Sticky and blunt ends
डीएनए छोर रैखिक डीएनए अणुओं के सिरों के गुणों को संदर्भित करते हैं, जिन्हें आणविक जीव विज्ञान में टर्मिनस पर पूरक तारों के आकार के आधार पर "चिपचिपा" या "कुंद" के रूप में वर्णित किया जाता है। चिपचिपे सिरों में, एक स्ट्रैंड दूसरे की तुलना में लंबा होता है (आमतौर पर कम से कम कुछ न्यूक्लियोटाइड्स द्वारा), जैसे कि लंबे स्ट्रैंड में बेस होते हैं जिन्हें बिना जोड़े छोड़ दिया जाता है। कुंद छोरों में, दोनों तारों की लंबाई बराबर होती है-यानी। वे एक ही आधार स्थिति पर समाप्त होते हैं, दोनों स्ट्रैंड पर कोई बिना जोड़े आधार नहीं छोड़ते हैं। इस अवधारणा का उपयोग आणविक जीव विज्ञान में, प्रतिरूपण में, या जब उप-प्रतिरूपण किया जाता है तो वेक्टर डीएनए में डीएनए डालें। इस तरह के छोर प्रतिबंध एंजाइमों द्वारा उत्पन्न किए जा सकते हैं जो विशिष्ट स्थानों पर अणु की फॉस्फोडीस्टर रीढ़ को तोड़ते हैं, जो स्वयं एक्सोन्यूक्लीज़ और एंडोन्यूक्लीज़ नामक एंजाइमों के एक बड़े वर्ग से संबंधित हैं। एक प्रतिबंध एंजाइम जो गैर-आसन्न स्थानों पर दोनों तारों की रीढ़ की हड्डी को काटता है, एक चौंका देने वाला कट छोड़ता है, जिससे दो अतिव्यापी चिपचिपे छोर पैदा होते हैं, जबकि एक एंजाइम जो एक सीधा कट बनाता है (दोनों तारों पर एक-दूसरे से सीधे पार के स्थानों पर) दो कुंद छोर उत्पन्न करता है। एकल-फंसे डीएनए अणु एक एकल-फंसे गैर-गोलाकार डीएनए अणु के दो गैर-समान छोर होते हैं, 3 'छोर और 5' छोर (आमतौर पर "तीन प्रमुख छोर" और "पांच प्रमुख छोर" उच्चारण किया जाता है)। संख्याएं डीऑक्सीराइबोज में कार्बन परमाणुओं की संख्या को संदर्भित करती हैं, जो एक चीनी है जो डीएनए अणु की रीढ़ का एक महत्वपूर्ण हिस्सा है। डी. एन. ए. की रीढ़ की हड्डी में एक डीऑक्सीराइबोज का 5 'कार्बन दूसरे के 3' कार्बन से फॉस्फोडीस्टर बॉन्ड लिंकेज द्वारा जुड़ा होता है। इस डीऑक्सीराइबोज के 5 'कार्बन को फिर से अगले के 3' कार्बन से जोड़ा जाता है, और इसी तरह आगे। डबल-स्ट्रैंडेड अणुओं में भिन्नता जब डी. एन. ए. का एक अणु डबल स्ट्रैंडेड होता है, जैसा कि डी. एन. ए. आमतौर पर होता है, तो दोनों स्ट्रैंड विपरीत दिशाओं में चलते हैं। इसलिए, अणु के एक छोर पर स्ट्रैंड 1 का 3 'छोर और स्ट्रैंड 2 का 5' छोर होगा, और दूसरे छोर पर इसके विपरीत होगा। हालाँकि, यह तथ्य कि अणु दो फंसे हुए हैं, कई अलग-अलग भिन्नताओं की अनुमति देता है। दोहरे फंसे अणु के सबसे सरल डी. एन. ए. छोर को ब्लंट एंड कहा जाता है। ब्लंट छोरों को गैर-सामंजस्यपूर्ण छोर के रूप में भी जाना जाता है। एक ब्लंट-एंडेड अणु में, दोनों स्ट्रैंड एक आधार जोड़ी में समाप्त होते हैं। जैव प्रौद्योगिकी में ब्लंट एंड हमेशा वांछित नहीं होते हैं क्योंकि जब दो अणुओं को एक में जोड़ने के लिए डीएनए लाइगेज का उपयोग किया जाता है, तो ब्लंट एंड के साथ उपज काफी कम होती है। उप-प्रतिरूपण करते समय, इसमें वांछित विपरीत अभिविन्यास में संभावित रूप से सम्मिलित डीएनए डालने का नुकसान भी होता है। दूसरी ओर, कुंद छोर हमेशा एक दूसरे के साथ संगत होते हैं। यहाँ ब्लंट-एंडेड डी. एन. ए. के एक छोटे से टुकड़े का एक उदाहरण दिया गया हैः 5 '-जी. ए. टी. सी. टी. जी. ए. टी. जी. सी. टी. ए. टी. जी. सी. टी. ए. जी. टी.-3'-सी. टी. ए. जी. ए. टी. सी. टी. ए. टी. सी. टी. ए. टी. सी. ए.-5 'ओवरहैंग और चिपचिपे छोर गैर-ब्लंट छोर विभिन्न ओवरहैंग द्वारा बनाए जाते हैं। एक ओवरहैंग एक डी. एन. ए. अणु के अंत में गैर-युग्मित न्यूक्लियोटाइड्स का एक विस्तार है। ये गैर-युग्मित न्यूक्लियोटाइड्स किसी भी स्ट्रैंड में हो सकते हैं, जिससे या तो 3 'या 5' ओवरहैंग बन सकते हैं। ये ओवरहैंग ज्यादातर मामलों में पालिंड्रोमिक होते हैं। एक ओवरहैंग का सबसे सरल मामला एकल न्यूक्लियोटाइड है। यह अक्सर एडेनिन होता है और कुछ डी. एन. ए. पोलीमरेज़ द्वारा 3 'ओवरहैंग के रूप में बनाया जाता है। आमतौर पर इसका उपयोग ऐसे एंजाइम द्वारा बनाए गए पीसीआर उत्पादों की क्लोनिंग में किया जाता है। उत्पाद को 3 'थाइमिन ओवरहैंग के साथ एक रैखिक डीएनए अणु के साथ जोड़ा जाता है। चूँकि एडेनिन और थाइमिन एक आधार जोड़ी बनाते हैं, यह एक लाइगेज द्वारा दो अणुओं के जुड़ने की सुविधा प्रदान करता है, जिससे एक गोलाकार अणु प्राप्त होता है। यहाँ ए-ओवरहैंग का एक उदाहरण दिया गया हैः 5 '-ए. टी. सी. टी. जी. ए. सी. टी. ए.-3'-टी. ए. जी. ए. सी. टी. जी. ए.-5 'लंबे ओवरहैंग को सामंजस्यपूर्ण छोर या चिपचिपा छोर कहा जाता है। वे अक्सर प्रतिबंध एंडोन्यूक्लीज़ द्वारा बनाए जाते हैं जब वे डी. एन. ए. को काटते हैं। बहुत बार वे दो डी. एन. ए. तारों को एक दूसरे से चार आधार जोड़े काटते हैं, जिससे एक अणु में चार आधार 3 'ओवरहैंग और दूसरे में एक पूरक 3' ओवरहैंग बनता है। इन सिरों को सामंजस्यपूर्ण कहा जाता है क्योंकि वे आसानी से एक लिगाज़ द्वारा एक साथ वापस जुड़ जाते हैं। उदाहरण के लिए, ये दो "चिपचिपे" छोर संगत हैंः 5 '-ए. टी. सी. टी. जी. ए. टी. जी. सी. टी.-3'-ए. टी. जी. ए. टी. जी. ए. टी. जी. सी. टी.-3 '-ए. टी. जी. ए. टी. जी. ए. टी. जी. सी. टी.-3'-ए. टी. जी. ए. टी. जी. ए. टी. जी. सी. टी.-3 '-ए. टी. जी. ए. टी. जी. ए. टी. जी. सी. टी.-3'-ए. टी. जी. ए. टी. जी. ए. टी. जी. सी. टी.-3 '-ए. टी. जी. ए. टी. जी. ए. टी. जी. जी. सी. टी.-3'-ए चूँकि लिगाज़ के काम करने के लिए ओवरहैंग को पूरक होना पड़ता है, इसलिए दोनों अणु केवल एक अभिविन्यास में शामिल हो सकते हैं। यह अक्सर आणविक जीव विज्ञान में अत्यधिक वांछनीय है। डी. एन. ए. के प्रत्येक एकल स्ट्रैंड के पार, हम आम तौर पर थाइमिन के साथ एडेनिन जोड़ी और गुआनिन के साथ साइटोसिन जोड़ी को एक समानांतर पूरक स्ट्रैंड बनाने के लिए देखते हैं जैसा कि नीचे वर्णित है। दो न्यूक्लियोटाइड अनुक्रम जो इस तरह से एक दूसरे से मेल खाते हैं, उन्हें पूरक के रूप में संदर्भित किया जाता हैः 5 '-ए. टी. सी. टी. जी. ए. सी. टी.-3'-टी. ए. जी. ए. सी. टी. जी. ए.-5 'एक खंडित छोर गैर-पूरक अनुक्रमों के एक महत्वपूर्ण अनुपात के साथ अंत के पास एक दोहरे फंसे (या अन्य बहु-फंसे) डी. एन. ए. अणु के क्षेत्र को संदर्भित करता है; यानी, एक अनुक्रम जहां निकटवर्ती तारों पर न्यूक्लियोटाइड सही ढंग से मेल नहीं खाते हैंः 5'-ए. टी. सी. टी. जी. ए. टी. जी. जी. ए.-3 '-टी. ए. जी. ए. सी. टी. जी. टी. ए. सी. टी. जी.-5' शब्द "खंडित" का उपयोग किया जाता है क्योंकि गलत तरीके से मेल खाने वाले न्यूक्लियोटाइड हालांकि दोहरे फंसे डीएनए के बीच में गैर-पूरक अनुक्रम भी संभव हैं, लेकिन सिरों से दूर बेमेल क्षेत्रों को "फ्रैड" के रूप में संदर्भित नहीं किया जाता है। डिस्कवरी रोनाल्ड डब्ल्यू. डेविस ने पहली बार इकोआरआई, प्रतिबंध एंडोन्यूक्लीज़ की क्रिया के उत्पाद के रूप में चिपचिपे सिरों की खोज की। स्ट्रेंथ स्टिकी एंड लिंक अपनी स्थिरता में अलग होते हैं। गठन की मुक्त ऊर्जा को स्थिरता का अनुमान लगाने के लिए मापा जा सकता है। ओलिगोन्यूक्लियोटाइड यूवी थर्मल विकृतीकरण वक्रों से संबंधित डेटा से विभिन्न अनुक्रमों के लिए मुक्त ऊर्जा सन्निकटन किए जा सकते हैं। इसके अलावा आणविक गतिकी अनुकरण से भविष्यवाणियों से पता चलता है कि कुछ चिपचिपे अंत लिंक दूसरों की तुलना में खिंचाव में बहुत मजबूत होते हैं। संदर्भ सैम्ब्रुक, जोसेफ; डेविड रसेल (2001)। आणविक प्रतिरूपणः एक प्रयोगशाला नियमावली। न्यूयार्कः कोल्ड स्प्रिंग हार्बर लेबोरेटरी प्रेस। डी. एन. ए. आनुवंशिकी तकनीक आणविक जीव विज्ञान