Group III pyridoxal-dependent decarboxylases
आणविक जीव विज्ञान में, समूह III पायरिडोक्सल-निर्भर डीकार्बोक्सिलेस जीवाणु एंजाइमों का एक परिवार है जिसमें ऑर्निथिन डीकार्बोक्सिलेस, लाइसिन डीकार्बोक्सिलेस और आर्जिनिन डीकार्बोक्सिलेस शामिल हैं। पायरिडोक्सल-5 '-फॉस्फेट-निर्भर एमिनो एसिड डिकार्बोक्सिलेस को एमिनो एसिड अनुक्रम के आधार पर चार समूहों में विभाजित किया जा सकता है। समूह III में प्रोकैरियोटिक ऑर्निथिन और लाइसिन डिकार्बोक्सिलेस और प्रोकैरियोटिक बायोडिग्रेडेटिव प्रकार के आर्जिनिन डिकार्बोक्सिलेस शामिल हैं। संरचना इन एंजाइमों में कई संरक्षित क्षेत्र होते हैं। एन-टर्मिनल डोमेन में एक फ्लेवोडॉक्सिन जैसी तह होती है, और समग्र 3डी संरचना में इसकी स्थिति के कारण इसे "विंग" डोमेन कहा जाता है। लैक्टोबैसिलस 30ए (एल30ए ऑर्नडीसी) से ऑर्निथिन डिकार्बोक्सिलेस बड़े, पायरिडोक्सल-5 '-फॉस्फेट-निर्भर डिकार्बोक्सिलेस का प्रतिनिधि है जो लाइसिन, आर्जिनिन या ऑर्निथिन पर कार्य करता है। एल30ए ऑर्नडीसी की क्रिस्टल संरचना को 3 ए रिज़ॉल्यूशन में हल किया गया है। सी6 समरूपता से संबंधित छह आयामी एंजाइमेटिक रूप से सक्रिय डोडेकैमर (लगभग 106 डी. ए.) की रचना करते हैं। L30a OrnDC के प्रत्येक मोनोमर को पाँच अनुक्रमिक तह डोमेन के संदर्भ में वर्णित किया जा सकता है। अमीनो-टर्मिनल डोमेन, अवशेष 1 से 107 तक, एक पाँच-फंसे बीटा-शीट से बना होता है जिसे "विंग" डोमेन कहा जाता है। प्रत्येक डाइमर के दो विंग डोमेन डोडेकैमर के केंद्र की ओर अंदर की ओर प्रोजेक्ट करते हैं और डोडेकैमर स्थिरीकरण में योगदान करते हैं। प्रमुख क्षेत्र में एक संरक्षित लाइसिन अवशेष होता है, जो पाइरिडोक्सल-फॉस्फेट समूह के संलग्नक का स्थान है। समूह I पाइरिडोक्सल-निर्भर डीकार्बोक्सिलेस समूह II पाइरिडोक्सल-निर्भर डीकार्बोक्सिलेस समूह IV पाइरिडोक्सल-निर्भर डीकार्बोक्सिलेस संदर्भ प्रोटीन डोमेन भी देखें।