Transcription factor II B
प्रतिलेखन कारक II बी (टी. एफ. आई. आई. बी.) एक सामान्य प्रतिलेखन कारक है जो आर. एन. ए. पोलीमरेज़ II प्रीनिटिएशन कॉम्प्लेक्स (पी. आई. सी.) के गठन में शामिल है और प्रतिलेखन की शुरुआत को उत्तेजित करने में सहायता करता है। टी. एफ. आई. आई. बी. नाभिक के लिए स्थानीयकृत है और डी. एन. ए.-टी. बी. पी. (टी. ए. टी. ए.-बाइंडिंग प्रोटीन) परिसर को बांधकर और स्थिर करके और आर. एन. ए. पोलीमरेज़ II और अन्य प्रतिलेखन कारकों की भर्ती करके पी. आई. सी. गठन के लिए एक मंच प्रदान करता है। यह जीन द्वारा कूटबद्ध किया जाता है, और आर्कियल प्रतिलेखन कारक बी के लिए समरूप है और बैक्टीरियल सिग्मा कारकों के अनुरूप है। संरचना टी. एफ. आई. आई. बी. एक एकल 33के. डी. ए. पॉलीपेप्टाइड है जिसमें 316 एमिनो एसिड होते हैं। टी. एफ. आई. आई. बी. चार कार्यात्मक क्षेत्रों से बना हैः सी-टर्मिनल कोर डोमेन; बी लिंकर; बी रीडर और एमिनो टर्मिनल जिंक रिबन। टी. एफ. आई. आई. बी. प्रतिलेखन कारक आई. आई. डी. की टी. ए. टी. ए.-बाध्यकारी प्रोटीन (टी. बी. पी.) उप-इकाई और आर. एन. ए. पोलीमरेज़ II की आर. पी. बी. 1 उप-इकाई के साथ प्रोटीन-प्रोटीन अंतःक्रिया करता है। टी. एफ. आई. आई. बी. बी. पहचान तत्व (बी. आर. ई.) के साथ अनुक्रम-विशिष्ट प्रोटीन-डी. एन. ए. अंतःक्रिया करता है, जो टी. ए. टी. ए. तत्व के बगल में एक प्रवर्तक तत्व है। पी. आई. सी. के गठन और प्रतिलेखन आरंभ में टी. एफ. आई. आई. बी. कार्रवाई के तंत्र में छह चरण हैंः आर. एन. ए. पोलीमरेज़ II को टी. एफ. आई. आई. बी. बी कोर और बी रिबन के माध्यम से डी. एन. ए. में भर्ती किया जाता है। आर. एन. ए. पोलीमरेज़ II टी. एफ. आई. आई. बी. बी. लिंकर और बी. रीडर (ओपन काम्प्लेक्स फॉर्मेशन) की सहायता से डी. एन. ए. को खोलता है। आर. एन. ए. पोलीमरेज़ II टी. एफ. आई. आई. बी. बी. रीडर द्वारा सहायता प्राप्त एक प्रतिलेखन प्रारंभ स्थल का चयन करता है। आर. एन. ए. पोलीमरेज़ II पहला फॉस्फोडीस्टर बंधन बनाता है। आर. एन. ए. पोलीमरेज़ II नवजात आर. एन. ए. और टी. एफ. आई. आई. बी. बी. रीडर लूप के बीच टकराव के कारण लघु अप्रभावी प्रतिलेखों का उत्पादन करता है। नवजात आर. एन. ए. के 12-13 न्यूक्लियोटाइड्स तक विस्तार से टी. एफ. आई. आई. बी. के साथ आगे की झड़पों के कारण टी. एफ. आई. आई. बी. का निष्कासन होता है। आर. एन. ए. पोलीमरेज़ II के साथ अंतःक्रिया टी. एफ. आई. आई. बी. के प्रत्येक कार्यात्मक क्षेत्र आर. एन. ए. पोलीमरेज़ II के विभिन्न भागों के साथ अंतःक्रिया करते हैं। एमिनो टर्मिनल बी रिबन आर. एन. ए. पोलीमरेज़ II के डॉक डोमेन पर स्थित है और सक्रिय स्थल की ओर दरार तक फैला हुआ है। बी रिबन का विस्तार बी रीडर है जो आर. एन. ए. निकास सुरंग के माध्यम से डी. एन. ए.-आर. एन. ए. संकर के बंधन स्थल और सक्रिय स्थल की ओर फैलता है। बी लिंकर बी रीडर और बी कोर के बीच का क्षेत्र है जो आर. एन. ए. पोलीमरेज़ II के दरार में पाया जाता है और पतवार और क्लैंप कुंडलित-कुंडल द्वारा तब तक जारी रहता है जब तक कि यह सी टर्मिनल बी कोर तक नहीं पहुंच जाता जो आर. एन. ए. पोलीमरेज़ II की दीवार के ऊपर पाया जाता है। बी रीडर और बी लिंकर में अत्यधिक संरक्षित अवशेष होते हैं जो आर. एन. ए. पोलीमरेज़ II सुरंग के माध्यम से सक्रिय स्थल की ओर स्थित होते हैं और इन प्रमुख अवशेषों के पृथक्करण के बिना तंग बंधन सुनिश्चित करते हैं। इन दोनों क्षेत्रों को आर. एन. ए. पोलीमरेज़ II के कुछ अधिक लचीले क्षेत्रों की स्थिति को समायोजित करने के लिए भी सोचा जाता है ताकि डी. एन. ए. की सटीक स्थिति की अनुमति दी जा सके और नवजात आर. एन. ए. श्रृंखला पर नए एन. टी. पी. को जोड़ा जा सके। आर. एन. ए. पोलीमरेज़ II को बांधने पर, बी रीडर और बी लिंकर आर. एन. ए. पोलीमरेज़ II के फलाव क्षेत्र के मामूली पुनर्स्थापना का कारण बनते हैं जो एक आवश्यक दूसरे मैग्नीशियम आयन को सक्रिय स्थल में बांधने की अनुमति देता है। यह एक बीटा शीट और एक क्रमबद्ध लूप बनाता है जो प्रतिलेखन शुरू होने पर संरचना की स्थिरता में मदद करता है। खुले और बंद परिसर खुले और बंद अनुरूपण डीएनए की स्थिति को संदर्भित करते हैं और क्या टेम्पलेट स्ट्रैंड को पी. आई. सी. के भीतर गैर-टेम्पलेट स्ट्रैंड से अलग किया गया है। जिस स्थान पर डी. एन. ए. बुलबुला बनाने के लिए खुलता है, वह एक सुरंग के ऊपर स्थित है जो बी-कोर, बी-लिंकर और बी-रीडर के साथ-साथ आर. एन. ए. पोलीमरेज़ II के कुछ हिस्सों द्वारा पंक्तिबद्ध है। बी लिंकर सीधे उस बिंदु के साथ संरेखित पाया जाता है जिस पर डी. एन. ए. खुलता है और खुले परिसर में यह दो डी. एन. ए. तारों के बीच पाया जाता है, यह सुझाव देते हुए कि इसकी प्रवर्तक पिघलने में भूमिका है, लेकिन उत्प्रेरक आर. एन. ए. संश्लेषण में इसकी कोई भूमिका नहीं है। हालाँकि टी. एफ. आई. आई. बी. दोनों संरचनाओं में एक समान संरचना रखता है, लेकिन डी. एन. ए. खुलने पर कोर और बी रीडर के बीच कुछ इंट्रामोलिकुलर इंटरैक्शन बाधित हो जाते हैं। डी. एन. ए. के पिघलने के बाद प्रतिलेखन आरंभकर्ता (आई. एन. आर.) डी. एन. ए. पर स्थित होना चाहिए ताकि टी. एस. एस. को आर. एन. ए. पोलीमरेज़ II द्वारा पहचाना जा सके और प्रतिलेखन शुरू किया जा सके। यह 'टेम्पलेट टनल' के माध्यम से डी. एन. ए. को पारित करके किया जाता है और डी. एन. ए. को स्कैन किया जाता है, आई. एन. आर. की तलाश की जाती है और इसे ऐसी स्थिति में रखा जाता है जो यह सुनिश्चित करता है कि प्रतिलेखन प्रारंभ स्थल आर. एन. ए. पोलीमरेज़ सक्रिय स्थल द्वारा सही स्थान पर स्थित है। टी. एफ. आई. आई. बी. का बी रीडर टेम्पलेट सुरंग में पाया जाता है और आई. एन. आर. का पता लगाने में महत्वपूर्ण है, बी रीडर में उत्परिवर्तन टी. एस. एस. को बदलने का कारण बनता है और इसलिए गलत प्रतिलेखन होता है (हालांकि पी. आई. सी. गठन और डी. एन. ए. पिघलना अभी भी होता है)। खमीर इस संरेखण का एक विशेष रूप से अच्छा उदाहरण है क्योंकि खमीर इनर मोटिफ में स्थिति 28 पर सख्ती से संरक्षित ए अवशेष होता है और खुले जटिल मॉडल में बी रीडर हेलिक्स में एक पूरक टी अवशेष पाया जा सकता है। जब इस टी अवशेष को उत्परिवर्तित किया जाता है, तो बी रीडर की भूमिका पर जोर देते हुए प्रतिलेखन काफी कम प्रभावी था। बी रीडर लूप को सक्रिय स्थल में एन. टी. पी. को स्थिर करने के लिए आगे सोचा जाता है और इसके लचीलेपन के कारण, आर. एन. ए. अणु के प्रारंभिक संश्लेषण के दौरान न्यूक्लिक एसिड को संपर्क में रहने की अनुमति देता है। बढ़ते आर. एन. ए.-डी. एन. ए. संकर को स्थिर करता है) रिलीज जब आर. एन. ए. प्रतिलेख 7 न्यूक्लियोटाइड्स तक लंबा पहुंच जाता है, तो प्रतिलेखन विस्तार चरण में प्रवेश करता है, जिसकी शुरुआत डी. एन. ए. बुलबुले के ढहने और टी. एफ. आई. आई. बी. के निकास से होती है। ऐसा इसलिए माना जाता है क्योंकि नवजात आर. एन. ए. बी. लिंकर हेलिक्स के साथ टकराव करता है जब यह 6 आधार लंबा होता है और 12-13 आधारों तक आगे बढ़ने पर यह बी-रीडर और बी-रिबन के साथ टकराव करेगा जिससे पृथक्करण होगा। डी. एन. ए. डुप्लेक्स पतवार के ऊपर बी लिंकर के साथ भी टकराता है (डी. एन. ए. को दोहरे हेलिक्स में बदलने के कारण)। फॉस्फोराइलेशन टी. एफ. आई. आई. बी. सेरीन 65 पर फॉस्फोराइलेटेड होता है जो बी रीडर डोमेन में पाया जाता है। इस फॉस्फोराइलेशन के बिना, प्रतिलेखन की शुरुआत नहीं होती है। यह सुझाव दिया गया है कि सामान्य प्रतिलेखन कारक टी. एफ. आई. आई. एच. इस फॉस्फोराइलेशन के लिए काइनेज के रूप में कार्य कर सकता है, हालांकि इसका समर्थन करने के लिए और अधिक साक्ष्य की आवश्यकता है। हालांकि टी. एफ. आई. आई. बी. विस्तार के दौरान डी. एन. ए. के साथ आर. एन. ए. पोलीमरेज़ II परिसर के साथ यात्रा नहीं करता है, हाल ही में यह सुझाव दिया गया है कि जीन लूपिंग में इसकी भूमिका है जो प्रवर्तक को जीन के टर्मिनेटर से जोड़ती है। हालाँकि, हाल के शोध से पता चला है कि टी. एफ. आई. आई. बी. में कमी कोशिकाओं के लिए घातक नहीं है और प्रतिलेखन का स्तर महत्वपूर्ण रूप से प्रभावित नहीं होता है। ऐसा इसलिए है क्योंकि 90 प्रतिशत से अधिक स्तनधारी प्रवर्तकों में बी. आर. ई. (बी मान्यता तत्व) या टाटा बॉक्स अनुक्रम नहीं होता है जो टी. एफ. आई. आई. बी. को बांधने के लिए आवश्यक होता है। इसके अलावा, टी. एफ. आई. आई. बी. के स्तर को विभिन्न प्रकार की कोशिकाओं में और कोशिका चक्र के विभिन्न बिंदुओं पर उतार-चढ़ाव के लिए दिखाया गया है, जो इस साक्ष्य का समर्थन करता है कि यह सभी आर. एन. ए. पोलीमरेज़ II प्रतिलेखन के लिए आवश्यक नहीं है। जीन लूपिंग आर. एन. ए. पोलीमरेज़ II के सी टर्मिनल डोमेन और पॉलीएडीनाइलेशन कारकों पर पाए जाने वाले फॉस्फोराइलेटेड सेरीन अवशेषों के बीच बातचीत पर निर्भर है। एस. एस. यू. 72 और सी. एस. टी. एफ.-64 जैसे इन पॉलीएडीनाइलेशन कारकों के साथ प्रवर्तकों की बातचीत के लिए टी. एफ. आई. आई. बी. की आवश्यकता है। यह भी सुझाव दिया गया है कि जीन लूप गठन और डीएनए बुलबुले का पतन दोनों टीएफआईआईबी फॉस्फोराइलेशन का परिणाम हैं; हालाँकि, यह स्पष्ट नहीं है कि यह जीन लूप गठन प्रतिलेखन दीक्षा का कारण या परिणाम है या नहीं। अन्य प्रतिलेखन परिसरों आर. एन. ए. पोलीमरेज़ III में समानताएं टी. एफ. आई. आई. बी. के समान कारक का उपयोग करती हैं जिसे बी. आर. एफ. (टी. एफ. आई. आई. बी.-संबंधित कारक) कहा जाता है जिसमें एक संरक्षित जस्ता रिबन और सी टर्मिनल कोर भी होता है। हालांकि, संरचना अधिक लचीले लिंकर क्षेत्र में अलग हो जाती है, हालांकि बी. आर. एफ. में अभी भी उसी स्थिति में अत्यधिक संरक्षित अनुक्रम होते हैं जो बी रीडर और बी लिंकर पाए जाते हैं। ये संरक्षित क्षेत्र संभवतः टी. एफ. आई. आई. बी. में डोमेन के समान कार्य करते हैं। आर. एन. ए. पोलीमरेज़ I टी. एफ. आई. आई. बी. के समान कारक का उपयोग नहीं करता है; हालाँकि, यह माना जाता है कि एक अन्य अज्ञात कारक उसी कार्य को पूरा करता है। जीवाणु प्रणालियों में टी. एफ. आई. आई. बी. के लिए कोई प्रत्यक्ष समरूपता नहीं है, लेकिन ऐसे प्रोटीन हैं जो बिना किसी अनुक्रम समानता के जीवाणु बहुलक को इसी तरह से बांधते हैं। विशेष रूप से जीवाणु प्रोटीन σ70 में ऐसे क्षेत्र होते हैं जो बी-लिंकर, बी-रिबन और बी-कोर के समान बिंदुओं पर पोलीमरेज़ को बांधते हैं। यह विशेष रूप से σ3 क्षेत्र और क्षेत्र 4 लिंकर में स्पष्ट है जो पोलीमरेज़ सक्रिय साइट में डीएनए को स्थिर कर सकता है। नैदानिक महत्व एंटीवायरल गतिविधि हाल के अध्ययनों से पता चला है कि टी. एफ. आई. आई. बी. के स्तर में कमी कोशिकाओं के भीतर प्रतिलेखन स्तर को प्रभावित नहीं करती है, ऐसा आंशिक रूप से माना जाता है क्योंकि 90 प्रतिशत से अधिक स्तनधारी प्रमोटरों में बी. आर. ई. या टी. ए. टी. ए. बॉक्स नहीं होता है। हालाँकि, यह दिखाया गया है कि टी. एफ. आई. आई. बी. इन विट्रो प्रतिलेखन और हर्पिस सिम्प्लेक्स वायरस के विनियमन के लिए महत्वपूर्ण है। ऐसा माना जाता है कि टी. एफ. आई. आई. बी. में साइक्लिन ए की समानता है। प्रतिकृति से गुजरने के लिए, वायरस अक्सर साइक्लिन और अन्य प्रोटीन का उपयोग करके कोशिका चक्र के माध्यम से मेजबान कोशिकाओं की प्रगति को रोकते हैं। चूंकि टी. एफ. आई. आई. बी. की संरचना साइक्लिन ए के समान है, इसलिए यह सुझाव दिया गया है कि टी. एफ. आई. आई. बी. के कम स्तरों में एंटीवायरल प्रभाव हो सकते हैं। न्यूरोडीजेनेरेशन अध्ययनों से पता चला है कि टी. बी. पी. में पॉलीग्लूटामाइन ट्रैक्ट की लंबाई से टी. बी. आई. बी. का टी. बी. पी. से जुड़ाव प्रभावित होता है। विस्तारित पॉलीग्लूटामाइन मार्ग जैसे कि न्यूरोडीजेनेरेटिव रोगों में पाए जाने वाले मार्ग टी. एफ. आई. आई. बी. के साथ बातचीत में वृद्धि करते हैं। ऐसा माना जाता है कि यह इन बीमारियों में प्रतिलेखन को प्रभावित करता है क्योंकि यह मस्तिष्क में अन्य प्रवर्तकों के लिए टी. एफ. आई. आई. बी. की उपलब्धता को कम कर देता है क्योंकि टी. एफ. आई. आई. बी. इसके बजाय विस्तारित पॉलीग्लूटामाइन मार्गों के साथ बातचीत कर रहा है। संदर्भ बाहरी लिंक आणविक आनुवंशिकी प्रोटीन जीन अभिव्यक्ति प्रतिलेखन कारक