Twisted intercalating nucleic acid
ट्विस्टेड इंटरकेलेटिंग न्यूक्लिक एसिड (टी. आई. एन. ए.) एक न्यूक्लिक एसिड अणु है, जिसे जब ट्रिपलएक्स बनाने वाले ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड्स (टी. एफ. ओ.) में जोड़ा जाता है, तो डबल-स्ट्रैंडेड डी. एन. ए. (डी. एस. डी. एन. ए.) और टी. एफ. ओ. से हूगस्टीन ट्रिपलएक्स डी. एन. ए. गठन को स्थिर करता है। ट्रिपल बॉन्ड के चारों ओर मुड़ने की इसकी क्षमता ट्रिपलएक्स डीएनए बनाने के लिए डबल स्ट्रैंडेड डीएनए के भीतर अंतःक्रिया की आसानी को बढ़ाती है। कुछ विन्यासों को वॉटसन-क्रिक एंटीपैरलल डुप्लेक्स डीएनए को स्थिर करने के लिए दिखाया गया है। टीना-डी. एन. ए. प्राइमरों को पी. सी. आर. में बंधन की विशिष्टता को बढ़ाने के लिए दिखाया गया है। जी-क्वाड्रुप्लेक्स में टीना सम्मिलन का उपयोग एंटी-एचआईवी-1 गतिविधि को बढ़ाने के लिए भी दिखाया गया है। टी. आई. एन. ए. स्थिर पी. टी. डी. एन. ए. आधारित नैदानिक परीक्षणों की बेहतर संवेदनशीलता और विशिष्टता को प्रदर्शित करता है। ट्रिपलेक्स डी. एन. ए. ट्रिपल हेलिक्स तब बनते हैं जब एक सिंगल-स्ट्रैंडेड ट्रिपलेक्स बनाने वाला ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड (टी. एफ. ओ.) विशिष्ट प्रमुख ग्रूव इंटरैक्शन के माध्यम से डी. एस. डी. एन. ए. के प्यूरिन युक्त स्ट्रैंड से जुड़ जाता है। आम तौर पर, समानांतर (पाइरिमिडीन) बाइंडिंग मोटिफ में शारीरिक स्थितियों के तहत पीएच-संवेदनशील सी +-जी-सी हूगस्टीन बेस ट्रिप्लेक्स के गठन की आवश्यकता के कारण टी. एफ. ओ. की तीसरी पंक्ति की आत्मीयता कम होती है। टी. एफ. ओ. के संशोधन का प्रयास किया गया है ताकि उनके लक्ष्यों के लिए उनकी बाध्यकारी आत्मीयताओं में सुधार किया जा सके और नए ट्रिपलएक्स न्यूक्लियोबेस के डिजाइन के साथ डी. एस. डी. एन. ए. अनुक्रम में प्रतिबंधों को कम किया जा सके। हाल ही में, यह पाया गया है कि होमोपाइरिमिडीन ऑलिगोडॉक्सिन्यूक्लियोटाइड्स के बीच में (आर)-1-ओ-[4-(1-पाइरेनाइलथिनिल) फेनिलमिथाइल] ग्लिसरॉल (टी. आई. एन. ए.) का उभार हूगस्टीन-प्रकार ट्रिपलएक्स और डुप्लेक्स में थर्मल स्थिरता को जन्म दे सकता है, जबकि उसी न्यूक्लियोटाइड सामग्री के वाटसन-क्रिक-प्रकार डुप्लेक्स अस्थिर थे। टी. एम. को बढ़ाने के लिए, आधार असंतुलन को टी. एफ. ओ. के केंद्र में रखा जाना चाहिए और जब संभव हो, ए, सी या टी से जी आधार असंतुलन से बचा जाना चाहिए। बेस मिसमैच को बेस मिसमैच के प्रत्येक तरफ टी. आई. एन. ए. के इंटरकलेशन द्वारा बेअसर किया जा सकता है और टी. आई. एन. ए. इंटरकलेटिंग डायरेक्ट 3 'या 5' द्वारा मुखौटा किया जा सकता है। अनुप्रयोग परख विशिष्टता डी. एन. ए. संकरण का उपयोग करते हुए नैदानिक परख एंटीपैरलल डुप्लेक्स हेलिक्स के पृथक्करण द्वारा सीमित हैं। ऑर्थो-टी. आई. एन. ए. जैसे इंटरकेलेटर्स जैसे डी. एन. ए. स्थिरीकरण अणुओं का उपयोग करके इसमें सुधार किया जा सकता है, जो डुप्लेक्स गठन को स्थिर करेंगे। अध्ययनों से पता चलता है कि स्थिरता में सबसे बड़ी वृद्धि तब हुई जब इंटरकलेटिंग प्राइमर का उपयोग 3 'और 5' सिरों पर किया गया था। ओलिगोन्यूक्लियोटाइड में टीना अणु का स्थान प्रोब संकरण की विश्लेषणात्मक संवेदनशीलता में सुधार करने में सक्षम है। पैरा-टी. आई. एन. ए. अणु सभी स्थितियों में टी. एम. को कम कर देते हैं, विशेष रूप से जब ऑलिगोन्यूक्लियोटाइड के केंद्र में होते हैं, जबकि ऑर्थो-टी. आई. एन. ए. अणुओं में, केंद्र में तटस्थता के साथ सुधार कहीं भी देखा गया था। आंतरिक टीना अणु के साथ अंतिम पैरा-या ऑर्थो-अणु के संयोजन ने टी. एम. की उच्चतम वृद्धि दिखाई। टी. आई. एन. ए. अणुओं को टी. एम. में अधिकतम वृद्धि के लिए अंतिम रूप से रखा जाना चाहिए। टी. एम. में वृद्धि पी. सी. आर. जैसे परीक्षणों की विशिष्टता को बढ़ाती है। एंटी-एचआईवी-1 गतिविधि हाल के अध्ययनों से पता चलता है कि जी-क्वाड्रुप्लेक्स में टीना सम्मिलन का उपयोग भी एंटी-एचआईवी-1 गतिविधि को बढ़ाने के लिए दिखाया गया है। इस तरह के अध्ययनों में, दो जी क्वाड्रुप्लेक्स बनाने वाले अनुक्रम जो कोशिका रेखाओं पर एंटी-एचआईवी-1 गतिविधि प्रदर्शित करते हैं, उन्हें लॉक न्यूक्लिक एसिड (एलएनए) या टीआईएनए के सम्मिलन का उपयोग करके संशोधित किया गया था। इसका समावेश एंटी-एचआईवी-1 गतिविधि में 8 गुना सुधार प्रदान करता है और 5 'फॉस्फेट की शुरूआत जी-क्वाड्रुप्लेक्स के डाइमराइजेशन को बाधित करने के लिए दिखाई गई थी। ओलिगोन्यूक्लियोटाइड्स बनाने वाले कई एंटीवायरल क्वाड्रुप्लेक्स ने अधिक तापीय रूप से स्थिर जी-क्वाड्रुप्लेक्स और उच्च-क्रम जी क्वाड्रुप्लेक्स संरचनाओं का निर्माण किया, जो एंटीवायरल गतिविधि के लिए जिम्मेदार हो सकते हैं। उपचारात्मक अनुप्रयोग टी. एफ. ओ. अपनी उच्च अनुक्रम विशिष्टता के कारण एंटी-जीन थेरेपी में आशाजनक हैं। हालांकि, विवो में पोटेशियम का स्तर टी. एफ. ओ. को एकल रूप से जी-चौकड़ी संरचना बनाने के लिए बढ़ावा देता है, टी. एफ. ओ. एस. को ट्रिपलएक्स गठन में परस्पर क्रिया करने से रोकता है और टी. एफ. ओ. कोशिका उपचारों की प्रभावशीलता को कम करता है। हालांकि, जैसा कि परमशिवम और अन्य लोगों द्वारा दिखाया गया है, उच्च ग्वानीन सांद्रता वाले टी. एफ. ओ. में (आर)-1-ओ-[4-(1-पायरेनीलेथिनिल) फिनाइलमिथाइल] ग्लिसरॉल (टी. आई. एन. ए.) का उभार पोटेशियम के माध्यम से स्व-संघ की उपस्थिति को बहुत कम कर देता है। टीना-टी. एफ. ओ. का उपयोग भविष्य में विवो में जीनोम को लक्षित करने और एक चिकित्सीय अंत की ओर जीनोम हेरफेर करने के लिए किया जा सकता है। प्यूरिन टी. आई. एन. ए.-टी. एफ. ओ. का उपयोग के. आर. ए. एस. प्रोटो-ऑन्कोजीन के प्रति प्रतिजन अणुओं के रूप में विशिष्ट प्रतिज्ञा रखता है। संदर्भ न्यूक्लिक एसिड