Millitome
एक मिलिटोम (लैटिन मिले से, जिसका अर्थ है "हजार", जैसा कि मिलीमीटर में, और ग्रीक टेम्नीन जिसका अर्थ है "काटना") एक उपकरण है जिसे एक ताजा प्राप्त अंग को पकड़ने और एकल-कोशिका विश्लेषण में उपयोग के लिए इसे कई छोटे ऊतक खंडों में काटने की सुविधा के लिए डिज़ाइन किया गया है। एक मिलीटोम में कार्बन स्टील काटने वाले चाकू को समान आकार के स्लाइस या ऊतक सामग्री के क्यूब्स का उत्पादन करने के लिए मार्गदर्शन करने के लिए x और y दोनों दिशाओं में अलग, समान रूप से रखे गए काटने के खांचे होते हैं। मिलिटोम डिजाइन और उपयोग एचआईवीई एमसी-आईयू टीम, इंडियाना विश्वविद्यालय (पी. आई.: कैटी बोर्नर; एन. आई. एच. पुरस्कार संख्याः ओटी2ओडी026671) और मानव संदर्भ एटलस परियोजना के लिए नेटवर्क विज्ञान केंद्र (सी. एन. एस.) के लिए साइबर इन्फ्रास्ट्रक्चर के सदस्यों द्वारा विकसित किया गया था, जो यू. एस. नेशनल इंस्टीट्यूट ऑफ हेल्थ कॉमन फंड के मानव जैव आणविक एटलस कार्यक्रम (एच. यू. बी. एम. ए. पी.) का हिस्सा है। मिलीटोम का उपयोग समान आकार के ऊतक ब्लॉक बनाने के लिए किया जाता है जो एच. यू. बी. एम. ए. पी. की 3डी संदर्भ वस्तु पुस्तकालय से अंगों के आकार और आकार से मेल खाते हैं। एक मिलीटोम में एक संबद्ध डिजिटल डेटा पैकेज होता है जिसमें एक एसटीएल फ़ाइल, एचयूबीएमएपी आईडी को स्थानिक स्थान निर्धारित करने के लिए एक स्प्रेडशीट और संदर्भ अंग के आकार, आयाम, दाता लिंग और पार्श्वता के बारे में जानकारी के साथ एक मेटाडेटा फ़ाइल शामिल होती है जिसके लिए मिलीटोम फिट किया जाता है। यहाँ उल्लिखित प्रक्रियाएँ वर्णन करती हैं कि कैसे मिलीटोम उत्पन्न होते हैं और मानव संदर्भ एटलस में प्रत्येक टुकड़े या घन के लिए स्थानिक स्थानों को कैसे बनाए रखा जाता है। मॉडल एक मिलीटॉम मॉडलर मिलीटॉम 3डी फाइल बनाता है जिसे 3डी मुद्रित किया जा सकता है और हूबीएमएपी सीसीएफ एक्सप्लोरेशन यूजर इंटरफेस या अन्य आभासी वातावरण में उपयोग के लिए मेल खाने वाले 3डी आभासी ब्लॉक बनाने के लिए जिम्मेदार है। ओपनस्कैड, एक ओपन-सोर्स, कोड-आधारित 3डी मॉडलर, का उपयोग 3डी ज्यामिति बनाने के लिए किया जाता है। सभी मिलीटॉम मॉडल मानव संदर्भ एटलस पोर्टल के माध्यम से उपलब्ध एन. एल. एम. दृश्यमान मानव परियोजना से 3डी संदर्भ अंगों का उपयोग करते हैं। परिणामी 3डी मॉडल के दो मुख्य उपयोग हैंः 3डी ज्यामिति डेटा प्रदान करता है जिसे 3डी मुद्रित किया जा सकता है, जिससे एक भौतिक मिलीटोम बनता है। इस मामले में, 3डी फाइलों को एसटीएल प्रारूप में निर्यात किया जाता है और 3डी मुद्रण अनुप्रयोग जैसे अल्टीमेकर क्यूरा या मैटर कंट्रोल में आयात किया जाता है। एच. यू. बी. एम. ए. पी. के ई. यू. आई. जैसे वेब इंटरफेस में उपयोग किए जाने वाले समान मिलीटोम के साथ काटे गए ऊतक ब्लॉकों के लिए 3डी डेटा प्रदान करता है। दोनों उद्देश्यों के लिए एक ही 3डी ज्यामिति का उपयोग इस बात की गारंटी देता है कि भौतिक और आभासी दोनों संस्करणों में एक विशिष्ट मिलीटोम के आयाम, अनुपात और अन्य विशेषताएँ मेल खाती हैं। अभिगम और उपयोग एक मिलीटॉम उपयोगकर्ता विभिन्न अंगों के लिए पूर्व संकलित मिलीटॉम तक पहुँचने के लिए एच. आर. ए. मिलीटॉम वेबसाइट पर जाता है और दाता लिंग, अंग पार्श्वता (यदि लागू हो), अंग के आकार और दूरी कम करने के मामले में सबसे अच्छे मिलान अंगों का चयन करता है। इसके बाद उपयोगकर्ता अनुकूलित मिलीटोम के लिए एक डेटा फ़ाइल पैकेज डाउनलोड करता है जिसमें तीन फाइलें होती हैंः एक एसटीएल फ़ाइल जिसका उपयोग मिलीटोम टिश्यू कटिंग टूल को 3डी प्रिंट करने के लिए किया जाता है-एक लुकअप सीएसवी फ़ाइल जो पूर्वनिर्धारित मिलीटोम आईडी को एचयूबीएमएपी आईडी से जोड़ती है-एक मेटाडेटा सीएसवी फ़ाइल जिसमें मिलीटोम के बारे में जानकारी होती है ताकि प्रजनन क्षमता सुनिश्चित की जा सके-एसटीएल फ़ाइल को घर में 3डी प्रिंट किया जा सकता है या वाणिज्यिक मुद्रण सेवा को भेजा जा सकता है। लुकअप सी. एस. वी. फाइल मिलिटोम आई. डी. (मिलिटोम पर एक ऊतक ब्लॉक को दर्शाती है) को एच. यू. बी. एम. ए. पी. आई. डी. (मिलिटोम के साथ काटे गए भौतिक ऊतक ब्लॉक) से जोड़ती है। मेटाडेटा सी. एस. वी. फाइल मिलिटोम के बारे में निम्नलिखित मेटाडेटा प्रदान करती हैः अंग, लिंग, पार्श्वता (यदि लागू हो), ऊतक खंड का आकार और मिलिटोम द्वारा उपयोग किए जाने वाले कटिंग ग्रिड का आकार। इसमें मिलीटोम एसटीएलः x, y, z-स्थिति और x, y-आयाम में प्रत्येक मिलीटोम आईडी के बारे में मेटाडेटा भी होता है। ऊतक काटने में उपयोग मिलीटॉम ट्रे का उपयोग कार्बन या स्टेनलेस स्टील के चाकू के साथ किया जाता है। एक बार अंग कट जाने के बाद, सभी ऊतक खंडों का स्थान और आवर्तन बनाए रखा जाना चाहिए। ऊतक खंडों को अलग और क्रम में रखने के लिए बर्फ घन ट्रे का सफलतापूर्वक उपयोग किया गया है। चूंकि एक मिलीटोम की एक 3डी प्रिंटिंग में कई घंटे लग सकते हैं, इसलिए पूरे अंग से कई ऊतक क्यूब्स प्राप्त करने में रुचि रखने वाले अंग एस. एम. ई. को मानक आकार के मिलीटोम को पहले से प्रिंट करना चाहिए और उन्हें अपनी प्रयोगशाला में हाथ में रखना चाहिए। यह मानव ऊतक को उपलब्ध होने पर तुरंत काटने की अनुमति देता है। ऊतक ब्लॉकों की पहचान करना डेटा पैकेज के हिस्से के रूप में प्रदान की गई लुकअप सी. एस. वी. स्प्रेडशीट में मिलिटोम आई. डी. को सूचीबद्ध किया गया है जिन्हें कटिंग ग्रिड में प्रत्येक ब्लॉक को पूर्व-निर्दिष्ट किया गया है। मिलिटम आई. डी. को वाई-अक्ष के लिए संख्याओं, एक्स-अक्ष के लिए अक्षरों और नीचे/शीर्ष पार्श्वता के लिए "बी" या "टी" अक्षरों का उपयोग करके सौंपा जाता है। मिलिटोम उपयोगकर्ता मिलिटोम के भीतर उनके स्थान के आधार पर प्रत्येक ऊतक के नमूने को सौंपे गए ऊतक ब्लॉक आईडी को रिकॉर्ड करता है। यह ऊतक के नमूने से डेटा को संदर्भ अंग के भीतर एक विशेष आभासी ऊतक ब्लॉक स्थान से जोड़ने की अनुमति देता है। मिलीटॉम ऊतक पंजीकरण की समीक्षा एक बार जब मिलीटॉम डेटा पैकेज को एच. यू. बी. एम. ए. पी. कंसोरिटम के इन्फ्रास्ट्रक्चर एंगेजमेंट घटक द्वारा निगला जाता है, तो मिलीटॉम उपयोगकर्ता यह सत्यापित करने के लिए एक्सप्लोरेशन यूजर इंटरफेस पर जाता है कि सभी ऊतक ब्लॉकों का आकार, स्थान और अभिविन्यास सही है। इस प्रक्रिया की जानकारी पंजीकरण उपयोगकर्ता इंटरफेस एस. ओ. पी. में "अन्वेषण उपयोगकर्ता इंटरफेस के साथ अपने पंजीकरण की जाँच" अनुभाग के तहत दी गई है। यदि सुधार या समायोजन की आवश्यकता होती है, तो मिलीटॉम उपयोगकर्ता अद्यतन करने के लिए सुविधा प्रदाता से संपर्क करता है। संदर्भ बाहरी लिंक एचयूबीएमएपी कंसोर्टियम एचयूबीएमएपी विजिबल ह्यूमन एमओओसी (वीएचएमओओसी) साइबर इन्फ्रास्ट्रक्चर फॉर नेटवर्क साइंस (सीएनएस) सेंटर हिस्टोलॉजी सर्जिकल उपकरण