BitterDB
बिटरडीबी यौगिकों का एक डेटाबेस है जिसका स्वाद मनुष्यों के लिए कड़वा बताया गया था। बिटरडीबी डेटाबेस का उद्देश्य कड़वे स्वाद वाले प्राकृतिक और सिंथेटिक यौगिकों और उनके संज्ञानात्मक कड़वे स्वाद रिसेप्टर्स (टी2आर या टीएएस2आर) के बारे में जानकारी एकत्र करना है। सारांश बिटरडीबी में 670 से अधिक यौगिक शामिल हैं जिनका स्वाद मनुष्यों के लिए कड़वा बताया गया था। यौगिकों को नाम, रासायनिक संरचना, अन्य कड़वे यौगिकों के साथ समानता, एक विशेष मानव कड़वे स्वाद रिसेप्टर के साथ संबंध और अन्य गुणों द्वारा भी खोजा जा सकता है। डेटाबेस में कड़वे स्वाद रिसेप्टर्स में उत्परिवर्तन के बारे में भी जानकारी है जो कड़वे यौगिकों द्वारा रिसेप्टर सक्रियण को प्रभावित करने के लिए दिखाए गए थे। डेटाबेस अवलोकन कड़वे यौगिक बिटरडीबी में वर्तमान में 670 से अधिक यौगिक हैं जिन्हें साहित्य में कड़वे के रूप में उद्धृत किया गया था। प्रत्येक यौगिक के लिए, डेटाबेस अपने आणविक गुणों के बारे में जानकारी प्रदान करता है, यौगिक की कड़वाहट के लिए संदर्भ, जिसमें यौगिक की कड़वाहट श्रेणी के बारे में अतिरिक्त जानकारी शामिल है (जैसे। एक 'कड़वा-मीठा' या 'थोड़ा कड़वा' एनोटेशन), विभिन्न यौगिक पहचानकर्ता (स्माइल्स, सीएएस रजिस्ट्री नंबर, आईयूपीएसी व्यवस्थित नाम), एक संकेत है कि क्या यौगिक एक प्राकृतिक स्रोत से लिया गया है या सिंथेटिक है, यौगिक की पबकेम प्रविष्टि का एक लिंक और डाउनलोड करने के लिए विभिन्न फ़ाइल प्रारूप (एसडीएफ, छवि, मुस्कुराहट)। 200 से अधिक कड़वे यौगिकों को प्रयोगात्मक रूप से उनके संबंधित मानव कड़वे स्वाद रिसेप्टर्स से जोड़ा गया है। उन यौगिकों के लिए, बिटरडीबी अतिरिक्त जानकारी प्रदान करता है, जिसमें इन लिगैंड-रिसेप्टर इंटरैक्शन का संकेत देने वाले प्रकाशनों के लिंक, रिसेप्टर सक्रियण के लिए प्रभावी एकाग्रता और/या ईसी50 मूल्य और बिटरडीबी में संबंधित कड़वे स्वाद रिसेप्टर प्रविष्टियों के लिंक शामिल हैं। कड़वे यौगिकों से पूछताछ और ब्राउज़ करना अलग-अलग तरीकों से पूछताछ और ब्राउज़ किया जा सकता है। उदाहरण के लिए, 'उन्नत खोज' विकल्प उपयोगकर्ता को उन यौगिकों को पुनः प्राप्त करने की अनुमति देता है जो विभिन्न मानदंडों में फिट होते हैं, जैसे कि विशिष्ट भौतिक गुणों का संयोजन या संबंधित मानव कड़वे स्वाद रिसेप्टर्स का संयोजन। पूछताछ विकल्पों के अलावा, उपयोगकर्ता सभी बिटरडीबी यौगिकों के साथ एक छँटाई योग्य तालिका के माध्यम से ब्राउज़ कर सकता है। कड़वा स्वाद रिसेप्टर्स बिटरडीबी में 25 ज्ञात मानव कड़वा स्वाद रिसेप्टर्स के बारे में डेटा होता है। प्रत्येक रिसेप्टर के लिए कई गुण प्रदर्शित किए जाते हैं। कड़वे स्वाद रिसेप्टर्स को विभिन्न मानदंडों का उपयोग करके खोजा जा सकता हैः नाम, ज्ञात लिगेंड और यूनीप्रोट परिग्रहण संख्या। एक टेबल का उपयोग करके जो सभी कड़वे स्वाद रिसेप्टर्स और उनके बारे में कुछ जानकारी प्रस्तुत करता है, उपयोगकर्ता विभिन्न विकल्पों द्वारा ब्राउज़ और सॉर्ट कर सकता है, जैसे कि रिसेप्टर से जुड़े कड़वे लिगेंड की संख्या। स्थानीय ब्लास्ट सेवा और वैश्विक संरेखण बिटरडीबी दो अतिरिक्त सुविधाएँ प्रदान करता हैः एक प्रश्न अनुक्रम और विभिन्न मानव कड़वे स्वाद रिसेप्टर्स के बीच स्थानीय समानता निर्धारित करने के लिए एक स्थानीय ब्लास्ट सेवा, और 25 मानव कड़वे स्वाद रिसेप्टर्स का वैश्विक संरेखण। संरेखण क्लस्टल डब्ल्यू 2 का उपयोग करके उत्पन्न किया गया था, और प्रत्येक रिसेप्टर की माध्यमिक संरचना को प्रदर्शित करता है, जैसा कि टॉपकॉन्स सर्वर द्वारा भविष्यवाणी की गई थी। बिटरडीबी यौगिकों को अपलोड करने के लिए एक 'अपलोड' विकल्प प्रदान करता है, जहां उपयोगकर्ताओं को कड़वे यौगिकों के बारे में जानकारी जमा करने के लिए प्रोत्साहित किया जाता है। इस डेटा की लेखकों द्वारा समीक्षा की जाएगी और तदनुसार डेटाबेस में अपलोड किया जाएगा। डेटाबेस अद्यतन प्राप्त करने के लिए उपयोगकर्ता डाक सूची में शामिल हो सकते हैं। उदाहरण भी देखें कड़वे संदर्भ बाहरी लिंक http://bitterdb.agri.huji.ac.il/bitterdb जैविक डेटाबेस संवेदी प्रणाली गुस्टेशन गुस्टेटरी प्रणाली कड़वे यौगिक