Human Metabolome Database
मानव चयापचय डेटाबेस (एच. एम. डी. बी.) मानव शरीर में पाए जाने वाले छोटे अणु चयापचयों का एक व्यापक, उच्च गुणवत्ता वाला, स्वतंत्र रूप से सुलभ, ऑनलाइन डेटाबेस है। इसे जीनोम कनाडा द्वारा वित्त पोषित मानव चयापचय परियोजना द्वारा बनाया गया है और यह पहले समर्पित चयापचय डेटाबेस में से एक है। एच. एम. डी. बी. एन. एम. आर. स्पेक्ट्रोस्कोपी, जी. सी.-एम. एस. स्पेक्ट्रोमेट्री और एल. सी./एम. एस. स्पेक्ट्रोमेट्री का उपयोग करके मानव चयापचय की पहचान और लक्षण वर्णन सहित मानव चयापचय अनुसंधान की सुविधा प्रदान करता है। इस खोज प्रक्रिया में सहायता के लिए, एचएमडीबी में तीन प्रकार के डेटा होते हैंः 1) रासायनिक डेटा, 2) नैदानिक डेटा, और 3) आणविक जीव विज्ञान/जैव रसायन डेटा (चित्र। 1-3)। रासायनिक आंकड़ों में लगभग 10,000 एन. एम. आर., जी. सी.-एम. एस. और एल. सी./एम. एस. स्पेक्ट्रा के साथ विस्तृत विवरण के साथ 41,514 चयापचय संरचनाएं शामिल हैं। नैदानिक आंकड़ों में> 10,000 मेटाबोलाइट-बायोफ्लुइड सांद्रता और 600 से अधिक विभिन्न मानव रोगों पर मेटाबोलाइट सांद्रता की जानकारी शामिल है। जैव रासायनिक डेटा में 5,688 प्रोटीन (और डी. एन. ए.) अनुक्रम और 5,000 से अधिक जैव रासायनिक प्रतिक्रियाएं शामिल हैं जो इन चयापचय प्रविष्टियों से जुड़ी हैं। एच. एम. डी. बी. में प्रत्येक मेटाबोलाइट प्रविष्टि में 110 से अधिक डेटा क्षेत्र होते हैं जिनमें दो तिहाई जानकारी रासायनिक/नैदानिक डेटा के लिए समर्पित होती है और अन्य एक तिहाई एंजाइमेटिक या जैव रासायनिक डेटा के लिए समर्पित होती है। कई डेटा फ़ील्ड अन्य डेटाबेस (केईजीजी, मेटासाइक, पबकेम, प्रोटीन डेटा बैंक, सीएचईबीआई, स्विस-प्रोट और जेनबैंक) और विभिन्न प्रकार की संरचना और पाथवे व्यूइंग एपलेट से हाइपरलिंक हैं। एच. एम. डी. बी. डाटाबेस व्यापक पाठ, अनुक्रम, वर्णक्रमीय, रासायनिक संरचना और संबंधपरक प्रश्न खोजों का समर्थन करता है। इसका व्यापक रूप से चयापचय, नैदानिक रसायन विज्ञान, बायोमार्कर खोज और सामान्य जैव रसायन शिक्षा में उपयोग किया गया है। चार अतिरिक्त डेटाबेस, ड्रगबैंक, टी3डीबी, एस. एम. पी. डी. बी. और एफ. ओ. ओ. डी. बी. भी डेटाबेस के एच. एम. डी. बी. सूट का हिस्सा हैं। ड्रगबैंक में ~ 1,600 दवा और दवा चयापचय के बारे में समतुल्य जानकारी होती है, टी3डीबी में 3,100 सामान्य विषाक्त पदार्थों और पर्यावरणीय प्रदूषकों के बारे में जानकारी होती है, एसएमपीडीबी में 700 मानव चयापचय और रोग मार्गों के लिए मार्ग आरेख होते हैं, जबकि एफओओडीबी में ~ 28,000 खाद्य घटकों और खाद्य योजकों के बारे में समतुल्य जानकारी होती है। एच. एम. डी. बी. का पहला संस्करण 1 जनवरी, 2007 को जारी किया गया था, इसके बाद 1 जनवरी, 2009 (संस्करण 2), 1 अगस्त, 2009 (संस्करण 2), 18 सितंबर, 2012 (संस्करण 3) और 1 जनवरी, 2013 (संस्करण 3), 2017 (संस्करण 4), 2022 (संस्करण 5) पर दो बाद के संस्करण जारी किए गए। एच. एम. डी. बी. के प्रत्येक प्रमुख संस्करण (संस्करण 5 तक) का विवरण तालिका 1 में दिया गया है। दायरा और अभिगम एच. एम. डी. बी. में सभी डेटा गैर-स्वामित्व वाले हैं या गैर-स्वामित्व वाले स्रोत से प्राप्त किए गए हैं। यह स्वतंत्र रूप से सुलभ है और किसी के लिए भी उपलब्ध है। इसके अलावा, लगभग हर डेटा आइटम पूरी तरह से पता लगाने योग्य है और स्पष्ट रूप से मूल स्रोत के लिए संदर्भित है। एच. एम. डी. बी. डेटा एक सार्वजनिक वेब इंटरफेस और डाउनलोड के माध्यम से उपलब्ध है। केईजीजी ड्रगबैंक एसएमपीडीबी मेटासाइक बोवाइन मेटाबोलोम डेटाबेस मेटाबोलोम मेटाबोलोमिक्स लिस्ट ऑफ बायोलॉजिकल डेटाबेस संदर्भ मेटाबोलोमिक डेटाबेस मेडिकल डेटाबेस बायोलॉजिकल डेटाबेस फूड डेटाबेस ह्यूमन मेटाबोलाइट्स भी देखें।