FAM83A
प्रोटीन एफएएम83ए (अनुक्रम समानता 83 के साथ परिवार का सदस्य) जिसे ट्यूमर एंटीजन बीजे-टीएसए-9 के रूप में भी जाना जाता है, एक प्रोटीन है जिसे मनुष्यों में एफएएम83ए जीन द्वारा कूटबद्ध किया जाता है। इस प्रोटीन में अज्ञात कार्य 1669 (DUF1669) का एक डोमेन होने की भविष्यवाणी की गई है, जो इस प्रोटीन को PLDC _ सुपरफैमिली में रखता है। इसे फेफड़े, प्रोस्टेट और मूत्राशय के कैंसर में एक संभावित बायोमार्कर के रूप में जोड़ा गया है। जीन एफएएम83ए गुणसूत्र 8, लोकस q24.13 पर स्थित है और 27,566 आधार जोड़े में फैला हुआ है। जेनोमैटिक्स द्वारा टूल एलडोराडो द्वारा भविष्यवाणी के अनुसार ऊपर की ओर लगभग 4,000 आधार जोड़े हैं। एफ. ए. एम. 83ए जीन सहित गुणसूत्र के इस भाग में विलोपन के परिणामस्वरूप अक्सर लैंगर-गीडियन सिंड्रोम होता है। एम. आर. एन. ए. एफ. ए. एम. 83ए. एम. आर. एन. ए. के 10 अलग-अलग स्प्लाइस रूप हैं, जिसमें प्रतिलेखन संस्करण 1 इस लेख का विषय है। इस एम. आर. एन. ए. में लगभग 2,900 आधार जोड़े होते हैं। इसमें अज्ञात कार्य 1669 (DUF1669) का एक डोमेन है, और यह PLDC _ SF सुपरफ़ैमिली का सदस्य है। इसे एफएएम83ए और अन्य एन-टर्मिनस फॉस्फोलाइपेज डी-जैसे डोमेन के बीच अत्यधिक समान अनुक्रमों के आधार पर इस सुपरफ़ैमिली में रखा गया है; हालाँकि, इसमें कार्यात्मक हिस्टिडीन की कमी है और इसलिए केवल एक समान संरचना होने की भविष्यवाणी की गई है। इस एम. आर. एन. ए. में चार एक्सोन होते हैं। भविष्यवाणी एम. आर. एन. ए. के अनुवादित क्षेत्रों में कई संभावित आर. एन. ए. स्टेम लूप संरचनाओं को दर्शाती है। प्रोटीन एफएएम83ए जीन एफएएम83ए प्रोटीन आइसोफॉर्म ए के लिए कूटबद्ध करता है। यह प्रोटीन लंबाई में 434 एमिनो एसिड है, और इसका वजन लगभग 45 किलो डाल्टन है। हालांकि संरचना की पुष्टि नहीं हुई है, GOR4 का उपयोग करके यह भविष्यवाणी की गई है कि इसमें चार अल्फा हेलिसेस और पांच बीटा शीट्स हैं, जिसमें 8.964 के एक आइसोइलेक्ट्रिक बिंदु के साथ कोई सिग्नल पेप्टाइड प्रतीत नहीं होता है और यह एक ट्रांसमेम्ब्रेन प्रोटीन नहीं है। सीबीएलएएसटी का उपयोग करते हुए, यह प्रोटीन 3एच0जी के साथ एक सामान्य अनुक्रम साझा करने के लिए देखा गया था, हालांकि, एफएएम83ए के अनुमानित कार्यात्मक क्षेत्र में नहीं। हालाँकि, यह अभी भी इस प्रोटीन के लिए संभावित आंशिक संरचना पर मूल्यवान जानकारी प्रदान कर सकता है। अभिव्यक्ति FAM83A मानव शरीर के कई अलग-अलग क्षेत्रों में और बहुत अलग स्तरों पर व्यक्त की जाती है। ईएसटी डेटा से पता चलता है कि यह जीन मुख्य रूप से वयस्कों में व्यक्त किया जाता है। यह प्रोस्टेट, फेफड़े और अन्नप्रणाली में अन्य बढ़ी हुई अभिव्यक्ति के साथ मुंह और स्वरयंत्र में महत्वपूर्ण स्तर दिखाता है। ये सामान्य स्तर सिर और गर्दन के ट्यूमर, फेफड़ों के ट्यूमर, प्रोस्टेट कैंसर और मूत्राशय के कार्सिनोमा में और भी अधिक बढ़ जाते हैं। माइक्रोएरे अभिव्यक्ति डेटा भी विभिन्न पर्यावरणीय स्थितियों, विशेष रूप से चिड़चिड़ाहट को दर्शाता है। इस तरह के उत्तेजक सिगरेट का धुआं हो सकते हैं, जहां एफ. ए. एम. 83. ए. को 24 घंटे के संपर्क के बाद अभिव्यक्ति में वृद्धि करने के लिए दिखाया गया है, और ब्रोन्कियल उपकला कोशिकाओं पर घर की धूल के घुन का अर्क, जहां एफ. ए. एम. 83. ए. अभिव्यक्ति भी संपर्क के बाद बढ़ती है। एफ. ए. एम. 83. ए. कम अभिव्यक्ति दिखाता है जब सक्रिय प्रतिलेखन कारक 2 (ए. टी. एफ. 2) को बाहर कर दिया जाता है। चूंकि ए. टी. एफ. 2 के प्रवर्तक क्षेत्र में जुड़ने की भविष्यवाणी नहीं की गई थी, इसलिए यह सुझाव देता है कि एफ. ए. एम. 83ए और ए. टी. एफ. 2 के बीच एक अप्रत्यक्ष संबंध है। ए. टी. एफ. 2 के साथ एक अप्रत्यक्ष संबंध के साथ-साथ उत्तेजक और एलर्जी कारकों के लिए बढ़ती अभिव्यक्ति के साथ, यह सुझाव देता है कि एफ. ए. एम. 83ए एक संकेत मार्ग में हो सकता है। कई अध्ययन हैं जो FAM83A अति अभिव्यक्ति को फेफड़ों, प्रोस्टेट और मूत्राशय के कैंसर से जोड़ते हैं। शोधकर्ताओं का मानना है कि यह जीन इन कैंसरों, विशेष रूप से फेफड़ों के कैंसर का जल्द पता लगाने के लिए एक अच्छा उम्मीदवार हो सकता है। यह अज्ञात है कि एफएएम83ए को क्यों या कैसे विनियमित किया जाता है। अध्ययनों से पता चला है कि आर्सेनिक विनियमन का कारण बनने वाले प्रवर्तक को एसिटिलेट कर सकता है, यह सुझाव देते हुए कि यह कैंसर में इस जीन के अनियंत्रित होने के समान तंत्र हो सकता है। प्रोटीन अंतःक्रिया एफ. ए. एम. 83. ए. को स्ट्रिंग उपकरण के माध्यम से तालू, फेफड़े और नाक के उपकला कार्सिनोमा से जुड़े प्रोटीन (पी. एल. यू. एन. सी.) के साथ अंतःक्रिया करते हुए दिखाया गया है। एकत्र की गई यह जानकारी कैंसर से निपटने वाली टेक्स्ट माइनिंग जानकारी से आई है। होमोलॉजी FAM83A एक अपेक्षाकृत नया जीन प्रतीत होता है, जिसमें BLAST और BLAT केवल हड्डी वाली मछलियों के माध्यम से वर्तनी को वापस दिखाते हैं। यह अपने रिश्तेदारों के माध्यम से अत्यधिक संरक्षित है DUF1669 डोमेन प्रोटीन का सबसे अधिक संरक्षित क्षेत्र है, जिसके बाहर के क्षेत्र अधिक परिवर्तनशील हैं। नीचे अर्थोलॉग की एक तालिका दी गई है, जिसमें कहा गया है कि यह एक व्यापक सूची नहीं हैः संदर्भ