BioLinux
बायोलिनक्स एक ऐसा शब्द है जिसका उपयोग लिनक्स प्लेटफॉर्म पर जैव सूचना विज्ञान सॉफ्टवेयर तक पहुंच को आसान बनाने में शामिल विभिन्न परियोजनाओं में निम्नलिखित में से एक या अधिक तरीकों का उपयोग करके किया जाता हैः पूर्ण प्रणालियों का प्रावधान जैव सूचना विज्ञान सॉफ्टवेयर भंडार का प्रावधान मानक वितरण में जैव सूचना विज्ञान पैकेजों का जोड़ जैव सूचना विज्ञान सॉफ्टवेयर के साथ लाइव डीवीडी/सीडी जोड़ा गया सामुदायिक निर्माण और समर्थन प्रणाली अब लिनक्स सिस्टम और अन्य इकाइयों दोनों पर समान उद्देश्यों के साथ विभिन्न परियोजनाएं हैं, और इनमें से एक चयन नीचे दिया गया है। कैनेडियन बायोइन्फॉर्मेटिक्स हेल्पडेस्क न्यूज़लेटर में भी एक अवलोकन है जो लिनक्स-आधारित कुछ परियोजनाओं का विवरण देता है। पैकेज रिपॉजिटरी ऐप्पल/मैक कई लिनक्स पैकेज मैक ओएस एक्स के साथ संगत हैं और कई परियोजनाएं हैं जो मैक ओएस एक्स चलाने वाले कंप्यूटर पर चयनित लिनक्स पैकेज (जैव सूचना विज्ञान सॉफ्टवेयर सहित) को स्थापित करना आसान बनाने का प्रयास करती हैं। (स्रोत?) बायोआर्कलिनक्स बायोआर्कलिनक्स रिपॉजिटरी में आर्क लिनक्स और आर्क लिनक्स आधारित वितरण के लिए 3,770 से अधिक पैकेज हैं। डेबियन डेबियन कई शैक्षणिक संस्थानों में उपयोग में आने वाला एक और बहुत लोकप्रिय लिनक्स वितरण है, और कुछ जैव सूचना विज्ञानियों ने डेब प्रारूप में इस वितरण के लिए अपने स्वयं के सॉफ्टवेयर पैकेज उपलब्ध कराए हैं। रेड हैट पैकेज भंडार आम तौर पर लिनक्स के वितरण के लिए विशिष्ट होते हैं जिसका उपयोग जैव सूचना विज्ञानी कर रहे हैं। जैव सूचना विज्ञान के काम में कई लिनक्स संस्करण प्रचलित हैं। फेडोरा वाणिज्यिक रेड हैट प्रणाली का एक स्वतंत्र रूप से वितरित संस्करण है। रेड हैट का व्यापक रूप से कॉर्पोरेट दुनिया में उपयोग किया जाता है क्योंकि वे वाणिज्यिक सहायता और प्रशिक्षण पैकेज प्रदान करते हैं। फेडोरा कोर रेड हैट का एक समुदाय समर्थित व्युत्पन्न है और उन लोगों के बीच लोकप्रिय है जो रेड हैट की प्रणाली को पसंद करते हैं लेकिन उन्हें वाणिज्यिक समर्थन की आवश्यकता नहीं है। जैव सूचना विज्ञान अनुप्रयोगों के कई उपयोगकर्ताओं ने फेडोरा के साथ काम करने के लिए डिज़ाइन किए गए आरपीएम (रेड हैट का पैकेज प्रारूप) का उत्पादन किया है, जिसे आप संभावित रूप से रेड हैट एंटरप्राइज लिनक्स सिस्टम पर भी स्थापित कर सकते हैं। मंड्रीवा और एसयूएसई जैसे अन्य वितरण आरपीएम का उपयोग करते हैं, इसलिए ये पैकेज इन वितरणों पर भी काम कर सकते हैं। स्लैकवेयर कम उपयोग किए जाने वाले लिनक्स वितरणों में से एक है। यह उन लोगों के बीच लोकप्रिय है जिन्हें लिनक्स ऑपरेटिंग सिस्टम का बेहतर ज्ञान है और जो उपलब्ध विभिन्न जी. यू. आई. पर कमांड लाइन पसंद करते हैं। पैकेज टीजीजेड या टीजीएक्स प्रारूप में होते हैं। स्लैकवेयर पर आधारित सबसे व्यापक रूप से ज्ञात लाइव वितरण स्लैक्स है और इसका उपयोग कई जैव सूचना विज्ञान वितरणों के लिए आधार के रूप में किया गया है। बायोस्लैक्स लाइव डी. वी. डी./सी. डी. लाइव डी. वी. डी. या सी. डी. बायोइन्फॉर्मेटिक्स कंप्यूटिंग प्रदान करने का एक आदर्श तरीका नहीं है, क्योंकि वे सी. डी./डी. वी. डी. ड्राइव से चलते हैं। इसका मतलब है कि वे पारंपरिक हार्ड डिस्क स्थापना की तुलना में धीमे हैं और उनमें कॉन्फ़िगर करने की सीमित क्षमता है। हालाँकि, वे तदर्थ समाधान प्रदान करने के लिए उपयुक्त हो सकते हैं जहाँ कोई अन्य लिनक्स पहुँच उपलब्ध नहीं है, और यहाँ तक कि लिनक्स स्थापना के लिए आधार के रूप में भी उपयोग किया जा सकता है। अच्छे जैव सूचना विज्ञान समर्थन के साथ मानक वितरण सामान्य रूप से, लिनक्स वितरण में आधिकारिक पैकेजों की एक विस्तृत श्रृंखला उपलब्ध होती है, लेकिन इसमें आमतौर पर वैज्ञानिक समर्थन के रूप में बहुत कुछ शामिल नहीं होता है। अपवाद हैं, जैसे कि नीचे दिए गए विवरण। जेन्टू लिनक्स जेन्टू लिनक्स ई-बिल्ड्स के रूप में 156 से अधिक जैव सूचना विज्ञान अनुप्रयोग (मुख्य वृक्ष में जेन्टू विज्ञान-जीव विज्ञान झुंड देखें) प्रदान करता है, जो स्रोत कोड से अनुप्रयोगों का निर्माण करते हैं। अतिरिक्त 325 पैकेज जेंटू साइंस ओवरले (परीक्षण के लिए) में हैं। यद्यपि उत्कृष्ट सामुदायिक समर्थन के साथ एक बहुत ही लचीली प्रणाली है, स्रोत से स्थापित करने की आवश्यकता का मतलब है कि जेंटू प्रणाली अक्सर स्थापित करने में धीमी होती है, और इसके लिए काफी रखरखाव की आवश्यकता होती है। द्विआधारी पैकेज बनाने के लिए केंद्रीय सर्वर का उपयोग करके संकलन के कुछ समय को कम करना संभव है। दूसरी ओर, आप अपने सबसे अच्छे प्रोसेसर का उपयोग करके उच्चतम गति से चलने के लिए सभी को ठीक कर सकते हैं (उदाहरण के लिए वास्तव में एस. एस. ई. और ए. वी. एक्स. और ए. वी. एक्स. 2 सी. पी. यू. निर्देशों का उपयोग करने के लिए)। द्विआधारी-आधारित डिस्ट्रो आमतौर पर केवल i686 या यहां तक कि केवल i386 निर्देश सेट का उपयोग करके द्विआधारी प्रदान करते हैं। फ्रीबीएसडी एक लिनक्स वितरण नहीं है, बल्कि यूनिक्स का एक संस्करण है जो बहुत समान है। इसके बंदरगाह जेंटू के ईबिल्ड के समान हैं। हालाँकि, परियोजना लगातार x86 और ए. आर. एम. जैसे टियर-1 प्लेटफार्मों के लिए पूर्व-संकलित द्विआधारी पैकेजों का निर्माण करती है। उपयोगकर्ता गैर-पोर्टेबल अनुकूलन या अन्य निर्माण विकल्पों को सक्षम करने के लिए स्रोत से किसी भी पोर्ट को बनाने और स्थापित करने का विकल्प भी चुन सकते हैं। बिल्ड-फ्रॉम-सोर्स विकल्प बंदरगाह प्रणाली को एक लाइसेंस के साथ सॉफ्टवेयर की स्थापना को स्वचालित करने की भी अनुमति देता है जो पुनर्वितरण की अनुमति नहीं देता है। बंदरगाहों के संग्रह में 31,000 से अधिक बंदरगाह हैं, जिनमें से 2,200 से अधिक वैज्ञानिक श्रेणियों में हैं और 240 से अधिक जीव विज्ञान से संबंधित हैं। नए बंदरगाहों और अद्यतनों को फ्रेश पोर्ट्स साइट पर सूचीबद्ध किया गया है। पी. जी. जी. एस. आर. सी. पैकेज प्रबंधक, जो मूल रूप से फ्री. बी. एस. डी. बंदरगाहों से बना है, का रखरखाव नेट. बी. एस. डी. परियोजना द्वारा किया जाता है, लेकिन इसका उद्देश्य सभी पी. ओ. एस. आई. एक्स.-संगत संचालन प्रणालियों का समर्थन करना है। नेटबीएसडी, कई लिनक्स वितरण, मैकओएस और सनओएस व्युत्पन्न पर इसका अच्छी तरह से परीक्षण किया गया है। फ्रीबीएसडी बंदरगाहों की तरह, कुछ प्लेटफार्मों के लिए पूर्व-संकलित द्विआधारी पैकेज बनाए रखे जाते हैं। पैकेज को किसी भी प्लेटफॉर्म पर स्रोत से बनाया जा सकता है, या यदि अतिरिक्त अनुकूलन या विकल्प वांछित हैं। पी. जी. जी. एस. आर. सी. संग्रह में 19,000 से अधिक पैकेज हैं, जिनमें से लगभग 800 वैज्ञानिक श्रेणियों में हैं और 60 से अधिक जीव विज्ञान से संबंधित हैं। डेबियन मानक डेबियन स्थापना के हिस्से के रूप में सौ से अधिक जैव सूचना विज्ञान पैकेज प्रदान किए गए हैं। एन. ई. बी. सी. बायो-लिनक्स पैकेज को एक मानक डेबियन प्रणाली पर भी स्थापित किया जा सकता है जब तक कि बायो-लिनक्स-बेस पैकेज भी स्थापित है। यह एक/यु. एस. आर./स्थानीय/बायोइन्फ निर्देशिका बनाता है जहाँ हमारे अन्य पैकेज अपना सॉफ्टवेयर स्थापित करते हैं। डेबियन पैकेज उबंटू लिनक्स या अन्य डेबियन-व्युत्पन्न संस्थापनाओं पर भी काम कर सकते हैं। सामुदायिक निर्माण और समर्थन प्रणाली समर्थन और प्रलेखन प्रदान करना किसी भी बायोलिनक्स परियोजना का एक महत्वपूर्ण हिस्सा होना चाहिए, ताकि जो वैज्ञानिक आईटी विशेषज्ञ नहीं हैं, वे अपनी विशिष्ट समस्याओं का जवाब जल्दी से पा सकें। सहायता मंच या डाक सूची भी अनुसंधान समुदाय के भीतर ज्ञान के प्रसार के लिए उपयोगी हैं। इनमें से कुछ संसाधन यहाँ जुड़े हुए हैं। यह भी देखें मुक्त स्रोत जैव सूचना विज्ञान सॉफ्टवेयर की सूची जैव चिकित्सा साइबरनेटिक्स सॉफ्टवेयर संदर्भ जैव सूचना विज्ञान सॉफ्टवेयर लिनक्स कम्प्यूटेशनल विज्ञान की सूची