Multi-Omics Profiling Expression Database
मल्टी-ओमिक्स प्रोफाइलिंग एक्सप्रेशन डेटाबेस (एमओपीईडी) एक विस्तारित मल्टी-ओमिक्स संसाधन था जो मॉडल जीवों और मनुष्यों पर सार्वजनिक रूप से उपलब्ध अध्ययनों से ट्रांसक्रिप्टोमिक्स और प्रोटिओमिक्स जानकारी की तेजी से ब्राउज़िंग का समर्थन करता है। आज तक (2021) इसने गतिविधियाँ बंद कर दी हैं और ऑनलाइन अनुपलब्ध है। व्यवस्थित प्रोटीन अन्वेषक अनुसंधान वातावरण एम. ओ. पी. ई. डी. को अधिक से अधिक शोध समुदाय के लिए डेटा की तुलना और साझाकरण को सरल बनाने के लिए बनाया गया है। एमओपीईडी प्रोटीन स्तर निरपेक्ष और सापेक्ष अभिव्यक्ति डेटा, मेटा-विश्लेषण क्षमताओं और मात्रात्मक डेटा को विशिष्ट रूप से प्रदान करने के लिए मानकीकृत विश्लेषण पाइपलाइन स्पायर को नियोजित करता है। संसाधित सापेक्ष अभिव्यक्ति प्रतिलेखन डेटा जीन एक्सप्रेशन ऑम्निबस (जी. ई. ओ.) से प्राप्त किया गया था। विशिष्ट प्रोटीन और जीन के लिए डेटा से पूछताछ की जा सकती है, जीव, ऊतक, स्थानीयकरण और स्थिति के आधार पर ब्राउज़ किया जा सकता है, और गलत खोज दर और अभिव्यक्ति द्वारा क्रमबद्ध किया जा सकता है। एमओपीईडी उपयोगकर्ताओं को अपने स्वयं के अभिव्यक्ति डेटा की कल्पना करने और मौजूदा अध्ययनों के साथ इसकी तुलना करने का अधिकार देता है। इसके अलावा, एमओपीईडी जीनकार्ड्स, पैंथर, एंट्रेज़, यूनीप्रोट, केईजीजी, सीड और रिएक्टोम सहित विभिन्न प्रोटीन और पाथवे डेटा-बेस को जोड़ता है। प्रोटीन और जीन पहचानकर्ताओं को जीनकार्ड्स (एमओपीईडी के साथ क्रॉस-संदर्भित), जेनबैंक, रेफसेक, यूनीप्रोट, वर्मबेस और सैक्रोमाइसेस जीनोम डेटाबेस (एसजीडी) से एकीकृत किया जाता है। एम. ओ. पी. ई. डी. के वर्तमान संस्करण (एम. ओ. पी. ई. डी. 2.5,2014) में लगभग 5 मिलियन कुल रिकॉर्ड हैं जिनमें ~ 260 प्रयोग और ~ 390 स्थितियां शामिल हैं। एम. ओ. पी. ई. डी. को सिएटल बाल अनुसंधान संस्थान में कोल्कर टीम द्वारा विकसित और समर्थित किया गया है। मॉडल ऑर्गेनिज्म प्रोटीन एक्सप्रेशन डेटाबेस एम. ओ. पी. ई. डी. को पहले मॉडल ऑर्गेनिज्म प्रोटीन एक्सप्रेशन डेटाबेस के रूप में जाना जाता था, इसका नाम मल्टी-ओमिक्स प्रोफाइलिंग एक्सप्रेशन डेटाबेस में बदलने से पहले। संदर्भ आगे पढ़ने के लिए जैविक डेटाबेस प्रोटिओमिक्स ओमिक्स