटीआर4पी की अनवाइंडिंग गतिविधि में सुधार किया जाता है। पॉली (ए) पूंछ की लंबाई को बनाए रखने और नियंत्रित करने में भी एम. टी. आर. 4. पी. की महत्वपूर्ण भूमिका है। लेकिन एम. टी. आर. 4. पी. के विनाश या अनुपस्थिति के परिणामस्वरूप हाइपरएडेनाइलेशन होता है और पॉली (ए) पूंछ की लंबाई में बाधा आती है। टी. आर. एफ. 5. पी., एयर1. पी. और एम. टी. आर. 4. पी. के बीच बने परिसर को टी. आर. ए. एम. पी. 5 परिसर कहा जाता है। एस. सेरेविसिया में पोलीमरेज़ की उपस्थिति के आधार पर दो प्रकार के ट्रैम्प कॉम्प्लेक्स होते हैं। यदि टी. आर. एफ. 4. पी. मौजूद है तो परिसर को टी. आर. ए. एम. पी. 4 कहा जाता है और यदि टी. आर. एफ. 5. पी. मौजूद है तो इसे टी. आर. ए. एम. पी. 5 कहा जाता है। तीनों पोलीमरेज़ (पोल I, II, III) द्वारा उत्पादित आर. एन. ए. सब्सट्रेट आर. एन. ए. टी. आर. ए. एम. पी. कॉम्प्लेक्स के लिए सब्सट्रेट के रूप में कार्य करते हैं। ट्रैम्प कॉम्प्लेक्स विभिन्न आर. एन. ए. के प्रसंस्करण और निगरानी में शामिल है और असामान्य आर. एन. ए. को कम करता है। विभिन्न प्रकार के आर. एन. ए. सब्सट्रेट में राइबोसोमल आर. एन. ए. (आर. आर. एन. ए.), छोटे नाभिकीय आर. एन. ए. (एस. एन. ओ. आर. एन. ए.), स्थानांतरण आर. एन. ए. (टी. आर. एन. ए.), छोटे नाभिकीय आर. एन. ए. (एस. एन. आर. एन. ए.), आर. एन. ए. पोलीमरेज़ II (पोल II) के लंबे प्रतिलेख आदि शामिल हैं। लेकिन वह तंत्र जिसके द्वारा टीआरएएमपी कॉम्प्लेक्स विभिन्न सब्सट्रेट की पहचान करता है, अज्ञात है। टीआरएएमपी परिसर एक्सोसोम जटिल एक्सोन्यूक्लीज आरआरपी6 को संलग्न करके आरएनए प्रसंस्करण में अधिक कुशलता से काम करता है जिसमें एनएबी3 (आरएनए बाइंडिंग प्रोटीन) एक महत्वपूर्ण भूमिका निभाता है। मिथाइलट्रांसफेरेज एचएमटी1पी (आरएमटी1पी) जैसे विभिन्न एंजाइमों के कारण क्रोमैटिन पोस्ट-ट्रांसक्रिप्शनल संशोधनों को बनाए रखने में भूमिका का क्रोमैटिन रखरखाव पर अप्रत्यक्ष प्रभाव पड़ सकता है। क्रोमैटिन संरचनाएँ तब प्रभावित होती हैं जब टी. आर. ए. एम. पी. परिसर के आर. एन. ए. सब्सट्रेट को जीनोम में प्रतिलेखित किया जाता है। विभिन्न टीआरएएमपी घटक विभिन्न प्रोटीनों के साथ शारीरिक और आनुवंशिक रूप से परस्पर क्रिया करते हैं और क्रोमैटिन और डीएनए चयापचय में परिवर्तन लाते हैं। TRAMP-मध्यस्थ प्रक्रियाओं का संरक्षण Saccharomyces cerevisiae में TRAMP परिसर के घटक खमीर से लेकर स्तनधारियों तक के अन्य जीवों में संरक्षित हैं। सिड14पी, एयर1पी और एम. टी. आर. 4पी सहित स्किज़ोसेकेरोमाइसेस पोम्बे के टी. आर. ए. एम. पी. जटिल घटक कार्यात्मक रूप से एस. सेरेविसिया में टी. आर. ए. एम. पी. परिसर के घटकों के समान हैं। मनुष्यों में ट्रैम्प कॉम्प्लेक्स में हेलिकेस एच. एम. टी. आर. 4. पी., एक गैर-कैनॉनिकल पॉली (ए) पोलीमरेज़ एच. पी. ए. पी. डी. (पी. ए. पी.-संबंधित डोमेन-युक्त) 5 या एच. पी. ए. पी. डी. 7, और एक जिंक नकल प्रोटीन एच. जेड. सी. सी. एच. सी. 7, आर. एन. ए. बाइंडिंग प्रोटीन एच. आर. बी. एम. 7. पी. सहित विभिन्न घटक होते हैं। संदर्भ प्रोटीन परिसर