HYPHY (software)
HYPHY () एक मुक्त बहु-मंच (मैक, विंडोज और यूनिक्स) कम्प्यूटेशनल फाइलोजेनेटिक्स सॉफ्टवेयर पैकेज है जिसका उद्देश्य आनुवंशिक अनुक्रम डेटा का अधिकतम संभावना विश्लेषण करना है और विभिन्न सांख्यिकीय परिकल्पनाओं का परीक्षण करने के लिए उपकरणों से लैस है। HYPHY नाम "PHYlogenies का उपयोग करके परिकल्पना परीक्षण" के लिए एक संक्षिप्त नाम है। मार्च 2018 तक, लगभग 2,000 सहकर्मी-समीक्षित वैज्ञानिक पत्रिका लेख हाइफी का हवाला देते हैं। प्रमुख विशेषताएँ पूर्वनिर्धारित मानक मॉडल या विकास के उपयोगकर्ता-परिभाषित मॉडल का उपयोग करके न्यूक्लियोटाइड, प्रोटीन और कोडन अनुक्रमों के विश्लेषण का समर्थन करती हैं। पैकेज एक चित्रमय उपयोगकर्ता इंटरफेस के साथ-साथ बड़े और जटिल विश्लेषणों को स्थापित करने और परिणामों को संसाधित करने के लिए एक बैच भाषा के माध्यम से बातचीत का समर्थन करता है। हाइफी में व्यक्तिगत अमीनो-एसिड स्थलों और/या वंशावली पर अनुकूली विकास का पता लगाने के लिए विधियों का एक बहुमुखी समूह शामिल है, जिसमें नील्सन-यांग पी. ए. एम. एल. और सुजुकी-गोजोबोरी दृष्टिकोण और कई अन्य के सामान्यीकरण शामिल हैं। हाइफी का विकास 1997 में शुरू हुआ, 2000 में पहली सार्वजनिक रिलीज़ के साथ और दिसंबर 2020 तक का सबसे हालिया संस्करण 2.5 था। सॉफ्टवेयर/कोड उपलब्धता और लाइसेंस HYPHY को एम. आई. टी. लाइसेंस के तहत जारी स्रोत कोड के साथ फ्रीवेयर के रूप में वितरित किया जाता है। मैक ओएस एक्स और विंडोज के लिए संकलित द्विआधारी डाउनलोड के लिए उपलब्ध हैं। स्रोत कोड उपलब्ध है ताकि उपयोगकर्ता पॉज़िक्स प्रणालियों पर हाइफ़ी अनुप्रयोग को संकलित कर सकें। अनुकूली विकास का पता लगाने के लिए हाइफी विधियों का एक उपसमुच्चय भी टेम्पल विश्वविद्यालय में हाइफी दल द्वारा डेटामोंकी समूह पर उपलब्ध कराया जाता है। टिप्पणियाँ बाहरी लिंकः HYPHY होम पेजः डाटामोंकी सर्वर, जो विभिन्न प्रकार के HYPHY उपकरणों (बिना किसी लागत के) का समर्थन करता है। : हाइफी/डाटामोंकी फ़ाइलोजेनेटिक्स सॉफ्टवेयर का समर्थन करता है