Serratus (virology)
सेराटस पृथ्वी के विरोम की कुल आनुवंशिक विविधता को उजागर करने के लिए एक बड़े पैमाने पर वायरोइनफॉर्मेटिक्स प्लेटफॉर्म है। अन्य शोधकर्ताओं द्वारा संयोग से अनुक्रमित किए गए नए कोरोना वायरस को उजागर करने के लक्ष्य के साथ शुरू हुई इस परियोजना का विस्तार सभी आर. एन. ए. वायरसों को शामिल करने के लिए किया गया, जो एक वायरल आर. एन. ए.-निर्भर आर. एन. ए. पोलीमरेज़ (आर. डी. आर. पी.) को कूटबद्ध करते हैं। 2020 के अंत तक सार्वजनिक डेटाबेस से ज्ञात लगभग 15,000 अलग-अलग आर. एन. ए. वायरस अनुक्रम थे, जिन्हें अलग-अलग आर. डी. आर. पी. (एमिनो एसिड अनुक्रम में 10 प्रतिशत से अधिक अंतर) की संख्या से मापा जाता था। बड़े पैमाने पर क्लाउड कंप्यूटिंग के लिए अनुकूलित जैव सूचना विज्ञान कार्यप्रवाह का उपयोग करते हुए, शोध दल ने केवल 11 दिनों में सीक्वेंस रीड आर्काइव (एसआरए) में 57 लाख स्वतंत्र रूप से उपलब्ध अनुक्रमण डेटासेट (कच्चे डेटा के 20.4 पेटाबाइट) का विश्लेषण किया और इसकी कंप्यूटिंग लागत 23,900 अमेरिकी डॉलर थी। इस विश्लेषण से 132,000 नए वायरल आर. डी. आर. पी. का पता चला, जो आर. एन. ए. वायरस की ज्ञात आनुवंशिक विविधता में लगभग परिमाण वृद्धि के क्रम का प्रतिनिधित्व करता है। डेटाबेस के भीतर, आर. एन. ए. वायरस को उनके आर. डी. आर. पी. पामप्रिंट के अनुसार वर्गीकृत किया जाता है, जो एक प्रकार का आणविक बारकोड है। पामप्रिंट का उपयोग एक कम्प्यूटेशनल रूप से कुशल सूचकांक के रूप में किया जा सकता है, जिसकी पहचान के लिए एस. आर. ए. अनुक्रमण में एक विशेष आर. एन. ए. वायरस होता है। इस तरह का सूचकांक कच्चे अनुक्रमण डेटासेट के लक्षित विश्लेषण की अनुमति देता है जिससे नए आर. एन. ए. वायरस की विशेषता हो सकती है। सभी सेराटस डेटा आई. एन. डी. एस. सी. रिलीज नीति के तहत स्वतंत्र रूप से उपलब्ध हैं। संदर्भ बाहरी लिंक पामआईडीः आरडीआरपी अनुक्रम खोज उपकरण सेराटस कोड रिपॉजिटरी बायोइन्फॉर्मेटिक्स कम्प्यूटेशनल बायोलॉजी वायरोलॉजी अध्ययन के कम्प्यूटेशनल क्षेत्र