TEDDM1
ट्रांसमेम्ब्रेन एपिडिडाइमल प्रोटीन 1 एक ट्रांसमेम्ब्रेन प्रोटीन है जिसे टी. ई. डी. डी. एम. 1 जीन द्वारा कूटबद्ध किया जाता है। टी. ई. डी. डी. एम. 1 को आमतौर पर टी. एम. ई. एम. 45सी के रूप में भी जाना जाता है और यह 273 एमिनो एसिड को कूटबद्ध करता है जिसमें छह अल्फा-हेलिक्स ट्रांसमेम्ब्रेन क्षेत्र होते हैं। प्रोटीन में अज्ञात कार्य का 118 एमिनो एसिड लंबाई परिवार होता है। जबकि टी. ई. डी. डी. एम. 1 के सटीक कार्य को समझा नहीं गया है, यह प्लाज्मा झिल्ली का एक अभिन्न घटक होने की भविष्यवाणी की गई है। जीन लोकस टी. ई. डी. डी. एम. 1 गुणसूत्र 1 पर स्थित है जो माइनस छोर पर 1q25.3 पर पाया जाता है। टी. ई. डी. डी. एम. 1 एकल एक्सॉन से बना है। टी. ई. डी. डी. एम. 1 के जीन पड़ोस में ग्लूटामेट-अमोनिया लाइगेज (जी. एल. यू. एल.), लॉन्ग इंटरजेनिक नॉन-प्रोटीन कोडिंग आर. एन. ए. 272 (एल. आई. एन. सी. 00272), और शार्पर-एम. पी. आर. ए. नियामक क्षेत्र 13543 (एल. ओ. सी. 122149321) शामिल हैं। अभिव्यक्ति टी. ई. डी. डी. एम. 1 अधिकांश प्रमुख ऊतकों में व्यक्त की जाती है। जीन वृषण में उच्च स्तर पर और टी. ई. डी. डी. एम. 1 अभिव्यक्ति के साथ अन्य सभी ऊतकों के सापेक्ष हृदय में निम्न स्तर पर व्यक्त किया जाता है। मस्तिष्क में, टी. ई. डी. डी. एम. 1 को एमिग्डाला, हिप्पोकैम्पस और स्ट्रैटम में व्यक्त किया जाता है। चूहे के मस्तिष्क में, आर. एन. ए. जांच का उपयोग करके सामान्य अभिव्यक्ति के साथ टी. ई. डी. डी. एम. 1 की खोज की गई थी। कोशिका के भीतर, टी. ई. डी. डी. एम. 1 मुख्य रूप से प्लाज्मा झिल्ली में व्यक्त किया जाता है। अन्य झिल्ली-बद्ध प्रोटीनों के समान, टी. ई. डी. डी. एम. 1 प्रोटीन में एक अनुमानित संकेत पेप्टाइड होता है, हालांकि संकेत पेप्टाइड का प्रकार अज्ञात है। क्योंकि टी. ई. डी. डी. एम. 1 अन्य ट्रांसमेम्ब्रेन प्रोटीन के साथ कई विशेषताओं को साझा करता है, इससे पता चलता है कि प्रोटीन की विभिन्न कोशिका प्रक्रियाओं जैसे सिग्नल ट्रांसडक्शन और प्रोटीन ट्रैफिकिंग में भूमिका हो सकती है। जीन स्तर विनियमन टी. ई. डी. डी. एम. 1 का अभिव्यक्ति पैटर्न सर्वव्यापी था। मनुष्यों में टी. ई. डी. डी. एम. 1 एम. आर. एन. ए. की प्रचुरता मध्यम से कम थी। प्रोटीन टी. ई. डी. डी. एम. 1 प्रोटीन का आणविक भार लगभग 31.3 के. डी. ए. है और टी. ई. डी. डी. एम. 1 का सैद्धांतिक आइसोइलेक्ट्रिक बिंदु (पी. आई.) 8.02 है। विशेष रूप से, यह अन्य प्रोटीनों के औसत पी. आई. से अलग है क्योंकि उनका पी. आई. 4-7 की पी. एच. सीमा में होता है। इससे पता चलता है कि टी. ई. डी. डी. एम. 1 प्रोटीन में अधिकांश प्रोटीन के सापेक्ष बुनियादी अमीनो एसिड की अधिकता होती है। डोमेन टी. ई. डी. डी. एम. 1 में अज्ञात कार्य का एक प्रमुख डोमेन है जिसका नाम डी. यू. एफ. 716 है। यह क्षेत्र प्रोटीन के अमीनो एसिड स्थिति 95 से 219 तक फैला हुआ है। DUF716 में अधिकांश ल्यूसीन जिपर होता है जो आमतौर पर प्रोटीन के डाइमराइजेशन से जुड़ा होता है। डीयूएफ716 में प्रोटीन के छह ट्रांसमेम्ब्रेन क्षेत्रों में से तीन भी होते हैं, और इसमें उच्च संरक्षण के एमिनो एसिड खंड होते हैं, यह सुझाव देते हुए कि डीयूएफ716 संभवतः टीईडीडीएम1 प्रोटीन कार्य में महत्वपूर्ण भूमिका निभाता है। पोस्ट ट्रांसलेशनल मॉडिफिकेशन टी. ई. डी. डी. एम. 1 कई पोस्ट ट्रांसलेशनल मॉडिफिकेशन के अधीन है। अठारह अनुमानित फॉस्फोराइलेशन स्थल हैं। अन्य विशिष्ट स्थलों में एक एन-ग्लाइकोसिलेशन साइट, एक कैसिइन किनेज II फॉस्फोराइलेशन साइट, एक ल्यूसीन ज़िपर पैटर्न, दो एन-मिरिस्टिलेशन साइट और तीन प्रोटीन किनेज सी फॉस्फोराइलेशन साइट शामिल हैं। एन-ग्लाइकोसिलेशन झिल्ली प्रोटीन की एक और विशिष्ट विशेषता है और यह स्राव और साइटोस्केलेटल संगठन में शामिल है। कैसिइन काइनेज II प्रोटीन स्थिरता और कोशिका संकेत प्रतिक्रिया से जुड़ा हुआ है। ल्यूसीन ज़िपर अनुक्रम रूपांकन हैं जो प्रोटीन-प्रोटीन अंतःक्रिया को सुविधाजनक बनाते हैं। एन-मिरिस्टिलेशन साइट लिगैंड बाइंडिंग और प्रोटीन डायनामिक्स में शामिल हैं। प्रोटीन काइनेज सी फॉस्फोराइलेशन का संबंध कोशिका प्रसार और जीन अभिव्यक्ति के विनियमन से है। संरचना टी. ई. डी. डी. एम. 1 की द्वितीयक संरचना एन-टर्मिनस पर मुक्त यादृच्छिक कुंडल और एक एकल अल्फा हेलिक्स के साथ शुरू होती है। टी. ई. डी. डी. एम. 1 में छह ट्रांसमेम्ब्रेन प्रोटीन संरचनात्मक रूप से समान अल्फा हेलिक्स के रूप में चिह्नित किए जाते हैं। प्रोटीन का यह क्षेत्र एन-टर्मिनस के सापेक्ष काफी संघनित होता है। अल्फा हेलिक्स में आमतौर पर मुख्य रूप से हाइड्रोफोबिक अवशेष होते हैं, जो प्लाज्मा झिल्ली के भीतर स्थित इन क्षेत्रों के साथ संरेखित होते हैं। अल्फा हेलिक्स आमतौर पर डीएनए बाइंडिंग रूपांकनों से भी जुड़े होते हैं। होमोलॉजी/इवोल्यूशन पैरालॉग टी. ई. डी. डी. एम. 1 में दो ज्ञात पैरालॉग हैं, टी. एम. ई. एम. 45ए और टी. एम. ई. एम. 45बी। मानव जीन टी. ई. डी. डी. एम. 1 के लिए 100 से अधिक ऑर्थोलॉग मौजूद हैं। इन ज्ञात ऑर्थोलॉग में से वे केवल स्तनधारियों, उभयचरों में मौजूद पाए गए थे, और पाए गए सभी ऑर्थोलॉग की fish.The विचलन तिथि की तुलना होमो सेपियन्स के सापेक्ष की गई थी। मछली टी. ई. डी. डी. एम. 1 मानव टी. ई. डी. डी. एम. 1 के लिए सबसे दूर से संबंधित ऑर्थोलॉग हैं, जिसमें विचलन की सबसे दूर की औसत तारीख 46.4 करोड़ साल पहले है। जबकि टी. ई. डी. डी. एम. 1 के लिए ऑर्थोलॉग हड्डी वाली मछली में मौजूद हैं, जैसा कि प्रोटोप्टेरस एनेक्टेंस में इसके अस्तित्व से पता चलता है, जीन के ऑर्थोलॉग कार्टिलाजिनस मछली में अधिक बार पाए गए थे। विकास टी. ई. डी. डी. एम. 1 के आणविक विकास की सापेक्ष दर काफी हद तक फाइब्रिनोजेन अल्फा के समान थी और साइटोक्रोम सी की विकास दर की तुलना में बहुत अधिक तेज थी। परस्पर क्रिया करने वाले प्रोटीनों ने एस. टी. आर. आई. एन. जी. के माध्यम से पाए जाने वाले टी. ई. डी. डी. एम. 1 प्रोटीन के लिए कार्यात्मक भागीदारों की भविष्यवाणी की। नैदानिक महत्व पिछले कैंसर अनुसंधान अध्ययनों के अनुसार, जीन-आधारित संघ विश्लेषणों से पता चला है कि जी. एल. यू. एल. के साथ टी. ई. डी. डी. एम. 1 दो जीन हैं जो हेपेटाइटिस बी वायरस से संबंधित हेपेटोसेलुलर कार्सिनोमा के साथ सबसे महत्वपूर्ण रूप से सहसंबद्ध हैं, जो यकृत कैंसर का सबसे आम रूप है। टी. ई. डी. डी. एम. 1 का केराटिनोसाइट्स के साथ जुड़ाव और भ्रूण प्रत्यारोपण और विकास के एक महत्वपूर्ण नियामक माइक्रो आर. एन. ए.-31 के अवरोध के कारण भी महत्वपूर्ण नैदानिक महत्व है। संदर्भ