Influenza A segment 7 splice site
इन्फ्लूएंजा ए वायरस खंड 7 पूर्व-एम. आर. एन. ए. की 3 'स्प्लाइस साइट दो अलग-अलग प्रकार की आर. एन. ए. संरचना को अपना सकती हैः एक सूडोकॉट और एक हेयरपिन। यह संरचनात्मक परिवर्तन आर. एन. ए. वैकल्पिक विभाजन में एक भूमिका निभाने के लिए प्रस्तावित है और इस पूर्व-एम. आर. एन. ए. के विभाजन द्वारा उत्पादित एम1 और एम2 प्रोटीन के उत्पादन को प्रभावित कर सकता है। अवलोकन इस संरचित क्षेत्र की खोज पहली बार थर्मोडायनामिक फोल्डिंग मुक्त ऊर्जा और एमिनो एसिड कोडन दमन पर आधारित इन्फ्लूएंजा ए के जैव सूचना विज्ञान सर्वेक्षण में की गई थी। द्वितीयक संरचना के प्रारंभिक मॉडल न्यूक्लिक एसिड संरचना भविष्यवाणी के लिए कम्प्यूटेशनल तरीकों पर आधारित थे। हेयरपिन संरचना की भविष्यवाणी आर. एन. ए. कैलिफोल्ड का उपयोग करके की गई थी, जबकि सूडोकनॉट की भविष्यवाणी डॉटकॉट के साथ की गई थी। खंड 7 एम1 प्रोटीन और छोटे एम2 प्रोटॉन चैनल प्रोटीन को कूटबद्ध करता है, जो आरएनए स्प्लिसिंग द्वारा उत्पादित होता है। एम2 प्रोटीन वायरस के लिए महत्वपूर्ण हैः यह आयन चैनल बनाता है जो विरियन के अम्लीकरण की अनुमति देता है जो अन-कोटिंग में उत्तेजित होता है। एम2 का उत्पादन करने के लिए उपयोग किए जाने वाले 3 'स्प्लाइस साइट क्षेत्र की संरचना-संवेदनशील रसायनों और एंजाइमों के साथ प्रयोगात्मक रूप से जांच की गई थी और समाधान में हेयरपिन और स्यूडोकनॉट अनुरूपण दोनों को अपनाने के लिए पाया गया था। प्रत्येक संरचना विभिन्न संरचनात्मक वातावरणों में महत्वपूर्ण विभाजन नियामक स्थलों को स्थान देती है, जो खंड 7 प्रतिलेख के विभाजन के मॉड्यूलेशन के लिए निहितार्थ है। उदाहरण के लिए, स्प्लाइस साइट, पॉलीपाइरिमिडीन ट्रैक्ट, ब्रांच पॉइंट, और ए. एस. एफ./एस. एफ. 2 एक्सोनिक एन्हांसर बाइंडिंग साइटों के हेयरपिन संरचना में अधिक सुलभ होने और स्यूडोकनॉट में कम सुलभ होने की उम्मीद है (चित्र 1)। स्यूडोकनॉट और हेयरपिन के बीच संतुलन को स्थानांतरित करके क्रमशः एम2 स्प्लिसिंग को कम करना या बढ़ाना संभव हो सकता है। संभावित रूप से साझा तंत्र यह अनुमानित तंत्र वह भी हो सकता है जो स्प्लिस्ड इन्फ्लूएंजा प्रतिलेखों के लिए सामान्य है। इसी तरह रखे गए, लेकिन संरचनात्मक रूप से अलग, इन्फ्लूएंजा वायरस सूडोकनॉट/हेयरपिन को खंड 8 प्रतिलेखों के 3 'स्प्लाइस साइट में भी वर्णित किया गया था, जो एनपी को कूटबद्ध करते हैं और, स्प्लिसिंग द्वारा, एनईपी प्रोटीन। ये संरचनाएँ इन्फ्लूएंजा ए और इन्फ्लूएंजा बी मेजबान प्रजाति विशिष्ट संरचनात्मक स्थिरता के बीच साझा किए गए संरचित आर. एन. ए. का एक परिवार बनाती हैं इन्फ्लूएंजा ए खंड 7 में 3 'स्प्लाइस साइट संरचनाएँ संरचनात्मक स्थिरता में मेजबान-प्रजाति विशिष्ट रुझानों को दर्शाती हैं। संरचनात्मक रूप से स्थिर करने वाले उत्परिवर्तन की सबसे बड़ी संख्या पक्षियों के विशिष्ट उपभेदों में होती है, जबकि सबसे संरचनात्मक रूप से अस्थिर करने वाले उत्परिवर्तन मानव उपभेदों में हुएः सूअर बीच में गिर गए। स्थिरता में यह सामान्य प्रवृत्तिः पक्षी, सूअर, मानव, मोटे तौर पर उस तापमान का अनुसरण करते हैं जिस पर प्रत्येक मेजबान प्रजाति के भीतर इन्फ्लूएंजा वायरस प्रजनन करता है। पक्षियों की आंत और सूअर और मानव फेफड़ों का तापमान क्रमशः 42,37 और 34 डिग्री सेल्सियस होता है। यह अवलोकन इन्फ्लूएंजा ए कोडिंग अनुक्रमों में वैश्विक प्रवृत्ति का एक स्थानीय उदाहरण है, जहां पक्षियों, सूअरों और मानव उपभेदों में अलग-अलग स्थिरता दिखाई देती है। यह मामला हो सकता है कि आर. एन. ए. संरचना मेजबानों में अधिक स्थिर है जहां कार्यात्मक संरचनाओं या महत्वपूर्ण संरचनात्मक संतुलन को संरक्षित करने के लिए प्रतिकृति तापमान अधिक है। सूडोकॉट नॉन-कोडिंग आर. एन. ए. न्यूक्लिक एसिड सेकेंडरी स्ट्रक्चर भी देखें संदर्भ बाहरी लिंक सूडोबेस + +-आर. एन. ए. सूडोकॉट सेकेंडरी स्ट्रक्चर का डेटाबेस टर्नर लैब सिस-रेगुलेटरी आर. एन. ए. तत्व आणविक आनुवंशिकी इन्फ्लुएंजा