Toxic Small RNA
आणविक जीवविज्ञान में, विषाक्त लघु आर. एन. ए. (टी. एस. आर. एन. ए., जिसे टी. आर. एन. ए.-व्युत्पन्न छोटे आर. एन. ए. के साथ भ्रमित नहीं किया जाना चाहिए) ट्रांस-एन्कोडेड छोटे गैर-कोडिंग आर. एन. ए. का एक परिवार है जो विशेष रूप से बीटाप्रोटोबैक्टीरिया के अंतर-आनुवंशिक क्षेत्रों में पाया जाता है। कई समानान्तर लोकी प्रत्येक कोडिंग जीनोम में समान (लेकिन समान नहीं) टी. एस. आर. एन. ए. को कूटबद्ध कर सकते हैं। आमतौर पर, बुर्खहोल्डेरिया की प्रत्येक प्रजाति में 3 से 5 समरूप टी. एस. आर. एन. ए. होते हैं। बुर्खहोल्डेरिया वंश की चार प्रजातियों के साथ किए गए प्रयोगों ने लघुगणक विकास चरणों में टी. एस. आर. एन. ए. की संरक्षित और संरचनात्मक अभिव्यक्ति दिखाई। क्रम और संरचना बुर्खहोल्डेरिया सेनोसेपेशिया में 4 टी. एस. आर. एन. ए. की द्वितीयक संरचनाओं की विशेषता से पता चलता है कि वे दोहरे हेयरपिन संरचनाएँ बनाते हैं। कभी-कभी, यह संरचना आर. एन. ए. के संसाधित होने के बाद ही परिणाम देती है (जैसा कि एन. सी. एस. 27 में)। आमतौर पर, द्वितीयक संरचना के अप्रचलित खंडों में एक सी. यू.-समृद्ध (साइटोसिन और यूरेसिल समृद्ध) क्षेत्र होता है। इस सी. यू.-समृद्ध क्षेत्र को कार्यात्मक क्षेत्र माना जाता है जो एम. आर. एन. ए. के राइबोजोम-बाइंडिंग साइट (आर. बी. एस.) को बांधता है। कार्य जबकि कार्रवाई का तंत्र लक्ष्य के आधार पर भिन्न हो सकता है, यह सुझाव दिया गया है कि टी. एस. आर. एन. ए. कई एम. आर. एन. ए. के राइबोजोम बाइंडिंग अनुक्रम को बांधकर जीन अभिव्यक्ति को नियंत्रित करते हैं। हर्बास्पिरिलम सेरोपेडिकाई में पाए जाने वाले टी. एस. आर. एन. ए. की कम जी. सी. (गुआनिन और साइटोसिन) सामग्री इस परिकल्पना का समर्थन करेगी। यह संभव है कि इस अंतःक्रिया को स्थिर करने के लिए चैपरोन प्रोटीन एच. एफ. क्यू. की आवश्यकता हो, लेकिन इसकी भूमिका स्पष्ट नहीं है। मोटे तौर पर, यह सुझाव दिया जाता है कि टी. एस. आर. एन. ए. बुर्खहोल्डेरिया में कार्बोहाइड्रेट और एमिनो एसिड चयापचय को नियंत्रित करते हैं। वे तब अधिक व्यक्त होते हैं जब बी. सेनोसेपेशिया को भुखमरी के वातावरण की तुलना में ग्लूकोज युक्त माध्यम में उगाया जाता है। इसके विपरीत, टी. एस. आर. एन. ए. की अत्यधिक अभिव्यक्ति अमीनो-एसिड समृद्ध वातावरण में विकास को बाधित करती है। विकास का यह क्षीणन माध्यम की विशिष्ट सामग्री पर निर्भर करता है, क्योंकि सामान्य वृद्धि अभी भी कई वातावरणों में होती है। जबकि अधिकांश विशिष्ट टी. एस. आर. एन. ए. काफी हद तक अस्वाभाविक रहते हैं, एन. सी. एस. 27 के कार्य का अध्ययन किया गया है। इसमें एक संरक्षित अनुक्रम होता है जो कई परिवहन और चयापचय प्रतिलेखों के शाइन-डाल्गार्नो अनुक्रम का विपरीत पूरक है। संभावित लक्ष्यों में कई जीन शामिल हैं जो कार्बोहाइड्रेट परिवहन और सुगंधित अमीनो एसिड के क्षरण को नियंत्रित करते हैं। विशिष्ट लक्ष्यों में 4-हाइड्रॉक्सीफिनाइलपाइरुविक एसिड डाइऑक्सीजिनेज (एच. पी. पी. डी.) और इंडोलपाइरुवेट फेरेडॉक्सिन ऑक्सीडोरिडक्टेज (आई. ओ. आर.) शामिल हैं। ये एंजाइम फेनिललैनिन और टायरोसिन अपचय में शामिल होते हैं। अन्य संभावित लक्ष्यों में ए. टी. पी.-बाइंडिंग कैसेट ट्रांसपोर्टर (ए. बी. सी. ट्रांसपोर्टर) में ग्लिसरॉल किनेज और सब्सट्रेट बाइंडिंग प्रोटीन शामिल हैं। इसलिए, कई साक्ष्य बताते हैं कि टी. एस. आर. एन. ए. कार्बोहाइड्रेट और एमिनो एसिड चयापचय को नियंत्रित करते हैं, हालांकि, इस कार्य की पुष्टि नहीं हुई है। एक अपेक्षाकृत अध्ययन न किए गए टी. एस. आर. एन. ए., एन. सी. एस. 62, को टी. एन.-सेक डेटा के आधार पर आवश्यक होने का सुझाव दिया गया है। मूल रूप से, टी. एस. आर. एन. ए. का नाम इसलिए रखा गया था क्योंकि उन्हें क्लोनिंग वेक्टर पर व्यक्त करने पर ई. कोलाई के विकास को रोकने के लिए पाया गया था। टी. एस. आर. एन. ए. किस तंत्र द्वारा विषाक्त होते हैं, यह अभी भी अज्ञात है। टी. एस. आर. एन. ए. विकास माध्यम में ई. कोलाई के लिए विषाक्त नहीं होते हैं, और न ही ई. कोलाई के साथ उगाए जाने पर बी. सेनोसेपेशिया द्वारा स्रावित होते हैं। इसके अतिरिक्त, वे उन बैक्टीरिया के लिए विषाक्त नहीं हैं जिनमें ये आर. एन. ए. अणु पाए जाते हैं (बी. सेनोसेपेशिया)। एन. सी. आर. एन. ए. के इस परिवार के लिए एक नाम परिवर्तन का सुझाव दिया गया है। उनकी संरचना के आधार पर, कुछ टी. एस. आर. एन. ए. को 'डबल हेयरपिन आर. एन. ए.' कहने का प्रस्ताव दिया गया है। मूल रूप से 2015 में पहचाने गए एक टी. एस. आर. एन. ए. (एन. सी. एस. 27) को बुर्खहोल्डेरिया डबल-हेयरपिन एस. आर. एन. ए. नियामक के लिए बी. डी. एच. आर. 1 नाम का सुझाव दिया गया है। एस्चेरिचिया कोलाई एस. आर. एन. ए. बाह्य कोशिकीय आर. एन. ए. सूची आर. एन. ए. आर. एफ. ए. एम. आर. एन. ए. हस्तक्षेप छोटे हस्तक्षेप करने वाले आर. एन. ए. छोटे नाभिकीय आर. एन. ए.-व्युत्पन्न सूक्ष्म आर. एन. ए. बाहरी लिंक पैनडाटॉक्स-जीनों का एक डेटाबेस जो बैक्टीरिया के लिए विषाक्त है आर. एफ. ए. एम. डेटाबेस-संबंधित एन. सी. आर. एन. ए. के सैकड़ों परिवारों की एक क्यूरेटेड सूची संदर्भ गैर-कोडिंग आर. एन. ए.