Rubicon homology domain
रुबिकॉन होमोलॉजी डोमेन (जिसे आर. एच. डोमेन के रूप में भी जाना जाता है) लगभग 250 एमिनो एसिड का एक विकासवादी रूप से संरक्षित प्रोटीन डोमेन है जो प्रोटीन-प्रोटीन अंतःक्रिया में मध्यस्थता करता है। आर. एच. डोमेन ऑटोफैगी और एंडोसोमल ट्रैफिकिंग के विनियमन में शामिल कई मानव प्रोटीनों में मौजूद हैं। जबकि सभी आरएच डोमेन की विशेषता नहीं है, मानव रूबिकॉन और पी. एल. ई. के. एच. एम. 1 के छोटे जी. टी. पी. एस. रैब 7 के साथ बातचीत में मध्यस्थता करते हैं, जो देर से एंडोसोम और ऑटोफैगोसोम पर पाया जाता है। आरएच डोमेन में 16 संरक्षित सिस्टीन और हिस्टिडीन अवशेष होते हैं जो जस्ता परमाणुओं को बांधते हैं और कम से कम 4 जस्ता उंगली रूपांकनों का निर्माण करते हैं। रुबिकॉन के आरएच डोमेन के सी-टर्मिनस की ओर एमिनो एसिड अवशेषों को रब 7 के साथ बातचीत के लिए आवश्यक दिखाया गया है। संरचना रब7 के साथ परिसर में रूबिकॉन आरएच क्षेत्र की 3डी परमाणु संरचना को एक्स-रे क्रिस्टलोग्राफी द्वारा निर्धारित किया गया है। आरएच डोमेन की संरचना में एक "एल" आकार होता है, जिसमें "एल" का आधार रब 7 के स्विच क्षेत्रों के साथ संपर्क बनाता है। संरचना मुख्य रूप से अल्फा हेलिकल है, जिसमें जस्ता उंगली के रूपांकनों के आसपास के छोटे बीटा स्ट्रैंड क्षेत्र मौजूद हैं। रुबिकॉन आर. एच. डोमेन का एन-टर्मिनल क्षेत्र एक एफ. वाई. वी. ई. डोमेन जैसा दिखता है, हालांकि पी. आई. 3. पी. के कैनॉनिकल एफ. वाई. वी. ई. डोमेन बाइंडिंग के लिए आवश्यक बुनियादी अवशेष मौजूद नहीं हैं। आर. एच. डोमेन आर. एच. डोमेन वाले प्रोटीन कई प्रोटीनों में पाए जाते हैं, जिनमें शामिल हैं (मनुष्यों में): रुबिकॉन, प्रोटीन के आर. एच. डोमेन-युक्त परिवार का परिभाषित सदस्य और ऑटोफैगी पी. एल. ई. के. एच. एम. 1 का एक नकारात्मक नियामक, ऑस्टियोपेट्रोसिस पेसर में शामिल एक प्रोटीन, ऑटोफैगी डी. ई. एफ. 8 का एक सकारात्मक नियामक, लाइसोसोम परिधीय वितरण पी. एल. ई. के. एच. एम. 3 का एक नियामक, कंकाल मांसपेशियों के भेदभाव में शामिल प्रोटीन डोमेन प्रोटीन संरचना