Endogenous retrovirus
एंडोजेनस रेट्रोवायरस (ई. आर. वी.) जीनोम में एंडोजेनस वायरल तत्व हैं जो निकटता से मिलते-जुलते हैं और रेट्रोवायरस से प्राप्त किए जा सकते हैं। वे जबड़े वाले कशेरुकी जीवों के जीनोम में प्रचुर मात्रा में होते हैं, और वे मानव जीनोम (~ 1 प्रतिशत के कम अनुमान) के 5-8% तक होते हैं। ई. आर. वी. एक ऊर्ध्वाधर रूप से विरासत में प्राप्त प्रोवायरल अनुक्रम है और एक प्रकार के जीन का एक उपवर्ग है जिसे ट्रांसपोसन कहा जाता है, जिसे आम तौर पर जीन अभिव्यक्ति और विनियमन में महत्वपूर्ण भूमिका निभाने के लिए जीनोम के भीतर पैक और स्थानांतरित किया जा सकता है। ई. आर. वी. में हालांकि अधिकांश ट्रांसपोसन कार्यों की कमी होती है, आमतौर पर संक्रामक नहीं होते हैं और अक्सर रेट्रोवायरल प्रतिकृति चक्र के दोषपूर्ण जीनोमिक अवशेष होते हैं। मेजबान कोशिका के परमाणु जीनोम में उनके एकीकरण और रिवर्स-ट्रांसक्रिप्शन के कारण उन्हें जर्मलाइन प्रोवायरस रेट्रोलेमेंट्स के रूप में प्रतिष्ठित किया जाता है। शोधकर्ताओं ने सुझाव दिया है कि रेट्रोवायरस एक प्रकार के ट्रांसपोसन से विकसित हुए हैं जिसे रेट्रोट्रांसपोसन कहा जाता है, एक वर्ग I तत्व; ये जीन उत्परिवर्तित हो सकते हैं और जीनोम में किसी अन्य स्थान पर जाने के बजाय वे बहिर्जात या रोगजनक बन सकते हैं। इसका मतलब है कि सभी ई. आर. वी. एक रेट्रोवायरस द्वारा सम्मिलन के रूप में उत्पन्न नहीं हुए होंगे, लेकिन कुछ रेट्रोवायरस में आनुवंशिक जानकारी के लिए स्रोत हो सकते हैं जो वे मिलते-जुलते हैं। जब रोगाणु-रेखा में वायरल डी. एन. ए. का एकीकरण होता है, तो यह एक ई. आर. वी. को जन्म दे सकता है, जो बाद में मेजबान आबादी के जीन पूल में स्थिर हो सकता है। एक रेट्रोवायरस के प्रतिकृति चक्र में मेजबान कोशिका के परमाणु जीनोम में वायरल जीनोम की एक डीएनए प्रति का सम्मिलन ("एकीकरण") शामिल होता है। अधिकांश रेट्रोवायरस शारीरिक कोशिकाओं को संक्रमित करते हैं, लेकिन कभी-कभी जर्मलाइन कोशिकाओं (कोशिकाएं जो अंडे और शुक्राणु का उत्पादन करती हैं) का संक्रमण भी हो सकता है। शायद ही कभी, रेट्रोवायरल एकीकरण एक जर्मलाइन कोशिका में हो सकता है जो आगे चलकर एक व्यवहार्य जीव के रूप में विकसित होती है। यह जीव अंतःस्थापित रेट्रोवायरल जीनोम को अपने स्वयं के जीनोम के एक अभिन्न अंग के रूप में ले जाएगा-एक "एंडोजेनस" रेट्रोवायरस (ई. आर. वी.) जो इसकी संतानों को एक नए एलील के रूप में विरासत में मिल सकता है। कई ई. आर. वी. अपने मेजबानों के जीनोम में लाखों वर्षों से बने हुए हैं। हालांकि, इनमें से अधिकांश ने मेजबान डीएनए प्रतिकृति के दौरान निष्क्रिय उत्परिवर्तन प्राप्त कर लिए हैं और अब वायरस का उत्पादन करने में सक्षम नहीं हैं। ई. आर. वी. को पुनर्संयोजन विलोपन के रूप में जानी जाने वाली एक प्रक्रिया द्वारा जीनोम से आंशिक रूप से भी निकाला जा सकता है, जिसमें नए एकीकृत रेट्रोवायरस के समान अनुक्रमों के बीच पुनर्संयोजन के परिणामस्वरूप वायरल जीनोम के आंतरिक, प्रोटीन-कोडिंग क्षेत्रों को हटाया जाता है। सामान्य रेट्रोवायरस जीनोम में तीन जीन होते हैं जो इसके वायरल जीनोम के आक्रमण, प्रतिकृति, पलायन और प्रसार के लिए महत्वपूर्ण होते हैं। ये तीन जीन हैं गैग (वायरल कोर के लिए संरचनात्मक प्रोटीन के लिए एन्कोड), पोल (रिवर्स ट्रांसक्रिप्टेस, इंटीग्रेज़ और प्रोटीज के लिए एन्कोड), और एनवी (वायरस के बाहरी हिस्से के लिए कोट प्रोटीन के लिए एन्कोड)। इन वायरल प्रोटीनों को पॉलीप्रोटीन के रूप में कूटबद्ध किया जाता है। अपने जीवन चक्र को पूरा करने के लिए, रेट्रोवायरस मेजबान कोशिका की मशीनरी पर बहुत अधिक निर्भर करता है। प्रोटीज वायरल पॉलीप्रोटीन के पेप्टाइड बंधनों को कम करता है, जिससे अलग-अलग प्रोटीन कार्यात्मक हो जाते हैं। नाभिक में प्रवेश करने से पहले मेजबान कोशिका के कोशिका द्रव्य में वायरल आर. एन. ए. से वायरल डी. एन. ए. को संश्लेषित करने के लिए रिवर्स ट्रांसक्रिप्टेस कार्य करता है। एकीकरण मेजबान जीनोम में वायरल डीएनए के एकीकरण का मार्गदर्शन करता है। समय के साथ, ई. आर. वी. का जीनोम न केवल बिंदु उत्परिवर्तन प्राप्त करता है, बल्कि अन्य ई. आर. वी. के साथ फेरबदल और पुनः संयोजन भी करता है। एन. वी. के लिए एक क्षय अनुक्रम वाले ई. आर. वी. के फैलने की संभावना अधिक हो जाती है। जीनोमिक विकास में भूमिका एंडोजेनस रेट्रोवायरस जीनोम को आकार देने में सक्रिय भूमिका निभा सकते हैं। इस क्षेत्र में अधिकांश अध्ययनों ने मनुष्यों और उच्च नरवानरों के जीनोम पर ध्यान केंद्रित किया है, लेकिन अन्य कशेरुकी जीवों, जैसे चूहे और भेड़ का भी गहराई से अध्ययन किया गया है। ई. आर. वी. जीनोम के पार्श्व में लंबे टर्मिनल रिपीट (एल. टी. आर.) अनुक्रम अक्सर वैकल्पिक प्रवर्तक और बढ़ाने वाले के रूप में कार्य करते हैं, जो अक्सर ऊतक-विशिष्ट रूपों का उत्पादन करके ट्रांसक्रिप्टोम में योगदान करते हैं। इसके अलावा, रेट्रोवायरल प्रोटीन को स्वयं नए मेजबान कार्यों को पूरा करने के लिए चुना गया है, विशेष रूप से प्रजनन और विकास में। होमोलॉगस रेट्रोवायरल अनुक्रमों के बीच पुनर्संयोजन ने भी जीन फेरबदल और आनुवंशिक भिन्नता की पीढ़ी में योगदान दिया है। इसके अलावा, रेट्रोवायरल अनुक्रमों के संभावित विरोधी प्रभावों के उदाहरण में, उनका मुकाबला करने के लिए दमनकारी जीन सह-विकसित हुए हैं। लगभग 90 प्रतिशत एंडोजेनस रेट्रोवायरस एकल एल. टी. आर. होते हैं, जिनमें सभी ओपन रीडिंग फ्रेम (ओ. आर. एफ.) की कमी होती है। पूर्ण रेट्रोवायरल अनुक्रमों से जुड़े एकल एल. टी. आर. और एल. टी. आर. को मेजबान जीन पर प्रतिलेखन तत्वों के रूप में कार्य करते हुए दिखाया गया है। उनकी क्रिया की सीमा मुख्य रूप से प्रोटीन कोडिंग जीन के 5 'यू. टी. आर. में सम्मिलन द्वारा होती है; हालाँकि, वे 70-100 के. बी. दूर तक के जीन पर कार्य करने के लिए जाने जाते हैं। इनमें से अधिकांश तत्वों को उनके संबंधित जीन में इन्द्रिय दिशा में डाला जाता है, लेकिन एल. टी. आर. के एंटीसेंस दिशा में और पड़ोसी जीन के लिए एक द्विदिशात्मक प्रवर्तक के रूप में कार्य करने के प्रमाण मिले हैं। कुछ मामलों में, एल. टी. आर. जीन के लिए प्रमुख प्रवर्तक के रूप में कार्य करता है। उदाहरण के लिए, मनुष्यों में एएमवाई1सी का अपने प्रवर्तक क्षेत्र में एक पूर्ण ईआरवी अनुक्रम होता है; संबंधित एलटीआर पाचन एंजाइम एमाइलेज की लार विशिष्ट अभिव्यक्ति प्रदान करता है। इसके अलावा, पित्त एसिड-सी. ओ. ए. के लिए प्राथमिक प्रवर्तकः एमिनो एसिड एन-एसाइलट्रांसफेरेज (बी. ए. ए. टी.), जो पित्त चयापचय में अभिन्न एंजाइम के लिए कोड करता है, एल. टी. आर. मूल का है। एकल ई. आर. वी.-9 एल. टी. आर. के सम्मिलन ने एक कार्यात्मक ओपन रीडिंग फ्रेम का उत्पादन किया हो सकता है, जिससे मानव प्रतिरक्षा से संबंधित जी. टी. पीज़ जीन (आई. आर. जी. एम.) का पुनर्जन्म हो सकता है। ई. आर. वी. सम्मिलन को या तो जीन में सीधे एकीकरण द्वारा वैकल्पिक स्प्लाइस साइटों को उत्पन्न करने के लिए भी दिखाया गया है, जैसे कि मानव लेप्टिन हार्मोन रिसेप्टर के साथ, या एक अपस्ट्रीम एल. टी. आर. की अभिव्यक्ति द्वारा संचालित, जैसे कि फॉस्फोलाइपेज ए-2 जैसे प्रोटीन के साथ। हालाँकि, अधिकांश समय, एल. टी. आर. कई वैकल्पिक प्रवर्तकों में से एक के रूप में कार्य करता है, जो अक्सर प्रजनन और विकास से संबंधित ऊतक-विशिष्ट अभिव्यक्ति प्रदान करता है। वास्तव में, ज्ञात एल. टी. आर.-प्रवर्तित प्रतिलेखन रूपों में से 64 प्रतिशत प्रजनन ऊतकों में व्यक्त किए जाते हैं। उदाहरण के लिए, एस्ट्रोजन संश्लेषण के लिए एक महत्वपूर्ण एंजाइम एरोमाटेस पी450 के लिए जीन सीवाईपी19 कोड, जो आम तौर पर अधिकांश स्तनधारियों के मस्तिष्क और प्रजनन अंगों में व्यक्त किया जाता है। हालांकि, नरवानरों में, एक एल. टी. आर.-प्रचारित प्रतिलेखन संस्करण नाल को अभिव्यक्ति प्रदान करता है और गर्भावस्था के दौरान एस्ट्रोजन के स्तर को नियंत्रित करने के लिए जिम्मेदार होता है। इसके अलावा, न्यूरोनल एपोप्टोसिस अवरोधक प्रोटीन (एन. ए. आई. पी.), जो आम तौर पर व्यापक होता है, में एच. ई. आर. वी.-पी परिवार का एक एल. टी. आर. होता है जो एक प्रवर्तक के रूप में कार्य करता है जो वृषण और प्रोस्टेट को अभिव्यक्ति प्रदान करता है। अन्य प्रोटीन, जैसे नाइट्रिक ऑक्साइड सिंथेस 3 (एन. ओ. एस. 3), इंटरल्यूकिन-2 रिसेप्टर बी (आई. एल. 2. आर. बी.), और एस्ट्रोजन संश्लेषण के एक अन्य मध्यस्थ, एच. एस. डी. 17. बी. 1, भी वैकल्पिक रूप से एल. टी. आर. द्वारा विनियमित होते हैं जो प्लेसेंटल अभिव्यक्ति प्रदान करते हैं, लेकिन उनके विशिष्ट कार्य अभी तक ज्ञात नहीं हैं। प्रजनन अभिव्यक्ति की उच्च डिग्री को उस विधि के बाद का प्रभाव माना जाता है जिसके द्वारा उन्हें अंतर्जनित किया गया था; हालाँकि, यह रोगाणु-रेखा ऊतकों में डी. एन. ए. मिथाइलेशन की कमी के कारण भी हो सकता है। प्लेसेंटल प्रोटीन अभिव्यक्ति का सबसे अच्छा-विशिष्ट उदाहरण एक वैकल्पिक रूप से प्रचारित मेजबान जीन से नहीं बल्कि एक रेट्रोवायरल प्रोटीन के पूर्ण सह-विकल्प से आता है। रेट्रोवायरल फ्यूजोजेनिक एन. वी. प्रोटीन, जो मेजबान कोशिका में विरियन के प्रवेश में भूमिका निभाते हैं, का स्तनधारी नाल के विकास पर महत्वपूर्ण प्रभाव पड़ा है। स्तनधारियों में, सिंसाइटिन नामक अक्षुण्ण एन. वी. प्रोटीन सिंसाइटियोट्रोफोब्लास्ट के गठन और कार्य के लिए जिम्मेदार होते हैं। ये बहु-नाभिकीय कोशिकाएं मुख्य रूप से पोषक तत्वों के आदान-प्रदान को बनाए रखने और भ्रूण को मां की प्रतिरक्षा प्रणाली से अलग करने के लिए जिम्मेदार होती हैं। यह सुझाव दिया गया है कि इस कार्य के लिए इन प्रोटीनों के चयन और निर्धारण ने जीवंतता के विकास में महत्वपूर्ण भूमिका निभाई है। इसके अलावा, ई. आर. वी. और उनके संबंधित एल. टी. आर. के सम्मिलन में अंतर-गुणसूत्र स्थान पर वायरल अनुक्रमों के बीच पुनर्संयोजन के कारण गुणसूत्र पुनर्व्यवस्था को प्रेरित करने की क्षमता है। इन पुनर्व्यवस्थाओं को जीन दोहराव और विलोपन को प्रेरित करने के लिए दिखाया गया है जो बड़े पैमाने पर जीनोम प्लास्टिसिटी में योगदान करते हैं और नाटकीय रूप से जीन कार्य की गतिशीलता को बदल देते हैं। इसके अलावा, सामान्य रूप से रेट्रोलेमेंट्स काफी हद तक तेजी से विकसित होने वाले स्तनधारी-विशिष्ट जीन परिवारों में प्रचलित हैं, जिनका कार्य काफी हद तक तनाव और बाहरी उत्तेजनाओं की प्रतिक्रिया से संबंधित है। विशेष रूप से, मानव वर्ग I और वर्ग II एम. एच. सी. जीन दोनों में अन्य बहु-लोकस-जीन परिवारों की तुलना में एच. ई. आर. वी. तत्वों का उच्च घनत्व होता है। यह दिखाया गया है कि एच. ई. आर. वी. ने बड़े पैमाने पर डुप्लिकेट डुप्लीकॉन ब्लॉकों के गठन में योगदान दिया है जो जीन के एच. एल. ए. वर्ग 1 परिवार को बनाते हैं। अधिक विशेष रूप से, एचईआरवी मुख्य रूप से इन ब्लॉकों के बीच ब्रेक पॉइंट के भीतर और बीच के क्षेत्रों पर कब्जा करते हैं, यह सुझाव देते हुए कि काफी दोहराव और विलोपन की घटनाएं, जो आमतौर पर असमान क्रॉसओवर से जुड़ी होती हैं, उनके गठन को सुविधाजनक बनाती हैं। इम्यूनोहाप्लोटाइप के रूप में विरासत में मिले इन ब्लॉकों की पीढ़ी, एंटीजन की एक विस्तृत श्रृंखला के खिलाफ एक सुरक्षात्मक बहुरूपता के रूप में कार्य करती है, जिसने मनुष्यों को अन्य नरवानरों पर एक लाभ के साथ प्रेरित किया हो सकता है। ई. आर. वी. संवर्धकों के सह-विकल्प के परिणामस्वरूप विभिन्न प्रजातियों के बीच बहुत ही विकासवादी विशिष्ट अंग होने के कारण नाल की विशेषता का सुझाव दिया गया है। हार्मोन और विकास कारकों के लिए कूटबद्ध जीन में उत्परिवर्तन के बजाय नियामक उत्परिवर्तन, प्लेसेंटल मॉर्फोलॉजी के ज्ञात विकास का समर्थन करते हैं, विशेष रूप से क्योंकि अधिकांश हार्मोन और विकास कारक जीन गर्भावस्था के जवाब में व्यक्त किए जाते हैं, न कि प्लेसेंटल विकास के दौरान। शोधकर्ताओं ने चूहे और चूहे के बीच प्लेसेंटल विकास के नियामक परिदृश्य का अध्ययन किया, जो दो निकट से संबंधित प्रजातियां हैं। यह रैट ट्रोफोब्लास्ट स्टेम कोशिकाओं (टी. एस. सी.) के सभी नियामक तत्वों का मानचित्रण करके और माउस टी. एस. सी. में उनके ऑर्थोलॉग से उनकी तुलना करके किया गया था। टी. एस. सी. इसलिए देखे गए क्योंकि वे भ्रूण नाल में विकसित होने वाली प्रारंभिक कोशिकाओं को प्रतिबिंबित करते हैं। उनकी मूर्त समानताओं के बावजूद, संवर्धक और दमित क्षेत्र ज्यादातर प्रजाति-विशिष्ट थे। हालाँकि, अधिकांश प्रवर्तक अनुक्रम चूहे और चूहे के बीच संरक्षित किए गए थे। अपने अध्ययन के अंत में, शोधकर्ताओं ने प्रस्ताव दिया कि ईआरवी ने प्लेसेंटल विकास, इम्यूनोसप्रेशन और कोशिका संलयन की मध्यस्थता के माध्यम से प्रजाति-विशिष्ट प्लेसेंटल विकास को प्रभावित किया। ई. आर. वी. द्वारा कोशिकीय तंत्र का दोहन करने का एक अन्य उदाहरण पी53 है, जो एक ट्यूमर सप्रेसर जीन (टी. एस. जी.) है। डी. एन. ए. क्षति और कोशिकीय तनाव पी53 मार्ग को प्रेरित करता है, जिसके परिणामस्वरूप कोशिका एपोप्टोसिस होता है। अनुक्रमण के साथ क्रोमैटिन इम्यूनोप्रेसिपिटेशन का उपयोग करते हुए, सभी पी53-बाध्यकारी स्थलों में से तीस प्रतिशत कुछ प्राइमेट-विशिष्ट ईआरवी परिवारों की प्रतियों के भीतर स्थित थे। एक अध्ययन ने सुझाव दिया कि इससे रेट्रोवायरस को लाभ होता है क्योंकि पी53 का तंत्र प्रतिलेखन का तेजी से प्रेरण प्रदान करता है, जिससे मेजबान कोशिका से वायरल आरएनए का निकास होता है। अंत में, मेजबान डी. एन. ए. के आनुवंशिक क्षेत्रों में ई. आर. वी. या ई. आर. वी. तत्वों का सम्मिलन, या उनके प्रतिलेखन रूपों की अत्यधिक अभिव्यक्ति, सकारात्मक रूपों की तुलना में हानिकारक प्रभाव पैदा करने की बहुत अधिक क्षमता रखती है। जीनोम में उनकी उपस्थिति ने एक सह-विकासवादी गतिशीलता पैदा की है जिसने रिप्रेसर जीन के दोहराव और विस्तार को बढ़ाया है। इसके सबसे स्पष्ट उदाहरण में स्तनधारी जीनोम में टेंडम जिंक-फिंगर जीन का तेजी से दोहराव और प्रसार शामिल है। जिंक-फिंगर जीन, विशेष रूप से वे जिनमें एक के. आर. ए. बी. डोमेन शामिल है, कशेरुकी जीनोम में उच्च प्रतिलिपि संख्या में मौजूद हैं, और उनके कार्यों की सीमा प्रतिलेखन भूमिकाओं तक सीमित है। हालाँकि, स्तनधारियों में यह दिखाया गया है कि इन जीनों का विविधीकरण नए रेट्रोवायरल अनुक्रमों या उनके प्रतिलेखन को दबाने के लिए उनकी अंतर्जात प्रतियों के जवाब में कई दोहराव और स्थिरीकरण घटनाओं के कारण था। रोग में भूमिका कशेरुकी जीनोम में होने वाले अधिकांश ई. आर. वी. प्राचीन हैं, उत्परिवर्तन द्वारा निष्क्रिय हैं, और अपनी मेजबान प्रजातियों में आनुवंशिक निर्धारण तक पहुंच गए हैं। इन कारणों से, असामान्य परिस्थितियों को छोड़कर उनके मेजबानों पर नकारात्मक प्रभाव पड़ने की संभावना बहुत कम है। फिर भी, चूहों, बिल्लियों और कोआला सहित पक्षियों और गैर-मानव स्तनपायी प्रजातियों के अध्ययनों से यह स्पष्ट है कि छोटे (यानी हाल ही में एकीकृत) ई. आर. वी. रोग से जुड़े हो सकते हैं। स्तनधारियों के जीनोम में सक्रिय ई. आर. वी. की संख्या उनके शरीर के आकार से नकारात्मक रूप से संबंधित है, जो कैंसर रोगजनन के माध्यम से पेटो के विरोधाभास में योगदान का सुझाव देती है। इसने शोधकर्ताओं को मानव कैंसर और ऑटोइम्यून रोग के कई रूपों में ई. आर. वी. के लिए एक भूमिका का प्रस्ताव देने के लिए प्रेरित किया है, हालांकि निर्णायक साक्ष्य की कमी है। न्यूरोलॉजिकल विकार मनुष्यों में, ई. आर. वी. को मल्टीपल स्क्लेरोसिस (एम. एस.) में शामिल होने का प्रस्ताव दिया गया है। एम. एस. और ई. आर. वी. डब्ल्यू. ई. 1, या "सिंसाइटिन", जीन के बीच एक विशिष्ट संबंध, जो एक ई. आर. वी. सम्मिलन से प्राप्त होता है, रोग के रोगियों में "एम. एस.-संबद्ध रेट्रोवायरस" (एम. एस. आर. वी.) की उपस्थिति के साथ बताया गया है। मानव ई. आर. वी. (एच. ई. आर. वी.) को भी ए. एल. एस. और लत में फंसाया गया है। 2004 में यह बताया गया था कि सिज़ोफ्रेनिया वाले लोगों के सीरा में एच. ई. आर. वी. के प्रति प्रतिपिंड अधिक आवृत्ति में पाए गए थे। इसके अतिरिक्त, हाल ही में शुरू हुए सिज़ोफ्रेनिया वाले लोगों के मस्तिष्कमेरु द्रव में एक रेट्रोवायरल मार्कर, रिवर्स ट्रांसक्रिप्टेस का स्तर था, जो नियंत्रण विषयों की तुलना में चार गुना अधिक था। शोधकर्ता एच. ई. आर. वी. और सिज़ोफ्रेनिया के बीच एक संभावित संबंध को देखना जारी रखते हैं, जिसमें सिज़ोफ्रेनिया को प्रेरित करने वाले संक्रमण की अतिरिक्त संभावना होती है। प्रतिरक्षा ई. आर. वी. को न केवल रोग पैदा करने वाले संबंधों के माध्यम से, बल्कि प्रतिरक्षा के माध्यम से भी रोग से जुड़ा हुआ पाया गया है। लंबे टर्मिनल रिपीट्स (एल. टी. आर.) में ई. आर. वी. की आवृत्ति संभवतः वायरल ट्रांसक्रिप्शन और प्रतिकृति को बढ़ावा देने वाले प्रतिरक्षा संकेत मार्गों का लाभ उठाने के लिए वायरल अनुकूलन से संबंधित है। 2016 में किए गए एक अध्ययन ने जन्मजात प्रतिरक्षा की एक शाखा, इंटरफेरॉन द्वारा प्रेरित जीन विनियमन नेटवर्क के माध्यम से एक मेजबान में एकीकृत प्राचीन वायरल डीएनए के लाभ की जांच की। ये साइटोकिन्स वायरल संक्रमण का सबसे पहले जवाब देते हैं और घातक कोशिकाओं के लिए प्रतिरक्षा निगरानी में भी महत्वपूर्ण हैं। ई. आर. वी. के सी. आई. एस.-नियामक तत्वों के रूप में कार्य करने की भविष्यवाणी की गई है, लेकिन कुछ शारीरिक कार्यों के लिए इसके अधिकांश अनुकूली परिणाम अभी भी अज्ञात हैं। ऐसा डेटा है जो मानव इंटरफेरॉन प्रतिक्रिया के विनियमन में ईआरवी की सामान्य भूमिका का समर्थन करता है, विशेष रूप से इंटरफेरॉन-गामा (आईएफएनजी) के लिए। उदाहरण के लिए, इंटरफेरॉन-उत्तेजित जीन को सी. डी. 14 + मैक्रोफेज में सिग्नल ट्रांसड्यूसर और ट्रांसक्रिप्शन 1 (एस. टी. ए. टी. 1) और/या इंटरफेरॉन नियामक कारक (आई. आर. एफ. 1) के सक्रियक द्वारा बंधे ई. आर. वी. के साथ बहुत समृद्ध पाया गया। एच. ई. आर. वी. मानव जन्मजात प्रतिरक्षा प्रतिक्रिया को आकार देने में भी विभिन्न भूमिकाएँ निभाते हैं, जिसमें कुछ अनुक्रम प्रणाली को सक्रिय करते हैं और अन्य इसे दबा देते हैं। वे एक्सोजेनस रेट्रोवायरल संक्रमणों से भी बचा सकते हैंः वायरस जैसे प्रतिलेख पैटर्न पहचान रिसेप्टर्स को सक्रिय कर सकते हैं, और प्रोटीन सक्रिय रेट्रोवायरस के साथ हस्तक्षेप कर सकते हैं। एच. ई. आर. वी.-के. (एच. एम. एल. 2) से एक गैग प्रोटीन को एच. आई. वी. गैग के साथ मिश्रित दिखाया गया है, जिसके परिणामस्वरूप एच. आई. वी. कैप्सिड गठन बाधित होता है। जीन विनियमन एक अन्य प्रस्तावित विचार यह था कि एक ही परिवार के ई. आर. वी. ने विनियमन के एक ही नेटवर्क में कई जीनों की भर्ती करने में भूमिका निभाई। यह पाया गया कि एम. ई. आर. 41 तत्वों ने एस. टी. ए. टी. 1 बाइंडिंग साइटों के पास स्थित जीन को अतिरिक्त अनावश्यक नियामक वृद्धि प्रदान की। चिकित्सा में पोर्सिन एंडोजेनस रेट्रोवायरस की भूमिका मनुष्यों के लिए, पोर्सिन एंडोजेनस रेट्रोवायरस (पी. ई. आर. वी.) ज़ेनोट्रांसप्लांटेशन में पोर्सिन ऊतकों और अंगों का उपयोग करते समय, एक प्रजाति के जीव से विभिन्न प्रजातियों के जीव में जीवित कोशिकाओं, ऊतकों और अंगों का प्रत्यारोपण करते समय एक चिंता पैदा करते हैं। हालाँकि सुअर आम तौर पर व्यावहारिक, वित्तीय, सुरक्षा और नैतिक कारणों से मानव अंग रोगों के इलाज के लिए सबसे उपयुक्त दाता होते हैं, लेकिन पी. ई. आर. वी. को पहले सुअरों से हटाया नहीं जा सका था, क्योंकि उनकी वायरल क्षमता मेजबान जीनोम में एकीकृत होने और संतानों में पारित होने की थी, वर्ष 2017 तक, जब एक प्रयोगशाला ने सी. आर. आई. एस. पी. आर.-सी. ए. एस. 9 का उपयोग करते हुए सुअर जीनोम से सभी 62 रेट्रोवायरस को हटा दिया था। क्रॉस-प्रजाति संचरण के परिणाम अज्ञात रहते हैं और इनमें खतरनाक क्षमता होती है। शोधकर्ताओं ने संकेत दिया है कि पी. ई. आर. वी. द्वारा मानव ऊतकों का संक्रमण बहुत संभव है, विशेष रूप से प्रतिरक्षाविहीन व्यक्तियों में। एक इम्यूनोसप्रेस्ड स्थिति संभावित रूप से वायरल डीएनए की अधिक तेजी से और दृढ़ प्रतिकृति की अनुमति दे सकती है, और बाद में मानव-से-मानव संचरण के अनुकूल होने में कम कठिनाई होगी। हालाँकि दाता के अंग/ऊतक में मौजूद ज्ञात संक्रामक रोगजनकों को रोगजनक-मुक्त झुंडों के प्रजनन द्वारा समाप्त किया जा सकता है, लेकिन दाता में अज्ञात रेट्रोवायरस मौजूद हो सकते हैं। ये रेट्रोवायरस अक्सर दाता में अव्यक्त और स्पर्शोन्मुख होते हैं, लेकिन प्राप्तकर्ता में सक्रिय हो सकते हैं। अंतर्जनित विषाणुओं के कुछ उदाहरण जो मानव कोशिकाओं को संक्रमित कर सकते हैं और गुणा कर सकते हैं, वे हैं बैबून (बी. ए. ई. वी.), बिल्लियाँ (आर. डी. 114) और चूहे। पी. ई. आर. वी. के तीन अलग-अलग वर्ग हैं, पी. ई. आर. वी.-ए., पी. ई. आर. वी.-बी. और पी. ई. आर. वी.-सी. पी. ई. आर. वी.-ए. और पी. ई. आर. वी.-बी. पॉलीट्रॉपिक हैं और इन विट्रो में मानव कोशिकाओं को संक्रमित कर सकते हैं, जबकि पी. ई. आर. वी.-सी. पारिस्थितिक है और मानव कोशिकाओं पर प्रतिकृति नहीं बनाता है। वर्गों के बीच प्रमुख अंतर एन. वी. प्रोटीन के रिसेप्टर बाइंडिंग डोमेन और लॉन्ग टर्मिनल रिपीट्स (एल. टी. आर.) में है जो प्रत्येक वर्ग की प्रतिकृति को प्रभावित करते हैं। पी. ई. आर. वी.-ए. और पी. ई. आर. वी.-बी. एल. टी. आर. प्रदर्शित करते हैं जो यू3 क्षेत्र में दोहराए जाते हैं। हालाँकि, पी. ई. आर. वी.-ए. और पी. ई. आर. वी.-सी. दोहराव रहित एल. टी. आर. प्रदर्शित करते हैं। शोधकर्ताओं ने पाया कि संवर्धन में पी. ई. आर. वी. ने सक्रिय रूप से अपने एल. टी. आर. की दोहराव संरचना के लिए अनुकूलित किया ताकि एक मेजबान कोशिका द्वारा प्रदर्शन किए जा सकने वाले सर्वोत्तम प्रतिकृति प्रदर्शन से मेल खा सके। अपने अध्ययन के अंत में, शोधकर्ताओं ने निष्कर्ष निकाला कि रिपीटलेस पी. ई. आर. वी. एल. टी. आर. रिपीट-हार्बरिंग एल. टी. आर. से विकसित हुआ। यह संभवतः सम्मिलन उत्परिवर्तन से हुआ था और एल. टी. आर. और एन. वी./एन. वी. पर डेटा के उपयोग के माध्यम से साबित हुआ था। ऐसा माना जाता है कि दोहराव रहित एल. टी. आर. की पीढ़ी वायरस की अनुकूलन प्रक्रिया को प्रतिबिंबित कर सकती है, जो एक बहिर्जातीय से अंतर्जातीय जीवन शैली में बदल सकती है। 1999 में किए गए एक नैदानिक परीक्षण अध्ययन में 160 रोगियों का नमूना लिया गया, जिनका विभिन्न जीवित सुअर ऊतकों के साथ इलाज किया गया था और 97 प्रतिशत रोगियों में लगातार पी. ई. आर. वी. संक्रमण का कोई सबूत नहीं देखा गया, जिनके लिए पी. सी. आर. के लिए पी. ई. आर. वी. अनुक्रमों के प्रवर्धन के लिए पर्याप्त मात्रा में डी. एन. ए. उपलब्ध था। इस अध्ययन में कहा गया है कि पूर्वव्यापी अध्ययन संक्रमण या संबंधित नैदानिक लक्षणों की वास्तविक घटनाओं का पता लगाने के लिए सीमित हैं। इसने बारीकी से निगरानी किए गए संभावित परीक्षणों का उपयोग करने का सुझाव दिया, जो संभावित क्रॉस-प्रजाति पी. ई. आर. वी. संचरण का अधिक पूर्ण और विस्तृत मूल्यांकन और पी. ई. आर. वी. की तुलना प्रदान करेगा। ह्यूमन एंडोजेनस रेट्रोवायरस (एचईआरवी) में मानव जीनोम का एक महत्वपूर्ण हिस्सा शामिल है, जिसमें लगभग 98,000 ईआरवी तत्व और टुकड़े 5-8% बनाते हैं। 2005 में प्रकाशित एक अध्ययन के अनुसार, प्रतिकृति बनाने में सक्षम किसी भी एचईआरवी की पहचान नहीं की गई थी; सभी दोषपूर्ण प्रतीत हुए, जिनमें प्रमुख विलोपन या मूर्खतापूर्ण उत्परिवर्तन थे (एचईआरवी-के के लिए सच नहीं)। ऐसा इसलिए है क्योंकि अधिकांश एचईआरवी केवल मूल वायरस के निशान हैं, जिन्हें पहली बार लाखों साल पहले एकीकृत किया गया था। 100, 000 जीनोम परियोजना के हिस्से के रूप में एचईआरवी एकीकरण का विश्लेषण चल रहा है। 2023 के एक अध्ययन में पाया गया कि एच. ई. आर. वी. निष्क्रिय अवस्थाओं से जागृत हो सकता है और उम्र बढ़ने में योगदान कर सकता है जिसे एंटीबॉडी को निष्क्रिय करके अवरुद्ध किया जा सकता है। मानव अंतजनन रेट्रोवायरस की खोज मूल रूप से तब की गई थी जब मानव जीनोमिक पुस्तकालयों की जांच कम कठोरता वाली स्थितियों में पशु रेट्रोवायरस से जांच का उपयोग करके या वायरस अनुक्रमों के समान ओलिगोन्यूक्लियोटाइड्स का उपयोग करके की गई थी। वर्गीकरण एच. ई. आर. वी. को पशु रेट्रोवायरस के लिए उनके समरूपता के आधार पर वर्गीकृत किया जाता है। वर्ग I से संबंधित परिवार स्तनधारी गैमरेट्रोवायरस (प्रकार सी) और एप्सिलोनरेट्रोवायरस (प्रकार ई) के अनुक्रम में समान हैं। वर्ग II से संबंधित परिवार स्तनधारी बेटारेट्रोवायरस (प्रकार बी) और डेल्टारेट्रोवायरस (प्रकार डी) के लिए समरूपता दिखाते हैं। तृतीय श्रेणी से संबंधित परिवार झागदार वायरस के समान होते हैं। सभी वर्गों के लिए, यदि गैग, पोल और एनवी जीन में समरूपता अच्छी तरह से संरक्षित दिखाई देती है, तो उन्हें एक सुपरफ़ैमिली में समूहीकृत किया जाता है। ज्ञात है कि प्रथम श्रेणी के और भी परिवार हैं। परिवारों को स्वयं कम समान तरीके से नामित किया जाता है, जिसमें एक बहिर्जात रेट्रोवायरस, प्राइमिंग टीआरएनए (एचईआरवी-डब्ल्यू, एचईआरवी-के), या कुछ पड़ोसी जीन (एचईआरवी-एडीपी), क्लोन संख्या (एचईआरवी-एस 71), या कुछ एमिनो एसिड मोटिफ (एचईआरवी-एफआरडी) के आधार पर नामकरण का मिश्रण होता है। एक प्रस्तावित नामकरण का उद्देश्य कभी-कभी पैराफाइलेटिक मानकों को साफ करना है। उत्पत्ति मानव विकास के दौरान कभी-कभी, एच. ई. आर. वी. के बहिजनित पूर्वज रोगाणु रेखा कोशिकाओं में खुद को डालते हैं और फिर मेजबान के कोशिकीय तंत्र का उपयोग और शोषण करते हुए मेजबान के जीन के साथ प्रतिकृति बनाते हैं। अपनी विशिष्ट जीनोमिक संरचना के कारण, एच. ई. आर. वी. को प्रवर्धन और स्थानान्तरण के कई दौरों के अधीन किया गया था, जिससे रेट्रोवायरल डी. एन. ए. का अधिक व्यापक वितरण होता है। फिर भी, मनुष्यों और चिंपांज़ी के विचलन के बाद से वायरस का एक परिवार सक्रिय रहा है। यह परिवार, जिसे एच. ई. आर. वी.-के. (एच. एम. एल. 2) कहा जाता है, एच. ई. आर. वी. तत्वों का 1 प्रतिशत से भी कम है, लेकिन यह सबसे अधिक अध्ययन किए गए तत्वों में से एक है। ऐसे संकेत हैं कि यह पिछले कुछ लाख वर्षों में भी सक्रिय रहा है, उदाहरण के लिए, कुछ मानव व्यक्तियों के पास दूसरों की तुलना में एच. एम. एल. 2 की अधिक प्रतियां हैं। परंपरागत रूप से, एच. ई. आर. वी. के आयु अनुमान एच. ई. आर. वी. के 5 'और 3' एल. टी. आर. की तुलना करके किए जाते हैं; हालाँकि, यह विधि केवल पूर्ण लंबाई वाले एच. ई. आर. वी. के लिए प्रासंगिक है। एक हालिया विधि, जिसे क्रॉस-सेक्शनल डेटिंग कहा जाता है, एचईआरवी सम्मिलन की उम्र का अनुमान लगाने के लिए एकल एलटीआर के भीतर भिन्नताओं का उपयोग करती है। यह विधि एच. ई. आर. वी. आयु का अनुमान लगाने में अधिक सटीक है और इसका उपयोग किसी भी एच. ई. आर. वी. सम्मिलन के लिए किया जा सकता है। क्रॉस-सेक्शनल डेटिंग का उपयोग यह सुझाव देने के लिए किया गया है कि HERV-K (HML2) के दो सदस्य, HERV-K106 और HERV-K116, पिछले 800,000 वर्षों में सक्रिय थे और HERV-K106 ने 150,000 साल पहले आधुनिक मनुष्यों को संक्रमित किया होगा। हालांकि, एचईआरवी-के (एचएमएल2) परिवार के ज्ञात संक्रामक सदस्यों की अनुपस्थिति और प्रकाशित मानव जीनोम अनुक्रम के भीतर पूर्ण कोडिंग क्षमता वाले तत्वों की कमी से कुछ लोगों को पता चलता है कि परिवार के वर्तमान में सक्रिय होने की संभावना कम है। 2006 और 2007 में, फ्रांस और अमेरिका में स्वतंत्र रूप से काम करने वाले शोधकर्ताओं ने एचईआरवी-के (एचएमएल2) के कार्यात्मक संस्करणों को फिर से बनाया। एच. ई. आर. वी. प्रोटीन की अभिव्यक्ति एच. ई. आर. वी. के एक जैविक रूप से सक्रिय परिवार, एच. ई. आर. वी.-के. की अभिव्यक्ति, नाल में पाए जाने वाले प्रोटीन का उत्पादन करती है। इसके अलावा, एच. ई. आर. वी.-डब्ल्यू. (ई. आर. वी. डब्ल्यू.-1) और एच. ई. आर. वी.-एफ. आर. डी. (ई. आर. वी. एफ. आर. डी.-1) के लिफाफा जीन की अभिव्यक्ति सिंसाइटिन का उत्पादन करती है जो कोशिका-कोशिका संलयन को प्रेरित करके प्लेसेंटोजेनेसिस के दौरान सिंसाइटियोट्रोफोब्लास्ट कोशिका परत की पीढ़ी के लिए महत्वपूर्ण हैं। ह्यूगो जीन नामकरण समिति (एच. जी. एन. सी.) मानव ई. आर. वी. के लिए जीन प्रतीकों को मंजूरी देती है। कार्यात्मक प्रभाव MER41.AIM2 एक HERV है जो AIM2 (मेलानोमा 2 में अनुपस्थित) के प्रतिलेखन को नियंत्रित करता है जो विदेशी साइटोसोलिक DNA के संवेदक के लिए कूटबद्ध करता है। यह AIM2 के लिए एक बाध्यकारी साइट के रूप में कार्य करता है, जिसका अर्थ है कि यह AIM2 के प्रतिलेखन के लिए आवश्यक है। शोधकर्ताओं ने इसे CRISPR/Cas9 का उपयोग करके हेला कोशिकाओं में MER41.AIM2 को हटाकर दिखाया था, जिससे संशोधित हेला कोशिकाओं में AIM2 का एक अज्ञात प्रतिलेख स्तर हो गया था। नियंत्रण कोशिकाएँ, जिनमें अभी भी MER41.AIM2 ERV था, सामान्य मात्रा में AIM2 प्रतिलेखन के साथ देखी गईं। प्रतिरक्षा के संदर्भ में, शोधकर्ताओं ने निष्कर्ष निकाला कि MER41.AIM2 संक्रमण के लिए एक सूजन प्रतिक्रिया के लिए आवश्यक है। बाहरी विषाणुओं द्वारा सक्रियण काफी प्रमाण बताते हैं कि एच. ई. आर. वी. को वायरल संक्रमणों द्वारा फिर से सक्रिय किया जा सकता है, जैसे किः 1) रेट्रोवायरस-मानव इम्यूनोडेफिशिएंसी वायरस प्रकार-1 (एच. आई. वी.-1), मानव टी-लिम्फोट्रोपिक वायरस 1 (एच. टी. एल. वी.-1); 2) आर. एन. ए. वायरस-इन्फ्लूएंजा ए वायरस, हेपेटाइटिस सी वायरस (एच. सी. वी.), गंभीर तीव्र श्वसन सिंड्रोम कोरोनावायरस-2 (एस. ए. आर. एस. सी. ओ. वी.-2); 3) डी. एन. ए. वायरस-हर्पीस सिम्प्लेक्स वायरस प्रकार-1 (एच. एस. वी.-1), एपस्टीन-बार वायरस (ई. बी. वी.), मानव साइटोमेगालोवायरस (सी. एम. वी आगे के अध्ययनों से पता चला है कि पारगमन का तंत्र प्रमुख ई. बी. वी. लेट जीन पारगमनकर्ता, ई. बी. एन. ए.-2 की अभिव्यक्ति पर निर्भर करता है। गहन विश्लेषण ने एचईआरवी-के18 संक्रमण के लिए एक मजबूत उम्मीदवार के रूप में ईबीवी अव्यक्त झिल्ली प्रोटीन एलएमपी-2ए की पहचान करने वाली तस्वीर को पूरा किया। एच. ई. आर. वी.-के18 में भी सुपर एंटीजन गतिविधि होने की सूचना मिली है। पॉलीक्लोनल टी और बी कोशिका सक्रियण उनके प्रतिजन रिसेप्टर की विशिष्टता की परवाह किए बिना)। यह भी दिखाया गया है कि ई. बी. वी. जी. पी. 350 प्रोटीन के इन विट्रो बाइंडिंग के कारण बी-कोशिकाओं, मोनोसाइट्स, मैक्रोफेज और एस्ट्रोसाइट्स-कोशिकाओं में एमएसआरवीएनवी और सिंसाइटिन-1 सक्रिय हो जाता है जो मल्टीपल स्क्लेरोसिस के रोगजनन में शामिल होते हैं। मोनोसाइट्स, विशेष रूप से मैक्रोफेज में उनके विभेदन के बाद, ई. बी. वी. जी. पी. 350 के लिए सबसे अधिक उत्तरदायी प्रतीत होते हैं, जो बी cells.This की तुलना में एच. ई. आर. वी.-वेनव के उच्च स्तर को व्यक्त करते हैं, जो एक अन्य अध्ययन के अनुरूप है, जिसने प्रदर्शित किया कि संक्रामक मोनोन्यूक्लियोसिस के दौरान ई. बी. वी. ने अन्य रक्त कोशिका प्रकारों की तुलना में मोनोसाइट्स में एच. ई. आर. वी.-डब्ल्यू/एम. एस. आर. वी. अभिव्यक्ति के सबसे मजबूत सक्रियण को बढ़ावा दिया। लाखों वर्षों से कशेरुकी जीवों के जीनोम में एकीकृत होने के बावजूद, ईआरवी बाहरी वायरस और मेजबान जीनोम के बीच एक मध्यवर्ती चरण का प्रतिनिधित्व करते हैं; यह सुझाव दिया जाता है कि एचईआरवी-व्युत्पन्न प्रोटीन और पेप्टाइड्स के लिए प्रतिरक्षा सहिष्णुता थाइमस और अस्थि मज्जा में एचईआरवी के एपिजेनेटिक मौन के कारण अपूर्ण है, जो सभी एचईआरवी-विशिष्ट टी और बी कोशिकाओं को हटाने से रोकता है। इसके प्रमाण के रूप में, ई. आर. वी.-व्युत्पन्न एंटीजन के साथ गैर-मानव नरवानरों के टीकाकरण ने मजबूत बहु-कार्यात्मक साइटोटॉक्सिक टी कोशिका प्रतिक्रिया के साथ-साथ उच्च एंटीबॉडी टाइटर्स को भी स्थापित किया। जातिजनित अध्ययनों के अनुसार, मानव जीनोम में मौजूद 30 एच. ई. आर. वी. परिवारों में, एच. ई. आर. वी.-के. (एच. एम. एल.-2) तत्व जो हाल ही में एकीकृत हुए हैं, सबसे अक्षुण्ण और जैविक रूप से सक्रिय रूप हैं। एच. ई. आर. वी.-के. एन. वी. और एच. ई. आर. वी.-एच. एन. वी., जिन्हें ट्यूमर से जुड़े एंटीजनों का एक नया वर्ग माना जाता है, विभिन्न प्रकार के कैंसर के रोगियों में मजबूत साइटोटॉक्सिक टी-सेल प्रतिक्रियाओं को बढ़ावा देने के लिए पाए गए हैं। न्यूक्लिक एसिड के जन्मजात प्रतिरक्षा संवेदन के स्तर पर, एंडोजेनस रेट्रोवायरस से प्राप्त सिंगल-स्ट्रैंडेड आर. एन. ए. (एस. एस. आर. एन. ए.) और डबल-स्ट्रैंडेड आर. एन. ए. (डी. एस. आर. एन. ए.) को पैटर्न पहचान रिसेप्टर्स (पी. आर. आर.) द्वारा पहचाना जाता है। एस. एस. आर. एन. ए. को टोल जैसे रिसेप्टर्स टी. एल. आर.-7 और टी. एल. आर.-8 द्वारा महसूस किया जा सकता है, जिसके परिणामस्वरूप उत्तेजित डेंड्राइटिक कोशिकाओं (डी. सी.) और मैक्रोफेज द्वारा आई. एफ. एन.-ए. का स्राव होता है, जिसे एच. आई. वी.-1 से प्राप्त एस. एस. आर. एन. ए. के लिए देखा गया था। डी. एस. आर. एन. ए. सबसे अधिक प्रतिरक्षात्मक न्यूक्लिक एसिड रोगजनक-संबंधित आणविक पैटर्न (पी. ए. एम. पी.) में से एक हो सकता है, क्योंकि वे सामान्य अवस्था में कोशिकाओं में नहीं पाए जाते हैं। एच. ई. आर. वी.-व्युत्पन्न डी. एस. आर. एन. ए. को टी. एल. आर.-3, आर. आई. जी.-I और एम. डी. ए. 5 द्वारा पहचाना जा सकता है; आर. आई. जी.-I और एम. डी. ए. 5 को टाइप I आई. एफ. एन. प्रतिक्रिया को प्रेरित करने के लिए जाना जाता है। जब डी. एन. ए. में पुनः प्रतिलेखित किया जाता है, तो रेट्रोवायरस को इंटरफेरॉन जीन (सी. जी. ए. एस.-एस. टी. आई. एन. जी.) मार्ग के चक्रीय जी. एम. पी.-ए. एम. पी. सिंथेस-उत्तेजक द्वारा महसूस किया जा सकता है, जिससे परमाणु कारक-कप्पा बी (एन. एफ.-के. बी.) और आई. एफ. एन. नियामक कारक 3 (आई. आर. एफ. 3) सक्रिय हो जाता है, जो बदले में एक प्रकार I आई. एफ. एन. प्रतिक्रिया को ट्रिगर करता है। डी. एस. डी. एन. ए. को आई. एफ. एन.-नियामक कारकों (डी. ए. आई.) के डी. एन. ए.-निर्भर सक्रियक द्वारा भी महसूस किया जा सकता है; डी. एन. ए.: आर. एन. ए. संकरों को टी. एल. आर.-9 द्वारा पहचाना जा सकता है पी. आर. आर. के माध्यम से न्यूक्लिक एसिड की पहचान वायरल संक्रमणों के खिलाफ लड़ने के लिए एक बहुत ही कुशल रणनीति प्रदान करती है, साथ ही साथ स्वयं-न्यूक्लिक एसिड को पहचानने और स्व-प्रतिरक्षा को बढ़ावा देने की संभावना के कारण मेजबान को जोखिम में डालती है। आश्चर्य की बात नहीं है कि एच. ई. आर. वी. को विभिन्न ऑटोइम्यून और सूजन संबंधी बीमारियों से जुड़ा हुआ पाया गया है, जैसे कि मल्टीपल स्क्लेरोसिस, एम्योट्रोफिक लेटरल स्क्लेरोसिस (ए. एल. एस.), सिस्टमिक ल्यूपस एरिथेमेटोसस (एस. एल. ई.), रुमेथॉइड आर्थराइटिस (आर. ए.), स्जोग्रेन सिंड्रोम (एस. एस.)। प्रोटीन स्तर पर, टी. एल. आर. और कुछ एच. ई. आर. वी. प्रोटीनों के बीच एक सीधी अंतःक्रिया दिखाई गई है। उदाहरण के लिए, एच. ई. आर. वी.-डब्ल्यू. एन. वी. की सतह इकाई (जिसे मल्टीपल स्क्लेरोसिस से जुड़े रेट्रोवायरल तत्व (एम. एस. आर. वी.) एन. वी. के रूप में भी जाना जाता है) टी. एल. आर. 4 और सी. डी. 14 से जुड़ी हुई पाई गई, जो आई. एल.-1β, आई. एल.-6 और टी. एन. एफ. ए. सहित प्रो-इंफ्लेमेटरी साइटोकिन्स के उत्पादन को उत्तेजित करती है। HERV-W Env मानव डेंड्राइटिक कोशिकाओं में एक परिपक्वता प्रक्रिया को ट्रिगर कर सकता है, जिससे उन्हें Th1-जैसे प्रकार के Th कोशिका विभेदन का समर्थन करने की क्षमता मिलती है। प्रतिरक्षात्मक अध्ययनों ने एच. आई. वी. संक्रमित व्यक्तियों में एच. ई. आर. वी. के खिलाफ टी कोशिका प्रतिरक्षा प्रतिक्रियाओं के लिए कुछ सबूत दिखाए हैं। यह परिकल्पना कि एच. आई. वी. एच. आई. वी. संक्रमित कोशिकाओं में एच. ई. आर. वी. अभिव्यक्ति को प्रेरित करता है, इस प्रस्ताव को जन्म दिया कि एच. ई. आर. वी. प्रतिजनों को लक्षित करने वाला एक टीका विशेष रूप से एच. आई. वी. संक्रमित कोशिकाओं को समाप्त कर सकता है। इस नए दृष्टिकोण का संभावित लाभ यह है कि एच. आई. वी. संक्रमित कोशिकाओं के सरोगेट मार्कर के रूप में एच. ई. आर. वी. एंटीजन का उपयोग करके, यह कुख्यात रूप से विविध और तेजी से उत्परिवर्तित होने वाले एच. आई. वी. एंटीजन को सीधे लक्षित करने में निहित कठिनाई को दरकिनार कर सकता है। ई. आर. वी. के संपूर्ण जीनोम अनुक्रमण की विशेषता के लिए तकनीक उदाहरण-एक चीनी पोर्सिन ई. आर. वी. (पी. ई. आर. वी.) चीनी मूल के मिनीपिग आइसोलेट, पी. ई. आर. वी.-ए.-बी. एम. को पूरी तरह से और विभिन्न नस्लों और कोशिका रेखाओं के साथ अनुक्रमित किया गया था ताकि इसकी आनुवंशिक भिन्नता और विकास को समझा जा सके। न्यूक्लियोटाइड प्रतिस्थापन की देखी गई संख्या और विभिन्न जीनोम अनुक्रमों के बीच शोधकर्ताओं को एक अनुमान आयु निर्धारित करने में मदद मिली कि पी. ई. आर. वी.-ए.-बी. एम. को इसके मेजबान जीनोम में एकीकृत किया गया था, जो यूरोपीय मूल के सूअरों की तुलना में पहले एक विकासवादी आयु का पाया गया था। अनुक्रमण के साथ क्रोमैटिन इम्यूनोप्रेसिपिटेशन (चीप-सेक) इस तकनीक का उपयोग प्रोमोटर्स और एन्हांसर के सूचक हिस्टोन चिह्नों को खोजने के लिए किया जाता है, जो डी. एन. ए. प्रोटीन और दमित क्षेत्रों और ट्राइमिथाइलेशन के लिए बाध्यकारी स्थल हैं। डी. एन. ए. मिथाइलेशन को चूहे की शारीरिक कोशिकाओं में ई. आर. वी. के मौन बनाए रखने के लिए महत्वपूर्ण दिखाया गया है, जबकि हिस्टोन के निशान भ्रूण स्टेम कोशिकाओं (ई. एस. सी.) और प्रारंभिक भ्रूणजनन में इसी उद्देश्य के लिए महत्वपूर्ण हैं। अनुप्रयोग जातिजनन का निर्माण क्योंकि अधिकांश एच. ई. आर. वी. का कोई कार्य नहीं होता है, वे चयनात्मक रूप से तटस्थ होते हैं, और प्राइमेट जीनोम में बहुत प्रचुर मात्रा में होते हैं, वे आसानी से लिंकेज विश्लेषण के लिए जातिजनन मार्कर के रूप में काम करते हैं। उनका उपयोग एकीकरण स्थल बहुरूपता या ऑर्थोलॉग के विकसित, प्रोवायरल, न्यूक्लियोटाइड अनुक्रमों की तुलना करके किया जा सकता है। यह अनुमान लगाने के लिए कि एकीकरण कब हुआ, शोधकर्ताओं ने प्रत्येक विशेष स्थान पर आणविक विकास की दर का पता लगाने के लिए प्रत्येक जातिजनित पेड़ से दूरी का उपयोग किया। यह भी उपयोगी है कि ई. आर. वी. कई प्रजातियों के जीनोम में समृद्ध हैं (अर्थात। पौधे, कीड़े, मोलस्क, मछली, कृन्तक, घरेलू पालतू जानवर और पशुधन) क्योंकि इसके अनुप्रयोग का उपयोग विभिन्न प्रकार के जातिजनित प्रश्नों के उत्तर देने के लिए किया जा सकता है। प्रोवायरस की आयु और प्रजातियों के पृथक्करण की घटनाओं के समय बिंदुओं को निर्दिष्ट करना यह विभिन्न विकासवादी अवधियों से अलग-अलग एचईआरवी की तुलना करके पूरा किया जाता है। उदाहरण के लिए, यह अध्ययन विभिन्न होमिनोइड्स के लिए किया गया था, जो मनुष्यों से लेकर बंदरों तक थे। मौजूद विशाल विविधता के कारण पी. ई. आर. वी. के साथ ऐसा करना मुश्किल है। आगे के शोध एपिजेनेटिक परिवर्तनशीलता शोधकर्ता एपिजेनेटिक रिलीज और मानव रोग के साथ उनके संभावित संबंधों और जीन नियामक नेटवर्क की विशिष्टताओं की खोज के माध्यम से निष्क्रिय पारगम्य तत्वों के पुनः सक्रियण का अध्ययन करने के लिए अलग-अलग एपिजेनोम और ट्रांसक्रिप्टोम का विश्लेषण कर सकते हैं। ज़ेनोट्रांसप्लांटेशन की प्रतिरक्षा संबंधी समस्याओं को हाइपरएक्यूट रिजेक्शन (एच. ए. आर.) पर काबू पाने के एक प्रभावी तरीके के बारे में बहुत कम जाना जाता है, जो दाता उपकला पर गैलेक्टोसिल-अल्फ़ा1-3गैलेटोसिल (अल्फ़ा-गैल) एंटीजन को पहचानने वाले ज़ेनोरेक्टिव एंटीबॉडी द्वारा शुरू किए गए पूरक के सक्रियण का अनुसरण करता है। जीन चिकित्सा में एच. ई. आर. वी. के जोखिम कारक क्योंकि रेट्रोवायरस एक दूसरे के साथ और अन्य अंतजनन डी. एन. ए. अनुक्रमों के साथ पुनः संयोजन करने में सक्षम होते हैं, इसलिए जीन चिकित्सा के लिए एच. ई. आर. वी. के संभावित जोखिमों का पता लगाना फायदेमंद होगा, यदि कोई हो। इसके अलावा, रेट्रोवायरल वैक्टर में एचईआरवी अनुक्रमों को शामिल करके साइट-निर्देशित एकीकरण के लिए एचईआरवी की पुनः संयोजन की इस क्षमता में हेरफेर किया जा सकता है। एच. ई. आर. वी. जीन अभिव्यक्ति शोधकर्ताओं का मानना है कि एच. ई. आर. वी. जीन द्वारा कूटबद्ध आर. एन. ए. और प्रोटीन को कोशिका शरीर विज्ञान और रोगजनक स्थितियों में अनुमानित कार्य के लिए खोजा जाना जारी रखा जाना चाहिए। संश्लेषित प्रोटीन के जैविक महत्व को अधिक गहराई से परिभाषित करने के लिए इसकी जांच करना समझदारी होगी। एवियन सार्कोमा ल्यूकोसिस वायरस (ए. एस. एल. वी.) एंडोजेनस वायरल एलिमेंट एंडोजेनी (जीव विज्ञान) ई. आर. वी. 3 एच. ई. आर. वी.-एफ. आर. डी. हॉरिज़ॉन्टल जीन ट्रांसफर जाग्सीक्टे शीप रेट्रोवायरस (जे. एस. आर. वी.) कोआला रेट्रोवायरस (के. ओ. आर. वी.) माउस मैमरी ट्यूमर वायरस (एम. एम. टी. वी.) म्यूरीन ल्यूकेमिया वायरस (एम. एल. वी.) और ज़ेनोट्रॉपिक म्यूरीन ल्यूकेमिया वायरस से संबंधित वायरस (एक्स. एम. आर. वी.) पेलियोविरोलॉजी संदर्भ आगे पढ़ने के लिए बाहरी लिंक एच. ई. आर. वी. डी.-मानव एंडोजेनस रेट्रोवायरस डेटाबेस आणविक जीव विज्ञान स्वाइन रोग गैर-कोडिंग डी. एन. ए.